ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Transkript

1 ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ Ünvanı : Yrd. Doç. Dr. Adı Soyadı : Tülay İfakat ÇAĞATAY Doğum Tarihi : Doğum Yeri : Bolu Yabancı Dil : İngilizce Uzmanlık alanı : Moleküler Mikrobiyoloji, Deniz Mikrobiyolojisi, Bakteriyal Balık Hastalıkları, Aquatik Biyoyeknoloji, Genomiks ve Proteomiks, Nütrigenomiks E-posta : tulaycagatay@akdeniz.edu.tr Tel : Öğrenim Bilgileri Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Lisans Biyoloji Hacettepe Üniversitesi 1992 Y. Lisans Genel Biyoloji (Mikrobiyoloji) Hacettepe Üniversitesi 1996 Post Graduate Moleküler Mikrobiyoloji Lincoln Üniversitesi 1998 Diploma Doktora Moleküler Mikrobiyoloji Lincoln Üniversitesi 2005 Post Doc. Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Lincoln Üniversitesi 2008 Yüksek Lisans Tez Başlığı ve Tez Danışman(lar)ı: Çağatay, T.I., 1997, Bazı poliaromatik bileşiklerin biyodegredasyonunda beyaz çürükçül fungusun katalaz, süperoksit dismutaz ve lignin peroksidaz aktivitelerinin rolü. Master tezi, Hacettepe Üniv., Fen Fak., Bioloji Bölümü, Ankara, Turkey. Danışman: Prof. Dr. Nazif Kolankaya Doktora Tezi Başlığı ve Danışman(lar)ı : Çağatay, T.I., 2005, The Glycosylation of Type-IV Fimbrial Proteins. Doktora tezi, Lincoln University, Agriculture and Life Sciences Division, Molecular Biology Department, Canterbury, New Zealand. Danışman: Prof. Dr. Jon Hickford Görevler: Görev Unvanı Görev Yeri Yıl Ar. Gör. Hacettepe Üniv., Biyoloji Böl., Biyoteknoloji ABD Lecturer Lincoln Üniv., Molekülar Biyoloji ve Biyoteknoloji Böl GENAR Hacettepe Üniv. Teknokenti 2005 (1 yıl) Lab.Yöneticisi Yrd. Doç. Dr Ahi Evran Üniv., Fen Fak., Biyoloji Böl (5 ay)

2 Yrd. Doç. Dr Akdeniz Üniv., Su Ürünleri Fak., Temel Bilimler Doç. Dr. Prof. Dr. Yönetilen Yüksek Lisans Tezleri: Antalya körfezindeki fekal mikrobiyal kirleticilerin Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile belirlenmesi. (Tamamlandı-2011). Gökkuşağı alabalıklarından (Oncorhynchus mykiss) izole edilen hareketli Aeromonas türlerinde bulunan virulans genlerin tespiti üzerine bir çalışma (Tamamlandı-2012) Yönetilen Doktora Tezleri: Anaç Temin Edilen Bazı Bölgelerdeki Levrek (Dicentrarchus labrax L. 1758) Balıklarında Genetik Varyasyonların Mikrosatelit Markırlar ile Belirlenmesi. (Tamamlandı-2012) Projelerde Yaptığı Görevler : Gökkuşağı Alabalığında (Oncorhynchus Mykiss) Karşılaşılan Bazı Hastalık Etmenlerini Belirlemek Üzere Diagnostik Tanı Kiti Geliştirilmesi İçin Ön Araştırma. Proje Yürütücüsü. Akdeniz Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Proje Birimi nolu A tipi proje. (2012-.). Anaç Temin Edilen Bazı Bölgelerdeki Levrek (Dicentrarchus labrax L. 1758) Balıklarında Genetik Varyasyonların Mikrosatelit Markırlar ile Belirlenmesi. Proje Yürütücüsü. Akdeniz Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Proje Birimi nolu Doktora projesi (Tamamlandı). Gökkuşağı alabalığı nda (Oncorhynchus mykiss) Aeromonas türlerinde hastalığa neden olan (virulans) genlerin karakterizasyonu. Proje Yürütücüsü. Akdeniz Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Proje Birimi nolu Yüksek Lisans projesi (Tamamlandı). Antalya körfezindeki fekal mikrobiyal kirleticilerin Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile belirlenmesi. Proje Yürütücüsü. Akdeniz Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Proje Birimi nolu Yüksek Lisans projesi projesi (Tamamlandı). Antalya Körfezindeki Mikrobiyal Kirleticilerin PCR Yöntemi İle Taranması, Proje Yürütücüsü. Akdeniz Üniversitesi Bilimsel Araştırmalar Proje Birimi nolu A Tipi proje (Tamamlandı) Isolation, Characterization of Pathogen Dichelobacter nodosus, from New Zealand. Proje Asistanı. Lincoln Universitesi AFSD Araştırma Proje Merkezi ( ). Developing Gene Markers for Footrot Resistance and Gene Variations of fima gene of D. nodosus. Proje Asistanı. Lincoln Üniversitesi AFSD Araştırma Proje Merkezi ( ). Polymorphrism at the Ovine 3-Adrenergic Receptor Gene. Proje Asistanı. Universitesi AFSD Araştırma Proje Merkezi projesi ( ). Lincoln Beyaz Çürkçül Funguslar ile Düşük Kaliteli Türk Linyitlerinin Biyolojik Çözünürlüğü. Proje Asistanı. Hacettepe Üniversitesi BAP Projesi ( ).

