Patolojide Güncel Gelişmeler. Dr. Güray Aktürk Çiğli Eğitim ve Araştırma Hastanesi İzmir

Transkript

1 Patolojide Güncel Gelişmeler Dr. Güray Aktürk Çiğli Eğitim ve Araştırma Hastanesi İzmir

2 Jinekopatoloji Endometrial Karsinom Moleküler Sınıflaması

3 EC Geleneksel Dualistik Sınıflama* Tip 1 Östrojen ilişkili Obez Reseptör pozitifliği sık Endometrial hiperplazi ilişkili Endometrioid histoloji baskın Low grade.. Tip 2 Östrojenden bağımsız Non-obez Endometrial atrofi zemini Seröz histoloji baskın High grade.. KORELASYON MÜKEMMEL DEĞİL! *Bokhman JV. Two pathogenetic types of endometrial carcinoma. Gynecol Oncol Feb;15(1):10-7. PubMed PMID:

4 EC Geleneksel Sınıflama - Yetersizlikler Tip 1 vs Tip 2 Overlap Lynch sendromu: zayıf hasta Aynı tip içinde overlap Obezite ilişkili tip 2 tümörler Grade 3 endometrioid ca: tip 2 ye yakın özellikler, hiperplazi ile ilişkisiz olgular Seröz ca: Küçük bir kısmı hiperplazi ilişkili, %20 sinde myometrial invazyon yok

5 EC Geleneksel Sınıflama - Yetersizlikler PIK3CA endometrioidlerin %52 sinde, serözlerin %42 sinde Endometrioidlerin sadece bir grubunda PTEN, KRAS, CTNNB1, PIK3CA TP53 serözlerin %75 inde, endometrioidlerin %12 sinde Serözlerin sadece bir grubunda TP53 ve PPP2R1A Moleküler heterojenite!!

6 The Cancer Genome Atlas 2005, NCI Center for Cancer Genomics 33 kanser tipi Whole genome, exome ve microrna sequencing Pilot dönem GBM ve Over Ca Faz II NCI ve NHGRI 3 yıl 50 milyon dolar Data kullanıma açık 2.5 petabyte veri

7

8

9

10 TCGA Endometrial Kanser Çalışması Endometrioid (307), seröz(53), mikst endometrioid ve seröz(13) 4 ana grup: 1. POLE ekzonükleaz mutasyonu (Ultramutated) 2. MSI (Hypermutated) 3. Copy-number low 4. Copy number high

11

12 POLE (Ultramutated) POLE: DNA Polimerazın bir subuniti (Polimeraz Ꜫ) POLE ekzonükleaz domain inde hot-spot mutasyonları SONUÇ: Çok yüksek düzeyde mutasyon oranları (MSIx5) Kopya sayısı değişiklikleri az PTEN, PIK3R1, PIK3CA, FBXW7 ve KRAS mutasyonları En önemlisi Progresyonsuz gidişat!

13 MSI (Hypermutated) Endometrioid tümörler MLH1 promoter metilasyonu Yüksek mutasyon oranları Kopya sayısı değişiklikleri az KRAS, PTEN mutasyonları

14 Copy Number Low Endometrioid tümörler Mikrosatellit stabil düşük dereceli (1 ve 2) tümörler Sık CTNNB1 mutasyonları

15 Copy Number High (Seröz-Benzeri) Yaygın kopya sayısı değişiklikleri Mutasyon oranları düşük Rekürran TP53, PPPR21A ve FBXW7 mutasyonları PTEN ve KRAS mutasyonları nadir Prognoz kötü Çalışmada bu grupta serözlerin ve mikst karsinomların neredeyse tümü, endometrioidlerin %25i bulunmaktadır POLE dışında hiçbir mutasyon hiçbir gruba özgü değil!

16 Bokhman WHO TCGA Temel Klinik ve epidemiyoloji Histolojik özellikler Genomik karakteristikler Kategoriler Tip I Endometrioid POLE (Ultramutated) MSI (Hypermutated) Copy-number low (endometrioid) Copy number high (seröz benzeri) Tip II Seröz Copy number high (seröz benzeri) Clear cell NA

17 Genomik Sınıflama - Yetersizlikler Sadece endometrioid, seröz ve mikst ca dikkate alınmış! Yüksek dereceli endometrial kanserlerin sınıflaması tecrübeli jinekopatologlar arasında bile düşük gözlemciler arası uyuma sahip!

18

19

20 İntratümöral lenfositler

21 Eozinofilik sitoplazmik değişiklik

22 Mikst endometrioid ve seröz karsinom

23 Sekretuar değişiklikler gösteren endometrioid görünümlü alanlar

24 Seröz görünümlü alanlar, ancak uzun kolumnar hücreler hala endometrioid kuşkusu yaratıyor

25 POLE lerin biri hariç hepsi endometrioid veya endometrioid komponent içeriyor! intratümöral lenfositler %84 high grade (FIGO III) %60 eozinofilik hücre değişikliği %60 intratumoral heterojenite %52 skuamöz diferansiyasyon %40 bizaar/dev hücre değişikliği %40

26 Daha Pragmatik Bir Yaklaşım - ProMisE Talhouk A et al. Molecular classification of endometrial carcinoma on diagnostic specimens is highly concordant with final hysterectomy: Earlier prognostic information to guide treatment. Gynecol Oncol Oct;143(1):46-53.

