Derece Alan Üniversite Yıl Lisans Su Ürünleri Mühendisliği Çukurova Üniversitesi 2003

Transkript

1 ÖZGEÇMİŞ ROZELIN AYDIN 1. Adı Soyadı: Rozelin AYDIN 2. Doğum Tarihi: Öğrenim Durumu: PhD Derece Alan Üniversite Yıl Lisans Su Ürünleri Mühendisliği Çukurova Üniversitesi 2003 Yüksek Lisans Su Ürünleri Mühendisliği/ Cell Biology and Immunology & Aquaculture and Fisheries Cukurova Universitesi Wageningen Universitesi 2006 Doktora Mikrobiyoloji Wageningen Üniversitesi Akademik Unvanlar: Wageningen Universitesi, Mikrobiyoloji Laboratuvari, Molekuler Ekoloji Anabilim Dalında Araştırma Görevlisi, Wageningen Universitesi, Mikrobiyoloji Laboratuvari, Molekuler Ekoloji ve Fizyoloji Anabilim Dalinda Postdoc, 2011 Haziran Ekim. 6. Yapmis oldugu Yuksek Lisans ve Doktora Tezleri 6.1. Yuksek Lisans Tezleri 1

2 Aydin R., Chitosan uygulanan tilapia (Oreochromis niloticus) bireylerinde bazi immunolojik parametrelerin etkisinin arastirilmasi // The research on the efffect of chitosan on some immunologic parameters for applied Tilapia (Oreochromis niloticus) individuals. Aydin R., Alterations of the distal intestinal permeability and the endocytosis process in Atlantic salmon (Salmo salar L.) fed a soybean meal-based diet Doktora Tezi Aydin R., Searching for branched glycerol dialkyl gylcerol tetraether membrane lipid producing bacteria in soil. 7. Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri 7.1. Yüksek Lisans Tezleri Achirul Nditasari- Physiological and molecular characterization of enrichment cultures producing branched GDGT membrane lpids from Têt Watershed sample, Southwest France Doktora Tezleri Naiara Roja Azeto decontamination. Microbial anaerobic sulfate reduction for heavy metals 8. Yayınlar 8.1. Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler (SCI & SSCI & Arts and Humanities) Aydin R.,Balk M., Peterse F., Schouten S., Sinninghe Damste J.S., Stams A.J.M., Smidt H Searching for GDGT lipids producing bacteria in soil samples. Journal of Environmental Microbiology (submitted soon). Aydin R., Balk M., Peterse F., Schouten S., Sinninghe Damste J.S., Stams A.J.M, Smidt H Effect of temperature gradients on the microbial community structure of soils near hot spring. Applied and Environmental Microbiology(submitted soon). Aydin R., Nditasari A., Peterse F., Balk M., Schouten S., Sinninghe Damste J.S., Smidt H., Stams A.J.M Microbial community structure of soil samples enriched with methanol at different ph and temperature. Applied and Environmental Microbiology (submitted soon). Siavash A., Aydin R., Maphosa F., Smidt H Effects of İnstallation Of A Wastewater Treatment Plant On Bacterial Diversity İn The Hyporheic Zone Of A Eutrophic River. Journal of ISME. (submitted soon). 2

3 Aydin R., Rijpstra W.I.C., Schouten S., Sinninghe Damste J.S., Smidt H., Stams A.J.M., Identification and characterization of Azospirillum SSRF. International Journal of Systematic Microbiology. (manuscript in preparation). Aydin R., Maphosa F., Smidt H Microbial characterization of Angled Core Samples of a zerovalent iron barrier in Belgium. Applied and Environmental Microbiology. (manuscript in preparation). Paulo A., Aydin R., Plugge C., Stams A.J.M Bacterial diverstiy in anaerobi enrichments degrading sodium lauryl ether sulphate. (manuscript in preparation). Aydin R., Balk M., Smidt H., Leo van Overbeek, Stams A.J.M., Dedysh S.N., The cosmopolitan Acidobacteria and their role in natural environments. FEMS Microbiology. Ecology. (INVITED REVIEW- Under revision-resubmitted- accepted). Gelder, A.H., Aydin R., Alves, M.M., Stams, A.J.M., Glycerol fermentation by a newly isolated Trichococcus strain. Journal of Microbial Biotechnology 5: P.A. Uran, R. Aydin, J.W. Schrama, J.A.J Verreth and J.H.W.M. Rombout, Brief Communications: Soybean meal-induced uptake block in Atlantic Salmon Salmo Salar distal enterocytes. Journal of Fish Biology 73, Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler 1. YAPILAN SUNUMLAR 1. Wageningen University, Laboratory of Microbiology, PhD&PD meeting Wageningen/The Netherlands, March 2007 & November, Darwin Days & Netherlands Annual Ecology Meeting - Investigation of the synthesis of branched glycerol dialkyl glycerol tetraethers (GDGT) membrane lipids by anaerobic soil bacteria. Veldhoven/The Netherlands, April 21-22, Harvard University, Department of Microbiology and Molecular Genetics, Kolter Lab - Tracing the biology behind novel paleoenvironmental proxies: Identification and ecophysiology of anaerobic soil bacteria producing branched GDGT membrane lipids. Boston, MA/USA, April 15, Woods Hole Oceanographic Institute- Tracing the biology behind novel paleoenvironmental proxies: Identification and ecophysiology of anaerobic soil bacteria producing branched GDGT membrane lipids. Woods Hole, MA/USA, April 16, Konstanz Symposium- Can anaerobic bacteria produce branched GDGT membrane lipids? Wageningen/The Netherlands, March 6-8,

