Dinçer GÖKSÜLÜK. Hacettepe Üniversitesi, Biyoistatistik Anabilim Dalı, Sıhhiye Yerleşkesi ANKARA. Telefon: (312) Faks: (312)

Transkript

1 Dinçer GÖKSÜLÜK Hacettepe Üniversitesi, Biyoistatistik Anabilim Dalı, Sıhhiye Yerleşkesi ANKARA Telefon: (312) Faks: (312) dincer.goksuluk@hacettepe.edu.tr dincer.goksuluk@metu.edu.tr EĞİTİM Bütünleşik Doktora, Biyoistatistik, Tıp Fakültesi, Hacettepe Üniversitesi Doktora, İstatistik, Fen Fakültesi, Orta Doğu Teknik Üniversitesi Yüksek Lisans, İstatistik, Fen Fakültesi, Dokuz Eylül Üniversitesi Lisans, İstatistik, Fen Fakültesi, Dokuz Eylül Üniversitesi ALDIĞI ÜNVANLAR Araştırma Görevlisi: Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Biyoistatistik ABD., İŞ DENEYİMİ , Yedek Parça ve Stok Sorumlusu, ERÖZ Otomotiv - AUDI İLGİ ALANLARI - Genel Lineer Modeller - Proteomik (Proteomics) - Çok Değişkenli İstatistiksel Analizler - Transcriptomics - Kategorik Veri Analizi - Yeni nesil dizileme (NGS) - Güvenilirlik Analizi - Deney Tasarımları - Panel Veri Analizleri YABANCI DİL ve BİLGİSAYAR BECERİSİ İngilizce (KPDS) : İngilizce (ÜDS) : SAS Giriş Seviyesi Matlab, Maple, Orange - Orta Seviye 1

2 R Çok İyi SPSS, MINITAB İyi KURSLAR 1. Bilgisayar Uygulamalı Yapısal Eşitlik Modellemesi (Prof. Dr. Kazım Özdamar). Biyoistatistik Anabilim Dalı, Osmangazi Üniversitesi Şubat Eskişehir, TÜRKİYE. 2. Generalized Linear Mixed Models with Applications in Medicine. Ege Üniversitesi, University of Southampton, University of Reading Ortak Programı, Mayıs Çeşme, İzmir TÜRKİYE. 3. Evidence-Based Medicine for Clinicians. Weill Cornell Medical College Ocak PROJELER 1. RNA-Dizileme Verilerinin Sınıflandırılmasında Yeni İstatistiksel Öğrenme Yaklaşımları, Ass.Prof.Dr. Ahmet Ozturk. Erciyes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Birimi, TDK : (29,944 TL) 2. Leylekten Günümüze Üreme Sağlığı (LGUS, 2006). Dokuz Eylül Üniversitesi Sağlık Kültür Spor Dairesi (Koordinatör, Dr. Dilek GÜLDAL). Destekleyen Kuruluşlar: İl Sağlık Müdürlüğü, Buca Belediyesi, Türk Aile Hekimleri Uzmanları Derneği İzmir Şubesi. İstatistiksel Analizler ve Raporlama. ÖDÜLLER 1. Gevher Nesibe Geleneksel Araştırma Teşvik Ödülü, Birincilik (2015) Travma dışı akut karınlı hastaların tanısında istatistiksel öğrenme yöntemleri (Sözlü Bildiri). Kayseri Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi. Kayseri, TÜRKİYE 2. Sözlü Sunum Birincilik Ödülü (2015) - Diagonal Discriminant Analysis for Gene-Expression Based Tumor Classification, 3 rd International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, Hong Kong. 3. Young Statistician Showcase, Asya Kıtası Birincilik Ödülü (2014) - Classification of RNA-Seq data via bagging support vector machines(sözlü Bildiri). 27th International Biometric Conference (IBC), İTALYA. 4. Gevher Nesibe Araştırma Teşvik Ödülü, Birincilik (2014) - Yeni Nesil Dizileme Sistemleri İçin Veri Madenciliği Aracı (Sözlü Bildiri). Kayseri Erciyes Üniversitesi, Tıp Fakültesi. Kayseri, TÜRKİYE 5. Sözlü Sunum Birincilik Ödülü (2014) RNA-dizileme verileri ile gen ekspresyonuna dayalı sınıflandırmada yeni bir yaklaşımve MLSeq R/Bioconductor yazılımı. 16. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Antalya, TÜRKİYE. 2

