Immunosensörler, Genosensörler, Optik Sensörler, Biyomolekül immobilizayon teknikleri)

Transkript

1 Dr. Deniz BAŞ, Yrd.Doç. Çankırı Karatekin Üniversitesi, Gıda Mühendisliği Bölümü Öğretim Üyesi Cumhuriyet Mah. Ş.P.Üsteğmen Erdem Öztürk Sok. No. 12 Kat: 6 ÇANKIRI Tel: (Dahili: 1635) GSM: E- posta: denizbas@gmail.com veya denizbas@karatekin.edu.tr Kişisel Bilgiler Doğum Tarihi ve Yeri: 6 Eylül 1979, Konya Cinsiyet: Erkek Medeni Durumu: Bekar Askerlik Durumu: Tamamlandı (31 Temmuz Ocak 2010) Yabancı Dil: İngilizce (KPDS: 82, Mayıs 2010) Eğitim Hacettepe Üniversitesi, Gıda Mühendisliği, Doktora Hacettepe Üniversitesi, Gıda Mühendisliği, Yüksek Lisans Hacettepe Üniversitesi, Gıda Mühendisliği, Lisans Meram Anadolu Lisesi (Konya), Lise Yüksek Lisans Tezi Enzimatik Reaksiyonlara Ait Kinetik Katsayıların Cevap Yüzeyi Metodu Ve Yapay Sinir Ağları Kullanılarak Saptanması, Danışman: Doç.Dr. İsmail Hakkı BOYACI, Gıda Mühendisliği Bölümü, Hacettepe Üniversitesi, Doktora Tezi Yarı- İletken Nano Parçacıklar Kullanılarak Fotoelektrokimyasal DNA Biyosensörlerinin Hazırlanması, Danışman: Prof.Dr. İsmail Hakkı BOYACI, Gıda Mühendisliği Bölümü, Hacettepe Üniversitesi, Araştırma Konuları Gıda Bileşenlerinin ve Bulaşanlarının Hızlı Tayini Biyosensörler (Elektrokimyasal Sensörler, Nanoparçacıklar (yarı- iletken) - Quantum Dots, Immunosensörler, Genosensörler, Optik Sensörler, Biyomolekül immobilizayon teknikleri) Enzim Kinetiği (Serbest ve İmmobilize Enzim Kinetiği, Spektrofotometrik Yöntemler (UV- Vis, Fluorescence), Elektrokimyasal Yöntemler) Modelleme ve Optimizasyon (Yapay Sinir Ağları, Cevap Yüzeyi Yöntemi, Sayısal Çözümleme, Doğrusal ve Doğrusal olmayan regresyon) ÖDÜLLER yılları arasında en çok atıf alan beş yayın içerisinde bulunma, Journal of Food Engineering Yayın: Baş D., İ.H. Boyacı, Modeling and optimization. I. Usability of response surface methodology, Journal of Food Engineering, (2007) 78, (Atıf Sayısı: 141) Halen Journal of Food Engineering en çok atıf alan beş yayın listesinde birinci sırada listelenmekte BURSLAR European Science Foundation, COST 527 Short Term Scientific Mission (STSM), PREPARATION OF OPTICAL AFLATOXIN SENSOR USING PLASMA POLYMERIZATION TECHNIQUE, Low Temperature Plasma Physics Department Institute of Atomic Physics, Gheorghe Dinescu, January- February 2005.

