ODTÜ Biyoteknoloji. 25. Yıl Etkinliği. 14 Kasım Editor: Prof. Dr. Nesrin Hasırcı.

Ebat: px
Şu sayfadan göstermeyi başlat:

Download "ODTÜ Biyoteknoloji. 25. Yıl Etkinliği. 14 Kasım 2014. Editor: Prof. Dr. Nesrin Hasırcı. www.btec.metu.edu.tr"

Transkript

1 ODTÜ Biyoteknoloji 25. Yıl Etkinliği 14 Kasım 2014 Editor: Prof. Dr. Nesrin Hasırcı

2 ÖNSÖZ Değerli Biyoteknoloji EABD Öğretim Üyeleri, Mezunlarımız ve Sevgili Öğrencilerimiz, Bildiğiniz üzere, EABD mız, Fen Bilimleri Enstitüsü bünyesinde Biyoloji, Kimya, Kimya Mühendisliği, Gıda Mühendisliği ve Çevre Mühendisliği Bölümlerinin katkılarıyla 1989 yılında disiplinlerarası ve lisansüstü bir program olarak kurulmuģ, yüksek lisans ve doktora programları ile bugüne kadar gelmiģtir. BaĢlıca uygulama alanları olan sanayi, tarım, tıp/ilaç ve çevre alanlarında gerek Ülkemizde gerekse Dünya da biyoteknoloji çalıģmaları giderek önem kazanmıģ ve yeni yaklaģımlar ile farklı boyutlara taģınmıģtır. ODTÜ Biyoteknoloji EABD olarak, bizler de bu geliģime ayak uydurarak, bu alanlardaki uygulamalara yönelik Ülkemizin ihtiyacı olan mezunlar yetiģtirmek ve Biyoteknoloji araģtırmalarına katkı sağlamak adına özverili bir Ģekilde uğraģmakta ve emek vermekteyiz yılının, Biyoteknoloji EABD nın kuruluģunun 25. yıldönümü nedeniyle, kuruluģundan bu güne kadar Bölümümüzün gerek ulusal gerekse uluslararası ölçekli araģtırma/çalıģmalara yaptığı katkıları özetleyen bu kitapçığı hazırladık. Böyle bir dökümanın, tüm üye, mezun ve öğrencilerimize ıģık tutacağına, gelecekte yapılacak çalıģmalara yön vererek ivme kazandıracağına ve EABD mızı daha da iyi bir yere taģıyacağına inanıyoruz. 25 Yıldır Biyoteknoloji EABD mıza katkı veren ve bundan sonrada verecek olan herkese sonsuz teģekkürlerimizle ve saygılarımızla, ODTÜ Biyoteknoloji EABD Yürütme Komitesi Üyeleri Prof. Dr. Filiz B. Dilek Prof. Dr. Nesrin Hasırcı Prof. Dr.Ġnci Eroğlu Doç. Dr. ÇağdaĢ Son Doç.Dr. Deniz Çekmecioğlu Doç.Dr. Can Özen i

3 Editörün Notu ODTÜ Biyoteknoloji EABD nda 25 yıl geçirmek ve geçen yıllar içinde Bölümümüzün çok güzel ürünlerini bir anlamda meyvalarını görmek, benim için olduğu kadar eminim ki diğer meslektaģlarım için de büyük bir onurdur. 25.Yıl ımızı kutlamak için bir etkinlik düzenleyelim fikri ortaya çıktığı an hepimiz çok heyecanlandık. Amacımız, ODTÜ- Biyoteknoloji paydaģlarının tümünü mütevazi bir etkinlik çerçevesinde bir araya getirmek, küçük bir kitapcık ile geçmişte neler olmuş şu anda neler varmış konularında biraz bilgi vermekti. ġu anda ODTÜ içinde bulunan öğretim üyelerimizin çalıģma konularını web sayfalarından aldık, belli bir düzene koyduk ve pdf dosyası olarak onların onayına sunduk. Pek çok öğretim üyemiz bize geri dönüģ yaptı ve bazı değiģiklikler istedi. Bir kısmı istemlerini bana, bir kısmı asistanlarımıza ilettiği için bir karıģıklık yaģadıysakta tüm düzeltme, ekleme veya çıkartmaları yaptığımızı sanıyorum. Eğer gözümüzden kaçan, eksik bıraktığımız veya düzeltmediğimiz bir durum varsa lütfen kusurumuza bakmayın. Bölümümüzün tarihçesini yazalım dediğimizde, 25 yıl öncesine ait belgelere ulaģmak tahmin edebileceğiniz gibi pek de kolay olmadı. Fen Bilimleri Enstitüsü, Rektörlük, Bölümler ve kiģisel arģivler tarandı. O tarihlerde idareci olan ve çeģitli toplantılara katılan meslekteģlarımız ile konuģuldu. Toplayabildiğimiz dökümanları bu kitapta sizlere sunduk. Ekler kısmında göreceğiniz belgelerin çok büyük kısmı Prof. Dr. Vasıf Hasırcı nın arģivinden alınmıģtır. 25 hatta 30 sene önceye dayanan dosyalarını dolaplardan çıkarıp dökümanlarını önüme koyduğu ve tüm belgelerini benimle paylaģtığı için kendisine Ģükranlarımı sunuyorum. Ayrıca, elinizdeki kitabın hazırlanmasında bana yardım eden ve yoğun emek harcayan Biyoteknoloji EABD asistanlarımızdan özellikle Derya Gökçay, Adnan Yaramış, Evrim Elçin ve A. Hamit Battal a çok teģekkür ediyorum. Kitabın hazırlanmasından ayrı, 25.yıl etkinliğinin baģarılı geçebilmesi amacıyla, afiģ hazırlığından yaka kartına kadar her türlü koģuģturma iģlerini yürüten ve büyük özveri ile çalıģan Biyoteknoloji Laboratuvarı uzmanı Dr. Tamay Şeker e, Bölüm asistanlarımız Ayten Eroğlu, Fadime Kara Murdoch, Damla Arslantunalı, Taner Tuncer, Mehmet Sefa Ulutaş, Mustafa Çiçek ve Mustafa Nakipoğlu na, Yürütme Komitesi adına çok teģekkür ediyorum. Prof. Dr. Nesrin Hasırcı Yürütme Komitesi, Kimya Bölümü Temsilcisi ii

4 İÇİNDEKİLER BÖLÜMÜMÜZÜN TARİHÇESİ... 1 ÖĞRENCİ LİSTELERİ... 6 DOKTORA MEZUNLARI... 6 YÜKSEK LĠSANS MEZUNLARI KAYITLI ÖĞRENCĠLER YAYIN BİLGİLERİ YAYIN GRAFĠKLERĠ YAYIN LĠSTESĠ BÖLÜM BAġKANLARI ÖĞRETĠM ÜYELERĠ ÖĞRETĠM ÜYELERĠ BĠLGĠLERĠ ARAŞTIRMA GRUPLARI ODTÜ BĠTKĠ BĠYOTEKNOLOJĠSĠ GRUBU ODTÜ BĠYOHĠDROJEN ARAġTIRMA GRUBU BĠYOMALZEME VE DOKU MÜHENDĠSLĠĞĠ ARAġTIRMA GRUBU (BIOMAT) ÇEVRE BĠYOTEKNOLOJĠSĠ GRUBU ODTÜ MERKEZ LABORATUVARI BAZI ÖĞRETİM ÜYELERİNİN ÇALIŞMALARI EKLER EK EK EK EK EK EK EK EK EK EK EK EK EK EK EK iii

5 Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Biyoteknoloji Enstitü Anabilim Dalı Bölümümüzün Tarihçesi Orta Doğu Teknik Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoteknoloji Anabilim Dalı, 1989 yılında, ODTÜ içindeki beģ bölümün katkısı ile disiplinler arası lisansüstü bir program olarak kurulmuģtur. Programa katkı veren bölümler, Fen-Edebiyat Fakültesinden Biyoloji ve Kimya ile Mühendislik Fakültesinden Çevre Mühendisliği, Gıda Mühendisliği ve Kimya Mühendisliği bölümleridir. Geleneksel biyoteknoloji nin, yani bakteri, maya, mantar kullanımı ile fermentasyon teknolojileri uygulayarak yoğurt, peynir, alkol, ekmek gibi gıda malzemelerinin üretimi çok eski çağlara uzanmakla birlikte, Modern biyoteknoloji nin önem kazanması ancak 20.yüzyılda olmuģtur lı yıllarda, deoksiribonükleik asidin (DNA) keģfedilmesi Genetik Bilimi nin baģlangıcını oluģturmuģ ve 1950 sonrası yıllarda pek çok laboratuvar genetiği oynanmıģ bitki-ve-canlı çalıģmalarına baģlamıģtır. Genlerin bakterilere yerleģtirilmesi ve rekombinant insan insulini üretimi ilk kez 1982 yılında Genentech tarafından gerçekleģtirilmiģtir. Türkiye de, Geleneksel Biyoteknoloji var olmakla birlikte, Modern Biyoteknoloji olgusunun yerleģmeye baģlaması 1970 li yıllarda olmuģ ve 1980 li yıllarda ivme kazanmıģtır. O tarihlerde, tüm Dünyada, moleküler biyoloji alanında yapılan araģtırmaların artması ve elde edilen bulguların hızla uygulamaya aktarılması, Türkiye de de bilim adamlarının bu alana ilgisini artırmıģ ve modern biyoteknoloji ve genetik mühendisliği yönünde beyin gücü oluģturabilmek amacıyla çalıģmalar baģlamıģtır. Aynı yıllarda, Orta Doğu Teknik Üniversitesi ile Almanya da Darmstadt Technische Hochschule (Darmstadt Teknik Üniversitesi) arasında, daha önce baģka alanlarda (özellikle Kimya Bölümünden Prof. Dr. Önder Pamuk ve Doç. Dr. Ersin Yurtsever ile Prof. Dr. Jurgen Brickman arasında) yürütülen iģbirliğinin Biyoteknoloji alanını kapsaması konusunda giriģimler baģlatılmıģtır yılı baģlarında, o zamanki ODTÜ Rektörü Prof. Dr. Mehmet Gönlübol baģkanlığında, ve o zamanki Fen-Edebiyat Fakültesi Dekanı Prof. Dr. Tuğmaç Sayraç ın katılımı ile yapılan görüģmelerde, Darmstadt Teknik Üniversitesi Organik ve Biyokimya Bölümü ile ODTÜ Biyoloji Bölümü arasında iģbirlikteliği konusunda olumlu görüģler oluģturulmuģtur. Aynı yıl, Darmstadt Teknik Üniversitesi Organik ve Biyokimya Bölümü öğretim üyesi Prof. H. Günther Gassen ile Orta Doğu Teknik Üniversitesi Biyoloji Bölümü öğretim üyeleri Doç. Dr. Gürdal Alaeddinoğlu ve Doç. Dr. Vasıf Hasırcı arasında Biyoteknoloji konusunda ortaklık kurma görüģmeleri baģlatılmıģtır. Nisan 1985 tarihinde önce ODTÜ Rektörünün baģkanlığında bir heyet, daha sonra Haziran 1985 tarihinde Doç. Dr. Vasıf Hasırcı ve Ekim 1985 tarihinde Doç. Dr. Gürdal Alaeddinoğlu ortak proje oluģturmak amacıyla Darmstadt Teknik Üniversitesini ziyaret etmiģlerdir. 1

6 Darmstadt Teknik Üniversitesi Organik ve Biyokimya Bölümü ile ODTÜ Biyoloji Bölümü öğretim üyeleri arasında baģlatılan görüģmelerin sonucunda oluģturulan The Establishment of a Genetic Engineering Unit at METU (Turkey) Through the Cooperation of Darmstadt Technische Hochschule (F.R.G.) baģlıklı rapor iki kurumun Rektörlüklerine sunulmuģtur. Bu rapor özetle, 1) Eğitim ve eleman yetiģtirme, 2) Temel araģtırma, ve 3) Uygulamalı araģtırma olarak belirlenen ortak amaçların gerçekleģtirilmesi için ODTÜ de yeni bir laboratuvar olanağı yaratılmasını, Darmstadt için de Teknik eğitim ve araģtırma cihazlarını sağlamayı öngörmüģtür. Maddi desteğin sağlanabilmesi için çok güncel bir konuda ve özellikle Genetik Mühendisliği konusunda ortak proje yazımı hedeflenmiģtir. Taraflarca oluģturulan Klonierung und heterologe Expression der Glucose Oxydase aus Aspergillus niger, Produktion eines Lebensmittelstabilisators (ingilizce olarak: Cloning of Glucose Oxidase Genes from Aspergillus niger, Development of a Model System projesi her iki kurum tarafından ilgili makamlara sunulmuģtur (Sunulan proje içeriği Ek 1 de verilmiģtir). Bu projeye Alman AraĢtırma ve Teknoloji Bakanlığı (BMFT) tarafından tarihinde baģlamak üzere 3 yıl için Alman Markı destek sağlanmıģtır. Bütçenin Marklık kısmı ODTÜ cihaz alımları için ayrılmıģtır. Bütçenin bir kısmı, elemanların diğer kurumları ziyareti ve eğitilmesi için, bir kısmı da yeni bir Biyoteknoloji Merkezi kurulması için ayrılmıģtır. ġu an BIOMATEN Merkezi olan 2 katlı binanın temelini bu destek sağlamıģtır ve Biyoloji Bölümüne bağlı olarak Biyoteknoloji Araştırma Birimi olarak kurulmuģtur yılında TÜBĠTAK tarafından Biyoteknoloji İhtisas Komitesi oluģturulmuģ ve bu komitece hazırlanan rapor doğrultusunda 1985 yılında TÜBĠTAK Marmara Bilimsel ve Endüstriyel AraĢtırma Merkezi bünyesinde bir Biyoteknoloji Merkezi kurulmuģtur. Bu merkezin çalıģmalarında da, büyük atılımlar yapabilmek için belirli bir plan, kaynak ve özellikle beyin gücü gereksinimi ortaya çıkmıģtır. ODTÜ Biyoteknoloji AraĢtırma Merkezi kurulmasının ana hedeflerinden birisi, disiplinler arası yapılacak araģtırmalar ile farklı bilgi birikimlerini biraraya getirmek ve kritik beyin gücünü olmuģturmaktır. Biyoteknoloji Anabilim Dalı BaĢkanı Prof. Dr. Gürdal Alaeddinoğlu tarafından, eski tip bilgisayar programı olan moonstar ile yazılan, Biyoteknoloji Araştırma Merkezi Kurulma Gerekçesi baģlığı ile hazırlanan ve üzerinde el yazısı ile düzeltmeler yapılmıģ olan 8 sayfalık rapor, o dönem konunun önemini ve böyle bir merkezin ODTÜ için gereksinimini vurgulamıģtır. (Ek 2). ODTÜ ve Darmstadt Üniversiteleri arasındaki bu iģbirliği, Mayıs 1987'de her iki Üniversitenin rektörleri tarafından imzalanan bir protokol ile oluģturulmuģtur. 25 Kasım 1987 tarihli Darmstadt tan gelen mektup, iki kurum arasında iģbirliğinin artırılması ile ilgili olarak giriģimlerin yapılacağını belirtmektedir (Ek 3). Yürütülen çalıģmalar ile ilgili hazırlanan, Darmstadt Teknik Üniversitesi- ODTÜ Gen Teknolojisi Ortak Projesi GeliĢme Raporu, 4 Mart 1988 tarihinde ODTÜ Rektörlüğüne sunulmuģtur. 2

7 Büyük olasılıkla yıllarında Prof. Günther Gassen a gönderilen mesaj, Biyoteknoloji Birimi olarak kurulmakta olan yeni binanın inģası ile ilgili bilgi vermekte, aynı zamanda ODTÜ Rektörünün de Ağustos 1987 de değiģtiğini bildirmekte ve projede çalıģmak üzere bir elemanın Almanya dan ODTÜ ye gelmesini istemektedir (Ek 4). Aynı yıllarda hazırlanan bir baģka yazı, Biyoteknoloji Ünitesi nin henüz yapım aģamasında olduğunu, disiplinler arası olarak ve mikrobiyoloji, moleküler genetik, biyokimya ve biyomateryal alanlarını içeren ve Biyoloji öğretim üyeleri tarafından sunulan 3 projenin maddi olarak desteklenmesi ve alınacak cihazların Biyoloji Bölümünde bulunmayan cihazlara indirgendiğini belirtmektedir (Ek 5). 31 Mayıs 1988 Tarihli Üniversite Senatosu Toplantısı tutanağında, Fen-Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü ne bağlı olmak üzere Biyoteknoloji adı altında yeni bir anabilim dalı açılması teklifi görüģülmüģ, Biyoteknoloji isminin Mühendislik Fakültesi ndeki Gıda ve Kimya Mühendisliklerinin bazı alanlarını kapsadığının belirlenmesi üzerine, anabilim dalının Genetik Bilimleri adı altında açılmasının ve ayrıca Fen Bilimleri Enstitüsü ne bağlı bir Biyoteknoloji Enstitü Anabilim Dalı nın açılmasının Yükseköğretim Kurulu na önerilmesine karar verilmiģ (Ek 6) li yıllarda, bilim ve teknoloji alanında atılımlar yapmanın gereksinimi ve belli alanlarda Mükemmeliyet Merkezleri kurmanın önemi TÜBĠTAK tarafından da belirtilmiģtir. O zamanki TÜBĠTAK baģkanı Prof. Dr. Mehmet Ergin tarafından gönderilen tarihli yazıda Üniversitelerden gönderilecek raporların değerlendirileceği ve Center of Excellence sayılabilecek üst düzeyde çalıģmaları olan bazı Birimlere destek verileceği belirtilmiģtir (Ek 7). Bu kapsamda, ODTÜ de kurulacak Mükemmeliyet Merkezlerinden birinin Biyoteknoloji alanında olması önerilmiģtir. 22 Temmuz 1988 tarihli ve o dönemde ODTÜ Rektörü olan Prof. Dr. Ömer Saatçioğlu tarafından Biyoloji Bölüm BaĢkanı olan Doç. Dr. Vasıf Hasırcı ya gönderilen ileti, TÜBĠTAK ın bu çalıģmasını ve o dönem Fen Bilimleri Enstitüsü Müdürü olan Prof. Dr. Alpay Ankara koordinatörlüğünde, Genetik, Enzim ve Mikrobiyal İşlemler, ve Ayırma İşlemleri birimlerini içeren Biyoteknoloji Merkezi kurulması önerisini içermektedir (Ek 8). ODTÜ ve Darmstadt Teknik Üniversiteleri arasındaki iģbirliği neticesinde temelleri atılan Biyoteknoloji AraĢtırma Birimi 1988 yılında tamamlanmıģ, proje çerçevsinde alınan cihazlar bu binaya taģınmıģtır. Konu, Nisan 2000 tarihli ODTÜ 'Bu Hafta' gazetesinde haber olarak çıkmıģtır (Ek 9). 2 Ocak 1989 tarihinde, Biyoloji Bölümünde yürütülen Biyoteknoloji Projesi ve yapılan ek bina hakkında görüģme yapmak üzere o zamanki Biyoloji Bölüm BaĢkanı Doç. Dr. Aykut Kence, proje yürütücüsü Doç. Dr. Vasıf Hasırcı ya bir ileti göndermiģtir. (Ek 10) yıllarında, Biyoloji Bölümünün içinde Genetik Mühendisliği alanında çalıģan Biyoloji Bölümü öğretim üyelerinin aktivitelerini belirten bir rapor hazırlanmıģtır. Bu raporda, Darmstadt ile yürütülen projelerin yanı sıra, ilgili bölüm üyelerinin makaleleri, yürüttükleri tez çalıģmaları, katıldıkları konferanslar ve yaptıkları projeler verilmiģtir. Bu belgede, 1983 yılında Dr. 3

8 Alaeddinoğlu nun Industrial Aspects of Biochemistry and Genetics baģlığında bir NATO yaz okulu ve 1988 yılının Haziran ayında Dr. Hasırcı nın Biyoteknoloji Simpozyumu düzenlediği belirtilmektedir (Ek 11). NATO yaz okulu ile ilgili olarak tarihli Milliyet gazetesi küpürüde bu yazıya eklenmiģtir yılında Fen-Edebiyat Fakültesi Dekanı Prof. Dr. Tuğmaç Sayraç ın 5 Eylül 1988 tarihli yazısı ile Biyoloji Bölüm BaĢkanı Doç. Dr. Vasıf Hasırcı ya gönderdiği raporda, 1983 tarihinden itibaren, ODTÜ Fen-Edebiyat Fakültesinin değiģik birimleri ile Darmstadt Teknik Üniversitesi arasında baģlayan ve aktif olarak yürütülen çalıģmalar, özetlenmiģtir (Ek 12). Biyoteknoloji Projesi, Biyoteknoloji Araştırma Birimi ve Biyoteknoloji Merkezi Ģeklinde değiģik olgular geliģirken ve bu konularda yapılan çalıģmalar devam ederken, diğer taraftan da Biyoteknoloji Anabilim Dalı kurmanın önemi gündeme gelmiģtir. Güncel ve teknolojik bilgi sahibi yaratıcı öğrencilerin yetiģmesinin sağlanabilmesi için, disiplinlerarası ve Fen Bilimleri Enstitüsüne bağlı olan Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programı baģlamıģtır. Biyoteknoloji Programı na katkı veren beģ bölüm (Biyoloji, Kimya, Gıda, Çevre ve Kimya Mühendisliği) olmuģtur. O dönem hazırlanan Ders Listesi bu beģ bölümden öğretim üyelerinin verecekleri ve öğrencilerin alabilecekleri dersleri içermektedir (Ek 13). Biyoteknoloji EABD BaĢkanı Doç. Dr. Faruk Bozoğlu tarafından gönderilen, 20 Eylül 1989 tarihli ileti ile öğretim döneminde Biyoteknoloji EABD programına 5 öğrencinin kabul edildiği bildirilmiģtir. Ayrıca, aynı iletide, bir önceki dönemden devam eden 8 öğrencinin ders yükümlülüklerini görüģmek üzere tarihinde toplantı yapılacağı belirtilmiģtir (Ek 14) Tarihinde yapılan Biyoteknoloji EABD Toplantısı nda, ders programlarının yanı sıra, bir Yürütücü Komite - Steering Committee kurulması ve içinde katkı veren bölümlerden elemanların bulunması, Bölüm baģkanlığının her sene farklı bir Bölüm elemanına geçmesi ve Rotasyona bağlanması, asistan ve teknisyen gereksinimi, ortak proje oluģturulması gibi konularda görüģler belirtilmiģ ve tartıģılmıģtır yılında 15 sayfa olarak hazırlanan Ders yılı Akademik Faaliyet Raporu nda, o dönemdeki Yürütücü Komite üyeleri, ders programları, yüksek lisans ve doktora öğrencilerinin alabilecekleri dersler, kayıtlı öğrenciler, her bölümden programa katkı veren öğretim üyeleri ve yürütülmekte olan projeler hakkında bilgi verilmiģtir (Ek 15). 25. Yılını baģarıyla geride bırakan Biyoteknoloji Anabilim Dalına, 1989 tarihinden bu güne kadar çok sayıda öğretim üyesi BaĢkanlık yapmıģtır. Önceleri her yıl değiģen Bölüm BaĢkanlığının, daha sonra 2 yılda bir değiģmesi kabul edilmiģtir. Bu güne kadar 17 dönem Biyoteknoloji EABD BaĢkanlığı yapılmıģtır. Bölüme, değerli çalıģmaları ile katkı veren öğretim üyelerimizin bir kısmı emekli olmuģtur. Bazı öğretim üyelerimiz kurum değiģtirmiģ ve baģka kuruluģlarda çalıģmalarını devam 4

9 ettirmektedir, bazı üyelerimiz ise vefat etmiģtir. Her bir üyemizin verdiği emek çok büyüktür ve Ģükranla anılmaktadır. ġu an için Biyoteknoloji EABD na katkı veren 54 öğretim üyesi bulunmaktadır tarihinden itibaren Biyoteknoloji Bölümüne kayıtlı 277 Yüksek Lisans ve 136 Doktora öğrencisi olmuģtur. Mezunlarımızın sayısı da her yıl artmıģtır. Ġlk Yüksek Lisans mezunumuz 1991 yılında diplomasını alan Sadiye Birep Aygün ve ilk Doktora mezunumuz 1997 yılında diplomasını alan Kezban Ulubayram olmuģtur. ODTÜ Biyoteknoloji Bölümünden, bu güne kadar 234 yüksek lisans ve 85 doktora olmak üzere toplam 319 öğrencimiz mezun olmuģtur. ġu anda da kayıtlı olarak 43 yüksek lisans ve 51 doktora (toplam 94) öğrencimiz bulunmaktadır. Bölümümüz, en eski disiplinler arası program olarak ODTÜ de aynı zamanda en çok öğrenci yetiģtiren EABD da olmuģtur. Önümüzdeki yıllarda bu sayılar daha da artacaktır. Mezunlarımız ve öğrencilerimiz, gerek akademik yaģamda gerekse sanayi dallarında gösterdikleri ve gösterecekleri baģarılar ile gurur kaynağımız olmaya devam edeceklerdir. Bölüm öğrencilerimizin yapmıģ oldukları araģtırmalar, gerek yurt içi ve gerek yurt dıģı bilimsel dergilerde yayınlanmıģ, konferanslarda sunulmuģ ve bazı çalıģmalar en iyi tez, 'en iyi sunum' ya da en iyi poster ödüllerine layık görülmüģtür. Öğretim üyelerimizin de çabaları benzeri Ģekilde çok sayıda ödülle takdir görmüģtür. Yıllar içinde mezunlarımıza ait yayınların sayısı çok artmıģtır. Biyoteknoloji EABD na Ģu anda destek veren 8 bölüm ve 55 öğretim üyesi bulunmaktadır. Öğretim üyelerimizin ODTÜ internet sayfalarından alınan bilgileri kendi onayları ile bu kitaba eklenmiģtir. Bu bilgilerin dıģında, bazı öğretim üyelerimize ait ve belli bir amaca yönelik kurulan Merkez ve Grup çalıģmaları ile ilgili bilgiler ve ayrıca bazı üyelerimiz tarafından gönderilen bireysel çalıģma alanları ile ilgili bilgiler elinizdeki kitaba eklenmiģtir. Bölüm öğretim üyelerimiz, gerek Türkiye de gerekse Uluslararası platformlarda Bölümü müzün adını baģarı ile temsil etmiģlerdir etmeye devam etmektedirler. Bundan sonrada yapılacak çalıģmaların çok baģarılı devam edeceğine ve Uluslararası platformlarda her zaman olduğu gibi Bölümümüzün ağırlığını koruyacağına inanmaktayız. 2014'te kuruluģunun 25. Yılını kutlayan Biyoteknoloji Bölümü ne, bu süre içinde katkıda bulunan ve bundan sonra da her türlü katkıyı yapacağına inandığımız tüm paydaģlarımıza, öğretim üyelerimize, mezunlarımıza, öğrencilerimize, personelimize ve bizleri her zaman destekleyen Fen Bilimleri Enstitüsü Müdür ve Yöneticilerine ve özellikle de Rektörlüğümüze en derin teģekkürlerimizi sunarız. Biyoteknoloji Yürütme Komitesi adına, Prof. Dr. Nesrin Hasırcı 5

10 ÖĞRENCİ LİSTELERİ DOKTORA MEZUNLARIMIZ YEAR STUDENT THESIS TITLES KEZBAN ULUBAYRAM EGF Containinig Wound Dressing Materials FARZIN ROUHVAND ÜLKÜ BAYKAL PCR-based isolation, cloning and expression of streptokinase gene from a group C streptococcus equisimilis in E.Coli Synthesis and antisense activities of DNA oligomers with hydrolytically active sites ÖZLEM OSMANAĞAOĞLU OSMAN ÇATALOLUK Purification and characterization of bacteriocins produced by pediococcus acidilactici and pediococcus pentosaceus PCR amplication, cloning and sequencing of the gene coding for Salivaricin B and partial characterisation of the bacteriocin produced by lactobacillus salivarius M MEHRZAD MAHMOUDIAN Optimisation of tissue culture conditions and gene tarnsfer studies in lentil BÜLENT İÇGEN AYTEN YAZGAN ERDOĞAN EŞREF HAKKI EMEL BANU BAL CİHAN HALICIGİL FATMA NEŞE KÖK FÜSUN EYİDOĞAN ERKAN TÜRKER BARAN Characterization of local Salmonella enteritidis isolates of chicken, egg and human origin Molecular biology and genetics of dipeptide biosynthesis : the system is an essential component of quorum sensing global regulation A novel method for developing microsatellite markers and sequence analysis of wheat disease resistance gene analogs Genetic relationship analysis of bead wheat varieties by using simple sequence repeat markers Biochemical characterization of N-methylcarbamate pesticide biodegradation by an methylotropic isolate Construction of an acetylcholinesterase-choline oxidase biosensor for the determination of aldicarb Genetic manipulation of tobacco against osmotic stress via proline overproduction Increase of asparaginase in vivo half life by encapsulation and surface modification DİLEK KESKİN Controlled release of pain relievers for the alleviation of chronic pain AYŞEN TEZCANER Tissue engineered retinal pigment epithelium FAHRİYE ERTUĞRUL Studies on the development of osmotic stress resistant wheat (Triticum aestivum L.) by introducing aldose reductase gene through particle borbardment GAMZE TORUN Bone tissue generation on biodegradable polymeric scaffolds TAMAY ŞEKER Trehalose and glycogen metabolism of ger1 mutants of saccharomyces cerevisiae 6

11 MELEK ÖZKAN SEDEF TUNCA HATİCE BİLGİÇ GÜLSÜM ÖZTÜRK ASLI MUVAFFAK Cloning, sequencing and expression of L-lactate dehydrogenase gene from clostridium thermocellum and isolation, characterization and transformation of various cellulolytic, thermophilic, ethanol-producing bacteria Cloning, characterization and heterologous expression of the aspartokinase and aspartate semialdehyde dehydrogenase genes from the cephamycin C producer streptomyces clavuligerus Genetic relationship of wild and primitive wheat species from Turkey based on microsatellite markers and ancient DNA analysis Calixarene based artificial metalloenzyme and fluorescent sensor for soft-metal cations Controlled release systems for anticancer drugs and drug targeting in cancer therapy NOSHIN ASGHARI Complete microbial degration of aldicarb TAREK ELBASHITI ŞEYDA AÇAR Trehalose metabolism in wheat and identification of trehalose metabolizing enzymes under abiotic stress conditions Biochemical and genetic studies on the pyruvate branch point enzymes of rhizopus oryzae MUSTAFA CAN ATALAY Multidrug resistance in logally advanced breast cancer ELİF ASUMAN KORKUSUZ ÇAĞATAY CEYLAN FİGEN YILDIRIM YAVUZ ÖZTÜRK HALİL DÜNDAR ADNAN AL-ASBAHİ Domestic wastewater treatment in pilot-scale constructed wetlands implemented in the Middle East Technical University The evaluation of high hydrostatic pressure effects on bovine blood constituents and the microbial survival Elucidation of r gene mediated yellow rust disease resistance mechanism in wheat by dual bait yeast two-hybrid analysis Characterisation of the genetically modified cytochrome systems and their application to biohydrogen production in rhodobacter capsulatus Characterization and purification of a bacteriocin produced by Leuconostoc mesenteroides subsp. cremoris Identification and cloning of genes induced and / or repressed upon treatments of wheat plants (avocet s) with BTH, BABA and Trichoderma Harzianum Raifi KRL-AG AYŞEGÜL ERSAYIN YAŞINOK An investigation of bacterial and fungal xylanolytic systems OSMAN BOZKURT Determination of genes involved in the yellow rust disease of wheat ALİ OĞUZ BÜYÜKKİLECİ Investigation of sugar metabolism in rhizopus oryzae M.DİLEK AVŞAROĞLU Isolation, molecular characterization of food-borne drug resistant salmonella spp. and detection of class 1 integrons GÖKHAN DURUKSU Expression and analysis of Endo Beta-1,4-Mannanase of Aspergillus Fumigatus in heterologous hosts ÖZLEM AK Xylooligosaccharide production from cotton and sunflower stalks BAŞAR UYAR Hydrogen production by microorganisms in solar bioreactor 7

12 UFUK ÇELİKKOL AKÇAY TURGAY ÜNVER Regeneration of lentil (lens culinaris medik) and genetic transformation by using agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer Detection and characterization of plant genes involved in various biotic and abiotic stress conditions using ddrt-pcr and isolation of interacting proteins GÖKHAN KARS Improvement of biohydrogen production by genetic manipulations in rhodobacter sphaeroides O.U MELTEM DEMİREL KARS Molecular mechanisms of vincristine and paclitaxel resistance in mcf-7 cell line HALİME KENAR 3d patterned cardiac tissue construct formation using biodegradable materials PERUZE AYHAN Novel bioconversion reactions for the syntheses of a-hydroxy ketones DENİZ YÜCEL Stem cell based nerve tissue engineering on guided constructs ÖZLEM DARCANSOY İŞERİ ŞAZİYE BETÜL SOPACI Investigation of docetaxel and doxorubicin resistance in mcf-7 breast carcinoma cell line Microorganism mediated stereoselective bio-oxidation and bio-hydrogenation reactions and thiamine pyrophosphate dependent enzyme catalyzed enantioselective acyloin reactions PINAR ZORLUTUNA Nanopatterned tubular collagen scaffolds for vascular tissue engineering GÜLSÜM EBRU ÖZER UYAR PINAR YILGÖR YONCA YÜZÜGÜLLÜ HOUMAN JABBARI FARHOUD AYTAÇ KOCABAŞ ERKİN AYDIN NANSALMAA AMARSAIKHAN Cloning and characterization of trehalose-6-phosphate synthase gene from rhizopus oryzae Sequential growth factor delivery from polymeric scaffolds for bone tissue engineering Functional and structural analysis of catalase-phenol oxidase from scytalidium thermophilum Development of PCR methods for detection and quantification of genetically modified maize Co-production of xylanase and itaconic acid by aspergillus terreus nrrl 1960 on agricultural biomass and biochemical characterization of xylanase Biodegradable polymer - hydroxyapatite nanocomposites for bone plate applıcations The role of the cross pathway control protein in the stress response and adaptation of aspergillus species to antifungals FATMA BESTE KINIKOĞLU Tissue engineering of full-thickness human oral mucosa GÖZDE KERMAN BİLGİN TAŞKIN KAMAL ELKAHLOUT PEMBEGÜL UYAR The effect of strontium-containing silicon-doped hydroxyapatite ceramics on bone defect healing Selective quantification of viable Escherichia Coli cells in biosolids upon propidium monoazide treatment by quantitative PCR Phototrophic hydrogen production by agar-immobilized Rhodobacter capsulatus Investigation of chemopreventive and apoptotic characteristics of turkish medicinal plant rheum ribes 8

13 GÜLDEN AVCI Analysis of phenol oxidation products by scytalidium thermophilum bifunctional catalase/phenol oxidase (catpo) ALBANA NDREU Electrospun nanofibrous scaffolds for tissue engineering HAMDİ KAMÇI Genetic transformation of lentil ( Lens culinaris m. cv.sultan.1) with a transcription factor regulator (MBF1c) and analysis of transgenic plants AYSEL KIZILTAY Biodegradable poly (ester-urethane) scaffolds for bone tissue engineering ABDULLAH TAHİR BAYRAÇ In vitro selection of DNA aptamers to glioblastoma multiforme ASLI ERDOĞ MEHMET TUFAN ÖZ CEREN AKSOY ESRA UÇKUN KIRAN KURTULUŞ GÖKDUMAN SÜMEYRA GÜRKÖK KUBİLAY YILDIRIM GÖZDE ÜNSOY ROUHOLLAH KHODADUST BURÇAK KOCUKLU Characterization of liposomal celecoxib formulation as a drug delivery system in colorectal cancer cell lines Microarray based expression profiling of barley under boron stress and cloning of 3H boron tolerance gene Characterization and identification of human mesenchymal stem cells at molecular level Developing value-added products from agricultural and biorefinery by-products using biological strategies The Development of molecular genetic tools for detection of Salmonella pathogen Heterologous expression, characterization, and optimization of production of alpha-galactosidase from aspergillus fumigatus in aspergillus sojae Transcriptional and physiological responses to drought stress in Populus nigra L. The Synthesis and characterization of doxorubicin and bortezomib loaded magnetic nanoparticles for targeting tumor cells The Preparation and characterization of dendrimer coated magnetic nanoparticles for targeted cancer therapy Deletion mutagenesis of fusarium graminearum nrrl 2903 galactose oxidase in escherichia coli to study structure-function relations and for prospective biosensor applications EDA ALAGÖZ Screening of the putative hexokinase genes from rhizopus oryzae ERİNÇ BAHÇEGÜL Effect of biomass pretreatment conditions on the glucose and biodegradable film production from lignocellulosic wastes ARDA BÜYÜKSUNGUR Bioactive agents carrying quantum dot labeled liposomes CEYHUN KAYIHAN DOMINIC DEO ANDROGA NADER ALIPOUR GHORBANI CEREN BAYRAÇ Physiological, biochemical and molecular analysis of wheat cultivars under boron treatments Modeling and simulation of photobioreactors for biological hydrogen production Genomic characterization of pseudomonas aeruginosa clinical isolates by pulsed field gel electrophoresis method Generation Of Aptamer Against Salmonella Serovar Entitidis And Development Of Aptamer-Based Capillary Biosensor 9

14 YÜKSEK LİSANS MEZUNLARIMIZ YEAR STUDENT THESIS TITLES SADİYE BİREP AYGÜN Microbial utilization of chlorinated hydrocarbons VOLKAN SEYRANTEPE Introduction of callus from P.somniferum and P.orientale in vitro conditions FARZIN ROUHVAND Transformation of saccharomyces cerevisiae with a shuttle vector plasmid DNA from E.Coli by electroporation GÜLHAYAT ALTAY Genetic studies on bacteriocin producing lactic acid bacteria NOSHIN ASGHARI Microbial degradation of temik aldicarb RAMIN DARVARI AYTEN YAZGAN EZGİ MUALLA ERGİN Controlled release of 2', 7'-dichlorofluorescein and aldicarb from car boxymethyl cellulose microspheres Studies on heavy metal resistance system and accumulation of metals in Kluyveroyces marxianus. Pseudomonas aeruginosa ses elastase: isolation, microbiological and biochemical characterizations BÜLENT İÇGEN Characterization of various Rhizobium cicer strains and assessment of their symbiotic effectiveness ŞERİFE ESRA ERDAL Phsiological and genetical aspects of Rhizobium cicer-chickpea AYŞEN TEZCANER Structural stability of libosomes and the influence of constituents ÖZLEM OSMANAĞAOĞLU ÜLKÜ BAYKAL Isolation, identification and characterization of non-starter microorganizms form Turkish Casher Cheese Interaction of vitamin E with cholesterol-containing phospholid model membranes:an FTIR study CİHAN HALICIGİL Aldicarb biodegradation by soil bacteria MEHRZAD MAHMOUDIAN Agrobacterium mediated gene transfer in tobacco TÜZÜN ARIK Production of hydrogen by rhodobacter sphaeroides O.U FÜSUN EYİDOĞAN BANU KAYA Characterization of superoxide dismustase isoenzmyes in Turkish wheat varieties under different stress conditions. Hydrogen gas production by halobacterium halobium coupled to escherichia coli in a photobioreactor YELDA ÜNAL Increase of alpha amylase production of aspergllus oryzae by electroporation AYŞE MELTEM MAVİTUNA Effect of auxin-like plant growth regulators on salt stressed wheat varieties GAMZE TORUN Changing the liposomal surface properties by means of low molecular weigth heparin. 10

15 BEKLAN GÜRKAN Studies on the long term memory of bacteriorhodopsin MELEK ÖZKAN Optimization study on antidipteran (cryiv- type) toxin production FAHRİYE ERTUĞRUL PELİN KARAKAYA PERVİN KATMER Effects of cell cycle regulatory genes on the utilization of histone H3/H4 promoters in alfaalfa and maize protoplasts. Effect of filter media and backwash on biomass retention and soluble substrate removal in biologically active rapid filters. Assessment of toxicity and biogdegredability of pulping effluents to microbial treatment community by electrolytic respirometry AYSU GÜNAL Overproduction of neutral protease in Bacillus subtilis FATMA NEŞE KÖK Control of aldicarb concentration in the environment via use of carboximethyl cellulose microspheres: A two-pronged biotechnological approach SEDEF TUNCA Mutational programming of bacillus subtilis: overproduction of alfa-amylase NESLİHAN PARLAKGÖZ Heavy metal biosorption by phanerochaete chrysosporium GÜROL MEHMET SÜEL ÖZLEM AK FATOŞ DOĞANEL POLAT BANU ARUN Cloning and sequencing of a PCR amplicon of a novel dehalogenase gene from pseudomonas Sp.Strain SEC896 Production, Purification and characterization of chitosanase from Penicillium spinulosum Enantioselective biotransformation of acetoxy ketones to chiral a-hydroxy derivatives by using Rhizopus Oryzae Construction of a glucose oxidase-catalase bioreactor by employing phema- EGDMA microspheres DİLEK KESKİN Antibiotic release from biodegradable microbial polyesters ERDOĞAN EŞREF HAKKI Amplification and isolation of a fragment of lactate dehydrogenase gene from Rhizopus Oryzae using RT-PCR FÜSUN TÜRESİN Controlled release of antibiotics from biodegradable Polyhydroxyalkanoate implants for the treatment of osteomyelitis ORKUN BAŞARIR Mutagenesis on the aspergillus oryzae a- Amylase gene promoter GÖKHAN TOLUN HALİL DÜNDAR RIFAT AYKUT ÖZER FİKRİYE ZEYNEP GÜMÜŞYAZICI DENİZ ÖZGÜR YİĞİT Characterization of Aspergillus oryzae transformed with a plasmid carrying a- Amylase gene Utilization of lignocellulosic compounds for the production of cellulases by Torula thermophila Subcloning and expression of Bacillus amyloliquefaciens alpha-amylase gene in Lactobacillus plantarum Synthesis of polyhydroxybutyrate and its copolymers by alcaligenes latus and alcaligenes eutrophus Identification of by-products in hydrogen producing bacteria; Rhodobacter sphaeroides O.U. 001 grown in waste water of a sugar refinery ALAADDİN BULAK ARPAT F-F progeny analysis of herbicide resistant transgenic tobacco plant 11

16 FERDA GÜVENÇ Partial purification and characterization of b-1,4-endoxylanase from Rhizopus oryzae ÖZLEM ÜNVER Molecular dynamics of pig citrate synthase B.ŞEBNEM YAVAŞÇAOĞLU Optimization of fermentation conditions for the production of xylanases from Rhizopus oryzae KEREM BORA Hydrogen gas production by Escherichia coli in a bioreactor FATMA NİHAN AKA Novel reagents for mild and selective hydrolysis of phosphodiester linkages ZEYNEP AKYOL Isolation and biochemical characterization of a-amylase inhibitor from common bean (Phaseolus vulgaris L.) BUĞÇE ALBAYRAK Controlled release of insulin from chitosan microspheres CEREN NUR BAKİ A novel calixarene based fluorescent chemosensor for ph İREM KARAMOLLAOĞLU HAYRİYE DURU AYŞEGÜL ERSAYIN YAŞINOK ÇİĞDEM ÖZCANGAZ ŞAZİYE BETÜL SOPACI Agrobacterium-mediated genetic transformation and microtuberization of potato (solanum tuberosum L.) The effects of nisin combined with edta and hydrogen peroxide on salmonella enteritidis in liquid whole EGG Biochemical characterization of R.oryzae xylanase and heterologous probe preparation from T. reesei Characterization of lactic isolates from Turkish, sourdough and interaction of these with yeast Southern analysis of Torula Thermophila genome for the multiplicity of cellulase genes FİRDEVS YALÇIN Characterization of bacterial isolates from salt lake EBRU AKSU Gelatin sponges as wound dressing materials SENEM ŞİMŞEK Multidrug resistance in chronic lymphocytic leukemia BANU AVCIOĞLU DÜNDAR Screening of soil microorganisms to isolate xylanase producers YAVUZ ÖZTÜRK AYLA ARSLAN Construction and analysis of a soluble version of the membrane-attached cytochrome Cy in Rhodobacter capsulatus Partial purification and kinetic characterization of L-lactate dehydrogenase from Rhizopus oryzae DENİZ ÖZASLAN Methomyl utilisation by methylotrophic bacteria AYÇA DOĞAN FİGEN YILDIRIM The effects of gamma irradiation on hazelnut tissue at molecular level by fourier transform infrared spectroscopy AFLP markers in molecular characterization and genetic relationship analysis of Triticum SSP.In Turkey and bulk segregant analysis for determination of linked yellow rust resistance marker 12

17 ÇAĞLA ALTUN BANU EYÜBOĞLU RAHŞAN NESLİHANOĞLU KUTLU GÖKSU ELPEK Genetic transformation of tobacco with HS1(PRO1) gene and evaluation of nematode resistance in transgenic plants Production and characterization of a thermostable xylanase from a thermophilic soil bacterium Synthese of bioactive compounds using biotechnological methods: fungal culture mediated syntheses of chiral a-hydroxy ketones and diols Molecular characterization of multi-drug resistant salmonella isolates in Turkey KADRİ KIVANÇ YARANGÜMELİ optimization of culture conditions for scytalidium thermophilum endoglucanase production on lignocellulosic biomass İPEK ZEYNEP DURUSU UFUK ÇELİKKOL AKÇAY KAMAL ELKAHLOUT ALTAN TABANOĞLU GÜLSÜM EBRU ÖZER UYAR Optimization of in vitro regeneration of Turkish wheat cultivars from immature embryo and inflorescence explants Optimization of an integrated bombardment and agrobacterium infiltration based transformation system for lentil Effect of bacteriorhodopsin on hydrogen gas production by rhodobacter sphaeroides O.U.001 in a photobioreactor Hydrogen production by rhodobacter sphaeroides O.U.001 in a solar bioreactor Effect of different stress conditions on trehalose accumulation and degradation in Rhizopus oryzae SEMA DOĞA ÇAPANOĞLU Fungus mediated biohydrogenation of carbonyl compounds SÜLEYMAN COŞKUN Biodegradable bone plates and bone marrow extract loaded microcapsules in bone repair PELİN MUTLU Polymophism in the human MRP1 gene BİRGÜL EREN ATAK Biological phosphorus removal in Ni(II)containing synthetic wastewaters ELİF UZ YAVUZ BARBAROS OSMAN BOZKURT GÖNÜL SEYİT SEÇİL ÇETİN MİSKET HEPER Analysis of triticum monococcum ssp, boeoticum accessions distributed over Turkey using aflp markers and assesment of polymorphism levels of newly isolated ssr markers Differential screening to search for wheat genes activated in zinc involved processes Differential display of wheat mrnas for the detection of yellow rust diase resistance genes Cloning of alpha and beta subunit genes of 20s proteasome from thermoplasma volcanium Cassette mutagenesis to identify the genes involved in quorum-sensing pathway and bacilysin biosynthesis in bacillus subtilis Sodium, calcium, ammonium, magnesium and hydrogen forms of zeolite Y for the adsorption of glucose and fructose from aqueous solutions AYSEL KIZILTAY Gelatin based drug release systems for thalassaemia treatment MOHAMED LAMİN SESAY Investigation of solids residence time on sludge characteristics with specific emphasis on extracellular polymers 13

18 SİBEL METE Scytalidium thermophilum polyphenol oxidase : production and partial characterization M.DİLEK AVŞAROĞLU Inactivation of lactococcal bacteriophages by high hydrostatic pressure ( HHP) SUZAN BER Collagen matrices for guided tissue engineering ERHAN ASTARCI SİBEL ÇINAR MİNE TÜRKTAŞ YASEMİN AKTAŞ Production and biochemical characterization of polyphenol oxidase from thermomyces lanuginosus Poly( N-vinyl 2- pyrrolidone) based hydrogels for the delivery of bioactive species Investigation of wheat genes involved in zinc efficiency mechanism using differential display technique Identification of the genes involved in phytosiderophore" synthesis and metal ion uptake in wheat using RT-PCR HALİME KENAR In vitro bone tissue engineering on patterned biodegradable polyester blends MEHMET SOMEL Characterisation of DNA from archaelogical wheat (Triticum L.) seeds from Anatolia DENİZ YÜCEL Construction of a choline oxidase biosensor ÇAĞLAR ÇEKİÇ Cloning, expression and sequencing of citrate synthase from thermoplasma volcanium MUAMMER ÖZGÜR ÇEVİK Effect of neuropeptide-y ( NPY) on bone metabolism as a neuromediator HAYRİYE ÖZÇELİK Productivity Analyses in Fermentations with Three Different Biolarvacides SELİN ZAİMOĞLU Inhibitory effects of plant originated extracts on bovine lens aldose reductase OYA AKÇELİK BETÜL DEÇANİ NİHAD YAQUBOV IŞIN NUR CİCERALİ Charaterization and indentification of bacteriocins from two lactococcus lactis subs lactis strains Extension of flower longevity in transgenic plants via antisense blockage of ethylene bıosynthesis The effects of thidiazuron on callus development and organogenesis from mature embryos of selected Turkish bread and durum wheat varieties Effect of salt stress on antioxidant defense systems of sensitive and resistance cultivars of lentil( Lens culinaris M.) CANDAN ZEYNEP SÖNMEZALP Detection of genetically modified insect resistant tomato via polymerase chain reaction GAMZE AYDIN Detection of genetically modified maize via polymerase chain reaction HÜMEYRA BAHÇECİ DİDEM DEMİRBAŞ Fatty acid methyl ester analysis of bacterşal isolates from salt lake, Turkey and characterization of their extracellular enzymes Optimization of Regeneration and Agrobacterium mediated transformation of wheat (Triticum aestivum L.cv. Yüregir 89) 14

19 CEREN AKSOY ABDULLAH TAHİR BAYRAÇ HAMDİ KAMÇI YELDA KAPTAN HOUMAN JABBARI FARHOUD FIRAT KARA Identification of serotype specific dna marker for salmonella typhimurium by rapd-pcr method Optimization of a regeneration and transformation system for lentil ( lens culinaris M., cv. Sultan-I) cotyledonary petioles and epicotyls Optimisation of agrobacterium mediated gene transfer and micrografting systems in lentil ( lens culinaris medik) Utilization of Scytalidium thermophilum phenol oxidase in bioorganic synthesis Morphometric, mtdna and microsatellite analysis in honeybee populations ( apis mellifera L.) of north and northwest İran Release and characterization of beta-galactosidase from lactobacillus plantarum ABUBAKER MUWONGE Detection of genetically modified potatoes by the polymerase chain reaction PINAR ZORLUTUNA Cornea engineering on biodegradable polyesters ŞERİFE AYAZ Development of a genetic material transfer approach for gene therapy ZEYNEP AHSEN KOÇER MEHMET TUFAN ÖZ OYA TAĞIT BİLGİN TAŞKIN GÖKÇEN EYÖVGE EDA ALAGÖZ KURTULUŞ GÖKDUMAN In vitro induction of growth and development of common juniper( Juniperus communis L.) from shoot and bud explants Optimization of selection conditions and agrobacterium mediated transformation of chickpea ( cicer arietinum L. cv. Gökçe) Development and analysis of controlled release polymeric rods containing vancomycin Effect of homologous multiple copies of aspartokinase gene on cephamycin c biosynthesis in streptomyces clavuligerus Preparation and characterization of poly( d,l-lactide-co-glycolide) microspheres for controlled release of anticancer drugs Kınetic analysis of glucose-6-phosphate branch point in saccharomyces cerevisiae Effects of hydrogen peroxide bleaching on human dentin and enamel microstructure and function GÜLDEN AVCI Molecular analysis of fungal laccase genes BURÇAK KOCUKLU GÖZDE ÜNSOY Analysis of pro-peptide selfprocessing mechanism of galactose oxidase by site-directed mutagenesis Biochemical characterization of recombinant 20s proteasome from thermoplasma volcanium and cloning of its vat gene FULYA KAYAGİL Effect of traditional starter cultures on quality of cheese TANER TUNCER Transformation of tobacco ( Nicotiana tabaccum) with antimicrobial pflp gene and analysis of transgenic plants SİNAN GÜVEN Integrated biomimetic scaffolds for soft tissue engineering 15