3 YAYINLAR SCI, SSCI, AHCI İndeksli Yayınlar 1. Akkaya N., Yılancı H. Ö., Goksuluk D. (2015). Applicability of Demirjian s four methods and Willems method for age estimation in a sample of Turkish children. Legal Med, 2. Korkmaz S., Zararsiz G., Goksuluk D. (2015) MLViS: A Web Tool for Machine Learning-Based Virtual Screening in Early-Phase of Drug Discovery and Development. PLoS ONE 10(4): e doi: /journal.pone Korkmaz S., Goksuluk D., Zararsiz G. (2014). MVN: An R Package for Assessing Multivariate Normality. The R Journal, 6(2): Korkmaz S., Zararsiz G., Goksuluk D. (2014). Drug/nondrug classification using Support Vector Machines with various feature selection strategies. Computer methods and programs in biomedicine, 117(2), Diğer Yayınlar 1. Zararsiz G, Korkmaz S, Goksuluk D, Eldem V, and Ozturk A. (2015). Diagonal Discriminant Analysis for Gene-Expression Based Tumor Classification. Journal of Advances in Information Technology, 6(2), doi: /jait Zararsiz G., Eldem V., Korkmaz S., Göksülük D., Duru İ.P., Ünver T., Karabulut E., Öztürk A. (2014). Diagonal Discriminant Analysis For Gene-Expression Based Tumor Classification, WIT Transactions on Information and Communication Technologies, no.1, pp.1-5, Korkmaz S, Goksuluk D and Zararsiz G. (2014). MVN: Multivariate Normality Tests. R package version Zararsiz G, Goksuluk D, Korkmaz S, Eldem V, Duru Izzet P, Unver T and Ozturk A. (2014). MLSeq: Machine learning interface for RNA-Seq data. R package version

