ÖZGEÇMİŞ. 4. Öğrenim Durumu: Derece Alan Üniversite Yıl

Transkript

1 ÖZGEÇMİŞ 1. Adı Soyadı : Dilek 2. Soyadı : GÖKSEL DURU 3. Unvanı : Yrd. Doç. Dr. 4. Öğrenim Durumu: Derece Alan Üniversite Yıl Lisans Fizik Mühendisliği İstanbul Teknik Üniversitesi 1999 Lisansüstü Biyomedikal Mühendisliği Boğaziçi Üniversitesi 2002 PhD Doktora Biyomedikal Mühendisliği Boğaziçi Üniversitesi Akademik Ünvanlar: Yrd. Doç. Dr. - T.C. İstanbul Arel Üniversitesi Araştırma Görevlisi - Boğaziçi Üniversitesi Yarı Zamanlı Öğrenci Asistanı - İTÜ 6. Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri Sena ILGIN Implementation and Design of a Human Computer Interface Based on Wireless EEG Measurements (Lisans) 2015 Ivan Franchi A Position-based Artificial Intelligence Approach for Checkers (Lisans) 2015 Engin TANIŞ Face Recognition Using Principle Component Analysis (Lisans) 2016 Gamze Atabay & Güler Hakem Infrared Temperature Sensor Design for Patient Monitoring (Lisans) Yayınlar 7.1 Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler 1. A.D. Duru, D.G. Duru, S. Yumerhodzha, N. Bebek, Analysis of correlation between white matter changes and functional responses in thalamic stroke: a DTI & EEG study, Brain Imaging Behav., DOI /s , pp. 1-13, 10 May D. Erol Barkana, A. Açık, D. Goksel Duru, A.D. Duru, Surgical Interface for Kidney Tumor Cryoablation: User-Centered Design Approach, Theoretical Biology and Medical Modelling (TBioMed), 2014 May 7;11 Suppl 1:S4. doi: / S1-S4. Epub 2014 May 7. Erratum in Theor Biol Med Model. 11:48; Dilek Göksel Duru and Mehmed Özkan, Application of Self-Organizing Artificial Neural Networks on Simulated Diffusion Tensor Images, Mathematical Problems in Engineering, vol. 2013, Article ID , 13 pages, doi: /2013/690140, Dilek Göksel Duru and Mehmed Özkan, Determination of Neural Fiber Connections Based on Data Structure Algorithm, Computational Intelligence and Neuroscience, vol. 2010, Article ID , 6 pages, doi: /2010/