20 SUAT BORA YEŞİLTEPE ARDA BÜYÜKSUNGUR Studies on selective adsorption of aqueous glucose or fructose on various cationic forms of Zeolite Cloning and expression ofbenzaldehydelyase from Pseudomonas fluorescens Biovar I in Pichia pastoris NİHAL ENGİN VRANA Collagen-based scaffolds for cornea tissue engineering ARAZ ZEYNİYEV Cephamycin C production by Streptomyces clavuligerus mutants impaired in regulation of aspartokinase ALBANA NDREU Electrospun nanofibrous scaffolds for tissue engineering DİDEM DEDEOĞLU SÜLEYMAN SARI Purification and characterization of Hexokinase isoenzymes from Rhizopus oryzae Development of helical tubular reactor for hydrogen producing photosynthetic bacteria UMUT DEMİRTAŞ Fungi mediated enantioselective biohydrogenation of benzils to benzoins EMRAH ALTıNDİŞ SELDA TÜRKOĞLU FADİME KARA MURDOCH CEYHUN KAYIHAN ALİYE SEDA YILMAZ ESRA UÇKUN KIRAN FİTNAT BUKET BAŞMANAV İLAY ÇELİK DEMET DEMETÇİ ZEYNEP DUMAN HACI EŞİYOK KUBİLAY YILDIRIM Identification of the new immunogenic proteins of bordetella pertussis by immunoproteomics Screening of tomato seeds for genetic modification and identification of genetically modified ripening delayed tomato seeds Investigation of sodium and potassium ions in relation to bioflocculation of mixed culture microorganisms Effect of cold stress on barley (hordeum vulgare L.) superoxide dismutase isozyme activities and expression levels of cu/znsod gene Compementation studies to identify genes with roles in zinc efficiency in barley Screening for genetically modified tomatoes & tomato seeds and identification of CRY1AC and SAM-K specific modifications using gene and construct specific PCR Sequential growth factor delivery from complexed microspheres for bone tissue engineering Detection of differentially expressed genes upon compatible and incompatible inoculation of wheat with yellow rust using suppression subtractive hybridization (SSH) Preparation and evaluation of polymer based microcarriers for hydrophobic anti-cancer drugs Polymerase chain reaction (pcr) for detection of borrelia burgdorferi sensu lato Enantioselective chemoenzymatic synthesis of oseltamivir (tamiflu)(r) intermediates Inheritance of wood specific gravity and its genetic correlation with growth traits in young pinus brutia progenies UMUT ERKILIÇ Biotechnological modification of steroidal structures OĞUZ BALCI Affinity chromatographic purification of recombinant human growth hormone 16

21 MEHLİKA KARAMANLIOĞLU ORHAN ÖZCAN NİHAN ÖZTÜRK Xylan-based biodegradable and wheat gluten-based antimicrobial film production Medium development for production of bacillus thuringiensis based biopesticides Thermoresponsive smart polymeric cell carriers of pnipan and elp for bone tissue engineering ÖZGE ŞENYURT Development of paper type tyrosinase biosensor İSMAİL ÖĞÜLÜR The effects of twelve quorum-sensing gene products on the expression of bacabcde operon in bacillus subtilis BANU BAYYURT Design of intelligent nanoparticles for use in controlled release CEREN BAYRAÇ GÜLAY DAĞDAŞ YASİN FATİH DAĞDAŞ KRESHNIK BOZHANAJ The development of alkaline phosphatase based paper bioreporter for evaluation of milk pasteurization Functional analysis of a mirna putatively involved in powdery mildew disease susceptibility in barley Investigating the roles of micrornas in biotic stress responses and functional characterization of a novel ztl-type f-box protein via virus induced gene silencing The effect of virus induced gene silencing of fas associated factor1 in blumeria graminis infected barley ERİNÇ BAHÇEGÜL ASUDE ÇALLAK KİRİŞÖZÜ BERNA KANKILIÇ Preparation of biodegradable films from agricultural biomass Molecular characterization of blumeria graminis f. sp. hordei using aflp markers Vancomycin containing plla delivery system for bone tissue biocompatibility and treatment of implant related chronic osteomyelitis NEŞE ÖZGAZİ Proteome analysis of blumeria graminis f. sp. hordei inoculated barley MAHER DERNAIKA GÜLSEREN PETEK ŞEN Molecular characterization of strawberry by applying dna fingerprinting technique using simple sequence repeats (ssrs) markers Poly (Dl-Lactic-Co-Glycolic Acid) microparticles and synthetic peptide drug conjugate for anti-cancer drug delivery DİDEM CORAL Studies on novel immunogenic proteins of Clostridium Chauvoei HANDE SELAMOĞLU high-level expression of hepatitis b surface antigen in pichia pastoris, its purification and immunological characterization AYŞE GİZEM SEBER Preparation of antimicrobial films from agricultural biomass UMUT ÇEKMEZ SAHRA UYGUN SEZİN DAĞDEVİREN Isolation of antimicrobial molecules from agricultural biomass and utilization in xylan-based biodegradable films Development of analysis methods for cry1ac and sam-k gene lines in tomato using pcr and real-time pcr Role of tnf-alpha in skeletal muscle atrophy in ovariectomized rats : an experimental functional, histological and molecular biology study 17

22 PELİN SEVİNÇ HATİCE TAŞPINAR ASENA GÜLŞAH PEKĞÖZ MURAT KAVRUK GÜLİZ VANLI CEREN AKSU ABDULHAMİT BATTAL EDA ÜNAL SENA CANSIZ FATMA GÜL LÜTFİYE YILDIZ BARIŞ BOYLU ÖZGE KARADAŞ ENDAM ÖZKAN Kinetic analyses of the effects of temperature and light intensity on growth, hydrogenm production and organic acid utilization by rhodobacter capsulatus Exponential feeding strategy development for benzaldehyde lyase production by recombinant "Escherichia coli" Deletion mutation of GLNB and GLNK genes in rhodobacter capsulatus to enhance biohydrogen production Development of acetylcholinesterase biosensor for the detection of pesticides Integration of clavaminate synthase 2 gene into the chromosome of an industrial strain of Streptomyces Clavuligerus for enhanced clavulanic acid production The role of calcium ion on activated sludge biochemical and physical properties in phosphorus deficient growth medium Optimization of mature embryo based regeneration and genetic transformation of Turkish wheat cultivars Investigation of magnesium ions effect on sludge properties in phosphorus deficient bioreactors Development of a sandwich-type DNA array platform for the detection of label-free oligonucleotide targets Development of an oligonucleotide based sandwich array platform for the detection of transgenic elements from plant sources using labal-free PCR products Isolation and characterization of Taq DNA polymerase and optimization and validation of newly designed thermal cyclers Genetic screening of Turkish wheat varieties for the durable resistance gene, Lr34 Collagen scaffolds with in situ grown calcium phosphate for osteogenic differentiation of wharton s jelly and menstrual blood stem cells Photofermentative hydrogen production using dark fermentation effluent of sugar beet thick juice by Rhodobacter Capsulatus BİRSEN DEMİRBAĞ UV responsive drug delivery from suprofen incorporated liposomes MÜGE ERKAN Reactivation potential of indicator bacteria in anerobically digested sludges after dewatering processes ESEN SAYIN In-vitro characterization of a novel cdte-cds/2mpa-dmsa quantum dot IŞKIN KÖSE Survival of probiotic microorganisms during storage after marketing GÖKHAN BAHÇECİOĞLU Poly(L-Lactic acid) (PLLA)-based meniscus tissue engineering EMILIA EKENEL GÖZDE KUMAŞ DAMLA ARSLANTUNALI Microarray applications for determination of the effects of emodin on breast cancer cell lines Detecting g-protein coupled receptor interactions using enhanced green fluorescent protein reassembly Multiwalled Carbon Nanotube- Poly(2-Hydroxyethyl Methacrylate) Composite Conduitfor Peripheral Nerve Repair 18

23 BEGÜM PEKSEL Proteome analysis of hydrogen production mechanism of Rhodobacter capsulatus grown on different growth conditions RENGİN ERDEM AG2S/2-MPA quantum dots; cytocompatibility and cellular iinternalization FULYA EKİZ KANIK BAHAR BOZKURT BAYANTES DAGVADORJ İBRAHİM KUTAY ÖZTÜRK ÖZGE ATA AKYOL BURCU GÜNDÜZ Bioactive surface design based on conducting polymers and applications to biosensors Feeding strategy development for human growth hormone production by Pichia pastoris Identification of proteins interacting with tagged-pathogen effector protein in agro-delivered planta Elucidation of the role of GCN2 gene in response to powdery mildew infection Metabological engineering of Pichia Pastoris for extracellular thermostable glucose isomerase production Recombinant transglutaminase production by metabolically engineered Pichia pastoris GÖRKEM BAYSAL Biological hydrogen production by using co-cultures of PNS bacteria DERYA GÖKÇAY FATMA SELİN KÖSE YAĞMUR AKSOY SEÇİL YILMAZ ALİ İNCEMEHMETOĞLU Physiological and biochemical screeing of different Turkish Lentil (Lens culinaris M.) cultivars under drought stress condition Physiological and biochemical screening of different Turkish lentil cultivars under salt stress conditions Bio-functional analysis of RAD23 gene using virus induced gene silencing method in response to powdery mildew attack in Barley Manufacturing and analysis of thermal and chemical properties of potato starch - gelatin biofilms Investigation the effects of different support medium on product with nutrient film technique AYLİN ACUN Construction of a collagen-based, split thickness cornea substitute BAHTİYAR YILMAZ İLKE SÜDER TUĞBA DURSUN EVRİM ELÇİN Optimization of piriformospora indica application and observation of piriformospora indica induced disease resistance against various plant pathogens in wheat and barley Labeling and optimization of organelle markers for co-localization with yeast GPCR dimers Study on the influence of scaffold inner organization on the treatment of spinal cord injury Panomycocin-incorporated chitosan-tpp nanoparticles : preparation, characterization and in vitro determination of antifungal activity against human dermatophytes BERKE BİLGENUR KANDEMİR PEI starch nanoparticles for cancer gene therapy AYŞE ANDAÇ AHMET ÇAĞLAR ÖZKETEN BURCU AKDAĞ Investigation of subcellular localization of a yellow rust pathogen effector candidate Cloning, transformation and wheat infiltration assay of a puccinia striiformis f. sp. tritici effector candidate Investigation of thermostable recombinant glucose isomerase production by sucrose utilizing escherichia coli 19

24 CEREN KAZANCI SENA YAMAN Asymmetric synthesis of beta-hydroxy phoshponates via benzaldehyde lyase catalyzed cross acyloin reactions A Comparative study for the production of recombinant intracellular glucose isomerase by escherichia coli and pichia pastoris ZEYNEP BARÇİN Anti-parkinsonian drug delivery across the blood-brain barrier MUSTAFA ÇİÇEK BORA DURUL EMMANUEL OWUSU KYERE ŞEBNEM GÜLEL ECE BULUT SİBEL ÖZTÜRK Investigation on immunoprotectivity of recombinant vaccine candidates glutamine-binding periplasmic protein and putative peptidoglycan-binding protein in mouse model Molecular Characterization Of Salmonella Isolates From Animals And Various Foods Molecular Evaluation And Antimicrobial Susceptibility Testing Of Escherichia Coli Isolates Collected From Various Food Products In Turkey Probiotic And Molecular Characterization Of Lactobacillus Isolates From Turkish Kefir Subtyping Of Salmonella Isolated From Human And Animal Clinical Cases, As Well As From Different Food Samples Using Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) Semi-Defined Medium Based Feeding Strategy Development For Human Growth Hormone Production By Recombinant Bacillus Subtilis SENEM HEPER Controlled Doxorubicin Delivery From Photoresponsive Liposomes Carrying Vitamin A Derivatives ÖZGE AKTUNA Optimization Of Hypericum Perforatum L Tissue Culture For Hypericin Production ŞEYMA ÜNSAL BEYGE Design And Characterization Of 5-L Autoclavable Batch-Culture Bioreactor BURÇE ÇİFÇİ Synthesis Of Peptide Inhibitors For Matrix Metalloproteinase-2 And Angiotensin Converting Enzyme 20

25 BĠYOTEKNOLOJĠ KAYITLI ÖĞRENCĠLER DOKTORA YÜKSEK LĠSANS BĠLĠMSEL HAZIRLIK AYġE ANDAÇ EZGĠ ANTMEN DAMLA ARSLANTUNALI ÖZGE ATA AKYOL GÖKHAN BAHÇECĠOĞLU OĞUZ BALCI ABDULHAMĠT BATTAL ORKUN CEVHEROĞLU MUSTAFA ÇĠÇEK BAYANTES DAGVADORJ TANER DEHA DURMUġ TUĞBA DURSUN BORA DURUL ĠPEK ZEYNEP DURUSU GÖZDE EKE FULYA EKĠZ KANIK EVRĠM ELÇĠN SAYIT MAHMUT ERDOĞAN ERKAN FEHĠM ERGÜLEN MÜGE ERKAN AYTEN EROĞLU DERYA GÖKÇAY BURCU GÜNDÜZ ERGÜN SENEM HEPER BERNA KANKILIÇ FADĠME KARA MURDOCH MURAT KAVRUK CEMĠLE KILIÇ IġKIN KÖSE ASLAN MASSAHI REZA MOONESI RAD BORA ONAT SEPREN ÖNCÜ ORHAN ÖZCAN AHMET ÇAĞLAR ÖZKETEN SĠBEL ÖZTÜRK MARYAM PARSIAN ELĠF SAKALLI ESEN SAYIN DENĠZ SEZLEV NEGAR TAGHAVI POURIANAZAR TANER TUNCER ABDUVALI VALIEV ADNAN YARAMIġ BAHTĠYAR YILMAZ IQBAL AAMIR ELĠF AġIK GÜLHAN IġIK DĠLAN AKIN EVRĠM AKSU MÜSLÜM KAAN ARICI FERAMUZ ATAK HEVAL ATAġ GÜNCE BAYRAM MAHMUT BEYGE AYġENUR BĠBER YAĞMUR ÇALIġKAN DĠRENĠġ ÇAYLI CANSU DEĞĠRMENCĠ HALĠL ĠBRAHĠM DERTLĠ EFE ERDEġ AYSHIN GHALICHI NĠL GÖL MERVE GÜLDIKEN BURCU GÜLEZ BEDRĠYE BÜġRA GÜNAY ONUR HASTÜRK HASAN HÜSEYIN KAZAN AYLĠN KÖMEZ CEREN KUVVET YANUAR DWI PUTRA LIMASALE ESRA METĠN MUSTAFA NAKĠPOĞLU BURCU ONURLU GĠZEM ÖZBEK SERHAT ÖZDEMIR ENDRI SOLLAKU AYLA ġahġn KÜBRA TOSUN TUĞÇE CEREN TUĞRUL GÖZDE NEZĠHE TUNCER GÖKÇE UYANIK TUĞÇE UYANIK SIDIKA YAĞMUR ÜNAL ÜMMÜGÜLSÜM YURTERI MEHMET SEDAT FEYAT (Ph.D.) MEHMET SEFA ULUTAġ (Ph.D.) ZĠRVE YĠĞĠT (Ph.D.) HANI ALISSA ALAM (M.S.) ZEYNEP BILGIN (M.S.) SELAY FIRTINA (M.S.) BERNA LEYLUHAN YURTSEVEN (M.S.) ONUR TUNA (M.S.) FATMA MELEK UYSAL (M.S.) 21

26 BĠYOTEKNOLOJĠ YAYIN BĠLGĠLERĠ YAYIN GRAFĠKLERĠ Year Documents Year Documents Total

27 YAYINLARIN KONULARA GÖRE DAĞILIMI Subject Area Documents Biochemistry, Genetics and Molecular Biology 162 Chemistry 126 Chemical Engineering 115 Materials Science 102 Engineering 63 Immunology and Microbiology 53 Agricultural and Biological Sciences 51 Environmental Science 38 Medicine 38 Physics and Astronomy 37 Pharmacology, Toxicology and Pharmaceutics 33 Energy 18 Mathematics 7 Dentistry 3 Social Sciences 3 Business, Management and Accounting 2 Earth and Planetary Sciences 2 Neuroscience 1 Veterinary 1 Total

28 BİYOTEKNOLOJİ BÖLÜMÜ YAYIN LİSTESİ Unsoy, G., Khodadust, R., Yalcin, S., Mutlu, P., Gunduz, U. Synthesis of Doxorubicin loaded magnetic chitosan nanoparticles for ph responsive targeted drug delivery (2014) European Journal of Pharmaceutical Sciences, 62, pp Ucan, D., Kanik, F.E., Karatas, Y., Toppare, L. Synthesis and characterization of a novel polyphosphazene and its application to biosensor in combination with a conducting polymer (2014) Sensors and Actuators, B: Chemical, 201, pp Udum, Y.A., Yildiz, H.B., Azak, H., Sahin, E., Talaz, O., Çirpan, A., Toppare, L. Synthesis and spectroelectrochemistry of dithieno(3,2-b:2,3 - d)pyrrole derivatives (2014) Journal of Applied Polymer Science, 131 (17), pp Hippius, C., Bütün, V., Erel-Goktepe, I. Bacterial anti-adhesive properties of a monolayer of zwitterionic block copolymer micelles (2014) Materials Science and Engineering C, 41, pp Yusan, P., Tuncel, I., Bütün, V., Demirel, A.L., Erel-Goktepe, I. PH-responsive layer-by-layer films of zwitterionic block copolymer micelles (2014) Polymer Chemistry, 5 (12), pp Toksabay, S., Hacioglu, S.O., Unlu, N.A., Cirpan, A., Toppare, L. Thieno[3,2-b]thiophene as π-bridge at different acceptor systems for electrochromic applications (2014) Polymer (United Kingdom), 55 (14), pp Akdaǧ, B., Çalik, P. Recombinant protein production by sucrose-utilizing Escherichia coli W: Untreated beet molasses-based feeding strategy development (2014) Journal of Chemical Technology and Biotechnology,. Article in Press. Acun, A., Hasirci, V. Construction of a collagen-based, split-thickness cornea substitute (2014) Journal of Biomaterials Science, Polymer Edition,. Article in Press. Kirdeciler, S.K., Ozen, C., Akata, B. Fabrication of nano- to micron-sized patterns using zeolites: Its application in BSA adsorption (2014) Microporous and Mesoporous Materials, 191, pp Unsoy, G., Yalcin, S., Khodadust, R., Mutlu, P., Onguru, O., Gunduz, U. Chitosan magnetic nanoparticles for ph responsive Bortezomib release in cancer therapy (2014) Biomedicine and Pharmacotherapy,. Article in Press. 24

29 Liu, S., Lorenzen, E.D., Fumagalli, M., Li, B., Harris, K., Xiong, Z., Zhou, L., Korneliussen, T.S., Somel, M., Babbitt, C., Wray, G., Li, J., He, W., Wang, Z., Fu, W., Xiang, X., Morgan, C.C., Doherty, A., O'Connell, M.J., McInerney, J.O., Born, E.W., Dalén, L., Dietz, R., Orlando, L., Sonne, C., Zhang, G., Nielsen, R., Willerslev, E., Wang, J. Population genomics reveal recent speciation and rapid evolutionary adaptation in polar bears (2014) Cell, 157 (4), pp Cited 2 times. Yildiz, H.B., Kamaci, M., Karaman, M., Toppare, L., Sayin, S. Photoelectrochemical biosensing approach for alcohol determination by "wiring" of alcohol oxidase photonically with P(SNS-NH 2)/AOx/CNT/[Ru(bpy) 3]2+ Modified electrodes (2014) Journal of Macromolecular Science, Part A: Pure and Applied Chemistry, 51 (5), pp Aydemir Sezer, U., Arslantunali, D., Aksoy, E.A., Hasirci, V., Hasirci, N. Poly(ε-caprolactone) composite scaffolds loaded with gentamicin-containing β-tricalcium phosphate/gelatin microspheres for bone tissue engineering applications (2014) Journal of Applied Polymer Science, 131 (8), art. no ,. Demirci Uzun, S., Kayaci, F., Uyar, T., Timur, S., Toppare, L. Bioactive surface design based on functional composite electrospun nanofibers for biomolecule immobilization and biosensor applications (2014) ACS Applied Materials and Interfaces, 6 (7), pp Thliveros, P., Uçkun Kiran, E., Webb, C. Microbial biodiesel production by direct methanolysis of oleaginous biomass (2014) Bioresource Technology, 157, pp Kekec, N.C., Kanik, F.E., Udum, Y.A., Hizliates, C.G., Ergun, Y., Toppare, L. A novel conducting polymer based platform for ethanol sensing (2014) Sensors and Actuators, B: Chemical, 193, pp Cited 1 time. Kocabas, A., Ogel, Z.B., Bakir, U. Xylanase and itaconic acid production by Aspergillus terreus NRRL 1960 within a biorefinery concept (2014) Annals of Microbiology, 64 (1), pp Cited 1 time. Hacioglu, S.O., Toksabay, S., Sendur, M., Toppare, L. Synthesis and electrochromic properties of triphenylamine containing copolymers: Effect of π- bridge on electrochemical properties (2014) Journal of Polymer Science, Part A: Polymer Chemistry, 52 (4), pp Cited 4 times. Androga, D.D., Sevinç, P., Koku, H., Yücel, M., Gündüz, U., Eroglu, I. Optimization of temperature and light intensity for improved photofermentative hydrogen production using Rhodobacter capsulatus DSM 1710 (2014) International Journal of Hydrogen Energy, 39 (6), pp Cited 1 time. Soylemez, S., Kanik, F.E., Uzun, S.D., Hacioglu, S.O., Toppare, L. Development of an efficient immobilization matrix based on a conducting polymer and functionalized multiwall carbon nanotubes: Synthesis and its application to ethanol biosensors (2014) Journal of Materials Chemistry B, 2 (5), pp Cited 2 times. Endogan, T., Kiziltay, A., Kose, G.T., Comunoglu, N., Beyzadeoglu, T., Hasirci, N. Acrylic bone cements: Effects of the poly(methyl methacrylate) powder size and chitosan addition on their properties (2014) Journal of Applied Polymer Science, 131 (3), art. no ,. 25

30 Güney, A., Hasirci, N. Properties and phase segregation of crosslinked PCL-based polyurethanes (2014) Journal of Applied Polymer Science, 131 (1), art. no ,. Ak, M., Yildiz, H.B., Toppare, L. Enzyme immobilization in a photosensitive conducting polymer bearing azobenzene in the main chain (2014) Polymer Bulletin, 71 (7), pp Turac, E., Sahmetlioglu, E., Toppare, L. Synthesis and characterization of conducting copolymers of thiophene derivatives (2014) Journal of Macromolecular Science, Part A: Pure and Applied Chemistry, 51 (3), pp Eke, G., Kuzmina, A.M., Goreva, A.V., Shishatskaya, E.I., Hasirci, N., Hasirci, V. In vitro and transdermal penetration of PHBV micro/nanoparticles (2014) Journal of Materials Science: Materials in Medicine, 25 (6), pp Selcan Gungor-Ozkerim, P., Balkan, T., Kose, G.T., Sezai Sarac, A., Kok, F.N. Incorporation of growth factor loaded microspheres into polymeric electrospun nanofibers for tissue engineering applications (2014) Journal of Biomedical Materials Research - Part A, 102 (6), pp Cited 1 time. Aydogan, C., Kiskan, B., Hacioglu, S.O., Toppare, L., Yagci, Y. Electrochemical manipulation of adhesion strength of polybenzoxazines on metal surfaces: From strong adhesion to dismantling (2014) RSC Advances, 4 (52), pp Aydin, G., Yucel, M., Chan, M.-T., Oktem, H.A. Evaluation of abiotic stress tolerance and physiological characteristics of potato (Solanum tuberosum L. cv. Kennebec) that heterologously expresses the rice Osmyb4 gene (2014) Plant Biotechnology Reports, 8 (3), pp Karahan, A., Borsa, P., Gucu, A.C., Kandemir, I., Ozkan, E., Orek, Y.A., Acan, SC., Koban, E., Togan, I. Geometric morphometrics, Fourier analysis of otolith shape, and nuclear-dna markers distinguish two anchovy species (Engraulis spp.) in the Eastern Mediterranean Sea (2014) Fisheries Research, 159, pp Yilmaz, R., Cabi, E., Dogan, M. Molecular analyses of the genera Eremopyrum (Ledeb.) Jaub. & spach and Agropyron gaertner (Poaceae) by PCR methods (2014) Pakistan Journal of Botany, 46 (3), pp Khan, M.K., Pandey, A., Choudhary, S., Hakki, E.E., Akkaya, M.S., Thomas, G. From RFLP to DArT: Molecular tools for wheat (Triticum spp.) diversity analysis (2014) Genetic Resources and Crop Evolution, 61 (5), pp Göker, S., Hizalan, G., Udum, Y.A., Toppare, L. Electrochemical and optical properties of 5,6-bis(octyloxy)-2,1,3 benzooxadiazole containing low band gap polymers (2014) Synthetic Metals, 191, pp Soylemez, S., Ekiz Kanik, F., Ileri, M., Hacioglu, S.O., Toppare, L. Development of a novel biosensor based on a conducting polymer (2014) Talanta, 118, pp Cited 2 times. 26

31 Taghavi Pourianazar, N., Mutlu, P., Gunduz, U. Bioapplications of poly(amidoamine) (PAMAM) dendrimers in nanomedicine (2014) Journal of Nanoparticle Research, 16 (4),. Zaifoglu, B., Hacioglu, S.O., Unlu, N.A., Cirpan, A., Toppare, L. Structure-property relations in donor-acceptor-donor type benzimidazole containing conjugated polymers (2014) Journal of Materials Science, 49 (1), pp Yiǧit, D., Udum, Y.A., Güllü, M., Toppare, L. Electrochemical and optical properties of novel terthienyl based azobenzene, coumarine and fluorescein containing polymers: Multicolored electrochromic polymers (2014) Journal of Electroanalytical Chemistry, 712, pp Bahcecioglu, G., Buyuksungur, A., Kiziltay, A., Hasirci, N., Hasirci, V. Construction and in vitro testing of a multilayered, tissue-engineered meniscus (2014) Journal of Bioactive and Compatible Polymers, 29 (3), pp Eskitoros, M.S., Çalik, P. Co-substrate mannitol feeding strategy design in semi-batch production of recombinant human erythropoietin production by Pichia pastoris (2014) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 89 (5), pp Demirci, S., Koban Baştanlar, E., Daǧtaş, N.D., Pişkin, E., Engin, A., Özer, F., Yüncü, E., Doǧan, Ş.A., Togan, I. Mitochondrial DNA diversity of modern, ancient and wild sheep (Ovis gmelinii anatolica) from Turkey: New insights on the evolutionary history of sheep (2013) PLoS ONE, 8 (12), art. no. e81952,. Gokduman, K., Demir, A.S. Camptothecin anticancer drug loaded iron oxide micro and nanoparticles: Tuning targeted and sustained release of the drug in bioactive form (2013) Current Nanoscience, 9 (6), pp Bahcegul, E., Akinalan, B., Toraman, H.E., Erdemir, D., Ozkan, N., Bakir, U. Extrusion of xylans extracted from corn cobs into biodegradable polymeric materials (2013) Bioresource Technology, 149, pp Cited 1 time. Ramazanoglu, M., Lutz, R., Rusche, P., Trabzon, L., Kose, G.T., Prechtl, C., Schlegel, K.A. Bone response to biomimetic implants delivering BMP-2 and VEGF: An immunohistochemical study (2013) Journal of Cranio-Maxillofacial Surgery, 41 (8), pp Uzun, S.D., Unlu, N.A., Sendur, M., Kanik, F.E., Timur, S., Toppare, L. A novel promising biomolecule immobilization matrix: Synthesis of functional benzimidazole containing conducting polymer and its biosensor applications (2013) Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 112, pp Cited 2 times. Aydemir Sezer, U., Arslantunali, D., Aksoy, E.A., Hasirci, V., Hasirci, N. Poly(ε-caprolactone) composite scaffolds loaded with gentamicin-containing β-tricalcium phosphate/gelatin microspheres for bone tissue engineering applications (2013) Journal of Applied Polymer Science,. Article in Press. 27

32 Eskitoros, M.Ş., Ata, O., Çalik, P. Metabolic reaction network of Pichia pastoris with glycosylation reactions: Flux analysis for erythropoietin production (2013) Journal of Chemical Technology and Biotechnology,. Article in Press. Haykir, N.I., Bakir, U. Ionic liquid pretreatment allows utilization of high substrate loadings in enzymatic hydrolysis of biomass to produce ethanol from cotton stalks (2013) Industrial Crops and Products, 51, pp Soylemez, S., Kanik, F.E., Tarkuc, S., Udum, Y.A., Toppare, L. A sepiolite modified conducting polymer based biosensor (2013) Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 111, pp Cited 2 times. Endogan, T., Ozyaylali, I., Kulacoglu, H., Serbetci, K., Kiyak, G., Hasirci, N. Effects of ethylene oxide resterilization and in-vitro degradation on mechanical properties of partially absorbable composite hernia meshes (2013) Chirurgia (Romania), 108 (6), pp Erdoǧ, A., Putra Limasale, Y.D., Keskin, D., Tezcaner, A., Banerjee, S. In vitro characterization of a liposomal formulation of celecoxib containing 1,2-Distearoyl-sn- Glycero-3-Phosphocholine, Cholesterol, and Polyethylene Glycol and its functional effects against colorectal cancer cell lines (2013) Journal of Pharmaceutical Sciences, 102 (10), pp Kence, M., Oskay, D., Giray, T., Kence, A. Honey bee colonies from different races show variation in defenses against the varroa mite in a 'common garden' (2013) Entomologia Experimentalis et Applicata, 149 (1), pp Namal, I., Ozelcaglayan, A.C., Udum, Y.A., Toppare, L. Synthesis and electrochemical characterization of fluorene and benzimidazole containing novel conjugated polymers: Effect of alkyl chain length on electrochemical properties (2013) European Polymer Journal, 49 (10), pp Uçkun Kiran, E., Akpinar, O., Bakir, U. Improvement of enzymatic xylooligosaccharides production by the co-utilization of xylans from different origins (2013) Food and Bioproducts Processing, 91 (4), pp Cited 1 time. Akpinar, H.Z., Udum, Y.A., Toppare, L. Spray-processable thiazolothiazole-based copolymers with altered donor groups and their electrochromic properties (2013) Journal of Polymer Science, Part A: Polymer Chemistry, 51 (18), pp Cited 5 times. Çalik, P., Bozkurt, B., Zerze, G.H., Inankur, B., Bayraktar, E., Boy, E., Orman, M.A., Açik, E., Özdamar, T.H. Effect of co-substrate sorbitol different feeding strategies on human growth hormone production by recombinant Pichia pastoris (2013) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 88 (9), pp Cited 1 time. 28

33 Yilgor, P., Yilmaz, G., Onal, M.B., Solmaz, I., Gundogdu, S., Keskil, S., Sousa, R.A., Reis, R.L., Hasirci, N., Hasirci, V. An in vivo study on the effect of scaffold geometry and growth factor release on the healing of bone defects (2013) Journal of Tissue Engineering and Regenerative Medicine, 7 (9), pp Cited 4 times. Ileri, M., Hacioglu, S.O., Toppare, L. The effect of para- and meta-substituted fluorine on optical behaviorof benzimidazole derivatives (2013) Electrochimica Acta, 109, pp Cited 1 time. Kavas, M., Baloǧlu, M.C., Akça, O., Köse, F.S., Gökçay, D. Effect of drought stress on oxidative damage and antioxidant enzyme activity in melon seedlings (2013) Turkish Journal of Biology, 37 (4), pp Cited 1 time. Kesik, M., Kanik, F.E., Hizalan, G., Kozanoglu, D., Esenturk, E.N., Timur, S., Toppare, L. A functional immobilization matrix based on a conducting polymer and functionalized gold nanoparticles: Synthesis and its application as an amperometric glucose biosensor (2013) Polymer (United Kingdom), 54 (17), pp Cited 6 times. Kesik, M., Kocer, O., Kanik, F.E., Unlu, N.A., Rende, E., Aslan-Gurel, E., Rossi, R.M., Udum, Y.A., Toppare, L. Effective and functional surface design for biosensing applications based on a novel conducting polymer and PMMA/Clay nanocomposite (2013) Electroanalysis, 25 (8), pp Cited 2 times. Yüncü, E., Demirci, S., Koban Baştanlar, E., Doǧan, T.A., Taşdemir, U., Togan, T. Comparative study of three simple molecular approaches in search of mtdna haplogroup identification of domestic sheep (2013) Small Ruminant Research, 114 (1), pp Cited 1 time. Kanik, F.E., Kolb, M., Timur, S., Bahadir, M., Toppare, L. An amperometric acetylcholine biosensor based on a conducting polymer (2013) International Journal of Biological Macromolecules, 59, pp Cited 3 times. Khodadust, R., Mutlu, P., Yalcin, S., Unsoy, G., Gunduz, U. Polyinosinic:polycytidylic acid loading onto different generations of PAMAM dendrimer-coated magnetic nanoparticles (2013) Journal of Nanoparticle Research, 15 (8), art. no. 1860,. Baloglu, M.C., Battal, A., Aydin, G., Eroglu, A., Oz, M.T., Kavas, M., Oktem, H.A., Yucel, M. Vector construction strategies for transformation of wheat plant (2013) Journal of Animal and Plant Sciences, 23 (3), pp Karakus, M., Nurioglu, A.G., Akpinar, H.Z., Toppare, L., Cirpan, A. Synthesis and electrochromic properties of trans-stilbene bearing copolymers obtained with different repeat unit and chain length (2013) Electrochimica Acta, 100, pp Cited 2 times. Corakci, B., Hacioglu, S.O., Toppare, L., Bulut, U. Long wavelength photosensitizers in photoinitiated cationic polymerization: The effect of quinoxaline derivatives on photopolymerization (2013) Polymer (United Kingdom), 54 (13), pp Cited 8 times. 29

34 Rouhollah, K., Pelin, M., Serap, Y., Gozde, U., Ufuk, G. Doxorubicin loading, release, and stability of polyamidoamine dendrimer-coated magnetic nanoparticles (2013) Journal of Pharmaceutical Sciences, 102 (6), pp Cited 3 times. Cicek, M., Mutlu, O., Erdemir, A., Ozkan, E., Saricay, Y., Turgut-Balik, D. Single mutation in Shine-Dalgarno-like sequence present in the amino terminal of lactate dehydrogenase of plasmodium effects the production of an eukaryotic protein expressed in a prokaryotic system (2013) Molecular Biotechnology, 54 (2), pp Yildiz, G., Arslan-Ergul, A., Bagislar, S., Konu, O., Yuzugullu, H., Gursoy-Yuzugullu, O., Ozturk, N., Ozen, C., Ozdag, H., Erdal, E., Karademir, S., Sagol, O., Mizrak, D., Bozkaya, H., Ilk, H.G., Ilk, O., Bilen, B., Cetin-Atalay, R., Akar, N., Ozturk, M. Genome-Wide Transcriptional Reorganization Associated with Senescence-to-Immortality Switch during Human Hepatocellular Carcinogenesis (2013) PLoS ONE, 8 (5), art. no. e64016,. Cited 1 time. Keshtov, M.L., Udum, Y.A., Toppare, L., Kochurov, V.S., Khokhlov, A.R. Synthesis of aromatic poly(pyridinium salt)s and their electrochromic properties (2013) Materials Chemistry and Physics, 139 (2-3), pp Cited 1 time. Cevher, S.C., Unlu, N.A., Ozelcaglayan, A.C., Apaydin, D.H., Udum, Y.A., Toppare, L., Cirpan, A. Fused structures in the polymer backbone to investigate the photovoltaic and electrochromic properties of donor-acceptor-type conjugated polymers (2013) Journal of Polymer Science, Part A: Polymer Chemistry, 51 (9), pp Cited 4 times. Angardi, V., Çalik, P. Beet molasses based exponential feeding strategy for thermostable glucose isomerase production by recombinant Escherichia coli BL21 (DE3) (2013) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 88 (5), pp Cited 2 times. Hakki, S.S., Korkusuz, P., Purali, N., Korkusuz, F., Bozkurt, B.S., Hakki, E.E., Onder, M.E., Gorur, I., Nohutcu, R.M., Timucin, M., Ozturk, A. Periodontal ligament cell behavior on different titanium surfaces (2013) Acta Odontologica Scandinavica, 71 (3-4), pp Deniz, T.K., Nurioglu, A.G., Unlu, N.A., Sendur, M., Toppare, L., Cirpan, A. Syntheses, electrochemical and photophysical properties of biphenyl containing conjugated copolymers (2013) Polymer (United Kingdom), 54 (9), pp Cited 1 time. Soylemez, S., Kanik, F.E., Nurioglu, A.G., Akpinar, H., Toppare, L. A novel conducting copolymer: Investigation of its matrix properties for cholesterol biosensor applications (2013) Sensors and Actuators, B: Chemical, 182, pp Cited 6 times. Ozgen, O., Aksoy, E.A., Hasirci, V., Hasirci, N. Surface characterization and radical decay studies of oxygen plasma-treated PMMA films (2013) Surface and Interface Analysis, 45 (4), pp Cited 1 time. Ak, M., Cetişli, H., Toppare, L. Blend or copolymer? Spectroelectrochemical evidence of copolymerization and blending of two electrochromic monomers (2013) Colloid and Polymer Science, 291 (4), pp

35 Özgür, E., Peksel, B. Biohydrogen production from barley straw hydrolysate through sequential dark and photofermentation (2013) Journal of Cleaner Production, 52, pp Nurioglu, A.G., Akpinar, H., Kanik, F.E., Toffoli, D., Toppare, L. Further investigation of intramolecular H-bonding in benzimidazole and EDOT containing monomer (2013) Journal of Electroanalytical Chemistry, 693, pp Khodadust, R., Unsoy, G., Yalcin, S., Gunduz, G., Gunduz, U. PAMAM dendrimer-coated iron oxide nanoparticles: Synthesis and characterization of different generations (2013) Journal of Nanoparticle Research, 15 (3), art. no. 1488,. Cited 3 times. Ertan, A.B., Yilgor, P., Bayyurt, B., Çalikoǧlu, A.C., Kaspar, Ç., Kök, F.N., Kose, G.T., Hasirci, V. Effect of double growth factor release on cartilage tissue engineering (2013) Journal of Tissue Engineering and Regenerative Medicine, 7 (2), pp Cited 3 times. Uçkun Kiran, E., Trzcinski, A., Webb, C. Microbial oil produced from biodiesel by-products could enhance overall production (2013) Bioresource Technology, 129, pp Cited 4 times. Koclar Avci, G., Coruh, N., Bolukbasi, U., Ogel, Z.B. Oxidation of phenolic compounds by the bifunctional catalase-phenol oxidase (CATPO) from Scytalidium thermophilum (2013) Applied Microbiology and Biotechnology, 97 (2), pp Cited 1 time. Bilgic, H., Demiriz, M., Ozler, M., Ide, T., Dogan, N., Gumus, S., Kiziltay, A., Endogan, T., Hasirci, V., Hasirci, N. Gelatin based scaffolds and effect of EGF dose on wound healing (2013) Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, 3 (2), pp Yildiz, D.E., Apaydin, D.H., Toppare, L., Cirpan, A. Dielectric and electrical properties of an organic device containing benzotriazole and fluorene bearing copolymer (2013) Journal of Applied Polymer Science, 128 (3), pp Cited 4 times. Yilgor Huri, P., Huri, G., Yasar, U., Ucar, Y., Dikmen, N., Hasirci, N., Hasirci, V. A biomimetic growth factor delivery strategy for enhanced regeneration of iliac crest defects (2013) Biomedical Materials (Bristol), 8 (4), art. no ,. Halili, A.N., Hasirci, N., Hasirci, V. A mechanically functional collagen-based construct designed as a meniscus substitute (2013) Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, 3 (2), pp Cited 2 times. Erkan, M., Sanin, F.D. Can sludge dewatering reactivate microorganisms in mesophilically digested anaerobic sludge? Case of belt filter versus centrifuge (2013) Water Research, 47 (1), pp Cited 1 time. 31

36 Haykir, N.I., Bahcegul, E., Bicak, N., Bakir, U. Pretreatment of cotton stalk with ionic liquids including 2-hydroxy ethyl ammonium formate to enhance biomass digestibility (2013) Industrial Crops and Products, 41 (1), pp Cited 8 times. Al Layla, A.M.T., Türkarslan, O., Kurbanoglu, S., Sulaiman, S.T., Al-Flayeh, K.A., Toppare, L. A new amperometric biosensor for diamine: Use of a conducting polymer layer (2013) Journal of Macromolecular Science, Part A: Pure and Applied Chemistry, 50 (9), pp Zaifoglu, B., Sendur, M., Unlu, N.A., Toppare, L. High optical transparency in all redox states: Synthesis and characterization of benzimidazole and thieno[3,2-b]thiophene containing conjugated polymers (2012) Electrochimica Acta, 85, pp Cited 3 times. Aksoy, E.A., Hasirci, N. Detailed characterization of structure-property relationship of polyurethanes synthesized as biomaterials (2012) Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, 2 (4), pp Cited 1 time. Gunel, A., Asbahi, A., Ozgazi, N., Akkaya, M.S. Identification of differentially expressed proteins in wheat after benzothiadiazole treatment (2012) Journal of Plant Diseases and Protection, 119 (5-6), pp Isik, Z., Ersahin, T., Atalay, V., Aykanat, C., Cetin-Atalay, R. A signal transduction score flow algorithm for cyclic cellular pathway analysis, which combines transcriptome and ChIP-seq data (2012) Molecular BioSystems, 8 (12), pp Aksoy, C., Severcan, F. Characterization of stem cells by vibrational spectroscopy (2012) Advances in Biomedical Spectroscopy, 6, pp Kanik, F.E., Rende, E., Timur, S., Toppare, L. A novel functional conducting polymer: Synthesis and application to biomolecule immobilization (2012) Journal of Materials Chemistry, 22 (42), pp Cited 7 times. Turac, E., Sahmetlioglu, E., Demircan, A., Toppare, L. Synthesis and characterization of conducting copolymer of Trans-1-(4-methyl-3'-thienyl)-2- (ferrocenyl)ethene with EDOT (2012) Journal of Applied Polymer Science, 126 (3), pp Cited 6 times. Unsoy, G., Yalcin, S., Khodadust, R., Gunduz, G., Gunduz, U. Synthesis optimization and characterization of chitosancoated iron oxide nanoparticles produced for biomedical applications (2012) Journal of Nanoparticle Research, 14 (11), art. no. 964,. Cited 13 times. Mutlu, P., Ural, A.U., Gündüz, U. Differential oncogene-related gene expressions in myeloma cells resistant to prednisone and vincristine (2012) Biomedicine and Pharmacotherapy, 66 (7), pp Cited 1 time. 32

37 Aksoy, C., Severcan, F. Role of vibrational spectroscopy in stem cell research (2012) Spectroscopy (New York), 27 (3), pp Cited 1 time. Demirci, S., Emre, F.B., Ekiz, F., Oguzkaya, F., Timur, S., Tanyeli, C., Toppare, L. Functionalization of poly-sns-anchored carboxylic acid with Lys and PAMAM: Surface modifications for biomolecule immobilization/stabilization and bio-sensing applications (2012) Analyst, 137 (18), pp Cited 7 times. Cansiz, S., Özen, C., Bayraç, C., Bayraç, AT., Gül, F., Kavruk, M., Öktem, HA., Yilmaz, R., Eyidogan, F. A sandwich-type DNA array platform for detection of GM targets in multiplex assay (2012) European Food Research and Technology, 235 (3), pp Cited 1 time. Endogan, T., Kiziltay, A., Hasirci, V., Hasirci, N. Modification of acrylic bone cements with oxygen plasma and additives (2012) Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, 2 (3), pp Cited 2 times. Çelik, E., Çalik, P. Production of recombinant proteins by yeast cells (2012) Biotechnology Advances, 30 (5), pp Cited 26 times. Akpinar, H., Nurioglu, A.G., Toppare, L. Influence of hydrogen bonding on electrochromic properties of conducting polymers (2012) Journal of Electroanalytical Chemistry, 683, pp Cited 3 times. Hasirci, V., Pepe-Mooney, B.J. Understanding the cell behavior on nano-/micro-patterned surfaces (2012) Nanomedicine, 7 (9), pp Cited 5 times. Nurioglu, A.G., Akpinar, H., Sendur, M., Toppare, L. Multichromic benzimidazole-containing polymers: Comparison of donor and acceptor unit effects (2012) Journal of Polymer Science, Part A: Polymer Chemistry, 50 (17), pp Cited 10 times. Başkurt, E., Ekiz, F., Demirkol, D.O., Timur, S., Toppare, L. A conducting polymer with benzothiadiazole unit: Cell based biosensing applications and adhesion properties (2012) Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 97, pp Cited 1 time. Hocaoglu, I., Çizmeciyan, M.N., Erdem, R., Ozen, C., Kurt, A., Sennaroglu, A., Acar, H.Y. Development of highly luminescent and cytocompatible near-ir-emitting aqueous Ag 2S quantum dots (2012) Journal of Materials Chemistry, 22 (29), pp Cited 11 times. Hakki, S.S., Bozkurt, S.B., Hakki, E.E., Korkusuz, P., Purali, N., Koç, N., Timucin, M., Ozturk, A., Korkusuz, F. Osteogenic differentiation of MC3T3-E1 cells on different titanium surfaces (2012) Biomedical Materials, 7 (4), art. no ,. 33

38 Aksoy, C., Guliyev, A., Kilic, E., Uckan, D., Severcan, F. Bone marrow mesenchymal stem cells in patients with beta thalassemia major: Molecular analysis with attenuated total reflection-fourier transform infrared spectroscopy study as a novel method (2012) Stem Cells and Development, 21 (11), pp Cited 3 times. Bahcegul, E., Apaydin, S., Haykir, N.I., Tatli, E., Bakir, U. Different ionic liquids favor different lignocellulosic biomass particle sizes during pretreatment to function efficiently (2012) Green Chemistry, 14 (7), pp Cited 7 times. Oktem, H.A., Senyurt, O., Eyidogan, F.I., Bayrac, C., Yilmaz, R. Development of a laccase based paper biosensor for the detection of phenolic compounds (2012) Journal of Food, Agriculture and Environment, 10 (2), pp Cited 1 time. Nur, Y., Duygulu, Ş., Pitcher, M.W., Toppare, L. The electrochemical synthesis of poly(methylcarbyne) for diamond film coatings (2012) Journal of Applied Polymer Science, 124 (5), pp Kiziltay, A., Fernandez, A.M., Roman, J.S., Hasirci, V., Hasirci, N. Lysine based poly(ester-urethane) films for tissue engineering applications (2012) Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, 2 (2), pp Cited 1 time. Uçkun Kiran, E., Salakkam, A., Trzcinski, A.P., Bakir, U., Webb, C. Enhancing the value of nitrogen from rapeseed meal for microbial oil production (2012) Enzyme and Microbial Technology, 50 (6-7), pp Cited 5 times. Bulut, U., Yilmaz, S., Yigitsoy, B., Toppare, L. Long wavelength photosensitizers for diaryliodonium salts based on the 2-benzyl-2 H -benzo[ d ][1,2,3]triazole Skeleton (2012) Journal of Macromolecular Science, Part A: Pure and Applied Chemistry, 49 (5), pp Ozelcaglayan, A.C., Sendur, M., Akbasoglu, N., Apaydin, D.H., Cirpan, A., Toppare, L. Synthesis and electrochemical properties of a new benzimidazole derivative as the acceptor unit in donor-acceptor-donor type polymers (2012) Electrochimica Acta, 67, pp Cited 13 times. Kalkan, N.A., Aksoy, S., Aksoy, E.A., Hasirci, N. Adsorption of reactive yellow 145 onto chitosan coated magnetite nanoparticles (2012) Journal of Applied Polymer Science, 124 (1), pp Cited 5 times. Mutlu, P., Ural, A.U., Gündüz, U. Differential gene expression analysis related to extracellular matrix components in drugresistant RPMI-8226 cell line (2012) Biomedicine and Pharmacotherapy, 66 (3), pp Cited 3 times. Kaya, E., Apaydn, D.H., Yldz, D.E., Toppare, L., Cirpan, A. Solution processable benzotriazole and fluorene containing copolymers for photovoltaic applications (2012) Solar Energy Materials and Solar Cells, 99, pp Cited 12 times. 34

39 Ozdemir, S., Sendur, M., Oktem, G., Doǧan, O., Toppare, L. A promising combination of benzotriazole and quinoxaline units: A new acceptor moiety toward synthesis of multipurpose donor-acceptor type polymers (2012) Journal of Materials Chemistry, 22 (11), pp Cited 14 times. Karakus, M., Apaydn, D.H., Yldz, D.E., Toppare, L., Cirpan, A. Benzotriazole and benzothiadiazole containing conjugated copolymers for organic solar cell applications (2012) Polymer, 53 (6), pp Cited 14 times. Tanriverdi, S., Tuncagil, S., Toppare, L. A new amperometric alcohol oxidase biosensor based on conducting polymer of (4,7-dithien-2- yl-2, 1,3-benzothiadiazole) (2012) Journal of Macromolecular Science, Part A: Pure and Applied Chemistry, 49 (3), pp Cited 1 time. Ashammakhi, N., Ndreu, A., Yang, Y., Ylikauppila, H., Nikkola, L. Nanofiber-based scaffolds for tissue engineering (2012) European Journal of Plastic Surgery, 35 (2), pp Cited 8 times. Karakus, M., Balan, A., Baran, D., Toppare, L., Cirpan, A. Electrochemical and optical properties of solution processable benzotriazole and benzothiadiazole containing copolymers (2012) Synthetic Metals, 162 (1-2), pp Cited 5 times. Bulut, U., Kolay, M., Tarkuc, S., Udum, Y.A., Toppare, L. Quinoxaline derivatives as long wavelength photosensitizers in photoinitiated cationic polymerization of diaryliodonium salts (2012) Progress in Organic Coatings, 73 (2-3), pp Cited 3 times. Tarkuc, S., Udum, Y.A., Toppare, L. Tailoring the optoelectronic properties of donor-acceptor-donor type π-conjugated polymers via incorporating different electron-acceptor moieties (2012) Thin Solid Films, 520 (7), pp Cited 4 times. Yilmaz, R., Akça, O., Baloǧlu, M.C., Öz, M.T., Öktem, H.A., Yücel, M. Optimization of yeast (Saccharomyces cerevisiae) RNA isolation method for real-time quantitative PCR and microarray analysis (2012) African Journal of Biotechnology, 11 (5), pp Cited 1 time. Apaydin, D.H., Akpinar, H., Sendur, M., Toppare, L. Electrochromism in multichromic conjugated polymers: Thiophene and azobenzene derivatives on the main chain (2012) Journal of Electroanalytical Chemistry, 665, pp Cited 3 times. Kalkan, N.A., Aksoy, S., Aksoy, E.A., Hasirci, N. Preparation of chitosan-coated magnetite nanoparticles and application for immobilization of laccase (2012) Journal of Applied Polymer Science, 123 (2), pp Cited 23 times. Guven, B., Boyaci, I.H., Tamer, U., Çalik, P. A rapid method for detection of genetically modified organisms based on magnetic separation and surface-enhanced Raman scattering (2012) Analyst, 137 (1), pp Cited 8 times. 35