2 Yayınlar SCI ve SCI- Expanded indeksleri kapsamında taranan dergilerde yayımlanan makaleler 1. D. Baş, İ.H. Boyacı, Photoelectrochemical competitive DNA hybridization assay using semiconductor quantum dot conjugated oligonucleotides, Analytical and Bioanalytical Chemistry (2011), 400, D. Baş, İ.H. Boyacı, Rapid method for quantitative determination of proteolytic activity with cyclic voltammetry, Electroanalysis (2010), 22, 3, D. Baş, İ.H. Boyacı, Quantitative Photoelectrochemical Detection of Biotin Conjugated CdSe/ZnS Quantum Dots on the Avidin Immobilized ITO Electrodes, Electroanalysis (2009), 21, Ö. Torun, F.C. Dudak, D. Baş, U. Tamer, İ.H. Boyacı, Thermodynamic analysis of the interaction between 3- aminophenylboronic acid and monosaccharides for development of biosensor, Sensors and Actuators B: Chemical (2009), 140, Sokullu E., D. Baş, İ.H. Boyacı, Z. Öner, A.G. Karahan, İ. Çakır, M.L. Çakmakçı, Determination of Transglutaminase Activity Using Fluorescence Spectrophotometer, Food Biotechnology, (2008), 22, Baş D., F.C. Dudak, İ.H. Boyacı, Modeling and optimization. IV. Investigation of reaction kinetics and kinetic constants using a program in which artificial neural network (ANNs) was integrated, Journal of Food Engineering, (2007), 79, Baş D., F.C. Dudak, İ.H. Boyacı, Modeling and optimization. III. Reaction rate estimation using artificial neural network (ANN) without a kinetic model, Journal of Food Engineering, (2007) 79, Baş D., İ.H. Boyacı, Modeling and optimization. II. Comparison of estimation capabilities of response surface methodology with artificial neural networks in a biochemical reaction, Journal of Food Engineering, (2007) 78, Baş D., İ.H. Boyacı, Modeling and optimization. I. Usability of response surface methodology, Journal of Food Engineering, (2007) 78, Boyacı İ.H., D. Baş, F.C. Dudak, A. Topçu, İ. Saldamlı, U.Ö.Ş. Şeker, and C. Tamerler, Statistical Modeling of Beta- galactosidase Inhibition During Lactose Hydrolysis, Food Biotechnology, (2006), 20, SCI, SCI Expanded, SSCI, AHCI dışında uluslararası indeksler tarafından taranan dergilerde yayımlanan tam metinli makaleler 1. F.C. Dudak, D. Baş, N. Başaran- Akgul, U. Tamer, İ.H. Boyacı, Nano- sized structures for the detection of food components and contaminants, Frontiers in Bioscience (2011), E3, Yurt içi hakemli dergilerde yayımlanan yabancı dilde tam metinli araştırma makaleleri 1. K. Kılıç, D. Baş, İ.H. Boyacı, An Easy Approach for the Selection of Optimal Neural Network Structure, Gıda (2009) 34 (2):

3 Bildiriler Uluslararası Bildiriler 1. Baş D., Boyacı İ.H., Towards a Portable Sensor for The Wheat Bug Protease for Quantitative and Rapid Determination of the Proteolytic Activity, 9 th European Young Cereal Scientists and Technologists Workshop, Budapeşte, Macaristan, Nisan (Sözlü Bildiri) 2. Baş D., Boyacı İ.H., Quantitative Determination of Proteolytic Activity with Cyclic Voltammetry on Gelatin Coated Electrodes, PITTCON 2010, Orlando, FL, ABD, 28 Şubat 5 Mart (Poster) 3. Boyacı İ.H., Baş D., Tamer U., Applications of electroanalytical methods for the detection of food components and contaminants, 8 th International Electrochemistry Meeting in Turkey, Antalya, 8-11 Ekim, (Sözlü Bildiri) 4. Baş D., Boyacı İ.H., Cyclic Voltammetric method for the quantitative determination of protease activity, 5 th Black Sea Basin Conference on Analytical Chemistry, Ordu, Eylül (Sözlü Bildiri) 5. Baş D., Boyacı İ.H., Artificial Neural Networks (ANN) and usability of ANN in enzyme kinetics, 3 rd International Symposium on Biochemistry and Molecular Biology within the 6 th International Congress on Chemistry and Chemical Engineering, Enzyme Technology Session, Havana, Küba, Ekim 2006 [ISBN: X] (Sözlü Bildiri) 6. Boyacı İ.H., Şeker U.