Curriculum Vitae. Title Department University Year/Period Research Assistant Molecular Biology and Halic University

Transkript

1 Curriculum Vitae 1. Name Surname: Özge Çelik Contact information Address: Istanbul Kultur University Faculty of Science and Letters Department of Molecular Biology and Genetics Ataköy, Istanbul/Turkey Phone: ocelik@iku.edu.tr 2. Date of Birth: Title: Assoc. Prof. Dr. 4. Education: Degree Field University Year Bachelor Biology Istanbul University 2001 Master Pharmaceutical Biotechnology Marmara University 2005 Doctorate Biology/Radiobiology Istanbul University Academic Titles Title Department University Year/Period Research Assistant Molecular Biology and Halic University Genetics Research Assistant Molecular Biology and Istanbul Kultur University Genetics Assist. Prof.Dr. Molecular Biology and Istanbul Kultur University Genetics Assoc. Prof. Dr. Molecular Biology and Genetics Istanbul Kultur University Publications 6.1 Articles published in peer reviewed international journals 1. Özge Çelik, Çimen Atak, Zekiye Suludere. Response of soybean plants to gamma radiation: Biochemical analyses and expression patterns of trichome development. Plant Omics Journal 7(5): , Özge Çelik, Çimen Atak. RAPD analysis of salt tolerant tobacco mutants generated by gamma radiation. Genetics and Molecular Research, In Press. Page 1 of 10

2 3. Özge Çelik, Selin Gül Ünsal. Expression analysis of proline metabolism-related genes in salt-tolerant soybean mutant plants. Plant Omics Journal 6(5): , Sevim Akyüz, Tanıl Akyüz, Özge Çelik, Çimen Atak. FTIR and EDXRF investigations of salt tolerant soybean mutants. Journal of Molecular Structure 1044: 67-71, Özge Çelik, Çimen Atak. The effect of salt stress on antioxidative enzymes and proline content of two Turkish tobacco varieties. Turkish Journal of Biology, 36(3): , Özge Çelik, Çimen Atak. Evaluation of the proline accumulation and Δ - pyrroline-5- carboxylate synthetase (P5CS) gene expression during salinity stress in two soybean (Glycine max L. Merr.) varieties. Polish Journal of Environmental Studies, 21(3): , Çimen Atak, Özge Çelik, Leyla Açık. Genetic Analysis of Rhododendron mutants using random Amplified Polymorphic DNA (RAPD). Pakistan Journal of Botany 43(2): , Çolak; V. Antar; A. Karaoglan; O. Akdemir; E. Sahan; Ö. Çelik and A. Sagmanligil. Q-VD-Oph, a pancaspase inhibitor, reduces trauma-induced apoptosis and improves the recovery of hind-limb function in rats after spinal cord injury. Neurocirugia 20 (6): , Çolak, M. Kaya, A. Karaoğlan, A. Sağmanlıgil, O. Akdemir, E. Şahan, Ö. Çelik. Calpain inhibitor AK 295 inhibits calpain-induced apoptosis and improves neurologic function after traumatic spinal cord injury in rats. Neurocirugia 20 (3): , Çimen Atak, Özge Çelik. Micropropagation of Anthurium adreanum from leaf explants. Pakistan Journal of Botany, 41(3): , Özge Çelik, Nihal Büyükuslu, Çimen Atak, Aitekin Rzakoulieva, The effects of magnetic field on the activity of superoxide dismutase and catalase in Glycine max (L.)Merr. roots. Polish J. Environ Studies, 18(2): , Ahmet Çolak, Bilal Kelten, Ayhan Sağmanlıgil, Osman Akdemir, Alper Karaoğlan, Elife Şahan, Özge Çelik, Şeref Barut. Tauroursodeoxycholic acid and secondary damage after spinal cord injury in rats. Journal of Clinical Neuroscience, 15, , Atak, Ç. Çelik, Ö., Olgun, A., Alikamanoğlu,S. Rzakoulieva A. Effect of magnetic field on peroxidase activities of soybean tissue culture. Biotechnology & Biotechnolojical Equipment.21(2): , Özge Çelik, Jülide Akbuğa. Preparation of superoxide dismutase loaded chitosan microspheres: Characterization and release studies. European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics 66:42-47, Özge Çelik, Çimen Atak, Aitekin Rzakulieva, Stimulation of rapid regeneration by a magnetic field in Paulownia node cultures. Journal of Central European Agriculture, Vol 9, No.2, , Papers delivered in international conferences and printed as proceedings 1. Sevim Akyüz, Tanıl Akyüz, Özge Çelik, Çimen Atak. FTIR and EDXRF ınvestigations of the second generations of salt tolerant soybean mutants. 31st European Congress on Molecular Spectroscopy, 2012, p 111, Ağustos 2012, Romania. Page 2 of 10