40 Bahcegul, E., Toraman, H.E., Ozkan, N., Bakir, U. Evaluation of alkaline pretreatment temperature on a multi-product basis for the co-production of glucose and hemicellulose based films from lignocellulosic biomass (2012) Bioresource Technology, 103 (1), pp Cited 12 times. Tunca, R.I., Kence, M. Genetic diversity of honey bee (Apis mellifera L.: Hymenoptera: Apidae) populations in Turkey revealed by RAPD markers (2011) African Journal of Agricultural Research, 6 (29), pp Esmer, E.N., Tarkuc, S., Udum, Y.A., Toppare, L. Near infrared electrochromic polymers based on phenazine moieties (2011) Materials Chemistry and Physics, 131 (1-2), pp Cited 7 times. Androga, D.D., Özgür, E., Eroglu, I., Gündüz, U., Yücel, M. Significance of carbon to nitrogen ratio on the long-term stability of continuous photofermentative hydrogen production (2011) International Journal of Hydrogen Energy, 36 (24), pp Cited 9 times. Aydar, S., Elif Böyükbayram, A., Şendur, M., Toppare, L. Immobilization of invertase in DAD type polymers: Combination of benzothiadiazole acceptor unit and 3,4-ethylenedioxythiophene and thiophene donor units (2011) Journal of Macromolecular Science, Part A: Pure and Applied Chemistry, 48 (11), pp Cited 3 times. Kaya, I., Kirişözü, A.C., Ersoy, F.Y., Dere, S., Akkaya, M.S. Genetic diversity and relationship analysis among accessions of Aegilops ssp. in Turkey using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers (2011) African Journal of Biotechnology, 10 (72), pp Emre, F.B., Ekiz, F., Balan, A., Emre, S., Timur, S., Toppare, L. Conducting polymers with benzothiadiazole and benzoselenadiazole units for biosensor applications (2011) Sensors and Actuators, B: Chemical, 158 (1), pp Cited 14 times. Yüzügüllü, Y., Ögel, Z.B., Bölükbaşi, U.B., Çoruh, N., Karakaş, G. Production of a novel bifunctional catalase-phenol oxidase of scytalidium thermophilum in the presence of phenolic compounds [Scytalidium thermohilum'un özgün çift aktiviteli katalazfenol oksidazi{dotless}ni{dotless}n fenolik maddeler varli{dotless}ǧi{dotless}nda üretimi] (2011) Turkish Journal of Biology, 35 (6), pp Kankilic, B., Bayramli, E., Kilic, E., Daǧdeviren, S., Korkusuz, F. Vancomycin containing PLLA/β-TCP controls MRSA in vitro (2011) Clinical Orthopaedics and Related Research, 469 (11), pp Cited 3 times. Unver, E.K., Tarkuc, S., Udum, Y.A., Tanyeli, C., Toppare, L. The effect of the donor unit on the optical properties of polymers (2011) Organic Electronics: physics, materials, applications, 12 (10), pp Cited 6 times. Pekgöz, G., Gündüz, U., Erolu, I., Yücel, M., Kovács, K., Rákhely, G. Effect of inactivation of genes involved in ammonium regulation on the biohydrogen production of Rhodobacter capsulatus (2011) International Journal of Hydrogen Energy, 36 (21), pp Cited 5 times. 36

41 Bahcegul, E., Tatli, E., Haykir, N.I., Apaydin, S., Bakir, U. Selecting the right blood glucose monitor for the determination of glucose during the enzymatic hydrolysis of corncob pretreated with different methods (2011) Bioresource Technology, 102 (20), pp Cited 7 times. Sendur, M., Balan, A., Baran, D., Toppare, L. Syntheses and optoelectronic properties of quinoxaline polymers: The effect of donor unit (2011) Journal of Polymer Science, Part A: Polymer Chemistry, 49 (18), pp Cited 1 time. Ekiz, F., Ouzkaya, F., Akin, M., Timur, S., Tanyeli, C., Toppare, L. Synthesis and application of poly-sns-anchored carboxylic acid: A novel functional matrix for biomolecule conjugation (2011) Journal of Materials Chemistry, 21 (33), pp Cited 11 times. Akturk, O., Tezcaner, A., Bilgili, H., Deveci, M.S., Gecit, M.R., Keskin, D. Evaluation of sericin/collagen membranes as prospective wound dressing biomaterial (2011) Journal of Bioscience and Bioengineering, 112 (3), pp Cited 10 times. Kenar, H., Kose, G.T., Toner, M., Kaplan, D.L., Hasirci, V. A 3D aligned microfibrous myocardial tissue construct cultured under transient perfusion (2011) Biomaterials, 32 (23), pp Cited 22 times. Bulut, U., Kolay, M., Tarkuc, S., Toppare, L. Dibenzophenazine derivatives as visible photosensitizers for diaryliodonium salts (2011) Journal of Polymer Science, Part A: Polymer Chemistry, 49 (15), pp Cited 4 times. Tuncagil, S., Ozdemir, C., Demirkol, D.O., Timur, S., Toppare, L. Gold nanoparticle modified conducting polymer of 4-(2,5-di(thiophen-2-yl)- 1H-pyrrole-1-l) benzenamine for potential use as a biosensing material (2011) Food Chemistry, 127 (3), pp Cited 13 times. Ilk, O., Rajabli, F., Dungul, D.C., Ozdag, H., Ilk, H.G. A novel approach for small sample size family-based association studies: Sequential tests (2011) European Journal of Human Genetics, 19 (8), pp Cited 2 times. Raposo, F., Fernández-Cegrí, V., de la Rubia, M.A., Borja, R., Béline, F., Cavinato, C., Demirer, G., Fernández, B., Fernández-Polanco, M., Frigon, J.C., Ganesh, R., Kaparaju, P., Koubova, J., Méndez, R., Menin, G., Peene, A., Scherer, P., Torrijos, M., Uellendahl, H., Wierinck, I., de Wilde, V. Biochemical methane potential (BMP) of solid organic substrates: Evaluation of anaerobic biodegradability using data from an international interlaboratory study (2011) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 86 (8), pp Cited 30 times. Tural, B., Betül Sopac, Š., Özkan, N., Demir, A.S., Volkan, M. Preparation and characterization of surface modified γ-fe 2O 3 (maghemite)silica nanocomposites used for the purification of benzaldehyde lyase (2011) Journal of Physics and Chemistry of Solids, 72 (8), pp Cited 3 times. Kocabas, A., Suday Kocabas, D., Bakir Bolukbasi, U. One-step purification and characterization of a low molecular weight xylanase from Aspergillus terreus NRRL 1960 (2011) Journal of Applied Biological Sciences, 5 (2), pp Cited 1 time. 37

42 Köroǧlu, T.E., Öǧülür, I., Mutlu, S., Yazgan-Karataş, A., Özcengiz, G. Global regulatory systems operating in bacilysin biosynthesis in Bacillus subtilis (2011) Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology, 20 (3), pp Cited 3 times. Ozdemir, C., Tuncagil, S., Demirkol, D.O., Timur, S., Toppare, L. Design of carbon nanotube modified conducting polymer for biosensing applications (2011) Journal of Macromolecular Science, Part A: Pure and Applied Chemistry, 48 (7), pp Cited 4 times. Soyaslan, E.T., Çalik, P. Enhanced recombinant human erythropoietin production by Pichia pastoris in methanol fedbatch/sorbitol batch fermentation through ph optimization (2011) Biochemical Engineering Journal, 55 (1), pp Cited 7 times. Unver, E.K., Tarkuc, S., Baran, D., Tanyeli, C., Toppare, L. Synthesis of new donor-acceptor polymers containing thiadiazoloquinoxaline and pyrazinoquinoxaline moieties: Low-band gap, high optical contrast, and almost black colored materials (2011) Tetrahedron Letters, 52 (21), pp Cited 8 times. Balan, A., Baran, D., Toppare, L. Benzotriazole containing conjugated polymers for multipurpose organic electronic applications (2011) Polymer Chemistry, 2 (5), pp Cited 43 times. Nielsen, R., Kingshott, P., Uyar, T., Hacaloglu, J., Larsen, K.L. Characterization of β-cyclodextrin modified SiO2 (2011) Surface and Interface Analysis, 43 (5), pp Cited 3 times. Baran, D., Oktem, G., Celebi, S., Toppare, L. Neutral-state green conjugated polymers from pyrrole bis-substituted benzothiadiazole and benzoselenadiazole for electrochromic devices (2011) Macromolecular Chemistry and Physics, 212 (8), pp Cited 6 times. Öktem, G., Balan, A., Baran, D., Toppare, L. Donor-acceptor type random copolymers for full visible light absorption (2011) Chemical Communications, 47 (13), pp Cited 25 times. Gurkok, S., Cekmecelioglu, D., Ogel, Z.B. Optimization of culture conditions for Aspergillus sojae expressing an Aspergillus fumigatus α-galactosidase (2011) Bioresource Technology, 102 (7), pp Cited 1 time. Bayrac, A.T., Sefah, K., Parekh, P., Bayrac, C., Gulbakan, B., Oktem, H.A., Tan, W. In vitro selection of DNA aptamers to glioblastoma multiforme (2011) ACS Chemical Neuroscience, 2 (3), pp Cited 23 times. Çalik, P., Şahin, M., Taşpinar, H., Soyaslan, E.Ş.., Inankur, B. Dynamic flux balance analysis for pharmaceutical protein production by Pichia pastoris: Human growth hormone (2011) Enzyme and Microbial Technology, 48 (3), pp Cited 2 times. 38

43 Hizalan, G., Balan, A., Baran, D., Toppare, L. Spray processable ambipolar benzotriazole bearing electrochromic polymers with multicolored and transmissive states (2011) Journal of Materials Chemistry, 21 (6), pp Cited 14 times. Dagdeviren, S., Kandilci, H.B., Uysal, B., Zeybek, N.D., Korkusuz, P., Gümüsel, B., Korkusuz, F. Tumor necrosis factor-alpha antagonist administration recovers skeletal muscle dysfunction in ovariectomized rats (2011) Journal of Orthopaedic Research, 29 (2), pp Özdemir, S., Balan, A., Baran, D., Doan, O., Toppare, L. Green to highly transmissive switching multicolored electrochromes: Ferrocene pendant group effect on electrochromic properties (2011) Reactive and Functional Polymers, 71 (2), pp Cited 8 times. Yigitsoy, B., Abdul Karim, S.M., Balan, A., Baran, D., Toppare, L. Multichromic polymers of benzotriazole derivatives: Effect of benzyl substitution (2011) Electrochimica Acta, 56 (5), pp Cited 8 times. Kaya, E., Balan, A., Baran, D., Cirpan, A., Toppare, L. Electrochromic and optical studies of solution processable benzotriazole and fluorene containing copolymers (2011) Organic Electronics: physics, materials, applications, 12 (1), pp Cited 17 times. Gürakan, G.C., Aydin, G., Yilmaz, R. Qualitative detection of GM maize (Bt11) in food and feed sold commercially in Turkey by PCR based methods (2011) Indian Journal of Biotechnology, 10 (1), pp Cited 4 times. Ekiz, F., Yuksel, M., Balan, A., Timur, S., Toppare, L. Electrochemical Polymerization of (2-Dodecyl-4, 7-di (thiophen-2-yl)-2h-benzo[d][1,2,3] triazole): A Novel Matrix for Biomolecule Immobilization (2010) Macromolecular Bioscience, 10 (12), pp Cited 10 times. Akpinar, H., Balan, A., Baran, D., Ünver, E.K., Toppare, L. Donor-acceptor-donor type conjugated polymers for electrochromic applications: Benzimidazole as the acceptor unit (2010) Polymer, 51 (26), pp Cited 24 times. Heybeli, T., Kulacoglu,H., Genc,V., Ergul, Z., Ensari, C., Kiziltay,A., Yilmazer, D., Serbetci,K., Hasirci, N. Basic fibroblast growth factor loaded polypropylene meshes in repair of abdominal wall defects in rats (2010) Chirurgia (Romania), 107 (6), pp Ivanova, E.N., Petrov, P., Bouga, M., Emmanouel, N.G., Tunca, R.I., Kence, M. Genetic variation in honey bee (Apis mellifera L.) populations from Bulgaria [Zmienność Genetyczna w populacjach pszcoły miodnj(apis mellifera L.)w Bułagartoii] (2010) Journal of Apicultural Science, 54 (2), pp Cited 4 times. Akbaşoǧlu, N., Balan, A., Baran, D., Cirpan, A., Toppare, L. Electrochemical and optical studies of furan and thieno[3,2-b]thiophene end capped benzotriazole derivatives (2010) Journal of Polymer Science, Part A: Polymer Chemistry, 48 (23), pp Cited 20 times. 39

44 Sendur, M., Balan, A., Baran, D., Karabay, B., Toppare, L. Combination of donor characters in a donor-acceptor-donor (DAD) type polymer containing benzothiadiazole as the acceptor unit (2010) Organic Electronics: physics, materials, applications, 11 (12), pp Cited 19 times. Yigitsoy, B., Karim, S.M.A., Balan, A., Baran, D., Toppare, L. Benzyl substituted benzotriazole containing conjugated polymers: Effect of position of the substituent on electrochromic properties (2010) Synthetic Metals, 160 (23-24), pp Cited 11 times. Çalik, P., Bayraktar, E., Inankur, B., Soyaslan, E.Ş., Şahin, M., Taşpinar, H., Açik, E., Yilmaz, R., Özdamar, T.H. Influence of ph on recombinant human growth hormone production by Pichia pastoris (2010) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 85 (12), pp Cited 9 times. Özdurak, R.H., Şeker, T., Korkusuz, P., Korkusuz, F. Quantification of anandamide and 2-arachidonylglycerol in plasma samples: A short, non-toxic HPLC method and sample storage [Plazma örneklerinde anandamid ve 2-araşidonilgliserol'ün kantitatif deǧerlendirmesi: Ki{dotless}sa, nontoksik bir HPLC metodu ve örnek saklama] (2010) Turkish Journal of Biochemistry, 35 (3), pp Saraç, Ö.S., Atalay, V., Cetin-Atalay, R. GOPred: GO molecular function prediction by combined classifiers (2010) PLoS ONE, 5 (8), art. no. e12382,. Cited 5 times. Raposo, F., Fernández-Cegrí, V., De la Rubia, M.A., Borja, R., Beltrán, J., Cavinato, C., Clinckspoor, M., Demirer, G., Diamadopoulos, E., Frigon, J.C., Koubova, J., Launay, M., Méndez, R., Menin, G., Noguerol, J., Uellehdahl, H., West, S. Quality improvement in determination of chemical oxygen demand in samples considered difficult to analyze, through participation in proficiency-testing schemes (2010) TrAC - Trends in Analytical Chemistry, 29 (9), pp Cited 11 times. Deniz, A., Sade, A., Severcan, F., Keskin, D., Tezcaner, A., Banerjee, S. Celecoxib-loaded liposomes: Effect of cholesterol on encapsulation and in vitro release characteristics (2010) Bioscience Reports, 30 (5), pp Cited 9 times. Bozkurt, T.O., Mcgrann, G.R.D., Maccormack, R., Boyd, L.A., Akkaya, M.S. Cellular and transcriptional responses of wheat during compatible and incompatible racespecific interactions with Puccinia striiformis f. sp. tritici (2010) Molecular Plant Pathology, 11 (5), pp Cited 13 times. Yasinok, A.E., Biran, S., Kocabas, A., Bakir, U. Xylanase from a soil isolate, Bacillus pumilus: Gene isolation, enzyme production, purification, characterization and one-step separation by aqueous-two-phase system (2010) World Journal of Microbiology and Biotechnology, 26 (9), pp Cited 7 times. Uyar, E.O., Hamamci, H., Türkel, S. Effect of different stresses on trehalose levels in Rhizopus oryzae (2010) Journal of Basic Microbiology, 50 (4), pp Cited 4 times. Makas, Y.G., Kalkan, N.A., Aksoy, S., Altinok, H., Hasirci Nesrin, N. Immobilization of laccase in κ-carrageenan based semi-interpenetrating polymer networks (2010) Journal of Biotechnology, 148 (4), pp Cited 16 times. 40

45 Giray, T., Kence, M., Oskay, D., Döke, M.A., Kence, A. Scientific note: Colony losses survey in Turkey and causes of bee deaths (2010) Apidologie, 41 (4), pp Cited 11 times. Gürkök, S., Söyler, B., Biely, P., Ögel, Z.B. Cloning and heterologous expression of the extracellular alpha-galactosidase from Aspergillus fumigatus in Aspergillus sojae under the control of gpda promoter (2010) Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic, 64 (3-4), pp Cited 1 time. Norris, A.L., Özen, C., Serpersu, E.H. Thermodynamics and kinetics of association of antibiotics with the aminoglycoside acetyltransferase (3)-IIIb, a resistance-causing enzyme (2010) Biochemistry, 49 (19), pp Cited 8 times. Iwai, H., Öztürk, B., Ihara, M., Ueda, H. Antibody affinity maturation in vitro using unconjugated peptide antigen (2010) Protein Engineering, Design and Selection, 23 (4), pp Cited 6 times. Serpersu, E.H., Özen, C., Norris, A.L., Steren, C., Whittemore, N. Backbone resonance assignments of a promiscuous aminoglycoside antibiotic resistance enzyme; The aminoglycoside phosphotransferase(3 )-IIIa (2010) Biomolecular NMR Assignments, 4 (1), pp Cited 2 times. Çelik, E., Çalik, P., Oliver, S.G. Metabolic flux analysis for recombinant protein production by Pichia pastoris using dual carbon sources: Effects of methanol feeding rate (2010) Biotechnology and Bioengineering, 105 (2), pp Cited 22 times. Çalik, P., Inankur, B., Soyaslan, E.Ş., Şahin, M., Taşpinar, H., Açik, E., Bayraktar, E. Fermentation and oxygen transfer characteristics in recombinant human growth hormone production by Pichia pastoris in sorbitol batch and methanol fed-batch operation (2010) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 85 (2), pp Cited 8 times. Çalik, P., Balci, O., Özdamar, T.H. Human growth hormone-specific aptamer identification using improved oligonucleotide ligand evolution method (2010) Protein Expression and Purification, 69 (1), pp Cited 6 times. Özdamar, T.H., Şentürk, B., Yilmaz, O.D., Kocabaş, P., Çalik, G., Çalik, P. Bioreaction network flux analysis for human protein producing Bacillus subtilis based on genome-scale model (2010) Chemical Engineering Science, 65 (1), pp Demircan, T., Akkaya, M.S. Virus induced gene silencing in Brachypodium distachyon, a model organism for cereals (2010) Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 100 (1), pp Cited 21 times. Çimen, I., Tunçay, S., Banerjee, S. 15-Lipoxygenase-1 expression suppresses the invasive properties of colorectal carcinoma cell lines HCT-116 and HT-29 (2009) Cancer Science, 100 (12), pp Cited 13 times. 41

46 Uz, E., Yildirim-Ersoy, F., Hakki, E.E., Akkaya, M.S. Genetic relationship of wild einkorn based on geographical distribution in Anatolia and Thrace using AFLP markers (2009) Journal of Applied Biological Sciences, 3 (2), pp Cited 1 time. Çelik, E., Çalik, P., Oliver, S.G. Fed-batch methanol feeding strategy for recombinant protein production by Pichia pastoris in the presence of co-substrate sorbitol (2009) Yeast, 26 (9), pp Cited 32 times. Raposo, F., de la Rubia, M.A., Borja, R., Alaiz, M., Beltrán, J., Cavinato, C., Clinckspoor, M., Demirer, G., Diamadopoulos, E., Helmreich, B., Jenicek, P., Martí, N., Méndez, R., Noguerol, J., Pereira, F., Picard, S., Torrijos, M. An interlaboratory study as useful tool for proficiency testing of chemical oxygen demand measurements using solid substrates and liquid samples with high suspended solid content (2009) Talanta, 80 (1), pp Cited 7 times. Öz, M.T., Yilmaz, R., Eyidoǧan, F., de Graaff, L., Yücel, M., Öktem, H.A. Microarray Analysis of Late Response to boron toxicity in barley (Hordeum vulgare L.) leaves [Arpa (Hordeum vulgare L.) Yapraklari{dotless}nda Bor Toksisitesine Geç Tepkinin Mikroarray Analizleri] (2009) Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 33 (2), pp Cited 10 times. Özgür, E., Yücel, M., Öktem, H.A. Identification and characterization of hydrolytic enzymes from the midgut of the cotton bollworm, Helicoverpa armigera Hübner (Lepidoptera: Noctuidae) (2009) Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 33 (3), pp Cited 3 times. ÇalIk, P., Levent, H. Effects of pulse feeding of beet molasses on recombinant benzaldehyde lyase production by Escherichia coli BL21(DE3) (2009) Applied Microbiology and Biotechnology, 85 (1), pp Cited 5 times. Kaya-Çeliker, H., Angardi, V., Çalik, P. Regulatory effects of oxygen transfer on overexpression of recombinant benzaldehyde lyase production by Escherichia coli BL21 (DE3) (2009) Biotechnology Journal, 4 (7), pp Cited 2 times Kocabaş, P., Çalik, P., Çalik, G., Özdamar, T.H. Microarray studies in Bacillus subtilis (2009) Biotechnology Journal, 4 (7), pp Cited 3 times. Valiev, A., Ogel, Z.B., Klepzig, K.D. Analysis of cellulase and polyphenol oxidase production by southern pine beetle associated fungi (2009) Symbiosis, 49 (1), pp Cited 4 times. Endogan, T., Serbetci, K., Hasirci, N. Effects of ingredients on thermal and mechanical properties of acrylic bone cements (2009) Journal of Applied Polymer Science, 113 (6), pp Cited 12 times. 42

47 Yücel, O., Sargin, A.K., Tekiner, A., Kunak, Z.I., Halili, I., Aydin, A., Ndreu, A., Gözübüyük, A., Can, B., Karayilanoglu, T., Genç, O. Influence of proanthocyanidin on blunt traumatized lungs after nitrogen mustard exposure (real terror attack simulation) [Proantosiyanidinin nitrojen mustarda maruz bi{dotless}raki{dotless}lmi{dotless}ş künt travma oluşturulmuş akciǧerlerdeki etkisi (Gerçek terör saldi{dotless}ri{dotless} simülasyonu)] (2009) Gulhane Medical Journal, 51 (1), pp Çelik, E., Çalik, P., Oliver, S.G. A structured kinetic model for recombinant protein production by Mut+ strain of Pichia pastoris (2009) Chemical Engineering Science, 64 (23), pp Cited 9 times. Karahan, M.A., Kulacoglu, H., Seker, D., Ergul, Z., Kiziltay, A., Yilmazer, D., Captug, O., Yavuz, A., Serbetci, K., Bilgili, H., Hasirci, N. How safe is the use of prosthetic materials in the repair of abdominal-wall defects in malnourished subjects? (2009) Central European Journal of Medicine, 4 (3), pp Cited 1 time. Uyar, B., Schumacher, M., Gebicki, J., Modigell, M. Photoproduction of hydrogen by rhodobacter capsulatus from thermophilic fermentation effluent (2009) Bioprocess and Biosystems Engineering, 32 (5), pp Cited 23 times. Şimşek, Ö., Buzrul, S., Akkoç, N., Alpas, H., Akçelik, M. Stress response kinetics of two nisin producer strains of lactococcus lactis spp. lactis (2009) Applied Biochemistry and Biotechnology, 158 (2), pp Cited 1 time. Molnár, J., Kars, M.D., Gündüz, U., Engi, H., Schumacher, U., Van Damme, E.J., Peumans, W.J., Makovitzky, J., Gyémánt, N., Molnár, P. Interaction of tomato lectin with ABC transporter in cancer cells: Glycosylation confers functional conformation of P-gp (2009) Acta Histochemica, 111 (4), pp Cited 12 times. Acar, H.Y., Kas, R., Yurtsever, E., Ozen, C., Lieberwirth, I. Emergence of 2MPA as an effective coating for highly stable and luminescent quantum dots (2009) Journal of Physical Chemistry C, 113 (23), pp Cited 24 times. Ceylan, C., Severcan, M., Bozoglu, F., Severcan, F. Evaluation of high hydrostatic pressure effects on bovine red blood cells and platelets (2009) High Pressure Research, 29 (2), pp Cited 2 times. Koban, E., Gökçek Saraç, Ç., Açan, S.C., Savolainen, P., Togan, I. Genetic relationship between Kangal, Akbash and other dog populations (2009) Discrete Applied Mathematics, 157 (10), pp Cited 3 times. Karamollaoǧlu, I., Öktem, H.A., Mutlu, M. QCM-based DNA biosensor for detection of genetically modified organisms (GMOs) (2009) Biochemical Engineering Journal, 44 (2-3), pp Cited 16 times. Uyar, B., Eroglu, I., Yücel, M., Gündüz, U. Photofermentative hydrogen production from volatile fatty acids present in dark fermentation effluents (2009) International Journal of Hydrogen Energy, 34 (10), pp Cited 42 times. 43

48 Orman, M.A., Çalik, P., Özdamar, T.H. The influence of carbon sources on recombinant-human-growth-hormone production by Pichia pastoris is dependent on phenotype: A comparison of Muts and Mut+ strains (2009) Biotechnology and Applied Biochemistry, 52 (3), pp Cited 11 times. Kars, G., Gündüz, U., Yücel, M., Rakhely, G., Kovacs, K.L., Eroǧlu, I. Evaluation of hydrogen production by Rhodobacter sphaeroides O.U.001 and its hupsl deficient mutant using acetate and malate as carbon sources (2009) International Journal of Hydrogen Energy, 34 (5), pp Cited 29 times. Selcuklu, S.D., Yakicier, M.C., Erson, A.E. An investigation of micrornas mapping to breast cancer related genomic gain and loss regions (2009) Cancer Genetics and Cytogenetics, 189 (1), pp Cited 16 times. Çalik, P., Angardi, V., Haykir, N.I., Boyaci, I.H. Glucose isomerase production on a xylan-based medium by Bacillus thermoantarcticus (2009) Biochemical Engineering Journal, 43 (1), pp Cited 3 times. Özdamar, T.H., Şentürk, B., Yilmaz, Ö.D., Çalik, G., Çelik, E., Çalik, P. Expression system for recombinant human growth hormone production from Bacillus subtilis (2009) Biotechnology Progress, 25 (1), pp Cited 12 times. Dagdas, Y.F., Dagdas, G., Unver, T., Akkaya, M.S. A new ZTL-type F-box functions as a positive regulator in disease resistance: VIGS analysis in barley against powdery mildew (2009) Physiological and Molecular Plant Pathology, 74 (1), pp Duruksu, G., Ozturk, B., Biely, P., Bakir, U., Ogel, Z.B. Cloning, expression and characterization of endo-β-1,4-mannanase from aspergillus fumigatus in aspergillus sojae and pichia pastoris (2009) Biotechnology Progress, 25 (1), pp Cited 13 times. Ashammakhi, N., Ndreu, A., Nikkola, L., Wimpenny, I., Yang, Y. Advancing tissue engineering by using electrospun nanofibers (2008) Regenerative Medicine, 3 (4), pp Cited 28 times. Severcan, F., Gokduman, K., Dogan, A., Bolay, S., Gokalp, S. Effects of in-office and at-home bleaching on human enamel and dentin: An in vitro application of fourier transform infrared study (2008) Applied Spectroscopy, 62 (11), pp Cited 13 times. Demir, A.S., Ayhan, P., Demirtaş, U., Erkiliç, U. Fusarium roseum and Aspergillus oryzae-mediated enantioselective reduction of benzils to benzoins (2008) Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic, 55 (3-4), pp Cited 10 times. Gürakan, G.C., Aksoy, C., Ögel, Z.B., Ören, N.G. Differentiation of Salmonella typhimurium from Salmonella enteritidis and other Salmonella serotypes using random amplified polymorphic DNA analysis (2008) Poultry Science, 87 (6), pp Cited 4 times. 44

49 Kara, F., Gurakan, G.C., Sanin, F.D. Monovalent cations and their influence on activated sludge floc chemistry, structure, and physical characteristics (2008) Biotechnology and Bioengineering, 100 (2), pp Cited 19 times. Eda Çelik, S., Ozbay, N., Oktar, N., Çalik, P. Use of biodiesel byproduct crude glycerol as the carbon source for fermentation processes by recombinant Pichia pastoris (2008) Industrial and Engineering Chemistry Research, 47 (9), pp Cited 29 times. Akbulut, M., Yücel, M., Öktem, H.A. Analysis and optimization of DNA delivery into chickpea (Cicer arietinum L.) seedlings by Agrobacterium tumefacience (2008) African Journal of Biotechnology, 7 (8), pp Cited 5 times. Ndreu, A., Nikkola, L., Ylikauppilar, H., Ashammakhi, N., Hasirci, V. Electrospun biodegradable nanofibrous mats for tissue engineering (2008) Nanomedicine, 3 (1), pp Cited 21 times. Bayraktar, E., Kocapiçak, O., Mehmetoǧlu, U., Parlaktuna, M., Mehmetoǧlu, T. Recovery of amino acids from reverse micellar solution by gas hydrate (2008) Chemical Engineering Research and Design, 86 (2), pp Cited 4 times. Vrana, E., Builles, N., Hindie, M., Damour, O., Aydinli, A., Hasirci, V. Contact guidance enhances the quality of a tissue engineered corneal stroma (2008) Journal of Biomedical Materials Research - Part A, 84 (2), pp Cited 24 times. Goksu, E.I., Karamanlioglu, M., Bakir, U., Yilmaz, L., Yilmazer, U. Production and characterization of films from cotton stalk xylan (2007) Journal of Agricultural and Food Chemistry, 55 (26), pp Cited 37 times. Uyar, B., Eroglu, I., Yücel, M., Gündüz, U., Türker, L. Effect of light intensity, wavelength and illumination protocol on hydrogen production in photobioreactors (2007) International Journal of Hydrogen Energy, 32 (18), pp Cited 72 times. Çelik, E., Çalik, P., Halloran, S.M., Oliver, S.G. Production of recombinant human erythropoietin from Pichia pastoris and its structural analysis (2007) Journal of Applied Microbiology, 103 (6), pp Cited 29 times. Demir, A.S., Ayhan, P., Betül Sopaci, S. Thiamine pyrophosphate dependent enzyme catalyzed reactions: Stereoselective C-C bond formations in water (2007) Clean - Soil, Air, Water, 35 (5), pp Cited 24 times. Aydoǧan, Ö., Bayraktar, E., Parlaktuna, M., Mehmetoǧlu, T., Mehmetoǧlu, Ü. Production of L-aspartic acid by biotransformation and recovery using reverse micelle and gas hydrate methods (2007) Biocatalysis and Biotransformation, 25 (5), pp Cited 5 times. Çalik, P., Ileri, N. ph influences intracellular reaction network of β-lactamase producing Bacillus licheniformis (2007) Chemical Engineering Science, 62 (18-20), pp Cited 1 time. 45

50 Akpinar, O., Ak, O., Kavas, A., Bakir, U., Yilmaz, L. Enzymatic production of xylooligosaccharides from cotton stalks (2007) Journal of Agricultural and Food Chemistry, 55 (14), pp Cited 50 times. Yucel, D., Ozer, N., Hasirci, V. Construction of a choline biosensor through enzyme immobilization on a poly(2-hydroxyethyl methacrylate)-grafted teflon film (2007) Journal of Applied Polymer Science, 104 (5), pp Cited 11 times. Yildirim, M., Bahar, B., Genç, I., Korkmaz, K., Karnez, E. Diallel analysis of wheat parents and their F2 progenies under medium and low level of available N in soil (2007) Journal of Plant Nutrition, 30 (6), pp Cited 1 time. Ileri, N., Çalik, P., Şengül, A. Phosphate enrichment and fed-batch operation for prolonged β-lactamase production by Bacillus licheniformis (2007) Journal of Applied Microbiology, 102 (5), pp Açar, S., Yücel, M., Hamamci, H. Purification and characterisation of two isozymes of pyruvate decarboxylase from Rhizopus oryzae (2007) Enzyme and Microbial Technology, 40 (4), pp Cited 5 times. Karahuseyinoglu, S., Cinar, O., Kilic, E., Kara, F., Akay, G.G., Demiralp, D.Ö., Tukun, A., Uckan, D., Can, A. Biology of stem cells in human umbilical cord stroma: In situ and in vitro surveys (2007) Stem Cells, 25 (2), pp Cited 253 times. Tükel, Ç., Avşaroǧlu, M.D., Şimsek, Ö., Akçelik, M. Isolation and partial characterization of a novel bacteriocin produced by Lactococcus lactis ssp. lactis MC38 (2007) Journal of Food Safety, 27 (1), pp Cited 7 times. Dogan, A., Siyakus, G., Severcan, F. FTIR spectroscopic characterization of irradiated hazelnut (Corylus avellana L.) (2007) Food Chemistry, 100 (3), pp Cited 57 times. Büyükkileci, A.O., Hamamci, H., Yucel, M. Lactate and ethanol productions by Rhizopus oryzae ATCC 9363 and activities of related pyruvate branch point enzymes (2006) Journal of Bioscience and Bioengineering, 102 (5), pp Cited 4 times. Zorlutuna, P., Tezcaner, A., Kiyat, I., Aydinli, A., Hasirci, V. Cornea engineering on polyester carriers (2006) Journal of Biomedical Materials Research - Part A, 79 (1), pp Cited 10 times. Dilek Sanin, F., Vatansever, A., Turtin, I., Kara, F., Durmaz, B., Sesay, M.L. Operational conditions of activated sludge: Influence on flocculation and dewaterability (2006) Drying Technology, 24 (10), pp Cited 9 times. 46

51 Kocabaş, P., Çalik, P., Özdamar, T.H. Fermentation characteristics of l-tryptophan production by thermoacidophilic Bacillus acidocaldarius in a defined medium (2006) Enzyme and Microbial Technology, 39 (5), pp Cited 8 times. Öztürk, Y., Yücel, M., Daldal, F., Mandaci, S., Gündüz, U., Türker, L., Eroǧlu, I. Hydrogen production by using Rhodobacter capsulatus mutants with genetically modified electron transfer chains (2006) International Journal of Hydrogen Energy, 31 (11), pp Cited 43 times. Ögel, Z.B., Yüzügüllü, Y., Mete, S., Bakir, U., Kaptan, Y., Sutay, D., Demir, A.S. Production, properties and application to biocatalysis of a novel extracellular alkaline phenol oxidase from the thermophilic fungus Scytalidium thermophilum (2006) Applied Microbiology and Biotechnology, 71 (6), pp Cited 22 times. Hasirci, V., Kenar, H. Novel surface patterning approaches for tissue engineering and their effect on cell behavior (2006) Nanomedicine, 1 (1), pp Cited 25 times. Sesay, M.L., Özcengiz, G., Dilek Sanin, F. Enzymatic extraction of activated sludge extracellular polymers and implications on bioflocculation (2006) Water Research, 40 (7), pp Cited 27 times. Çalik, P., Yilgör, P., Demir, A.S. Influence of controlled-ph and uncontrolled-ph operations on recombinant benzaldehyde lyase production by Escherichia coli (2006) Enzyme and Microbial Technology, 38 (5), pp Cited 17 times. Akçelik, O., Tükel, Ç., Özcengiz, G., Akçelik, M. Characterization of bacteriocins from two Lactococcus lactis subsp. lactis isolates (2006) Molecular Nutrition and Food Research, 50 (3), pp Cited 24 times. Ileri, N., Çalik, P. Effects of ph strategy on endo- and exo-metabolome profiles and sodium potassium hydrogen ports of β-lactamase-producing Bacillus licheniformis (2006) Biotechnology Progress, 22 (2), pp Cited 18 times. Kenar, H., Köse, G.T., Hasirci, V. Tissue engineering of bone on micropatterned biodegradable polyester films (2006) Biomaterials, 27 (6), pp Cited 46 times. Ulubayram, K., Kiziltay, A., Yilmaz, E., Hasirci, N. Desferrioxamine release from gelatin-based systems (2005) Biotechnology and Applied Biochemistry, 42 (3), pp Cited 5 times. Coskun, S., Korkusuz, F., Hasirci, V. Hydroxyapatite reinforced poly(3-hydroxybutyrate) and poly(3-hydroxybutyrate-co-3- hydroxyvalerate) based degradable composite bone plate (2005) Journal of Biomaterials Science, Polymer Edition, 16 (12), pp Cited 25 times. 47

52 Çalik, P., Ileri, N., Erdinç, B.I., Aydogan, N., Argun, M. Novel antifoam for fermentation processes: Fluorocarbon-hydrocarbon hybrid unsymmetrical bolaform surfactant (2005) Langmuir, 21 (19), pp Cited 12 times. Çalik, P., Arifoǧlu, M., Çalik, G. Oxygen transfer effects in β-lactamase fermentation by Bacillus licheniformis in a glucosebased defined medium (2005) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 80 (9), pp Cited 4 times. Hakki, S.S., Nohutcu, R.M., Hakki, E.E., Berry, J.E., Akkaya, M.S., Somerman, M.J. Dexamethasone and basic-fibroblast growth factor regulate markers of mineralization in cementoblasts in vitro (2005) Journal of Periodontology, 76 (9), pp Cited 22 times. Köse, G.T., Korkusuz, F., Özkul, A., Soysal, Y., Özdemir, T., Yildiz, C., Hasirci, V. Tissue engineered cartilage on collagen and PHBV matrices (2005) Biomaterials, 26 (25), pp Cited 57 times. Mozafari, M.R., Reed, C.J., Rostron, C., Hasirci, V. A review of scanning probe microscopy investigations of liposome-dna complexes (2005) Journal of Liposome Research, 15 (1-2), pp Cited 20 times. El-Bashiti, T., Hamamci, H., Öktem, H.A., Yücel, M. Biochemical analysis of trehalose and its metabolizing enzymes in wheat under abiotic stress conditions (2005) Plant Science, 169 (1), pp Cited 30 times. Muvaffak, A., Gurhan, I., Gunduz, U., Hasirci, N. Preparation and characterization of a biodegradable drug targeting system for anticancer drug delivery: Microsphere-antibody conjugate (2005) Journal of Drug Targeting, 13 (3), pp Cited 15 times. Korkusuz, E.A., Beklioǧlu, M., Demirer, G.N. Comparison of the treatment performances of blast furnace slag-based and gravel-based vertical flow wetlands operated identically for domestic wastewater treatment in Turkey (2005) Ecological Engineering, 24 (3), pp Cited 57 times. Avcioglu, B., Eyupoglu, B., Bakir, U. Production and characterization of xylanases of a Bacillus strain isolated from soil (2005) World Journal of Microbiology and Biotechnology, 21 (1), pp Cited 10 times. Korkusuz, E.A., Beklioǧlu, M., Demirer, G.N. Treatment efficiencies of the vertical flow pilot-scale constructed wetlands for domestic wastewater treatment (2004) Turkish Journal of Engineering and Environmental Sciences, 28 (5), pp Cited 6 times. Muvaffak, A., Gurhan, I., Hasirci, N. Prolonged cytotoxic effect of colchicine released from biodegradable microspheres (2004) Journal of Biomedical Materials Research - Part B Applied Biomaterials, 71 (2), pp Cited 31 times. 48

53 Çalik, G., Pehlivan, N., Özçelik, I.Ş., Çalik, P., Özdamar, T.H. Fermentation and oxygen transfer characteristics in serine alkaline protease production by recombinant Bacillus subtilis in molasses-based complex medium (2004) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 79 (11), pp Cited 2 times. Demir, A.S., Hamamci, H., Ayhan, P., Duygu, A.N., Igdir, A.C., Capanoglu, D. Fungi mediated conversion of benzil to benzoin and hydrobenzoin (2004) Tetrahedron Asymmetry, 15 (16), pp Cited 22 times. Köse, G.T., Korkusuz, F., Korkusuz, P., Hasirci, V. In vivo tissue engineering of bone using poly(3-hydroxybutyric acid-co-3-hydroxyvaleric acid) and collagen scaffolds (2004) Tissue Engineering, 10 (7-8), pp Cited 36 times. Muvaffak, A., Gürhan, I., Hasirci, N. Cytotoxicity of 5-fluorouracil entrapped in gelatin microspheres (2004) Journal of Microencapsulation, 21 (3), pp Cited 17 times. Çirli, Ö.Ö., Hasirci, V. UV-induced drug release from photoactive REV sensitized by suprofen (2004) Journal of Controlled Release, 96 (1), pp Cited 8 times. Çelik, E., Çalik, P. Bioprocess parameters and oxygen transfer characteristics in β-lactamase production by Bacillus species (2004) Biotechnology Progress, 20 (2), pp Cited 22 times. Kok, F.N., Hasirci, V. Determination of binary pesticide mixtures by an acetylcholinesterase- choline oxidase biosensor (2004) Biosensors and Bioelectronics, 19 (7), pp Cited 69 times. Keskin, D.S., Wise, D.L., Hasirci, V. Pain control via opioid analgesic-local anesthetic loaded IPNs. (2004) Current drug delivery., 1 (1), pp Cited 7 times. Çalik, P., Kalender, N., Özdamar, T.H. Overexpression of serine alkaline protease encoding gene in Bacillus species: Performance analyses (2003) Enzyme and Microbial Technology, 33 (7), pp Cited 9 times. Çalik, P., Çelik, E., Telli, I.E., Oktar, C., Özdemir, E. Protein-based complex medium design for recombinant serine alkaline protease production (2003) Enzyme and Microbial Technology, 33 (7), pp Cited 8 times. Torun Köse, G., Korkusuz, F., Korkusuz, P., Purali, N., Özkul, A., Hasirci, V. Bone generation on PHBV matrices: An in vitro study (2003) Biomaterials, 24 (27), pp Cited 63 times. Muvaffak, A., Hasirci, N. The use of antibodies in diagnosis and therapy of cancer. (2003) Advances in experimental medicine and biology, 534, pp Cited 3 times. 49

54 Sendil Keskin, D., Hasirci, V. Controlled release of bioactive agents in gene therapy and tissue engineering. (2003) Advances in experimental medicine and biology, 534, pp Cited 2 times. Hasirci, V., Bonney, I., Goudas, L.C., Shuster, L., Carr, D.B., Wise, D.L. Antihyperalgesic effect of simultaneously released hydromorphone and bupivacaine from polymer fibers in the rat chronic constriction injury model (2003) Life Sciences, 73 (26), pp Cited 9 times. Tezcaner, A., Bugra, K., Hasirci, V. Retinal pigment epithelium cell culture on surface modified poly(hydroxybutyrate-cohydroxyvalerate) thin films (2003) Biomaterials, 24 (25), pp Cited 50 times. Baran, E.T., Özer, N., Hasirci, V. Solid-phase enzyme modification via affinity chromatography (2003) Journal of Chromatography B: Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, 794 (2), pp Cited 11 times. Şeker, T., Hamamci, H. Trehalose, glycogen and ethanol metabolism in the gcr1 mutant of Saccharomyces cerevisiae (2003) Folia Microbiologica, 48 (2), pp Cited 3 times. Şendil-Keskin, D., Altunay, H., Wise, D.L., Hasirci, V. In vivo pain relief effectiveness of an analgesic-anesthetic carrying biodegradable controlled release rod systems (2003) Journal of Biomaterials Science, Polymer Edition, 14 (6), pp Cited 6 times. Sendil, D., Maszczynska Bonney, I., Carr, D.B., Lipkowski, A.W., Wise, D.L., Hasirci, V. Antinociceptive effects of hydromorphone, bupivacaine and biphalin released from PLGA polymer after intrathecal implantation in rats (2003) Biomaterials, 24 (11), pp Cited 10 times. Torun Köse, G., Kenar, H., Hasirci, N., Hasirci, V. Macroporous poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate) matrices for bone tissue engineering (2003) Biomaterials, 24 (11), pp Cited 111 times. Çalik, P., Bayram, A., Özdamar, T.H. Regulatory effects of alanine-group amino acids on serine alkaline protease production by recombinant Bacillus licheniformis (2003) Biotechnology and Applied Biochemistry, 37 (2), pp Cited 6 times. Yagmurlu, A., Barlas, M., Gursel, I., Gokcora, I.H. Reduction of surgery-induced peritoneal adhesions by continuous release of streptokinase from a drug delivery system (2003) European Surgical Research, 35 (1), pp Cited 5 times. Elpek, G., Içgen, B., Özcengiz, G. Colicinogeny, lipopolysaccharide and outer membrane protein profiles of multi-drug resistant Salmonella typhimurium isolates from turkey (2002) Turkish Journal of Medical Sciences, 32 (6), pp Cited 1 time. 50

55 Çalik, P., Şenver Özçelik, I., Çalik, G., Özdamar, T.H. Enzyme-ion exchanger interactions in serine alkaline protease separation: Theory, equilibria and kinetics (2002) Biochemical Engineering Journal, 12 (3), pp Cited 4 times. Içgen, Y., Içgen, B., Özcengiz, G. Regulation of crystal protein biosynthesis by Bacillus thuringiensis: II. Effects of carbon and nitrogen sources (2002) Research in Microbiology, 153 (9), pp Cited 18 times. Içgen, Y., Içgen, B., Özcengiz, G. Regulation of crystal protein biosynthesis by Bacillus thuringiensis: I. Effects of mineral elements and ph (2002) Research in Microbiology, 153 (9), pp Cited 10 times. Gen, B., Gurakan, G.C., Ozcengiz, G. Characterisation of local isolates of Enterobacteriaceae from Turkey (2002) Microbiological Research, 157 (3), pp Cited 2 times. Dünkelmann, P., Kolter-Jung, D., Nitsche, A., Demir, A.S., Siegert, P., Lingen, B., Baumann, M., Pohl, M., Müller, M. Development of a donor-acceptor concept for enzymatic cross-coupling reactions of aldehydes: The first asymmetric cross-benzoin condensation (2002) Journal of the American Chemical Society, 124 (41), pp Cited 152 times. Çalik, P., Bilir, E., Çalik, G., Özdamar, T.H. Influence of ph conditions on metabolic regulations in serine alkaline protease production by Bacillus licheniformis (2002) Enzyme and Microbial Technology, 31 (5), pp Cited 29 times. Köse, G.T., Tezcaner, A., Hasirci, V. Fundamentals of tissue engineering: Carrier materials and an application (2002) Technology and Health Care, 10 (3-4), pp Cited 8 times. Demir, A.S., Hamamci, H., Sesenoglu, O., Neslihanoglu, R., Asikoglu, B., Capanoglu, D. Fungal deracemization of benzoin (2002) Tetrahedron Letters, 43 (36), pp Cited 37 times. Içgen, B., Özcengiz, G., Alaeddinoglu, N.G. Evaluation of symbiotic effectiveness of various Rhizobium cicer strains (2002) Research in Microbiology, 153 (6), pp Cited 10 times. Içgen, B., Candan Gürakan, G., Özcengiz, G. Characterization of Salmonella Enteritidis isolates of chicken, egg and human origin from Turkey (2002) Food Microbiology, 19 (4), pp Cited 17 times. Kok, F.N., Bozoglu, F., Hasirci, V. Construction of an acetylcholinesterase-choline oxidase biosensor for aldicarb determination (2002) Biosensors and Bioelectronics, 17 (6-7), pp Cited 65 times. 51

56 Baran, E.T., Özer, N., Hasirci, V. Poly(hydroxybutyrate-co-hydroxyvalerate) nanocapsules as enzyme carriers for cancer therapy: An in vitro study (2002) Journal of Microencapsulation, 19 (3), pp Cited 35 times. Çalik, P., Özdamar, T.H. Metabolic flux analysis for human therapeutic protein productions and hypothesis for new therapeutical strategies in medicine (2002) Biochemical Engineering Journal, 11 (1), pp Cited 11 times. Şendil, D., Wise, D.L., Hasirci, V. Assessment of biodegradable controlled release rod systems for pain relief applications (2002) Journal of Biomaterials Science, Polymer Edition, 13 (1), pp Cited 13 times. Hasirci, V., Litman, A.E., Trantolo, D.J., Gresser, J.D., Wise, D.L., Margolis, H.C. PLGA bone plates reinforced with crosslinked PPF (2002) Journal of Materials Science: Materials in Medicine, 13 (2), pp Cited 3 times. Hasirci, V., Tezcaner, A., Hasirci, N., Süzer, Ş. Oxygen plasma modification of poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate) film surfaces for tissue engineering purposes (2002) Journal of Applied Polymer Science, 87 (8), pp Cited 23 times. Gursel, I., Yagmurlu, F., Korkusuz, F., Hasirci, V. In vitro antibiotic release from poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate) rods (2002) Journal of Microencapsulation, 19 (2), pp Cited 34 times. Özalp, Y., Özdemir, N., Hasirci, V. Vancomycin release from poly(d,l-lactide) and poly(lactide-co-glycolide) disks (2002) Journal of Microencapsulation, 19 (1), pp Cited 5 times. Coşkun, S., Hasirci, V. Biodegradable bone plate integrated with growth factor releasing microcapsule system (2002) Technology and Health Care, 10 (3-4), pp Şendil, D., Wise, D.L., Hasirci, V. Pain reliever delivery from two different controlled release systems (2002) Technology and Health Care, 10 (3-4), pp Şendil, D., Maszcynska, I., Carr, D.B., Lipkowski, A.W., Wise, D.L., Hasirci, V. Pain control via intrathecal polymeric implants (2002) Technology and Health Care, 10 (3-4), pp Çirli, Ö.Ö., Hasirci, V. Photoactive liposomes as drug carriers (2002) Technology and Health Care, 10 (3-4), pp Muvaffak, A., Hasirci, N. Controlled release from glutaraldehyde crosslinked gelatin microspheres (2002) Technology and Health Care, 10 (3-4), pp Cited 10 times. 52