3 İdari Görevler : Dönem Görev Birim Deniz Biyolojisi ABD Başkanlığı Fak., Bologna Birim Koordinatörü ve Bologna Eşgüdüm Komisyonu Üyesi Fak.Erasmus- LeonardoVinci Birim Koordinatörü Fak.Farabi Birim Koordinatörü Fak.Uzmanlar Grubu Üyesi Fak.Burs ve Sosyal Hizmetler Komisyonu Üyesi Akdeniz Ü., Akünsem / Akvam Danışma Kurulu üyesi Su Ürünleri Fakülte Kurulu Üyesi Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler : Ödül, Destek ve Burslar: 2011-Akdeniz Üniv. ERASMUS-LLP Ders Verme Hareketliliği Programı Akdeniz Üniv.Yayın Teşvik Ödülü Yurt Dışı Bilimsel Etkinliklere Katılma Desteği, TÜBİTAK Akdeniz Üniv., ERASMUS-LLP Ders Verme Hareketliliği Programı TÜBİTAK Bilimsel Araştırmaları Teşvik Ödülü Akdeniz Univ. 3 ay Post Doc. yurtdışı destek desteği, Yeni Zelanda Travel Scholarship (Seyahat Bursu), Lincoln Univ., Yeni Zealanda Travel Scholarship (Seyahat Bursu), Lincoln Univ., Yeni Zealanda Travel Stipend of Glycobiology Society (ulaşım bursu- San Fransisco, USA) Miss Clarice Bell Memorial Doktora Bursu, Lincoln Univ., Yeni Zealanda Grand Lodge of New Zealand Doktora Bursu, Yeni Zelanda Lincoln University Doktora Bursu, Yeni Zelanda The Sarita Catherine McClure Post Graduate Scholarship (Yüksek Lisans ve Doktora bursu), Lincoln Univ., Yeni Zelanda Ziyaretçi Araştırma Bursu (1 ay) (Visitor Scholarship), Monash Univ., Bacterial Pathogenesis Research Group, Microbioloji Böl., Melburn, Avusturalya Yurt dışı bilimsel etkinlik katılım desteği, TUBİTAK. Teşvikler 2011-(10-13 Ocak)-Maldi-TOFF Technology in the II. Euroclone International Workshop of Genomic and Proteomic, Milan, Italya (14 Mart): M-Medical- Molecular Diagnostic Biotechnology, Paris, Fransa.

