Yrd.Doç.Dr.Erdal COŞGUN. Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl

Transkript

1 1. Öğrenim Durumu: Üniversite Yrd.Doç.Dr.Erdal COŞGUN Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Lisans Fen Fakültesi/İstatistik Hacettepe Üniversitesi Doktora/S.Yeterlik/ Tıpta Uzmanlık (Bütünleşik Doktora) Tıp Fakültesi/Biyoistatistik Hacettepe Üniversitesi Akademik Unvanlar Görev Unvanı Araştırma Görevlisi Görev Yeri Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Biyoistatistik Yıl 3. Yayınlar 3.1 Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler 1. Erdal COŞGUN, Nita Limdi, Christine W.Duarte, High Dimensional Pharmacogenetic Prediction of a Continuous Trait using Machine Learning Techniques with Application to Warfarin Dose Prediction in African American, Bioinformatics, 2011 May 15;27(10): İbrahim Sakçak, Fatih Mehmet Avşar, Erdal Coşgun, Comparison of The Application of Low Concentration and 80% Phenol Solution in Pilonidal Sinus Disease,JRSM Short Rep Jun 30;1(1):5. doi: /shorts Comparison of Early and Late Changes in Immunoglobulins and Acute Phase Reactants after Laparoscopic Adjustable Gastric Banding in Patients with Morbid Obesity, Sakçak İbrahim, M.D., Avşar Mehmet Fatih, M.D., Hamamcı Enver Okan, M.D., Bostanoğlu Settar, M.D., Sonışık Muhittin, M.D., Bostanoğlu Akın, M.D., Erdem Nihal Zekiye, Ph.D., Coşgun Erdal, OBES SURG, Jan.2010, DOI /s y, 2010, Obesity Surgery 4. Changes in comorbid diseases in morbidly obese patients treated by laparoscopic adjustable gastricbanding, Sakçak İbrahim, M.D., Avşar Mehmet Fatih, M.D., Erdem Nihal Zekiye, Ph.D., Hamamcı Enver Okan, M.D., Bostanoğlu Settar, M.D., Sonışık Muhittin, M.D., Bostanoğlu Akın, M.D., Coşgun Erdal, Pak J Med Sci Jan - Mar 2010; 26(1): Bostanoglu S, Sakcak I, Avsar FM, Cosgun E, Hamamci EO. Comparison of Karydakis technique with Limberg Flap Procedure in Pilonidal Sinus Disease: Advantages of Karydakis technique. Pak J Med Sci 2010;26(4):

2 6. Ibrahim S, Mehmet AF, Erdal C, Zekiye EN. The development of migration in laparoscopic adjustable gastric banding and the approach to treatment. Pak J Med Sci 2010;26(3): İbrahim SAKÇAK, Fatih Mehmet AVŞAR, Esra Uçar YILMAZ, Hakan ATAŞ, Kemal KILIÇ,Erdal COŞGUN, İpek MUMCUOĞLU, Sevilay SEZER, Settar BOSTANOĞLU, Attila İŞGÖREN, The Prevention of the Development of Peritonitis with Different Disinfectants to Compare the Efficacy of Gastric Lavage at the NOTES, The journal of The Faculty of Veterinary Medicine, Univ. Of Kafkas. 17 (Suppl A): S37-S42, İbrahim İ., Barış D Yıldız,Fatih M., Avsar,Saadet A.,K.Kılıc,Erdal COŞGUN,Orhan G. Ozbilen, Enver O. Hamamcı, Does N ratio Affect Survival in D1 and D2 Lymph node Dissection for Gastric Cancer?, World Journal of Gastroenterology, 2011,17(35), Dr.Enver Okan HAMAMCI, Dr. Rıfat PİYADE, Dr. Settar BOSTANOĞLU, Dr. İbrahim SAKÇAK, Dr.Mehmet Fatih AVŞAR, Erdal COŞGUN, Preoperative Localization in Primary Hyperparathyroidism Surgery,Turkiye Klinikleri J Med Sci 2011;31(3): Sakcak, Ibrahim; Avsar, Fatih Mehmet; Cosgun, Erdal; Yildiz, Baris Dogu, Management of concurrent cholelithiasis in gastric banding for morbid obesity, European Journal of Gastroenterology & Hepatology,2011, 23 (9), Avsar FM, Sakcak I, Yildiz BD, Cosgun E, Hamamci EO Is Gastro-Gastric Fixation Suture Necessary ın Laparoscopic Adjustable Gastric Banding? A Prospective Randomized Study.,J Laparoendosc Adv Surg Tech A., 21,10, , Koray Ergunay, Yasemin Balaban, Erdal Cosgun, Alpaslan Alp, Halis Simsek, Burcin Sener, Gonca Tatar, Gulsen Hascelik, Epidemiologic trends in HBV infections at a reference centre in Turkey: an 11-year retrospective analysis, Ann Hepatol,September- October, Vol. 11 No. 5, Cem Sahin, Ergin A., Ayyildiz S. ve Erdal Coşgun, Effect of biofilm formation, and biocorrosion on denture base fractures, JOURNAL OF ADVANCED PROSTHODONTIC,Vol:5,Issue:2, Page: ,May Elif Oztürk, Yu-Chih Chiang, Erdal Coşgun et al., Effect of resin shades on opacity of ceramic veneers and polymerization efficiency through ceramics, Journal of Dentistry, 415 (2013) 15. Birben E., Sahiner U., Karaaslan C., Yavuz T.S, Cosgun E., Kalayci O., Sackesen C., The Genetic Variants of Thymic Stromal Lymphopoietin Protein in Children with Asthma and Allergic Rhinitis,Int Arch Allergy Immunol 2014;163: , (DOI: / ) 3.2 Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler 1. International Conference On Multivariate Statistical Modelling & High Dimensional Data Mining,19-23 June 2008, Kayseri, Turkey, Title: A Comparative Study Of The Results Of Extractable Nuclear Antibody (Ena) Tests With Apriori Method And Clustering Method 2. V. Conference Of The Eastern Mediterranean Region Of The International Biometric Society (Emr - Ibs), May 10-14, 2009, Istanbul, Turkey, Title : A Comparative Study Of Principal Component Analysis Based Classification Methods On Microarray Data

