RUHR ÜNİVERSİTESİ-BOCHUM ALMANYA DOKTORA ( ) Biyoloji ve Biyoteknoloji Faku ltesi, Biyofizik Bo lu mu

Transkript

1 İletişim: İstanbul Kemerburgaz Üniversitesi Tıp Fakültesi, Biyofizik Anabilim Dalı, Bağcılar / İSTANBUL Elektronik posta adresi: yekbun.adiguzel@kemerburgaz.edu.tr Tel: 0(212) /1427 (iş) YEKBUN ADIGÜZEL EĞİTİM RUHR ÜNİVERSİTESİ-BOCHUM ALMANYA DOKTORA ( ) Biyoloji ve Biyoteknoloji Faku ltesi, Biyofizik Bo lu mu ORTA DOĞU TEKNİK ÜNİVERSİTESİ TÜRKİYE YÜKSEK LİSANS (TEZSİZ) ( ) Sosyal Bilimler Enstitu su, Bilim ve Teknoloji Politikaları Çalışmaları ANKARA ÜNİVERSİTESİ TÜRKİYE YÜKSEK LİSANS ( ) Tıp Faku ltesi, Pediatrik Moleku ler Genetik ORTA DOĞU TEKNİK ÜNİVERSİTESİ TÜRKİYE LİSANS ( ) Fen Edebiyat Faku ltesi, Moleku ler Biyoloji ve Genetik Bo lu mu AKADEMİK ÜNVAN Doçentlig ini Sag lık Bilimlerinde, Biyofizik Alanı nda almıştır. TEZ BAŞLIKLARI DOKTORA ATR-FTIR spectroscopy of membrane-bound Ras protein. YÜKSEK LİSANS Endotelyal Nitrik Oksit Sentaz G894T, Endotelin T-C, Factor V 1691 G-A, Protrombin G-A Polimiorfizmlerinin Burger Hastalığı (Thromboangiitis Obliterans) için Birer Risk Faktörü Olarak İncelenmeleri. DENEYİM ÖĞRETİM ÜYESİ İ stanbul Kemerburgaz U niversitesi, Tıp Faku ltesi, Biyofizik Anabilim Dalı PROJE PERSONELİ STATÜSÜNDE DOKTORA SONRASI ARAŞTIRMACI ( ) ODTU Mikro Elektro Mekanik Sistemler (MEMS) Grubu nun içerisindeki Biyolojik ve Biyomedikal (Bio)MEMS alt grubunda, Avrupa Birlig i 7. Çerçeve Programı Projesi DOKTORA SONRASI ARAŞTIRMACI ( ) Almanya da, Ruhr U niversitesi-bochum, Kimya ve Biyokimya Faku ltesi, No robiyokimya YAZ STAJI ( ) Ankara U niversitesi, Tıp Faku ltesi, Tıbbi Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı

2 DERS DENEYİMİ İSTANBUL KEMERBURGAZ ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ MED 111 kodlu, Tıp Bilimlerine Giriş isimli zorunlu alan dersi kapsamındaki biyofizik konuları Konu kapsamı: Biyosibernetik; Ultrases ile go ru ntu leme; Lazer ve medikal uygulamaları; Nu kleer radyasyon; Tıbbi go ru ntu leme teknikleri MED 121 kodlu, Hu cre, Doku ve Organ Sistemleri İ isimli zorunlu alan dersi kapsamındaki biyofizik konuları Konu kapsamı: Vu cut sıvıları, yu zey gerilimi, ozmos, difu zyon; Asit-baz denge parametreleri; Kan gazları; Hu cre zarı potansiyeli; Sinaptik iletim; Aksiyon potansiyeli; Kas kasılması; Dolaşım biyofizig i; Go rme ve İ şitme duyuları MED 122 kodlu, Hu cre, Doku ve Organ Sistemleri İİ isimli zorunlu alan dersi kapsamındaki biyofizik konuları Konu kapsamı: Termodinamik; Nanoteknoloji; Biyomekanik; Radyasyonun biyolojik etkileri RUHR ÜNİVERSİTESİ-BOCHUM BİYOLOJİ VE BİYOTEKNOLOJİ FAKÜLTESİ BİYOFİZİK BLM. ( ) G-blok pratik dersleri asistanlıg ı Kapsamı: G-blok o g rencilerine proteinlerin FTİR spektroskopisini, protein ikincil yapı analizini anlatmak, deneysel olarak bakteriyorodopsin proteininin FTİR-ATR spektrumunu elde ettikten sonra MATLAB R-12 Kinetik programını kullanarak spektrumlardan ikincil yapı analizi yapmalarını sag lamak. PROJE TÜBİTAK 3001 PROJESİ ( ) Görevi: Proje yu ru tu cu su Proje Başlığı: Web-Tabanlı Protein İ kincil Yapısı Tahmin Araçlarının FT-İR Spektrofotometrisi ile Protein İ kincil Yapısının Deneysel Analizinde Kullanımının İ ncelenmesi ARAŞTIRMA TEKNİK VE ALANLARI SPEKTROSKOPİ TEKNİKLERİ Fourier Do nu şu mlu Kızılo tesi FTİR ve ATR-FTİR Spektroskopisi Yu zeye Hassas Raman (SERS) ve Moro tesi (UV) Spektroskopisi Ku tle Manyetik Rezonans Spektroskopisi (NMR) BİYOSENSÖRLER VE BİYOMEMS Yu zey aktifleştirme ve hasta başı test sistemleri HÜCREDE SİNYAL İLETİMİ Proteinler ve lipit zar yapıları, hu crede sinyal iletimindeki etkileşimleri BİYOFİZİK, BİYOSEMİYOTİK VE BİLGİ TEORİSİ Sayfa 2

