HALİL DÜNDAR.

Ebat: px

Şu sayfadan göstermeyi başlat:

Download "HALİL DÜNDAR."

Nazar Gökay
7 yıl önce
İzleme sayısı:

1 HALİL DÜNDAR e-posta: EĞİTİM Doktora, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, ODTÜ Yüksek Lisans, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, ODTÜ Lisans, Biyoloji Bölümü, Hacettepe Üniversitesi Fen Fakültesi İlgi alanları: Laktik asit bakterileri tarafından üretilen bakteriyosinlerin saflaştırılması ve klonlanması, gıda bozulması etmeni ve patojen bakterilere bakteriyosin uygulanması, kalıtsal metabolik hastalıklarda genetik haritalama ve mutasyon taranması ÇALIŞMALAR 2011 Aralık-2012 Temmuz Laktik asit bakterilerince üretilen bakteriyosinlerin biyokimyasal ve genetik karakterizasyonu Norwegian University of Life Sciences, Department of Chemistry, Biotechnology and Food Science, Laboratory of Microbial Gene Technology, Ås, NORVEÇ Yeni bir kompleks polinöropati fenotipinin klinik karakterizasyonu, hastalık lokusunun haritalanması ve sorumlu genin tüm ekzom dizileme ile bulunması (Doktora sonrası, Hacettepe Üniversitesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Metabolizma Ünitesi, Doktora sonrası araştırmacı) Kalıtsal metabolik hastalıklarda Affymetrix resequencing DNA çipleri ile mutasyonların belirlenmesi (Doktora sonrası, Hacettepe Üniversitesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Metabolizma Ünitesi, Doktora sonrası araştırmacı)

2 Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris tarafından üretilen bir bakteriyosinin saflaştırılması ve karakterizasyonu) (Doktora tezi, ODTÜ Biyoteknoloji Anabilim Dalı) Torula thermophila tarafından lignoselulozik maddeler üzerinde selülaz üretimi (Yüksek lisans tezi, ODTÜ Biyoteknoloji Anabilim Dalı) TEKNİKLER Molecular Biology: PCR, klonlama, total ve plasmid DNA ekstraksiyon-purifikasyonu, jel elektroforezis, SNP çipleri ile genome boyu genotiplendirme, yeniden dizileme DNA çipleri ile dizileme, direkt DNA dizileme ve ABI 3130 genetic analyzer, kısmen next generation dizi analizi Biyokimya: Protein saflaştırma teknikleri (size-exclusion kromatografi, ion-exchange kromatografi, hidrofobik interaction kromatografi, reverse-faz kromatografi), Akta purifier FPLC, organik solventler ile protein ekstaksiyonu enzim ölçümleri, SDS- PAGE, Western blotting. Mikrobiyoloji: Mikroskopi, bakteri izolasyon ve identifikasyonu, patojenler ile deneyim, 16S rdna tiplendirme, mikroorganizmalardan antimikrobiyal madde taranması, endüstriyel enzim üretimi. Enstrümanlar: Akta FPLC, ABI 3130 Genetic Analyzer, Affymetrix Microarray platform YAYINLAR A.1 Ozgül R.K., Güzel-Ozantürk A., Dündar H., Yücel-Yılmaz D., Coşkun T., Sivri S., Aydoǧdu S., Tokatlı A., Dursun A Galactosemia in the Turkish population with a high frequency of Q188R mutation and distribution of Duarte-1 and Duarte-2 variations. Journal of Human Genetics. 58: A.2 Dündar H, Özgül R.K., Güzel-Ozantürk A., Dursun A., Sivri S., Aliefendioğlu D., Coşkun T., Tokatlı A Microarray based mutational analysis of patients with methylmalonic acidemia: Identification of 10 novel mutations. Molecular Genetics and Metabolism. 106(4): A.3 Dündar H., Özgül R.K., Yalnızoglu D., Erdem S., Oguz K.K., Tuncel D., Temucin Ç.M. and Dursun A Identification of a novel Twinkle mutation in a family with 2