3 2. Çelik, Ö., Atak, Ç., Örnektekin, S., Olgun, A. Preliminary study on radiosensitivity of two tomato (Lycopersicon esculentum L.) lines. Kırgızistan Birinci Uluslararası Biyoloji Kongresi, 2012, p , Eylül 2012, Kırgızistan- Turkey Manas University, Bishkek, KIRGIZİSTAN 3. Atak, Ç., Çelik, Ö., Olgun, A., Erdoğmuş, M. Induction and selection of salt tolerant soybean (Glycine max L. Merr) Mutants. Kırgızistan Birinci Uluslararası Biyoloji Kongresi, 2012, p , Eylül 2012, Kırgızistan-Turkey Manas University, Bishkek, KIRGIZİSTAN 4. Özge Çelik, Çimen Atak. The Comparison of P5CS Gene Expressions of Two Soybean Varieties Under Salt Stress In Vitro Biology Meeting, In Vitro Cellular and Development Biology-Plant, 47, P Özge Çelik, Çimen Atak. Selection and Molecular Profiling Of Salt Tolerant Tobacco Plants Obtained By Gamma Radiation. In Vitro Cellular and Development Biology-Animal, 2010 In Vitro Biology Meeting and IAPB 12th World Congress Abstract Issue, P Özge Çelik, Zekiye Suludere, Çimen Atak. Effects of Salinity Stress On Densities Of Trichomes, Glandular Trichomes And Stomata In Two Soybean Varieties. In Vitro Cellular and Development Biology-Animal, 2010 In Vitro Biology Meeting and IAPB 12th World Congress Abstract Issue, P Özge Çelik, Çimen Atak. In vitro and in vivo investigaton of salt tolerance in two oriental tobacco (Nicotiana tabacum L.) species. In Vitro Cellular and Development Biology-Animal, 2009 Meeting on In Vitro Biology abstract Issue, Vol.45, s 71-72, Ö. Çelik, Ç.Atak, N. Büyükuslu, The effects of magnetic field on germinatation of soybean seeds and on the activity of superoxide dismutase and catalase. In Vitro Cellular and Developmental Biology-Animal, Vol 43, s49-50, Özge Çelik, Jülide Akbuğa, Evaluation of Superoxide dismutase loaded microspheres. EUFEPS Workshop on Optimising Biotech Medicines: Second- Generation Pharmaceutical Proteins, p 38, January 11-12, 2007, Munich, Germany. 10. Özge Çelik, Jülide Akbuğa, Development of Superoxide Dismutase Loaded Microspheres. 2 nd European Congress on Life Science Process Technology, Nürnberg, Germany, March Books and sections in books published internationally 1. Özge Çelik. Biochemical Markers of Plant Salt Tolerance: Comparative Investigation on Antioxidative Metabolism. Lambert Academic Publishing, 2012, ISBN-10: Page 3 of 10