3 3. V. Conference Of The Eastern Mediterranean Region Of The International Biometric Society (EMR- IBS), May 10-14, 2009, Istanbul, Turkey, Title : Comparing the Treatment Effects When the Survival Curves Cross: A Simulation Study, Sevilay KARAHAN, Erdal COSGUN, Dr.Osman Saracbasi 4. XV. Society for Design and Process Science, June, 2010, Dallas, Texas, USA, Title : The New Hybrid Method for Classification of Patients by Gene Expression Profiling, 5. International Biometric Conference, 5 10 December 2010,Floripa, Brazil,Title : rrf: Robust Random Forest for Microarray Data Sets 6. The Spring Meeting of Eastern North American Region (ENAR)-IBS, March 20-23,2011, Miami, Florida, USA, Title : High Dimensional Predictive Modeling in Pharmacogenetics: Application of Machine Learning Techniques to Predict Warfarin Dose Response in African Americans, Erdal Cosgun, Nita Limdi, Ph.D. and Christine W. Duarte.Ph.D th International Conference on Electronic Publishing, June 22-24, 2011, Istanbul, Turkey, Title : Effectiveness Analysis of Electronic Resources at the Hacettepe University (2007), Erdal Coşgun, M.Sc., Erdem Karabulut,Ph.D., Ergun Karaağaoğlu, Ph.D. ISBN , pp Joint Statistical Meetings, July 30 Aug.01, 2011, Miami, Florida, USA, Title: Machine Learning Techniques for Predictive Modeling in Pharmacogenetics: Modeling Warfarin Dose Response in African Americans Erdal Cosgun, Nita A. Limdi and Christine Woods Duarte 9. Society for Design and Process Conference, June 12 16, 2011, Jeju, South Korea, Title : Random Forest And Boosted Classification Tree Based Multifactor Dimensionality Reduction Analysis (MDR), Erdal Cosgun, Ergun Karaağaoğlu, Sam Saffer, Sang C. Suh 10. Society for Design and Process Conference, June 12 16, 2011, Jeju, South Korea, Title : GENE 3E : A New Bioinformatics Tool For Genetic Data Mining, Erdal Cosgun, Yiğitcan Aksari 11. Long Term Outcomes of Redo Surgery After Laparoscopic Adjustable Gastric Banding By: Uluer, A.; Ozden, S.; Avsar, M.; Cosgun E* et al. Conference: 18th World Congress of the International-Federation-for-the-Surgery-of- Obesity-and-Metabolic-Disorders (IFSO) Location: Istanbul, TURKEY Date: AUG 28-31, 2013 Sponsor(s): Int Federat Surg Obes & Metab Disorders (IFSO) OBESITY SURGERY Volume: 23 Issue: 8 Pages: Published: AUG Long Term Outcomes of Laparoscopic Adjustable Gastric Banding By: Ozden, S.; Uluer, A.; Avsar, M.; Cosgun E* et al. Conference: 18th World Congress of the International-Federation-for-the-Surgery-of- Obesity-and-Metabolic-Disorders (IFSO) Location: Istanbul, TURKEY Date: AUG 28-31, 2013 Sponsor(s): Int Federat Surg Obes & Metab Disorders (IFSO) OBESITY SURGERY Volume: 23 Issue: 8 Pages: Published: AUG Comparing kernel functions of support vector machines for different gene selection methods in a microarray study By: Zararsiz, Gokmen; Ozturk, Ahmet; Elmali, Ferhan; Cosgun E et al.