3 infantile onset spinocerebellar ataxia by whole exome sequencing. Pediatric Neurology. 46 (3): A.4 Ögel Z.B., Yarangumeli, K., Dündar, H., Ifrij, I Submerged cultivation of Scytalidium thermophilum on complex lignocellulosic biomass for endoglucanase production. Enzyme and Microbial Technology. 28 (7-8): A.5 Dündar H, Çelikbıçak Ö, Salih B, Bozoglu F Large-scale purification of a bacteriocin from Leuconostoc mesenteroides using diatomite calcium silicate (Kabul edildi, Turkish Journal of Biology) HAZIRLIK AŞAMASINDA OLAN MAKALELER A.1 Dündar H, Ozgül R.K, Sivri, S., Coşkun T, Tokatlı A, Dursun A. (2013) Cirrhosis associated with propionate metabolism (gönderilecek) A.2 Dündar H, Çelikbıçak Ö, Atakay M, Salih B, Bozoglu F. (2013) Comparison of two methods for purification of enterocin B, a bacteriocin produced by Enterococcus faecium W3 (gönderildi, Preparative Biochemistry amd Biotechnology) A.3 Dündar H, Atakay M, Çelikbıçak Ö, Salih B, Bozoglu F. (2013) Purification and characterization of a bacteriocin from oenological Leuconostoc mesenteroides to control malolactic fermentation (gönderildi, Journal of Microbiology and Biotechnology) Konferanslar (ULUSLARARASI) A.1 Dündar H., Salih B Purification, characterization and partial amino acid sequence of mesentericin W3, a new anti-listeria bacteriocin. 36 th FEBS CONGRESS. Biochemistry for Tomorrow s Medicine 2011, June 25-30, 2011, Torino, İtalya, S9.2.5 (Sözlü Sunum). A.2 Dündar H., Özgül R.K., Yalnızoglu D., Özdamar S.E., Tuncel D., Akarsu N., Dursun A Next generation sequencing in a family with infantile onset spinocerebellar ataxia identified a novel missense mutation in C10orf2 gene. European Human Genetics Conference. May 28-31, 2011, Amsterdam, Hollanda, P

4 A.3 Dündar H., Özgül R.K., Dursun A Analysis of MUT gene mutations in Turkish patients with methylmalonic acidemia using resequencing microarrays: identification of fourteen novel mutations. European Human Genetics Conference. June 12-15, 2010, Göteborg, İsveç, P A.4 Dündar H., Yücel D., Dursun A., Özgül R.K Genome-wide genotyping for the characterization of disease locus in a family with an uncharacterized neurometabolic disease. Annual Symposium of the Society for the Study of Inborn Error of Metabolism, Istanbul, Turkey, 31 August-3 September 2010, İstanbul, Journal of Inherited Metabolic Disease. Vol. 33 Suppl. 1 August 2010, pp P A.5 Dündar H., Özgül R.K., Ünal Ö., Karaca M., Aydin H.İ.,Tokatli A., Sivri H.S., Coşkun T., Dursun A Molecular and structural analysis of six nonsense mutations in mut methylmalonic acidemia patients including two novel nonsense mutations. Annual Symposium of the Society for the Study of Inborn Error of Metabolism, Istanbul, Turkey, 31 August-3 September 2010, İstanbul, Journal of Inherited Metabolic Disease. Vol. 33 Suppl. 1 August 2010, pp P A.6 Dursun A., Dündar H., Özgül R.K., Talim B., Kale G., Demir H., Temizel S.I., Tokatlı A., Sivri S., Coskun T Cirrhosis associated wıth propionate metabolism. Annual Symposium of the Society for the Study of Inborn Error of Metabolism, Istanbul, Turkey, 31 August-3 September 2010, İstanbul, Journal of Inherited Metabolic Disease. Vol. 33 Suppl. 1 August 2010, pp P A.7 Özgül R.K., Güzel A., Dündar H., Yücel D., Yılmaz A., Ünal O., Tokatlı A., Sivri S., Coskun T., Dursun A Mutation profile of BCKDHA, BCKDHB and DBT genes for maple syrup urine disease in Turkey. Annual Symposium of the Society fort he Study of Inborn Error of Metabolism, Istanbul, Turkey, 31 August-3 September 2010, İstanbul, Journal of Inherited Metabolic Disease. Vol. 33 Suppl. 1 August 2010, pp P A.8 Karaca M., Özgül R.K., Dündar H., Coskun T., Tokatli A., Sivri S., Dursun A Molecular analysis of homocystinuria in Turkish patients. Annual Symposium of the Society for the Study of Inborn Error of Metabolism, Istanbul, Turkey, 31 4