3 DESTEK, BURS VE ÖDÜLLER ( ) ODTU Temel Bilim Bursu, Lisans eg itimi boyunca ( ) Bilimsel Araştırma Projesi Desteg i, yurtdışı doktora eg itimi o ncesinde ODTU de kayıtlı oldug u doktora programı çalışması kapsamında ( ) Dortmund, Almanya daki Max Planck Moleku ler Fizyoloji Enstitu su nu n Uluslararası Max Planck Enstitu su Kimyasal Biyoloji Araştırma Okulu (İMPRS-CB) Bursu, doktora eg itimi boyunca ( ) DAAD / STİBET Bursu, doktora eg itiminin sonunda 3 ay boyunca ( ) FEBS ten Genç Seyahat Desteg i, SPATİAL 2009 Kongresi ne katılım için ( ) FEBS ten Kongre Sekretaryası Desteg i, FEBS 2009 Kongresi ne katılım için ( ) Roche Desteg i, 23. Ulusal Biyokimya Kongresi ne katılım için ( ) Sıra dışı katkı o du lu, Biyosensors & Bioelectronics Dergisi için hakemlig i için ( ) Poster o du lu, Birinci Beyin Araştırmaları Okulu nda sunulan derleme poster için DERGİ HAKEMLİKLERİ Biyosensors & Bioelectronics Analytical & Bioanalytical Chemistry İEEE Sensors Current Applied Physics Journal of Spectroscopy Journal of Respiratory and Pulmonary Medicine of OMİCS Biomedicine J. Journal of Gerontology & Geriatrics Research of OMİCS Biomedicine J. Translational Materials Research Archives of Pulmonology and Respiratory Care ÜYELİKLER Tu rk Biyofizik Derneg i Tu rk Biyokimya Derneg i Biophysical Society (2014 ve 2015) YAYINLAR (56 ATIF ALMIŞTIR) KİTAP BÖLÜMÜ 1. Y. Adıgu zel, P.İ. Haris, F. Severcan, F. Severcan, P.İ. Haris, Screening of Proteins in Cells and Tissues by Vibrational Spectroscopy, Vibrational Spectroscopy in Diagnosis and Screening, , Amsterdam, İOS Press, 2012 Sayfa 3

