Sensör Bakteri Geliştirilmesi için Escherichia coli Hücrelerinin Transformasyon Optimizasyonları
|
|
- Ekin Konca
- 7 yıl önce
- İzleme sayısı:
Transkript
1 Sensör Bakteri Geliştirilmesi için Escherichia coli Hücrelerinin Transformasyon Optimizasyonları Başak Alan, Özgür Ozan Ceylan, Cansu Çelik, Berkhan Genç, Sevecen Kaplan, Süleyman Mert Yiğitbaşı Danışman: Prof. Dr. Feride İffet Şahin ÖZET: Uluslararası Genetik Mühendisliğiyle Geliştirilmiş Makine (International Genetically Engineered Machine-iGEM) yarışması Massachusetts Teknoloji Enstitüsü tarafından üniversite öğrencilerinin katılımıyla düzenlenmektedir. Yarışma kapsamında genler ve genetik kontrol üniteleri birleştirilerek bakteri ve diğer organizmalara özelleşmiş fonksiyonlar kazandırılmaktadır. Çalışma grubumuz yarışmaya katılmak için Baskent_Meds takım ismiyle kayıt yaptırmıştır. Takımımız Legionella pneumophila yı tür düzeyinde özgül olarak algılayabilen ve ifadelenme düzeyinde bu algıya cevap vererek bazı Stafilokok suşların salgıladığı anti-legionella peptidini üretebilen Escherichia coli hücreleri oluşturmayı hedeflemektedir. Projemiz kapsamlı ve uzun soluklu bir çalışma olup, Dönem II Çalışma Grubu nda sensör hücrelerin oluşturulması için Legionella pneumophila quorum sensing mekanizmasından sorumlu lqs gen bölgesinin E. coli hücrelerine klonlanabilmesi için alıcı uyumlu hücre gruplarının oluşturulması ve transformasyon yöntemlerinin optimize edilmesi amaçlanmıştır (2, 19). Anahtar kelimeler: Kompetan bakteri suşu, transformasyon, plazmid izolasyonu Giriş: Legionella bakterileri gram negatif patojen mikroorganizmalardır. Su depolama tankları, havuzlar, klimalar gibi sistemler bu bakterinin çoğalması için elverişli ortamlardır (3, 11). Elliye yakın çeşidi tespit edilmiş olup, L.pneumophilla, Legionella kökenli tüm enfeksiyonların yaklaşık %90 ına kaynaklık etmektedir. Virulans faktörünü insanda intrasellüler yaşam sürdürdüğü akciğer alveolar hücrelerinde göstermektedir. Bakterilerin bulunduğu ortamda düşük veya yüksek miktardaki popülasyon yoğunluğunu ayırt edebilmesi türlere özel sinyal moleküllerinin algılanması ile mümkün olmaktadır. Böylelikle hücre sayısındaki değişikliğe cevap olarak gen ekspresyonu, simbiyozis, virülans, antibiyotik üretimi ve biyofilm oluşumunun popülasyon düzeyinde kontrolü düzenlenebilmektedir (8, 17, 19, 22). Bu olay Quorum Sensing (QS) olarak ifade edilmektedir. Legionella pneumophila ve Vibrio cholera türlerinin quorum sensing molekülleri α-hidrosilketon türleridir (15, 18, 21). L. pneumophila da lqsa (autoinducer
2 synthase), lqsr (response regulator) ve lqss (sensor kinase) genlerinden oluşan lqs (legionalla quorum sensing) gen kümesi quorum sensing mekanizmasından sorumludur (20, 21). Sebep olduğu ölümlerin çoğu, kolay tespit edilememesi ya da belirtilerinin Klebsiella pneumoniae belirtileri ile karıştırılmasından kaynaklanmaktadır. L. pneumophila lqs algılama sisteminin bazı gen bileşenlerinin başka bir bakteriye aktarılması ile L. pneumophila yı tür düzeyinde özgül olarak algılayabilen ve ifadelenme düzeyinde bu algıya cevap verebilen hücreler oluşturmak mümkündür (16). GEREÇ VE YÖNTEM: Besiyeri Hazırlanması 50 ml SOC medium hazırlanması: İlk olarak; 1 gr tryptone (Tryptic Soy Broth), 0.25 gr yeast extract, 0.5 ml 1 M NaCl, 41.7 ml 3 M KCl konulur ve distile su(dh 2 O) ile 49 ml ye tamamlanır ardından 121 C de 20 otoklavlanır. İkinci olarak hazırlanan; 0,9522 gr MgCl 2 (5 ml), 1,233 g MgSO 4.7H2O konularak, dh 2 O ile 5 ml ye tamamlanır ve filtre sterilizasyonu (0,2 m) uygulanır. Hazırlanan 2M glikoz çözeltisinden 5 ml bu çözeltiye eklenir. İlk hazırlanan çözeltiye steril koşullarda 0,5 ml ikinci çözeltiden ve 0,5 ml son çözeltiden eklenir. Luria Broth Agar-Ampisillin (100 g/ml) hazırlanması: 10 g LB broth ve 6 g agar agar dh 2 O ile 400 ml ye tamamlanır. ph 7,5 a ayarlanır. 121 C da 20 otoklavlanır. Ampisillin stok çözeltisi (40 mg/ml): 200 mg ampisillin 5 ml steril dh 2 O eklenir. Ardından filtre sterilizasyonu (0,2 m) yapılır. Ampisillin, LBA solüsyonuna petriler dökülmeden eklenir ve petriler dökülür (7). JM109, DH5α ve XL1-Blue E. coli Suşlarından CaCl 2 Çöktürme Yöntemi ile Kompetan (Alıcı Uyumlu) Hücre Eldesi Bir gece katı besiyerinde (Luria Broth Agar; LBA) büyüyen kültürler sıvı besiyerine (LB) inoküle edilir. Ardından 37 C, yaklaşık 3 saat inkübasyon yapılır ve 30 dakikada bir 600 nm de optik yoğunluk (OD) ölçülür. OD yaklaşık 0,6 olduğunda kültürler 15 ml lik falkon tüplerde 10 buz üzerinde inkübe edilir. İnkübe edilen kültürler 4 C da 4000 rpm de 10 santrifüj edilir. Süpernatant atılır ve pellet kurutulur. Pellete 2 ml 0,1M CaCl 2 eklenerek pellet çözülür. Tekrar 4 C de 4000 rpm de 10 santrifüj edilir. Süpernatant atılır ve pellet
3 1,2 ml 0,1M CaCl 2 içeren 200 l süspansiyon eppendorf tüplere dağıtılır. Elde edilen hücreler -40 C da saklanır. Transformasyon Transformasyon aşamasında kullanılan vektörler lqs bölgesini içeren pucbm20 (pnt-1), lqsa genini içeren pmmb207c-rbs (pts-2) ekspresyon vektörü, luc genini içeren puseamp(+) ve kontrol pgem -3Z vektörleridir. Transformasyonda kullanılan tüm plastik malzeme soğuk olarak kullanılır. -40 C dan çıkartılan hücreler buz üzerinde eritilir ve erimenin hemen ardından hücrelerin ısısı yükselmeden 50 l hücre kültürüne 5 l vektör eklenir. 30 buzda inkübe edildikten sonra C daki su banyosunda inkübasyon yapılır. 2 buz inkübasyonunun ardından 450 l SOC besiyeri eklenir. 37 C da 3 saat çalkalamalı inkübasyon ile kültürler 60 çoğaltılır. 100 l kültür ampisillin içeren LBA besiyerine yayma yöntemi ile inoküle edilir (4). Plazmid İzolasyonu QIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen, Almanya) kullanılarak üretici firmanın önerileri doğrultusunda plazmid izolasyonu yapıldı. Bu kapsamda; bir gece 37 C da inkübe edilen 5 ml (LB) taze kültür 8000 rpm de 3 santrifüjlenir ve süpernatant atılır. 250 µl Buffer P1 eklenerek pellet çözülür ve mikrosantrifüj tüpüne aktarılır. 250 µl Buffer P2 eklenir ve örnek berraklaşıncaya kadar 4-6 kere ters düz edilerek karıştırılır. 350 µl Buffer N3 eklenir ve 4-6 kere ters düz edilerek karıştırılır rpm de 10 mikrosantrifüj yapılır. Süpernatant elüsyon kolonuna alınır ve 60 santrifüj yapılır. Kolondan geçen süzüntü atılır. Kolon, 0,5 ml Buffer PB eklenerek yıkanır ve 60 santrifüj yapılır. Kolondan geçen süzüntü atılır. Kolon 0,75 ml Buffer PE eklenerek yıkanır ve 60 santrifüj yapılır. Kolondan geçen süzüntü atılır. Kolon 2 ml lik eppendorf tüpe yerleştirilir ve kolona 50 µl Buffer EB eklenir, 1 beklemenin ardından 1 santrifüj yapılarak plazmid süzüntüde elde edilir. Elde edilen plazmid -20 C da saklanır. Koloni Polimeraz Zincir Reaksiyonu (kpzr) Koloni polimeraz zincir reaksiyonunun (6) karışımının içeriği Tablo 1 de verilmektedir. Hazırlanan PZR karışımına steril kürdan ile seçilen tek koloni eklenir. 96 C da 5 inkübasyonun ardından PZR tüpüne 1 ünite Taq polimeraz eklendikten sonra Tablo 2 de koşulları belirtilen PZR uygulanır. Tablo 1 Reaksiyon karışımı l