2 7.2 Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler 1. A.D. Duru, D.G. Duru, S. Yumerhodzha, S. Sencer, N. Bebek, Fractional Anisotropy Changes of Thalamic Stroke Patients: A TBSS Approach, 22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Geneva, Switzerland, June 26-30, Dilek Goksel Duru, Mehmed Ozkan, Self Organizing Feature Mapping Tractography (SOFMAT): An artificial neural network approach for DTI, 22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Geneva, Switzerland, June 26-30, Özcan-Çakır, C.E., Atış, E.S., Çotuk, H.B., Göksel-Duru, D., Duru, A.D., Changes in Neural Activity due to Posture Position, 21st annual Congress of the European College of Sport Science ECSS Vienna 2016, 6-9 July T.H. Balcıoğlu, D. Şahin, M. Assem, A.D. Duru, D. Göksel Duru, Technical Perception Assessment for Performance Enhancement of Elite Karate-Do Players by Gaze Characteristics Analysis: A Pilot Study, 13th International Sport Sciences Congress, p. 43, Konya, Turkey, 7-9 Nov Adil Deniz Duru, Zubeyir Bayraktaroglu, Elif Kurt, Cigdem Ulasoglu, Dilek Göksel Duru, Ahmet Ademoglu, Tamer Demiralp, Source concordance analysis of simultaneously recorded steady state visual evoked potentials and fmri, 20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Berlin, Germany, June Dilek Goksel Duru, Adil Deniz Duru, Duygun Erol Barkana, Oner Sanli, Mehmed Ozkan, Assessment of Surgeon s Stress Level and Alertness Using EEG during Laparoscopic Simple Nephrectomy, 6th International IEEE EMBS Conference on Neural Engineering, Sheraton San Diego Hotel & Marina, San Diego, CA, 6-8 November Dilek Goksel Duru, Mehmed Ozkan, Self-Organizing Maps for Brain Tractography in MRI, 6th International IEEE EMBS Conference on Neural Engineering, Sheraton San Diego Hotel & Marina, San Diego, CA, 6-8 November Barkana Erol D., Duru Goksel D., Duru A. D., Acik A., Ozkan M., Development and Evaluation of an Interface for Pre-Operative Planning of Cryoablation of a Kidney Tumor, 3rd Joint Workshop on New Technologies for Computer/Robot Assisted Surgery (CRAS), September , Verona, Italy. 9. Barkana Erol D.; Ozkan M.; Duru Goksel D.; Duru D.; Applying Human Factors for Design of a Kidney Tumor Cyroablation Surgical Interface, Computer Assisted Radiology and Surgery 27th International Congress and Exhibition (CARS), June 2013, Heidelberg, Germany. 10. Duygun Erol Barkana, Mehmed Ozkan, Fethi Calisir, Dilek Goksel Duru and Adil Deniz Duru, Development of a Surgical Interface for Cryoablation of Kidney Tumors, IWBBIO 2013 International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, Dilek Göksel Duru, Mehmed Özkan, Analysis of Diffusion Tensor Eigensystem Based on an Artificial Neural Network Approach, 28. Uluslararası Fizik Kongresi, Bodrum, 6-9 Eylül Dilek Göksel Duru, Mehmed Özkan, Implementation of an Artificial Neural Network Based Algorithm for Diffusion Tensor Tractography, 16th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Palau de Congressos de Catalunya, Barselona, 6-10 Haziran Goksel Duru D., Ozkan M., Determination of Neural Fiber Connections Based on Data Structure Algorithm, 7th International Symposium on Noninvasive Functional Source Imaging of the Brain and Heart & 7th International Conference on Bioelectromagnetism, Engineering Faculty of Rome, Roma, İtalya, Mayıs Göksel Duru D., Özkan M., Fiber Tracking Based on Unsupervised Learning, Proceedings of the 4th International IEEE EMBS Conference on Neural Engineering, p , Antalya, Türkiye, 29 Nisan 2 Mayıs