4 2. Çimen Atak, Özge Çelik. Micropropagation of Anthurium spp. Plant Science (Editörler: Dr. Nabin Kumar Dhal, Dr. Sudam Charan Sahu), Chapter No. 10, InTech Open Science, 2012, ISBN Çimen Atak, Özge Çelik. Hücre Biyolojisi Laboratuvarı. T.C. İstanbul Kültür Üniversitesi, 2011 II. Baskı, 2009 I. Baskı, ISBN Articles published in peer reviewed national journals 1. N. Büyükuslu, Ö. Çelik, Ç. Atak, The effects of magnetic field on the activity of superoxide dismutase. Journal of Cell and Molecular Biology,5:57-62, Ç. Atak, Ö. Emiroğlu, S. Alikamanoğlu, A. Rzakoulieva, Stimulation of regeneration by magnetic field in soybean (Glycine max L. Merrill) tissue cultures. Journal of Cell and Molecular Biology, 2: , Papers delivered at national conferences and printed as proceedings 1. Özge Çelik, Çimen Atak, Zekiye Suludere. Tuza Toleranslı Ttütün Mutantlarında Yaprak Tüylerinin Ultrastrüktürel İncelenmesi. Uluslararası Katılımlı 20. Ulusal Elektron Mikroskopi Kongresi, Ekim 2011, Antalya. 2. Özge Çelik, Çimen Atak, Zekiye Suludere. Gama Radyasyonun Soya (Glycine max (L.) Merrill) Yapraklarının Ultrastrüktürel ve Biyokimyasal Özellikleri Üzerine Etkisi. Uluslar arası Katılımlı 19. Ulusal Elektron Mikroskopi Kongresi, Haziran 2009, Trabzon. 3. Antar, V., Kelten B., Kaya M., Çelik, Ö., Karaoğlan, A., Akdemir, O., Soy, O., Sağmanlıgil, A., Barut, Ş., Çolak, A. Bir Genel Kaspaz İnhibitörü Olan QVD- OPH nın Nöroprotektif Etkilerinin Deneysel Spinal Kord Travması Modelinde İncelenmesi. Türk Nöroşirurji Derneği, XIX. Bilimsel Kongresi, Türk Nörolojisi Dergisi, Cilt 15, S.076, Kelten, B., Kaya, M., Antar, V., Çelik, Ö., Karaoğlan, A., Akdemir, O., Soy, O., Çolak, A. Bir Safra Asidi Olan TUDCA nın Nöroprotektif Etkilerinin Deneysel Spinal Kord Travması Modelinde İncelenmesi. Türk Nöroşirurji Derneği, XIX. Bilimsel Kongresi, Türk Nörolojisi Dergisi, Cilt 15, S.077, Kaya, M., Antar, V., Kelten, B., Çelik, Ö., Akdemir, O., Karaoğlan, A., Soy, O., Çolak, A. Bir Kalpain İnhibitörü Olan AK295 in Nöroprotektif Etkilerinin Deneysel Spinal Kord Travması Modelinde İncelenmesi. Türk Nöroşirurji Derneği, XIX. Bilimsel Kongresi, Türk Nörolojisi Dergisi, Cilt 15, S.074, Atak,Ç., Atok,O., Emiroğlu,Ö., Alikamanoğlu.S. Manyetik Alanın In Vitro Soya Büyümesinde Peroksidaz Aktivitesi ve Total RNA Miktarı Üzerine Etkisi. V.Ulusal Ekoloji ve Çevre Kongresi, Bolu, 5-8 Ekim Narçin Palavan-Ünsal, Nezih Hekim, Çimen Atak, Mehmet Ali Tüfekçi, Özge Emiroğlu, Damla Büyüktuncer. Soya Fasülyesi Süspansiyon Hücre Kültürlerinde Page 4 of 10

5 Hidrojen Peroksidin Toksik Etkilerinin Apoptotik Parametrelerle Saptanması. V.Ulusal Ekoloji ve Çevre Kongresi, Bolu, 5-8 Ekim Ç. Atak, Ö. Emiroğlu, A. Ulus, F. Boyacı, Orman Güllerinin (Rhododendron sp.) In Vitro Üretimi. XIII. Biyoteknoloji Kongresi, Çanakkale, Ağustos Atak, Ö. Emiroğlu, S. Alikamanoğlu, A.Rzakoulieva, Manyetik Alanın Soya (Glycine max L.Merrill) Doku Kültürleri Üzerine Etkisi. XIII. Biyoteknoloji Kongresi, Çanakkale, Ağustos Ö. Emiroğlu, C. Erzik, Görkey, Ş. Transgenik Canlıların Etik Açıdan Değerlendirilmesi, 3.Ulusal Tıp Etiği Kongresi (Uluslararası Katılımlı), Bursa, Haziran Projects directed and participated Project Name Supporting Organization/Project Code Project Timeline Duty in the Project Tuza Toleranslı Tütün (Nicotiana tabacum L.) Mutantlarında Toleranslılıktan Sorumlu Olan Genlerin Gene Fishing TM Metodu ile Belirlenmesi, Gen İfadelerinin Karşılaştırmalı Analizi ve Biyoinformatik Değerlendirmeler Hakkari den İstanbul a Bilim ve Kültür Köprüsü Mutasyon ıslahı ile soyada (Glycine max L.) tuzluluğa toleranslı bitkilerin geliştirilmesi Mutasyon ıslahı ile domateste (Lycopersicon esculentum) kuraklığa toleranslı mutant bitkilerin eldesi ve seleksiyonu Tuza toleranslı soya mutantlarında RNAseq analizi Gama radyasyonunun soya (Glycine max L. Merill) bitkisinin yapısal ve biyokimyasal özelliklerine etkileri Tuz stresinin soya (Glycine max L. Merill) bitkisinin yapısal ve biyokimyasal özelliklerine etkileri TÜBİTAK/ 3001 Research Project Project ID: 113Z571 TUBİTAK/4004 Science and Society Project Project ID: 213B669 Istanbul Kultur University, Black Sea Agricultural Research Institute Istanbul Kultur University, HB Agricultural Consulting (Dr. Hasan Bolkan, n t.com), AGROMAR (Karacabey, Bursa) Coordinator Instructor Researcher Researcher Istanbul Kultur University Coordinator Istanbul Kultur University Gazi University Istanbul Kultur University Gazi University Researcher Researcher Page 5 of 10