4 dh 2 O 35,8 10X PZR Tamponu 5 25mM MgCl 2 5 2,5mM dntp 4 100p mol/ l ileri ve geri primerler 0,5/0,5
5 Tablo 2 C dk Siklus İlk denatürasyon Denatürasyon 95 1 Bağlanma Uzama 72 2 Son uzama İnkübasyon 4 - Agaroz Jel Elektroforezi Agaroz Jel Hazırlanması: 9 g agaroz tartılır ve 60 ml 1X tris borik sit EDTA (TBE) eklenir. Agaroz, mikrodalga fırında ısıtılarak kaynatılarak solüsyon berraklaşıncaya kadar çözdürülür. etidyum bromür son konsantrasyonu 0,5 g/ml olacak şekilde eklenir ve çalkalayarak tüm çözeltiye dağılması sağlanır. Solüsyonun biraz soğuması beklendikten sonra agaroz tabağına yavaşça dökülür ve polimerizasyon için beklemeye bırakılır. Örneklerin Jele Yüklenmesi: Jel 1X TBE tamponu içeren tanka yerleştirilir. Örnekler yükleme tamponu (6X; Fermentas, USA) ile 1:5 oranında karıştırılarak kuyucuklara yüklenir. Başka bir kuyucuğa 6 l markör (Fermentas) yüklenir. Elektroforez 90 V da 70 dakika yürütülür (5). Bu çalışma Başkent Üniversitesi Tıp ve Sağlık Bilimleri Araştırma Kurulu tarafından onaylanmış (DA12/05) ve Başkent Üniversitesi Araştırma Fonunca desteklenmiştir. BULGULAR Her üç kompetan suş ile yapılan transformasyon çalışmaları sonucunda, JM109 suşundan elde edilen kompetan hücrelerin transformasyon verimliğinin daha yüksek olduğu saptandı (Şekil1).
6 Şekil 1: Her üç suş için transformasyon sonuçları Seçilen transforme kolonilerden izole edilen puseamp ve pgem-3z vektörleri agaroz jel elektroforezi ile görüntülendi (Şekil 2). puseamp(+)-luc vektörü ile transformasyon, luc primerleri kullanılarak koloni polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ve agaroz jel elektroforezi ile doğrulandı (Şekil 3). Şekil 2: Seçilen transfome JM109 kolonileri ve izole edilen puseamp ve pgem-3z vektörlerinin agaroz jel elektroforez görüntüleri
7 Şekil 3: Her üç suş için transformasyon sonuçları 200 ng pnt-1 ve pts-2 plazmid miktarı ile gerçekleştirilen transformasyonun yüksek moleküler ağırlıklı bu plazmidler için yeterli olmadığı saptandı (Şekil 4). Çalışmalarımız bu plazmidlerin E. coli hücrelerine transformasyonu için devam etmektedir. Şekil 4: JM109 hücrelerine pnt-1 ve pts-2 plazmidleri ile yapılan transformasyon sonuçları igem Hakkında Uluslararası Genetik Mühendisliğiyle Geliştirilmiş Makine (International Genetically Engineered Machine igem) Massachusetts Teknoloji Enstitüsü (MIT) tarafından 2004 yılından itibaren dünyanın çeşitli bölgelerindeki üniversite takımlarının katılımı ile düzenlenmekte olan bir yarışmadır. Bu takımlar, sentetik biyoloji ve mühendislik yaklaşımlarını kullanarak fonksiyonel biyolojik sistemler oluşturmaktadır. Yarışma kapsamında, akademisyenler ve gönüllü araştırmacılar, DNA tabanlı yeniden standart biyolojik parçalar oluşturup tüm araştırmacıların kullanımına sunmuştur. Bu genetik parçaları kapsayan bir DNA seti ile çalışmaya başlayan biyoteknoloji konusuna meraklı yüksek lisans, lisans ve lise seviyelerindeki öğrencilerden oluşan takımlar günlük yaşamda karşılaşılan problemlere çözüm olabilecek yeni genetik programlar oluşturmaya
8 çalışıyorlar. Bu yaklaşım oldukça karmaşık olan biyolojik veri birikimini belirli kıstaslara göre kategorize ederek belirli standartlar oluşturmak ve bu standartları kullanarak hazırlanacak biyolojik parçaları (genler ve genetik kontrol üniteleri) bir bilgi bankasında kataloglamak üzerine oturuyor. Yarışmanın finalinde ise takım üyeleri, araştırma projelerini içinde akademisyenlerin, endüstri ve sosyal bilimler alanında uzman kişilerin bulunduğu bir jüriye ve diğer takımlara sunuyor. Yarışma sonucu üniversite takımlarına proje fikirlerinin tutarlılığı, deneylerinde ulaştıkları sonuçlar ve projelerinin bilim dünyasına katkısı göz önünde bulundurularak 6 klasmanda Altın, Gümüş ve Bronz madalyalar veriliyor(9). Gelecek hedefimiz; Legionella pneumophila yı tür düzeyinde özgül olarak algılayabilen ve ifadelenme düzeyinde bu algıya cevap vererek, bazı Stafilokok suşların salgıladığı anti- Legionella peptidini üretebilen Escherichia coli hücreleri oluşturmaktır. Proje kapsamında, iki adet transforme E. coli üretilecektir (2). Bunlardan bir tanesi L. pneumophilia LqsA gen bölgesini içeren plazmid ile, ikincisi ise L. pneumophilia LqsR ve LqsS gen bölgelerini ve Warnericin RK peptidini (22 aa düz peptit) içeren plazmid ile transforme edilmiş olacaktır (12, 20, 23, 25, 26). Bu plazmid büyüklük olarak taşıyabilirse, renk reaksiyonu oluşturacak bir gen bölgesi de içerecektir. LqsA ile transforme E. coli, çalışmamızda ürettiğimiz kompozit plazmitin Legionella pneumophilia yı algıladığını göstermek amacıyla kontrol bakteri olarak kullanılacaktır. Projeden beklentimiz, hazırladığımız plazmitin Legionella pneumophiliayı tanıyarak, kontamine edebileceği yüzeylerde çoğalmasını engellemesini sağlamaktır. KAYNAKLAR 1) Bastos MCF, Ceotto H, Coelho MLV, et al. Staphylococcal Antimicrobial Peptides: Relevant Properties and Potential Current Biotechnological Applications. Pharma Biotech. 2009; 10: ) Choi JH, Lee SY. Secretory and extracellular production of recombinant proteins using Escherichia coli. Appl Microbiol Biotech. 2004; 64: ) Declerck P. Biofilms: the environmental playground of Legionella pneumophilaemi. Environ Microbiol. 2010; 12(3): ) Frederick M. Ausubel (Editor), Roger Brent (Editor), Robert E. Kingston (Editor), David D. Moore (Editor), J. G. Seidman (Editor), John A. Smith (Editor), Kevin Struhl (Editor), Short Protocols in Molecular Biology, 4th Edition, John Wiley & Sons, Inc., Canada, 1999; ) Frederick M. Ausubel (Editor), Roger Brent (Editor), Robert E. Kingston (Editor), David D. Moore (Editor), J. G. Seidman (Editor), John A.