4 Uluslararası Bilimsel Toplantılarda Sunulan Bildiriler 1. Goksuluk D, Korkmaz S, Zararsiz G, easyroc: an interactive web-tool for ROC analysis, The user! Conference 2015, Aalborg-DENMARK, June 30 - July 3, Zararsiz G, Akyildiz HY, Goksuluk D, Korkmaz S, Ozturk A, DDNAA: Decision Support System for Differential Diagnosis of Nontraumatic Acute Abdomen, The user! Conference 2015, Aalborg- DENMARK, June 30 - July 3, Zararsiz G, Goksuluk D, Korkmaz S, Eldem V, Duru IP, Unver T, Ozturk A, MLSeq: Machine Learning Interface for RNA-Seq Data, The user! Conference 2015, Aalborg-DENMARK, June 30 - July 3, Göksülük D., Zararsız G., Korkmaz S., Karaağaoğlu A. E. (2015). Negative binomial linear discriminant analysis for the classification of RNA-Seq data, The 8th Conference of Eastern Mediterranean Region International Biometric Society (EMR-IBS), Mayıs 2015, Kapadokya, Türkiye. 5. Zararsız G., Akyıldız H. Y., Göksülük D., Korkmaz S., Öztürk A. (2015). Statistical learning approaches in diagnosing patients with nontraumatic acute abdomen, The 8th Conference of Eastern Mediterranean Region International Biometric Society (EMR-IBS), Mayıs 2015, Kapadokya, Türkiye. 6. Konar N. M., Karaismailoğlu E., Göksülük D, Karaağaoğlu A. E. (2015). The effect of correlation structure between diagnostic tests on net reclassification improvement (NRI) and integrated discrimination improvement (IDI), The 8th Conference of Eastern Mediterranean Region International Biometric Society (EMR-IBS), Mayıs 2015, Kapadokya, Türkiye. 7. Zararsiz G., Eldem V., Korkmaz S., Göksülük D., Duru I.P., Unver T., Karabulut E., Öztürk A. (2015). Diagonal Discriminant Analysis For Gene-Expression Based Tumor Classification, International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICBCB 2015), Hong Kong, HONGKONG, Mart Göksülük D., Korkmaz S., Zararsız G., Karaağaoğlu A. E. (2014). Ensemble Machine Learning Approach For Biomarker Discovery Using Mass-Spectrometry Based Proteomics Data, 27th International Biometric Conference (IBC), 6-11 Temmuz 2014, Floransa, İTALYA. 9. Zararsız G., Göksülük D., Korkmaz S., Eldem V., Unver T. (2014). Classification of RNA-Seq data via bagging support vector machines, 27th International Biometric Conference (IBC), 6-11 Temmuz 2014, Floransa, İTALYA. 10. Korkmaz S., Zararsız G., Göksülük D., Saraçbaşı O. (2014). Homology Modeling Using Machine Learning Approach, 27th International Biometric Conference (IBC), 6-11 Temmuz 2014, Floransa, İTALYA. 11. Korkmaz S., Göksülük D., Zararsız G. (2013). bbrvm: An R package for Ensemble Classification Approaches of Relevance Vector Machine, The R User Conference, Temmuz, Albacete, İSPANYA. 12. Göksülük D., Gürler S., Eliiyi D. T. (2013). A Bayesian Approach to Preventive Maintenance Optimization in Unreliable Systems, 26th European Conference on Operational Research (EURO-INFORMS), 1-4 Temmuz, Roma, İTALYA. 13. Göksülük D., Alın A. Penalized Logistic Regression when Multicollinearity Exists Among the Predictors. New Developments in Theory and Applications of Statistics (NEDETAS), Mayıs Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Ankara - TÜRKİYE. 4

5 Ulusal Bilimsel Toplantılarda Sunulan Bildiriler 1. Göksülük D., Korkmaz S., Zararsiz G., Karaağaoğlu A. E. Kütle spektrometrisine dayalı proteomik verilerinin ensemble veri madenciliği yöntemleri ile sınıflandırılması. XVI. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Eylül 2014, Ankara Üniversitesi, Antalya, TÜRKİYE. 2. Zararsiz G., Göksülük D., Korkmaz S., Eldem V., Duru İ. P., Ünevr T., Öztürk A. RNA-dizileme verileri ile gen ekspresyonuna dayalı sınıflandırmada yeni bir yaklaşımve MLSeq R/Bioconductor yazılımı. XVI. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Eylül 2014, Ankara Üniversitesi, Antalya, TÜRKİYE. 3. Korkmaz S., Zararsiz G., Göksülük D., Saraçbaşı O. Makine öğrenimi yaklaşımı ile homolog protein tespiti. XVI. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Eylül 2014, Ankara Üniversitesi, Antalya, TÜRKİYE. 4. Korkmaz S., Göksülük D., Zararsiz G. MVN: Çok değişkenli normal dağılıma uygunluğun belirlenmesi için bir R paketi. XVI. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Eylül 2014, Ankara Üniversitesi, Antalya, TÜRKİYE. 5. Göksülük D., Zararsiz G., Korkmaz S., Eldem V., Duru İ. P. RNA-Dizileme verilerinde kullanılan anlamlılık testlerine ilişkin hesaplama sürelerinin karşılaştırılması (Poster). XVI. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Eylül 2014, Ankara Üniversitesi, Antalya, TÜRKİYE. 6. Zararsız G., Eldem V., Korkmaz S., Göksülük D., Duru İ. P., Ünver T., Öztürk A. De-Brujin grafikleri ile De Novo genom dizileme analizleri (Poster). XVI. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Eylül 2014, Ankara Üniversitesi, Antalya, TÜRKİYE. 7. Zararsız G., Korkmaz S., Göksülük D., Eldem V., Öztürk A. RNA-Dizileme verilerinin istatistiksel değerlendirilmesi (Poster). XVI. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Eylül 2014, Ankara Üniversitesi, Antalya, TÜRKİYE. 8. Gürler S., Eliiyi D. T., Göksülük D., Şahin A. Determining Preventive Maintenance Times in Unreliable Systems with Bayesian Method. İstatistik Günleri Sempozyumu (İGS), Haziran Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Ankara - TÜRKİYE. 9. Göksülük D., Alın A., Emrem E., Telci B. K. Çoklu Doğrusal Bağlantı Durumunda Kullanılan İki Alternatif Regresyon Yöntemi: Temel Bileşenler Regresyon Yöntemi (PCR) ve Kısmi En Küçük Kareler Regresyon Yöntemi (PLS). V. İstatistik Kolokyumu, 6-7 Mayıs, Selçuk Üniversitesi, Konya. TÜRKİYE. 5