6 Gama radyasyonu ile tuza toleranslı tütün (Nicotiana tabacum L.) Mutantlarının Eldesi ve Seleksiyonu Orman güllerinin (Rhododendron sp.) in vitro kültürlerinde gama radyasyonu ile mutasyonun teşvik edilmesi Ağaç süs bitkilerinin doku kültürü yöntemleri ile mikro üretimi Istanbul University Coordinator Halic University Researcher Halic University Researcher Orman güllerinin (Rhododendron sp.) in vitro üretimi Halic University Bahçeköy Forest Management Researcher 7. Administrative designations Istanbul Kultur University, Department of Molecular Biology and Genetics FEDEK Coordinator 8. Membership in scholarly institutions 9. Awards and grants Biotechnology Federation FESPB EFB 1. İstanbul Kültür Üniversitesi, Başarı ve Teşvik Ödülü, 2013: Tübitak 2209 A Üniversite Öğrencileri Yurt İçi Araştırma Projeleri Destek Programında proje danışmanlığı 2. İstanbul Kültür Üniversitesi, Bilimsel yayınlara destek programı çerçevesinde para ödülü, 2012: Özge Çelik, Çimen Atak. The effect of salt stress on antioxidative enzymes and proline content of two Turkish tobacco varieties. Turkish Journal of Biology, 36(3): , İstanbul Kültür Üniversitesi, Başarı Ödülü, 2012: Ekim 2011 tarihleri arasında Antalya da gerçekleşen Uluslararası Katılımlı 20. Ulusal Elektron Mikroskopi Kongresi nde Tuza Toleranslı Tütün Mutantlarında Yaprak Tüylerinin Ultrastrüktürel İncelenmesi başlıklı poster sunumu ile Prof. Dr. Üveis Maskar Biyolojik Bilimler Poster Üçüncülük Ödülü. 4. İstanbul Kültür Üniversitesi, Bilimsel yayınlara destek programı çerçevesinde para ödülü, 2010: Page 6 of 10

7 A. Özge Çelik, Çimen Atak. Selection and Molecular Profiling Of Salt Tolerant Tobacco Plants Obtained By Gamma Radiation. In Vitro Cellular and Development Biology-Animal, 2010 In Vitro Biology Meeting and IAPB 12 th World Congress Abstract Issue, P-212. B. Özge Çelik, Zekiye Suludere, Çimen Atak. Effects of Salinity Stress On Densities Of Trichomes, Glandular Trichomes And Stomata In Two Soybean Varieties. In Vitro Cellular and Development Biology-Animal, 2010 In Vitro Biology Meeting and IAPB 12 th World Congress Abstract Issue, P Uluslararası katılmlı 20. Ulusal Elektron Mikroskopi Kongresi, Prof. Dr. Üveis Maskar Biyolojik Bilimler Poster Üçüncülük Ödülü Ekim 2011 tarihleri arasında Antalya da gerçekleşen Uluslar arası Katılımlı 20. Ulusal Elektron Mikroskopi Kongresi nde Tuza Toleranslı Tütün Mutantlarında Yaprak Tüylerinin Ultrastrüktürel İncelenmesi başlıklı poster sunumu ile Prof. Dr. Üveis Maskar Biyolojik Bilimler Poster Üçüncülük Ödülü. 6. Uluslar arası kongre katılım bursu 2010 In Vitro Biology & 12 th IAPB Kongresi, SIVB Öğrenci Katılım Bursu, İstanbul Kültür Üniversitesi, Bilimsel yayınlara destek programı çerçevesinde para ödülü, 2009: A. Çolak; V. Antar; A. Karaoglan; O. Akdemir; E. Sahan; Ö. Çelik and A. Sagmanligil. Q-VD-Oph, a pancaspase inhibitor, reduces trauma-induced apoptosis and improves the recovery of hind-limb function in rats after spinal cord injury. Neurocirugia 20 (6): , B. Çolak, M. Kaya, A. Karaoğlan, A. Sağmanlıgil, O. Akdemir, E. Şahan, Ö. Çelik. Calpain inhibitor AK 295 inhibits calpain-induced apoptosis and improves neurologic function after traumatic spinal cord injury in rats. Neurocirugia 20 (3): , C. Çimen Atak, Özge Çelik. Micropropagation of Anthurium adreanum from leaf explants. Pakistan Journal of Botany, 41(3): , D. Özge Çelik, Nihal Büyükuslu, Çimen Atak, Aitekin Rzakoulieva, The effects of magnetic field on the activity of superoxide dismutase and catalase in Glycine max (L.)Merr. roots. Polish J. Environ Studies, 18(2): , E. Özge Çelik, Çimen Atak. In vitro and in vivo investigaton of salt tolerance in two oriental tobacco (Nicotiana tabacum L.) species. In Vitro Cellular and Development Biology-Animal, 2009 Meeting on In Vitro Biology abstract Issue, Vol.45, s 71-72, TÜBİTAK Bilimsel Yayınları Teşvik Ödülü, 2009 Çimen Atak, Özge Çelik. Micropropagation of Anthurium adreanum from leaf explants. Pak. J. Bot., 41(3): , İstanbul Kültür Üniversitesi, Bilimsel yayınlara destek programı çerçevesinde para ödülü, 2009: Page 7 of 10