9 Smith (Editor), Kevin Struhl (Editor), Short Protocols in Molecular Biology, 4th Edition, John Wiley & Sons, Inc., Canada, 1999; ) Frederick M. Ausubel (Editor), Roger Brent (Editor), Robert E. Kingston (Editor), David D. Moore (Editor), J. G. Seidman (Editor), John A. Smith (Editor), Kevin Struhl (Editor), Short Protocols in Molecular Biology, 4th Edition, John Wiley & Sons, Inc., Canada, 1999; ) Frederick M. Ausubel (Editor), Roger Brent (Editor), Robert E. Kingston (Editor), David D. Moore (Editor), J. G. Seidman (Editor), John A. Smith (Editor), Kevin Struhl (Editor), Short Protocols in Molecular Biology, 4th Edition, John Wiley & Sons, Inc., Canada, 1999; 1-2 8) Guerrieri El, Bondi M, Sabia C et al. Effect of Bacterial Interference on Biofilm Development by Legionella pneumophila. Curr Microbiol. 2008; 57: ) 10) Huang Y, Huang,J Chen Y. Alpha-helical cationic antimicrobial peptides: relationships of structure and function. Protein Cell 2010; 1(2): ) Loret JF, Robert S, Thomas V, et al. Comparison of disinfectants for biofilm, protozoa and Legionella control. J Water Health. 2005; 3(4): ) Low KO, Mahadi NM, Rahim RA, et al. An effective extracellular protein secretion by an ABC transporter system in Escherichia coli: statistical modeling and optimization of cyclodextrin glucanotransferase secretory production. J Ind Microbiol Biotechnol. 2011; 38: ) Mohammed Al-Mahrous M, Jack WR, Sandiford SK, et al. Identification of a haemolysin-like peptide with antibacterial activity using the draft genome sequence of Staphylococcus epidermidis strain A487. Immunol Med Microbiol. 2011; 62: ) Marchand A, Verdon J, Lacombe C, et al. Anti-Legionella activity of staphylococcal hemolytic peptides. Peptides 2011; 32: ) Molofsky AB and Swanson MS. Legionella pneumophila CsrA is a pivotal repressor of traits and activator of replication. Molecular Microbiology 2003; 50(2): ) Murray PR, Rosenthal KS, and Pfaller MS, Medical Microbiology, 6th Ed, Mosby Elsevier, Philadelpia, PA, USA; 2009; ) Sahr T, Bruggemann H, Buchrieser C, et al. Two small mcrnas jointly govern virulence and transmission in Legionella pneumophila.molecular Microbiology 2009; 72(3): ) Tiaden A, Spirig T, Hilbi H. Bacterial gene regulation by a-hydroxyketone signaling. Trends Microbiol. 2010; 18(7):288-97
10 19) Tiaden A, Spirig T, Carranza P et al. Synergistic Contribution of the Legionella pneumophila lqs Genes to Pathogen-Host Interactions. J Bacteriol. 2008; 190(22): ) Tiaden A, Spirig T, Hilbi H, et al. The Legionella pneumophila response regulator LqsR promotes host cell interactions as an elementof the virulence regulatory network controlled by RpoS and LetA. Cellular Microbiology 2007; 9(12): ) Tiaden A, Spirig T, Hilbi H, et al. The legionella Autoinducer Synthase LqsA Produces an α-hydroxyketane Signaling Molecule. The journal of Biological Chemistry 2008; 283(26): ) Tiaden A, Spirig T, Sahr T, et al. The autoinducer synthase LqsA and putative sensorkinase LqsS regulate phagocyte interactions,extracellular filaments and a genomic island of Legionella pneumophila. Environ Microbiol. 2010; 12(5): ) Verdon J, Falge M, Maier E, et al. Detergent-Like Activity and a-helical Structure of Warnericin RK,an Anti-Legionella Peptide. Biophy J. 2009; 97: ) Verdon J, Girardin N, Lacombe C et al. δ-hemolysin, an update on a membraneinteracting peptide. Peptides 2009; 30: ) Verdon J, Labanowski J, Sahr T et al. Fatty acid composition modulates sensitivity of Legionella pneumophila to warnericin RK, an antimicrobial peptide. Biochim Biophy Acta. 2011; 1808: ) Verdon J,Héchard Y,Lacombe C. Characterization of anti-legionella activity of warnericin RK and delta-lysin I from Staphylococcus warneri. Peptides 2008; 29:
Legionella Pneumophillia yı Tür Düzeyinde Algılayan Biyosensör Escherichia Coli Hücrelerinin Oluşturulması
Legionella Pneumophillia yı Tür Düzeyinde Algılayan Biyosensör Escherichia Coli Hücrelerinin Oluşturulması Başak Alan, Özgür Ozan Ceylan, Cansu Çelik, Berkhan Genç, Sevecen Kaplan, Süleyman Mert Yiğitbaşı
DetaylıRTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti
RTA JEL / PZR Saflaştırma Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 DNA parçalarının agaroz jelden geri kazanımı ve PZR ürünlerinin saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09009050
DetaylıPOLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)
Deney: M 1 POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP) a) PCR yöntemi uygulaması b) RPLF sonuçları değerlendirilmesi I. Araç ve Gereç dntp (deoksi Nükleotid
DetaylıRTA Bakteriden Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Bakteriden Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 IVD Bakteri örneklerinden genomik nükleik asit izolasyonu ve saflaştırılması için In vitro tanı amaçlı kullanım için Yalnızca
DetaylıKAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA
İçerik Giriş...2 Deney İçin Gerekli Olan Malzemeler...3 Deneyin Yapılışı... 4-9 Genomik DNA Kalıbının Hazırlanması...4 PCR Amplifikasyonu... 4-5 DNA Miktarının Belirlenmesi...6 Sekans Reaksiyonunun Hazırlanması...7