57 Çinar, S., Hasirci, V. Characterization of gamma radiation initiated, highly swellable poly(n-vinyl 2-pyrrolidone) hydrogels (2002) Technology and Health Care, 10 (3-4), pp Içgen, B., Gürakan, G.C., Özcengiz, G. Effects of plasmid curing on antibiotic susceptibility, phage type, lipopoly saccharide and outer membrane protein profiles in local Salmonella isolates (2001) Food Microbiology, 18 (6), pp Cited 6 times. Çalik, P., Çalik, G., Özdamar, T.H. Bioprocess development for serine alkaline protease production: A review (2001) Reviews in Chemical Engineering, 17 (4 SUPPL.), pp Cited 13 times. Kok, F.N., Bozoglu, F., Hasirci, V. Immobilization of acetylcholinesterase and choline oxidase in / on phema membrane for biosensor construction (2001) Journal of Biomaterials Science, Polymer Edition, 12 (11), pp Cited 7 times. Bakir, U., Yavascaoglu, S., Guvenc, F., Ersayin, A. An endo-β-1,4-xylanase from Rhizopus oryzae: Production, partial purification and biochemical characterization (2001) Enzyme and Microbial Technology, 29 (6-7), pp Cited 44 times. Hasirci, V., Berthiaume, F., Bondre, S.P., Gresser, J.D., Trantolo, D.J., Toner, M., Wise, D.L. Expression of liver-specific functions by rat hepatocytes seeded in treated poly(lactic-coglycolic) acid biodegradable foams (2001) Tissue Engineering, 7 (4), pp Cited 45 times. Demir, A.S., Hamamci, H., Sesenoglu, O., Aydogan, F., Capanoglu, D., Neslihanoglu, R. Simple chemoenzymatic access to enantiopure pharmacologically interesting (R)-2- hydroxypropiophenones (2001) Tetrahedron Asymmetry, 12 (13), pp Cited 33 times. Türesin, F., Gürsel, I., Hasirci, V. Biodegradable polyhydroxyalkanoate implants for osteomyelitis therapy: In vitro antibiotic release (2001) Journal of Biomaterials Science, Polymer Edition, 12 (2), pp Cited 39 times. Çalik, P., Özdamar, T.H. Carbon sources affect metabolic capacities of Bacillus species for the production of industrial enzymes: Theoretical analyses for serine and neutral proteases and α-amylase (2001) Biochemical Engineering Journal, 8 (1), pp Cited 31 times. Ögel, Z.B., Yarangümeli, K., Dü, H., Ifrij, I. Submerged cultivation of Scytalidium thermophilum on complex lignocellulosic biomass for endoglucanase production (2001) Enzyme and Microbial Technology, 28 (7-8), pp Cited 33 times. Hasrc, V., Lewandrowski, K., Gresser, J.D., Wise, D.L., Trantolo, D.J. Versatility of biodegradable biopolymers: Degradability and an in vivo application (2001) Journal of Biotechnology, 86 (2), pp Cited 80 times. 53

58 Korkusuz, F., Korkusuz, P., Ekşioĝlu, F., Gürsel, I., Hasirci, V. In vivo response to biodegradable controlled antibiotic release systems (2001) Journal of Biomedical Materials Research, 55 (2), pp Cited 39 times. Hakki, E.E., Akkaya, M.S. RT-PCR amplification of a Rhizopus oryzae lactate dehydrogenase gene fragment (2001) Enzyme and Microbial Technology, 28 (2-3), pp Cited 13 times. Özalp, Y., Özdemir, N., Kocagöz, S., Hasirci, V. Controlled release of vancomycin from biodegradable microcapsules (2001) Journal of Microencapsulation, 18 (1), pp Cited 24 times. Gürsel, I., Korkusuz, F., Türesin, F., Gürdal Alaeddinoǧlu, N., Hasirci, V. In vivo application of biodegradable controlled antibiotic release systems for the treatment of implant-related osteomyelitis (2001) Biomaterials, 22 (1), pp Cited 90 times. Ozturk, Z.N., Ogel, Z.B. PCR with degenerate primers amplifies a subgenomic DNA fragment from the endoglucanase gene(s) of Torula thermophila, a thermophilic fungus (2000) Applied Biochemistry and Biotechnology - Part B Molecular Biotechnology, 16 (2), pp Cited 2 times. Demir, A.S., Aksoy-Cam, H., Camkerten, N., Hamamci, H., Doǧanel, F. An efficient synthesis of (1S, 2R)-1-amino-2-indanol, a key intermediate of HIV protease inhibitor, indinavir (2000) Turkish Journal of Chemistry, 24 (2), pp Cited 11 times. Türker, L., Sudaǧidan, M. Theoretical aspects of some 4-[2,6-substituted-9H-purin-9-yl]-2-cyclopentene-1-methanol derivatives as anti-hiv agents (2000) ACH - Models in Chemistry, 137 (1), pp Hasirci, V., Lewandrowski, K.U., Bondre, S.P., Gresser, J.D., Trantolo, D.J., Wise, D.L. High strength bioresorbable bone plates: Preparation, Mechanical properties and in vitro analysis (2000) Bio-Medical Materials and Engineering, 10 (1), pp Cited 11 times. Lewandrowski, K.-U., Gresser, J.D., Wise, D.L., Trantolo, D.J., Hasirci, V. Tissue responses to molecularly reinforced polylactide-co-glycolide implants (2000) Journal of Biomaterials Science, Polymer Edition, 11 (4), pp Cited 6 times. Yiǧit, D.Ö., Gündüz, U., Türker, L., Yücel, M., Eroǧlu, n. Identification of by-products in hydrogen producing bacteria; Rhodobacter sphaeroides O.U. 001 grown in the waste water of a sugar refinery (1999) Progress in Industrial Microbiology, 35 (C), pp Cited 1 time. Kök, F.N., Yakup Arca, M., Gencer, O., Abak, K., Hasrc, V. Controlled release of aldicarb from carboxymethyl cellulose microspheres: In vitro and field applications (1999) Pesticide Science, 55 (12), pp Cited 19 times. 54

59 Yildiz, E.E., Özcengiz, G., Içgen, B., Alaeddinoǧlu, N.G. Assignment of biological functions to specific plasmids in a local isolate of Rhizobium cicer (1999) Folia Microbiologica, 44 (1), pp Yagmurlu, M.F., Korkusuz, F., Gürsel, I., Korkusuz, P., Örs, U., Hasirci, V. Sulbactam-cefoperazone polyhydroxybutyrate-co-hydroxyvalerate (PHBV) local antibiotic delivery system: In vivo effectiveness and biocompatibility in the treatment of implant-related experimental osteomyelitis (1999) Journal of Biomedical Materials Research, 46 (4), pp Cited 60 times. Kök, F.N., Wilkins, R.M., Cain, R.B., Arica, M.Y., Alaeddinoǧlu, G., Hasirci, V. Controlled release of aldicarb from lignin loaded ionotropic hydrogel microspheres (1999) Journal of Microencapsulation, 16 (5), pp Cited 14 times. Yaylaoglu, M.B., Yildiz, C., Korkusuz, F., Hasirci, V. A novel osteochondral implant (1999) Biomaterials, 20 (16), pp Cited 73 times. Yaylaoǧlu, M.B., Korkusuz, P., Örs, U., Korkusuz, F., Hasirci, V. Development of a calcium phosphate-gelatin composite as a bone substitute and its use in drug release (1999) Biomaterials, 20 (8), pp Cited 72 times. Ak, O., Bakir, U., Guray, T. Production, purification and characterization of chitosanase from Penicillium spinulosum (1998) Biochemical Archives, 14 (4), pp Cited 7 times. Köse, G.T., Arica, M.Y., Hasirci, V. Low-molecular-weight heparin-conjugated liposomes with improved stability and hemocompatibility (1998) Drug Delivery: Journal of Delivery and Targeting of Therapeutic Agents, 5 (4), pp Cited 1 time. Ak, Ö., Bakir, U., Güray, T. Isolation of a chitosan degrading fungus, Penicillium spinulosum, and chitosanase production by the isolate (1998) Studies in Organic Chemistry, 53 (C), pp Eker, F., Haris, P.I., Severcan, F. Vitamin Dr-Melittia-phospholipid model membrane interactions (1998) Biochemical Society Transactions, 26 (4),. Cited 1 time. Arica, M.Y., Denizli, A., Baran, T., Hasirci, V. Dye derived and metal incorporated affinity poly(2-hydroxyethyl methacrylate) membranes for use in enzyme immobilization (1998) Polymer International, 46 (4), pp Cited 31 times. Erdogdu, G., Hasirci, V. An overview of the role of mineral solubility in silicosis and asbestosis (1998) Environmental Research, 78 (1), pp Cited 15 times. 55

60 Mozafari, M.R., Zareie, M.H., Piskin, E., Hasirci, V. Formation of supramolecular structures by negatively charged liposomes in the presence of nucleic acids and divalent cations (1998) Drug Delivery: Journal of Delivery and Targeting of Therapeutic Agents, 5 (2), pp Cited 14 times. Arica, M.Y., Alaeddinoǧlu, N.G., Hasirci, V. Immobilization of glucoamylase onto activated phema/egdma microspheres: Properties and application to a packed-bed reactor (1998) Enzyme and Microbial Technology, 22 (3), pp Cited 62 times. Mozafari, M.R., Hasirci, V. Mechanism of calcium ion induced multilamellar vesicle-dna interaction (1998) Journal of Microencapsulation, 15 (1), pp Cited 21 times. Kök, F.N., Arica, M.Y., Hasirci, V. Construction of a bioraactor for the degradation of the pesticide, aldicarb (1997) Studies in Environmental Science, 66 (C), pp Arica, M.Y., Yiǧtoǧlu, M., Lale, M., Kök, F.N., Hasirci, V. Controlled release of Aldicarb from carboxymethylcellulese microcapsules (1997) Turkish Journal of Chemistry, 21 (2), pp Cited 2 times. Baran, T., Arica, M.Y., Denizli, A., Hasirci, V. Comparison of β-galactosidase immobilization by entrapment in and adsorption on poly(2- hydroxyethylmethacrylate) membranes (1997) Polymer International, 44 (4), pp Cited 16 times. Zareýe, M.H., Mozafarý, M.R., Hasirci, V., Pýpkýn, E. Scanning tunnelling microscopy investigation of liposome-dna-ca2+ complexes (1997) Journal of Liposome Research, 7 (4), pp Cited 14 times. Kaplan, O., Bakir, U., Erarslan, A. Thermal inactivation of native and crosslinked invertases (1997) Biotechnology Techniques, 11 (9), pp Cited 2 times. Arica, M.Y., Denizli, A., Salih, B., Piskin, E., Hasirci, V. Catalase adsorption onto Cibacron Blue F3GA and Fe(III)-derivatized poly(hydroxyethyl methacrylate) membranes and application to a continuous system (1997) Journal of Membrane Science, 129 (1), pp Cited 57 times. Arica, B., Arica, M.Y., Kaş, H.S., Hincal, A.A., Hasirci, V. In-vitro studies of enteric coated diclofenac sodium-carboxymethylcellulose microspheres (1996) Journal of Microencapsulation, 13 (6), pp Cited 16 times. Zareie, M.H., Borucu, A., Ozden, M.Y., Hasirci, V., Pişkin, E. Imaging of liposomes by scanning tunneling microscopy (1996) Artificial Cells, Blood Substitutes, and Immobilization Biotechnology, 24 (5), pp Cited 5 times. 56

61 Darvari, R., Hasirci, V. Pesticide and model drug release from carboxymethylceullose microspheres (1996) Journal of Microencapsulation, 13 (1), pp Cited 22 times. Arica, M.Y., Hasirci, V., Alaeddinoǧlu, N.G. Covalent immobilization of α-amylase onto phema microspheres: Preparation and application to fixed bed reactor (1995) Biomaterials, 16 (10), pp Cited 88 times. Gursel, I., Hasirci, V. Properties and drug release behaviour of poly(3-hydroxybutyric acid) and various poly(3- hydroxybutyrate-hydroxyvalerate) copolymer microcapsules (1995) Journal of Microencapsulation, 12 (2), pp Cited 48 times. Gursel, M., Hasirci, V. Influence of membrane components on the stability and drug release properties of reverse phase evaporation vesicles (REVs): Light sensitive all-trans retinal, negatively charged phospholipid dicetylphosphate and cholesterol (1995) Journal of Microencapsulation, 12 (6), pp Cited 4 times. Arica, M.Y., Hasirci, V. Glucose oxidase sandwiched between phema layers: A continuous flow reactor application (1993) Biomaterials, 14 (11), pp Cited 12 times. Arica, M.Y., Hasirci, V. Bioreactor applications of glucose oxidase covalently bonded on phema membranes (1993) Biomaterials, 14 (11), pp Cited 16 times. Arica, M.Y., Hasirci, V. Immobilization of glucose oxidase: A comparison of entrapment and covalent bonding (1993) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 58 (3), pp Cited 53 times. Arica, M.Y., Sharif, F.A., Alaeddinoglu, N.G., Hasirci, N., Hasirci, V. Covalent immobilization of Aspergillus niger on phema membrane: Application to continuous flow reactors (1993) Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 58 (3), pp Cited 19 times. 57

62 BĠYOTEKNOLOJĠ BÖLÜM BAġKANLARI GÖREV TARĠHĠ ADI SOYADI (GIDA MÜH.) Prof. Dr. Faruk Bozoğlu (BĠYOLOJĠ) Prof. Dr. Gürdal Aleaddinoğlu (BĠYOLOJĠ) Prof. Dr. Ufuk Gündüz (KĠMYA MÜH.) Prof. Dr. Ġnci Eroğlu (KĠMYA) Prof. Dr. Nesrin Hasırcı (ÇEVRE MÜH.) Prof. Dr. Ülkü YetiĢ (GIDA MÜH.) Prof. Dr. Haluk Hamamcı (BĠYOLOJĠ) Prof. Dr. Meral Yücel (KĠMYA MÜH.) Prof. Dr. Suzan Kıncal (KĠMYA) Prof. Dr. Ayhan Sıtkı Demir (ÇEVRE MÜH.) Prof. Dr. F. Dilek Sanin (GIDA MÜH.) Prof. Dr. Zümrüt Ögel ( ) Prof. Dr. Candan Gürakan ( ) (GIDA MÜH.) Prof. Dr. Fatih Yıldız (BĠYOLOJĠ) Prof. Dr. Gülay Özcengiz (KĠMYA MÜH.) Prof. Dr. Ġnci Eroğlu (KĠMYA) Prof. Dr. Nesrin Hasırcı (ÇEVRE MÜH.) Prof. Dr. Filiz B. Dilek 58

63 BĠYOTEKNOLOJĠ EABD ÖĞRETĠM ÜYELERĠ 2014 Bilgisayar Mühendisliği Doç. Dr. Tolga Can Biyoteknoloji Doç. Dr. Can Özen (Bölüm BaĢkan Yrd.) Biyoloji Prof. Dr. Orhan Adalı Prof. Dr. Ufuk Gündüz Prof. Dr. Tülin Güray Prof. Dr. Vasıf Hasırcı Prof. Dr. Fatih Ġzgü Prof. Dr. Zeki Kaya Prof. Dr. Semra Kocabıyık Prof. Dr. Hüseyin Avni Öktem Prof. Dr. Gülay Özcengiz Prof. Dr. Feride Severcan Prof. Dr. Ġnci Togan Prof. Dr. Meral Yücel Doç. Dr. Sreeparna Banerjee Doç. Dr. AyĢe Elif Erson Bensan Doç. Dr. AyĢegül Gözen Doç. Dr. Sertaç Önde Doç. Dr. ÇağdaĢ Son Doç. Dr. Mayda Gürsel Doç. Dr. Tülin Yanık Yrd. Doç. Dr. Mehmet Somel Çevre Mühendisliği Prof. Dr. Göksel Demirer Prof. Dr. Filiz Bengü Dilek (Bölüm BaĢkanı) Prof. Dr. F. Celal Gökçay Prof. Dr. F. Dilek Sanin Prof. Dr. Ülkü YetiĢ Doç. Dr. Tuba Hande Ergüder Bayramoğlu Doç. Dr. Bülent Ġçgen Dr. Robert W. Murdoch 59

64 Gıda Mühendisliği Prof. Dr. Alev Bayındırlı Prof. Dr. Faruk Bozoğlu Prof. Dr. G. Candan Gürakan Prof. Dr. Haluk Hamamcı Prof. Dr. Zümrüt Begüm Ögel (emekli) Prof. Dr. Fatih Yıldız (emekli) Doç. Dr. Deniz Çekmecelioğlu Yrd. Doç. Dr. YeĢim Soyer Yrd. Doç. Dr. Halil Mecit Öztop Kimya Prof. Dr. Mahinur Akkaya Prof. Dr. Erdal Bayramlı Prof. Dr. Ayhan Sıtkı Demir (vefat) Prof. Dr. Nesrin Hasırcı Prof. Dr. Cihangir Tanyeli Prof. Dr. Levent Toppare Doç. Dr. Nursen Çoruh Yrd. Doç. Dr. Ġrem Erel Yrd. Doç. Dr. Salih Özçubukçu Kimya Mühendisliği Prof. Dr. Ufuk BölükbaĢı Prof. Dr. Ġnci Eroğlu Prof. Dr. Pınar Çalık Yrd. Doç. Dr. Harun Koku Yrd. Doç. Dr. Erhan Bat Mühendislik Bilimleri Doç. Dr. Dilek Keskin Doç. Dr. AyĢen Tezcaner 60

65 ÖĞRETĠM ÜYELERĠ BĠLGĠLERĠ Prof. Dr. Alev Bayındırlı ÇalıĢmaAlanları Food Engineering (Fruit and vegetable processing, food enzymes) Biotechnology (Production of enzymes) Lisans, ODTÜ, Kimya Mühendisliği M.S., ODTÜ, Gıda Mühendisliği PhD., ODTÜ, Gıda Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Alev Bayindirli (Editor) Enzymes in Fruit and Vegetable Processing: Chemistry and Engineering Applications CRC press/taylorand Francis Group,USA, 2010 Umut Yücel, Hami Alpas and Alev Bayındırlı Evaluation of High Pressure Pretreatment for Enhancing the Drying Rates of Carrot, Apple, and Green Bean Journal of Food Engineering (2010)98: M.D. Avsaroglu, F. Bozoglu F, M. Akcelik, A. Bayındırlı Effect of High Pressure on Lactococcal Bacteriophages Journal of Food Safety (2009) Volume: 29: I. Hasbay Adil, M.E. Yener, A. Bayındırlı Extraction of total phenolics of sour cherry pomace by high pressure solvent and subcritical fluid and determination of the antioxidant activities of the extracts Separation Science and Technology (2008) 43: I. Hasbay Adil, H., I. Çetin, M.E.Yener, A. Bayındırlı Subcritical (carbon dioxide + ethanol) extraction of polyphenols from apple and peach pomaces, and determination of the antioxidant activities of the extracts Journal of Supercritical Fluids (2007) 43 (2007):

66 Doç. Dr. AyĢe Elif Erson Bensan ÇalıĢmaAlanları Identification and characterization of novel genes that are abnormally expressed in breast cancer cells. Investigation of the role of non-coding RNAs (micrornas) in neoplatic transformation events Investigation of polyadenylation mechanisms and their impact on mrna profiles when deregulated in cancer cells. Lisans,ODTÜ, Biyoloji M.S., University of Michigan, Ġnsan Genetiği Ph.D., University of Michigan, Ġnsan Genetiği SeçilmiĢ Yayınları H. Begum Akman and A. Elif Erson-Bensan. Alternative Polyadenylation and Its Impact on Cellular Processes. MicroRNA 2014; 3(1):2-9 Akman BH, Can T, Erson-Bensan AE. Estrogen-induced upregulation and 3'-UTR shortening of CDC6. Nucleic Acids Res Nov;40(21): Akhavantabasi S, Sapmaz A, Tuna S, Erson-Bensan AE, mir-125b targets ARID3B in breast cancer cells. Cell Structure and Function. 2012; 37(1):27-38 Astarci E, Erson-Bensan AE, Banerjee S. MMP16 expression is downregulated by microrna-146a in spontaneously differentiating Caco-2 cells. Dev Growth Differ Feb 20. doi: /j X x. Ozek NS, Tuna S, Erson-Bensan AE, Severcan F. Characterization of microrna-125b expression in MCF7 breast cancer cells by ATR-FTIR spectroscopy. Analyst Dec 15;135(12): Keller JA, Erson-Bensan AE and Petty EM, Connections between CHFR, the cell cycle, and chemosensitivity: Are they critical in cancer?, Cancer Biol Ther.2010 Nov 6;10(9). Akhavantabasi S, Akman HB, Sapmaz A, Keller J, Petty EM, Erson AE. USP32 is an active, membrane bound ubiquitin protease overexpressed in breast cancers. Mamm Genome Aug; 21(7-8): Erson AE, Petty EM mirnas and cancer: New research developments and potential clinical applications, Cancer Biol Ther.2009 Dec; 8 (24): Selcuklu DS, Yakicier C, Erson AE. An investigation of microrna genes mapping to genomic instability regions in breast cancer. Cancer Genet Cytogenet. 2009,189(1):15-23 Sukas S, Erson AE, Sert C, Kulah H, A parylene based double-channel micro-electrophoresis system for rapid mutation detection via heteroduplex analysis. Electrophoresis. 2008, 29:

67 Doç. Dr. AyĢegül Gözen ÇalıĢmaAlanları Physiology and genetics of freshwater bacteria; Nosocomial infections; bacterial pneumonia Lisans,ODTÜ, Biyoloji Ph.D., Michigan State University, Mikrobiyoloji SeçilmiĢ Yayınları Baysallar, M., Güçlü, A.U., Yetiser, S., Kiliç, A., Gözen, A.G., Açikel, C. Comparison of culture and PCR methods in detection of haemophilus influenzae, streptococcus pneumoniae and moraxella catarrhalis in children with otitis media with effusion Turkiye Klinikleri Journal of Medical Sciences. 33 (1): ÖzaktaĢ, T., TaĢkın, B., Gözen A.G. High level antibiotic resistance among fish surface associated bacterial populations in non-aquaculture freshwater environment. Water Research (19) Kocer, Z.A., Gozen, A.G., Önde, S., Kaya, Z. Indirect organogenesis from bud explants of Juniperus communis L. : Effects of genotype, gender, sampling time, and growth regulator combinations Dendrobiology 66: Taskin, B., Gozen, A.G., Duran, M. Selective quantification of viable Escherichia coli bacteria in biosolids by quantitative PCR with propidium monoazide modification Applied and Environmental Microbiology 77 (13), Dogan, O., Babız, H., Gozen, A.G., Budak, S. Synthesis of 2-aziridinyl phosphonates by modified Gabriel-Cromwell reaction and their antibacterial activities European Journal of Medicinal Chemistry 46 (6), Garip, S., Gozen A.C., Severcan, F. Use of Fourier transform infrared spectroscopy for rapid comparative analysis of Bacillus and Micrococcus isolates Food Chemistry 113(4): Beklioğlu, M., Gözen, A.G., Yıldırım, F. Zorlu, P. and Önde, S. Ġmpact of food levels in trade-off between temperature and fish predation pressure in vertical distribution of Daphnia Hydrobiologia 614(1): Beklioğlu, M., Telli, M. and Gözen, A.G. Fish and mucus-dwelling bacteria interact to produce a kairomone that induces diel vertical migration in Daphnia Freshwater Biology 51:

68 Doç. Dr. AyĢen Tezcaner ÇalıĢma Alanları Biyomalzemeler Doku Mühendisliği EriĢkin Kök Hücreler Ġlaç Salım Sistemleri Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoteknoloji PhD., ODTÜ, Biyoteknoloji SeçilmiĢ Yayınları O.Erdemli, S. Ozen, D. Keskin, A. Usanmaz, E. D. Batu, B. Atilla, A. Tezcaner, In vitro evaluation of effects of sustained anti-tnf release from MPEG-PCL-MPEG and PCL microspheres on human rheumatoid arthritis synoviocytes, Journal of Biomaterial Applications 2014 DOI: / Ocal Y, Kurum B, Karahan S, Tezcaner A, Ozen S, Keskin D. Characterization and Evaluation of Triamcinolone, Raloxifene, and Their Dual-Loaded Microspheres as Prospective Local Treatment System in Rheumatic Rat Joints Journal of Pharmaceutical Sciences, 2014 Jun 17. doi: /jps O. Erdemli, A.Usanmaz, D. Keskin, A.Tezcaner, Characteristics and release profiles of MPEG-PCL- MPEG microspherescontaining immunoglobulin G Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, Volume 117, N. E. Vrana, O. Erdemli, G. Francius, A. Fahs, M. Rabineau, C. Debry, A. Tezcaner, D. Keskin, P. Lavalle Double entrapment of growth factors by nanoparticles loaded into polyelectrolyte multilayer film Journal of Materials, J. Mater. Chem. B, 2014, 2, Yaprakci, V., Erdemli, O., Kayabolen, A., Tezcaner, A., Bozkurt F. and D. Keskin In vitro/in vivo comparison of cefuroxime release from poly(ε-caprolactone) calcium sulfate implants for osteomyelitis treatment, Biotechnol Appl Biochem Nov-Dec;60(6): doi: /bab.111. Erdoğ, A., Putra Limasale, Y.D., Keskin D., Tezcaner A., Banerjee S. In Vitro Characterization of a Liposomal Formulation of Celecoxib Containing 1,2-Distearoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine, Cholesterol, and Polyethylene Glycol and its Functional Effects Against Colorectal Cancer Cell Lines. Journal of Pharmaceutical Sciences, Jul 29. doi: /jps (2013) Kavas, A., Tuncay, S., Banerjee, S., Keskin D. ve Tezcaner A. Potential of Raloxifene in reversing osteoarthritis-like alterations in rat chondrocytes: An in vitro model study. Journal of Biosciences, 38, (2013) 64

69 Doç. Dr. Bülent Ġçgen ÇalıĢma Alanları Bacterial degradation & transformation & detoxification Bioremediation of contaminated environments Biotechnology of aerobic & anaerobic waste treatment Metabolic engineering & catabolic genes Biomolecular tools in engineering applications Biomarkers & bioindicators & DNA probes Environmental omic technologies Lisans, Hacettepe Üniversitesi, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoteknoloji PhD., ODTÜ, Biyoteknoloji SeçilmiĢ Yayınları Icgen, B. and Yilmaz F. Co-occurrence of antibiotic and heavy metal resistance in Kızılırmak river isolates (2014) Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology, doi: /s Cerit, S., Yilmaz, F., and Icgen, B. Challenging tin toxicity by a novel strain isolated from fresh waters (2014) Desalination and Water Treatment, doi: / Yilmaz, F. and Icgen, B. Characterization of SDS-degrading Delftia acidovorans and in situ monitoring of its temporal succession in SDS-contaminated surface waters (2014) Environmental Science and Pollution Research, 21 (12), Akbulut, S., Yilmaz, F., and Icgen, B. Surface water isolates of hemolytic and non-hemolytic Acinetobacter with multiple drug and heavy metal resistance ability (2014) Journal of Water and Health, 12 (1), Yilmaz, F., Orman, N., Serim, G., Kochan, C., Ergene, A., and Icgen, B. Surface water-borne multidrug and heavy metal-resistant Staphylococcus isolates characterized by 16S rdna sequencing (2013) Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology, 91 (6), Koc, S., Kabatas, B., and Icgen, B. Multidrug and heavy metal-resistant Raoultella planticola isolated from surface water (2013) Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology, 91 (2), Aktan, Y., Tan, S., and Icgen, B. Characterization of lead-resistant river isolate Enterococcus faecalis and assessment of its multiple metal and antibiotic resistance (2013) Environmental Monitoring and Assessment, 185 (6), Ozer, G., Ergene, A., and Icgen, B. Biochemical and molecular characterization of strontium-resistant environmental isolates of Pseudomonas fluorescens and Sphingomonas paucimobilis (2013) Geomicrobiology Journal, 30 (5),

70 Doç. Dr. Can Özen ÇalıĢmaAlanları Peptide Drug Discovery and Design Venomics Lisans,ODTÜ, Biyoloji PhD, University of Tennessee-Oak Ridge National Labs, Knoxville, TN, USA, Biyokimya SeçilmiĢ Yayınları Kırdeciler K, Özen C, Akata B. Fabrication of nano- to micron-sized patterns using zeolites: Its application in BSA adsorption. Microporous and Mesoporous Materials 2014, 191, [SCI] Hocaoglu, I, Cizmeciyan, MN, Erdem, R, Ozen, C, Kurt, A, Sennaroglu, A, Acar HY. Development of highly luminescent and cytocompatible near-ir-emitting aqueous Ag2S quantum dots. J. Mater. Chem. 2012, 29 (22), Sevinc E, Ertas FS, Ulusoy G, Ozen C and Acar HY. (2012) Meso-2,3-dimercaptosuccinic acid: From Heavy Metal Chelation to CdS Quantum Dots. J. Mater. Chem., 2012, 22 (11), Cansiz S, Ozen C, Bayrac C, Bayrac AT, Gul F,Kavruk M, Yilmaz R, Eyidogan F, Oktem HA. A sandwich-type DNA array platform for detection of GM targets in multiplex assay. European Food Research and Technology, 2012; 3(235), Prado M E; Almeida R A; Ozen C; Luther D A; Lewis M J; Headrick S J; Oliver S P (2011) Vaccination of dairy cows with recombinant Streptococcus uberis adhesion molecule induces antibodies that reduce adherence to and internalization of S. uberis into bovine mammary epithelial cells. Veterinary immunology and immunopathology 2011; 141(3-4): Norris AL, Ozen C, Serpersu EH (2010). Thermodynamics and kinetics of association of antibiotics with the aminoglycoside acetyltransferase (3)-IIIb, a resistance-causing enzyme. Biochemistry 2010; 49(19): Serpersu EH, Özen C, Norris AL, Stern C, Whittemore NA (2010). Backbone resonance assignments of a promiscuous aminoglycoside antibiotic resistance enzyme; the aminoglycoside phosphotransferase(3')-iiia. Biomol NMR Assign, 2010; 4(1):

71 Prof. Dr. G. Candan Gürakan ÇalıĢmaAlanları Food microbiology Hygiene Molecular identification and characterization of bacteria Lactic acid bacteria Detection of genetically modified microorganisms Pathogenic bacteria Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyokimya PhD., ODTÜ, Biyokimya SeçilmiĢ Yayınları Nielsen, B., Gurakan G.C., Unlu G Kefir: a multifaceted fermented dairy product. Probiotics and antimicrobial Proteins. DOI /s Altay-Dede, N., Acar-Soykut E., Gurakan, G.C Phenotypic diversity and technologica properties of yogurt cultures isolated from traditionally produced Turkish yogurts with comparison to commercial starter cultures. Italian Journal of Food Science 26, Ghazi F., Benmechernene, Z., Kihal, M., Gurakan, G.C The reproducibility of random amplified polymorphic DNA (RAPD) profiles of Streptococcus thermophilus strains with XD9, M13 and OPI-02 MOD primers. African Jornal of Biotechnology, 12, Kayagil, Fulya and G. Candan Gurakan Effects of starter culture combinations using isolates from traditional cheese of Turkish white cheese, International Journal of Dairy Technology, 62, Gürakan, G.C. and Altay, N. Yogurt Microbiology and Biochemistry In Development and Manufacture of Yogurt and other Functional Dairy Products, Fatih Yıldız (Ed) CRC Press Taylor and Francis Group, Fl, USA. (ISBN: ). Gürakan, G.C. and Cebeci, A. Barboros Özer. Probiotic Dairy Beverages: Microbiology and Technology.In Development and Manufacture of Yogurt and other Functional Dairy Products, Fatih Yıldız (Ed) CRC Press Taylor and Francis Group, USA. (ISBN: ). pp Gürakan, G.C., Aydin, G. and Yilmaz, R Qualitative detection of GM maize (Bt 11) in food and feed sold commercially in Turkey by PCR based methods. Indian Journal of Biotechnology, 10: Cebeci, A. and Gurakan, G.C Comparative typing of L. delbruckeii subsp bulgaricus strains using multilocus sequence typing and RAPD-PCR. European Food Research and Technology 233,

72 Prof. Dr. F. Celal Gökçay ÇalıĢmaAlanları Biodegradation of unusual compounds Bio-leaching and recovery of mining residues and wastes Bacterial desulfurization of coals Microbial solubilization of lignites Activated sludge kinetics. Nutrient removing activated sludge. Effect of heavy metals on activated sludge kinetics Biological treatment of paper pulp bleachery effluents Treatability of chlorinated organic compounds PhD., University of Wales, UC Cardiff, Microbiology SeçilmiĢ Yayınları U. G. Ozkan-Yucel, C. F. Gökçay, Application of ADM1 model to a full-scale anaerobic digester under dynamic organic loading conditions. "Environmental Technology ", 31, (2010), p Umay Gokce Ozkan Yucel, Celal Ferdi Gokcay, Effect of Initial Azo Dye Concentration and Biomass Acclimation on Sludge Digestion and Dye Co-treatment.. "Clean-Soil, Air, Water ", 38, (2010), p Cisem Yigita, Gulnur Madena, Nur Disaa, Ozge Yılmaza, Abdullah Ogutvericia, Emre, Hazardous waste management in Turkey: current legislative requirements and future challenges. ". Desalination and Water Treatment ", 26, (2011), p Okan Tarık Komesli, Sezgin Bakırdere, Ceren Bayören and Celal F Gokcay., Simultaneous determination of selected endocrine disrupter compounds in wastewater samples in ultra trace levels using HPLC-ES-MS/MS. "Environment and Assessment ", , (2011), p.. M. Muz, M. S. Sonmez, O. T. Komesli, S. Bakırdere and C. F. Gokcay, Determination of selected natural hormones and endocrine disrupting compounds in domestic wastewater treatment plants by liquid chromatography electrospray ionization tandem mass spectrometry after solid phase extraction. "Analyst", 137, (2012), p

73 Prof. Dr. Cihangir Tanyeli ÇalıĢmaAlanları Organik kimya Lisans, ODTÜ, Kimya M.S., ODTÜ, Kimya PhD., ODTÜ, Kimya SeçilmiĢ Yayınları Elif K. Unver, Simge Tarkuc, Derya Baran, Cihangir Tanyeli, Levent Toppare, Synthesis of new donor acceptor polymers containing thiadiazoloquinoxaline and pyrazinoquinoxaline moieties: lowband gap, high optical contrast, and almost black colored materials. "Tetrahedron Letters", 52, (2011), p Hüseyin Karaca, Serdar Sezer, Cihangir Tanyeli, Synthesis of L-prolinol substituted novel optically active phthalocyanines. "Dyes & Pigments", 90, (2011), p Elif K. Unver, Simge Tarkuc, Yasemin A. Udum, Cihangir Tanyeli, Levent Toppare, The effect of the donor unit on the optical properties of polymers. "Organic Electronics", 12, (2011), p Gumus, A., Tanyeli, C., Stereoselective synthesis of gamma-lactone fused cyclopentanoids."tetrahedron:asymmetry",, (2012), p Sezer, S., Gumrukcu, Y., Bakırcı, I., Unver, M. Y., Tanyeli, C., Stereoselective synthesis of optically active cyclopenta[c]pyridines and tetrahydropyridines. "Tetrahedron:Asymmetry",, (2012), p Demirci, S., Emre, F., Ekiz,F., Oguzkaya,F., Timur, S., Tanyeli, C., Toppare, L., Functionalization of poly SNS anchored carboxylic acid with Lys and PAMAM: surface modifications for biomolecule immobilization stabilization and biosensing applications. "Analyst",, (2012), p

74 Doç. Dr. ÇağdaĢ Devrim Son ÇalıĢmaAlanları Membrane proteins, Protein-protein interactions, GPCRs, nachrs, Fluorescence proteins, Confocal microscopy, Total Internal Reflection Fluorescence microscopy, FRET, HPLC, Mass spectrometry, MALDI-TOF, protein purification, Photo affinity cross-linking Lisans,ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoloji Ph.D., University of Tennessee, Knoxville, Biyokimya SeçilmiĢ Yayınları Srinivasan R, Pantoja R, Moss FJ, Mackey ED, Son CD, Miwa J, Lester HA. Nicotine up-regulates α4β2 nicotinic receptors and ER exit sites via stoichiometry-dependent chaperoning. J Gen Physiol (2011) Jan;137(1):59-79 Cagdas D. Son, Fraser J. Moss, Bruce N. Cohen, Henry A. Lester. Nicotine Normalizes Intracellular Subunit Stoichiometry of Nicotinic Receptors Carrying Mutations linked to Autosomal Dominant Nocturnal Frontal Lobe Epilepsy. Molecular Pharmacology (2009) May;75(5): Lester HA, Xiao C, Srinivasan R, Son CD, Miwa J, Pantoja R, Banghart MR, Dougherty DA, Goate AM, Wang JC. Nicotine is a Selective Pharmacological Chaperone of Acetylcholine Receptor Number and Stoichiometry. Implications for Drug Discovery. AAPS J. (2009) March; 11(1): George K. E. Umanah, Cagdas Son, FaXiang Ding, Fred Naider and Jeffrey M. Becker. Cross-Linking of a DOPA-Containing Peptide Ligand into Its G Protein-Coupled Receptor.Biochemistry (2009) March; 48(9): Li-Yin Huang, George Umanah, Melinda Hauser, Cagdas Son, Boris Arshava, Fred Naider, and Jeffrey M. Becker. Unnatural amino acid replacement in a yeast G protein-coupled receptor in its native environment. Biochemistry (2008) May; 47(20): Byung-Kwon Lee, Kyung-Sik Jung, Cagdas Son, Heejung Kim, Nathan C. VerBerkmoes, Boris Arshava, Fred Naider, and Jeffrey M. Becker. Affinity purification and Characterization of a G-Protein Coupled Receptor, Saccharomyces cerevisiae Ste2p. Protein Expression and Purification (2007) Nov; 56(1): Cagdas D. Son, Hasmik Sargsyan, Hurst GB, Fred Naider, Jeffrey M. Becker. Analysis of Ligand- Receptor Cross-linked Fragments by Mass Spectrometry. Journal of Peptide Research (2005) Mar; 65(3):

75 Doç. Dr.Deniz Çekmecelioğlu ÇalıĢmaAlanları Microbial conversion of food and agricultural byproducts to value-added products Bio-chemical treatment of foods, food and agricultural wastes Food safety Modeling and optimization of food and agricultural processing systems Lisans, Gaziantep Üniversitesi, Gıda Mühendisliği M.S., Gaziantep Üniversitesi, Gıda Mühendisliği PhD., Pennsylvania State University, Agric And Biolo Eng SeçilmiĢ Yayınları Cekmecelioglu, D. and O.N. Uncu. Kinetic modeling of enzymatic hydrolysis of pretreated kitchen wastes for enhancing bioethanol production. Waste Management (2012), Celebioglu, H.Y., D. Cekmecelioglu, M. Dervisoglu, T. Kahyaoglu. Effect of extraction conditions on hemicellulose yields and optimisation for industrial processes. International Journal of Food Science and Technology (2012), Uncu, O.N. and D. Cekmecelioglu Cost-effective approach to ethanol production and optimization by response surface methodology. Waste Management 31: Gurkok, S., D. Cekmecelioglu, and Z.B. Ogel Optimization of culture conditions for Aspergillus sojae expressing an Aspergillus fumigatus α-galactosidase. Bioresource Technology 102: Ozturk, B., D. Cekmecelioglu, and Z. B. Ogel Optimal conditions for enhanced β-mannanase production by recombinant Aspergillus sojae. Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic 64:

76 Doç. Dr. Dilek Keskin ÇalıĢmaAlanları Biomaterials Controlled drug delivery systems Biomaterials for bone, cartilage and skin Biomechanics Osteoporosis, osteoarthritis Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoteknoloji PhD., ODTÜ, Biyoteknoloji SeçilmiĢ Yayınları Deniz A., A. Sade, F. Severcan, D. Keskin, A. Tezcaner, S Banerjee, Celecoxib loaded liposomes: effect of cholesterol on encapsulation and in vitro release characteristics. "Bioscience Reports", 30, (2010), p Erdemli, O., O. Çaptug, H. Bilgili, D. Orhan, A. Tezcaner ve D. Keskin, In Vitro and In Vivo Evaluation of the Effects of Demineralized Bone Matrix or Calcium Sulfate Addition to Polycaprolactone-Bioglass Composites. "Journal of Materials Science: Materials in Medicine", 21, (2010), p Tasci, A., H. Bilgili, H. Altunay, M.R. Geçit ve D. Keskin, Biomechanical and Histological Outcome of Combined Raloxifene-Estrogen Therapy on Skeletal and Reproductive Tissues. "European Journal of Pharmacology", 327, (2010), p Basar, B., A. Tezcaner, D. Keskin, ve Z. Evis, Improvements in microstructural, mechanical, and biocompatibility properties of nano-sized hydroxyapatites doped with yttrium and fluoride. "Ceramics International", 10, (2010), p Tasci, A.G, H. Bilgili, H. Altunay, M.R. Gecit, D. Keskin, Prospective evaluation of Vitamin K2, Raloxifene and their co-administration in osteoporotic rats. "European Journal of Pharmaceutical Sciences", 17, (2011), p Basar B., A. Tezcaner, D. Keskin, Z. Evis, Synthesis, phase transitions and cellular biocompatibility of nanophase alumina hydroxyapatite composites. "Advances in Applied Ceramics", 110, (2011), p Akturk, O., A. Tezcaner, H. Bilgili, M.S. Deveci, M.R. Gecit, D. Keskin, Evaluation of sericin/collagen membranes as prospective wound dressing biomaterial. "Journal of Bioscience and Bioengineering", 112, (2011), p

77 Prof. Dr. F. Dilek Sanin ÇalıĢmaAlanları Biodegradation and removal of xenobiotic compounds Recevery of bioenergy from wastewater sludge Microbial extracellular polymers and use in water and wastewater treatment Bioflocculation of pure and mixed culture microorganisms Lisans, ODTÜ, Çevre Mühendisliği M.S., ODTÜ, Çevre Mühendisliği PhD., Duke University, Çevre Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Ömeroğlu, S. ve Sanin, F.D. Fate and degradation kinetics of nonylphenol compounds in aerobic batch digesters. Water Research 64, 1-12, Zorba, G. T. ve Sanin, F. D. Disintegration of Sludge by Sonication and Improvement of Methane Production Rates in Batch Anaerobic Digesters. Clean Soil, Air, Water, 41, 4, , Kıvılcımdan Moral, C. ve Sanin, F.D., An Investigation of Agitation Speed as a Factor Affecting the Quantity and Monomer Distribution of Alginate from Azotobacter vinelandii ATCC "Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology", 39, , Kıvılcımdan Moral, Ç., Doğan, Ö. ve Sanin, F.D. Use of Laboratory-grown Bacterial Alginate in Copper Removal. Water Science and Technology 65, 11, , Koksoy, G. T. ve Sanin, F. D., Effect of digester F/M ratio on gas production and sludge minimization of ultrasonically treated sludge. "Water Science and Technology ", 62, , Apul, O. G., ve Sanin, F. D., Ultrasonic pretreatment and subsequent anaerobic digestion under different operational conditions. "Bioresource Technology ", 101, , Kara, F., Gürakan, C. G. ve Sanin, F.D. Monovalent Cations and their Influence on Activated Sludge Floc Chemistry, Structure and Physical Characteristics. Biotechnology and Bioengineering 100, 2, , Sesay, M. L., Özcengiz, G. ve Sanin, F.D. Enzymatic Extraction of Activated Sludge Extracellular Polymers and Implications on Bioflocculation. Water Research 40, 7, , Onur Guven Apul, Ilgin Dogan, F. Dilek Sanin, Can Capillary Suction Time be an Indicator for Sludge Disintegration?. "JOURNAL OF RESIDUALS SCIENCE & TECHNOLOGY", 6, (2009), p

78 Prof. Dr. Erdal Bayramlı ÇalıĢmaAlanları Fiziksel kimya Lisans, ODTÜ, Kimya M.S., ODTÜ, Kimya PhD., Mcgill University, Kimya SeçilmiĢ Yayınları Doğan M., Yılmaz A., Bayramlı E., Synergistic effect of boron containing substances on flame retardancy and thermal stability of intumescsnt polypropylene composites. "Polymer Degradation and stability", 95, (2010), p Nihat Ali IĢıtman, Mehmet Doğan, Erdal Bayramlı and Cevdet Kaynak, Fire Retardent Properties of Intumescent P0lypropylene Composites filled with Calcium Carbonate. "Polymer Engineering and Science", 51, (2011), p Mehmet Doğan, AyĢen Yılmaz and Erdal Bayramlı, Effect of Boron Containing Materials on Flammability and Thermal Degradation of Polyamide-6 Composites Containing Melamine Cyanurate."Polymers for Advanced Technologies", 22, (2011), p Erdal Bayramlı et al, Physical Properties and Cure Characteristics of Natural Rubber/Nanoclay Composites with Two Different Compatibilizers. "Journal of Applied Polymer Science", 121, (2011), p Mehmet Doğan and Erdal Bayramlı, Synergistic Effect of Boron Containing Substances on Flame Retardancy and Thermal Stability of Clay Containing Intumescent Polypropylene Nanoclay Composites."Polymers for Advanced Tchnologies", 22, (2011), p

79 Yrd. Doç. Dr. Erhan Bat ÇalıĢmaAlanları Polymers for Biomedical Applications Micro and Nanofabrication Techniques Design and Fabrication of Functional Materials and Surfaces Lisans, ODTÜ, Kimya Mühendisliği M.S., ODTÜ, Kimya Mühendisliği PhD., University of Twente, Polymer Chemistry and Biomaterials Group SeçilmiĢ Yayınları E. Bat, E.W. Lin, S. Saxer, H.D. Maynard Morphing Hydrogel Patterns by Thermo-Reversible Fluorescence Switching Macromolecular Rapid Communications, 2014, 35: E. Bat, Z. Zhang, J. Feijen, D.W. Grijpma, A.A. Poot Biodegradable Elastomers for Biomedical Applications and Regenerative Medicine Regenerative Medicine, 2014, 9: R. de la Rica*, E. Bat*, K.L. Herpoldt, H. Xie, H.D. Maynard, M.M. Stevens Nanoparticle Growth via Concentration Gradients Generated by Enzyme Nanopatterns Advanced Functional Materials, 2014, 24: (* co-first author, inside front cover article). Z.P. Tolstyka, W. Richardson, E. Bat, C.J. Stevens, D.P. Parra, J.K. Dozier, M.D. Distefano, B. Dunn,and H.D. Maynard. Chemoselective Immobilization of Proteins by Microcontact Printing and Bioorthogonal Click Reactions ChemBioChem 2013, 14: P.F. Moonen, E. Bat, W.P. Voorthuijzen, J. Huskens. Soft-lithographic Patterning of Room Temperature Sintering Ag Nanoparticles on Foil RSC Advances 2013; 3: J. Lee, E.W. Lin, U.Y. Lau, J.L. Hedrick, E. Bat, H.D. Maynard. Trehalose Glycopolymers as Excipients for Protein Stabilization Biomacromolecules 2013; 14(8): E. Bat, T.G. van Kooten, J.A. Plantinga, M.C. Harmsen, M.J.A. van Luyn, J. Feijen, D.W. Grijpma. Physical Properties and Erosion Behavior of Poly(trimethylene carbonate co-e-caprolactone) Networks Macromolecular Bioscience 2013; 13(5): E. Bat, T.G. van Kooten, J. Feijen, D.W. Grijpma. Crosslinking of Trimethylene Carbonate and D,Llactide (Co)polymers by Gamma Irradiation in the Presence of Pentaerythritol Triacrylate, Macromolecular Bioscience 2011;11(7):

80 Prof. Dr. Faruk Bozoğlu ÇalıĢmaAlanları Food Microbiology Biochemistry Biotechnology Lisans, ODTÜ, Kimya M.S., ODTÜ, Kimya PhD., North Carolina State University, Food Science SeçilmiĢ Yayınları Bozoglu Faruk, Inactivation Mechanisms of Different Mycotoxins, NATO Advanced Research Workshop on Advances in Food Security and Safety against Terrorist Threats and Natural Disasters, ADVANCES IN FOOD PROTECTION: FOCUS ON FOOD SAFETY AND DEFENSE, Book Series: NATO Science for Peace and Security Series A-Chemistry and Biology, , 2011 Stanciugelu, H, Alpas, D. Stanescu F. Bozoglu: A social cognitive perspective of terrorism risk perception on food chain security. ESA RN 22 Sociology of risk and umcertainity Conference. (21). Sweeden, 2011 Stanciugelu, H, Alpas, D. Stanescu, F. Bozoglu and S.Stan; Terrorism risk perception and crisis communication planning. ESA 10 th Conference-Social Relations in Turbulent Times. (30), Switzerland BOZOGLU F and SAGDICOGLU CELEP A.G, Polyphenolic and Probiotic Ingredients of Common Foods in Turkish Diet and their Health Benefits. Bioactive compounds and Functional Foods in Health and Diseases. 10 (68-70). Texas,USA 2012 Ceylan Cagatay; Severcan Feride; Ozkul Aykut; et al. Biophysical and microbiological study of high hydrostatic pressure inactivation of Bovine Viral Diarrheavirus type 1 on serum ; VETERINARY MICROBIOLOGY, 154 : 3-4, DOI: /j.vetmic JAN,

81 Prof. Dr. Fatih Ġzgü ÇalıĢmaAlanları Pharmaceutical Biotechnology; Yeast genetics and molecular biology; Mammalian cell culture technology Lisans, Ankara Üniversitesi M.S., Ankara Üniversitesi Ph.D., Ankara Üniversitesi, Farmasötik Biyoloji SeçilmiĢ Yayınları Fatih Izgu, Demet Altinbay, Ayfer Yucelis, Identification and killer activity of a yeast contaminating starter cultures of Saccharomyces cerevisiae strains used in Turkish baking industry. "Food Microbiology ", 14, (1997), p Fatih Izgu, Demet Altinbay, Killer toxins of certain yeast strains have potential growth inhibitory activity on Gram-positive pathogenic bacteria. "Microbios ", 89, (1997), p Fatih izgu et.al, Biological substances (chapter ın a book). "European Pharmacopeia", 3, (1999), p Fatih Izgu, Demet Altınbay, Armagan Koçer, Isolation and characterization of K6 type yeast killer protein. "Microbios", 99, (1999), p Fatih Ġzgü, Demet Alyınbay, Yasemin Derinel, Immunization of saccharomyces cerevisiae to a contaminating killer toxin producing candida tropicalis. "Food Microbiology", 21, (2004), p Fatih Ġzgü, Demet Altınbay, Isolation and characterization of the K-5 type yeast killer protein and its homology with an exo-beta-1,3 - glucanase. "Bioscience, Biotechnology, Biochemistry", 68, (2004), p Fatih Izgü, Demet Altınbay, Abdullah Sertkaya, Enzymic Activity of the K5 Type Yeast Killer Toxin and its Characterization. "Biosci. Biotechnol. Biochem.", 69, (2005), p Ġzgü, F., Altınbay, D., Acun T, Killer toxin of Pichia anomala NCYC 432; Purification, characterization and its exo-β-1,3 glucanase activity. "Enzyme and Microbial Technology", 39, (2006), p Fatih Ġzgü, Demet Altınbay Akif Emre Türeli, In vitro activity of panomycocin, a novel exo-β-1,3- glucanase isolated from Pichia anomala NCYC 434, against dermatophytes. "Mycoses", 50, (2007), p Fatih Izgü, Demet Altınbay, Akif Emre Türeli, In Vitro Susceptibilities of Candida spp. to Panomycocin, a Novel Exo-β-1,3-Glucanase Isolated from Pichia anomala NCYC 434. "Microbiol. Immunol.,", 51, (2007), p