5 August-3 September 2010, İstanbul, Journal of Inherited Metabolic Disease. Vol. 33 Suppl. 1 August 2010, pp P A.9 Güzel A., Özgül R.K., Dündar H., Coskun T., Sivri S., Tokatlı A., Göksun E., Hismi B., Dursun A Galactosemia in a Turkish population with a high prevalence of Q188R mutation. Annual Symposium of the Society for the Study of Inborn Error of Metabolism, Istanbul, Turkey, 31 August-3 September 2010, İstanbul, Journal of Inherited Metabolic Disease. Vol. 33 Suppl. 1 August 2010, pp P A.10 Yılmaz A., Güzel A., Dündar H., Dursun A., Uslu N., Yuce A., Özgül R.K Screening of ATP7B gene mutations in Turkish patients with Wilson dısease by custom designed resequencing microarrays. Annual Symposium of the Society for the Study of Inborn Error of Metabolism, Istanbul, Turkey, 31 August-3 September 2010, İstanbul, Journal of Inherited Metabolic Disease. Vol. 33 Suppl. 1 August 2010, pp P A.11 Dursun A., Yalnizoglu D., Dündar H., Erdem S., Akarsu A.N., Özgül R.K., Association of polyneuropathy, mental retardation, sensorineural hearing loss, 6th nerve palsy, convulsions, and oral dyskinesia; a propable new neurometabolic disorder. Annual Symposium of the Society for the Study of Inborn Error of Metabolism, Istanbul, Turkey, 31 August-3 September 2010, İstanbul, Journal of Inherited Metabolic Disease. Vol. 33 Suppl. 1 August 2010, pp P Konferanslar (ULUSAL) A.1 Özgül R.K., Dündar H., Yalnızoğlu D., Erdem S., Tuncel D., Temuçin Ç., Akarsu N., Dursun A Homozigotluk haritalaması ve ekzon dizileme yöntemi ile infantile onset spinocerebellar ataxi (IOSCA) ya neden olan C10orf2 gen mutasyonunun saptanması. Uluslararası katılımlı 11. Metabolik Hastalıklar ve Beslenme Kongresi Nisan Çeşme/İzmir. Sayfa 117-P49. A.2 Dündar H., Özgül R.K., Dursun A Structural analysis of three novel missense mutations in the Mut gene of methylmalonic acidemia patients. 9. Ulusal 5

6 Tıbbi Genetik Kongresi. 1-5 Aralık, İstanbul. Clinical Genetics. 2010; 78 (Suppl. 1) pp.125 A.3 Dündar H., Özgül R.K., Dursun A Identification of a novel insertion mutation in PCCA gene of a Turkish propionic acidemia patient. 9. Ulusal Tıbbi Genetik Kongresi. 1-5 Aralık, İstanbul. Clinical Genetics. 2010; 78 (Suppl. 1) pp.125 A.4 Dündar H., Bozoğlu F Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris. tarafından üretilen bir bakteriyosinin büyük ölçekte ve hızlı saflaştırılması. 19. Ulusal Biyoloji Kongresi, Haziran 23-27, 2008, Özet kitabı (2008). SM 004 (Poster) A.5 Dündar H., Bozoğlu F Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris tarafından üretilen bir bakteriyosinin tanımlanması. "15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi" (2007), s.21 A.6 Dündar H., Bozoğlu F Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris tarafından üretilen bir bakteriyosinin saflaştırılması. "15. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi. " (2007), s.51 DİĞER EĞİTİMLER EMBO Electron Microscopy and Stereology in Cell Biology, Haziran 17-27, 2010, Electron Microscopy Laboratory, Department of Molecular Biosciences, University of Oslo, Norveç. Next generation sequencing data analysis, Leiden University Medical Center, Kasım 1-3, 2010, Leiden, Hollanda. 6

Benzer belgeler

ÖZGEÇMİŞ. Expression Pattern Comparison of Two Ubiquitin Specific Proteases. Functional Characterization of Two Potential Breast Cancer Related Genes

ÖZGEÇMİŞ. Expression Pattern Comparison of Two Ubiquitin Specific Proteases. Functional Characterization of Two Potential Breast Cancer Related Genes ÖZGEÇMİŞ 1. Adı ve Soyadı: Shiva Akhavantabasi 2. Ünvanı: Yrd. Doç. Dr. 3. Email adresi: shiva.akhavan@yeniyuzyil.com 4. Öğrenim Durumu: Derece Alan Üniversite Yıl Lisans Mikrobiyoloji Jahrom Azad Üniversitesi