Detaylı1. Ekstraksiyon Tamponu: %2 (w/v) CTAB (Cetyltrimethyl-ammonium bromide) 1.4 M NaCl, % 0.2 (v/v) β-merkaptoetanol, 20 mm EDTA. 100 mm Tris-HCl (ph 8)
KONU-7. MOLEKÜLER BĠYOLOJĠDE TEMEL TEKNĠKLER BĠTKĠDEN GENOMĠK DNA ĠZOLASYONU Kullanılan Tamponlar: 1. Ekstraksiyon Tamponu: %2 (w/v) CTAB (Cetyltrimethyl-ammonium bromide) 1.4 M NaCl, % 0.2 (v/v) β-merkaptoetanol,
DetaylıBiyofilmler; mikroorganizmaların, biyotik veya abiyotik yüzeylere adhezyonu sonrasında oluşturdukları glikokaliks olarak da adlandırılan
Biyofilmler; mikroorganizmaların, biyotik veya abiyotik yüzeylere adhezyonu sonrasında oluşturdukları glikokaliks olarak da adlandırılan ekstraselluler matriks içinde, birbirlerine yapışarak meydana getirdikleri
DetaylıLizis tamponu (50mL) : NaC 0,15M, EDTA 5mM, Tris-HCL 50mM, Np40 %1, Proteaz inhibitör kokteyli-1 tablet (Roche 50mL için ETDA free)
4. UYGULAMALI PROTEİN ELDESİ YÖNTEMLERİ A. BİLGİ Organlarda, dokularda ve hücre içerisinde bulunan proteinlerin analiz edilebilmesi için önce hücrenin dışına, bir sıvı içerisinde çıkarılmalıdırlar. Bu
DetaylıApplication of an Alternative Recombinant System for Chondroitin Sulfate Synthesis
2017 Published in 5th International Symposium on Innovative Technologies in Engineering and Science 29-30 September 2017 (ISITES2017 Baku - Azerbaijan) Application of an Alternative Recombinant System
DetaylıREAKSİYON PRENSİPLERİ
REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda
DetaylıProtokolü PD S Reaksiyon
Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 www.bmlabosis.com İnternal Pozitif
DetaylıSoru 1: DNA miktarını saptamak için spektrofotometrik yöntemin arkasındaki prensibi açıklayınız:
Ara Sınav Soruları Soru 1: DNA miktarını saptamak için spektrofotometrik yöntemin arkasındaki prensibi açıklayınız: Cevap1: 260 nm de 1 cm yol uzunluğundaki OD = 50 μ g/ml çift sarmal DNA için, 40 μ g/ml
DetaylıREKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL
Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL 1960 lardan bu yana genetik ve moleküler biyolojideki kavrayışımızın hızla artması, biyoteknolojide heyecan verici buluşlar ve uygulamalara yol açtı. DNA yapısı ve fonksiyonlarının
DetaylıProtokolü PD S001 01. 50 Reaksiyon
Salmonella sp. Real time PCR Tespit Kiti Protokolü PD S001 01 50 Reaksiyon REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen
DetaylıRTA Plazmid DNA İzolasyon Kiti
RTA Plazmid DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 Bakteri örneklerinden plazmid DNA izolasyonu ve saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09007050 50 test 09007100
DetaylıRTA Kandan Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Kandan Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-05 IVD İnsan kan örneklerinden in vitro tanı amaçlı genomik nükleik asit izolasyon ve saflaştırması için In vitro tanı amaçlı
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI güz dönemi 2. HAFTA GAZİ ÜNİVERSİTESİ FEN FAKÜLTESİ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ
MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI 2014-2015 güz dönemi 2. HAFTA GAZİ ÜNİVERSİTESİ FEN FAKÜLTESİ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARINDA KULLANILAN CİHAZLAR ÇEKER OCAK STERİL KABİN HASSAS TERAZİ
DetaylıRTA Mayadan Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Mayadan Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Klavuzu Yayın Tarihi - 2011-12 Maya örneklerinden genomik nükleik asit izolasyonu ve saflaştırılması için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09002050
DetaylıKromozom, DNA ve Gen. Allel Segregasyonu. DNA çift sarmalı. Hastalık yapan mutasyonlar protein fonksiyonunu bozar. Hastalık yapan mutasyonlar
Temel Genetik Kavramlar DNA izolasyon yöntemleri Kromozom, DNA ve Gen Hücre Nukleus Kromozomlar Gen Prof.Dr.Uğur ÖZBEK Protein DNA çift sarmalı Allel Segregasyonu Şeker Fosfat omurga Bazlar Baz çifti A
DetaylıBiyolistik - Gen Silahı. İlker Gönülalp Yıldız Teknik Üniversitesi Biyoloji Bölümü
Biyolistik - Gen Silahı İlker Gönülalp Yıldız Teknik Üniversitesi Biyoloji Bölümü Biyolistik Biyolistik, biyolojik ve balistik kelimelerinin kısaltmalarının birleştirilmesi şeklinde adlandırılan, hücrelerin
DetaylıEnzimlerinin Saptanmasında
Gram Negatif Bakterilerde Karbapenemaz Enzimlerinin Saptanmasında OXA-48 K-Se T, Blue-Carba Test ve PCR Testlerinin Etkinliğinin Karşılaştırılması Ayham Abulaila, Fatma Erdem, Zerrin Aktaş, Oral Öncül
DetaylıMAIA Pesticide MultiTest
MAIA Pesticide MultiTest GIDALARDA PESTİSiT KALINTILARI İÇİN AB MAKSİMUM KALINTI LİMİTLERİ İLE UYUMLU ÇOKLU KALINTI TARAMA TESTİ Microplate Acetylcholinesterase Inhibition Assay (MAIA) katı veya sıvı gıda
DetaylıMİKROBİYOLOJİ LABORATUARINDA SIK KULLANILAN BAZI BESİYERLERİNİN HAZIRLANMASI VE MUHAFAZASI
MİKROBİYOLOJİ LABORATUARINDA SIK KULLANILAN BAZI BESİYERLERİNİN HAZIRLANMASI VE MUHAFAZASI Çevre Mühendisliği Laboratuarlarında yaptığımız mikrobiyolojik deneylerde en çok buyyon ve jeloz besiyerlerini
DetaylıDNA Đzolasyonu. Alkaline-SDS Plasmit Minipreleri. Miniprep ler bakteri kültüründen plasmit DNA sı izole etmenizi sağlar.