4 Conference: European Biotechnology Congress Location: Istanbul, TURKEY Date: SEP 28-OCT 01, 2011 Sponsor(s): European Biotechnol Themat Network Assoc CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY, Volume: 22, Supplement: 1 Pages: S59- S59 Published: SEP Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler 1. Erdal COŞGUN, Ergun Karağaoğlu, Ph.D., The New Hybrid Method for Classification of Patients by Gene Expression Profiling, Biomedical Engineering: Healthcare Systems, Technology and Techniques, Page , Springer (2011)- (BookCI-WOS- Article-Book Chapter) 2. Gökmen Zararsız, Erdal Coşgun, mirnomics: MicroRNA Biology and Computational Analysis, Introduction to Statistical Methods, Methods in Molecular Biology book, 2014, XII, 333 p. 69 illus., Springer 3. Alper Bayazit, Petek Askar, Erdal Cosgun, Predicting Learner Answers Correctness Through Eye Movements With Random Forest,, Educational Data Mining, Peña-Ayala, Alejandro (Ed.), 2014, XVIII, 468 p. 139 illus. Springer 3.4. Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler 1. Erdal COŞGUN, Ergun Karaağaoğlu, Veri Madenciliği Yöntemleri ile Mikrodizilim Gen İfade Analizi (Microarray Gene Expression Data Analysis With Data Mining Methods), Hacettepe Tıp Dergisi, 42: , Tuba GÜNEBAK ŞAHİN, Berkan SAYAL, Erdal COŞGUN, H. Tanju BESLER, M. Sinan BEKSAÇ, Methylenetetrahydrofolate Reductase Enzyme Mutations and Relationship of Homocysteine Vitamin B12 and Folate Blood Levels, Gynecology Obstetrics & Reproductive Medicine,Vol:19,No:1, Serap DURUKAN, Çağdaş AKYÜREK, Erdal COŞGUN, Hacettepe Üniversitesi Erişkin Hastanesi nde Çalışan Hemşirelerin Örgütsel Güven, Güçlendirme Ve Bağlılık Düzeylerinin Belirlenmesi, Süleyman Demirel Üniversitesi, İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi Dergisi, Y.2010, Vol.15, No.3 pp Serap DURUKAN;Doç. Dr. Elif DİKMETAŞ; Erdal COŞGUN, Bir Kamu Hastanesinde Tıbbi Sekreterlerin işgücü Verimliliğine ilişkin Algılamalarına Yönelik Bir Araştırma, Ç.Ü. Sosyal Bilimler Enstitüsü Dergisi, Cilt 20, Sayı 2, 2011, Sayfa Laparoskopik Ayarlanabilir Stomalı Mide bantı Uygulamalarında nadir bir komplikasyon: Bant ta açılma, İbrahim Sakçak, Fatih Mehmet Avşar, Enver Okan Hamamcı, Settar Bostanoğlu, Muhittin Sonışık, Akın Bostanoğlu, Nihal Zekiye Erdem, Erdal Coşgun, Ulusal Cerrahi Dergisi 2009; 25(4): İbrahim Sakçak, Fatih Mehmet Avşar, Barış Doğu Yıldız, Kemal Kılıç, Muhittin Sonışık, Akın Bostanoğlu, Erdal Coşgun, Surgical Methods And Complications Of Hyperthyroidism With Euthyroid In Terms Of Applied Comparison, The Journal of Medical Sciences, Scientists Solidarity Association,2011, Vol: 3, 2, İbrahim Sakçak, Mehmet Fatih Avşar, Erdal Coşgun, Morbid Obez Tedavisinde Laparoskopik Ayarlanabilir Gastrik Bant Uygulamaları: İlk 134 Olgunun Sonuçları, Ortadoğu Tıp Dergisi, 2010, 2(2), 32-37