Ö.Ş., Baş D., Topcu A, Tamerler C., Saldamli I., Statistical Modelling of Product Inhibition Effect on β- Galactosidase Enzyme During Lactose Hydrolysis, 11 th European Congress on Biotechnology, Computational Biotechnology, Basel, İsviçre, Ağustos 2003, 287. (Sözlü Bildiri) Ulusal Bildiriler 1. Baş D., İ.H. Boyacı, Photoelectrochemical detection of Biotin conjugated CdSe/ZnS Quantum Dots on the Avidin Immobilized ITO electrodes, 5 th National Nanoscience and Nanotechnology Conference, Eskişehir, 8-12 Haziran (Sözlü Bildiri) 2. Ceylan Ö., K. Sıçramaz, D. Baş, K. Kılıç, İ.H. Boyacı, Prusya Mavisi/İletken Polimer Modifiyeli Elektrot Kullanarak Süt Örneklerinde Peroksit Tayini, 7. Elektrokimya Günleri, Ankara, Haziran (Özet Kitabı, p69) (Poster) 3. Baş D., K. Kılıç, F.C. Dudak, İ.H. Boyacı, Yapay Sinir Ağlarının Gıda Alanında Kullanılması, Turkey 9. Gıda Kongresi, Bolu, Mayıs (Kongre Kitabı, s953) (Poster) 4. Baş D., İ.H. Boyacı, Yapay Sinir Ağları ve Cevap Yüzeyi Metodu Kullanılarak Enzimatik Reaksiyon Hız Değerlerinin Tahmin Edilmesi: Beta- Galaktozidaz Enzimi ile Model Çalışma, XIV. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Eskişehir, 31 Ağustos 2 Eylül (Kongre Kitabı, s ) (Sözlü Bildiri) 5. Baş D., İ.H. Boyacı, M. Mutlu, Enzimatik Reaksiyon Hızının Tahmin Edilmesinde Yapay Sinir Ağları ve Cevap Yüzeyi Metodu Yaklaşımlarının Karşılaştırılması: Amiloglukozidaz Enzimi ile Model Çalışma, Gıda Kongresi 2005, İzmir, Nisan 2005, (Poster Sunum Kitabı, s ) (Poster) 6. Dudak F.C., İ.H. Boyacı, U.Ö.Ş. Şeker, D. Baş, C. Tamerler, Laktoz Hidrolizinde Beta- Galaktozidaz İnhibisyonunun Cevap Yüzeyi Yöntemi ile İncelenmesi, Gıda Kongresi 2005, İzmir, Nisan 2005, (Sözlü Sunum Kitabı, s91-98) (Sözlü Bildiri)

4 ATIFLAR (Toplam Atıf Sayısı: 194) * SCI, SCI- Expanded, SSCI ve AHCI tarafından taranan dergilerde yazar olarak yer almadığı yayınlarda, adayın eserlerine yapılan atıf 1. D. Baş, İ.H. Boyacı, Quantitative Photoelectrochemical Detection of Biotin Conjugated CdSe/ZnS Quantum Dots on the Avidin Immobilized ITO Electrodes, Electroanalysis (2009), 21, (Atıf Sayısı: 1) 2. Ö. Torun, F.C. Dudak, D. Baş, U. Tamer, İ.H. Boyacı, Thermodynamic analysis of the interaction between 3- aminophenylboronic acid and monosaccharides for development of biosensor, Sensors and Actuators B: Chemical (2009), 140, (Atıf Sayısı: 1) 3. Baş D., F.C. Dudak, İ.H. Boyacı, Modeling and optimization. IV. Investigation of reaction kinetics and kinetic constants using a program in which artificial neural network (ANNs) was integrated, Journal of Food Engineering, (2007), 79, (Atıf Sayısı: 10) 4. Baş D., F.C. Dudak, İ.H. Boyacı, Modeling and optimization. III. Reaction rate estimation using artificial neural network (ANN) without a kinetic model, Journal of Food Engineering, (2007) 79, (Atıf Sayısı: 15) 5. Baş D., İ.H. Boyacı, Modeling and optimization. II. Comparison of estimation capabilities of response surface methodology with artificial neural networks in a biochemical reaction, Journal of Food Engineering, (2007) 78, (Atıf Sayısı: 18) 6. Baş D., İ.H. Boyacı, Modeling and optimization. I. Usability of response surface methodology, Journal of Food Engineering, (2007) 78, (Atıf Sayısı: 148) 7. Boyacı İ.H., D. Baş, F.C. Dudak, A. Topçu, İ. Saldamlı, U.