3 15. Goksel Duru D., Ozkan M., Self Organizing Feature Maps for the Fiber Tracking in Diffusion Tensor MR Images, The 4th Institution of Engineering and Technology International Conference on Advances in Medical, Signal and Information Processing MEDSIP 2008, Lido Palace Hotel, Santa Margherita Ligure, İtalya, Temmuz Goksel Duru D., Ozkan M., SOM Based Diffusion Tensor MR Analysis, 5th International Symposium on Image and Signal Processing and Analysis ISPA 2007, p , Digital Object Identifier /ISPA , Eylül 27-29, Goksel Duru D., Ozkan M., Fiber Tracking: A Recursive Stack Algorithmic Approach, 29th International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society in conjunction with the Biennial Conference of the French Society of Biological and Medical Engineering (SFGBM), Lyon, Fransa, Ağustos, Goksel Duru D., Ozkan M., Diffusion Tensor MR Imaging: Simulated Dataset for Verification and Validation of DT-MRI Analyzing Tools, International Workshop on Image Analysis in the Life Sciences, Theory and Applications, Linz, Avusturya, 28 Şubat 2 Mart Goksel D., Ozkan M., Towards rapid analysis of diffusion tensor MR imaging, European Radiology, vol. 16(1), p. 286, Feb Goksel D., Ozkan M., Simulated Dataset for Verification & Validation of DT-MRI Analyzing Tools, Proceedings of 28th IEEE EMBS Annual International Conference, New York, s , Göksel D., Özkan M., Simulated Diffusion Tensor MR Imaging (DT-MRI) Dataset for Verification and Validation of DT Analyzing Tools, Proceeding Book of 5th International Conference on Advanced Engineering Design AED 2006, vol. 5, pp , ISBN number Yazılan Uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler 1. Duru, DG, ve Özkan, M, Data Structure and Software Engineering Challenges and Improvements, Edited by James L. Antonakos, Pages 42 52, Print ISBN: , ebook ISBN: , DOI: /b , Apple Academic Press, Oct Dilek Göksel Duru, A Hebbian Learning Approach for Diffusion Tensor Analysis and Tractography, New Advances in Machine Learning, ISBN , InTech Press, p , Goksel Duru D., Ozkan M., Generating Simulated DT-MRI Dataset, Encyclopedia of Healthcare Information Systems, Information Science Reference, ISBN , Publisher Medical Information Science Reference IGI Global, p , Ulusal Dergilerdeki Yayınlar 7.5 Ulusal Bilimsel Toplantılarda Sunulan ve Bildiri Kitabında Basılan Bildiriler 1. Dilek Göksel Duru, Adil Deniz Duru, Mental İşyükü Paradigması Sırasında Oluşan Elektrofizyolojik Özniteliklerin İncelenmesi, 26. IEEE SİU, Zonguldak, Mayıs Umut Taner, Selin İşoğlu, Esin Yıldırım, Elif Işıkçı Koca, Dilek Göksel Duru, Maksimum Oksijen Tüketimi ile Elektrofizyolojik Ölçümler Arasındaki İlişkinin Analizi, IEEE EBBT2016, İstanbul, Nisan Dilek Göksel Duru, Beyinde anatomik bağlantısallık kestirimi, 19. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT) Kitapçığı, (Davetli Konuşmacı), Kasım E. Işıkçı Koca ve D. Göksel Duru, Multipl Skleroz Manyetik Rezonans Görüntülerinde Aktif Kontur Modeli ile Lezyon Tespiti (Extraction of Multiple Sclerosis Lesions in MR 3

4 Images Based on Active Contours), Tıp Teknolojileri Ulusal Kongresi 2015 (TıpTekno 15) Kitapçığı, pp. 1-4, Ekim S. Ilgın ve D. Göksel Duru, Kablosuz EEG Ölçümlerine Dayalı Beyin Bilgisayar Arayüzü Tasarımı ve Uygulaması, Tıp Teknolojileri Ulusal Kongresi 2015 (TıpTekno 15) Kitapçığı, pp. 1-4, Ekim D. Göksel Duru, S. Yumerhodzha, A.D. Duru, S. Sencer, N. Bebek, Yolak Tabanlı Uzaysal İstatistik ile Talamik İnme Sonrası Anatomik Bağlantısallık Değişimlerinin İncelenmesi, Tıp Teknolojileri Ulusal Kongresi 2015 (TıpTekno 15) Kitapçığı, pp. 1-4, Ekim T.H. Balcıoğlu, D. Şahin, M. Assem, S.B. Selman, D. Göksel Duru, Göz Hareketleri Takibi ile Elit Spor cularda Bakış Karakteristikleri Analizi: Pilot Çalışma (Analysis of gaze characteristics with eye tracking in elite athletes: A pilot study), 18th National Biomedical Engineering Meeting (BIYOMUT), p.1-4, Oct S. Yumerhodzha, D.G. Duru, A.D. Duru, N. Bebek, Talamik İnmede Ak Madde Değişimleri (White matter changes in thalamic stroke), 18th National Biomedical Engineering Meeting (BIYOMUT), p.1-4, Oct D. Göksel Duru ve A.D. Duru, Yolak Tabanlı Uzaysal İstatistik Uygulaması (Application of Tract Based Spatial Statistics, Elektrik-Elektronik, Bilgisayar, Biyomedikal Mühendislikleri Bilimsel Toplantısı (EBBT) Kitapçığı, pp , Mayıs D. Göksel Duru ve A.D. Duru, Beyin fiber traktografi hesaplamalarında kruskal asgari tarama ağacı yaklaşımı, IEEE 22. Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları Kurultayı Kitapçığı, p , Nisan Dilek Göksel Duru and Mehmed Özkan, Gözetimsiz Öğrenmeye Dayalı Difüzyon Tensör Traktografi, 15. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, Nisan 2010, Antalya. 12. Göksel Duru D., Özkan M., Özyineli Yığıt Veri Yapısı Kullanılarak Yolak Takibi, 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, İzmir, Mayıs Goksel Duru D., Ozkan M., Difüzyon Tensör Görüntülemede Önyükleme Yöntemi Uygulamaları, Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı Bildiriler Kitabı, s , Boğaziçi Üniversitesi, İstanbul, Goksel Duru D., Ozkan M., DT-MRG ile Beyin Analizi, Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı Bildiriler Kitabı, s , Boğaziçi Üniversitesi, İstanbul, Goksel Duru D., Ozkan M., Difüzyon Tensör MR Analizi: Kardiyak Uygulama, Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı Bildiriler Kitabı, s , Boğaziçi Üniversitesi, İstanbul, Göksel D., Özkan M., Difüzyon Tensör MR Analizi Doğrulamasi Ve Geçerliliği Amaçli Sentetik Görüntü Seti, Biyomut 2006 Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, s , Mayıs Göksel D., Özkan M., Difüzyon Tensör MR Görüntüleme, Biyomut 2005, s , İstanbul, Mayıs Diğer Yayınlar Ph.D. Thesis: Diffusion Tensor Fiber Tracking with Self-Organizing Feature Maps (Boğaziçi Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü) M.Sc. Thesis: Cardiac Motion Analysis in MRI for Classification (Boğaziçi Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü) 4