27

28 Dijital Patoloji

29 Dijital Patoloji Still Images Dynamic Images Whole Slide Images (WSI)

30 WSI Avantajlar Zoom konusunda daha özgür Aynı anda birden çok foküs Preparatlar yanyana Mikroskopsuz aynı vakada telekonferans ya da konsültasyon Preparat kalitesi sonsuza dek aynı Image analyse ve morfometri Elektronik hasta kayıtlarına veya patoloji raporuna entegrasyon

31 Preparat Tarayıcılar Alternatif 1 Tek objektif Aynı anda tek preparat tarama Farklı odak noktaları Açık format (jpeg2000 veya DICOM) Lineer tarama Floresans + Alternatif 2 Farklı objektifler Aynı anda multipl preparat tarama Devamlı tarama Kapalı format CCD kamera Floresans + Floresan dijital görüntüler solmadan süresiz olarak saklanabilir!

32 Preparat Tarayıcılar Farklı foküsleri tarayıp 3 boyutlu görüntü ortaya çıkarma Sitoloji Frozen Section Mitoz

33 WSI Kalitesine Etkili Faktörler Doku kalitesi Teknik Tarayıcının görüntü yakalama tekniği (Foküs, beyaz ayarı, kontrast..) Postprocessing Taramanın tam olup olmaması Monitör veya projektör kalitesi

34 WSI Cihazları ve Tarama Süreleri Dimetrix Aperio ScanScope CS Philips Diğer Cihazlar 58 sn 4 dk <50 sn 9-80 dk arası

35 IT Infrastructure Slide tarayıcı raporlama sistemi entegrasyonu Barkod Depolama Monitör/Projektör Kalitesi Network Format SSD/Fiziksel Disk/Cloud 1600x1200 = %21 mikroskop min 100 mbit JPEG2000/DICOM/ClosedF

36 WSI Uygulamaları Eğitim Tanı Araştırma Arşivleme

37 WSI - Eğitim Multihead Kişi sayısı sınırı! WSI Sınırsız katılım Anotasyonlar, linkler, sorular Profesyonel yazılım gerekli PathXL Digital Slide Box

38 WSI - Dezavantajlar Fiziksel mikroskop eğitimi yok Eğitim infrastructure a bağlı İyi bir scanner WSI, iyi bir mikroskoptan çözünürlük olarak daha iyi değil!

39 WSI Dijital Tanı Zor ve nadir vaka konsultasyonu UMC Utrecht Digital Cons Server Yazılım: mscope Slide Konferansı / Panel Clinical Trials Telerevizyon ve QA Arizona University

40 WSI Görüntü Analizi Morfometrik alan, hacim, uzunluk, dansite gibi ölçümler IHC değerlendirme HER-2 IHC Değerlendirme ACISIII FDA onaylı HER-2, ER, PR değerlendirebiliyor. FISH korelasyonu gözle incelemeden daha yüksek! TMA için ayrı yazılımlar mevcut ACIS Genomx Ariol SL-50

41 WSI Günlük Rutin Validasyon çalışmaları yeterli değil Meme, akciğer, GİS ve prostatta cam prep-wsi yüksek tanısal korelasyonu gösteren çalışmalar mevcut Yaygınlaşırsa Superspecialization!

42 WSI - Araştırma Morfometri Görüntü Analizi TMA Skorlama 3D rekontrüksiyon

43 WSI Dijital Arşiv Cam preparat dezavantajları Geniş arşiv odaları Kırılabilite Boya solması Lojistik ve arşive yanlış yerleştirme WSI Avantajlar Arşiv odasına gerek yok Preparat kalitesi sonsuza dek aynı Kolay erişim Aynı anda multipl kişi erişimi Patoloji raporu entegrasyonu

44 Sosyal Medya ve Patoloji

45

46

47 Pasif Aktif

48

49 1604 hastane* Youtube: 720 Facebook: 1301 Twitter: 1011 LinkedIn: 656 Foursquare: 1080 Blog: 215 Total: 6587 *

50 PATHOLOGY 2.0

51

52 Facebook, Keyword: «Pathology» Pathology Discussion Forum Followers Archives of Pathology & Laboratory Medicine Zagazig Pathology Association Pathology Residents Wiki Differential Diagnosis in Pathology Subspecialty Groups Pathology Job Opportunities Digital Pathology Second Consultation Online Global Pathology Course Kişiler: pathologyforpathology (Sulen Sarioglu)

53 Facebook, Keyword: «Patoloji» Patoloji Dernekleri Federasyonu Patoloji Dernekleri Federasyonu Asistan Komisyonu Patoloji Platformu Türkiye de Patolojinin Geleceği Patoloji Asistan Hekimleri Grubu Patoloji Teknikerleri Derneği Patoloji Laboratuvar Teknikeri Patoloji Çalışanları Derneği Patoloji Teknikerleri Paylaşma Platformu İş Arayan Patoloji Teknikerleri

54 Twitter, Accounts: «Pathology» Human Pathology CAPathologists Pathology Surgical Pathology Virtual Pathology USCAP ERDENER OZER Pathology Student Web Pathology Üniversiteler, Kişiler, Şirketler, Gruplar

55 Twitter, Accounts: «Patoloji» Patoloji Dernekleri Federasyonu Adli Patoloji Patoloji Teknikeri

56 Youtube, keyword: «Patoloji» Ufuk Üniversitesi Patoloji (30 Video) Patoloji nedir? Patologlar ne yapar? (Erdener Özer)

57 Youtube, keyword: «pathology» USCAP TV Pathology mini tutorials WashingtonDeceit Weill Cornell Medicine Department of Pathology and Laboratory Medicine SCC Pathology Jerad Gardner NYCPathology (MountSinai) USCAP Social Media Committee Chair

58 Bloglar - Türkçe

59 Bloglar - Uluslararası PATHO-L Discussion Group:

60

61 Teşekkürler..