4 2009-(1-2 Ekim):Workshop on Pathogens that affect agricultural activity, University of Chile, Santiago, Şili (1-5 Ekim): Clontech Europe Molecular Biology workshop, Chantili, Paris, Fransa (Aralık): Exploring Modular Protein Architecture Course, European Molecular Biology organizationin EMBL, Heidelberg, Almanya (Eylül): Clontech Europe Molecular Biology-Cell Biology workshop and meeting, Cabourge, Fransa (26 Haziran-2 Temmuz): Sequenom advanced Maldi-TOF MS training 1, Hamburg, Almanya (1-8 Mart): Sequenom Maldi-TOF MS training 2, Hamburg, Almanya Verdiği lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler: Düzey Lisans Lisansüstü Dersin Adı Genel Mikrobiyoloji, Genetik, Biyokimya, Mesleki İngilizce, Yarıyıl Stajı, Mesleki Uygulama, Bitirme Ödevi, Sucul ekosistemler mikrobiyolojisi, Su Kirliliği ve Canlılara Etkisi, Akuatik Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji, Su Ürünlerinde Moleküler Yaklaşımlar, Akuatik Biyoteknoloji, Uzmanlık Alan Dersi, Danışmanlık, Seminer, Balık İmmunolojisi ve Serolojik Yöntemler, Balık Zoonozlarının Tanımlanması ve Kontrolü, Su Ürünlerinde İleri Biyokimyasal Teknikler, Su Ürünlerinde Moleküler Biyolojik Uygulamalar, Balık popülasyon çalışmalarında kullanılan genetik teknikler ESERLER A. Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler : A1. Çağatay, T.I., 2012, Multiplex-PCR markers for detecting faecal water pollution in Antalya coast, Fresenius Environmental Bulletin, Vol. 21 (12), A2. Çağatay, T.I., ve Hickford, J., 2011, Serotyping Dichelobacter nodosus with PCR- SSCP, Journal of Animal and Veterinary Advances, Vol. 10(13) A3. Çağatay, T.I., ve Hickford, J., 2008, Glycosylation of type-iv fimbriae of Dichelobacter nodosus, Veterinary Microbiology, 126, A4. Çağatay, T.I., 2008, Protein Glycosylation in Pathogen Bacteria, Glycobiology, Vol.18 (11), p A5. Çağatay, T.I., ve Hickford, J., 2006, Characterization of Footrot Bacteria Dichelobacter nodosus Using PCR Amplification and DNA Sequencing Analysis, Turkish Journal of Veteninary Animimal Sciences, Vol. 30, A6. Çağatay, T.I., ve Hickford, J., 2005, Update on Ovine Footrot in New Zealand: Isolation, Identification and Characterization of Dichelobacter nodosus strains, Veterinary Microbiology, 111, DOI: /j.vetmic

5 A7. Çağatay, T.I., ve Hickford, J., 2003, Type IV pilin of D. nodusus is glycosylated, Glycobiology, Vol 13 (11), B. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler : B1. Çağatay, T.I., 2012, Development of DNA-based diagnostic commercial kit for marine fıish pathogens, Aqua 2012, 1-5 Eylül, Prag, Çek Cumhuriyeti. B2. Bodur, T., Cagatay, T.I., 2012, Determination of morphologic structure of European sea bass Dicentrarchus labrax for selective breedıng in Turkey, Aqua 2012, 1-5 Eylül, Prag, Çek Cumhuriyeti. B3. Çağatay, T.I., 2012, A New tool: Phage therapy against fish pathogens in marine aquaculture, 1. Ulusal Marine Bioteknoloji ve Genomiks Çalıştayı, Mayıs, Bodrum, TUDAV yayını. B4. Çağatay, T.I., 2011, Virulence markers in Aeromonas spp. in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), Aquaculture Europe 2011, Ekim, Rodos, Yunanistan. B5. Çağatay, T.I., 2010, Detection of Major Fish Pathogens with Multiple PCR in Turkey European Science Foundation (ESF)-COST Conference on Marine Biotechnology Future Challenges in Maretea, Italy. B6. Çağatay, T.I., 2010, Detection of Fecal Indicator bacteria from surface and deep water by using multıplex PCR, 14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society, September, Palacongressi, Rimini, Italy B7. Çagatay, T.I., 2009, Detection of Major Fish Pathogens in Rainbow trout with Multiplex PCR, 14th EAFP International Conference Diaseases of Fish and Shellfish, Prag, Çekoslovakya. B8. Çagatay, T.I., 2009, DNA-based rapid detection technique for major fish pathogens in cultured rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). lnternational Workshop on Molecular and Genetic Research Workshop on Pathogens that affect agricultural Productivity, 1-2 Ekim, San Tiago, Şili. B9. Çagatay, T.I., Gümüş, E., Dağaşan, M., ve Şen, E.B., 2009, Major fish pathogens in cultured rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). lnternational Workshop on Molecular and Genetic Research Workshop on Pathogens that affect agricultural Productivity, 1-2 Ekim, San Tiago, Şili (POSTER). B10. Çagatay, T.I., 2009, DNA-based rapid detection technique for fish pathogens in cultured rainbow trout in Turkey, Genomics in Aquaculture International Symposium, Bodo, Norveç. B11. Dere, T.I., ve Kolankaya, N., The Role of Superoxide Dismutase, Catalase Activity of Fungi on Biodegradation of Some Polyaromatics. 33. International Forensic Toxicology and 1. Environmental Toxicology, Eylül, Selanik, Yunanistan. B12. Kolankaya, N., Ergene, A., ve Dere, T.I, Düşük Kaliteli Linyitlerin Biyosolubilizasyonu. Sixth European Congress on Biotechnology, Haziran, Floransa, Italya.