5 NTV Bilim Dergisi muhtelif sayılarında bilimsel makaleler yayımlamıştır. Seçili olanlar : D. Göksel Duru, Bisiklet : Sürmesi kolay hesabı zor.., NTV Bilim Dergisi, s.18, D. Göksel Duru, Kaplumbağa hesabı nasıl yapılır?, NTV Bilim Dergisi, s.19, D. Göksel Duru, Epileptik odak nerede?, NTV Bilim Dergisi, s.20, D. Göksel Duru, 0,2 saniye aşık olmaya yeter mi?, NTV Bilim Dergisi, s.nisan, D. Göksel Duru, Yürüme Mekaniği, NTV Bilim Dergisi, s.mart, D. Göksel Duru, Renkler ve Duygular, NTV Bilim Dergisi, s.mayıs, Projeler Uluslararası: ISUR - Intelligent Surgical Robotics Başlıklı Avrupa Birliği Yedinci Çerçeve Programı Projesi - Proje Mühendisi (Bütçe: TL) Ulusal: Boğaziçi Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri, Biyo-Medikal Mühendisliği Enstitüsü, Beyin Sinir Yolakları ve Perfüze Doku Füzyonu İle Stereotaktik Cerrahi, Araştırmacı, Proje Kodu: 07HX104D. (Bütçe: TL) 9. İdari Görevler İstanbul Arel Üniversitesi Mühendislik-Mimarlık Fakültesi Dekan Yardımcısı (15 Ekim 2015 Günümüz) İstanbul Arel Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Bölüm Başkan Yardımcısı (2014 Günümüz) 10. Bilimsel kuruluşlara Üyelikler IEEE IEEE-EMBS 11. Ödüller Boğaziçi Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü Onur Ödülü Prof. Dr. Necmi Tanyolaç Ödülü 23. Uluslararası IEEE-EMBC Konferansı, Öğrenci Makale Yarışması Finalisti, 2001 ISMRM (International Society of MR in Medicine), Öğrenci bursu, 2002 Whitaker Öğrenci Destek Ödülü, 2002 EMBEC'02, Öğrenci Yarışması Finalisti, Viyana Boğaziçi Üniversitesi Vakfı, Akademik Destek Ödülü, 2002 Siemens Medical Solutions, Akademik Destek, 2004 Boğaziçi Üniversitesi Vakfı, Akademik Destek Ödülü, 2006 AED 2006 En İyi Öğrenci Sunum Ödülü (4.), 2006 Boğaziçi Üniversitesi Vakfı, Akademik Destek Ödülü, 2007 Boğaziçi Üniversitesi Vakfı, Akademik Destek Ödülü,