8 Ahmet Çolak, Bilal Kelten, Ayhan Sağmanlıgil, Osman Akdemir, Alper Karaoğlan, Elife Şahan, Özge Çelik, Şeref Barut. Tauroursodeoxycholic acid and secondary damage after spinal cord injury in rats. Journal of Clinical Neuroscience, 15, , Uluslararası katılmlı 19. Ulusal Elektron Mikroskopi Kongresi, Biyolojik Bilimler Elektron Mikroskop Fotoğraf Yarışmasında Birincilik Ödülü Haziran 2009 tarihinde Trabzon da gerçekleşen l9.ulusal Elektron Mikroskopi Kongresi, Yrd. Doç.Dr. Mustafa Özerler Mikroyapı Fotoğraf Ödülü (Biyolojik Bilimler) yarışmasında Gama Radyasyonun Soya (Glycine max (L.) Merrill) Yapraklarının Ultrastrüktürel ve Biyokimyasal Özellikleri Üzerine Etkisi araştırması çerçevesinde çekilen ve Sonsuzluk adı verilen elektron mikroskop fotoğrafı ile 1. lik Ödülü. 11.İstanbul Kültür Üniversitesi, Bilimsel yayınlara destek programı çerçevesinde para ödülü, 2008: Atak, Ç. Çelik, Ö. Olgun, A., Alikamanoğlu,S. Rzakoulieva A. Effect of magnetic field on peroxidase activities of soybean tissue culture. Biotechnology & Biotechnolojical Equipment.2,p ,2007. Ö. Çelik, Ç.Atak, N. Büyükuslu, The effects of magnetic field on germinatation of soybean seeds and on the activity of superoxide dismutase and catalase. In Vitro Cellular and Developmental Biology-Animal, Vol 43, s49-50, TÜBİTAK Bilimsel Yayınları Teşvik Ödülü, 2007 Özge Çelik, Jülide Akbuğa. Preparation of superoxide dismutase loaded chitosan microspheres: Characterization and release studies. European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics 66:42-47, Page 8 of 10

9 10. Courses taught over the last two academic years: Academic Year Term Course Name Fall Spring Fall Spring Fall Hours/week Theoretical Applied Number of Students Genetic Laboratory Plant Hormones Recombinant DNA Technology Applications Senior Project I Research Project I Plant Biology Introduction to Plant Biotechnology Molecular Biology Techniques II Senior Project II Reserach Project II Genetic Laboratory Plant Hormones Recombinant DNA Technology Applications Senior Project I Research Project I Plant Stress Physiology (Master) Transgenic Plant Technology (Master) Plant Biology Introduction to Plant Biotechnology Molecular Biology Techniques II Introduction to Biosafety Senior Project II Reserach Project II 0 1 Biosafety (Master) Genomic-Proteomic General Biology Laboratory Genetic Laboratory Plant Hormones Recombinant DNA Technology Applications Senior Project I Research Project I 0 4 2