82 Prof. Dr. Fatih Yıldız ÇalıĢmaAlanları Health and Food ; Nutritional needs of Hormonal system and Somatic cell nutrition. Photovoltaics in Food and agricultural Industries. Food Traceability based on DNA fingerprinting, RFID applications in packaging, and storage ; GIS sytems in agricultural Production. Effects of Packaging on food product safety, and sensory quality. Lisans, Atatürk Üniversitesi M.S., University of Maryland,College Park U.S.A Ph.D., University of Maryland,College Park U.S.A SeçilmiĢ Yayınları YILDIZ F.(2015) Novel Natural Ingredients and Technologies to Provide Stable and Clean Label Products, (Accepted for publication), online journal, Cogent Food and Agriculture, Published by Taylor and Francis Group, New York,NY,USA YILDIZ F.,(2014) Pro and prebiotic addition to baby formulas and nutritional indices for infants. First 1000 days of mother and infant Nutrition Congress : From Fetal Life to childhood. Ministry of Health and YĠSAV Foundation, March 27-29, 2014, J.W. MARRIOT HOTEL, ANKARA,Turkey. YILDIZ F.(2014)Molecular Health Indicators of Functional Foods: Emerging ingredients for the food and beverage sectors. Fi Food Ingredients Conference 2014,Ġstanbul, Mogan International Research Center Publication No:1. YILDIZ F.,ĠLALAN K.(2013) ODTÜ Gıda Ambalaj Malzemeleri AraĢtırma Projesi. ODTÜ Gıda Mühendisliği Bölümü AraĢtırma Raporu,191 sayfa, ODTÜ Ankara. METU Food packaging research papers. YILDIZ F.,(2013) Hydrolyzed proteins in infant formulas. (Bebek formulasyonlarında hidrolize kazein ve peyniraltı suyu proteinleri) Nutrition of Infants and mothers in the first 1000 days: From Fetal life to childhood life. Congress organized by Ministry of Health and YĠSAV Foundation) May 2013 Hilton Hotel,Ankara,Turkey. YILDIZ F. CÖMERT N.(2013) Stem cell nutrition in Human. Probiotics and Functional Foods Congress April 2013, Side Antalya, Organized by YILDIZ F.(2012) International,Food,Agriculture and Gastronomy Congress, in Antalya Belek, Turkish Agricultural Federation Publication No.10. METU-Department of Food Engineering, Ankara,Turkey. YILDIZ, F., Çelebi Celalettin R.,Uçar Ömür (2010) Measuring Emotions among Perfume consumers by EMG Technique 1st World Congress on Olfaction and Issues,November 4-5,2010,Maison de la Recherche, Paris, France 78

83 Prof. Dr. Feride Severcan ÇalıĢmaAlanları Molecular Biophysics; Cell Biophysics; Ecotoxilogy; Environmental Biophysics Lisans, Ankara Üniversitesi, Fizik M.S., Ankara Üniversitesi, Fizik Ph.D., Rochester University, Fizik Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Cakmak G., Miller L.M., Zorlu F., Severcan F., Amifostine, a Radioprotectant Agent, Protects Rat Brain Tissue Lipids against Ionizing Radiation Induced Damage: An FTIR Microspectroscopic Imaging Study, Archives of Biochemistry and Biophysics, 520, 67-73, Aksoy C, Guliyev A, Kilic E, Uckan D, Severcan F., Bone marrow mesenchymal stem cells in patients with beta thalassemia major: Molecular analyses with attenuated total reflection-fourier transform infrared (ATR-FTIR) spectroscopy study as a novel method,. Stem Cells Dev Jan 4. In press PMID: Bezirci, G., Akkas, S.B. Rinke, K., Yildirim, F., Kalaylioglu, Z., Severcan, F., Beklioglu, M. Impacts of salinity and fish-exuded kairomone on the survival and macromolecular profile of Daphnia pulex, Ecotoxicology, 21(2): , Ceylan, C., Severcan, F, Ozkul, A Severcan, M Bozoglu, F, Taheri, N Biophysical and microbiological study of high hydrostatic pressure inactivation of Bovine Viral Diarrheavirus type 1 on serum, Veterinary Microbiology, 154:266-,2012. Cakmak G, Zorlu F, Severcan M, and F. Severcan, Screening of Protective Effect of Amifostine on Radiation-Induced Structural and Functional Variations in Rat Liver Microsomal Membranes by FT- IR Spectroscopy, Analytical Chemistry, 83 (7) , Bozkurt O., Severcan M., Severcan F., Diabetes induces compositional, structural and functional alterations on rat skeletal soleus muscle revealed by FTIR spectroscopy: a comparative study with EDL muscle. "ANALYST ", 135, (2010), p Akkas SB, Kepenek AO, Beklioglu M, Severcan F. Mollecular approach to the chemical characterization of fish-exuded kairomone: a Fourier transform infrared spectroscopic study. "AQUATIC SCIENCES", 72, (2010), p Garip S., Severcan F., Low Concentration of Simvastatin is More Effective in Strengthening the Bone than High Concentration of Simvastatin Treatment. "Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 52, (2010), p

84 Prof. Dr. Filiz Bengü Dilek ÇalıĢmaAlanları Water and wastewater treatment Biological treatment of wastewaters Industrial wastewater treatment Microbiology of wastewater treatment Physico-chemical treatment processes Lisans, ODTÜ, Çevre Mühendisliği M.S., ODTÜ, Çevre Mühendisliği PhD., ODTÜ, Çevre Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Erkan Sahinkaya, Nigmet Uzal, Ulku Yetis, Filiz B. Dilek, Biological treatment and nanofiltration of denim textile wastewater for reuse. "Journal of Hazardous Materials", 153, (2008), p Sahinkaya, E., Dilek, F. B, The Growth Behavior of Chlorella vulgaris in the presence of 4- Chlorophenol and 2,4-Dichlorophenol. "Ecotoxicology and Environmental Safety", 72, (2009), p Kaya, D., Dilek, F.B., Gökçay, C.F. Reuse of lagoon effluents in agriculture by post-treatment in a step feed dual treatment (SFTD ) process. Desalination, 215, 29-36, Sahinkaya, E., Dilek, F. B. Modelling Chlorophenols Degradation in Sequencing Batch Reactors with Instantaneous Feed- Effect of 2,4-DCP Presence on 4-CP Degradation Kinetics. Biodegradation, 18(4), , Bural C.B., Demirer, G.N., Kantoglu, O., Dilek, F.B., Treatment of opium alkaloid contaınıng wastewater in sequencing batch reactor (SBR)- effect of gamma irradiation. "Radiation Physics and Chemistry", 79, (2010), p Sahinkaya, E., Dilek, F. B. Biodegradation Kinetics of 2,4-Dichlorophenol by Acclimated Mixed Cultures. Journal of Biotechnology, 127(4), , Sahinkaya, E., Dilek, F. B. Biodegradation of 4-CP and 2,4-DCP Mixture in a Rotating Biological Contactor (RBC). Biochemical Engineering Journal, 31(2), ,

85 Prof. Dr. Göksel Niyazi DEMĠRER ÇalıĢmaAlanları Anaerobic Environmental Biotechnology Wastewater Engineering Cleaner Production/Pollution Prevention Natural Treatment Systems Bioenergy and Biobased Products Lisans, ODTÜ, Çevre Mühendisliği M.S., ODTÜ, Çevre Mühendisliği PhD., Vanderbilt University, Çevre Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Yılmazel Y.D. and Demirer G.N., Removal and recovery of nutrients from anaerobic digestion residues of poultry manure as struvite. "Environmental Technology", 32, (2011), p Yılmaz V. and Demirer G.N.,, Anaerobic digestion of cattle manure: Effect of phase-separation. "WIT Transactions on Ecology and the Environment", 143, (2011), p Alkaya E. and Demirer G.N, Anaerobic acidification of sugar-beet processing wastes: Effect of operational parameters. "Biomass and Bioenergy", 35, (2011), p Raposo F, Fernández-Cegrí V, de la Rubia Maria, Béline F, Cavinato C, Demirer GN, Biochemical Methane Potential (BMP) of solid organic substrates: Evaluation of anaerobic biodegradability using data from an international interlaboratory study. "Journal of Chemical Technology & Biotechnology", 86, (2011), p Ulutas F., Alkaya E., Bogurcu M., Demirer G.N., A comparative analysis of Turkish and European Union environmental legislation regarding cleaner (sustainable) production concept. "International Journal of Environment and Sustainable Development", 10, (2011), p Ulutas F., Alkaya E., Bogurcu M. and Demirer G.N., Determination of the framework conditions and research-development needs for the dissemination of cleaner (sustainable) production applications in Turkey. "International Journal of Sustainable Development & World Ecology", 19, (2012), p Ulutas F., Alkaya E., Bogurcu M. and Demirer G.N., The national capacity assessment on cleaner (sustainable) production in Turkey. "Sustainable Cities and Society", 5, (2012), p

86 Prof. Dr. Gülay Özcengiz ÇalıĢmaAlanları Molecular Microbiology and Genetics Proteomics Biotechnology Lisans, M.S., ODTÜ Ph.D., ODTÜ SeçilmiĢ Yayınları Tefon, B.E., Özcengiz, E., Özcengiz, G Pertussis Vaccines: State-of-the-Art and Future Trends. Current Topics in Medicinal Chemistry. 13: Özcengiz G., Demain A. L Recent advances in the biosynthesis of penicillins, cephalosporins and clavams and its regulation. Biotechnology Advances. 31: Kurt A., Alvarez-Alvarez R., Liras P., Özcengiz G Role of cmch-ccar intergenic region and ccar overexpression in cephamycin C biosynthesis in Streptomyces clavuligerus. Applied Microbiology and Biotechnology. DOI /s Okay, S., Özcengiz, E. and Özcengiz G Immunogenicity and protective efficacy of the recombinant Pasteurella lipoprotein E and outer membrane protein H from Pasteurella multocida A:3 in mice. Research in Veterinary Science. 93: Köroğlu, T.E., Öğülür, Ġ., Mutlu, S., Yazgan-KarataĢ, A. and Özcengiz, G Global Regulatory Systems Operating in Bacilysin Biosynthesis in Bacillus subtilis.journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. 20: Tefon, B.E., Kühnel, S., Özcengiz, E., Becher, D., Hecker, M. andözcengiz, G A comprehensive analysis of Bordetella pertussis surface proteome and identification of new immunogenic proteins. Vaccine. 29: Altindis, E., Tefon, B.E, Yildirim, V. Özcengiz, E., Becher, D., Hecker, M. and Özcengiz, G Immunoproteomic analysis of Bordetella pertussis and identification of new immunogenic proteins. Vaccine. 27: Yıldırım V., Özcan, S., Becher, D., Buettner, K., Hecker, M., and Özcengiz, G Characterization of proteome alterations in Phanerochaete chrysosporium in response to lead exposure. BMC Proteome Science.9:

87 Yrd. Doç. Dr. Halil Mecit Öztop ÇalıĢmaAlanları Magnetic Resonance Imaging (MRI) NMR Relaxometry Colloidal systems Controlled release Lisans, ODTÜ, Gıda Mühendisliği M.S., ODTÜ, Gıda Mühendisliği PhD., University of California Davis, Biological Systems Engineering SeçilmiĢ Yayınları Williams P., Oztop, MH. McCarthy, MJ., McCarthy, KL., Lo, YM., Characterization of Water Distribution in Xanthan-Curdlan Hydrogel Complex Using Magnetic Resonance Imaging, Nuclear Magnetic Resonance Relaxometry, Rheology, and Scanning Electron Microscopy, Journal of Food Science, 76 (6):E Kong, F., Oztop, MH., Singh, RP., McCarthy MJ., Physical changes of peanuts during simulated gastric digestion. 50 : Oztop, M., McCarthy, MJ., McCarthy, KLM., Rosenberg, M., Characterization of diffusion of divalent ions (Mn+2 and Ca+2) from heat-set whey protein gels: An NMR Relaxometry and Magnetic Resonance Imaging (MRI) Study. Submitted to Journal of Food Science. Wichchukit S., Oztop, M., McCarthy, MJ., McCarthy, KLM. Use of whey protein/alginate beads to design a sustained release system in a viscous media. Submitted to Food Hydrocolloids Oztop, M., Bansal, H., McCarthy, MJ McCarthy, KL., Takhar, P. Using Multi-Slice-Multi-Echo MR images with NMR Relaxometry to asses water and fat distribution in coated chicken nuggets. Submitted to Journal of Food Engineering as a communication 83

88 Prof. Dr. Haluk Hamamcı ÇalıĢmaAlanları Yeast physiology Lactic acid production PhD., University of California at Davis, Kimya Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Ertugay, N. and Hamamcı, H., Storage Behaviour of Immobilized Dried Micro-organisms. "Food Microbiology ", 15, (1998), p Yarar, S., Hamamcı, H. and Bakır, U., Partial Purification and Charecterization of Neutral Trahalase Enzyme from Commercial Bakers' Yeast, S. Cerevisiae. "Journal of Food Biochemistry", 24, (2000), p Demir, A.S., Hamamcı, H., Doğanel, F. and Özgül E., Chemoenzymatic Synthesis of (1S,2R)-1-amino-2- indanol, a Key Intermediate of HIV Protease Inhibitor, Indinavir. "Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic", 9, (2000), p Uyar EO, Hamamci H, Turkel S, Effect of different stresses on trehalose levels in Rhizopus oryzae."journal of Basic Microbiology ", 50, (2010), p Alagoz E., Acar S., Yucel M., Hamamci H., Cloning and expression studies of putative Rhizopus oryzae hexokinase genes in Saccharomyces cerevisiae. "FEBS Journal ", 277, (2010), p

89 Yrd. Doç. Dr. Harun Koku ÇalıĢmaAlanları Analysis of Chromatographic Stationary Phases Electron Microscopy Imaging and Image Processing Biological Hydrogen Production Lisans, ODTÜ, Kimya Mühendisliği M.S., ODTÜ, Kimya Mühendisliği PhD., University of Delaware, Kimya Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Androga DD, Sevinç P, Koku H, Yücel M, Gündüz U and Eroğlu Ġ. Optimization of temperature and light intensity for improved photofermentative hydrogen production using Rhodobacter capsulatus DSM Int J Hydrogen Energy. 39(6): , Koku H, Maier RS, Schure MR, Lenhoff AM, Modeling of Dispersion in a Polymeric Chromatographic Monolith. J Chromatogr A, 1237, 55 63, Koku H, Maier RS, Czymmek KJ, Schure MR, Lenhoff AM, Modeling of Flow in a Polymeric Chromatographic Monolith. J. Chromatogr. A, 1218(22), ,

90 Prof. Dr. Hüseyin Avni Öktem ÇalıĢmaAlanları Nanobiotechnology, Nanotechnology, CBRN, Plant biotechnology, Transgenic techonologies, GMO, Signal transduction, Molecular diagnostics, Array technologies, Biosensors, Aptamers, Renewable bio-energy technologies Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyokimya Ph.D., Joszef Attila Univ SeçilmiĢ Yayınları Bayrac AT, Sefah K, Parekh P, Bayrac C, Oktem HA, Tan W, In vitro Selection of DNA Aptamers to Glioblastoma Multiforme, ACS Chemical Neuroscience (2011) in publication. Akcay UC, Ercan O, Kavas M, Yildiz L, Yilmaz C, Oktem HA, Yucel M, Drought-induced oxidative damage and antioxidant responses in peanut (Arachis hypogaea L.) seedlings. Plant Growth Regulation, 61: 21-28, Oz MT, Yilmaz R, Eyidogan F, de Graaff L, Yucel M, Oktem HA, Microarray Analysis of Late Response to Boron Toxicity in Barley (Hordeum vulgare L.) Leaves, Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 33: , Akcay UC, Mahmoudian M, Kamci H, Yucel M, Oktem HA, Agrobacterium tumefaciens-mediated genetic transformation of a recalcitrant grain legume, lentil (Lens culinaris Medik) Plant Cell Reports 28: , Karamollaoglu I, Oktem HA, Mutlu M, QCM-based DNA biosensor for detection of genetically modified organisms (GMOs) Biochemical Engineering Journal 44: , Oktem HA, Eyidooan F, Demirba D, Bayrac AT, Oz MT, Ozgur E, Selcuk F, Yucel M, Antioxidant responses of lentil to cold and drought stress Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 17: 15-21, Öktem H.A., Bayramoğlu G., Özalp V.C., Arica M.Y. Single step purification of recombinant Thermus aquaticus DNA-polymerase using DNA-aptamer immobilized novel affinity magnetic beads. Biotechnology Progress, 23: , Eskiocak U, Ozkan-Ariksoysal D, Ozsoz M, Oktem HA, Label-free detection of telomerase activity using guanine electrochemical oxidation signal Analytical Chemistry 79: ,

91 Prof. Dr. Ġnci Eroğlu ÇalıĢmaAlanları Chemical Reaction Engineering Process Design Multiphase Reactors Bioreactors Hydrogen Energy System Biyological Hydrogen Production Fuel Cell Lisans, ODTÜ, Kimya Mühendisliği M.S., ODTÜ, Kimya Mühendisliği PhD., ODTÜ, Kimya Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Eroğlu, Ġ., Tabanoğlu, A., Gündüz, U., Eroğlu, E., Yücel, M., Hydrogen production by Rhodobacter sphaeroides O.U.001 in a flat plate solar bioreactor. "International Journal of Hydrogen Energy", 33, (2008), p E.Ozgur, A.E.Mars, B.Peksel, A.Louwerse, M.Yücel, U.Gündüz, P.Claassen, I.Eroglu, Biohydrogen production from beet molasses by sequential dark and photofermentation."international Journal of Hydrogen Energy", 35, (2010), p Ela Eroglu, Ufuk Gunduz, Meral Yucel, Inci Eroglu, Photosynthetic bacterial growth and productivity under continuous illumination or diurnal cycles with olive mill wastewater as feedstock. "International Journal of Hydrogen Energy", 35, (2010), p P.A.M Claassen, T.Vrije, E.Koukios, E.V.Niel, I. Eroglu, M.Modigell,A. Fried, Non-thermal production of pure hydrogen from biomass: HYVOLUTION Michael,,, Walter Werner Ahrer. "Journal of Cleaner Production", 18, (2010), p.s4-s8. Androga DD, Özgür E, Yücel M, Gündüz U, Eroglu I., Factors affecting the longterm stability of biomass and hydrogen productivity in outdoor photofermentation.. "Int J Hydrogen Energy", 36, (2011), p Pekgöz G, Gündüz U, Eroğlu I, Yücel M, Kovács K, Rákhely G, Effect of inactivation of genes involved in ammonium regulation on the biohydrogen production of Rhodobacter capsulatus.. "Int J Hydrogen Energy ", 36, (2011), p Boran E., Özgür E., Yücel M., Gündüz U. and Eroğlu Ġ, Biohydrogen production by Rhodobacter capsulatus in solar tubular photobioreactor on thick juice dark fermenter effluent. "J Cleaner Prod", 31, (2012), p

92 Prof. Dr. Ġnci Togan ÇalıĢmaAlanları Population genetics Ancient DNA Lisans, ODTÜ, Fizik M.S., Johns Hopkins University, Biyofizik Ph.D., ODTÜ, Biyoloji SeçilmiĢ Yayınları Eren Y, Demirci S, EvrenKoban Bastanlar E, Dogan S.A, Tasdemir,U, Togan i. Comparative study of three simple molecular approaches in search of mtdna haplogroup identification of domestic sheep (revised and resubmitted to Small Ruminant Research) Dinc H, Ozkan E, Koban E, Togan,I Beta-casein, Kappa-casein and Beta-lactoglobulin Polymorphisms in Relation to Breeding Practices of Cattle in Turkey (revised and resubmitted to Archiv Tierzucht) Altunok, V., Yüksek, N., Berkman, C.C., Ağaoğlu, Z.T., Togan, I Genetic Structure and Variation of Van Cats. Biochemical Genetics, 49: Can, OE., Kandemir, I., Togan, I The wildcat Felis silvestris in northern Turkey: assessment of status using camera trapping. Fauna & Flora International, Oryx, 45(1), Birler, S., Pabuccuoğlu, S., Demir, K., Cirit, Ü., Karaman, E., Bacınoglu, S., ÖzdaĢ, Ö.B., Evecen, M., Alkan, S., Baran, A., Bakırer, G., Hamzaoğlu, Ġ., Öztürk, Ö.A., Özcan, C., Koçak, Ö., Kılıçarslan, R., KaĢıkçı, G., Toydemir, S., Dinç, H., Koban, E., Togan, Ġ., Ġleri, Ġ.K. and Ak, K Production of cloned lambs: Transfer of early cleavage stage embryos to fınal recipients. Ġstanbul Üniv. Vet. Fak. Derg. 36(1): 1-8. Avcı, G., Uğuz, C., Bayram, Ġ., Erdoğan, M., Küçükkurt, Ġ., Dosay Akbulut, M., Özdemir, M., Lenger, ÖF., ĠĢcan, M., Togan, Ġ Effects of Nonylphenol on Growth Parameters and Antioxidant Defense System in Japanese Quails (Coturnix japonica). Kafkas Univ Vet Fak Derg, 16 (4): Beklioğlu, M., AkkaĢ, SB., Ozcan, HE., Bezirci, G., Togan, I Effects of 4-Nonylphenol, Fish Predation and Food Availability on Survival and Life History Traits of Daphnia magna Straus,Ecotoxicology, 19: Uğuz, C., ĠĢcan, M. ve Togan, I Alkylphenols in the environment and their adverse effects on living organisms. Kocatepe Veterinary Journal. 2 (1):

93 Yrd. Doç. Dr. Ġrem Erel-Göktepe ÇalıĢmaAlanları Preparation of functional surfaces Stimuli responsive polymer multilayer films Lisans, ĠTÜ, Kimya M.S., ĠTÜ, Polimer Bilim ve teknolojisi PhD., Stevens Institute of Technology, Polimer Kimyası SeçilmiĢ Yayınları Bag, E.; Begik, O.; Yusan, P.; Erel-Goktepe, I., Hydrogen-bonded Multilayers with Controllable phinduced Disintegration Kinetics for Controlled Release Applications from Surfaces. Journal of Macromolecular Science, Part A: Pure and Applied Chemistry, accepted. Yusan P.; Tuncel, I.; Bütün, V.; Demirel, A.L; Erel-Goktepe, I., ph-responsive Layer-by-layer Films of Zwitterionic Micelles Polymer Chemistry, 5, (2014), p Hippius, C.; V.Butun; Erel-Goktepe, I., Bacterial Anti-adhesive Properties of a Monolayer of Zwitterionic Block Copolymer Micelles. Materials Science and Engineering: C Materials for Biological Applications, 41, (2014), p.354. Taskin, O.S.; Erel-Goktepe, I; Khan, M.A.A; Pispas, S.; Yagci, Y., Polystyrene-b-poly(2-vinyl phenacyl pyridinium) Salts as Photoinitiators for Free Radical and Cationic Polymerizations and Their Photoinduced Molecular Associations. Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry, 285, (2014), p.30. Erel, I.; Karahan, E.H., Tuncer, C.; Bütün, V.; Demirel, A.L, Hydrogen-Bonded Multilayers of Micelles of a Dually Responsive Dicationic Block Copolymer. Soft Matter, 8, (2012), p.827. Erel, I.; Zhu, Z.; Zhuk, A.; Sukhishvili, S. A., Hydrogen-Bonded Layer-by-Layer Films of Block Copolymer Micelles with ph-responsive Cores. J. Colloid Interface Sci., 355, (2011), p.61. Erel, I.; Schlaad, H.; Demirel, A.L., Effect of Structural Isomerism and Polymer End Group on the ph-stability of Hydrogen Bonded Multilayers. J. Colloid Interface Sci., 361, (2011), p.477. Erel, I.; Zhu, Z.; Sukhishvili, S. A.; Patyukova, E.; Potemkin, I.; Kramarenko, E., Two Types of Block Copolymer Micelles with Ion-containing Cores. Macromolecular Rapid Communications, 31, (2010), p

94 Prof. Dr. Levent Toppare ÇalıĢmaAlanları Conducting Polymers Biosensors Electrochromism Organic Solar Cells Lisans, ODTÜ, Kimya M.S., ODTÜ, Kimya PhD., ODTÜ, Kimya SeçilmiĢ Yayınları Effects of dopant on characteristics of polypyrrole and its Copolymers, E. Aslan Gürel, L. Toppare, J. Hacaloğlu, J. Thermal Anal Calorimetry, 11, 1133 (2013) Dielectric and electrical properties of a benzotriazole and fluorene containing copolymer. D. Esra Yıldız D. Hazar Apaydın, L. Toppare, Ali Cirpan, J. Appl. Polym Sci.,3, 1659 (2013) Blend or Copolymer? Spectroelectrochemical evidence copolymerization or blending two electrochromic polymer, M. Ak, H. ÇetiĢli, L. Toppare Coll. Polym. Sci.,291, 767 (2013) A novel conducting polymer: Investigation of its matrix properties for cholesterol biosensor applications. S. Söylemez, F. Ekiz, L. Toppare. Sensors Actuators B, 182, 322 (2013) Synthesis of Aromatic Poly(pyridinium salt)s and their Electrochromic Properties. M. L. Keshtov,Y. Arslan Udum, L. Toppare, V. S. Kochurov, A. R. Khokhlov. Mat.Chem.Phys. 139, 936 (2013) 90

95 Prof. Dr. Mahinur S. Akkaya ÇalıĢmaAlanları Plant-pathogen interactions Protein-protein interactions Plant functional genomics Applications of Molecular Markers Click Chemistry Lisans, ODTÜ, Kimya M.S., The Ohio State University, Kimya PhD., The Ohio State University, Biyokimya & Moleculer Biyoloji ve Genetik SeçilmiĢ Yayınları Gunel A., Asbahi A., Ozgazi N., Akkaya M.S. Identification of differentially expressed proteins in wheat after benzothiadiazole treatment. Journal of Plant Diseases and Protection (JPDP). 2012, 119: Yildirim-Ersoy F., Ridout C.J., Akkaya M.S. Detection of physically interacting proteins with the CC and NB-ARC domains of a putative yellow rust resistance protein, Yr10, in wheat. Journal of Plant Diseases and Protection, 2011, 118: Ogul H., Akkaya M.S. Data Integration in Functional Analysis of MicroRNAs Current Bioinformatics 2011, 6: Bozkurt O., McGrann G.R.D., MacCormack R., Boyd L.A., Akkaya M.S. Cellular and transcriptional responses of wheat during compatible and incompatible race-specific interactions with Puccinia striiformis f. sp. tritici Molecular Plant Pathology. 2010, 11: DOI: /J X Demircan T. and Akkaya M.S. Virus induced gene silencing in Brachypodium distachyon, a model organism for cereals. Plant. Cell. Tiss. Organ. Cult. 2010, 100:91-96, (DOI /s x). Dagdas Y.F., Dagdas G., Unver T., and Akkaya M.S. A new ZTL type F-box functions as a positive regulator in disease resistance: VIGS analysis in barley against powdery mildew. Physiological and Molecular Plant Pathology. 2009, 74: Bozkurt O., Unver T., and Akkaya M.S. Genes differentially expressed in wheat associated with resistance to yellow rust disease caused by Puccinia striiformis f.sp. tritici (Physiological and Molecular Plant Pathology 2007, 71: : (DOI: /J.pmpp ) 91

96 Yrd. Doç. Dr. Mayda Gürsel ÇalıĢmaAlanları Innate immunity Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoloji Ph.D., University of London SeçilmiĢ Yayınları Steinhagen F, Meyer C, Tross D, Gursel M, Maeda T, Klaschik S, Klinman DM, Activation of type I interferon-dependent genes characterizes the "core response" induced by CpG DNA. J Leukoc Biol Oct;92(4): E. Erikçi, M. Gürsel, I. Gursel, Differential Immune Activation Following Encapsulation of Immunostimulatory CpG Oligodeoxynucleotide in Nanoliposomes. Biomaterials, 32:1715, FC. Yagci, O. Aslan, M. Gursel, G. Tincer, Y. Ozdamar, K. Karatepe, KC. Akcali, I. Gursel, Mammalian telomeric DNA suppresses endotoxin induced uveitis. J Biol Chem. 285:28806, M. Gürsel, I. Gursel, HS. Mostowski, DM. Klinman, CXCL16 Influences the Nature and Specificity of CpG-Induced Immune Activation, J. Immunol., 177:1575, C. Coban, KJ. Ishii, M. Gürsel, DM. Klinman, N. Kumar, Effect of plasmid backbone modification by different human CpG motifs on the immunogenicity of DNA vaccine vectors, J.Leuko.Biol., 78:647, H. Shirota, I. Gursel, M. Gürsel, D. M. Klinman, Suppressive oligodeoxynucleotides protect mice from lethal endotoxic shock, J. Immunol, 174:4579, T. Sugiyama, M. Gürsel, F. Takeshita, C. Coban, J. Conover, T. Kaisho, S. Akira, DM. Klinman, CpG RNA: identification of single stranded RNA that stimulates human CD14+CD11c+ monocytes, J. Immunol, 174:2273, S. Ito, K.J. Ishii, M. Gürsel, H Shirota, A. Ihata, D. M. Klinman, CpG oligodeoxynucleotides enhance neonatal resistance to listeria infection, J. Immunol, 174:777, H. Shirota, M. Gürsel, D. M. Klinman, Suppressive oligodeoxynucleotides inhibit Th1 differentiation by blocking IFNg and IL-12 mediated signaling, J. Immunol,173:5002, F. Takeshita, I. Gursel, K.J. Ishii, K. Suzuki, M. Gürsel, D. M. Klinman, Signal transduction pathways mediated by the interaction of CpG DNA with toll-like receptor 9, Semin. Immunol., 16:17,

97 Yrd. Doç. Dr. Mehmet Somel ÇalıĢmaAlanları Evolutionary genetics Mechanisms and evolution of aging Brain aging Transcriptome evolution Human evolution & population genetics Human ancient DNA Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoteknoloji Ph.D., University of Leipzig, Biyoloji SeçilmiĢ Yayınları Y Yuan, YPP Chen, J Boyd Kirkup, P Khaitovich, M Somel, Accelerated aging related transcriptome changes in the female prefrontal cortex, Aging cell 11 (5), M Somel, S Guo, N Fu, Z Yan, HY Hu, Y Xu, Y Yuan, Z Ning, Y Hu, MicroRNA, mrna, and protein expression link development and aging in human and macaque brain, Genome research 20 (9), M Somel, H Franz, Z Yan, A Lorenc, S Guo, T Giger, J Kelso, B Nickel, Transcriptional neoteny in the human brain, Proceedings of the National Academy of Sciences 106 (14), S Myles, M Somel, K Tang, J Kelso, M Stoneking, Identifying genes underlying skin pigmentation differences among human populations, Human genetics 120 (5), M Somel, X Liu, L Tang, Z Yan, H Hu, S Guo, X Jiang, X Zhang, G Xu, MicroRNA-driven developmental remodeling in the brain distinguishes humans from other primates, PLoS biology 9 (12), e S Myles, K Tang, M Somel, RE Green, J Kelso, M Stoneking, Identification and Analysis of Genomic Regions with Large Between Population Differentiation in Humans, Annals of human genetics 72 (1), M Somel, P Khaitovich, S Bahn, S Pääbo, M Lachmann, Gene expression becomes heterogeneous with age, Current Biology 16 (10), R359-R360 X Liu, M Somel, L Tang, Z Yan, X Jiang, S Guo, Y Yuan, L He, A Oleksiak, Extension of cortical synaptic development distinguishes humans from chimpanzees and macaques, Genome research 22 (4),

98 Prof. Dr. Meral Yücel ÇalıĢmaAlanları Bitki Biyoteknolojisi: Tahıl bitkilerinin doğal stres koģullarına dayanıklı çeģitlerinin Fizyolojik, Biyokimyasal ve Moleküler Yöntemlerle tesbiti ve Gen Mühendisliği yolu ile dayanıklı çeģitlerin geliģtirilmesi. Gen transferi ve transgenik bitkilerin rejenerasyonu. Biyo Enerji: Fotosentetik mikroorganizmalar kullanarak yenilenilebilir enerji eldesi için süreç ve teknolojilerin geliģtirilmesi (Biyohidrojen ve Biyodizel Üretimi). Enzim saflaģtırılması ve karakterizasyonu Lisans, ODTÜ, Kimya M.S., ODTÜ, Kimya Ph.D., ODTÜ, Biyoloji SeçilmiĢ Yayınları Melih Onay, Çağla Sönmez, Hüseyin Avni Öktem, Meral Yücel Thermo-resistant green microlagae for effective biodiesl production : isolation and characterization of unialgal species from geothermal flora of central Anatolia : Bioresource Technology (2014) 169:62-71 M.C. Baloğlu, A.Battal, G.Aydın, A.Eroğlu, M.T.Oz; M.Kavas, H.A.Öktem, M.Yücel Vector Construction Strategies For Transformation of Wheat Plant The Journal of Animal and Plant Sciences (2013) 23(3) ISSN: A.Gökce, Y Öztürk,Z.P.Çakar, M. Yücel, Temperature resistant mutants of Rhodobacter capsulatus generatted by a directed evolution approach and effects of temperature resistance on hydrogen production. "Int.J.of Hydrogen Energy", 37, (2012), p Öztürk Y, Gökce A.M, Peksel B, Gürgan M, Öztürk Y, Gündüz U, Eroglu Ġ,Yücel M., Hydrogen production properties of Rhodobacter capsulatus with genetically modified redox balancing pathways.. "Int.J.of Hydrogen Energy", 32, (2012), p Androga D., Özgür E, Eroglu I,Gündüz U, Yücel M., Amelioration of photofermentative hydrogen production from molasses dark fermenter effluent by zeolite-based removal of ammonium ion.. "International J.of Hydrogen Energy", 37, (2012), p C.Kayıhan, F.Eyidogan, N. Afsar, H.A.Öktem, M.Yücel, Cu/Zn Superoxide dismutase activity and respective gene expression during cold acclimation and freezing stress in barley cultivar.. "Biological Plantarum ", 56, (2012), p Boran E, Özgür E, Yücel M, Gündüz U, Eroglu I., Biohydrogen production by Rhodobacter capsulatus Hup- mutant in pilot solar tubular photobioreactor.. "Int.J of Hydrogen Energy", 37, (2012), p

99 Prof. Dr. Nesrin Hasırcı ÇalıĢma Alanları Synthesis, modification, characterization and biocompatibility studies of biomaterials: Wound Dressing Materials Biodegradable Scaffolds Responsive Hydrogels Enzyme Immobilization Controlled Release Bone Cement Compositions Micro and Nano Delivery Systems Lisans, ODTÜ, Kimya M.S., ODTÜ, Kimya PhD., ODTÜ, Kimya SeçilmiĢ Yayınları Aysun Güney, Nesrin Hasirci, Properties and Phase Segregation of Crosslinked PCL-Based Polyurethanes, Journal of Applied Polymer Science, DOI: /app.39758, 2014 Seniz Ucar, Pinar Yilgor, Vasif Hasirci, Nesrin Hasirci, Chitosan Based Wet Spun Scaffolds for Bioactive Agent Delivery in Bone Tissue Engineering, J. Appl. Polm. Sci, doi: /app.39629, 2014 Endogan-Tanir, T., Hasirci, V., Hasirci, N. Electrospinning of chitosan/poly (lactic acid-co-glycolic acid)/hydroxyapatite composite nanofibrous mats for tissue engineering applications. Polymer Bulletin. DOI: /s y, 2014 Filiz Kara, Eda Ayse Aksoy, Zehranur Yuksekdag, Nesrin Hasirci, Serpil Aksoy, Synthesis and surface modification of polyurethanes with chitosan for antibacterial properties, Carbohydrate Polymers, DOI:.org/ /j.carbpol , 2014 I. Saygun, V. Bal, A. Kızıltay, P. Yilgor Huri, F. Avcu, K. Üstün, V. Hasirci, N. Hasirci, Proliferation and Differentiation of Mesenchymal Stem Cells in Chitosan Scaffolds Loaded with Nanocapsules Containing Bone Morphogenetic Proteins-4, Platelet-Derived Growth Factor and Insulin-Like Growth Factor 1, Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, 4, , U. Aydemir Sezer, D. Arslantunali, E.A. Aksoy, V. Hasirci, N. Hasirci, Poly(ε-caprolactone) Composite Scaffolds Loaded with Gentamicin Containing β-tcp/ Gelatin Microspheres for Bone Tissue Engineering Applications, Journal of Applied Polymer Science, 131 (8) 1-11, 2014 O. Ozgen, V. Hasirci, N. Hasirci, Effects of oxygen nitrogen and argon plasmas on PMMA surfaces, Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, J. Biomater. Tissue Eng., 4, , Maria Teresa Calejo, Nesrin Hasirci, Shahla Bagherifam, Reidar Lund and Bo Nyström, Selfassembled Stimuli-responsive Structures from Cationic Polymers for Biomedical Applications; Ed: Dr.Sangram Keshari Samal and Dr. Peter Dubruel; Royal Society of Chemistry (RSC publisher),

100 Doç. Dr. Nursen Çoruh ÇalıĢmaAlanları Medicinal plants: Chemical extract preparation Investigation of antioxidant activity: medicinal plant extracts and isolated bioactive compounds Bioactive compound isolation from plant extracts: TLC, HPLC, Liquid column chromatograpy Spectroscopy: Fluorescence, Luminescence, CD, UV-VIS Lisans, ODTÜ, Kimya M.S., ODTÜ, Kimya PhD., University of Missouri,St-Louis, Kimya SeçilmiĢ Yayınları Çoruh, Celep, Özgökçe, ĠĢcan, antioxidant capacities of gundelia tournefortii L. Extracts and inhibition on glutathione-s-transferase activity. "food chemistry", 100, (2007), p Çoruh, Celep, Özgökçe,, antioxidant properties of prangos ferulacea (L) Lindl.,chaerophyllum macropodum boiss. And heracleum persicum desf. From apiaceae family used as food in eastern anatolia and their inhibitory effects on glutathione-s-transferase. "food chemistry", 100, (2007), p Yuzugullu, Y.; Koclar A., G.; Soyler, B.; Bakir, U. ; Karakas, G.;Coruh, N., Production of a novel bifunctional catalase-phenol oxidase of Scytalidium thermophilum in the presence of phenolic compounds, 2011, "Türk Biyoloji Dergisi", 35, (2011), p Sagdicoglu Celep, A. G.; Yilmaz, S. and Coruh, N., Antioxidant Capacity and Cytotoxicity of Aesculus hippocastanum on Breast Cancer MCF-7 Cells "JOURNAL OF FOOD AND DRUG ANALYSIS", 20, (2012), p

101 Prof. Dr. Orhan Adalı ÇalıĢmaAlanları Biochemistry and Molecular Biology, Biochemical Pharmacology and Toxicology, Pharmacogenetic Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoloji Ph.D., ODTÜ, Biyokimya SeçilmiĢ Yayınları A. Türkanoğlu Özçelik, B. C. Demirdöğen, ġ. Demirkaya, O. Adalı Flavin containing monooxygenase 3 genetic polymorphisms Glu158Lys and Glu308Gly and their relation to ischemic stroke Gene, 521(1-5), , B. C. Demirdöğen, A.Ç. Adalı, ġ. Demirkaya, S. Bek and O. Adalı Cytochrome P4501A1 genotypes and smoking- and hypertension-related ischemic stroke risk Human and Experimental Toxicology, 32(5), , S. Karakurt, A. Semiz, G. Celik, A. M. Gencler-Ozkan, A. Sen, O. Adalı Epilobium hirsutum alters xenobiotic metabolizing CYP1A1, CYP2E1, NQO1 and GPx activities, mrna and protein levels in rats Pharmaceutical Biology, 51(5), , Çiğdem Gökçek-Saraç, Orhan Adalı, Ewa Jakubowska-Doğru Hippocampal levels of ChAT, PKA, phospho-pka and phospho-camkiiα but not CaMKIIα positively correlate with spatial learning skills in rats Neuroscience Letters, 545(6), , Gurbet Celik, Asli Semiz, Serdar Karakurt, Sevki Arslan, Orhan Adalı, Alaattin Sen A Comparative Study for the Evaluation of Two Doses of Ellagic Acid on Hepatic Drug Metabolizing and Antioxidant Enzymes in the Rat BioMed Research International (Journal of Biomedicine and Biotechnology), Vol (7), Article ID , 9 pages, (doi: /2013/358945), Ç. G. Saraç, S. Karakurt, O. Adalı, E.J. Doğru Correlation between hippocampal levels of neural, epithelial and inducible NOS and spatial learning skills in rats Behavioural Brain Research, 235 (12), , B. C. Demirdögen, E. ġahin, A. Türkanoğlu Özçelik, S. Bek, S. Demirkaya, O. Adali Apolipoprotein A5 polymorphisms in Turkish population: association with serum lipid profile and risk of ischemic stroke Molecular Biology Reports, 39 (12), ,

102 Prof. Dr. Pınar Çalık ÇalıĢmaAlanları Biochemical reaction engineering for industrial bioprocess development Recombinant gene products (Production of pharmaceutical proteins and enzymes) Catalysis through metabolic engineering Modeling of intracellular reaction networks and analysis Site-directed biomimetic chemisorption based protein affinity separation Biomolecular modelling through metabolic engineering for bioseparation of proteins Enzyme enhanced ultrafiltration for the separation of enantiomers Lisans, Ankara Üni., Kimya Mühendisliği M.S., Ankara Üni., Kimya Mühendisliği PhD., Ankara Üni., Kimya Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Eskitoros, M. ġ., Ata, Ö., Çalık, P Metabolic reaction network of Pichia pastoris with glycosylation reactions: flux analysis for erythropoietin production, Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 89(11), Eskitoros, M. ġ., Çalık, P Co-substrate mannitol feeding strategy design in semi-batch production of recombinant human erythropoietin production by Pichia pastoris, Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 89 (5), Çalık, P., Bozkurt, B., Zerze, G.H., Inankur, B., Bayraktar, E., Boy, E., Orman, M.A., Açık, E., Özdamar, T.H., Effect of co-substrate sorbitol different feeding strategies on human growth hormone production by recombinant Pichia pastoris, Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 88(9), Angardi, V., Çalık, P., Beet molasses based exponential feeding strategy for thermostable glucose isomerase production byrecombinant Escherichia coli BL21 (DE3), Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 88 (5), pp Çelik, E., Çalık, P., Production of recombinant proteins by yeast cells, Biotechnology Advances, 30, Çalık, P., Ġnankur, B., Soyaslan, E.ġ., ġahin, M., TaĢpınar, H., Açık, E., Bayraktar, Fermentation and oxygen transfer characteristics in recombinant human growth hormone production by Pichia pastoris in sorbitol batch and methanol fed-batch operation. Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 85, (2010), p

103 Dr. Robert W. Murdoch ÇalıĢmaAlanları Genetics and biochemistry of novel microbial biodegradation pathways Molecular and microbiological techniques for assessing toxicity Molecular analysis of bacterial community structure Lisans, University of Texas at Austin, Zoology- Botany PhD., Cornell University, Environmental Toxicology SeçilmiĢ Yayınları Murdoch, R. and A. Costello Staniec. Diversity and composition of ammonia oxidizing bacteria in a streambed surrounding an artificial dam. Journal of Environmental Management 127 p , doi: /j.jenvman Murdoch, R. and A.G. Hay. Genetic and chemical characterization of ibuprofen and degradation by Sphingomonas Ibu-2. Microbiology 159 p , doi: /mic Kagle, J., Porter, A.W., Murdoch, R., Rivera-Cancel, G. and A.G. Hay. Biodegradation of Pharmaceutical and Personal Care Products. Advances in Applied Microbiology, 67 p , doi: /S (08) Murdoch, R. and A.G. Hay. Formation of catechols via acid side chain removal from ibuprofen and related aromatic acids. Applied and Environmental Microbiology, 71(10) p , doi: /aem

104 Yrd. Doç. Dr.Salih Özçubukçu ÇalıĢmaAlanları Metal and Light-Triggered Self Assembly of Peptide Hydrogels and Biomaterial Applications Lisans, ODTÜ, Kimya M.S., ODTÜ, Kimya PhD., RWTH Aachen University, Kimya SeçilmiĢ Yayınları Zhou, L.; Bosscher, M.; Zhang, C.; Özçubukçu, S.; Zhang, L.; Zhang, W.; Li, C. L.; Jensen, M. P.; Lai, L.; He, C. A protein engineered to bind uranyl selectively and with femtomolar affinity. Nature Chemistry, 2014, 6,236. (News in C&EN) Beemelmanns, C., Husmann, R., Whelligan, D.K., Özçubukçu, S., Bolm, C. Planar Chiral Disilanols and Diols as H-Bonding Asymmetric Organocatalysts Eur. J. Org. Chem. 2012, Özkal, E., Özçubukçu, S.; Pericas, M.A. Covalently Immobilized tris(triazolyl)methanol Cu(I) Complexes: Highly Active and Recyclable Catalysts for CuAAC Reactions Catal. Sci. Technol., 2012, 2, 195. Özçubukçu, S.; Wegner, S.; Mandal, K.; Jensen, M. P.; He, C. Selective Recognition of Americium by Peptide-Based Reagents Inorg. Chem. 2011, 50, Özçubukçu, S.; Özkal, E,; Jimeno, C.; Pericas, M. A. A Highly Active Catalyst for Huisgen 1,3- Dipolar Cycloadditions Based on the Tris(triazolyl)methanol-Cu(I) Structure Org. Lett. 2009, 11,4680. Özçubukçu, S.; Schmitt, E.; Leifert, A.; Bolm, C. A General and Efficient Synthesis of Nitrogen- Substituted Ferrocenes. Synthesis, 2007,

105 Prof. Dr. Semra Kocabıyık ÇalıĢmaAlanları Structure / function analysis of thermostable proteins; molecular biology of energy dependent progressive and programmed proteolysis; heat-shock response in thermohilic archaea. Lisans, Ankara Üniversitesi M.S., Ankara Üniversitesi Ph.D., ODTÜ, Biyoloji SeçilmiĢ Yayınları S. Kocabıyık and S. Aygar. Improvement of protein stability and enzyme recovery under stress conditions by using a small SHP (tpv-hsp 14.3) form Thermoplasma volcanium. Process Biochemistry, 47: , 2012 S. Kocabıyık et al., Molecular cloning and co-expression of Thermoplasma volcanium proteasome subunit genes. Protein Expression and Purification, 73 : , S. Kocabıyık. Essential Structural and Functional Features of Small Heat Shock Proteins in Molecular Chaperoning Process. Protein & Peptide Letters, 16, , S. Kocabıyık, B. Demirok. Cloning and overexpression of a thermostable signal peptide peptidase (SppA) from Thermoplasma volcanium GSS1 in E.coli. Biotechnology Journal, 4(7): , 2009 S. Kocabıyık and H.Ozel. An Extracellular pepstatin insensitive acid protease produced by Thermoplasma volcanium. Bioresource Technology, 98: , S. Kocabıyık and Ġ.Özdemir. Purification and Characterization of an intracellular Chymotrypsin-Like Serine Protease from Thermoplasma volcanium. Bioscience, Biotechnology and Biochemistry. 70(1): , S. Kocabıyık and B.Erdem : Intracellular Alkaline Proteases Produced by Thermoacidophiles. Detection of Protease Heterogeneity by Gelatin Zymography and Polymerase Chain Reaction (PCR). Bioresource Technology, 84:29-33, S. Kocabıyık and I.Erduran. The Effect of Valine Substitution for Glycine in the Dimer Interface of Citrate Synthase from Thermoplasma acidophilum on Stability and Activity. Biochem. Biophys. Res. Commun., 275: , Erduran, S. Kocabıyık. Amino acid substitutions in the subunit interface enhancing thermostability of Thermoplasma acidophilum citrate synthase. Biochem. Biophys. Res. Commun., 249: ,

106 Doç. Dr. Sertaç Önde ÇalıĢmaAlanları Plant tissue culture; Plant Gene Transfer Plant phylogenetics Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoloji Ph.D., Leeds University SeçilmiĢ Yayınları S. Önde, T.S. Futers, A.C. Cuming 1994 Rapid analysis of an osmotic stress responsive promoter by transient expression in intact wheat embryos. J. Exp. Bot. 45(274): Özgen, M., Önde, S., Birsin, M., Sancak, C. Transient expression of -glucuronidase (GUS) gene in mature embryos of winter durum wheat via microprojectile bombardment. Wheat Information Service, Number: 89, pp 30-32, Önde, S., Birsin, M., Yıldız, M., Sancak, C., Özgen, M. Transfer of a -glucuronidase reporter gene to sugarbeet (Beta vulgaris L.) via microprojectile bombardment Turk. J. Agric. For. Vol 24, pp , Özgen M, Birsin MA, Önde S. The effect of hybrid vigor on callus induction and plant regeneration from mature embryo culture of barley (Hordeum vulgare). Plant Cell, Tissue and Organ Cult. 2005; 82(1): Lise Y, Kaya Z, IĢık F, Sabuncu R, Kandemir Ġ, Önde S. The impact of over-exploitation on the genetic structure of Turkish red pine (Pinus brutia Ten.) populations determined by RAPD markers. Silva Fennica 2007; 41(2): Yıldız M, Önde S, Özgen M. Sucrose effects on concentration and plant regeneration from sugarbeet leaf and petiole explants. J Sugarbeet Res. 2007; 44(1&2): Özgen M, Yıldız M, Koyuncu N, Önde S. The effect of seed size on tissue culture response of callus from endosperm-supported mature embryos of Barley (Hordeum vulgare L.). Cereal Res Commun. 2007; 35(3): Dizkırıcı, A., Özcan, H.E., Önde, S., Temel, F., Akar, T. Budak, H. and Kaya, Z. Microsatellite (SSR) variation in Barley germplasm and its potential use for marker assisted selection in scald resistance breeding. International Journal of Integrative Biology 4 (1):9-15,

107 Doç. Dr. Sreeparna Banerjee ÇalıĢmaAlanları Non steroidal Anti-iflamatuvar ilaç olan Celecoxib in, EGFR antikoru yardımıyla kanserli hücreye ulaģtırılması. Böylece, Celecoxib gönderimindeki kardiyovasküler yan etkileri azaltır. Hedefli kanser terapisi, kemoterapinin baģka hücrelerde ortaya çıkarabileceği yan etkileri azaltır. Katı tümörler genellikle EGFR proteinini fazla ifade etmektedirler. Bu yeni lipozom formülü lipozomun, EGFR sentezleyen kanser hücrelerine hedeflenmesini sağlayarak, toksik olmayan, biyo-uyumlu bir çözüm sunmaktadır. Lisans, Presidency College, Calcutta University, Physiology M.S., Leeds University, Food Science Ph.D., Leeds University, Food Biochemistry SeçilmiĢ Yayınları Enayat S and Banerjee S. The ethanolic extract of bark from Salix aegyptiaca inhibits the metastatic potential and epithelial to mesenchymal transition of colon cancer cell lines. Nutrition and Cancer: An International Journal (doi: / ). Milackova I, Prnova MS, Majekova M, Sotnikova R, Stasko M, Kovacikova L, Banerjee S, Veverka M, Stefek M. 2-Chloro-1,4-naphthoquinone derivative of quercetin as an inhibitor of aldose reductase and anti-inflammatory agent. J Enzyme Inhib Med Chem (doi: / ) Erdoğ A, Limasale YD, Keskin D, Tezcaner A, Banerjee S. In vitro characterization of a liposomal formulation of celecoxib containing 1,2-Distearoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine (DSPC), cholesterol and polyethylene glycol (PEG) and its functional effects against colorectal cancer cell lines. Journal of Pharmaceutical Sciences. 2013, 102: Enayat S, Ceyhan MS, Basaran AA, Gursel M, Banerjee S. Anticarcinogenic effects of the ethanolic extract of Salix aegyptiaca in colon cancer cells: involvement of Akt/PKB and MAPK pathways. Nutrition and Cancer: An International Journal. 2013, 65: Tunçay Çağatay S, Çimen I, SavaĢ B, Banerjee S. MTA-1 expression is associated with metastasis and epithelial to mesenchymal transition in colorectal cancer cells. Tumor Biology 2013, 34: Kavas A, Tunçay Çağatay S, Banerjee S, Keskin D, Tezcaner A. Potential of raloxifene on reversing osteoarthritis-like alterations in rat chondrocytes: An in vitro model study. Journal of Biosciences, , Astarci E, Sade A, Çimen I, SavaĢ B and Banerjee S. The NF-κB target genes ICAM-1 and VCAM-1 are differentially regulated during spontaneous differentiation of Caco-2 cells. FEBS J. 2012, 279, Astarci E, Erson-Bensan AE, Banerjee S. MMP16 expression is downregulated by microrna-146a in spontaneously differentiating Caco-2 cells. Development Growth & Differentiation. 2012, 54,