6 TÜBİTAK Genç Araştırmacı Bursu, Mart 2009 Boğaziçi Üniversitesi Vakfı, Akademik Destek Ödülü, 2009 TÜBİTAK BİDEB Bursiyeri, Mayıs 2009 Boğaziçi Üniversitesi Vakfı, Akademik Destek Ödülü, 2010 BİYOMUT En İyi Sunum Ödülü 2011 Boğaziçi Üniversitesi Vakfı, Akademik Destek Ödülü, Son iki yılda Verdiğiniz Lisans ve Lisansüstü düzeydeki dersler Akademik yıl Dersin Kodu ve Adı Haftalık Saat Öğrenci Sayısı Ders Uyg. Lab. 2015/2016 Bahar 6BIOMAU009 Biyomedikal İşaret İşleme 6CENOAE008 Artificial Intelligence EENOAS405 Graduation Project CENOAE498 Graduation Project EENOAE020 Data Analysis and Decision Making MTCOAE403 Artificial Intelligence CEN356 Artificial Intelligence CEN462 Data Analysis and Decision Making /2016 Güz 6BIOMAU005 Biyomedikal Enstrümantasyon I 6BMHTBA001 Programlamaya Giriş-I EENOAS405 Graduation Project CENOAS009 Applied Informatics CEN498 Applied Informatics /2015 Bahar 6EEMTBA011 Elektromanyetik Alan ve Dalga Teorisi MTCOAE401 Graduation Project

7 6MTCBSA101 Linear Algebra MTH111 Linear Algebra (with Matlab) CEN496 Human Computer Interaction EEN492 Graduation Project /2015 Güz EEN491 Graduation Project /2014 Bahar 6MMFTBA008 Fizik II MMFTBA008 Fizik II MTCBSA108 Physics II MTH108 Physics II CEN356 Artificial Intelligence İş Deneyimleri (İş Deneyimi, Profesyonel Kurslar ve Diğer) ISUR - Intelligent Surgical Robotics Başlıklı Avrupa Birliği Yedinci Çerçeve Programı Projesi - Proje Mühendisi 2013 İstanbul Arel Üniversitesi Öğretim Üyesi Boğaziçi Üniversitesi Araştırma Görevlisi İ.T.Ü. Yarı Zamanlı Öğrenci Asistanlığı Swissair 1996 International Hospital İstanbul Biyomedikal Departmanı 1995 THY Enformasyon Sistemleri Elektronik Uygulamalar alanında Stajyer Sağlık Teknolojileri Kuluçka Merkezi Uygulamalı Girişimcilik Sertifikası, 2013 VIII. Ulusal Sinirbilimleri Kongresi, Multimodal Nörogörüntüleme Çalıştayı, Bolu, Mart 2009 ESMRMB Lectures on Diffusion Imaging, Diffusion: From basic Physics to Exploration of Microscopic Structure, Freiburg, Almanya, Eylül 19-21, 2005 ESMRMB Applied MR Techniques, Advanced Course, İstanbul, Eylül 8-10,

8 6th IEEE EMBS Summer School on Biomedical Imaging, Berder Island, Fransa, Haziran 19-27, 2004 Cebit Eurasia Future Park Talks, Motion Analysis of Tagged Cardiac Magnetic Resonance Images, Eylül 2-7, LAUTERBUR LECTURE: MRI - From Beginnings to Maybe, Paul C. Lauterbur, ISMRM 10th Scientific Meeting and Exhibition, Hawai i, 2002 İdari Görevler: İstanbul Arel Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Bölüm Başkan Yrd İstanbul Arel Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi Dekan Yrd Mayıs -.. İstanbul Arel Üniversitesi ArtıArel Kuluçka ve Girişimcilik Uygulama ve Araştırma Merkezi Md. 8