6 KONGRELER / SEMPOZYUMLAR Katıldığı Uluslararası Toplantılar 1. The R User Conference 2015, June 30 July , Aalborg - DENMARK 2. The 8 th Conference of Eastern Mediterranean Region International Biometric Society (EMR-IBS), Mayıs 2015, Kapadokya, Nevşehir, TÜRKİYE th International Biometric Conference (IBC), 6-11 Temmuz International Biometric Society, Floransa, İTALYA th European Conference on Operational Research (EURO-INFORMS), 1-4 Temmuz Sapienza University of Rome, Roma, İTALYA. 5. The R User Conference 2013, Temmuz. University of Castilla La-Mancha, Albacete, İSPANYA. 6. New Developments in Theory and Applications of Statistics (NEDETAS). Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Ankara, TÜRKİYE. Mayıs 2-4, Katıldığı Ulusal Toplantılar Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Eylül 2014, Ankara Üniversitesi, Antalya, TÜRKİYE. 2. Uluslararası Katılımlı 15. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, Ağustos Adnan Menderes Üniversitesi, Aydın, TÜRKİYE. 3. VII. İstatistik Günleri Sempozyumu (İGS). Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Ankara, Türkiye. Haziran 28-30, V. İstatistik Kolokyumu. Selçuk Üniversitesi. Konya, TÜRKİYE. 6-7 Mayıs, KİTAP ve KİTAP BÖLÜMLERİ 1. Göksülük, D. Epidemiolojik raporların yorumlanması (Ek-1). sayfa: (Günalp G. S. Klinik Jinekolojik Endikronoloji ve İnfertilite, 8. Baskı. Güneş Tıp Kitabevi. (Çeviri Kitap: Fritz M. A., Speroff L. Clinical Gynecologic Endocrinology and Infertility, Eighth Edition.)) 6

7 YAZILIM / Web-UYGULAMALARI 1. easyroc: An interactive web-tool for ROC analysis (web-uygulaması). url: 2. DDNAA: Decision support system for differential diagnosis of nontraumatic acute abdomen (web-uygulaması), url: 3. MVN: a web-tool for assessing multivariate normality (web-uygulaması). url: 4. MVN: Multivariate normality tests. R Paketi (Yazılım). url: 5. MLViS: Machine-learning based visual screening (web-uygulaması). url: 6. MLSeq: Machine-learning interface for RNA-Seq data. R/Bioconductor Paketi (Yazılım). url: 7. voomdda: Discovery of diagnostic biomarkers and classification of RNA-Seq data (webuygulaması). url: 7