DNA Đzolasyonu Saflaştırılmak istenen DNA ya genomik DNA dır ya da genomik olmayan mtdna, chldna, plasmit DNAsıdır.DNA izolasyon kitleri, genomik ve genomik olmayan DNA izole etmemizi sağlayan standartlaştırılmış
DetaylıListeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti
Listeria Monocytogenes Real time PCR Tespit Kiti Protokol PD LM00 0 50 Reaksiyon REŞİT GALİP CADDESİ 74-7 06700 ÇANKAYA, ANKARA, TÜRKİYE T +90 32 447 22 79 / 80 F +90 32 447 22 07 W www.bmlabosis.com İnternal
DetaylıNÜKLEİK ASİTLERİN ELEKTROFOREZİ
T.C. FIRAT ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ NÜKLEİK ASİTLERİN ELEKTROFOREZİ Yüksek Lisans Semineri Hazırlayan: Venhar ÇELİK Danışman: Yrd.Doç.Dr. Dilek Turgut-BALIK NÜKLEİK ASİTLERİN
DetaylıRTA Dokudan ve Parafine-Gömülü Dokudan Genomik DNA İzolasyon Kiti
RTA Dokudan ve Parafine-Gömülü Dokudan Genomik DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-05 IVD İnsan dokusu ve parafine gömülü doku örneklerinden in vitro tanı amaçlı genomik nükleik asit
DetaylıAgaroz jel elektroforezi
MOLEKÜLER TEKNİKLER Dr. Naşit İĞCİ Nevşehir Hacı Bektaş Veli Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü 4. Sınıf (2017-2018 Bahar) 2. NOT Agaroz jel elektroforezi PAGE daha çok proteinlerin ve küçük
DetaylıRekombinant DNA Teknolojisi-II
BYM613 Genetik MühendisliM hendisliği Rekombinant DNA Teknolojisi-II Hacettepe Üniversitesi Biyomühendislik BölümüB 2012-2013 2013 Güz G z DönemiD Dr. Eda Çelik-AKDUR edacelik@hacettepe.edu.tr İçerik (2
DetaylıBiyofilm ile ilişkili enfeksiyonlara yaklaşım TANI. Prof Dr Ayşe Kalkancı Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
Biyofilm ile ilişkili enfeksiyonlara yaklaşım TANI Prof Dr Ayşe Kalkancı Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı 1 Biyofilm nedir & Önemi nedir Anket 1223 sağlık çalışanı Çoğu
DetaylıTÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF
TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF PROJE ÖNERİSİ ADI TUHAF MATERYALLERDEN İZOLE EDİLEN DNA
DetaylıSU ÜRÜNLERİİŞLEME TESİSİNDEKİ MİKROBİYAL FLORANIN DEĞİŞİMİNDE TİCARİ DEZENFEKTANLARIN ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI. Aysu BESLER
SU ÜRÜNLERİİŞLEME TESİSİNDEKİ MİKROBİYAL FLORANIN DEĞİŞİMİNDE TİCARİ DEZENFEKTANLARIN ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI Aysu BESLER SUNUM PLANI Konu ve kapsam Amaç Yöntem Bulgular Sonuç ve Öneriler http://kaymurgida.com.tr/murat_fab/isleme.html
DetaylıTissue_LC_200_V7_DSP ve Tissue_HC_200_V7_DSP (QIAsymphony DSP DNA Mini Kiti için kullanıcı açısından doğrulanmıştır)
Ağustos 2015 QIAsymphony SP Protokol Sayfası Tissue_LC_200_V7_DSP ve Tissue_HC_200_V7_DSP (QIAsymphony DSP DNA Mini Kiti için kullanıcı açısından doğrulanmıştır) Bu belge Kit Versiyonu 1 için Tissue_LC_200_V7_DSP
DetaylıİMMUNİZASYON. Bir bireye bağışıklık kazandırma! Bireyin yaşı? İmmunolojik olarak erişkin mi? Maternal antikor? Konak antijene duyarlı mı? Sağlıklı mı?
İMMUNİZASYON Bir bireye bağışıklık kazandırma! Bireyin yaşı? İmmunolojik olarak erişkin mi? Maternal antikor? Konak antijene duyarlı mı? Sağlıklı mı? Canlıya antijen verdikten belli bir süre sonra, o canlıda
DetaylıHÜCRE DONDURMA VE ÇÖZME. Uzm. Mol. Bio. Gamze ÇAĞATAY
HÜCRE DONDURMA VE ÇÖZME Uzm. Mol. Bio. Gamze ÇAĞATAY Neden Dondurma? Hücreleri saklamak Düşük pasajlarda araştırma yapmak Hücrenin orijinal yapısını korumak Genetik stabiliteyi korumak Mikrobiyal ve çapraz
DetaylıTÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ-FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI (LİSE-3 [ÇALIŞTAY 2013) BİYOLOJİ PROJE RAPORU
TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ-FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI (LİSE-3 [ÇALIŞTAY 2013) BİYOLOJİ PROJE RAPORU GRUP TUHAF PROJE ADI TUHAF MATERYALLERDEN İZOLE EDİLEN
DetaylıRahim ağzı kanseri hücreleri doku kültürü mikroskopik görüntüsü.
Doç.Dr.Engin DEVECİ HÜCRE KÜLTÜRÜ Hücre Kültürü Araştırma Laboratuvarı, çeşitli hücrelerin invitro kültürlerini yaparak araştırmacılara kanser, kök hücre, hücre mekaniği çalışmaları gibi konularda hücre
DetaylıWestern Blot (veya immünblot), protein ekspresyonunu doğrulamak için standart laboratuvar
İçerik Giriş...2 Western Blot Yöntemi...2 Protein Örneklerinin Hazırlanması...2 Dikey Jel Sistemi Kullanımı...3 Kuru Transfer Sistem Kullanımı...4 Bloklama...6 Protein Tespiti...6 Kemilüminesans Tanımlama
DetaylıProtein Ekstraksiyonu
Protein Ekstraksiyonu Dr.Gaye Güler Tezel Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Anabilim Dalı Proteinler tüm canlı organizmalar için en önemli makromoleküllerden biridir. Bazıları yapısal komponentleri
DetaylıFinal Sınavı Soruları
Final Sınavı Soruları Soru1: PCR döngüsünü kısaca anlatılınız. Cevap1: İlk adımda solüsyonun sıcaklığı artırılarak DNA zincirinin denatüre olması sağlanır. Bu sırada Bundan sonra primerlerin tekli DNA
DetaylıPCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi
Hafta V PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları PCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi Doç. Dr. Hilâl Özdağ F Đ Z Đ K Đ A L T Y A P I Reaksiyonda kullanılanlar: P C R I. Kalıp DNA a) PCR degrade
DetaylıBRCA 1/2 DNA Analiz Paneli
FAST-BRCA Sequencing Kit BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR... 3 5
DetaylıOsmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü Araştırma Laboratuarları ve Üniteleri
Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü Araştırma Laboratuarları ve Üniteleri Biyoloji Bölümünde Merkezi Araştırma Laboratuarlarının Kurulumu Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi, Biyoloji Bölümü
DetaylıHLA Tiplendirmesi PCR-SSP. Türker Duman PhD
HLA Tiplendirmesi PCR-SSP Türker Duman PhD Büyük Doku Uygunluk Kompleksi (Major Histocompatibility Complex - MHC) İlk olarak farklı fare suşlarında deri naklinin reddiyle tanımlanan genetik bölgedir Alloreaktiviteden
DetaylıDNA izolasyonu hangi amaçlarla yapılır?