108 Doç. Dr. Tolga Can ÇalıĢmaAlanları Bioinformatics: Computational Systems Biology, Construction and Analysis of Protein Networks Statistical learning (Kernel Methods, Graphical Models) Lisans, ODTÜ, Bilgisayar Mühhendisliği M.S., University of California, Santa Barbara, Computer Science Ph.D., University of California, Santa Barbara, Computer Science SeçilmiĢ Yayınları T. Ersahin, L. Carkacioglu, T. Can, O. Konu, V. Atalay, R. Cetin-Atalay, "Identification of Novel Reference Genes Based on MeSH Categories," PLoS ONE 9(3): e93341, doi: /journal.pone O. Eren Ozsoy and T. Can, "A divide and conquer approach for construction of large-scale signaling networks from PPI and RNAi data using linear programming," IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 10(4): , July doi: /tcbb S. Hashemikhabir, E. S. Ayaz, Y. Kavurucu, T. Can, and Tamer Kahveci, "Large-Scale Signaling Network Reconstruction," IEEE/ACM Transcations on Computational Biology and Bioinformatics, Nov.-Dec (vol. 9 no. 6), pp doi: /tcbb B. H. Akman, T. Can, and A. E. Erson-Bensan, "Estrogen-induced upregulation and 3'-UTR shortening of CDC6," Nucl. Acids Res., September 12, 2012 doi: /nar/gks855 M. Sualp and T. Can, "Using network context as a filter for mirna target prediction," Biosystems, 105(3): , doi: /j.biosystems L. Carkacioglu, R. C. Atalay, O. Konu, V. Atalay, and T. Can, "Bi-k-Bi Clustering: Mining Large Scale Gene Expression Data Using Two-Level Biclustering," International Journal of Data Mining and Bioinformatics (IJDMB), 4(6): , doi: /ijdmb O. Camoglu, T. Can, and A. K. Singh, "Accurate and Scalable Techniques for the Complex/Pathway Membership Problem in Protein Networks," Advances in Bioinformatics, vol. 2009, Article ID , doi: /2009/

109 Doç. Dr. Tuba H. Erguder-Bayramoğlu ÇalıĢmaAlanları Anaerobic biotechnology Renewable energy and bio-based products Bio-granulation Agro-industrial waste treatment Removal of chlorinated compounds Biological nitrogen removal Lisans, ODTÜ, Çevre Mühendisliği M.S., ODTÜ, Çevre Mühendisliği PhD., ODTÜ, Çevre Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları ErĢan ÇY, Erguder TH The effects of seed sludge type on aerobic granulation via anoxicaerobic operation. Environmental Technology, 35 (23), ErĢan ÇY, Erguder TH The effects of aerobic / anoxic period sequence on aerobic granulation and COD/N treatment efficiency. Biores. Technol., 148: Diamantis V., Erguder TH., Aivasidis A, Verstraete W, Voudrias E Wastewater disposal to landfill-sites: a synergistic solution for centralized management of olive mill wastewater and enhanced production of landfill gas. Journal of Environ. Manage., 128: Ozkan L., Erguder TH., Demirer GN., Effects of pretreatment methods on solubilization of beetpulp and bio-hydrogen production yield. Intern. J Hydrogen Energy, 36(1): Alkaya, E., Erguder T.H., Demirer GN., Effect of operational parameters on anaerobic codigestion of dairy cattle manure and agricultural residues: A case study for the Kahramanmaras region in Turkey, Eng. Life Sci. 10(6): Erguder T.H., Wittebolle L., Marzorati M., Boon N., Verstraete W., Environmental factors shaping the ecological niches of ammonia-oxidizing archaea. FEMS Microbiology Reviews, 33 (5), Erguder T.H., Boon N., Vlaeminck S.E., Verstraete W., Partial nitrification achieved by pulse sulfide doses in a sequential batch reactor, Environ. Sci. Tech., 42 (23), Dogan E., Dunaev T., Erguder T.H., Demirer G.N., Performance of leaching bed reactor converting the organic fraction of municipal solid waste to organic acids and alcohols, Chemosphere, 74 (6), Erguder T.H., Demirer G.N., Low strength wastewater treatment with combined granular anaerobic and suspended aerobic cultures in upflow sludge blanket reactors, J. Environ. Eng. ASCE., 134 (4),

110 Prof. Dr. Tülin Güray ÇalıĢmaAlanları Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoloji Ph.D., ODTÜ, Biyoloji SeçilmiĢ Yayınları C.Chirica,T.Güray, G.C.Gürakan and T.F.Bozoğlu, Characterization of extracellular B-lactamases from penicillin G resistant cells of Streptococcus thermophilus.. "J. of Food Protection", 61, (1998), p T.Güray and T.Güvenç, Characterization of sheep liver N-acetyltransferase. "Biochem. Arch.", 13, (1997), p T.Güray and T.Güvenç, Sheep tissue acetyl coenzyme A-dependent arylamine N-acetyltrans- ferases.. "Comp.Biol.Physiol.", 118C, (1997), p ĠĢcan, M.Moderasi and T.Güray, Production of superoxide radicals by sheep liver nitrofurantoin reductase:in vitro effects of nitrofurantoin in metabolites on DNA.. "Toxicol. in Vitro", 9, (1995), p M.ĠĢcan, H.Rostami, M.ĠĢcan, T.Güray, A.Rautio and O.Pelkonen, Interindividual variability of coumarin 7-hydroxylation in a Turkish population.. "Eur. J. Clin. Pharmacol", 47, (1994), p G Sadi,N Eryilmaz,E Tütüncüoğlu,ġ Cingir,T Güray, Changes in expression profiles of antioxidant enzymes in diabetic rat kidneys. "Diabetes Metab Res Rev ", 28, (2012), p Sadi G, Eryılmaz N, Tütüncüoğlu E, Cıngır ġ, Güray T, Changes in expression profiles of antioxidant enzymes in diabetic rat kidneys. "DIABETES/METABOLISM RESEARCH AND REVIEWS DOI: /dmrr.1302",, (2011), p.. Sadi G and Guray T, Gene expressions of Mn-SOD and GPx-1 in streptozotocin induced diabetes:effect of antioxidants.. "Mol Cell Biochem", 327, (2009), p Sadi G, Yilmaz O, Guray T, Effect of vitamin C and lipoic acid on streptozotocin-induced diabetes gene expression:mrna and protein expressions of Cu-ZnSOD and catalase.. "Molecular and cellular biochemistry", 309, (2008), p

111 Yrd. Doç. Dr.Tülin Yanık ÇalıĢmaAlanları Monogenic obesity Neurodegeneration Lisans, Ege Üniversitesi, Biyoloji Ph.D., The George Washington University, Genetics And Cell Biology SeçilmiĢ Yayınları Niamh X. Cawley, Tulin Yanik, Irina Arnaoutova, Hong Lou, Nimesh Patel, and Y. Peng Loh. Techniques in neuropeptides processing, trafficking, and secretion. (2008)Springer protocols: Neurochemistry, Neuropeptide Techniques 39:67-96 Tulin Yanik, Geraldina Dominguez, Michael J. Kuhar, Emanuele Miraglia Del Guidice and Y. Peng Loh. (2006) The Leu34Phe ProCART Mutation leads to CART deficiency: A possible cause for obesity in humans. Endocrinology. 147(1): Tulin Yanik and Robert P. Donaldson. (2005) A protective interaction between catalase and isocitrate lyase in peroxisomes. Arch. of Biochem. and Biophys. 435: Niamh X. Cawley, Jiechun Zhou, Joanna M. Hill, Daniel Abebe, Sylvie Romboz, Tulin Yanik, Ramona M. Rodriguiz, William C. Wetsel, Y. Peng Loh. (2004). The carboxypeptidase E knockout mouse exhibits endocrinological and behavioral deficits. Endocrinology 145:

112 Prof. Dr. Ufuk BölükbaĢı ÇalıĢmaAlanları Biotechnology Enzyme Technology Lisans, ODTÜ, Kimya Mühendisliği M.S., ODTÜ, Gıda Mühendisliği Ph.D., Iowa State University, Kimya Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları KocabaĢ, D.S., Bakir U., Philips SEV, McPherson M.J., Ögel Z.B., Purification, characterization, and identification of a novel bifunctional catalase-phenol oxidase from Scytalidium thermophillum. "Applied Microbiology and biotechnology", 79, (2008), p YaĢinok, A.E., Biran, S., KocabaĢ, A., Bakir, U., Xylanase from a soil isolate, Bacillus pumilus: gene isolation, enzyme production, purification, characterization and one-step separation by aqueous-two phase system. "World journal of microbiology and biotechnology", 26, (2010), p Akpinar, O., Erdogan, K., Bakir, U., Yilmaz, L., Comparison of acid and enzymatic hydrolysis of tobacco stalk xylan for preparation of xylooligosaccharides. "LWT-Food Science and Technology", 43, (2010), p Kocabas, D.S., Ogel, Z.B. and Bakir U., Screening of tree leaves as annual renewable green biomass for phenol oxidase production and biochemical characterization of mulberry (Morus alba) leaf phenol oxidases. "World journal of biotechnology and microbiology", 27, (2011), p Bahcegul, E., Tatli, E., Haykir, I., Apaydin, S., Bakir, U., Selecting the right blood glucose monitor for the determination of glucose during the enzymatic hydrolysis of corncob pretreated with different methods,."bioresource Technology", 102, (2011), p Akpinar, O., Okan, L., Bostanci, S., Bakir U. and Yilmaz, L, Title: The Optimization of Dilute Acid Hydrolysis of Cotton Stalk in Xylose Production. "Applied Biochemistry and biotechnology", 163, (2011), p

113 Prof. Dr. Ufuk Gündüz ÇalıĢmaAlanları Multi-drug resistance in various cancer types, Drug targeting in cancer by nanoparticles, Bio-Hydrogen Production using photosynthetic bacteria Lisans, Iowa State University, Kimya Mühendisliği M.S., Iowa State University, Kimya Mühendisliği Ph.D., ODTÜ, Biyoloji Bölümü SeçilmiĢ Yayınları Yakar, A., Tansik, G., Keskin, T., Gündüz, U., Tailoring the magnetic behavior of polymeric particles for bioapplications, Journal of Polymer Engineering 33, 3, (2013) Khodadust, R., Mutlu, P.,Yalçın, S., Ünsoy, G., Gündüz, U., Polyinosinic:polycytidylic acid loading onto different generations of PAMAM dendrimer-coated magnetic nanoparticles, Journal of Nanoparticle Research (2013) 15:1860. Alpsoy,A., YaĢa,S., Gündüz,U., Etoposide resistance in MCF-7 breast cancer cell line is marked by multiple mechanisms, Biomedicine & Pharmacotherapy 68 (2014) Ozgur, E., Mars, A.E., Peksel, B., Louwerse, A., Yucel, M., Gündüz, U., Claassen, P.A.M., Eroglu, I., "Biohydrogen Production from Beet Molasses by Sequential Dark and Photofermentation", International J. of Hydrogen Energy 35, (2010) Kosova, B., Tezcanlı, B., Ekiz, H.A., Cakir, Z., Selvi, N., Dalmizrak, A., Kartal, M., Gündüz, U., Baran, Y., Suppression of STAT5A Increases Chemotherapeutic Sensitivity in Imatinib-Resistant and Imatinib-Sensitive K562 Cells Leukemia & Lymphoma 51, 10 (2010) AfĢar, N., Özgür, E., Gürgan, M., Akköse, S., Yücel, M., Gündüz, U., Eroglu, E., Hydrogen Productivity of Photosynthetic Bacteria on Dark Fermenter Effluent of Potato Steam Peels Hydrolysate, International J. of Hydrogen Energy 36, (2010) Iseri, O.D., Kars, M.D., Arpaci, F., Atalay, C., Pak, I., Gündüz, U., Drug resistant MCF-7 cells exhibit epithelial-mesenchymal transition gene expression pattern, Biomedicine and Pharmacotherapy 65, 1 (2011) Dönmez, Y., Akhmetova, L., IĢeri, O.D., Kars, M.D., Gündüz, U., Effect of MDR Modulators Verapamil and Promethazine on Gene Expression Levels of MDR1 and MRP1 in Doxorubicin- Resistant MCF-7 Cells, Cancer Chemotheraphy and Pharmacology 67, 4, (2011)

114 Prof. Dr. Ülkü YetiĢ ÇalıĢmaAlanları Primary research interest is on physiochemical operations in water, wastewater and hazardous waste treatment systems Current research focuses on hazardous waste management Applications of membranes processes for drinking water treatment and industrial wastewater treatment/reclamation Integrated pollution prevention and control, and understanding of disinfection by-product formation in water treatment Lisans, ODTÜ, Kimya Mühendisliği M.S., University of Pittsburgh, Kimya Mühendisliği PhD., ODTÜ, Çevre Mühendisliği SeçilmiĢ Yayınları Uzal, N., Yilmaz, L. and Yetis, U, Microfiltration/Ultrafiltration as Pretreatment for Reclamation of Rinsing Waters of Indigo Dyeing Wastewater. "Desalination", 240, (2009), p M. Unlu, H. Yukseler, U. Yetis, Indigo dyeing wastewater reclamation by membrane-based filtration and coagulation processes. "Desalination", 240, (2009), p.. Al, E., Yetis, U, Application of the contingent valuation method in a developing country: a case study of the Yusufeli Dam in northeast Turkey. "Water Science and Technology", 62, (2010), p Dogru, B, Kerestecioglu, M., Yetis, U., Assessment of the Best Available Wastewater Management Techniques for a Textile Mill: Cost and Benefit Analysis. "Water Science and Technology", 61, (2010), p Uzal,N., Yılmaz, L., and Yetis, U, Nanofiltration and Reverse Osmosis for Reuse of Indigo Dye Rinsing Waters. "Separation Scıence and Technology", 45, (2010), p Yigit,C.,Maden,G., Disa, N., Yılmaz, O., Ogutverici, A., Alp,E.,Unlu,K., Gokç, Hazardous Waste Management in Turkey: Current Legislative Requirements and Future Challenges. "Desalination and Water Treatment", 26, (2011), p Yilmaz, O., Dogru, B., Yetis, U., Current practices in hazardous waste management in Turkey, Desalination and Water Treatment. "Desalination and Water Treatment ", 26, (2011), p.. 110

115 Prof. Dr. Vasıf Hasırcı ÇalıĢmaAlanları Hydrogels, controlled drug delivery (antibiotic, pain reliever, growth factor, anticancer agent), intelligent systems and liposomes, tissue engineering (bone, cartilage, retinal pigment epithelial cells, cornea, nerve, cardiac tissue), biodegradable polymers, hard tissue repair, nanobiomaterials. Biosensors, bioreactors, biodegradation (biopolymers, pesticides) SeçilmiĢ Yayınları Lisans, ODTÜ, Biyoloji M.S., ODTÜ, Biyoloji Ph.D., University of Reading, Kimya Karadas, O., Yucel, D., Kenar, H., Kose, G., Hasirci, V. (2014). Collagen scaffolds with in situ-grown calcium phosphate for osteogenic differentiation of Wharton s jelly and menstrual blood stem cells. Journal of Tissue Engineering And Regenerative Medicine, 8, Kilic, C., Girotti, A., Rodriguez-Cabello, J., C., Hasirci, V. (2014). A collagen-based corneal stroma substitute with micro-designed architecture. Biomaterial Science, 2, Bahcecioglu, G., Buyuksungur, A., Kiziltay, A., Hasirci, N., Hasirci, V. (2014). Construction and in vitro testing of a multilayered, tissue-engineered meniscus. Journal of Bioactive and Compatible Polymers, 29(3), Ozcelik H., Padeste C., Hasirci V. (2014) Systematically organized nanopillar arrays reveal differences in adhesion and alignment properties of BMSC and Saos-2 cells. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. DOI: /j.colsurfb Halili A. N., Hasirci N., Hasirci V. (2014). A multilayer tissue engineered meniscus substitute. Journal of Material Science: Materials in Medicine, 25, Eke G., Kuzmina A., Goreva A., Shishatskaya E., Hasirci N., Hasirci V. (2014) In vitro and Transdermal Penetration of PHBV Micro/Nanoparticles. Journal of Nanomaterials Science: Materials in Medicine. DOI: /s D. Arslantunali, G. Budak, V. Hasirci. 2013, "Multiwalled CNT-pHEMA composite conduit for peripheral nerve repair", Society for Biomaterials, DOI: /jbm.a Pinar Yilgor Huri, Gazi Huri, Umit Yasar, Yurdanur Ucar, Nurten Dikmen, Nesrin Hasirci, Vasif Hasirci, A Biomimetic Growth Factor Delivery Strategy for Enhanced Regeneration of Iliac Crest Defects, Biomedical Materials,(doi: / /8/4/045009) 111

116 Yrd. Doç. Dr. YeĢim Soyer ÇalıĢmaAlanları Food Microbiology, Food Safety, Molecular Subtyping of Foodborne Pathogens ODTÜ Gıda Mühendisliği Bölümü bünyesindeki Gıda Güvenliği Laboratuvarımızdaki araģtırma konumlarımız gıda kaynaklı hastalık etmeni olan mikroorganizmaların, özellikle de bakterilerin, insanlara nasıl gıda yolu ile iletildiğini ve de farklı konakçılardaki evrimini incelemektir. Çiftlikten çatala giden zinciri incelerken klasik mikrobiyolojik yönetmelerin yanı sıra modern moleküler biyoloji tekniklerini de kullanmaktayız. Lisans, Ankara Üniversitesi, Gıda Mühendisliği M.S., Ankara Üniversitesi, Gıda Mühendisliği PhD., Cornell University, Food Science SeçilmiĢ Yayınları Yeni, F., Yavas, S., Soyer, Y. and H. Alpas Rapid and standardized methods for detection of foodborne pathogens and mycotoxins on fresh produce. Food Control, 40: Soyer, Y., J. Richards, K. Hoelzer, L.D. Warnick, E. Fortes,P. McDonough, N.B. Dumas, Y.T. Grohn, and M. Wiedmann Antimicrobial drug resistance patterns among cattle and human associated Salmonella strains. Journal of Food Protection, 76 (10): Soyer, Y., A. Moreno Switt, M. A. Davis, J. Maurer, P. L. McDonough, D. J. Schoonmaker-Bopp, N. B. Dumas, T. Root, L. D. Warnick, Y. T. Gröhn and M. Wiedmann Salmonella 4,5,12:i:-: an emerging Salmonella serotype that represents multiple distinct clones. Journal of Clinical. Microbiology 47 (11): Soyer, Y., R. H. Orsi, L. D. Rodriguez-Rivera, Q. Sun and M. Wiedmann Genome wide evolutionary analyses reveal serotype specific patterns of positive selection in selected Salmonella serotypes. BMC Evolutionary Biology 9: Soyer, Y., S. D. Alcaine, D. Schoonmaker-Bopp, T. P. Root, L. D. Warnick, P. L. McDonough, N. B. Dumas, Y. T. Gröhn and M. Wiedmann Pulsed-field Gel Electrophoresis diversity of human and bovine clinical Salmonella isolates. Foodborne Parthogens and Disease 7 (10): Davis, M. A., J. Y. Lim, Y. Soyer, H. Harbottle, Y. F. Chang, D. New, L. Orfe, T. E. Besser, and D. R. Call Development and validation of a resistance and virulence gene microarray targeting Escherichia coli and Salmonella enterica. Journal of Microbiology Methods 82 (1):

117 Prof. Dr. Zeki Kaya ÇalıĢmaAlanları Molecular genetics of trees and crops (QTL mapping, genomic mapping, DNA markers). Conservation of genetic resources of crop and tree species. Population genetics of forest trees, genetic adaptation, ecological genetics of plants. Breedings of forest trees. Propagation of forest trees by tissue culture. Lisans, Ġstanbul Üniversitesi, Orman Bilimi M.S., Oregon State University, Forest Science Ph.D., Oregon State University, Forest Science SeçilmiĢ Yayınları Gulsoy, A.D., Gulsoy, A.M., Cengel, B. and Kaya Z.2014.The evolutionary divergence of Pinus nigra subsp. pallasiana and its varieties based on noncoding trn regions of chloroplast genomes. Turk. J. Bot. 38: (DOI: /bot ) Dizkirici A., Ekici M and Kaya Z.2013.Comparative Molecular Phylogenetics of Astragalus sections from Turkey with New World Astragalus species using nrdna ITS sequences. Plant Sytematics and Evolution (in Press). Dizkirici A., Kansu C., Onde S., Birsin M., Ozgen M. and Kaya Z.2013.Phylogenetic relationships among Triticum L. and Aegilops L. species as genome progenitors of bread wheat based on sequence diversity in trnt-f region of chloroplast DNA.Genetic Resources and Crop Evolution. (2013. DOI /s x). Ozgen M., Ozdilek A., Birsin M.A., Onde S., Sahin D., Acikgoz E. and Kaya Z.2012.Analysis of ancient DNA from in vitro grown tissues of1600-year-old seeds revealed the species asanagyris foetida. Seed Science Research 22, ((doi: /s ). Cengel, B., Kaya, Z., Tayanc, Y., Kandemir, G.E., Velioglu, E., Alan, M. and Kaya Z.2012.Magnitude and efficiency of genetic diversity captured from seed stands of Pinus nigra (Arnold) subsp. pallasiana in established seed orchards and plantations.new Forests 43(3) : ((DOI: /s ). Zeybek, E., Onde, S. and Kaya, Z.2012.Improved in vitro micropropagation method with adventitious corms and roots for endangered saffron. Cent. Eur. J. Biol. 7(1): Ozdilek, A., Cengel, B., Kandemir, G., Tayanc, Y., Velioglu, E.,and Kaya, Z.2012.Molecular phylogeny of relict endemic Liquidambar orientalis Mill based on sequence diversity of the chloroplast-encoded matk gene.plant Sytematics and Evolution 298:

118 BĠYOTEKNOLOJĠ ARAġTIRMA GRUPLARI 114

119 ODTÜ BĠTKĠ BĠYOTEKNOLOJĠSĠ GRUBU Prof. Dr. Meral Yücel Prof. Dr. Hüseyin Avni Öktem Prof. Dr. Füsun Ġnci Eyidoğan Doç. Dr. Remziye Yılmaz Modern biyoteknolojinin tarıma yönelik uygulamaları 1990 lı yıllara kadar herbisit, böcek ve hastalıklara karģı direncin artırılması konularında yoğunlaģırken, yeni nesil transgenik bitkilerle stres direnci, kalite iyileģtirilmesi, yenilebilir aģılar, biyomölekül üretimi ve çevreyi korumaya yönelik geniģ bir yelpaze de geliģmektedir. Orta Doğu Teknik Üniversitesi nde Bitki Biyoteknolojisi ve Genetiğine yönelik çalıģmalar 1990 lı yılların baģında grubumuzca baģlamıģ olup 24 yıllık bir birikim oluģmuģtur. Grubumuz bu alanda ülkemizde bir çok ilke imza atmıģ ve gen transferi, mikroarray teknolojileri, DNA çipleri gibi bazı ileri teknolojilerin ülkemizde öncülüğünü yapmıģtır. ODTÜ Bitki Biyoteknolojisi AraĢtırma Alanları Transgenik teknolojiler: kullanılarak bitkilere abiyotik stres (tuz-kuraklık) toleransı kazandırılması MicroArray (Dizi) Teknolojileri: Stres koģulları altında mikroarray sistemleri ile gen ifade profillerinin belirlenmesi ve moleküler mekanizmanın anlaģılmasına yönelik çalıģmalar Stres Fizyolojisi ; Sıcaklık, kuraklık, tuz ve ağır metaller gibi abiyotik stres faktörlerinin bitkiler üzerinde oluģturdukları etkilerin fizyolojik ve biyokimyasal yöntemler ile saptanması. Ġlk proje çalıģması; Sıcaklık, Soğukluk, Kuraklık, Tuzluluk ve Metal Stresine Dayanıklı Zirai Bitkilerin Tesbiti ve Gen Transferine Yönelik ÇalıĢmalar TÜBĠTAK TBAG 31-DPT Projesi ( ) ile resmi çalıģmalar Biyoloji Bölümünde Prof.Dr.Meral Yücel ve Prof.Dr.Hüseyin A.Öktem in Laboratuvarında baģlatılmıģtır. Bu projeyi diğer projeler takip etmiģ ve yaklaģık 10 adet TÜBĠTAK, 3 DPT, 2 BOREN ve 45 ODTÜ-BAP ve 1 adet EUREKA projesi gerçekleģtirilmiģ olup bazıları aģağıda belirtilmiģtir. Herbisitlere Dirençli Transgenik Tütün Bitkilerinin Biyoteknolojik Yöntemlerle GeliĢtirilmesi TÜBĠTAK TBAG-1262 ( ) 115

120 Bitki Hormonlarının Buğdayda Stres faktörlerini (Sıcaklık, Kuraklık, Tuzluluk) Önleyici Etkilerinin Moleküler Düzeyde AraĢtırılması ( ) TÜBĠTAK- BDP Farklı Bitki Transformasyon Vektörlerinin Hazırlanması ve Protoplast ve Agrobacterium Sistemlerinde denenmesi TÜBĠTAK-TBAG-1586 ( ) Borun Tahıllar Üzerinde OluĢturduğu Toksik Etkinin Fizyolojik ve BiyokimyasAl Yönlerinin AraĢtırılması TOGTAG-TARP ( ) Bu çalıģmalar kapsamında Biyoloji Bölümünde Bitki Moleküler Biyolojisi, Biyoteknolojisi ve Biyokimya laboratuvarında - bitki doku kültürü, rejenarasyonu ve gen aktarımına yönelik yöntemler (Agrobacteriuma dayalı gen aktarımı, Partikül bombardımanı, Elektroporasyon gibi) oturtulmuģtur. Ağırlıklı olarak çalıģmalar buğday, arpa, mercimek, patates, nohut, pirinç, Ģekerpancarı ve tütün bitkilerinde gerçekleģtirilmiģtir. Aynı zamanda Deneysel Bitki Fizyolojisi dersi (Experimental Plant Physiology -Bio442) ile bu konularda çalıģmak isteyen Lisans ve Y.Lisans öğrencileri bitki fizyolojisi, genetik ve bitki biyoteknolojisinin temel ilkeleri konularında eğitilmiģ ve eğitilmeye devam edilmektedir. Laboratuvarımızda ilk gen taransferi çalıģmaları tütün bitkisinde Agrobacterium tumefaciens ile gercekleģtirilmiģtir (1993). Daha sonra, genetik transformasyonun en zor olduğu bitkilerden biri olan mercimekte sekiz yılı aģkın bir araģtırma sonucunda dünyada ilk kez Agrobakteriyuma dayalı stabil bir gen transferi yöntemi geliģtirilmiģtir. Buna ek olarak yine zor bitkiler olarak kabul edilen buğday, arpa, Ģekerpancarı gibi bitkiler ile de çalıģmalar yürütülmüģtür. Mahmoudian M., Yücel M., Oktem H.A. Transformation of Lentil (Lens culinaris M.) Cotyledonary Nodes via Vacuum Infiltration of Agrobacterium tumefaciens. Plant Mol. Biol. Rep. Vol 20 (3), , Mahmoudian M., Celikkol U., Yücel M., Oktem H.A. Vaccum Infiltration Based Agrobacterium Mediated Gene Transfer to Lentil (Lens culinaris) Tissues. Biotech. Biotechnol. Eq. 16 (1), 24-29, Çelikkol Akçay, U., Mahmoudian, M., Kamci,H., Yucel M., Öktem, H.A. Agrobacterium tumefaciens-mediated genetic transformation of a recalcitrant grain legume lentil (Lens culinaris Medik). Plant Cell Reports,.1 11, yılında ODTÜ Biyoloji Bölümü öğretim üyelerinden Prof.Dr. Hüseyin Avni Öktem ve Prof.Dr.Meral Yücel yönetiminde 13 kiģilik (içinde Moleküler Biyoloji, Biyoloji, Biyokimya, Biyoteknoloji uzmanları ve Elektrik Elektronik, Makina ve Uçak Mühendislerinden oluģan) bir ekip ile bitki biyoteknolojisi çalıģmalarında kullanılacak bir Gen Tabancası geliģtirilmiģtir. Bu cihazla tütün, mercimek, nohut, pamuk, arpa, soğan, Ģekerpancarı gibi bitkilere gen aktarım çalıģmalarında baģarılı olduğu gösterilmiģtir. Gen Tabancası Projesi çalıģması TÜBĠTAK, TTGV ve TÜSĠAD tarafından organize edilen Yedinci Teknoloji Ödülleri kapsamında Biyoteknoloji, Nanoteknoloji ve Nanobiyoteknoloji Özel Ödül kategorisinde birincilik ödülü almıģtır. Son yıllarda ise grubumuzun koordinatörlüğünde bazı kaynakların TürkçeleĢtirilmesine katkı sağlanması amacı ile muhtelif çeviriler gerçekleģtirilmiģtir. C.N. Stewart, JR. (Ed.) Bitki Biyoteknolojisi ve Genetik : Ġlkeler, Teknikler ve Uygulamalar, Hüseyin Avni Öktem, Meral Yücel (Çeviri Editörleri); Plant Biotechnology and Genetics : Principles, Techniques and Applications, 1. Basımından çeviri, XXVI renkli s.,nobel Yayıncılık, Ankara, Bu çeviri kitabı Ülkemizde Bitki Biyoteknolojisinin geliģmesine katkı sağlamıģ ve çoğu bitki biyoteknolojisi konusunda araģtırma yapan ve ders veren bilim insanlarının katkıları ile gerçekleģtirilmiģtir. 116

121 Ülkemizde Biyogüvenlik Kanunu 2010 yılında yürürlüğe girmiģtir. Buna yönelik Gıda ve yem amaçlı genetik yapısı değiģtirilmiģ organizmaların ve ürünlerin ithalat iģlemleri ile ilgili kontrol ve denetime yönelik yönetmelikler oluģturulmuģ ve GDO tespit ve miktar tayini önem kazanmıģtır. Kanun ve yönetmelik hazırlıklarında grubumuz üyelerinin uzun yıllara dayanan katkı ve destekleri olmuģtur. Laboratuvarımızda bu konuya yönelik olarak gıda, yem ve tohumlarda GDO analiz yöntemleri oturtulmuģtur. Biyoloji Bölümü ve Merkez Laboratuvar Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Ar-GE Merkezi ortak çalıģmaları sonunda ODTÜ Merkez Laboratuvarı Moleküler Biyoloji Biyoteknoloji AR-GE Merkezi gıda, tohum ve yemlerde GDO tespiti, miktar tayini konusunda 31 Aralık tarihinde TÜRKAK Akreditasyon belgesi alarak bu konuda ülkemizde analiz yapabilen az sayıdaki laboratuvarlar arasında yer almıģtır. Grubumuz, Biyoteknoloji konusunun ülkemizde tanıtılması geliģtirilmesi amacıyla faaliyet göstermekte olan en köklü sivil toplum kuruluģu olan Biyoteknoloji Derneğinin faaliyetlerine de aktif olarak katkı sağlamaktadır. Bu çerçevede grup üyelerimizin yoğun katkıları ile dünyanın en büyük Biyoteknoloji etkinliklerinden biri olan 15th European Congress on Biotechnology, Prof. Öktem BaĢkanlığında Eylül 2012 de Ġstanbul da düzenlenmiģtir. Grubumuz araģtırmalarını gerçekleģtirdiği 25 yıllık dilimde yurtiçi ve yurtdıģından birçok farklı kurum, kuruluģ ve araģtırmacılar ile ortak faaliyetler geçekleģtirmiģ ve ülkemizi birçok platformda baģarı ile temsil etmiģtir. Bu bağlamda, Macaristan, Hollanda, Ġngiltere, ABD, Ġsrail, gibi farklı ülkelerle ortak faaliyetler gerçekleģtirilmiģtir. Bitki Biyoteknolojisi dinamik bir alan olup bu konuda birçok Y.Lisan ve Doktora öğrencisi yetiģtirimiģ bulunuyoruz. 25 yıllık bir zaman diliminde toplam 46 Y.Lisans ve 25 Doktora tez çalıģması tamamlanmıģ, halen 10 Doktora ve 2 Y.Lisans çalıģması devam etmektedir. Toplam SCI yayın sayısı 50 ve ulusal hakemli yayın ve Ulusal/uluslararası tebliğlerin sayısı 170 in üzerindedir. 12 Kitap bölümü ve bir kitap çevirisi mevcuttur. Tuz ve kuraklık sterine dayanıklı transgenik buğday çeģitlerinin geliģtirilmesine yönelik çalıģmalarımız devam etmektedir. Bitki biyoteknolojisinin,bu konuda çalıģmalar yapan araģtırmacıların yanı sıra bitki yetiģtiriçileri içinde güclü ve yeni bir araç olma potansiyeli çok yüksektir. Hızlı iklim değiģikliği, su baskınları ve kuraklık, küresel ısınma ve bunlara ek olarak söz konusu değiģikliklerin getirecegi yeni zararlılarla ve hastalıklarla mücadelede ihtiyaç duyulan bir teknoloji olduğu görüģündeyiz. Bu bağlamda yeni geliģmekte olan Yenilenebilir Biyoenerji konusunda da grubumuzda son yıllarda yoğun araģtırma faaliyetleri baģlatılmıģ olup, mikroalglerden biyodizel üretimi konusunda baģarı sağlanmıģtır. Ülkemizde Bitki biyoteknolojisi, çoklu disiplin anlayıģına sahip ve dünyanın gıda ve giyim ihtiyacına olduğu kadar enerji (biyodizel yakıt), ilaç ve farmasötik ihtiyaçlarına da çözümler sunacak olan genç ve dinamik araģtırmacılar tarfından Ģekillendirilecektir. Bu çalıģmaların daha ileri taģınacagını ümit ediyoruz. Bu bağlamda, laboratuvarımızda çalıģmalarını tamamlayan bir çok öğrencimiz halen ülkemizde ve yurtdıģında muhtelif Üniversite ve kuruluģlarda bitki biyoteknolojisi konusundaki faaliyetlerini son derece baģarılı bir Ģekilde sürdürmekte ve bayrağı yeni nesillere taģımaktadırlar. DOKTORA ÖĞRENCĠLERĠ: Abdülhamit BATTAL, Ayten EROĞLU, Oya ERCAN, Ceren KARAKAS, Ferhunde AYSĠN, Melih ONAY, IĢkın KÖSE, Derya GÖKÇAY, Dilek ÇAM YÜKSEK LĠSANS ÖĞRENCĠLERĠ: Görkem BAYSAL, Çaka ĠNCE, 117

122 SeçilmiĢ Yayınlar ve Projeler: 1. Aydın G, Yücel M, Chan M.T., Öktem H.A. Evaluation of abiotic stress tolerance and physiological characteristics of potato (Solanum tuberosum L. cv. Kennebec) that heterologously expresses the rice Osmyb4 gene. Plant Biotechnology Reports, 8(3): 295:304, M. C. Baloglu, A. Battal, G. Aydin, A. Eroglu, M. T. Oz, M. Kavas, H. A. Oktem, M. Yucel. Vector constructıon strategies for transformation of wheat plant. The Journal of Animal & Plant Sciences, 23(3): , Baloglu, MC; Oz, MT; Oktem, HA; Yucel, M. Expression Analysis of TaNAC69-1 and TtNAMB-2, Wheat NAC Family Transcription Factor Genes Under Abiotic Stress Conditions in Durum Wheat (Triticum turgidum). Plant Molecular Bıology Reporter, 30(5) pp , Kayihan, C., Eyidoğan, F., Afsar, N., Oktem H.A., Yucel, M.,, Cu/Zn superoxide dismutase activity and respective gene expression during cold acclimation and freezing stress in barley cultivars, Biologia Plantarum, 56: Akcay U. C., Ercan O., Kavas M., Yildiz L., Yilmaz C., Oktem H. A., Yucel M. Drought-induced oxidative damage and antioxidant responses in peanut (Arachishypogaea L.) seedlings. Plant Growth Regul. 61, Öz M.T., Yılmaz R, Eyidoğan F, Graaf L.D., Yüce M., Öktem H.A. Microarray Analysis of Late Response to Boron Toxicity in Barley (Hordeum vulgare L.) Leaves, Turk J Agric For, Volume 33 (2) Nac Tipi Transkripsiyon Faktörleri Kullanılarak Abiyotik Stres Dirençli Transgenik Buğday ÇeĢitlerinin GeliĢtirilmesi ve Elde Edilen Bitkilerde Abiyotik Stres KoĢullarında Gen Ġfade Profillerinin Mikroarray Yöntemiyle Ġncelenmesi, TÜBĠTAK TOVAG ( TL) 8. BDP Kültür Bitkilerinde Tuz ve Kuraklık Stresine Dirençli Transgenik Bitkilerin GeliĢtirilmesi. Öktem H.A., Ellialtıoğlu ġebnem, Laszlo Szabados, TÜBĠTAK 9. Patates ve Tütünde Namatod Dirençli Transgenik Bitkilerin GeliĢtirilmesi, DPT (80 Milyar TL) 10. Bor Stresi Altında Buğday Bitkisinin Gen Ġfade Profillerinin Ġncelenmesi ve Tarımborun Bu Strese Tepki Üzerine Etkilerinin Moleküler Seviyelerde Belirlenmesi, BOREN (125,000 TL) 118

123 ODTÜ BĠYOHĠDROJEN ARAġTIRMA GRUBU Prof. Dr. Ġnci Eroğlu Prof. Dr. Meral Yücel Prof. Dr. Ufuk Gündüz Yrd. Doç. Dr. Harun Koku ArĢ. Gör. Muazzez Gürgan ArĢ. Gör. Emrah Sağır ArĢ. Gör. Emine Kayahan FOTOSENTEZĠ TAKLĠT EDEN BĠR ENERJĠ DÖNÜġÜM SĠSTEMĠ KEġFEDEBĠLĠR MĠYĠZ? Bacteriorhodopsin kullanılarak ıģık güdümlü proton pompalarından oluģan enerji dönüģüm hücresi tasarımı ( ) A: Bacteriorhodopsinin (BR) ıģığa bağlı yapısal değiģimi. B: BR ın uzun süreli aydınlatmaya tepkisi (Prof. Dr. Lemi Türker in katkılarıyla) 1,2 C: BR ın flaģ ıģığa tepkisi (Prof. Dr. Ordal Demokan ve Prof. Dr. Çiğdem Erçelebi nin katkılarıyla) 119

124 Hidrojen Enerji Sistemi AraĢtırılması ve GeliĢtirilmesi (1990 ve sonrası) Mor, Kükürtsüz Bakterilerle Fotosentetik Hidrojen Üretimi Fizyoloji, Metabolizma ve Genetik ÇalıĢmaları 3,4 Rhodobacter türlerinin hidrojen üretim metabolizmasının Ģematik gösterimi 5,7 Rhodobacter capsulatus DSM1710 için istek üzerine tasarlanmıģ Affymetrix GeneChip ile metabolik analizler (2008 ve sonrası) 120

125 Biyokütleden Isısal ĠĢlem Yapılmadan Saf Hidrojen Eldesi (2006 ve sonrası) Zeytin atık suyu, patates kabuğu, Ģeker pancarı melası, Ģeker pancarı koyu Ģerbeti, arpa samanı gibi biyokütleden biyolojik hidrojen üretimi prosesleri geliģtirilmiģtir. 6,8 Fotobiyoreaktör Ölçek Büyütme AraĢtırmaları Küçük ölçekli laboratuvar denemeleri 55 ml lik cam reaktörlerde (A) soğutmalı inkübatörlerde yapılmaktadır. Fotobiyoreaktör ölçeği açıkhava denemelerinde içten soğutmalı (B) panel reaktörlerde 4-40 L ve (C) borusal reaktörlerde 90 L ye kadar büyütülmüģtür. 3 aya varan sürekli hidrojen üretimi gerçekleģtirilmiģtir. 8,9 121

126 SeçilmiĢ Projeler 1. "Biyolojik Model Sistemlerde IĢık Enerjisinin Elektrik Enerjisine DönüĢümü", Türkiye Bilimsel ve Teknik AraĢtırma Kurumu, TBAG 706, Ocak Ocak "GüneĢ Enerjisi ile Hidrojen Gazı Üretimi için bir Foto Biyo Reaktör GeliĢtirilmesi, TÜBĠTAK KTÇAG 115, Eylül "Mikroorganizmalar ve GüneĢ Enerjisi ile Sürekli Hidrojen Üreten Biyoproseslerin GeliĢtirilmesi", TÜBĠTAK-TBAG 1535, Eylül Eylül Rhodobacter Türlerindeki Hidrojenaz Enzimlerinin Biyoreaktörde Fotobiyolojik Hidrojen Üretim Verimliliğinin Arttirilmasina Yönelik Genetik Ve Biyokimyasal ÇalıĢmalar, EU COST-841 Aksiyonu AraĢtıma Projesi, HYVOLUTION: Non- thermal production of pure hydrogen from biomass, Avrupa Birliği Altıncı Çerçeve AraĢtırma Projesi (IP), Kontrat No , Ocak 2006 Ocak Soğuk ve sıcaklık stresinin Rhodobacter capsulatus bakterisinde hidrojen üretim metabolizması üzerine etkileri TÜBĠTAK 108T455. Kasım Kasım SeçilmiĢ Yayınlar 1. Eroğlu Ġ., Aydemir A., Türker L., Yücel A.M., "Photoresponse of Bacteriorhodopsin Immobilized in Polyacrylamide Gel Membranes", Journal of Membrane Science, 86: , Yücel M., Zabut B.M., Eroğlu Ġ., Türker L., Kinetic Analysis of Light Induced Proton Dissociation and Association of Bacteriorhodopsin in Purple Membrane Fragments under Continuous Illumination, Journal of Membrane Science, 104: 65-72, Yiğit D.Ö., Gündüz U., Türker L., Yücel M., Eroğlu Ġ., "Identification of By-Products in Hydrogen Producing Bacteria; Rhodabacter spheroides OU001 Grown in the Waste Water of a Sugar Refinery", Journal of Biotechnology, 70: , YetiĢ M., Gündüz U., Eroğlu Ġ., Yücel M., Türker L., Photoproduction of Hydrogen from Sugar Refinery Wastewater by Rhodobacter sphaeroides O.U.001, International Journal of Hydrogen Energy, 25: , Koku H, Eroğlu Ġ, Gündüz U, Yücel M, Türker L., Aspects of the metabolism of hydrogen production by Rhodobacter sphaeroides, Int J. Hydrogen Energy, 27(11-12): , Eroğlu E., Gündüz U, Yücel M, Türker L, Photobiological hydrogen production by using olive mill wastewater as a sole substrate source, International Journal of Hydrogen Energy, 29/2: , Kars G, Gündüz U, Yücel M, Türker L, and Eroğlu Ġ, Hydrogen production and transcriptional analysis of nifd, nifk and hups genes in Rhodobacter sphaeroides O.U.001 grown in media with different concentrations of molybdenum and iron, International Journal of Hydrogen Energy (IJHE), 31/11: , Boran E., Özgür E., Yücel M., Gündüz U., Eroğlu Ġ. Biohydrogen production by Rhodobacter capsulatus in solar tubular photobioreactor on thick juice dark fermenter effluent, Journal of Cleaner Production, 31/ , Androga D.D., Sevinç P., Koku H., Yücel M., Gündüz U., Eroğlu, Ġ. Optimization of temperature and light intensity for improved photofermentative hydrogen production using Rhodobacter capsulatus DSM 1710, International Journal of Hydrogen Energy (IJHE), 39/ ,

127 BĠYOMALZEME VE DOKU MÜHENDĠSLĠĞĠ ARAġTIRMA GRUBU (BIOMAT) Prof. Dr. Vasıf Hasırcı Prof. Dr. Gamze Köse Doç. Dr. Türker Baran Dr. Aysel Kızıltay Prof. Dr. Nesrin Hasırcı Doç. Dr. Fatma NeĢe Kök Y. Doç. Dr. Deniz Yücel Dr. Tugba Endoğan Tanır Prof. Dr. Gürdal Alaeddinoğlu Doç. Dr. AyĢe Eda Aksoy Y. Doç. Dr. Halime Kenar Dr. Arda Büyüksungur BIOMAT Grubu, 40 yıldır yaptıkları çalıģmalarla Türkiye de biyomalzemeler, doku mühendisliği, rejeneratif tıp, medikal nanoteknoloji, kontrollu ilaç salım sistemleri, biyoreaktörler ve biyosensörler gibi biyoteknolojinin tıp uygulamaları konularında ilk çalıģmaları baģlatan öncü grup olmuģtur. Bu gruptan yetiģen pek çok bilim insanı Türkiye nin ve Dünya nın değiģik üniversitelerinde ve kurumlarında değerli araģtırmalar yapmaktadır. BIOMAT Grubu nun AraĢtırma Alanları: Nano ve mikrodesenli yüzeyler: Saos 2, BMSC, HOP, kıkırdak ve meniscus, Wharton Jelly hücrelerinin çukur, kanal ve sütunlarla bezeli yüzeylerdeki davranıģlarının incelenmesi Yüzey modifikasyonu: biyomalzeme yüzeylerinin antimikrobiyal, antitrombojenik, protein ve hücre bağlanmasını artıran, süper-hidrofilik veya süper-hidrofobik yapılması Doku mühendisliği: Polimerik ve kompozit gözenekli yapıların 2- ve 3-boyutlu destekler olarak kalıcı veya biyobozunur olarak hazırlanması (kornea, sinir, kemik, kıkırdak, damar, retina, kalp kası, ağız mukozası, menisküs dokuları üretilmiģ, in vitro ve preklinik ortamlarda denenmiģtir). Yara iyileģmesini hızlandıracak, doku hasarını kısa sürede giderecek polimerik ve kompozit biyobozunur desteklerin hazırlanması (Deri desteği olarak hazırlanan bir malzememiz ticari ürüne dönüģmüģtür) Biyobozunur implantlar: kemik plakaları, ilaç salım sistemleri, nano ve mikrolifli sistemler, süngerlerin yapımı ve amaçlarına uygun biyobozunurluk özelliklerinde tasarlanması Biyouyumluluk: Polimerik ve kompozit malzemelerin hücre ile etkileģimi, toksik etkilerin araģtırılması ve biyouyumluluğun artırılması çalıģmaları Nano ve mikro biyoaktif molekül taşıyıcı sistemler: antibiyotikler, antikanser ilaçlar, büyüme faktörleri, pestisitler, deri hastalıklarına yönelik ilaçlar, genetik malzemeleri taģıyan sistemlerin yapımı, ve baģka biyoaktif ajanların vücut içinde yayılmadan kanser hücrelerine hedeflenmesini sağlayan akıllı mikro ve nano sistemlerin tasarım ve üretimi Lipozomlar: heparinle yüzey modifikasyonu yapılmıģ lipozomlar, silikoz mekanizmasının incelenmesi, fotoaktif lipozomlar, enzim hapseden yüzeyi polimer kaplı lipozomlar, kuantum taneciği yüklü lipozomlar ve bunlardan DNA ve ilaç salım çalıģmaları Enzim ve Hücre İmmobilizasyon sistemleri ve Biyosensörler: Enzim (glikoz oksidaz, katalaz, kolin oksidaz, amilaz, lakkaz) ve biyoaktif moleküllerin bağlandığı sistemler ve pestisit gibi atıklar ve benzeri moleküller için uygulanabilecek sensörler, kandaki Ģekeri ölçebilmek amacıyla geliģtirilmiģ glikoz sensörü 123