6 C. Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler : C1. Cagatay, T.I., ve Adanır, R., 2012, Balıklarda enterohepatic sistemde görülen Trematod enfeksiyonları. Türkiye Parazitoloji Derneği yayınları (Baskıda) C2. Adanır, R., ve Cagatay, T.I., 2012, Balıklarda enterohepatic sistemde görülen Cestod enfeksiyonları. Türkiye Parazitoloji Derneği yayınları (Baskıda) C3. Çağatay, T.I., 2012, A New tool: Phage therapy against fish pathogens in marine aquaculture, TUDAV yayını, C4. Cagatay, T.I., 2010, The Glycosylation of Dichelobacter nodosus Fimbriae-Host Pathogen Relationship, 2010, LAP Lambert Academic Publishing, Deutschland, ISBN: , D. Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler : D1. Unlusayın, M, İlhan, R., ve Cagatay., T.I., Balik Proteinlerinin Saflaştirilmasinda Kullanilan Son Yöntemler, 2009, Journal of Fisheries Sciences, 3(4), D2. Kolankaya, N., Dere, T.I., ve Ergene, A., 1995, Beyaz çürkçül funguslarla bazı düşük kaliteli Türk linyitlerinin sıvılaştırılması, Hacettepe Fen Mühendislik Bilimleri Dergisi, Cilt 16, E. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında basılan bildiriler: E1. Şen, E.B., Çagatay, T.I., 2011, Gökkuşağı alabalığında hastalığa neden olan Aeromonas spp. etkenlerinin moleküler yöntemlerle tespiti, 16. Su Ürünleri Sempozyumu, Antalya. E2. Çagatay, T.I., ve Dağaşan, M., 2011, Deniz suyunda fekal mikrobiyal kirleticilerin multiplex PCR ile belirlenmesi, 16. Su Ürünleri Sempozyumu, Antalya. E3. Şen, E.B., Çagatay, T.I., 2010, Gökkuşağı alabalığı hastalık etkeni olan Aeromonas türlerinin Çoklu PCR Yöntemi ile Teşhisi, 2. Ulusal Alabalık Sempozyumu, 2010, Karaman. E4. Çagatay, I.T., Şen, E.B., Dağaşan, M, Gümüş, E., 2010, Gökkuşağı alabalığında bakteriyal hastalık etkenlerinin PCR ile tespiti, 20. Biyoloji Kongresi, Denizli. E5. Çagatay, T.I., Şen, E.B., Dağaşan, M, 2010, Körfezinde fekal mikrobial kirleticilerin PCR ile belirlenmesi, Ekoloji Sempozyumu, Aksaray. E6. Çagatay, T.I., 2009, Gökkuşağı alabalığında karşılaşılan balık patojenlerinin teşhisi, 15. Su Ürünleri Sempozyumu, Rize. E6. Çagatay, T.I. ve Kolankaya, N., 2005,, Bazı poliaromatiklerin biyodegradasyonunda Phanerochaete chrysosporium un lignin peroksidaz, süreoksit

7 dismutaz, katalaz aktivitelerinin Rolü, 14. BiyoteknoloJİ Kongresi, 31 Agustos-2 Eylül, Eskişehir. E7. Çağatay, T.I., Hickford, J., 2001, Glycosylation of D. nodosus fimbrial subunit proteins?, XII. Biyoteknoloji Kongresi, Eylül, Ayvalik-Balıkesir. E8. Dere, T.I., ve Kolankaya,. N., 1996, Bazı poliklorlu aromatiklerin detoksifikasyon enzimleri üzerine etkisi, 13. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eylül 1996, İstanbul. E9. Kolankaya, N., Ergene, A., Dere, T.I., Taşpınar A., Taşkın, K.M., 1994, Beyaz çürükçül funguslarda kömürün biyosolubilizasyonu, 12. Ulusal Biyoloji Kongresi, 6-8 Temmuz, Edirne. E10. Kolankaya, N., Gökcay, C.F., Ergene, A., ve Dere, T.I., 1993, Türkiye bazı linyitlerinin mikrobiyolojik sıvılaştırılması, 8. KÜKEM Dergisi, Cilt 16, Vol. 16, No. 2, p. 94. Ankara. F. Diğer yayınlar :