3. Ha&a DNA izolasyonu hangi amaçlarla yapılır? Klonlama Teşhis PCR Hibridizasyon yöntemleri (Southern blotting) Tiplendirme (RFLP) Korunma Örn. DNA aşıları " DNA fingerprinting ile adli tıp " analık babalık
DetaylıListeria monocytogenes in Asit Dirençli Türlerinin Benzalkonyum Klorür Direnci ve Biyofilm Oluşumu. Emel ÜNAL TURHAN, Karin Metselaar, Tjakko Abee
Listeria monocytogenes in Asit Dirençli Türlerinin Benzalkonyum Klorür Direnci ve Biyofilm Oluşumu Emel ÜNAL TURHAN, Karin Metselaar, Tjakko Abee Çalışmanın İçeriği L. monocytogenes ve asit dirençli türler,
DetaylıFarklı Koşullar Altında Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli ve Enterococcus faecalis in Bakteriyel Hareketlerinin Araştırılması *
Elektronik Mikrobiyoloji Dergisi TR Yıl: 2017 Cilt: 15; Sayı: 1; Sayfa: 08-15 www.mikrobiyoloji.org/pdf/702170102.pdf Farklı Koşullar Altında Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli ve Enterococcus faecalis
DetaylıGıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri. Bölüm 9. MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması
Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri Bölüm 9 MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara WORLD HEALTH ORGANIZATION
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI
MOLEKÜLER 2014-2015 BİYOLOJİ LABORATUVARI GÜZ DÖNEMİ MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI 7.HAFTA DERS NOTLARI GAZİ ÜNİVERSİTESİ FEN FAKÜLTESİ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ Sayfa 1 / 6 1. RFLP (RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUK
DetaylıCanlı Legionella pneumophila Tespiti ve MLST için Gerçek Zamanlı PCR ve HRM Analizi Tabanlı Yöntemlerin Geliştirilmesi
Canlı Legionella pneumophila Tespiti ve MLST için Gerçek Zamanlı PCR ve HRM Analizi Tabanlı Yöntemlerin Geliştirilmesi Selin Nar Ötgün, Meral Turan, Mustafa Kolukırık, Esra Arslan Ganiler, Nuriye Ünal,
DetaylıMitokondrial DNA Analiz Paneli
FAST-mtDNA Sequencing Kit Mitokondrial DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR...
DetaylıARB BOYAMA NASIL YAPILIR
ARB BOYAMA NASIL YAPILIR EZN (ARB) BOYAMA = Ehrlich Ziehl Neelsen = ASİDE DİRENÇLİ BOYAMA Tüberküloz bakterileri gibi dış yüzeyidne mikolik asit içeren bakteriler gram boyama ile boyanamazlar bu bakteriler
DetaylıSu Mikrobiyolojisi 02
İNSANİ TÜKETİM M AMAÇLI SULARDA MEMBRAN FİLTRASYON F YÖNTEMY NTEMİ İLE MİKROBM KROBİYOLOJİK K ANALİZLER Prof. Dr. Kadir HALKMAN Ankara Üniversitesi, Gıda Mühendisliği Bölümü Su Mikrobiyolojisi 02 Su Mikrobiyolojisi
DetaylıHatice YILDIRAN. Gıda Mühendisi BURDUR İL MÜDÜRLÜĞÜ
Hatice YILDIRAN Gıda Mühendisi BURDUR İL MÜDÜRLÜĞÜ GIDA TAKVİYELERİ Eğitim Yeri Eğitim Konusu : HOLLANDA-TNO : Gıda Takviyeleri Eğitim Süresi : 21 Aralık 2012-20 Mart 2013 Danışman : Dr. Koen VENEMA Eğitim
DetaylıRekombinant DNA Teknolojisi-I
BYM613 Genetik MühendisliM hendisliği Rekombinant DNA Teknolojisi-I Hacettepe Üniversitesi Biyomühendislik BölümüB 2012-2013 2013 Güz G z DönemiD Dr. Eda Çelik-AKDUR edacelik@hacettepe.edu.tr İçerik (2
DetaylıULUSAL BİYOÇEŞİTLİLİĞİNİN VE GEN KAYNAKLARININ KORUNMASI HEDEFLERİ DOĞRULTUSUNDA BÜYÜK MEMELİ TÜRLERİNİN ARAŞTIRILMASI, KORUNMASI VE YÖNETİMİ
ULUSAL BİYOÇEŞİTLİLİĞİNİN VE GEN KAYNAKLARININ KORUNMASI HEDEFLERİ DOĞRULTUSUNDA BÜYÜK MEMELİ TÜRLERİNİN ARAŞTIRILMASI, KORUNMASI VE YÖNETİMİ Örnekleme Çalışmaları: Önemli Noktalar DNA ÇALIŞMASI Projenin
DetaylıREAKSİYON PRENSİPLERİ
REAKSİYON PRENSİPLERİ Reaksiyon Bileşenleri: qpcr Master Mix (PMM) Hedef probe Mix (HPM) Zenginleştirilmiş gıda ürünleri kültüründen izole edilen DNA örneği Polimerase Chain Reaction (PCR): Son yıllarda
Detaylıattomol HLA-B*27 Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 1.Giriş 2. Genel Açıklamalar
attomol HLA-B*27 HLA-B*27 in tespitine yönelik kit (Doku tiplemesi için kullanmayın!) Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 40 tespit sipariş numarası: 1030 1.Giriş İnsan lökosit antijenleri(hla)
DetaylıSDS-PAGE Jel Elektroforezi İÇERİK
İÇERİK Tanım...2 SDS-PAGE jel elektroforez metodu...3 SDS-PAGE jel elektroforezi yürütme ortamının hazırlanması...4 Protein örneklerinin yüklenmesi...8 Jelin yürütülmesi...9 Jelin boyanması ve boyanın
DetaylıSODYUM DODESİL SÜLFAT POLİAKRİLAMİD JEL ELEKTROFOREZİ İLE PROTEİNLERİN ANALİZİ
T.C. FIRAT ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ BİYOLOJİ BÖLÜMÜ SODYUM DODESİL SÜLFAT POLİAKRİLAMİD JEL ELEKTROFOREZİ İLE PROTEİNLERİN ANALİZİ Yüksek Lisans Semineri Hazırlayan: Abdullah ASLAN Danışman:
DetaylıHücre Biyoloji Laboratuarı Güz dönemi Alıştırma Soruları (Dr.Selcen Çelik)
Hücre Biyoloji Laboratuarı 2014-2015 Güz dönemi Alıştırma Soruları (Dr.Selcen Çelik Konular: ph ve tamponlar, hücre kültür tekniği, mikrometrik ölçüm ph ve Tamponlar 1. ph sı 8.2 olan 500 ml. 20mM Tris/HCl
DetaylıÇOKLU TÜP FERMANTASYON YÖNTEMİ İLE TOPLAM KOLİFORM TAYİNİ. Koliform Bakteri Grubunun Tanımı
ÇOKLU TÜP FERMANTASYON YÖNTEMİ İLE TOPLAM KOLİFORM TAYİNİ Koliform Bakteri Grubunun Tanımı Koliform grubunu oluşturan bakteriler; tamamı aerobik veya fakültatif anaerobik olan, gram negatif, spor oluşturmayan,
DetaylıKistik Fibrozis DNA Analiz Paneli
FAST-CFTR Sequencing Kit Kistik Fibrozis DNA Analiz Paneli Dizi Analizi Amaçlı Kullanım İçin KULLANIM KILAVUZU İÇİNDEKİLER 1 GİRİŞ... 3 2 KİT İÇERİĞİ... 3 3 SAKLAMA... 3 4 GEREKLİ MATERYAL VE CİHAZLAR...