128 BIOMAT Grubu nun ÇalıĢmaları: Grubumuz öğretim üyelerinin danıģmanlığını yaptığı en az 80 Yüksek Lisans tezi ve 40 doktora tezi yönetilmiģtir. Bu çalıģmaların sonuçları 300'den fazla makale olarak hakemli bilimsel dergilerde yayınlanmıģtır. Ayrıca, grup üyelerinin, 3-boyutlu doku destekleri, yara örtüsü, kıkırdak desteği, yüzey-hücre etkileģimi, antimikrobiyal sert doku destekleri, zeolit-polimer kompozitleri ile ilgili buluģları için 8 patent baģvurusu yapılmıģ ve bunların bazıları onaylanmıģ, diğerleri incelemededir. BIOMAT Grubu nun Ġlkleri: BIOMAT grubu üyeleri Biyomalzeme ve Doku Mühendisliği alanında Türkiye de pek çok ilke imza atmıģtır. Bunların bazıları aģağıda verilmiģtir. Türkiye'deki ilk Biyomalzeme dersi olan Biomaterials (Bio 514) dersi ve bunun lisans düzeyi hali olan Bio 414 dersi 1980'lerin baģında ODTÜ de verilmiģtir. Türkiye'deki ilk ve en sürekli biyomalzeme alanındaki konferans olan Biyomedikal Bilim ve Teknoloji Sempozyumlarını (BIOMED) 1994'te baģlatmıģtır ve bu toplantı bu sene 20. yılını kutlamaktadır. 2., 5., 8.,13. ve 15. BIOMED toplantıları BIOMAT üyelerince düzenlenmiģtir. Uluslararası toplantılardan 4 th European Symposium on Biopolymers (ESBP 2007) ve Mediterranean School for Biotechnology (1992) BIOMAT üyelerince ve ilk kez Türkiye de düzenlenmiģtir. Türkiye'deki ilk Biyomalzeme ve Doku Mühendisliği Merkezi 2011 yılında üyelerimizce kurulmuģtur. Türkiyedeki ilk Biyoteknoloji AraĢtırma Birimi 1988 yılında kurulmuģtur. Tümüyle ODTÜ de yapılan çalıģmalara dayanan ve Türk Patent Enstitüsü tarafından Ġncelemeli Patent. ODTÜ içinde ilk kez oluģturulan Disiplinlerarası programların (Biyoteknoloji, Polimer Bilim ve Teknolojisi, Biyomedikal Mühendisliği, Mikro ve Nanoteknoloji) kurucu üyeleri arsında BIOMAT üyeleri önemli rol oynamıģlardır. BIOMAT Grubu nun Uluslararası Projeleri: BIOMAT üyeleri pek çok Avrupa Topluluğu projesinde rol almıģ almıģ ve 50'den fazla grupla ortak çalıģmalar yürütmüģtür. Uluslararası etkileģimleri ile ilgili bazı projeler aģağıda verilmiģtir. FP 6 STREP projesi olan Cornea Engineering FP 6 Network of Excellence Projesi olan ExperTissues FP 6 Marie Curie RTN projesi olan BioPolySurf FP7 projesi olan SkinTreat Prof. D.L.Wise (North Eastern Univ., Boston, ABD) ve Prof. V. Hasırcı'nın birlikte yürüttüğü Controlled Release Antibiotics projesi (NATO Collaborative Research Grant) NATO Science For Stability (SfS) Project The Production and Application of Microbial Polyesters In the Construction of Biodegradable Controlled Antibiotic Release Systems and Bone Fracture Repair Rods. V. Hasırcı liderliğinde ODTÜden 8 öğretim üyesi ve 1 endüstriyel ortak (Hipokrat) ile Dual Pain Reliever Controlled Release System projesi, V Hasırcı, D.B. Carr (Tufts University and New England Medical Center) ve D.L. Wise (Cambridge Scientific Inc. ve Northeastern University) ile Prof. R.Cain ve Dr.R.M.Wilkins (University of Newcastle upon Tyne) ve G.Alaeddinoğlu ve V. Hasırcı'nın ortaklaģa yürüttüğü Controlled Pesticide Release and Microbial Detoxification projesi (British Council Research Link) Prof. W. Bonfield ve Prof. G. Hastings, Interdisciplinary Research Centre (IRC) in Biomedical Materials (University of London Queen Mary and Westfield College, Royal Free Hos. Sch. Medicine, and Inst. Orthopedics,Royal Natl. Orth. Hosp, Ġngiltere) Prof. J.O.B.Carioca ve Prof.A.Harbans (Federal University of Ceara, Fortaleza, Brezilya) ve V. Hasırcı tarafından ortaklaģa yürütülen "Hydrogels of Natural Origin" projesi (CNPQ, Brezilya) V.Hasırcı H.G.Gassen ve N.G.Alaeddinoglu ortaklaģa baģlattığı "Cloning and Expression of The Glucose Oxidase Gene From Aspergillus niger" projesi (B.M.F.T. Grant; ODTÜ- Darmstadt T.H (Almanya). Bu proje ODTÜ de Biyoteknoloji EABD nın kuruluģuna yol açmıģtır. V. Hasırcı, N. Hasırcı ve Prof. I.L.Kamel (Drexel University, ABD) tarafından yürütülen "Mode of Crosslinking of Degradible PVNO Gels" projesi (NATO Research Grant) V.Hasirci, N.Hasirci ve I.L.Kamel (Drexel University, ABD) tarafından ortaklaģa yürütülen "Surface Modification of Intraocular Lenses" projesi (Destek: Cilco Inc., Iolab Inc., ve Drexel University Biomedical Eng. and Sci. Inst.). 124

129 Ulusal Projeler (son yıllar) Kalkınma Bakanlığı (DPT.2011K120350): Biyomalzeme ve Doku Mühendisliği Mükemmeliyet Merkezi Kurulması (BIOMATEN) Kalkınma Bakanlığı (MĠGEP Projesi): Bazı Omurga Sorunlarına Çözüm Olmak Ġçin Biyoaktif Polimerik Kafes Tasarımı ve Ġn Vitro Testlerle Biyouyumluluğunun Ġncelenmesi TÜBĠTAK (213M651): Doku Mühendisliği Yöntemi ile Kollajen ve NaCMC Kullanılarak Çift Katmanlı Deri Modeli OluĢturulması TÜBĠTAK (213M708): Doku Mühendisliği Yöntemi Ġle Hastaya Özel Ortopedik Ġmplant Tasarımı ve Üretimi. OGEK ODTÜ-GATA (BAP ) Retina Hasarlarının Tedavisinde Kullanılmak Üzere Doku Mühendisliği Yöntemiyle Yapay Bruk Membranı Kontrüksiyonu TÜBĠTAK Biyobozunur polikaprolaktan temelli kopolimer sistemlerin doku mühendisliği iskele yapıları olarak sentezlenmesi, karakterizasyon ve optimize edilmesi TÜBĠTAK Polisebasik anhidrit bazlı nano kapsüllerin hazırlanması, farklı parametrelerin ilaç yükleme kapasitesi ve salım profiline etkisinin incelenmesi ODTÜ-BAP Kemik doku mühendisliğinde antibiyotik sağlayan biyobenzer yapı iskelelerinin tasarımı ve üretimi, BAP , ODTÜ-BAP Gözenekli biyobozunur poliüretan nanoparçacıklarının tasarımı, BAP BIOMAT AraĢtırmalarından Örnekler Biyomalzemeler Biyobozunur sünger, mikrofiber mesh ve hızlı prototiplenme yoluyla üretilmiģ biyomalzemeler sert ve yumuģak dokuların defektlerinde implant olarak ve doku mühendisliği uygulamaları için hücre taģıyıcı sistemler olarak kullanılmaktadır. Biyo Nanoteknolojik uygulamalar Elektroeğirme yöntemiyle üretilen nanofiber filmler kullanılarak ekstraselüler matris benzeri yapılar, yapay damarlar, ve sinir yönlendiriciler (nerve guide) üretilmektedir. Litografik yöntemler kullanılarak hücre farklılaģmasını, çoğalmasını ve biçimlerini denetleyen ve belirleyen biyomalzeme yüzeyleri oluģturulmaktadır. Nanofiberlerin elektron mikroskopisi ve nanofiberler üzerinde büyüyen hücrelerin floresan görüntüleri. Mikro sütünlu biyobozunur filmler ve üzerinde çoğalan hücrelerin AFM ve SEM görüntüleri. İlaç Taşıma Sistemleri Ġlaç yüklenmiģ biyobozunur nano ve mikroküreler ile kontrollu ve hedeflenmiģ ilaç salım sistemleri oluģturulmaktadır. Sağdaki NEODERM yaraörtüsü BIOMAT tarafından patently bir üründür. 125

130 SeçilmiĢ Makaleler (2014) Karadas, O., Yucel, D., Kenar, H., Kose, G., Hasirci, V. (2014).Collagen scaffolds with in situ-grown calcium phosphate for osteogenic differentiation of Wharton s jelly and menstrual blood stem cells. Journal of Tissue Engineering and Regenerative Medicine, 8, Kilic, C., Girotti, A., Rodriguez-Cabello, J., C., Hasirci, V. (2014). A collagen-based corneal stroma substitute with micro-designed architecture. Biomaterial Science, 2, Bahcecioglu, G., Buyuksungur, A., Kiziltay, A., Hasirci, N., Hasirci, V. (2014). Construction and in vitro testing of a multilayered, tissue-engineered meniscus. Journal of Bioactive and Compatible Polymers, 29(3), Eke G., Kuzmina A., Goreva A., Shishatskaya E., Hasirci N., Hasirci V. (2014) In Vitro and Transdermal Penetration of PHBV Micro/Nanoparticles. Journal of Nanomaterials Science: Materials in Medicine. 25: Umran Aydemir Sezer, Damla Arslantunali, Eda Ayse Aksoy, Vasif Hasirci, Nesrin Hasirci (2014) Poly(εcaprolactone) Composite Scaffolds Loaded with Gentamicin Containing β-tcp/ Gelatin Microspheres for Bone Tissue Engineering Applications, Journal of Applied Polymer Science, 131 (8) Ozge Ozgen, Vasif Hasirci, Nesrin Hasirci (2014) Effects of Oxygen Nitrogen and Argon Plasmas on PMMA surfaces, Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, J. Biomater. Tissue Eng., 4(6), Filiz Kara, Eda Ayse Aksoy, Zehranur Yuksekdag, Nesrin Hasirci, Serpil Aksoy, (2014) Synthesis and surface modification of polyurethanes with chitosan for antibacterial properties, Carbohydrate Polymers, Carbohydrate Polymers, 112, I. Saygun, V. Bal, A. Kızıltay, P. Yilgor Huri, F. Avcu, K. Üstün, V. Hasirci, N. Hasirci (2014) Proliferation and Differentiation of Mesenchymal Stem Cells in Chitosan Scaffolds Loaded with Nanocapsules Containing Bone Morphogenetic Proteins-4, Platelet-Derived Growth Factor and Insulin-Like Growth Factor 1, Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, 4, Nesrin Hasırcı, Polimer-Ġlaç ve Polimer-Protein Konjugatları, Ed: Ayla Zırh Gürsoy, Nanofarmasötikler ve Uygulamaları, Kontrollu Salım Sistemleri Derneği Yayını, ISBN: , No:3, , 2014 Aysun Güney, Nesrin Hasirci (2014) Properties and Phase Segregation of Crosslinked PCL-Based Polyurethanes, Journal of Applied Polymer Science, Article first published online: 9 AUG 2013, DOI: /app.39758, 131 (1) Halili A. N., Hasirci N., Hasirci V. (2014). A Multilayer Tissue Engineered Meniscus Substitute. Journal of Material Science: Materials in Medicine, 25, Umran Aydemir Sezer, Deniz Billur, Gazi Huri, Pinar Yilgor Huri, Eda Ayse Aksoy, Hakan Terzioglu, Ertan Konukseven, Vasif Hasirci, Nesrin Hasirci (2014) In vivo Performance of Poly(ε-caprolactone) Constructs Loaded with Gentamicin Releasing Composite Microspheres for Use in Bone Regeneration, J. Biomater. Tissue Eng., 4, Shahla Bagherifam, Frode Miltzow Skjeldal, Gareth Griffiths, Gunhild M. Mælandsmo, Bo Nyström, Vasif Hasirci, Nesrin Hasirci, ph-responsive Nano Carriers for Doxorubicin Delivery, Pharmaceutical Research, DOI /s , Tugba Endogan Tanir, Vasif Hasirci, Nesrin Hasirci, Electrospinning of Chitosan and PLGA Based Nanofibrous Mats for Tissue Engineering Applications, Polymer Bulletin, DOI /s y. Article published online: SEP, Shahla Bagherifam, Gareth W. Griffiths, Gunhild M. Mælandsmo, Bo Nyström, Vasif Hasirci, Nesrin Hasirci (2014), Poly(sebacic anhydride) Nanocapsules as Carriers: Effects of Preparation Parameters on Properties and Release of Doxorubicin, Journal of Microencapsulation: (doi: / ), Article first published online: 17 Oct Tugba Endogan Tanir, Vasif Hasirci, Nesrin Hasirci Preparation and Characterization of Chitosan and PLGA Based Scaffolds for Tissue Engineering Applications, Polymer Composites, DOI: /pc.23100, Article first published online: 6 JUN Maria Teresa Calejo, Nesrin Hasirci, Shahla Bagherifam, Reidar Lund and Bo Nyström (2014) Selfassembled Stimuli-responsive Structures from Cationic Polymers for Biomedical Applications; Ed: Dr.Sangram Keshari Samal and Dr. Peter Dubruel; Royal Society of Chemistry (RSC publisher). Aysel Kızıltay, Angel M. Fernandez, Julio San Roman, Rui A. Sousa, Rui L. Reis, Vasıf Hasirci, Nesrin Hasirci, Poly(ester-urethane) scaffolds: Effect of Structure on Properties and Osteogenic Activity of Stem Cells, TERM, Article first published online: 26 DEC 2013, DOI: /term.1848,

131 ÇEVRE BĠYOTEKNOLOJĠSĠ GRUBU Prof. Dr. Celal F. Gökçay Prof. Dr. Filiz B. Dilek Prof. Dr. F. Dilek Sanin Prof. Dr. Göksel N. Demirer Doç. Dr. Bülent Ġçgen Doç. Dr. Tuba H. Ergüder Bayramoğlu Dr. Robert Murdoch Makaleler Uluslararası (SCI) Projeler Tübitak Projeleri Uluslararası Projeler Uygulamalı Araştırma Projeleri Prof. Dr. Celal F Gökçay Türk Linyitlerinden mikrobiyolojik yolla kükürt arıtımı - Yürütülen ilk biyoteknoloji çalıģmasıdır. Türk linyitlerinin bakteriyel yolla desufirizasyonu araģtırılmıģtır. ÇalıĢmada hava kirliliğine neden olan linyitlerdeki kükürtün bakteriler tarafından oksitlenerek uzaklaģtırılabileceği gösterilmiģtir. Kağıt fabrikası atıksularından funguslar kullanılarak renk ve organik klor arıtımı Atıksulardan izole edilen Penicillium türü bir fungusun havasız Ģartlarda herhangi bir ilave enerji kaynağına gerek göstermeksizin organik kloru uzaklaģtırdığı gösterilmiģtir. Atıksu Arıtma tesislerinin modellenmesi - Ankara arıtma tesisi ASM 1 modeli, Ġzmir ve Kayseri ileri arıtma tesisleri ASM2 modeli modellenmiģtir. Modellemelerde bulanık mantık algoritmaları kullanılmıģtır.arıtma tesislerinde çamurların çöktürülmesi ise FILAMENT modeli kullanılarak modellenmiģtir. Membran biyoreaktörlerle (MBR) atıksuların arıtılması ve geri kullanımı - Bu konu ile ilgili olarak ODTÜ kampusunda 240 m 3 /gün kapasiteli bir MBR tesisi kurulmuģ ve 12 yıl boyunca iģletildikten sonra Teknokent idaresine devredilmiģtir. Arıtılan atıksular ODTÜ Teknokent arazisinin sulanması için kullanılmakta ve bu tesis sayesinde su tüketiminden yılda TL civarında tasarruf edilmektedir. 127

132 Endokrin bozucu maddelerin (EBM) arıtma tesislerinde arıtılabilirliği - Bu konuda Türkiye de iģletilmekte olan 12 adet arıtma tesisinde model EBM ler periyodik sürelerle alınan kompozit su örnekleriyle örneklenmiģ ve konsantrasyonları belirlenmiģtir. EBM Arıtımına arıtma tesisi konfigurasyonlarının etkileri incelenmiģtir. Atık çamurların ozon destekli havasal ve havasız çürütülmesi - Atık çamurların kesikli ozonlanarak hızlı ve yüksek oranda havasal çürütülmeleri çalıģılmıģtır. ÇalıĢmalar sonucunda çamur çürütme süresi klasik günden 4 güne indirilmiģ ve çürütülen çamur oranı %40-50 den %80 üzerine çıkarılmıģtır. Bu çalıģma için üç adet uluslararası patent alınmıģtır. Kesikli ozon destekli havasal çürütme sonucunda çamurlarda biriken mikrokirleticilerin %99 üzerinde artılıdığı ve çamurlaırın steril hale gelerek bu Ģekilde toprağa verilebileceği göstrilmiģtir. Ortaya çıkan stabilize çamur miktarı sıfıra indirilmiģ, üretilen metan gazı miktarı kontrol reaktörüne göre %100 arttırılmıģtır. Bu Ģekilde enerji tüketen arıtma tesislerinin enerji üreten tesisler haline getirilmesi mümkün olmaktadır. Prof. Dr. Filiz B. Dilek Atıksularda bulunması muhtemel ağır metallerin aktif çamur prosesi üzerine etkileri çalıģılmıģtır. Metallerin gerek tek baģına gerekse birlikte bulundukları durumlarda arıtım performansı üzerine etkileri incelenmiģ, aklimasyon koģulları ve mikrobiyal konsorsiyum değiģimi ile bağlantısı araģtırılmıģtır. Aklimasyon sayesinde metallerin mikrobiyal kültür üzerindeki inhibisyon etkisinin önemli derecede azaltılabileceği ortaya konmuģtur. Endüstriyel atıksuların (kağıt, tekstil, Ģeker, alkaloid vb.) biyolojik arıtımları yönünde çeģitli araģtırmalar gerçekleģtirilmiģtir. Aktif çamur prosesi ve diğer çeģitli reaktör konfigürasyonları (kesikli, ardıģık kesikli, dönen disk reaktörler) kullanılarak ve/veya farklı biyokütleler (alg, beyaz çürükçül fungus) kullanılarak gerek arıtılabilirlik gerek toksisite çalıģmaları yürütülmüģ ve elde edilen bulgular, sistem kinetiği ve mikrobiyolojisi ile ilintilendirilmiģtir. Sadece organik madde giderimi değil, renk arıtımı da hedeflenmiģtir. Ayrıca, çeģitli ön arıtma teknikleri (Fenton oksidasyonu, ozonlama, radyasyon/ıģınlama vb) ile biyolojik arıtılabilirliğin değiģimi irdelenmiģtir. Lagün atıksularından alglerin uzaklaģtırılması için bir proses geliģtirilmiģ ve lagün çıkıģ suları bir damlatmalı filtre ile bağlantılanarak çıkıģ sularının bulanıklıktan arıtılmaları sağlanmıģtır. Beyaz çürükçül funguslar ile ağır metal biyosorpsiyon çalıģmaları, bu fungusların endüstriyel atıksularda bulunan organik kirleticilerin gideriminde kullanılması halinde ortaya çıkacak atık çamurun bertaraf edilmeden önce metal içeren bir baģka atıksuyun arıtımında kullanılabilmesi hedefine yönelik gerçekleģtirilmiģtir. Atıksularda bulunması muhtemel tehlikeli kimyasal bileģiklerin (örneğin, boyar maddeler, klorofenoller, triklosan gibi) biyolojik atıksu arıtma sistem performansları üzerine etkilerinin yanı sıra bu maddelerin arıtılabilirlikleri, toksik etkileri ve mikrobiyal konsorsiyum üzerine etkileri çalıģılmıģtır. Prof. Dr. F. Dilek Sanin AraĢtırmalarımın yoğunlaģtığı konulardan birisi atıksu arıtmada biyolojik yumak oluģumu ve hücre dıģı polimerlerin rolü olmuģur. Bu araģtırmalarda karıģık kültür mikroorganizmaların fizyolojilerini ve dolayısı ile biyopolimerlerin oluģumunu etkileyen faktörler ve bunun biyolojik yumak oluģumuna ve atıksu arıtımına etkileri incelenmiģtir. Hücre dıģı polimerlerle ilgili diğer bir araģtırmamız ise Azotobacter Vinelandii ile farklı fermentasyon koģullarında alginat üretimi olmuģtur. Elde edilen alginat literatürde ilk kez sulardan bulanıklığın gideriminde koagülan ve atıksulardan ağır metallerin gideriminde adsorban olarak kullanılmıģtır. Sürdürülebilir atık yönetimi, atıkların yeniden kullanımı ya da atıklardan faydalı ürünler elde etme kapsamında yürüttüğümüz çalıģmalarda ise atıkların (arıtma çamuru, katı atıklar) minimizasyonu, anaerobik arıtma ile bu atıklardan biyogaz üretimi ve üretilen biyogazın maksimizasyonu için kullanılabilecek ön iģlemlerin etkinliği incelenmiģtir. Atıksularda ve artıma çamurlarında patojen mikroorganizmalar ve bunların arıtma sırasında yaratılan çeģitli stres faktörleri altındaki davranıģları da araģtırmalarımız arasında yer almıģtır. Arıtma çamurlarına uygulanan iģlemler sırasında patojen ve indikatör mikroorganizmaların giderimleri ve yeniden büyüme potansiyelleri konvansiyonel kültür metotları ve moleküler metotlar kullanılarak (qpcr) incelenmiģtir. Nonilfenol grubu kirleticilerin arıtma çamurlarında aerobik ve anaerobik koģullarda parçalanmasının izlenmesi yapılmıģ, ilgili mekanizmalar ortaya konmuģtur. Aerobik ve anaerobik parçalanmada etkin olan mikroorganizmaların realtime PCR ile göreceli kantitatif analizi gerçekleģtirilmiģ; Floresan In Situ Hibritleme (FISH) metodu ve floresan mikroskop yardımıyla da ilgili mikroorganizmalar belirlenmiģtir. Ayrıca nonilfenolü parçalayabilen çevresel izolatların elde edilmesi, aerobik koģullar altında NP nin bu izolatlar tarafından parçalanması, oluģan ürünlerin izlenmesi ve metabolik yolun belirlenmesi gerçekleģtirilmiģtir. 128

133 Prof. Dr. Göksel N. Demirer Biyoteknoloji alanında yürütmekte olduğumuz çalıģmalar atıksu ve katı atık yönetimi, atıklardan biyoenerji/biyoürün eldesi ve sera gazı mitigasyonu konularında yoğunlaģmaktadır. Atıksu/katı atık yönetimi konusunda yürütülen çalıģmalar arasında evsel ve endüstriyel atıksular (zeytinyağı, Ģeker, peynir, kağıt üretimi, tekstil, alkollü içecek, alkaloid, vd.), katı atıklar ve artıklar (evsel katı atıkların organik bölümü, hayvansal gübre, pamuk iģleme atıkları, tarımsal artıklar, sera atık ve artıkları, vd.) ile arıtma çamurlarının havasız ve ardıģık (havasız ve havalı) sistemlerde arıtımı/ön arıtmı yer almaktadır. Ayrıca, yapay sulakalanlarda evsel atıksu arıtımı bu konuda yürüttüğümüz diğer bir çalıģmadır. Bu çalıģmalarda farklı reaktör konfigürasyonları, faklı mikrobiyel kültürler, iģletme koģulları, besleme protokolleri, mikrobiyel adaptasyon stratejileri, vd. kullanılmıģtır. Bunlara ek olarak, granülleģme, fazlı ve ardıģık biyoreaktör uygulamaları, toksisite, renk giderimi, indirgen dehalojenizasyon, vd. alanlarda yaptığımız diğer araģtırmalarda sentetik atıksularla da çalıģılmıģtır. Atıklardan biyo-enerji/biyo-ürün eldesi konusunda yaptığımız çalıģmalar arasında endüstriyel atıksular, katı atıklar ve artıklar, alg biyokütlesi ile arıtma çamurlarından biyogaz eldesi, Ģeker endüstrisi atıkları ve alg biyokütlesinden biyohidrojen eldesi, Ģeker endüstrisi atıklarından, evsel katı atıkların organik bölümünden ve hayvansal gübrelerden uçucu yağ asidi eldesi, arıtma tesisi çamurlarından ve hayvansal gübreden gübre (strüvit) eldesi yer almaktadır. Sentetik ve demir çelik endüstrisi baca gazlarından farklı alg kültürleri ile CO2 giderimi ise sera gazı mitigasyonu konusunda yaptığımız çalıģmalar arasındadır. Doç. Dr. Bülent Ġçgen Biyosorpsiyon, biyodegredasyon, biyoremidasyon, DNA probları ve hibridizasyon teknolojisi, çevresel genomik, proteomik ve transkriptomik uygulamalarını kapsayan araģtırmaları; ağır metal kirliliği gösteren yüzey sularında etkin biyorsorpsiyon yeteneği gösteren bakterilerin atıksularda metal arıtımı çalıģmalarında kullanılabilirliklerinin araģtırılması, bakterilerdeki metal direnç genlerini hedef alan DNA probları kullanarak ve/veya dizayn ederek flöresan in situ hibridizasyon metodu ile metal biyosorpsiyonunda etkin olabilecek bakterilerin metal kirliliği gösteren yüzey sularında in situ olarak takip edilmesi, deterjan kirliliği gösteren yüzey sularında, deterjan degredasyonunda etkin bakterilerin enzim aktivitelerinin değerlendirilmesi, deterjan degradasyon yeteneklerinin belirlenerek atıksularda deterjan uzaklaģtırma çalıģmalarında kullanılabilirliklerinin araģtırılması, flöresan in situ hibridizasyon metodu ile deterjan degredasyonunda etkin olabilecek bakterilerin deterjan kirliliği gösteren yüzey sularında in situ olarak takip edilmesi ve deterjan degredasyon etkinliklerinin belirlenmesi, metisilin ve vankomisin gibi halk sağlığı açısından önem arz eden antibiyotiklere karģi direnç sağlayan genlerin flöresan in situ hibridizasyon metodu ile yüzey sularında in situ olarak takip edilmesi, bu genleri taģıyan ve aktarma yeteneği olan bakterilerin yüzey sularındaki popülasyon yayılımlarının belirlenmesine yönelik olarak prob dizaylarının yapılması, yüzey aktif maddeleri üreterek petrol ve petrol türevlerini parçalama yeteneğine sahip bakterilerin enzim aktivitelerinin değerlendirilmesi, degradasyon yeteneklerinin belirlenerek petrol ve petrol türevleri ile kontamine olmuģ yerlerin biyoremidasyonunda kullanılması, flöresan in situ hibridizasyon metodu ile bakterilerin hidrokarbon kirliliği gösteren yüzey sularında in situ olarak takip edilmesi ve hidrokarbon degredasyon etkinliklerinin belirlenmesi, evsel atık çamurların anaerobik reaktörlerdeki amonyum, sülfit ve ozon uygulamalarında mikrobiyal konsorsiyum değiģimlerinin flöresan in situ hibridizayon yöntemi kullanarak belirlenmesi, konsorsiyumdaki dalgalanmaların modellenerek anaerobik reaktörlerdeki verimin artırılması çalıģmaları olarak özetlenebilir. 129

134 Doç. Dr. Tuba Hande Ergüder Bayramoğlu Anaerobik çevre biyoteknolojileri, atıksu arıtımı, biyogranülasyon teknolojisi ve yenilenebilir enerji/biyo-bazlı ürün üretimi alanlarında yoğunlaģan çalıģmalarımızda, arıtılmadan doğaya bırakıldığında çevre sorunlarına yol açacak atıkların/atıksuların yararlı ürünlere dönüģtürülerek zararın en aza indirgenmesi, bu yolda çeģitli biyolojik proseslerin entegrasyonu ile maksimum fayda sağlanması, mikrobiyal kültürlerin araģtırılarak geliģtirilmesi/aklimasyonu/tanımlanması araģtırılmaktadır. Anaerobik biyoteknoloji alanındaki çalıģmalarımızda, dünyada ve ülkemizde önemli yeri olan agro-endüstrilerden üretilen atıkların ve atıksuların yararlı biyo-ürünlere (metan, organik asitler, vb.) dönüģtürülmesi araģtırılmaktadır. Bu bağlamda, farklı endüstrilerden üretilen atıklar/atıksular, evsel (organik) katı atıklar vb. ile anaerobik arıtılabilirlik çalıģmaları yapılmıģ ve biyometan üretim potansiyelleri araģtırılmıģtır. ÇalıĢma sonuçları, birçok agro-endüstriyel atığın organik kaynak olarak kullanılabileceğini ve anaerobik tesislerin ülkemizdeki kullanım sahalarını göstermesi, ve sanayi-üniversite iģbirlikli ortak çalıģmalara yol göstermesi açısından önem taģımaktadır. Yenilenebilir-temiz enerji üretimi konusundaki araģtırmalarımız sadece metan üretimini değil, önemli bir temiz enerji kaynağı olan hidrojen üretimini de kapsamaktadır. Bu bağlamda, hidrojenin orijinal ve sentetik organik maddeden karanlık fermentasyon ve fotofermentasyon yöntemleri ile biyolojik olarak üretimi ve reaktörlerin entegrasyonu konusundaki çalıģmalarımız yoğun bir Ģekilde devam etmektedir. Klorlu bileģiklerin dehalojenasyonu çalıģmaları kapsamında, insektisitlerin (lindan ve dieldrin) anaerobik olarak daha az tehlikeli ve takip eden aerobik reaktörde parçalanabilir bileģiklere dönüģtürülmesi araģtırılmıģtır.anaerobik toksisite deneyleri ile söz konusu kimyasalların IC 50 değerleri belirlenmiģ, dehalojenasyon için mikrobiyel aklimasyonun gerekliliği gösterilmiģtir. Biyogranülasyon alanında önemli bir yeri olan aerobik biyogranülasyon çalıģmaları, stabil granüler çamur üretiminde yaģanan sorunlar sebebiyle birçok ülkede yoğun olarak araģtırılmaktadır. AraĢtırma grubumuz, bu bağlamda, aerobik granüllerin ve ilgili reaktör teknolojisinin geliģtirilmesi, aerobik granüllerin stabil yapısının bozunmasına yol açan faktörleri ve bu problemin giderimi konularını Askıda Çamur Granüller Askıda aerobik çamurdan geliģtirilen aerobik granüller araģtırmaktadır. Aerobik biyogranülasyon çalıģmaları ile doğaya arıtılmadan deģarj edildiğinde önemli çevre sorunlarına yol açan atıksulardan nütriyent (C-N) giderimi de araģtırılmaktadır. Aerobik granüler çamur yapısı ve etkileyen faktörlerin araģtırılması, moleküler teknolojilerin uygulanması yoluyla proseslerde yer alan kültürlerin belirlenmesi ve proseslerin geliģtirilmesinde kullanılmasına yönelik çalıģmalarımız devam etmektedir. Dr. Robert W. Murdoch AraĢtırma konularım mikrobiyoloji, ekotoksikoloji ve moleküler biyoloji alanlarının çevresel sorunlara çözüm getirme sürecinde uygulamalarını içermektedir. Biyodegradasyon ve Metabolizma- Ġhtyaç doğrultusunda çevreye ve insan sağlığına zararlı kimyasalların doğal ortamlarda ya da laboratuvar koģullarında izlenmesi, biyolojik parçalanma proseslerinin belirlenmesi ve bu kimyasalların parçalanmasından sorumlu mikroorganizmaların mikrobiyolojik ve moleküler yöntemlerle tanımlanması çalıģma alanlarımın temelini oluģturmaktadır. Bu alan ile ilgili bir çalıģmamızın konusu farmasötik flurbiprofen (analjezik, Türkiye de majezik ismiyle piyasaya sürülen ağrı kesici) kimyasalının biyolojik parçalanmasından sorumlu mikroorganizmaların mikrobiyolojik ve moleküler (RFLP, qpcr, FISH vs.) metotlarla tanımlanması ve metabolik yolun belirlenmesidir. Mikrobiyal Komünite Analizleri: Tanımlanması ve Kantitatif Tayini-Kültüre dayalı yöntemlerle mikroorganizmaların belirlenmesi ve kantitatif tayini oldukça zaman alıcı ve güvenilirlilik açısından tartıģmalı yöntemler olmaları nedeniyle mikroorganizmaların tanımlanmasında daha hızlı ve güvenilir sonuçlar veren moleküler yöntemler tercih edilmektedir Bu alan ile ilgili bir projemizin konusu patojen Salmonella bakterilerinin susuzlaģtırılmıģ aktif çamur örneklerinde (biyokatı) PMA-gerçek zamanlı PCR yöntemi ile belirlenmesi ve kantitatif tayinidir. Biyoteknoloji ve Ekotoksikoloji-Modern biyoteknoloji ve moleküler alanda meydana gelen geliģmeler ile artık bu kimyasalların etkileri çok hızlı, daha kapsamlı ve ucuz Ģekilde gerçekleģtirilmektedir. Bu anlamda genetik modifikasyonlarla tasarlanan mikroorganizmalar ilgili kimyasalların toksik etkilerini belirlemekte kullanılmaktadır. ÇalıĢmalarda kullanılan yöntemler: Rekombinant maya testi (YES) olarak tanımlanan östrojenik aktivite tayini Floresan proteinler ile genetik olarak modifiye edilen bakteriler 130

135 ODTÜ MERKEZ LABORATUVARI (MERLAB) Orta Doğu Teknik Üniversitesi nde DPT tarafından desteklenen proje kapsamında 2004 yılı içinde kurulan Merkez Laboratuvarı (MERLAB) değiģik disiplinlerdeki araģtırmacıların ortak ihtiyacı olan ileri teknoloji test analiz ve karakterizasyon cihazlarının yer aldığı bir araģtırma merkezidir. ODTÜ Merkez Laboratuvar Rektörlüğe bağlı bir merkez olup. Bünyesinde AR-GE Eğitim ve Ölçme ile Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji AR-GE Merkezlerini barındırmaktadır. ODTÜ MERLAB bugüne kadar edinmiģ olduğu saygınlığını ve itibarını korumak ve yükseltmek amacıyla TS EN ISO/IEC standardına uygun olarak kalite yönetim sistemini kurmuģ, ve Aralık 2013 tarihinde TÜRKAK tarafından akredite olmuģtur. Bu sistemin etkinliğini ve sürekliliğini sağlamak için çalıģmalarını büyük bir dikkat ve özenle sürdürmektedir. ODTÜ MERLAB AKREDĠTE METOTLAR MOLEKÜLER BĠYOLOJĠ VE BĠYOTEKNOLOJĠ AR-GE MERKEZĠ Laboratuvar Adı Metot Adedi Deney Metodu Deney Adı Genom Analiz Laboratuvarı 4 CRLVL 12/05XP CRLVL 08/05XP foodproof GMO Sample Preparation Kit Manual ISO Gıda, Yem Numuneleri ve Tohumlarda GDO Saptanması ve Miktar Tayini için DNA Ġzolasyon Yöntemi Kromatografi ve Fermentasyon Laboratuvarı 1 TS EN Meyve ve Sebze Suları Glikoz, Fruktoz, Sorbitol ve Sakaroz Muhtevası Tayini-Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografisi Metodu AR-GE EĞĠTĠM VE ÖLÇME MERKEZĠ Termal Analiz Laboratuvarı 4 EN ISO EN ISO EN ISO TS EN ISO Plastikler- Diferansiyel Taramalı Kalorimetri (DSC) Bölüm 1: Genel prensipler Plastikler- Diferansiyel Taramalı Kalorimetri (DSC) Bölüm 2: Camsı GeçiĢ Sıcaklığı Tayini Plastikler- Diferansiyel Taramalı Kalorimetri (DSC) Bölüm 3: KristalleĢme ve erime entalpisi ve sıcaklığının belirlenmesi Plastikler- Polimerlerin Termogravimetrik Analizi (TG) Mekanik Test Laboratuvarı 4 EN ISO EN ISO EN ISO ISO Plastikler- Çekme özelliklerinin tayini Bölüm 1: Genel prensipler Plastikler- Çekme özelliklerinin tayini Bölüm 2: Kalıplama ve ekstrüzyon plastikleri için deney Ģartları Plastikler- Çekme özelliklerinin tayini Bölüm 3: Film ve levhalar için deney Ģartları Metalik Malzemeler - Çekme deneyi Bölüm 1: Oda sıcaklığında deney metodu 131

136 MOLEKÜLER BĠYOLOJĠ VE BĠYOTEKNOLOJĠ AR-GE MERKEZĠ Doku Kültürü Laboratuvarı (DKL) Elektroforez Sistem Laboratuvarı (ESL) Genel Kullanım ve Örnek Hazırlama Laboratuvarı (GKL) Genom Analiz Laboratuvarı (GEN) Kromatografi ve Fermentasyon Laboratuvarı (KFL) Kütle Spektroskopi Laboratuvarı (KSL) Mikroskopi Laboratuvarı (MKL) ODTÜ MERKEZ LABORATUVAR BĠRĠMLERĠ AR-GE EĞĠTĠM VE ÖLÇME MERKEZĠ Duraylı Ġzotop Oranı Kütle Spektroskopi Laboratuvarı (DĠL) Elektrik, Manyetik ve Optik Özellikler Ölçüm Laboratuvarı (EMOL) Elektron Mikroskopi Laboratuvarı (EML) Elektron Spin Rezonans Spektroskopi Laboratuvarı (ESRL) Kimyasal Analiz Laboratuvarı (KAL) Kızıl Ötesi ve Raman Spektroskopi Laboratuvarı (KORL) Mekanik Test Laboratuvarı (MTL) Nano-Mekanik Test Laboratuvarı (NMTL) Nükleer Manyetik Rezonans Spektroskopi Laboratuvarı (NMRL) Parçacık Boyutu ve Zeta Potansiyel Ölçüm Laboratuvarı (PZL) Polimer Analiz Laboratuvarı (PAL) Radyojenik Ġzotop Laboratuvarı (RĠL) Reolojik Karakterizasyon Laboratuvarı (RKL) Termal Analiz Laboratuvarı (TAL) Transmisyon Elektron Mikroskopi Laboratuvarı (TEML) X-IĢını Difraksiyon Laboratuvarı (XRDL) Yüksek Çözünürlüklü Kütle Spektroskopi Laboratuvarı (YKL) Yüzey Analiz Laboratuvarı (YAL) Yüzey ve Gözenek Karakterizasyon Laboratuvarı (YGL) Moleküler Manyetik Mekanik Kimyasal Özellikler Yüzey Termal Fiziksel Özellikler Elektrik Elemental Optik Morfolojik 132

137 BAZI ÖĞRETĠM ÜYELERĠNĠN ÇALIġMALARI ASSOC.PROF. DR. AYġE GÜL GÖZEN Microbial Ecology Laboratory In my lab primarily we try to solve problems dealing with environmental pollution issues. One of these issues that we concentrate on has been antibiotic resistance. Extensive use of antibiotics in animal and fish farms fuels antibiotic resistance among environmental bacteria, due that these bacteria become the reservoir for the spreading of resistance functions among human pathogens We try to understand the mechanism underlying the changes occur at the genetic and epigenetic levels followed by the acquisition of the resistance. We hope to define and measure the extents of macromolecular changes so that we can come up with strategies and find means to reduce the increase of resistant bacteria populations. Other focus that we give equal share of attention is to investigate the macromolecular changes take place upon heavy metal acclimation in bacteria. Heavy or transition metal accumulation in aquatic environments has a direct effect on health. Bacteria that can be acclimated to grow under lethal or sub lethal concentrations of these metals are very promising for environmental clean up as well as refining of the metal rich discharges of industrial facilities. We try to define and measure the macromolecular changes occurring upon metal acclimation in bacteria in hope to device ways to utilize their capabilities in environmental clean-up technologies. In my lab we approach the problems from molecular biology, genetics and physiology perspectives. We always keep in mind and interpret our findings from the perspective of this basic question: How can we use the information that we generate to solve an environmental issue. Lab members: Tuba ÖzaktaĢ, Taha Ceylani, Rafiq Gourbanov, ġeyma Kepenek, Sıla Sungur, Elif Sevli Research Associates: Prof.Dr. Feride Severcan, Biophysics Laboratory Prof.Dr. Meryem Beklioğlu, Limnology Laboratory Prof. Dr. Zeki Kaya: Plant Genetics and Tissue Culture Laboratory 133

138 DOÇ. DR. CAN ÖZEN METU SYBORG - Peptit Ġlaç KeĢif ve Tasarım Laboratuvarı Doç. Dr. Can Özen in yürütücülüğünde 2010 yılından itibaren çalıģmalarını sürdüren METU SYBORG araģtırma grubunda biyoaktif peptitlerin keģif, karakterizasyon ve mühendisliği alanında araģtırmalar yapılmaktadır. ÇalıĢmalar ODTÜ Merkezi Laboratuvar Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Ar-Ge Merkezi bünyesinde ve ODTÜ Doku Mühendisliği ve Biyomalzeme Mükemmeliyet Merkezi (BIOMATEN) desteğiyle yürütülmektedir. Peptitler (mini-proteinler) çok geniģ bir biyolojik aktivite yelpazesine sahiptirler. Günümüze kadar hormon, sitokin, toksin ve antimikrobiyal özelliğe sahip birçok önemli peptit molekülü bulunmuģtur. Özellikle son yıllarda biyolojik uygulamaları artıģ gösteren kütle spektroskopisi gibi ileri teknikler sayesinde, kanser, sinir hastalıkları, Ģeker hastalığı vb. önemli sağlık problemlerinin tanı ve tedavisinde kullanılabilecek yeni peptitlerin keģfi de büyük bir hızla devam etmektedir. METU SYBORG un yürütmekte olduğu peptit yapısındaki ilaç keģif ve tasarım çalıģmalarında doğal kaynak olarak özellikle araknid grubu (akrep ve örümcek) hayvan venomları kullanılmaktadır. KeĢif çalıģmalarına paralel yürütülen yapısal biyoloji ve protein mühendisliği projeleriyle fonksiyonları geliģtirilen yeni peptit moleküllerinin tasarım, üretim ve karakterizasyonu amaçlanmaktadır. Yürütülen projeler kapsamında taksonomi, iyon kanalları, kütle spektroskopisi, peptit sentezi, inorganik kimya, biyomalzeme ve doku mühendisliği, tarım biyoteknolojisi, kanser ve bilgisayar mühendisliği gibi alanlarda uzman akademisyenlerle ortaklıklar yürütülmektedir. Daha fazla bilgiye grubun web sayfası adresinden ulaģılabilir. 134

139 G. CANDAN GÜRAKAN Süt Endrüstrisinde Laktik Asit Bakterileri Süt endüstrisinde sütü fermente ederek sevilerek tüketilen yoğurt, peynir gibi farklı baģka ürünlere döndüren laktik asit bakterileri (LAB), baģlangıç kültürleri olarak da isimlendirilirler. Yoğurtta 2 önemli organizma fermentasyon iģlevi görürken, peynirlerde peynir tipine gore değiģen daha geniģ bir LAB gurubu görev yapar. AraĢtırma gurubumuz ODTÜ Gıda Mühendisliği bölümünde süt ürünlerinde fermentasyondan ve/veya probiyotiklerin üretiminden sorumlu Lactobacillus türleri ve Streptococcus thermophilus suģları ile çalıģmalarını yürütmektedir. Bu mikroorganizmaların tür veya suģ bazunda birbirlerinden farklılaģtırılmaları, biyokimyasal ve moleküler tanıları ise; gıda sektöründe güvenli kullanımları, kalite, standardizasyon, patentleme gibi nedenlerle gereklidir. Yoğurt Türkiye için çok tüketilen değerli bir süt ürünüdür. Farklı yoğurtların tadında ki değiģiklik, büyük ölçüde, sütü fermente eden bakteri suģlarından kaynaklanmaktadır. Lactobacillus delbrueckeii ssp bulgaricus ve Streptococcus thermophilus yoğurdu yapan bakterilerdir. Köylerimizdeki yoğurtlar tüketicimizin damak tadına daha uygun olup bu organizmalarda suģ bazında farklılık göstermektedir. Yaptığımız çalıģmalarda köylerden toplanmıģ yoğurt örneklerinden izole edilen bu organizmaların suģları ile starter kültür oluģturmak için birçok çalıģma gerçekleģtirilmiģtir. Ġzole edilen 160 kadar yoğurt suģu ile tanı, karakterizasyon ve fajlara direnç calıģmaları rapor edilmiģtir (Altay ve ark., 2014). Bu suģlardan Lactobacillus delbrueckeii ssp bulgaricus ve Streptococcus thermophilus suģlarının birlikte seçici tanısı için, biyokimyasal metotlara göre daha kısa zamanda tamamlanan PZR yöntemleri geliģtirilmiģtir (Cebeci ve Gurakan, 2008). Diğer bir çalıģmada ise Lactobacillus delbrueckeii ssp bulgaricus suģlarının multilokus sekanslama ile ve RAPD- PZR (random amplified polymorphic DNA-polimeraz zincir reaksiyonu) yöntemlerinin kullanımı ile kıyaslamalı biçimde tiplemesi yapılmıģtır (Cebeci ve Gurakan, 2011). PFGE patterns of Streptococcus thermophilus strains obtained with ApaI restriction enzyme: Lane 1 and 12, molecular size marker; Lane 2, K1-26; Lane 3, N6-1; Lane 4, Ta040-1; Lane 5, Yo-mix 410-3; Lane 6, N9-2; Lane 7, K1-9; Lane 8, N4-1; Lane 9, K1-29; Lane 10, K1-24; Lane 11, K1-23 Streptococcus thermophilus suģları ile pulse field gel electrophoresis (PFGE) çalıģmaları yürütülmüģ bu suģların izole edildiği bölgeler bazında birbirlerine olan akrabalıkları tespit edilmiģtir (yayın için gönderildi). Ayrıca, üç farklı primer seti kullanılarak Streptococcus thermophilus suģları için RAPD 135

140 yönteminin optimizasyon çalıģmaları yapılmıģ OPI-02 MOD primeri, S. thermophilus suģları için tekrarlanabilir profillerin eldesinde en güvenilir primer seti olarak tespit edilmiģtir. Laktik asit bakterilerinin probiyotik kullanımları da ekibin ilgi alanına girmiģtir. Lactobacillus plantarum suģları probiyotik özellikleri açısından incelenmiģtir (Cebeci ve Gurakan, 2003). Kefirlerden izole edilen Lactobacillus cryspatus suģunın probiyotik özelliklerinin tespiti çalıģmaları devam etmektedir. Kaynaklar: -Altay, N., Acar-Soykut, E., Gurakan, G.C Phenotypic diversity and technological properties of yogurt cultures isolated from traditionally produced Turkish yogurts with comparison to commercial starter cultures. Italian Journal of Food Science (Basımda) -Cebeci A., ve Gurakan, G.C Properties of potential probiotic Lactobacillus plantarum strains. Food Microbiology 20 (2003) Cebeci A., ve Gurakan, G.C Molecular methods for identification of Lactobacillus delbrueckiisubsp. bulgaricus and Streptococcus thermophilus using methionine biosynthesis and 16S rrna genes. Journal of Dairy Research Cebeci A., ve Gurakan, G.C Comparative typing of L. delbrueckii subsp. bulgaricus strains using multilocus sequence typing and RAPD PCR. Eur Food Res Technol (2011) 233: Ghazi, F., Benmechernene, Z., Kihal, M., ve Gurakan, G.C The reproducibility of random amplified polymorphic DNA (RAPD) profiles of Streptococcus thermophilus strains with XD9, M13 and OPI-02 MOD primers. African Journal of Biotechnology, 12(44), pp , 136

141 DOÇ. DR. ÇAĞDAġ DEVRĠM SON Hücre zarında bulunan reseptör ve iyon kanallarının birbirleri ile olan etkileģimleri: Laboratuvarımda halen devam etmekte olan deneylerde, model bir GPCR olan maya α-faktör feromon reseptörü (Ste2p) yeģil floresan protein (GFP) türevleri ve bölünmüģ EGFP parçaları ile iģaretlenmekte, reseptörlerin sentezlenmelerinden, parçalanmalarına kadar geçen tüm süre zarfında hücre içinde ve hücre zarındaki hareketleri izlenerek bu reseptörlerin nerede ve nasıl eģleģtikleri değerlendirilmekte, son olarak transkripsiyon sonrası reseptörlerde gerçekleģen glikozilasyon ve fosforilasyonun reseptör eģleģmesine olan etkileri araģtırılmaktadır. Bu çalıģmalarda edinilen bulguların diğer GPCR ailelerine uyarlanması ile, bu büyük reseptör grubunun gerek reseptör sentezindeki dinamikleri, gerekse ligand etkileģimleri ile ilgili cevaplanmamıģ ya da GPCR lerin yalnız iģlev gördüğü varsayımı ile sınırlı Ģekilde yorumlanmıģ temel soruların cevaplanması mümkün olacaktır. EGFP Bright Field Merged DK102 yeast cells which co-express truncated Ste2p receptors labeled with N-EGFP (1-158) and C-EGFP ( ) at position 304. (a) shows DK102 yeast cells expressing truncated Ste2p receptors labeled with full length EGFP at position 304, (b) shows DK102 yeast cells with N-EGFP (1-158) and C-EGFP ( ) fragment inserted into truncated Ste2p (304) respectively 137

142 Makale Bilgisi: A1. Mehmet Emre Sahin, Tolga Can, and Cagdas Devrim Son. GPCRsort-Responding to the Next Generation Sequencing Data Challenge: Prediction of G protein-coupled receptors classes using Structural region lengths. OMICS: A Journal of Integrative Biology (2014) A2. Srinivasan R, Pantoja R, Moss FJ, Mackey ED, Son CD, Miwa J, Lester HA. Nicotine up-regulates {alpha}4{beta}2 nicotinic receptors and ER exit sites via stoichiometry-dependent chaperoning. J Gen Physiol (2011) Jan;137(1):59-79 A3. Cagdas D. Son, Fraser J. Moss, Bruce N. Cohen, Henry A. Lester. Nicotine Normalizes Intracellular Subunit Stoichiometry of Nicotinic Receptors Carrying Mutations linked to Autosomal Dominant Nocturnal Frontal Lobe Epilepsy. Molecular Pharmacology Fast Forward. Published on February 23, 2009 as DOI: /mol A4. Lester HA, Xiao C, Srinivasan R, Son CD, Miwa J, Pantoja R, Banghart MR, Dougherty DA, Goate AM, Wang JC. Nicotine is a Selective Pharmacological Chaperone of Acetylcholine Receptor Number and Stoichiometry. Implications for Drug Discovery. AAPS J. (2009) March; 11(1): A5. George K. E. Umanah, Cagdas Son, FaXiang Ding, Fred Naider and Jeffrey M. Becker. Cross-Linking of a DOPA-Containing Peptide Ligand into Its G Protein-Coupled Receptor. Biochemistry Biochemistry (2009) March; 48(9): A6. Li-Yin Huang, George Umanah, Melinda Hauser, Cagdas Son, Boris Arshava, Fred Naider, and Jeffrey M. Becker. Unnatural amino acid replacement in a yeast G protein-coupled receptor in its native environment. Biochemistry (2008) May; 47(20): A7. Byung-Kwon Lee, Kyung-Sik Jung, Cagdas Son, Heejung Kim, Nathan C. VerBerkmoes, Boris Arshava, Fred Naider, and Jeffrey M. Becker. Affinity purification and Characterization of a G-Protein Coupled Receptor, Saccharomyces cerevisiae Ste2p. Protein Expression and Purification (2007) Nov; 56(1): A8. Cagdas D. Son, Hasmik Sargsyan, Hurst GB, Fred Naider, Jeffrey M. Becker. Analysis of Ligand-Receptor Cross-linked Fragments by Mass Spectrometry. Journal of Peptide Research (2005) Mar; 65(3): A9. Cagdas D. Son, Hasmik Sargsyan, Fred Naider, Jeffrey M. Becker. Identification of binding regions of the Saccharomyces cerevisiae -factor pheromone receptor (Ste2p) by photo-affinity cross-linking. Biochemistry (2004) Oct 19; 43(41): A10. Andjelka ģeliĥ, Negin P. Martin, Cagdas D. Son, Jeffrey M. Becker, Fred Naider, and Mark E. Dumont. Sequences in the Intracellular Loops of the Yeast Pheromone Receptor Ste2p Required for G Protein Activation. Biochemistry (2003) Mar 18; 42(10): A11. Lee BK, Lee YH, Hauser M, Son CD, Khare S, Naider F, Becker JM. Tyr266 in the sixth transmembrane domain of the yeast -factor receptor plays key roles in receptor activation and ligand specificity. Biochemistry (2002) Nov 19; 41(46): A12. L. Keith Henry, Sanjay Khare, Cagdas Son, Fred Naider and Jeffrey M. Becker Identification of a contact region between the tridecapeptide -factor mating pheromone of Saccharomyces cerevisiae and its G proteincoupled receptor by photo-affinity labeling. Biochemistry (May 2002) 14; 41(19): Patent Bilgisi : Moss, Fraser J, Son, Cagdas D., Srinivasan, Rahul, Lester, Henry A. Methods and systems for detection of stoichiometry by Föster resonance Energy. US Pattent No: US8,642,352 B2, U.S. Divisional Application No.: 14/133,194, CIT File No.: CIT D, (Feb 2014) Tez BaĢlıkları: Gözde KumaĢ, Detecting G-Protein Coupled Receptor Interactions Using Enhanced Green Fluorescent Protein Reassembly, 2012 Yürütülen Projeler ve Projelerde Yaptığı Görevler : Adenozin 2a ve Dopamin 2 Reseptörlerinin Homo ve/veya Heteromerlerinin G Proteinleri Ġle EtkileĢiminin Canlı Nöron Hücrelerinde Analizi ve Bu EtkileĢimlerin Sinyal Yolakları Üzerindeki Etkileri Tübitak 1001 AraĢtırma Projesi, proje No:113Z639, Proje Yöneticisi, Kokain Ve Amfetamin Ile Regüle Edilen Transcript" (Cart) Peptidini Tanıyan G-Proteine Kenetli Reseptör Adaylarının Tayini Tübitak 1002 AraĢtırma Projesi, proje No:112T717, Proje Yöneticisi, G Proteine Kenetli Reseptörlerin EĢleĢmesi: Yapı-ĠĢlev Analizi Ve Moleküler Mekanizmalar Tübitak 1001 AraĢtırma Projesi, proje No: 110T414. Proje Yöneticisi, Interactions between G-protein Coupled Receptors and Ligand Gated Ion Channels, Marie Curie Reintegration Grant FP7- PEOPLE-2010-RG Proposal N Proje Yöneticisi, Nicotinic Receptor Upregulation by Nicotine: Molecular Mechanisms, Philip Morris External Research Program, Proje Yöneticisi,