4 2. POSTER BILDIRILERI 1-Microbial Sulfate Reduction For Heavy Metals Recovery, R. Aydin, N. Rojo, A.H. van Gelder, A.J.M. Stams. 5th Congress of European Microbiologists-FEMS 2013, July 21-25, 2013, Leipzig, Germany. 2-Effects of İnstallation Of A Wastewater Treatment Plant On Bacterial Diversity İn The Hyporheic Zone Of A Eutrophic River. S. Atashgahi, R. Aydin, D. Sipkema, K. Hamonts, F. Maphosa, D. Springael, H. Smidt, W. Dejonghe. 5th Congress of European Microbiologists-FEMS 2013, July 21-25, 2013, Leipzig, Germany. 3-Bacterial diverstiy in anaerobic enrichments degrading sodium lauryl ether sulphate. Ana Paulo, Rozelin Aydın, Caroline Plugge, Pedro Garcia-Encina, Alfons Stams. 13th World Congress on Anaerobic Digestion. June 25-28, 2013, Santiago de Compostela, Spain. 4- Microbial characterization of angled core samples of a zerovalent iron barrier in Belgium. R. Aydin, F. Maphosa, Q. Simons, H. Sapion, S. Van Roy, N. Hermans, Bastiaens L., H. Smidt.. ISME 14: 14th International Soceity of Microbial Ecology. Denmark, August 19-24, Effect of ph and temperature on the enrichment of aerobic methylotrophs. Rozelin Aydin, Francien Peterse, Melike Balk, Stefan Schouten, Jaap S. Sinninghe Damste, Hauke Smidt, Alfons J:M: Stams. ISME: 14th International Soceity of Microbial Ecology. Denmark, August 19-24, Identity and Ecophysiology of Bacteria Producing GDGT membrane lipids. Rozelin Aydin, Francien Peterse, Melike Balk, Stefan Schouten, Jaap S. Sinninghe Damste, Hauke Smidt, Alfons J:M: Stams..Ecology of Soil Microorganisms. Prague/Czech Republic, April, 27-May, 1, th Anniversary NVvM & Scientific Meeting 2011 Arnhem/The Netherlands, April 18-22, Darwin Days & Netherlands Annual Ecology Meeting Arnhem/The Netherlands,, February 7-9, ISME 13: 13 th International Symposium on Microbial Ecology Seattle, WA/USA, August 22-27, rd Congress of European Microbiologists - FEMS Gothenburg/Sweden, June 28- July 2, Darwin Days & Netherlands Annual Ecology Meeting 4

5 Veldhoven/The Netherlands, April 6-7, Darwin Days & Netherlands Annual Ecology Meeting Veldhoven/The Netherlands, March 28-29, Darwin Days & Netherlands Annual Ecology Meeting Veldhoven/The Netherlands April 26-27, Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler Rozelin Aydin, Searching for Branched Glycerol Tetraether Membrane Lipid Producing Bacteria in Soil, ISNB Paulo Uran, Etiology of Soybean-induced enteritis in fish (2008) adli kitap- Bolum 5. P.A. Uran, R. Aydin, J.W. Schrama, J.A.J Verreth & J.H.W.M Rombout. Soybean meal-induced uptake block in the distal enterocytes of Atlantic salmon (Salmo salar L.) Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler Rozelin Aydin, Ibrahim Cengizler Kitosan uygulanan tilapia (Oreochromis niloticus) bireylerinde bazi immunolojik parametrelerin etkisinin arastirilmasi. Cukurova Universitesi Fen Bilimleri Dergisi Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler XVII Ulusal Biyoloji Kongresi, Haziran Aflatoksinin balik yemleri uzerindeki etkisinin arastirilmasi Birinci Bolgesel Ogrenci Gida Sempozyumu, Adana, Nisan Balik zoonozlari Diğer yayınlar 9. Projeler 9.1. Soybean meal-induced uptake block in Atlantic salmon Salmo salar distal enterocytes Araştırmacı, Süre 9 ay Searching for branched glycerol dialkyl glycerol tetraether membrane lipid producing bacteria in soil. Wageningen Universitesi ve NIOZ ( Netherlands Institute of Sea Research) projesin de Wageningen Universitesi nde araştırmacı. Süre 4 sene 3 ay Microbial anaerobic sulfate reduction for heavy metals decontamination. Nystrar (Budel, The Netherlands) sirketi ile Wageningen Universi Mikrobiyoloji Labi nda ki Fizyoloji Grubunun ortak projesinde araştırmacı postdoc olarak çalışma. Süre 7 ay ECOLINC (Dutch Ecogenomics Innovation Centre) ve Bioclear projelerinde ileri molekuler teknikler kısmında bioremidiation üzerine araştırmacı postdoc olarak calışma. Sure 1 yil. 5