DetaylıGenom analizi için belirteç olarak kullanılan DNA dizileri
Salgınların Araştırılmasında Hızlı Genotiplendirme Yöntemleri Avantajları-Dezavantajları Doç. Dr. Z. Ceren KARAHAN Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobioyoloji Anabilim Dalı Moleküler Genetik
DetaylıBAKTERİLERDE GENETİK MADDE AKTARILMASI
BAKTERİLERDE GENETİK MADDE AKTARILMASI Bakterilerde genetik maddenin bir kısmı bakteriden bakteriye aktarılabilmekte ve bunun sonucunda önemli genetik değişmeler olmaktadır Verici hücre ile alıcı hücre
DetaylıPOYRAZ TIBBİ CİHAZLAR EDVOTEK
POYRAZ TIBBİ CİHAZLAR EDVOTEK EDVOTEK VİZYON Edvotek, bir çok disiplini bir araya getirerek karmaşık gibi görünen birçok bilimin temellerini anlatarak «Nasıl bilim adamı yetiştiririz?» sorusuna karşılık
Detaylı1.5 Kalite Kontrol Bölüm Fiziksel Kalite Kriterleri Bölüm Mikrobiyolojik Kalite Kriterleri Mikrobiyal Kontaminasyon
1.5 Kalite Kontrol Günümüzde gıda mikrobiyolojisi laboratuarlarında yaygın olarak ticari dehidre formülasyonlardan hazırlanan besiyerleri veya kullanıma hazır besiyerleri kullanılmaktadır. Kullanıma hazır
DetaylıDerece Bölüm/Program Üniversite Yıl Mühendislik Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü Y. Lisans Ziraat Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü
ÖZGEÇMİŞ Adı Soyadı: Araş. Gör. Gökşen GÜLGÖR Doğum Tarihi: 02.01.1987 Öğrenim Durumu: Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Lisans Mühendislik Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü Y. Lisans Ziraat Fakültesi
DetaylıÇÖZELTİLERDE YÜZDELİK İFADELER. Ağırlıkça yüzde (% w/w)
ÇÖZELTİ HAZIRLAMA İki veya daha çok maddenin çıplak gözle veya optik araçlarla yan yana fark edilememesi ve mekanik yollarla ayrılamaması sonucu oluşturdukları karışıma çözelti adı verilir. Anorganik kimyada,
DetaylıMikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D
Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D 1 Enfeksiyonun Özgül Laboratuvar Tanısı Mikroorganizmanın üretilmesi Mikroorganizmaya
DetaylıRTA Viral Nükleik Asit İzolasyon Kiti
RTA Viral Nükleik Asit İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2011-10 IVD In vitro tanı amaçlı insan serum veya plazma (EDTA) örneklerinden viral DNA ve RNA izolasyon ve saflaştırılması amacıyla
Detaylıattomol apo B-100 quicktype
attomol apo B-100 quicktype İnsan apolipoprotein B-100 (apo B-3500 mutasyonu) gen inde 10708G>A geçiş tespitine yönelik kit Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 20 tespit sipariş numarası: 1015
DetaylıTÜBĠTAK-BĠDEB YĠBO ÖĞRETMENLERĠ PROJE DANIŞMANLIĞI EĞĠTĠMĠ ÇALIŞTAYLARI YİBO-5 ÇALIŞTAY 2011 (FEN VE TEKNOLOJİ-FİZİK,KİMYA,BİYOLOJİ VE MATEMATİK)
TÜBĠTAK-BĠDEB YĠBO ÖĞRETMENLERĠ (FEN VE TEKNOLOJİ-FİZİK,KİMYA,BİYOLOJİ VE MATEMATİK) PROJE DANIŞMANLIĞI EĞĠTĠMĠ ÇALIŞTAYLARI YİBO-5 ÇALIŞTAY 2011 Pelargonium graveolens un FARKLI EKSPLANT ÖZÜTLERİNİN ANTİMİKROBİYAL
DetaylıDNA nın restriksiyon enzimleriyle (RE) kesilmesi. Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler DNA nın RE leri ile kesilmesi
DNA nın restriksiyon enzimleriyle (RE) kesilmesi Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler-4 Günümüzde 500 den fazla RE ticari olarak üretilmektedir. RE ler genellikle 10 U/ul konsantrasyonda satışa sunulmaktadır.
DetaylıPROTEİN. Mısırdan. İzolasyon Kiti. Öğretmen Kılavuzu. Öğrenci Kılavuzu
Mısırdan PROTEİN İzolasyon Kiti Öğretmen Kılavuzu a. Konu b. Kullanıcı Kitlesi c. Deney Süresi d. Materyaller e. Güvenlik f. Genel Bilgi g. Deney Öncesi Hazırlık h. Ön Bilgi i. Deneyin Yapılışı j. Deney
DetaylıGenetik Yöntemlerle Bakterilere Gen Transferleri. (Cüneyt Akdeniz)
Genetik Yöntemlerle Bakterilere Gen Transferleri (Cüneyt Akdeniz) Bakterilerde genetik maddenin bir kısmı bakteriden bakteriye aktarılabilmekte ve bunun sonucunda önemli genetik değişmeler olmaktadır.
DetaylıKABAK LİFİ (Luffa cylindrica) İLE TUTUKLANMIŞ RHİZOPUS ORYZAE DEN LİPAZ ÜRETİMİ
KABAK LİFİ (Luffa cylindrica) İLE TUTUKLANMIŞ RHİZOPUS ORYZAE DEN LİPAZ ÜRETİMİ Ş. BULUT, M.Ş.TANYILDIZI, V. SELEN, M. ELİBOL, D. ÖZER Fırat Üniversitesi, Kimya Mühendisliği Bölümü, 23119, Elazığ ÖZET
DetaylıAdana Bilim ve Teknolji Üniversitesi. Biyomühendislik. Bölüm Tanıtım Katalogu. Yasamın İçinde...
Adana Bilim ve Teknolji Üniversitesi Biyomühendislik Bölüm Tanıtım Katalogu Yasamın İçinde.... Hakkımızda Bölümümüz Adana nın yükselen akademik değeri Adana Bilim ve Teknoloji Üniversitesi nde kurulmuştur.