5 8. İbrahim Sakçak, Fatih Mehmet Avşar, Enver Okan Hamamcı, Özgür Akmeşe, Erdal Coşgun, Akın Bostanoğlu, Muhittin Sonışık, The effects of weight loss on glucose metabolism and insulin resistance in morbidly obese patients with laparoscopic adjustable gastric band,endokrinolojide Diyalog, 2010, 7 (3): Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler 1. XI. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, May 2008, Malatya, Turkey Başlık : Comparative Study Of Association Rule Based Classification With Logistic Regression And C XI. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, May 2008, Malatya, Turkey Başlık : Classification With Support Vector Machine 3. Ulusal İstatistik Kongresi, April 29-MAY 03, 2009, Antalya, Turkey Başlık : Gene Selection And Classification With Random Forest (RF) And SVM 4. XII. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, 28 Haziran-1 Temmuz 2010, Van, Aydoğan Ü., Karabulut E., Coşgun E., Sezer H. Başlık : Destek Vektör Makinelerinde Kullanılan Çekirdek Fonksiyonların Sınıflama Performanslarının Karşılaştırılması 5. XII. Ulusal Biyoistatistik Kongresi, 28 Haziran-1 Temmuz 2010, Van, Coşgun E., Korkem E., Karabulut E., Başlık : Random Forest ve Lojistik Regresyon Sınıflama Yöntemlerinin Karşılaştırılması 6. Turkish Medical Informatics Conference 2010, October 2010, Magosa, Cyprus Başlık : Machine learning and Data Mining at Genetic Researches 7. Ulusal Tıp Bilişimi Kongresi Nov , 2011, Antalya, Türkiye, Başlık : Gene 3E: Genetik Veri Madenciliği için Yeni Analiz Aracı, Erdal Coşgun, Aydın Kaya, Ali Seydi Keçeli, Yiğitcan Aksarı, Ergun Karaağaoğlu

6 4. Projeler I. TÜBİTAK SOBAG- BURSİYER Başlık: Hacettepe Üniversitesi Kütüphanelerinde Tam Metin Erisim Sağlanan Elektronik Veri Tabanlarının 2007 Yılı Için Etkinlik Analizi Proje Numarası: 108K350, Bütçe: TL, Proje Tarihi: 15/10/ /04/2010 II. III. IV. TÜBİTAK SBAG- BURSİYER Başlık: Limb-Girdle Kas Distrofisi Fenotipinden Sorumlu Yeni Gen Araştırılması Bütçe: TL, Proje Tarihi: Kasım Nisan 2015 BİLİM, SANAYİ VE TEKNOLOJİ BAKANLIĞI, TeknoGirişim Semayesi Desteği PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ Başlık: Genetik Veri Madenciliği için Analiz Aracı Bütçe: TL, Proje Tarihi : HAZİRAN Nisan 2013 HACETTEPE TEKNOKENT Başlık: Yeni Nesil Hastane Veri Tabanları için Veri Madenciliği Sistemi PROJE YÜRÜTÜCÜSÜ Bütçe: TL Proje Tarihi: Ekim 2013-Ekim 2015 V. DEVLET PLANLAMA TEŞKİLATI Tarih: 07/06/ /12/2013 Başlık: Türkiye de Parlamenter Sistemin Ampirik İncelenmesi Görev: Proje Koordinatörü ve Analisti VI. AVRUPA BİRLİĞİ Tarih: 04/ /2016 Başlık: Technical Assistance for Preparation of the Veterinary Strategy Document- EuropeAid/133669/D/SER/TR Görev: Biyoistatistik Uzmanı 9. İdari Görevler 1. Genel Müdür RGenetik Ar-GE, Biyoinformatik, Ltd. Şti. Hacettepe Teknokent, AR-GE-2 Binası, Ankara

7 10. Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler 1. Türk Biyoistatistik Derneği, 2. Society for Design and Process Science EK BİLGİLER ASİSTANLIĞI YAPILAN DERSLER I. BIS-786-Veri Madenciliği, (2008- ) II. BIS-710-Tıpta Karar Verme ( ) III. IV. Bilgisayar Bilimleri ( ) Biyoistatistik ( ) V. BIS-785-Machine Learning (2010 ) VI. VII. VIII. BIS-781-R Yazılımına Giriş (2010 ) BIS-761-Biyoinformatiğe Giriş (2011 ) BIS-783-İstatistiksel Genetik (2011.) IX. BIS-665- Biyoinformatik Analizler için Linux İşletim Sistemine Giriş (2012-) BİLGİSAYAR YAZILIMI BİLGİLERİ I. SPSS-(2003- )- Çok iyi II. III. IV. MATLAB- (2004-.) Orta Düzeyi* Clementine PASW Modeller ( SPSS INC.) ( ) Çok iyi STATISTICA ( ) Çok iyi V. R (2007-.) Çok iyi VI. VII. VIII. IX. SAS (2004- )- Orta Düzey NCSS (2004-.)- Çok iyi S-PLUS (2008-.)- Orta Düzey PLINK -Whole genome association analysis toolset (2010- )- Çok iyi X. ORANGE (2011- ) Çok iyi