Ö.Ş. Şeker, and C. Tamerler, Statistical Modeling of Beta- galactosidase Inhibition During Lactose Hydrolysis, Food Biotechnology, (2006), 20, (Atıf Sayısı: 1) Projeler 1. Manyetik ve optik özelliklere sahip nanopartiküllerin geliştirilmesi ve biyoanalizlerde kullanımı, TUBİTAK Projesi, Proje No: 107T682, Proje Yürütücüsü: İsmail Hakkı Boyacı, Araştırmacı: Uğur Tamer, Deniz Baş, Erhan Temür, Ceyda Dudak, Özlem Torun, TAMAMLANDI 2. Spektro- elektrokimyasal biyosensör geliştirilmesi: Yarı iletken nanokristallerin (kuantum noktalar) fotoakım özelliklerinin incelenmesi ve karakterizasyonu, TUBİTAK Projesi, Proje No: 107T244, Başlama Tarihi: Mayıs Proje Yürütücüsü: İsmail Hakkı Boyacı, Araştırmacı: Deniz Baş, TAMAMLANDI 3. Yarı iletken nanopartiküllerle işaretlenmiş antikorlarla E.coli tayini, TUBİTAK Projesi, Proje no: 104T409, Başlama Tarihi: Haziran Proje Yürütücüsü: İsmail Hakkı Boyacı, Araştırmacı: Deniz Baş, Ceyda Dudak, Kıvanç Kılıç, TAMAMLANDI * Tarihli Web of Science tarama sonuçlarına göre Araştırmacı ve/veya bursiyer olarak görev alınan projeler.

5 4. Transglutaminaz enzim üretimi ve süt sanayiinde kullanılma olanaklarının incelenmesi, Devlet Planlama Teşkilatı Projesi, Proje No: 2005K120680, Başlama Tarihi: Ocak 2005, Proje Yürütücüsü: Zübeyde Öner, Araştırmacı: Lütfü Çakmakçı, Aynur Gül Karahan, İsmail Hakkı Boyacı, İbrahim Çakır, Deniz Baş, Ceyda Dudak, Kıvanç Kılıç, TAMAMLANDI 5. Akıllı molekülün yüksek performanslı sıvı kromatografisi (HPLC) analizlerinde kullanılabilirliğinin incelenmesi: Gıda örneklerinde Staphylococcus enterotoksin B (SEB) tayininin gerçekleştirilmesi, TÜBİTAK Projesi, Proje No: 105O048, , Proje Yürütücüsü: İsmail Hakkı Boyacı, Araştırmacı: Deniz Baş, Ceyda Dudak, Kıvanç Kılıç, TAMAMLANDI 6. Gıda ve Tıp Alanlarında Kullanılan Enzimatik Test Kitlerinin Üretimi, Devlet Planlama Teşkilatı Projesi, Proje No: 03 K , , Proje Yürütücüsü: İsmail Hakkı Boyacı, Araştırmacı: Deniz Baş, Ceyda Dudak, TAMAMLANDI 7. Gıda ve Tıp Alanlarında Kullanılan Enzimatik Test Kitlerinin Üretimi, TUBİTAK Projesi, Proje No: TOVAG- 3294, Destek Projesi, Proje Yürütücüsü: İsmail Hakkı Boyacı, Araştırmacı: Deniz Baş, Ceyda Dudak, TAMAMLANDI 8. Aflatoksinin hızlı tayini için optik immunosensor hazırlanması, Hacettepe Üniversitesi, Bilimsel Araştırmalar Birimi Projesi, Proje No: , , Proje Yürütücüsü: İsmail Hakkı Boyacı, Araştırmacı: Ali Topçu, Deniz Baş, Ceyda Dudak, TAMAMLANDI BİLİMSEL ETKİNLİKLERDE GÖREV ALMA (BİLİMSEL VE YÖNETSEL) Uluslararası sempozyum ve kongrelerde (Düzenleme kurulu) 1. International Workshop on Plasma Polymers and Related Materials, European Co- operation in the Field of Scientific and Technical Research, COST 527 Plasma Polymers and Related Materials, 7-9 October 2004, Antalya, Turkey (Local Organization Committee, Düzenleme Kurulu)