DetaylıDENEY I ÇÖZELTİ KONSANTRASYONLARI. Genel Bilgi
DENEY I ÇÖZELTİ KONSANTRASYONLARI Genel Bilgi 1. Çözelti İki ya da daha fazla maddenin herhangi bir oranda bir araya gelerek oluşturdukları homojen karışıma çözelti denir. Diğer bir deyişle, bir maddenin
DetaylıHPLC ile Gübre Numunelerinde Serbest Aminoasitlerin Tayini
UYGULAMA NOTU Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografi L001 HPLC ile Gübre Numunelerinde Serbest Aminoasitlerin Tayini HAZIRLAYAN Yük. Kimyager Ozan HALİSÇELİK Ant Teknik Cihazlar Ltd. Şti. KONU: Gübre Numunelerinde
DetaylıONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ KİMYA MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ ORGANİK KİMYA LABORATUVARI
ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ KİMYA MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ ORGANİK KİMYA LABORATUVARI NÜKLEOFİLİK YERDEĞİŞTİRME REAKSİYONU -1 DENEY 4 : S N 1 REAKSİYONU : T- BÜTİL KLORÜRÜN SENTEZİ TEORİ
DetaylıRTA DNA qpcr Probe Master Mix
RTA DNA qpcr Probe Master Mix Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi -- 2012-01 DNA'nın gerçek zamanlı tayini ve miktar ölçümü için Yalnızca profesyonel kullanım için REF 09030025 25 test 09030100 100 test 09030500
Detaylıattomol lactose intolerance C>T quicktype
attomol lactose intolerance -13910C>T quicktype İnsan laktase-genine karşı -13910C>T geçiş tespitine yönelik mutasyon testi Sadece in vitro diagnostik kullanım içindir! 20 tespit sipariş numarası: 1045
DetaylıHEPATİT B VİRUSU KOR ANTİJENİ GEN BÖLGESİNİN MAYADA EKSPRESYONU*
Kısa Bildiri/Short Communication Mikrobiyol Bul 2010; 44: 291-295 HEPATİT B VİRUSU KOR ANTİJENİ GEN BÖLGESİNİN MAYADA EKSPRESYONU* EXPRESSION OF HEPATITIS B VIRUS CORE ANTIGEN GENE REGION IN YEAST CELL
DetaylıPROKARYOTLARDA GEN EKSPRESYONU. ve REGÜLASYONU. (Genlerin Gen Ürünlerine Dönüşümünü Kontrol Eden Süreçler)
PROKARYOTLARDA GEN EKSPRESYONU ve REGÜLASYONU (Genlerin Gen Ürünlerine Dönüşümünü Kontrol Eden Süreçler) Nihal EYVAZ (050559015) Şerife OKAY (050559025) Prof. Dr. Figen ERKOÇ Gazi Eğitim Fakültesi Gen
DetaylıLABORATUVAR MATEMATİĞİ
LABORATUVAR MATEMATİĞİ Dr. Zafer KÜÇÜKODACI GATA HEH Patoloji Servisi 22. ULUSAL PATOLOJİ KONGRESİ 7 Kasım 2012 Manavgat AMAÇ 2.3. DNA extraction by boiling : Total DNA was extracted by a boiling method
DetaylıPROTEİNLERİN AYRIŞTIRILMASI (İKİ YÖNLÜ JEL ELEKTROFOREZİ)
7. İKİ BOYUTLU JEL ELEKTROFOREZİ UYGULAMALARI PROTEİNLERİN AYRIŞTIRILMASI (İKİ YÖNLÜ JEL ELEKTROFOREZİ) A.BİLGİ İki yönlü jel elektroforezi, çok sayıda farklı kompleks protein içeren karışımlarının ayrılmasında
DetaylıDİCLE ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ DÖNEM I HÜCRE BİLİMLERİ 2 KOMİTESİ HÜCRE KÜLTÜRÜ ve TEKNOLOJİSİ Doç.Dr. Engin DEVECİ
DİCLE ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ DÖNEM I HÜCRE BİLİMLERİ 2 KOMİTESİ HÜCRE KÜLTÜRÜ ve TEKNOLOJİSİ Doç.Dr. Engin DEVECİ Hücre Kültürü Araştırma Laboratuvarı, çeşitli hücrelerin invitro kültürlerini yaparak
DetaylıLaboratuvar Tekniği. Adnan Menderes Üniversitesi Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü TBY 118 Muavviz Ayvaz (Yrd. Doç. Dr.) 5. Hafta (14.03.
Laboratuvar Tekniği Adnan Menderes Üniversitesi Tarımsal Biyoteknoloji TBY 118 Muavviz Ayvaz (Yrd. Doç. Dr.) 5. Hafta (14.03.2014) 1 5. Haftanın Ders İçeriği DNA ekstraksiyonu DNA ekstraksiyonunun amacı
DetaylıÇalışmalarımız Binboğa Bal firmasında gerçekleştirilmiştir. Desteklerinden dolayı Sn. Mehmet Çürük e teşekkürlerimizi sunarız.
UYGULAMA NOTU Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografi L005 HPLC ile Balda Sülfo Grubu Antibiyotik Analizi HAZIRLAYAN Kim. Mahmut Arıkan Ant Teknik Cihazlar Ltd. Şti. KONU: HPLC ile balda sülfo grubu antibiyotik
DetaylıORTOPEDİK PROTEZ ENFEKSİYONLARINDA SONİKASYON DENEYİMİ
ORTOPEDİK PROTEZ ENFEKSİYONLARINDA SONİKASYON DENEYİMİ Dr. Şua Sümer Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Enf. Hast. ve Klin. Mikr. AD 17 Mayıs 2016 Prostetik eklem ameliyatları yaşlı popülasyonun artışına
DetaylıPolimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
4. Ha&a Polimeraz Zincir Reaksiyonu Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Sunu içeriği PCR ın tanımı PCR ın kısa tarihçesi Hücre içi DNA replikasyonu PCR bileşenleri PCR temel prensipler PCR ın kullanım alanları
DetaylıHücre içinde bilginin akışı
Hücre içinde bilginin akışı 1 DNA Çift Zincir Heliks 2 Hücre Çekirdeği ve Çekirdek Zarının Yapısal Organizasyonu Hatırlıyor musunuz? DNA Kromatin Kromatid Kromozom RNA Protein Çekirdek Çekirdekcik Nükleotid
DetaylıRTA Viral DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2010-05
RTA Viral DNA İzolasyon Kiti Kullanma Kılavuzu Yayın Tarihi - 2010-05 IVD In vitro tanı amaçlı insan plazma ve serum örneklerinden viral nükleik asit izolasyon ve saflaştırılması için In vitro tanı amaçlı
DetaylıBakteri Hücrelerinde Bölünme
Bakteri Hücrelerinde Bölünme Bakteri hücrelerinde eşeysiz çoğalma görülür. Bu da ana hücrenin DNA miktarını ikiye (replikasyon) çıkardıktan sonra yaşadığı bir sitokinezle gerçekleşir. Yrd.Doç.Dr. Yosun
DetaylıKONU: MOLEKÜLER BİYOLOJİDE TEMEL TEKNİKLER; Çözeltiler ve Tamponlar
KONU: MOLEKÜLER BİYOLOJİDE TEMEL TEKNİKLER; Çözeltiler ve Tamponlar AMAÇ: - Moleküler Biyoloji laboratuvarında kullanılan çözeltileri ve hazırlanışlarını öğrenmek. - Biyolojik tamponların kullanım amaçlarını,
DetaylıBEÜ SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ ENFEKSİYON KONTROL KOMİTESİ
BEÜ SAĞLIK UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ ENFEKSİYON KONTROL KOMİTESİ 24 Mart 2015 Sürveyans HIV önlenmesi Uygun antibiyotik kullanımı Hastane temizliği Dezenfeksiyon uygulamaları Enfeksiyon kontrolü İzolasyon
DetaylıĠ.Ü. MÜHENDĠSLĠK FAKÜLTESĠ ÇEVRE MÜHENDĠSLĠĞĠ BÖLÜMÜ MĠKROORGANĠZMALARIN ASEPTĠK TRANSFERĠ VE ÇĠZGĠ EKĠM
Ġ.Ü. MÜHENDĠSLĠK FAKÜLTESĠ ÇEVRE MÜHENDĠSLĠĞĠ BÖLÜMÜ Çevre Mikrobiyolojisi Dersi Laboratuvar Uygulama 4 MĠKROORGANĠZMALARIN ASEPTĠK TRANSFERĠ VE ÇĠZGĠ EKĠM 1. ASEPTĠK TEKNĠKLER Mikroorganizmalar, teneffüs
DetaylıGIDA MİKROBİYOLOJİSİ LABORATUVAR UYGULAMASI
1. MİKROBİYOLOJİK ÖRNEK ALMA VE KÜLTÜR YAPMA Kültür Tipleri Saf kültür: Tek bir mikroorganizma türü üretilmiş kültürlerdir. Karışık Kültür: iki yada daha fazla çeşitte mikroorganizma türü aynı besiyerinde
DetaylıMOLEKÜLER MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARI ÇALIŞMA PROSEDÜRÜ
KOD.MİK.PR.02 YAYIN TRH. KASIM 2011 REV. TRH. EYLÜL 2012 REV. NO.1 SAYFA NO.1/14 1. AMAÇ: Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında yürütülen faaliyetleri tanımlamak. 2. KAPSAM: Bu talimat, Moleküler mikrobiyoloji
Detaylı