4 DERGI MAKALELERI 1. J. Gu ldenhaupt, Y. Adigu zel, J. Kuhlmann, H. Waldmann, C. Ko tting, K. Gerwert, "Secondary structure of lipidated Ras bound to a lipid bilayer", FEBS JOURNAL, 275, , Y. Adigu zel, E. Yilmaz, N. Akar, "Effect of enos and ET-1 polymorphisms in thromboangiitis obliterans", CLİNİCAL AND APPLİED THROMBOSİS- HEMOSTASİS, 16, , E. Yilmaz, R. Akar, S.T. Eker, G. Deda, Y. Adiguzel, N. Akar, "Relationship between functional promoter polymorphism in the XBP1 gene (-116C/G) and atherosclerosis, ischemic stroke and hyperhomocysteinemia", MOLECULAR BİOLOGY REPORTS, 37, , Y. Adiguzel, H. Kulah, "CMOS cell sensors for point-of-care diagnostics", SENSORS, 12, , J. Musayev, C. Altiner, Y. Adiguzel, H. Kulah, S. Eminoglu, T. Akin, "Capturing and detection of MCF-7 breast cancer cells with a CMOS image sensor", SENSORS AND ACTUATORS A-PHYSİCAL, 215, , Y. Adiguzel, H. Kulah, "Studies on visual detection and surface modification testing of glass microfiber filter paper based biosensor", BİOSENSORS & BİOELECTRONİCS, 54, 27-34, J. Musayev, Y. Adlgu zel, H. Ku lah, S. Eminoglu, T. Akln, "Label-Free DNA Detection Using a Charge Sensitive CMOS Microarray Sensor Chip", İEEE SENSORS JOURNAL, 14, , H. Torul, H. Çiftçi, F.C. Dudak, Y. Adiguzel, H. Kulah, İ.H. Boyacı, U. Tamer, "Glucose determination based on a two component self-assembled monolayer functionalized surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) probe", ANALYTİCAL METHODS, 6, , Y. Adiguzel, H. Kulah, "Breath sensors for lung cancer diagnosis", BİOSENSORS & BİOELECTRONİCS, 65, , 2015 ULUSLARARASI KONGRE, ÇALIŞTAY VE TOPLANTILAR 1. Y. Adiguzel, C. Ko tting, J. Kuhlmann, H. Waldmann, K. Gerwert, 32 nd FEBS Congress, "ATR-FTİR Spectroscopy of Membrane Bound Ras Protein", Viyana, Avusturya, Y. Adiguzel, C. Ko tting, J. Kuhlmann, H. Waldmann, K. Gerwert, 6 th EBSA European Biophysics Congress, "ATR-FTİR Spectroscopy of Membrane Bound Ras Protein", Londra, İ ngiltere, Y. Adiguzel, J. Gu ldenhaupt, C. Ko tting, J. Kuhlmann, H. Waldmann, K. Gerwert, ECSBM-2007: 12 th European Conference on the Spectroscopy of Biological Molecules, "ATR-FTİR Spectroscopy of Membrane Bound Ras Protein", Paris, Fransa, Y. Adiguzel, S. Hippe, R. Stoll, EMBO Conference Series on Spatial Dynamics of İntracellular Signaling - SPATİAL Overcoming distance in signaling networks, "Signal Transduction Through Membrane Modulation", Kudu s, İ srail, Y. Adiguzel, S. Hippe, H.J. Hauswald, R. Stoll, R. Heumann, 34 th FEBS Congress - Life s Molecular İnteractions, "Phosphorus NMR of Model Membrane İnteraction with Nitric Oxide", Prag, Çek Cumhuriyeti, 2009 Sayfa 4