6 10. İdari Görevler 10.1.Biyomühendislik Bölümü Bölüm Başkan Vekili, AR-GE ve Teknoloji Ofisi (ARGET) Yürütme Kurulu Üyesi, Erasmus Bölüm Koordinatörü, Wageningen Üniversitesi Araştırma Görevlileri Yürütme Kurulu Üyesi ( ) SENSE (Netherlands Research School for the Socio-Economic and Natural Sciences of the Environment) araştırma görevlileri komisyonunda/kurulunda yabancı uyruklu araştırma görevlilerinin sorunlarını çözmede Yürütme Kurulu Üyesi ( ). 11. Bilimsel ve Mesleki Kuruluşlara Üyelikler NVvM, The Netherlands Microbiology Society ISME, International Society of Microbial Ecology ASM, American Society for Microbiology FEMS, Federation of European Microbial Societies 12. Ödüller & Burslar En iyi poster odulu, The Ecology of Soil Microorganism, Prague, Czech Republic Socrates-Erasmus Öğrenci Değisim Programı/Bursu, 2005 Ekim Temmuz. 13. Son iki yılda verdiğiniz lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler için aşağıdaki tabloyu doldurunuz. Ingilizce olarak verilmistir. Akademik Yil Donem Dersin Adi Haftalik saati Ogrenci Sayisi Bahar Fizyoloji Bahar Fizyoloji Bahar Fizyoloji Guz Fizyoloji Guz Fizyoloji

7 14. Katıldığı workshoplar /Sertifikalar 1-TS EN ISO/IEC Kalibrasyon Laboratuvarlarının Yeterliliği İçin Genel Şartlar Temel Eğitimi, Katılım Sertifikası, , Adana. 2-TS EN ISO/IEC Deney Laboratuvarlarının Yeterliliği İçin Genel Şartlar İç Tetkik Eğitimi, Katılım Sertifikası, , Adana. 3-TS EN ISO/IEC Deney Laboratuvarlarının Yeterliliği İçin Genel Şartlar Dokümantasyon Eğitimi, Katılım Sertifikası, , Adana. 4-Nano Teknoloji Temelli Real-Time PCR Teknikleri Uygulamalı Kursu, Katılım Belgesi, Mart 2013, Mersin Üniversitesi, Mersin. 5-1.Çukurova Biyoteknoloji Günleri, Katılım Belgesi, Mart 2013, Adana. 6-TULİP-Türkiye Üniversite Liderlik İyileştirme Programı, Katılım Belgesi, April 2013, Düzce. 7-Endüstriyel Simbiyoz ve Temiz Üretim AR-GE Proje Pazarı, Katılım Belgesi, 22 April 2013, Adana. 8-Merck-Millipore Laboratuvar Kimyasalları&Ekipmanları Semineri, Katılım Belgesi, 08 May 2013, Adana. 9-QIIME/MG-RAST Workshop, Chopenhagen, 18th-19th August, Next Generation Sequencing Workshop, Leiden, 17th-19th March, Phylogeny/ARB Workshop, Wageningen, 2nd-4th September, Fish Immunology/Vaccination Workshop, Wageningen, 18th-22nd, April, Uluslararası İndekslere Kayıtlı Makale/Derleme İçin Yapılan Danışmanlık Sayısı Journal of Federation of Microbiology Ecology, Journal of Chemistry, Laboratuvar Teknikleri DNA izolasyonu, PCR, Cloning, Phylogenetic Analysis (ARB, MEGA5, Bioedit), Fingerprint (DGGE), Anaerobic & Aerobic kultivasyon teknikleri, İzolasyon, NGS sequencing (Yeni nesil sekanslama) ve data analizi (QIIME) and assembly, Bioinformatik, Histoloji teknikleri, Konfokal mikroskop kullanimi, HPLC, Dionex, GC. 7

8 17. Bilgisayar Teknikleri Microsoft Office Uygulamalari, Adobe In Design, Photoshop, Adobe Illustrator & CS6 grafik/kitap dizayn programlari 8