5 6. Y. Adiguzel, S. Hippe, H.-J. Hauswald, R. Stoll, R. Heumann, BİOTECH METU İnternational Symposium on Biotechnology: Developments and Trends, "Nitric Oxide İnteraction with Cholesterol Containing Model Membranes", Ankara, Tu rkiye, S. Hippe, Y. Adiguzel, C. Grote-Westrick, R. Heumann, Trinational Fall Meeting İnternational Meeting on Signal Transduction and Disease, "Nitric Oxide Enhances Plasma Membrane Fluidity: A Novel Mechanism for Morphological Differentiation", Aachen, Almanya, J. Musayev, Y. Adıgu zel, H. Ku lah, S. Eminog lu, T. Akın, MEMS The 26 th İEEE İnternational Conference on Micro Electro Mechanical Systems, "Cell Detection Using A CMOS İmage Sensor With Modified Pixel Structure Suitable For Bio- Chemical Surface Activation", Taype, Tayvan, H. Torul, U. Tamer, Y. Adıgu zel, H. Ciftci, H.C. Koydemir, H. Kulah, İMA th İnternational Conference on İnstrumental Methods of Analysis: Modern Trends and Applications, "SERS-Based Non-Enzymatic Glucose Detection on Chip", Thesaloniki, Yunanistan, H. Torul, Y. Adıgu zel, H. Çiftçi, H.C. Koydemir, U. Tamer, H. Kulah, İnternational Multidisciplinary Symposium on Drug Research & Development (İlarud 2013), "The Construction of a Optofluidic Platform Based On the Surface Enhanced Raman Spectroscopy and Measurement of Blood Sugar Levels", Antalya, Tu rkiye, Y. Adiguzel, İnternational Electronic Conference on Sensors and Applications, "Utilization of Dialysis Membrane for Biosensor Applications by UV Spectrophotometric Detection", (abstract no a003), Elektronik Konferans, Y. Adiguzel, H. Kulah, Biosensors & Bioelectronics rd İnternational Conference and Exhibition on Biosensors & Bioelectronics, "Progress on the Studies on Visual Detection and Surface Modification Testing of Glass Microfiber Filter Paper Based Biosensor", San Antonyo, Amerika, Y. Adiguzel, NanoNG14 - Nanoscience and Nanotechnology for Next Generation, "Blood Serum Protein Measurement with Dialysis Membrane for Biosensor Applications by UV Spectrophotometry", Elazıg, Tu rkiye, Y. Adiguzel, 59 th Annual Meeting of the Biophysical Society, "Biosensor Approach by UV Spectrophotometric Detection, Baltimore, Amerika, 2015 (Biophysical Journal, Cilt 108, Sayı 2, Ek 1, p483a, 27 Ocak 2015) 15. Y. Adiguzel, Modeling of Biomolecular Systems İnteractions, Dynamics, and Allostery: Bridging Experiments and Computations, "Web-Based Structure Prediction as Supplementary Tools to Protein Secondary Structure Analysis with FT-İR Spectroscopy", İ stanbul, Tu rkiye, Y. Adiguzel, Gatherings in Biosemiotics 15, "İnformation communication theory in biology and biosemiotics", Kopenhag, Danimarka, Y. Adiguzel, Ecology and Evolutionary Biology Symposium, "İnformation theoretic approach for the DNA and the protein length relation", Ankara, Tu rkiye, Y. Adiguzel, 1 st Brain Research School, "Epigenetics in Brain Research", İsparta, Tu rkiye, (J. Cell. Neur. Ox. Stress, Cilt 7, Sayı 1, , 2015) 19. Y. Adiguzel, İV. İnternational Molecular Biology Congress, "İnformation theoretic approach for equalizing the protein and mrna entropies", Ankara, Tu rkiye, 2015 Sayfa 5

6 ULUSAL KONGRE, ÇALIŞTAY VE TOPLANTILAR 1. Y. Adıgu zel, F. Severcan, XVİ. Ulusal Biyofizik Kongresi, "Radyoprotektan Amifostinin Yu ksu z Model Membran U zerine Etkisi", Ankara, Y. Adiguzel, S. Hippe, H.-J. Hauswald, R. Stoll, R. Heumann, NANOTR-V: 5th National Nanoscience and Nanotechnology Conference, "Signal Transduction Through Membrane Modulation" (İ ngilizce), Eskişehir, Y. Adiguzel, S. Hippe, H.-J. Hauswald, R. Stoll, R. Heumann, Winter School on Frontiers in Nanomedicine and Nanobiotechnology, "Lipids as Potential Building Blocks of the New Era Smart Materials" (İ ngilizce), Ankara, Y. Adıgu zel, H. Ku lah, 23. Ulusal Biyokimya Kongresi, "Hasta Başı Testler için Mikroelektromekanik Sistemler Tabanlı U ru nler", Adana, H. Ku lah, Y. Adıgu zel, 7. Ulusal Tanısal ve Moleku ler Mikrobiyoloji Kongresi, "Mikrobiyoloji Uygulamaları için Biyosenso rler ve BiyoMEMS", Ankara, Y. Adıgu zel, Uluslararası Katılımlı Elektrokimya Çalıştayı, Nanostructure Modified Electrochemical and Bioelectrochemical Systems, "Lipid Membran Elektrokimyası", Mug la, Y. Adıgu zel, 25. National Biophysical Congress, "Protein İ kincil Yapı Analizi için Web-tabanlı Programların Karşılaştırılması", Trabzon, M. Kazak, Y. Adıgu zel, 26. Ulusal Biyofizik Kongresi, "UV Spektrofotometrik Saptama Kullanılarak, Diyaliz Mebranın Biyosenso r Uygulamalası için Deg erlendirilmesi", Tokat, M. Kazak, Y. Adıgu zel, 27. Ulusal Biyofizik Kongresi, "Ag Tabanlı Yapı Tahmininin Protein İ kincil Yapı Analizine Yardımcı Araç Olarak Deg erlendirilmesi", Y. Adıgu zel, 27. Ulusal Biyofizik Kongresi, "Protein ve mrna Entropilerini Eşitlemek için Bilgi Teorisi Yaklaşımı", Malatya, 2015 Sayfa 6