143 DOÇ. DR. DENĠZ ÇEKMECELĠOĞLU Gıda Biyoteknolojisi Gıda Mühendisliği Bölümü Biyoproses Laboratuvarı nda çalıģan grubumuzun misyonu gıda ve tarımsal atıklardan katma-değerli ürünler üretmek, ürün verimini arttırmaya yönelik proses tasarlamak ve optimizasyonu sağlamaktır. Ġlkemiz, atık maddelerin yenilenebilir zengin kaynaklar olduğunu çalıģmalarımızla kanıtlayarak sıfır atık yönetim sistemini toplum yararına sunmaktır. Buna göre projelerimiz aģağıdaki gibidir: Lignoselülozik Hammaddenin ÖniĢlem ve Enzimatik Hidrolizi: Lignoselülozik biyokütlenin enzimler veya asit ve alkali gibi bazı kimyasal ön iģlemlerle kontrollü bir Ģekilde parçalanmasıyla monomerik Ģekerlere dönüģüm sağlanabilir. Elde edilen bu monomerik Ģekerler, uygun mikroorganizmalar ile sıvı biyo-yakıt, organik asit ve enzim üretimine dönüģtürmek mümkün olmaktadır. Böylece sadece direk yakılarak kullanılan birçok tarımsal atık, değerli ürünlere dönüģtürülebilmektedir. Asit ve alkali öniģlem uygulamasına dair Ģematik gösterim verilmiģtir. Biyoetanol: Hammadde olarak gıda ve tarım endüstrisi atıkları kullanılmaktadır. Fermente edilebilir Ģekerler ön iģlem ve enzimatik hidroliz ile üretilir. Erlen (250 ml) ve fermentör (2 L) ortamında biyoetanol üretimi optimize edilmektedir. Fermentasyon Saccharomyces cerevisiae ve Kluyveromyces marxianus mayaları kullanılarak gerçekleģtirilmektedir. Gıda Endüstrisi Atıklarından Enzim Üretimi: Enzim ve fermentasyon teknolojisi alanındaki hızlı geliģmeler endüstriyel enzimlerle ilgili yapılan araģtırmaların daha da önem kazanmasına neden olmuģtur. Endüstriyel enzimler için ürün maliyetinin %30-40 ını kültür ortamının maliyeti oluģturduğu göz önüne alındığında, maliyeti düģürmek amacıyla bol ve ucuz ham maddelerin kullanımının sağlanması son yıllarda araģtırmacıların üzerinde önemle durduğu hususlardan biridir. Tarımsal atıkların arasında buğday kepeği baģta olmak üzere soya, Ģeker pancarı, patates kabukları ile mısır, Ģeker kamıģı, çeģitli meyve posaları, yağ iģleme endüstrilerinin atıkları gibi iģlem sonrası geriye kalan atıklarla çok çalıģma yapıldığı görülmektedir. Bu bağlamda, laboratuarımızda fındık kabuğu kullanılarak pektinaz ve ksilanaz enzim üretimleri gerçekleģtirilmiģtir. 139

144 Hemiselülozun alkali yöntem ile özütlenmesi ve yenilebilir kaplama maddesi olarak kullanılması: Film oluģturma kapasitesi olan hemiselüloz, fındık kabuğu, mısır kabuğu ve Ģeker pancarı küspesi gibi tarımsal gıda atıklarından alkali özütleme yöntemiyle elde edilmektedir. Bu Ģekilde, hemiselüloz değerlendirilerek tarımsal atıkların katma değeri arttırılacak ve ekonomide canlılık ile çevreci yaklaģım elde edilecektir. Sonuç olarak, hemiselüloz kaplama çözeltisi muzda kararma ve diğer kalite kayıplarını önleyici, yenebilir kaplama maddesi olarak kullanılmıģ ve kayısı kurutmada kimyasal yöntem olan kükürtlemeye alternatif bir çözüm olarak araģtırılmıģtır. Biyolojik ĠyileĢtirme Uygulamaları (Bioremediation): Laboratuvarımızda çevre ve insan sağlığına olumsuz etkileri olan kirliliklerin giderilebilmesi için çalıģmalar da yapılmaktadır. Yağ üretimi sonrasında arta kalan ve yüksek besin içeriğine sahip yerfıstığı küspesinde bulunan aflatoksinin fermentasyon yoluyla ayrıģtırılması ve hayvan yemi olarak kullanımı Prof.Dr. Faruk Bozoğlu ile ortak hedeflerimizden birdir. Ayrıca, gıda ve tarım atıkları karıģımları doğal mikroflora kullanılarak karıģık kültür halinde kompostlanmaktadır. Kompost adı verilen son ürün çiftçilerin organik gübre gereksinimini karģılayacak niteliktedir ve uygulama alanı geniģtir. 140

145 PROF. FERĠDE SEVERCAN Saglık Bioteknolojisi ve Gıda Biyoteknolojisi Prof. Feride Severcan ın laboratuvarında spektroskopik ve kalorimetrik ve kromotografik metodların ve özellikle de Fourier transform infrared (FTIR) spektroskopisi ve mikroskopisi tekniklerin değiģik biyolojik sistemlere ve gıdalara uygulamaları yapılmaktadır. Örneğin; bir Y.lisans öğrencisi tezini, ıģınlanmıģ fındık dokusunun infrared spektroskopisi ile karakterizasyonu üzerine yapmıģtır. Modern nükleer teknolojiler, çevre dostu karbondioksit emisyonları olmayan yeni teknolojiler olarak, gıda sektöründe ürünün güvenli bir Ģekilde muhafazası için dünya çapında kullanılmaktadır. Gama ve X radyasyonları ile gıda ıģınlanması teknikleri sayesinde patojen mikroorganizmalar zararsız hale gelmekte, gıdalarda filizlenme, böceklenme ve bozulma önlenmekte ve raf ömrü uzatılmaktadır.1980 yılında BirleĢmiĢ Milletler Gıda ve Tarım Örgütü (FAO), Dünya Sağlık TeĢkilatı (WHO) ve Uluslararası Atom Enerjisi Ajansı (IAEA) 10 kgy e kadar dozlarla ıģınlanmıģ gıdalarda sağlığa zararlı bir değiģiklik oluģmadığı ve gıda güvenirliliği sağlandığını açıklamıģtır. Bu nedenle çalıģmamızda 1,5 kgy ve 10 kgy dozlarında gama ıģınlamasının fındık dokusundaki etkileri analiz edilmiģtir. DüĢük dozun fındık dokusundaki lipit ve proteinlerde zararlı bir değiģikliğe sebep olmadığı, ancak yüksek dozun ise lipit konsantrasyonunda azalma ve peroksidasyonla birlikte proteinlerin ikincil yapısını değiģtirdiği,agregasyon ve denatürasyona yol açtığı belirlenmiģtir. Food Chemistry de yayınlanan bu çalıģma 50 kez atıf almıģtır [Dogan v.d, 2007]. ÇalıĢmamız, bu alanda yapılmıģ ilk çalıģma olma özelliğine sahiptir ve gama ıģınlamanın sebep olduğu moleküler düzeydeki yapısal ve konformasyonel değiģiklikleri izlemede FTIR Spektroskopisinin etkili ve umut verici bir teknik olduğunu ve gıda sektöründe ıģınlanmıģ gıdaların belirlenmesinde uygulanma potansiyeli olduğunu göstermiģtir. Bu çalıģma nedeniyle tanınmıģ bir kitabevi (John Wiley) tarafından basılan bir kitaba bölüm yazma teklifi gelmiģtir [Severcan ve Bozkurt, 2010]. Diğer bir Y. Lisans tezinde literatürdeki farklı sonuçlara katkıda bulunmak için evde beyazlatma (17% karbamid peroksit) ve ofiste beyazlatma (35% hidrojen peroksit) uygulamalarının insan diģi üzerine etkileri FTIR spektroskopisi kullanılarak moleküler düzeyde incelenmiģtir [Severcan v.d. 2008]. Her iki beyazlatma metodunun etkileri dentin üzerinde ihmal edilebilir düzeyde gözlemlenmiģtir. Elde edilen sonuçlar ofiste beyazlatmanın minenin kristal yapısına ve mineralizasyonuna zararlı etkileri olduğunu ve diģte moleküler seviyede oluģabilecek değiģiklikler açısından evde beyazlatmanın ofiste beyazlatmadan daha güvenli olduğunu gösterilmiģtir. Ġnfrared spektroskopisi ve mikroskopisi Mezenkimal kök hücreler (MKH) lere de uygulanmıģ ve bir öğrencinin doktora tez çalıģmasını oluģturmuģtur. MKH farklı hücre tiplerine farklılaģabilme özellikleri ile doku yenilenmesi ve devamlılığındaki önemli rollerinden ötürü son yıllarda hücresel tedavide ve yenileyici tıpta ilgi odağı olmuģlardır. Böylece hücresel tedavi amaçlı kullanılabilecek kök hücrelerin saflığının ve farklılaģma basamaklarının belirlenmesinde; hücrelerin doğru karakterizasyonu ve tanısında güvenilir, hassas, hızlı, ucuz ve hücreye zarar vermeyen yeni yöntemlerin gerekliliğini doğurmuģtur. Bu çerçevede titreģim spektroskopisi kök hücre biyolojisinde hücrelerin moleküler seviyede analizi ve görüntülenmesi için gerçek zamanlı bilgi veren umut vadeden bir teknik olarak düģünülmektedir [Aksoy ve Severcan, 2012]. Bu amaçla iki farklı çalıģma tasarlanmıģ; ilkinde talasemi hastalığında diğerinde ise farklı yaģ gruplarındaki sağlıklı vericilerden elde edilen kemik iliği MKH leri Fourier Transform Kızılötesi (FTIR) Spektroskopisi ve mikrospektroskopisi kullanılarak moleküler seviyede karakterize edilmiģtir. Talasemi ile ilgili çalıģmada sağlıklı kontrol, kemik iliği nakli tedavisi öncesi ve sonrasındaki BM-MKH lere ait örnek grupları incelenmiģtir ve sonuçlar etki faktörü 4.7 olan Stem Cells and Development dergisinde yayınlanmıģtır [Aksoy v.d. 2012a], Bu sonuçlar FTIR mikroskospisi yöntemi ile de doğrulanmıģtır [Aksoy v.d. 2012b]. BM-MKH ler üzerinde verici yaģının etkilerinin araģtırıldığı diğer çalıģmada ise beģ farklı yaģ grubuna ait BM-MKH ler arasındaki farklılıklar yine aynı tekniklerle belirlenmiģtir. Genç yaģtaki sağlıklı vericilerden elde edilen BM-MKH lerin hücresel tedavide kullanımının daha baģarılı sonuçlar elde edilmesine yardımcı olacağı bulunmuģtur ve sonuçlar konusunun en iyi dergisi olan Age (etki faktörü:4.3) dergisinde yeni basılmıģtır. 141

146 Kaynakça: Aksoy C., Kaya, FA., Uckan D., Severcan F., Novel Molecular Markers Monitoring Donor Age Effect on Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells: FTIR Spectroscopy and Imaging Study. Age,. 2014, 36:9691. Aksoy C., Guliyev A., Kilic E., Uckan D., Severcan F., Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells in Patients with Beta Thalassemia Major: Molecular Analyses with ATR-FTIR Spectroscopy Study As A Novel Method. Stem Cells and Development, 2012a, 21(11), Aksoy C., Uckan D., Severcan F., FTIR Spectroscopic Imaging of Mesenchymal Stem Cells in Beta Thalassemia Disease State. Biomedical Spectroscopy and Imaging, 2012b, DOI /BSI , pp Aksoy C., ve Severcan F., Role of Vibrational Spectroscopy in Stem Cell Research. Invited Review Article. Spectroscopy: An Int. Journal, 2012, Vol. 27 (3), Dogan A. Siyakus G. and Severcan F. FTIR Spectroscopic Characterization of Irradiated Hazelnut (Corylus avellana L.). Food Chemistry, 2007, 100 (3), Severcan F and Ozlem Bozkurt. Applications of Vibrational Spectroscopy in Food Science. Edited by E. Li-Chan, P. R. Griffithsand, J. M. Chalmers John Wiley & Sons, Ltd. Severcan F, K.Gokduman, A.Dogan, S. Bolay, S. Gokalp, Applied Spectroscopy, 2008, 62 (11),

147 DOÇ. DR. ĠREM EREL Akıllı Polimer Filmler AraĢtırma Grubu ph ġekil 1. Ağız yoluyla ilaç taģınımı için ph ye duyarlı polimer hazneler AraĢtırma grubumuzun yürüttüğü çalıģmalar polimer kimyası, nanoteknoloji ve biyomedikal mühendisliğinin kesiģtiği alanda yoğunlaģmaktadır. Temel amacımız ph, sıcaklık, manyetik ve elektriksel alan gibi dıģ etkilerin değiģtirilmesi ile yüzey özelliklerini ayarlayabilen ultraince akıllı polimer filmleri tasarlamak, üretmek ve fizikokimyasal özelliklerini tanımlamaktır. Bu nanoboyutlu akıllı yüzey kaplamalarının yüksek teknoloji ürünü elektronik cihazlardan biyomedikal mühendisliğine geniģ uygulama alanları mevcuttur. ġekil 2. Bakteri YapıĢmayan Yüzeyler Bakteri yapıģmasını engelleyen özellikler taģıyan yüzey kaplamaları, kontrollü ilaç/protein/gen salımının gerçekleģtirilebileceği polimer platformlar, yüzeyi iģlevselleģtirilmiģ biyomedikal gereçler çalıģmalarımız sonucunda üretilen bilginin ve geliģtirilen malzemelerin uygulama alanlarının en önemli örneklerindendir. Odaklandığımız araģtırma projeleri ileride daha geliģmiģ sistemlerin hazırlanması yolunda gereken temel bilginin oluģturulması ve bu sistemlerin ġekil 3. Kontrollü ilaç salımı için polimer miseller biyolojik uygulamalardaki kullanılabilirliklerinin önünü açmasını hedeflemektedir. 143

148 PROF. DR. LEVENT TOPPARE Biyosensör AraĢtırma Grubu Prof. Dr. Levent Toppare Fulya Ekiz Kanik (Doktora öğrencisi) Melis Kesik (Doktora öğrencisi) Saniye Soylemez (ÖYP) Seyda Vanlı (Yüksek Lisans öğrencisi) Janset Turan (Yüksek Lisans öğrencisi) AraĢtırma konularımız iletken polimerler tabanlı biyosensörler ve fotovoltaik araçlar geliģtirilmesini ve uygulamalarını içermektedir. Bu amaçlara yönelik kullanılmak üzere birçok organik polimer tasarlayarak sentezlemekteyiz. Ġletken polimer tabanlı biyosensörler geliģtirdiğimiz laboratuvarımızda glukoz, kolesterol ve tarım ilaçları gibi birçok önemli maddenin nitel ve nicel tayinini gerçekleģtirmekteyiz. Bu çalıģmalarda, çeģitli iletken polimerler sentezlenerek biyosensör hazırlanmasında biyokatman geliģtirilmesinde kullanılmaktadır ve bu sayede geleneksel biyosensörlerin aksine cok daha hassas ve uzun ömürlü biyosensörler elde edilmektedir. Uygulamalarımızda, çeģitli enzimleri biyolojik bileģen ve iletken polimerleri immobilizasyon matrisi olarak kullanmaktayız. Ek olarak, iletken polimerlerin elektrokimyasal ve morfolojik özelliklerini birçok nanomaterial kullanımı ve çeģitli yüzey modifikasyonları ile geliģtirmekteyiz. ÇalıĢmalarımızda, biyolojik moleküllerin iletken polimerlerle birleģtirilmesi, altın nanoparçacıkların ve karbon nanotüplerın etkileri ile çeģitli yüzey tasarımları araģtırılmaktadır. SeçilmiĢ yayınlar: 1. Fulya Ekiz, Funda Oğuzkaya, Mehriban Akin, Suna Timur, Cihangir Tanyeli and Levent Toppare, Synthesis and application of poly-sns-anchored carboxylic acid: a novel functional matrix for biomolecule conjugation, J. Mater. Chem., 2011, 21, Melis Kesik, Fulya Ekiz Kanik, Gönül Hızalan, Duygu Kozanoglu, Emren Nalbant Esenturk, Suna Timur, Levent Toppare, A functional immobilization matrix based on a conducting polymer and functionalized gold nanoparticles: Synthesis and its application as an amperometric glucose biosensor, Polymer, 2013, 54, Saniye Soylemez, Fulya Ekiz Kanik, Sema Demirci Uzun, Serife O. Hacioglu and Levent Toppare, Development of an efficient immobilization matrix based on a conducting polymer and functionalized multiwall carbon nanotubes: synthesis and its application to ethanol biosensors, J. Mater. Chem. B, 2014,2,

149 Y. DOÇ. MECĠT HALĠL ÖZTOP Gıda Biyoteknelojisinde Manyetik Rezonans Görüntüleme Tekniği ve DüĢük Rezolüsyonlu NMR Relaksometre Uygulamaları Gıda Görüntüleme Laboratuarında, bilimde kullanılan en son teknolojilerin gıda alanında uygulanmasıyla birlikte geliģtirilebilir ve uygulanabilir araģtırmalara ev sahipliği yapmak ana amaçlarından biridir. Bunun ıģığında, Ģuan geliģtirilmekte olan projeler; Lignosellülozik yapıların Enzimatik Hidrolizi: Biyoteknolojide lignoselülozik biyokütleler sahip oldukları glikoz potansiyeli sebebiyle fermentasyon için uygun yapılardır. Ancak, karmaģık biyolojik yapılar oldukları için bir takım ön iģleme ihtiyaç duyarlar. Selüloz kaynağı olarak seçilen mısır koçanı, ayçiçeği küspesi, nar kabuğu enzimatik hidrolize uygun kılabilmek için konvansiyonel ısıtma ve alkali ön iģlemleri uygulanır. Enzim verimini tespit edebilmek için Manyetik Rezonans Görüntüleme ve NMR Relaksometre tekniklerini kullanarak sürecin kinetiğiyle iliģkilendirip verim tespitinin yapılması hedeflenmektedir. Avrupa Birliği nin önem verdiği üzere 2030 lu yıllarda yakıtın önemli bir kısmı biyo kütlelerden sağlanacaktır. Manyetik Rezonans Görüntüleme ile tohumlarda viral hastalıkların erken teģhisi: Bakteriyel ve viral hastalıklar tarımda verimi etkileyen en önemli etmenlerden biridir. Bu tip tohum kökenli hastalıklarla, etkin bir mücadele yönteminin olmaması üretimi olumsuz yönde etkiler. Genellikle, bu ürünlerin tespiti için çok fazla zaman ve yüksek maliyet gerektiren genetik teknikler kullanılmakta olup sadece seçilmiģ bir grup tohum için uygulanabilmektedir. Ancak, sağlıklı bir yetiģtiricilik için hızlı, güvenilir ve tahribatsız bir yöntem geliģtirilmesi hedeflenmektedir. Nükleer Manyetik Rezonans teknikleri kullanarak kontaminasyon riski yüksek tohumları erken teģhis ederek tarlada ürün veriminin artırılması amaçlanmaktadır. Dünya nüfusunun hızla artması ve tarım alanlarının kısıtlı olması, tarımda bu tip yöntemlerin önemini artıracaktır. Antimikrobiyal etken maddeler kullanılarak akıllı kese kağıdı tasarımı: Gıdalarda raf ömrünü uzatmak ve ürünün kalitesini arttırmak için doğal antimikrobiyal etkili aktif maddeler sayesinde akıllı kese kağıdı tasarlanabilecektir. Bu aktif maddelerin antimikrobiyal etkilerinin yanı sıra, gıdalara su 145

150 geçiģinde engelleyebilmektedir. Kekik, biberiye, nane esansiyel yağları ve kırmızı biberin etken maddelerinin kese kâğıtlarına daldırma ve püskürtme yöntemleriyle uygulanarak gıdaların raf ömrünü arttırmakta kullanılabilir. Manyetik Rezonans Görüntüleme ile ise mikrobiyal büyüme ve su geçiģleri kontrol edilebilecektir. Günümüzde, gıda paketlemesi ürünlerin raf ömrünü etkileyen en önemli unsurlardan biridir. Gıdalarda raf ömrünü uzatmak için fonksiyonel kağıt tasarımı: Gıda kalitesi ve güvenliği, aktif paketlemenin içerisindeki antioksidan ve antimikrobiyal maddelerle mümkün olabilmektedir. Ancak, sentetik etkin maddelerin sağlığa ve çevreye kaygısı yüzünden doğal ekstraktlar olan talep olumlu yönde artmıģtır. Gıdaların raf ömrünü arttırmak için, buzdolaplarında ve paketlerin altında kullanılmak üzere etken maddelerden kullanılarak elde edilen fonksiyonel kağıtların üretilmesi amaçlanmaktadır. Aktif bileģenlerin, selüloz matris içerisinde hapsedilmesinden dolayı bu fonksiyonel kağıtların antimikrobiyal bir özelliğe sahip olması hedeflenir. PaketlenmiĢ gıdalarındaki mikrobiyal büyüme dolayı gıda bozulmalarının artması, paketleme sektörünü aktif paketleme sistemlerinin geliģtirilmesine önem verilmesini sağlayacaktır. 146

151 DOÇ DR SREEPARNA BANERJEE LIPOXIB - Nano-lipozomlar yoluyla kanseri hedeflemek Amaç: Non steroidal Anti-iflamatuvar ilaç olan Celecoxib in, EGFR antikoru yardımıyla kanserli hücreye ulaģtırılması. Böylece, Celecoxib gönderimindeki kardiyovasküler yan etkileri azaltır. Hedefli kanser terapisi, kemoterapinin baģka hücrelerde ortaya çıkarabileceği yan etkileri azaltır. Katı tümörler genellikle EGFR proteinini fazla ifade etmektedirler. Bu yeni lipozom formülü lipozomun, EGFR sentezleyen kanser hücrelerine hedeflenmesini sağlayarak, toksik olmayan, biyo-uyumlu bir çözüm sunmaktadır. Teknik Özellikler: Bu buluģ, ekstrüzyon yöntem ile yapan 1,2-Distearoyl-sn-glycero-3- phosphocholine (DSPC) ve polyethylene glycol (PEG) olan nanopartiküller içermektedir. Celecoxib, lipit çiftkatmanı tarafından kapsanmaktadır. EGFR antikorunun Fab PEG zincirlerinin maleimide tarafında kovalent olarak bağlanmıģtır (ġekil). Avantajları: Nano-boyutlu: BağıĢıklık sistemi elimine edemez. DolaĢımda uzun kalan: PEG zincirleri, dolaģım sisteminde lipozomun uzun süre kalmasını sağlar. Biyo-uyumlu: Zehirli olmayan biyomateryallerden oluģur. Az yan etki: Celecoxib in sistemik yan etkilerini engeller. Kanseri hedefleyen: EGFR antikoru lipozomun normal hücreden ziyade kanser hücreleri tarafından içeri alınmasını sağlar. 147

152 Üretilen Tezler: Aslı Erdoğ (Deniz), Doktora Ġlaç taģıyıcı sistem olarak lipozomal selekoksib formülasyonunun kolorektal kanser hücrelerinde karakterizasyonu. (EĢ DanıĢmanı: Doç. Dr. AyĢen Tezcaner, Biyoteknoloji be Mühendislik Bilimler Bölümü). Makaleler: Erdoğ A, Limasale YD, Keskin D, Tezcaner A, Banerjee S. In vitro characterization of a liposomal formulation of celecoxib containing 1,2-Distearoyl-sn-Glycero-3-Phosphocholine (DSPC), cholesterol and polyethylene glycol (PEG) and its functional effects against colorectal cancer cell lines. Journal of Pharmaceutical Sciences. 2013, 102: Sade A, Tunçay S, Çimen I, Severcan F, Banerjee S. Celecoxib reduces fluidity and decreases metastatic potential of colon cancer cell lines irrespective of COX-2 expression. Bioscience Reports 2012, 32, Sade A, Banerjee S, Severcan F. Effects of the non steroidal anti-inflammatory drug celecoxib on cholesterol containing distearoyl phosphatidylcholine membranes. Spectroscopy - An international journal. 2011, 25, Deniz A, Sade A, Severcan F, TezcanerA, Keskin D, Banerjee S. Celecoxib Loaded Liposomes: Effect of Cholesterol on Encapsulation and in vitro Release Characteristics. Biosci Rep Jun 3;30(5): Sade, A, Banerjee, S and Severcan, F. Concentration dependent effects of celecoxib on model membranes. J Liposome Res Jun;20(2): Projeler: TÜBĠTAK 108T297, METU BAP-2007-R , BAP Patent BaĢvuru No: PCT/TR2012/

153 PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ Prof. Dr. Ufuk Gündüz 1973 yılında Iowa State Üniversitesi (ABD), Kimya Mühendisliği Bölümü nden mezun olmuģ, aynı bölümde Yüksek Lisans yaptıktan sonra, 1980 yılında ODTÜ Biyoloji Bölümünden doktora derecesi almıģtır yılında ODTÜ Fen Bilimleri Enstitüsü tarafından Biyoteknoloji EABD nı oluģturmak üzere görevlendirilmiģ, Dr. Faruk Bozoğlu (Gıda Müh) ve Dr. Hasan Orbey (Kimya Müh.) ile birlikte Biyoteknoloji EABD nın kuruluģunda görev almıģtır. Dr. Gündüz yıllarında ODTÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji EABD BaĢkanlığı, arasında Biyoteknoloji EABD Ġdari Komite Üyeliği yapmıģtır. Biyoteknoloji EABD nin kuruluģ yılında açtığı Fundamentals of Biotechnology dersini EABD nin temel dersi olarak vermektedir. ÇalıĢma Konuları Kanser tedavisinde geliģen dirençliliğin belirlenmesi ve engellenmesi ile ilgili çalıģmaları vardır. Son yıllarda kanserde ilaç hedeflenmesi amacıyla manyetik nanoparçacıkların sentezi, ve ilaç hedeflemede kullanılması konusunda tez, proje ve yayınlar yapmaktadır. Dr. Gündüz fotosentetik mikroorganizmalar kullanılarak Bio-Hidrojen üretimi konusunda çok sayıda tez yönetmiģ, yayın ve projeler yapmıģtır. Dr. Gündüz Ģimdiye kadar Biyoteknoloji EABD da lisansüstü çalıģma yapan 26 yüksek lisans ve 9 doktora öğrencisine tez danıģmanlığı yapmıģtır. Biyoteknoloji alanında yönettiği bazı tezler ve projelerden örnekler aģağıda verilmektedir. Biyoteknoloji tezleri A.Yüksek Lisans Tezleri: 1. Farzin Rouhvand, "Transformation of Saccharomyces cerevisiae with a Shuttle Vector Plasmid DNA from E. coli by Electroporation, ġubat 1992 (Biyoteknoloji) 2. Özlem Aydın, "Isolation, Identification and Characterization of Non-Starter Microorganizms form Turkish Casher Cheese" Ocak 1995 (Biyoteknoloji) 3. Yelda Erdal Ünal, " Increase of Alpha Amylase Production of Aspergillus oryzae by Electroporation" ġubat 1996 (Biyoteknoloji) 4. Gökhan Tolun, Characterization of Aspergillus oryzae Transformed with a Plasmid Carrying Alpha Amylase Gene Ocak 1999,108 Sayfa, ( Biyoteknoloji ) 5. Deniz Özgür Yiğit, Identification of Byproducts in Hydrogen Producing Bacteria; Rhodobacter sphaeroides O.U. 001 Grown in Wastewater of a Sugar Refinery Ağustos 1999,111 Sayfa (Biyoteknoloji) 6. Senem ġimģek, Multidrug Resistance in Chronic Lymphocytic Leukemia Aralık 2000, ( Biyoteknoloji) 7. Demet Suludere Çetin, Investigation of Polyhydroxybutyrate (PHB)Production by Rhodobacter sphaeroides O.U.001 Ağustos 2001, (Bioteknoloji). 8. Pelin Kaya, Identification of Polymorphisms in Multidrug Resistance Gene in Leukemia Patients, Ağustos 2002, (Biyoteknoloji). 9. Gökçen Eyövge, Preparation and Characterization of Poly (D,L-Lactide-co-Glycolide) Microspheres for Controlled Release of Anticancer Drugs,Ağustos 2005 ( Biyoteknoloji). 149

154 12.Demet Demetçi, Preparation and Evaluation of Polymer based Microcarriers for Hydrophobic Anti-Cancer Drugs, Kasım 2007,89 Sayfa (Biyoteknoloji). 13.Güç E, Synthesis and Characterization of Fatty Acid Based Hyperbranched Polymers for Anti- Cancer Drug Delivery, Eylül 2008,114 Sayfa (Biyoteknoloji). 14. Gülseren Petek ġen, Fabrication of Poly (dl-lactic- co-glycolic acid) Nanoparticles and Synthetic Peptide Drug Conjugate for Anticancer Drug Delivery, Aralık 2009, 98 Sayfa (Biyoteknoloji) 15. Pelin Sevinç, Kinetic Analyses of the Effects of Temperature and Light Intensity on Growth, Hydrogen Production, and Organic Acid Utilisation by Rhodobacter capsulatus, Haziran 2010, 189 Sayfa (Biyoteknoloji) 16. GülĢah Pekgöz, Deletion Mutation of GLNB and GLNK Genes in Rhodobacter capsulatus to Enhance Biohydrogen Production, Eylül 2010, 163 Sayfa (Biyoteknoloji) 17. Endam Özkan, Photofermentative Hydrogen Production Using Dark Fermentation Effluent of Sugar Beet Thick Juice by Rhodobacter capsulatus, Eylül 2011, 187 sayfa (Biyoteknoloji) B. Doktora Tezleri: 1. Farzın Roohvand, "PCR Based Isolation, Cloning,and Expression of Streptokinase Gene From a Group C Streptococcus equismilis in E. coli" Eylül 1998, 143 sayfa, (Biyoteknoloji). 2.Özlem Osmanağaoğlu, Purification and Characterization of Bacteriocins Produced by Pediococcus acidilacdici and Pediococcus pentosaceus, Temmuz 1999, 200 sayfa, (Biyoteknoloji). 3. Can Atalay, Multidrug Resistance in Locally Advanced Breast Cancer Haziran 2004, 70 sayfa, (Biyoteknoloji). 4. Gökhan Kars, Improvement of Biohydrogen Production by Genetic Manipulations in Rhodobacter sphaeroides O.U.001, Ekim 2008, 168 Sayfa, (Biyoteknoloji). 5. Meltem Demirel Kars, Molecular Mechanisms of Vincristine and Paclitaxel Resistance in MCF- 7 Cell line, Aralık 2008,233 Sayfa,(Biyoteknoloji). 6. Özlem Darcansoy ĠĢeri, Molecular Mechanisms of Doxorubicin and Docetaksel Resistance in MCF-7 Cells, ġubat 2009, (Biyoteknoloji) 7. Rouhollah Khodadust, The Preparation and Characterization of Dendrimer Coated Magnetic Nanoparticles for Targeted Cancer Therapy, Eylül 2013, (Biyoteknoloji) 8. Gözde Ünsoy, The Synthesis and Characterization of Doxorubicin and Bortezomib Loaded Magnetic Nanoparticles for Targeting Tumor Cells, Eylül 2013, (Biyoteknoloji) Hidrojen ile ilgili yer aldığı bazı Biyoteknoloji Projeleri: 1. TÜBĠTAK, TBAG 1535, Mikroorganizmalar ve GüneĢ Enerjisi ile Sürekli Hidrojen Üreten Biyoproseslerin GeliĢtirilmesi, ( ) 2. ODTÜ, AraĢtırma Fonu Projesi, AFP , Fotosentetik Bakterilerde Karetenoid Pigment Üretiminin Ġncelenmesi, ( ) 3. EU COST Projesi, TBAG-U/25 (101T122) COST-841, Rhodobacter Türlerindeki Hidrojenaz Enzimlerinin Biyoreaktörde Fotobiyolojik Hidrojen Üretim Verimliligin Artırılmasına Yönelik Genetik ve Biyokimyasal ÇalıĢmalar, ( ) 4. DPT Projesi, BAP DPT2002K , Rhodobacter sphaeroides O.U.001 SuĢunda Nitrojenaz Enzimlerini Kodlayan Genlerin Tanımlanması, ( ) 5. DPT-YUUP Projesi, BAP-08-11DPT.2005K120600, Hidrojen Gazı Üretimi, Depolanması, ve Yakıt Hücrelerinde Elektrik Elde Edilmesi, ( ) 6. EU-FPIP 6th Framework Project, HYVOLUTION: Non-thermal Production of Pure Hydrogen from Biomass, ( ) 150

155 EKLER EK 1 151

156 152

157 153

158 154

159 155

160 156

161 157

162 158

163 159

164 160

165 161

166 162

167 EK 2 163

168 164

169 165

170 166

171 167

172 168

173 169

174 170

175 EK 3 171

176 EK 4 172

177 EK 5 173

178 174

179 EK 6 175

180 176

181 EK 7 177

182 178

183 EK 8 179

184 EK 9 180

185 EK

186 EK

187 183

188 184

189 185

190 186

191 187

192 188

193 EK

194 190

195 191

196 192

197 193

198 194

199 195

200 EK

201 197

202 EK

203 199

204 200

205 201

206 EK

207 203

208 204

209 205

210 206

211 207

212 208

213 209

214 210

215 211

216 212

217 213

218 214

219 215

220 216

Prof. Dr. Nesrin HASIRCI. ODTÜ - Kimya Bölümü

Prof. Dr. Nesrin HASIRCI. ODTÜ - Kimya Bölümü Prof. Dr. Nesrin HASIRCI ODTÜ - Kimya Bölümü Biyoteknoloji EABD 25.Yıl ımızı kutlamak için bir etkinlik düzenleyelim fikri ortaya çıktığı an hepimiz çok heyecanlandık. Amacımız, ODTÜ-Biyoteknoloji paydaşlarının

Detaylı

ODTÜ BİYOTEKNOLOJİ 25.YIL. Prof. Dr. Fusun Eyidoğan Başkent Üniversitesi

ODTÜ BİYOTEKNOLOJİ 25.YIL. Prof. Dr. Fusun Eyidoğan Başkent Üniversitesi ODTÜ BİYOTEKNOLOJİ 25.YIL Prof. Dr. Fusun Eyidoğan Başkent Üniversitesi Yüksek Lisans Tezi Başlığı ve Danışmanları: İnci, Füsun. "Characterization of superoxide dismutase isoenzymes in Turkish wheat varieties

Detaylı

HAZ. ADI PROGRAM ÜNİVERSİTE ENSTİTÜ ANABİLİM KONU DURUMU BAŞ.TARİH BİTİŞ TARİH GENEL BİYOLOJİ ANABİLİM DALI

HAZ. ADI PROGRAM ÜNİVERSİTE ENSTİTÜ ANABİLİM KONU DURUMU BAŞ.TARİH BİTİŞ TARİH GENEL BİYOLOJİ ANABİLİM DALI ÖZGEÇMİŞ TC KİMLİK NO: PERSONEL AD: SOYAD: DOĞUM TARİHİ: SİCİL NO: UYRUK: EHLİYET: 12535301842 MUTLUNİSA ÜNALDI ÇORAL 10/13/72 12:00 AM A93844 B DİL ADI SINAV ADI PUAN SEVİYE YIL DÖNEM İngilizce KPDS 79

Detaylı

20 EKİM 2007 CUMARTESİ GÜNÜ YAPILAN SINAVIN SONUCU HUKUK İNGİLİZCESİ VI Cumartesi - Pazar Saat : 15.00-18.00 Salon D

20 EKİM 2007 CUMARTESİ GÜNÜ YAPILAN SINAVIN SONUCU HUKUK İNGİLİZCESİ VI Cumartesi - Pazar Saat : 15.00-18.00 Salon D 20 EKİM 2007 CUMARTESİ GÜNÜ YAPILAN SINAVIN HUKUK İNGİLİZCESİ VI Cumartesi - Pazar Saat : 15.00-18.00 Salon D 1 BETÜL KURNAZ 2 35490 VOLKAN UYSAL 3 34966 HOVSEP PAYEL 4 33196 GÖZDE İŞÇİ 5 SİBEL YILMAZ

Detaylı

YÜKSEKÖĞRETİM KURULU YARDIMCI DOÇENT 01.12.2014. : Sinop Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Sinop

YÜKSEKÖĞRETİM KURULU YARDIMCI DOÇENT 01.12.2014. : Sinop Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Sinop HÜLYA SİPAHİ ÖZGEÇMİŞ YÜKSEKÖĞRETİM KURULU YARDIMCI DOÇENT 01.12.2014 Adres : Sinop Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Sinop Telefon : 3682715516-4206 E-posta Doğum Tarihi : Faks : Kadro

Detaylı

ÖZGEÇMİŞ. Expression Pattern Comparison of Two Ubiquitin Specific Proteases. Functional Characterization of Two Potential Breast Cancer Related Genes

ÖZGEÇMİŞ. Expression Pattern Comparison of Two Ubiquitin Specific Proteases. Functional Characterization of Two Potential Breast Cancer Related Genes ÖZGEÇMİŞ 1. Adı ve Soyadı: Shiva Akhavantabasi 2. Ünvanı: Yrd. Doç. Dr. 3. Email adresi: shiva.akhavan@yeniyuzyil.com 4. Öğrenim Durumu: Derece Alan Üniversite Yıl Lisans Mikrobiyoloji Jahrom Azad Üniversitesi

Detaylı

Yrd.Doç.Dr. Didem SUTAY KOCABAŞ

Yrd.Doç.Dr. Didem SUTAY KOCABAŞ Yrd.Doç.Dr. Didem SUTAY KOCABAŞ Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Gıda Mühendisliği Bölümü Yunus Emre Yerleşkesi 70100 / KARAMAN Telefon: (338) 226 2000/5008 Belgegeçer:(338) 226

Detaylı

202 nolu sınıf Ders Adı LAW 201 Borçlar Hukuku Genel Hükümler I SIRA NO Öğrenci No Adı Soyadı Öğretim Elemanı Doç. Dr.

202 nolu sınıf Ders Adı LAW 201 Borçlar Hukuku Genel Hükümler I SIRA NO Öğrenci No Adı Soyadı Öğretim Elemanı Doç. Dr. 202 nolu sınıf LAW 201 Borçlar Hukuku Genel Hükümler I 1 1201011040 SAFİYE BÜKE 2 1201011010 TAHA EMİN YARIŞ 3 1101011062 SALİH YILDIZ 4 1201011030 KÜBRA ŞAHİN 5 1201011067 TUĞHAN ERTÜRK 6 1201011034 AYTEN

Detaylı

ÇANKAYA İLÇE MİLLİ EĞİTİM MÜDÜRLÜĞÜ SINAV SONUÇ LİSTESİ SIRA SOYAD AD KURUM ADAY NO SERTİFİKA TÜRÜ PUAN SONUÇ. 06924 Çağrı Merkezi Elemanı 95 GEÇTİ

ÇANKAYA İLÇE MİLLİ EĞİTİM MÜDÜRLÜĞÜ SINAV SONUÇ LİSTESİ SIRA SOYAD AD KURUM ADAY NO SERTİFİKA TÜRÜ PUAN SONUÇ. 06924 Çağrı Merkezi Elemanı 95 GEÇTİ Sayfa : 1 / 7 1 BULUT Abdulsamet 07001 Çağrı Merkezi Elemanı 85 GEÇTİ 2 AHMET TAHİR Ahmet 06898 Çağrı Merkezi Elemanı 55 GEÇTİ 3 KAYABAŞI Akgün 07002 Çağrı Merkezi Elemanı 50 GEÇTİ 4 DİNÇ Ali 06919 Çağrı

Detaylı

İstanbul Medeniyet Üniversitesi. Fen Fakültesi Kimya Bölümü Akademik Kurul Toplantısı Aralık - 2013

İstanbul Medeniyet Üniversitesi. Fen Fakültesi Kimya Bölümü Akademik Kurul Toplantısı Aralık - 2013 İstanbul Medeniyet Üniversitesi Fen Fakültesi Kimya Bölümü Akademik Kurul Toplantısı Aralık - 2013 Akademik Personel Mesut Görür Arş. Gör. Ayşe Demir Uzman Dr. Kübra Demir Uzman Büşra Şennik Arş. Gör.

Detaylı

ÖZGEÇMİŞ. Ünvan Kurum Alan Yıl. Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi. Biyoloji 2005-2010 Yarı zamanlı Öğretim Elemanı Yardımcı Doçent

ÖZGEÇMİŞ. Ünvan Kurum Alan Yıl. Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi. Biyoloji 2005-2010 Yarı zamanlı Öğretim Elemanı Yardımcı Doçent ÖZGEÇMİŞ 1. Adı Soyadı : Sibel YILMAZ İletişim Bilgileri Adres Telefon Mail 2. Doğum Tarihi : 08.03.1980 3. Unvanı : Yardımcı Doçent : Yeni Yüzyıl Üniversitesi, Fen/Edebiyat Fakültesi Moleküler Biyoloji

Detaylı

T.C. BOLU VALİLİĞİ Merkez Yunus Emre Ortaokulu Müdürlüğü 2014 YILI E-KAYIT OKUL ÖĞRENCİ LİSTESİ 11/10/2004 ORTAOKUL 01/04/2004 ORTAOKUL

T.C. BOLU VALİLİĞİ Merkez Yunus Emre Ortaokulu Müdürlüğü 2014 YILI E-KAYIT OKUL ÖĞRENCİ LİSTESİ 11/10/2004 ORTAOKUL 01/04/2004 ORTAOKUL 1 ABDULLAH KADİR EDİŞ 11/11/2004 ORTAOKUL 2 ABDÜLMUTTALİP KARAMAN 01/04/2004 ORTAOKUL 3 AHMET KOÇ 4 AHMET CAN ÇAMUR 12/07/2004 ORTAOKUL 5 ALEYNA AKKAYA 17/11/2004 ORTAOKUL 6 ALEYNA TAYŞİ 03/04/2004 ORTAOKUL

Detaylı

İSTANBUL KATILIMCI LİSTESİ

İSTANBUL KATILIMCI LİSTESİ İSTANBUL KATILIMCI LİSTESİ Aday Ad Aday Soyad Faaliyet Adı Faaliyet İli Faaliyet Yeri Başlama Tarihi Bitiş Tarihi ABDULNASIR ÇELİK 2016000004Rehberlik Kursu İSTANBUL ABDURRAHMAN AKYOL 2016000004Rehberlik

Detaylı

LABORATUAR TEKNİSYENLERİ. 2 Seda IŞIK Laboratuar Teknikeri Kan Tranfizyonu. 3 Asiye ERDEN Laboratuvar Teknikeri ücretsiz izinli

LABORATUAR TEKNİSYENLERİ. 2 Seda IŞIK Laboratuar Teknikeri Kan Tranfizyonu. 3 Asiye ERDEN Laboratuvar Teknikeri ücretsiz izinli 1 Bahriye IRATCI LABORATUAR TEKNİSYENLERİ Laboratuar Teknisyeni Laboratuvar 2 Seda IŞIK Laboratuar Teknikeri Kan Tranfizyonu 3 Asiye ERDEN Laboratuvar Teknikeri ücretsiz izinli 4 Mustafa KIVRAK Laboratuvar

Detaylı

İBRAHİM ÖNAL ANADOLU ÖĞRETMEN LİSESİ 2011 LYS SONUÇLARI

İBRAHİM ÖNAL ANADOLU ÖĞRETMEN LİSESİ 2011 LYS SONUÇLARI İBRAHİM ÖNAL ANADOLU ÖĞRETMEN LİSESİ 2011 LYS SONUÇLARI S. N. ADI SOYADI ÜNİVERSİTE ADI FAKÜLTE BÖLÜM 1 OĞUZCAN EREN FATİH ÜNİVERSİTESİ Tıp Fakültesi Tıp (Burslu) 2 ÖMER ÖZ DOKUZ EYLÜL ÜNİVERSİTESİ Tıp

Detaylı

Fen Edebiyat Fak. Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü Kütahya 1977

Fen Edebiyat Fak. Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü Kütahya 1977 Adı Soyadı Ünvanı Birimi Doğum Yeri Doğum Tarihi BİLECİK ŞEYH EDEBALİ ÜNİVERSİTESİ İsmail POYRAZ Yrd.Doç.Dr. AKADEMİK ÖZGEÇMİŞ FORMU KİŞİSEL BİLGİLER Fen Edebiyat Fak. Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü

Detaylı

18/11/2015 TARİHLİ ÖĞRETİM ELEMANI ALIM İLANI ÖN DEĞERLENDİRME SONUÇLARI

18/11/2015 TARİHLİ ÖĞRETİM ELEMANI ALIM İLANI ÖN DEĞERLENDİRME SONUÇLARI Sıra No 8//205 TARİHLİ ÖĞRETİM ELEMANI ALIM İLANI ÖN DEĞERLENDİRME SONUÇLARI Başvurduğu BÖL/ABD/ASD/PROG. ALES'in %60'ı ÖĞRETİM GÖREVLİSİ Yabancı Dil Puanı Yabancı Dil Puanının %40'ı (Puan Sıralamasına

Detaylı

Yüzey Suları Çalışma Grubu

Yüzey Suları Çalışma Grubu Yüzey Suları Çalışma TÜRKİYE ULUSAL HİDROLOJİ KOMİSYONU TUHK BAŞKANI: Dr. BÜLENT SELEK ÜNİVERSİTELER TEMSİLCİSİ: Prof. Dr. HAFZULLAH AKSOY Çalışma Grupları Üye Adı-Soyadı Görevi Çalıştığı Kurum Prof. Dr.

Detaylı

TARİH BÖLÜMÜ EYLÜL DÖNEMİ STAJ GRUPLARI

TARİH BÖLÜMÜ EYLÜL DÖNEMİ STAJ GRUPLARI TARİH BÖLÜMÜ EYLÜL DÖNEMİ STAJ GRUPLARI Uygulama Öğretim Elemanı: Yrd. Doç. Dr. Ertuğ CAN Grup No: ED : Kırklareli Anadolu Lisesi 9000 AHMET DOĞAN 90009 ALİCAN YILDIZ 90006 FATMA ERDOGAN 900070 EMRE KANAT

Detaylı

2015-2016 KISMİ ZAMANLI ÇALIŞMAYA HAK KAZANAN ÖĞRENCİ LİSTESİ

2015-2016 KISMİ ZAMANLI ÇALIŞMAYA HAK KAZANAN ÖĞRENCİ LİSTESİ 2015-2016 KISMİ ZAMANLI ÇALIŞMAYA HAK KAZANAN ÖĞRENCİ LİSTESİ ADI SOYADI ÇALIŞTIĞI BİRİM 1 SEVİLAY BIYIKLI ACİL TIP ANABİLİM DALI 2 VELAT KURT ACİL TIP ANABİLİM DALI 3 BÜŞRA GEDİK ACİL TIP ANABİLİM DALI

Detaylı

2014 YILI BAŞARILI ÖĞRENCİ LİSTESİ

2014 YILI BAŞARILI ÖĞRENCİ LİSTESİ MARMARA ÜNİVERSİTESİ 2014 YILI BAŞARILI ÖĞRENCİ LİSTESİ HAZAL VATANSEVER. : MARMARA ÜNİVERSİTESİ GÜZEL SANATLAR FAKÜLTESİ RESİM BÖLÜMÜ ASLI ARIBURNU. : MARMARA ÜNİVERSİTESİ GÜZEL SANATLAR FAKÜLTESİ MODA

Detaylı

REKOMBİNANT E.coli KÜLTÜRLERİ İLE ENZİM ÜRETİMİNİN KİNETİK ÖZELLİKLERİNİN İNCELENMESİ. Dilek KAZAN, Amable HOKTAÇSU ve Agnes ÇAMURDAN

REKOMBİNANT E.coli KÜLTÜRLERİ İLE ENZİM ÜRETİMİNİN KİNETİK ÖZELLİKLERİNİN İNCELENMESİ. Dilek KAZAN, Amable HOKTAÇSU ve Agnes ÇAMURDAN REKOMBİNANT E.coli KÜLTÜRLERİ İLE ENZİM ÜRETİMİNİN KİNETİK ÖZELLİKLERİNİN İNCELENMESİ Dilek KAZAN, Amable HOKTAÇSU ve Agnes ÇAMURDAN Boğaziçi Üniversitesi. Mühendislik fakültesukimya Mühendisliği Bolümü

Detaylı

DEĞİŞİM SANAT AKADEMİSİ BAŞARI LİSTESİ

DEĞİŞİM SANAT AKADEMİSİ BAŞARI LİSTESİ DEĞİŞİM SANAT AKADEMİSİ BAŞARI LİSTESİ MİMAR SİNAN ÜNİVERSİTESİ GÜZEL SANATLAR FAKÜLTESİ HARUN AÇAN.. İÇ MİMARLIK MERVE AKTAŞ. MODA TASARIM METİN SAİD DEMİRCİ GRAFİK METİN SAİD DEMİRCİ MODA TASARIM ASLI

Detaylı

20113101002 TUĞÇE AÇAN İşletme Yüksek Lisans Tezsiz Programı 20113101003 ÇAĞATAY AKAR İşletme Yüksek Lisans Tezsiz Programı 20113101004 EREN AKKALE

20113101002 TUĞÇE AÇAN İşletme Yüksek Lisans Tezsiz Programı 20113101003 ÇAĞATAY AKAR İşletme Yüksek Lisans Tezsiz Programı 20113101004 EREN AKKALE 20113101002 TUĞÇE AÇAN İşletme Yüksek Lisans 20113101003 ÇAĞATAY AKAR İşletme Yüksek Lisans 20113101004 EREN AKKALE İşletme Yüksek Lisans 20113101005 ERGUN ARISOY İşletme Yüksek Lisans 20113101006 TOLGA

Detaylı

BAHÇELİEVLER AYDIN DOĞAN MESLEKİ VE TEKNİK ANADOLU LİSESİ. Coğrafya Öğretmenliği Grubu Numarası Adı Soyadı

BAHÇELİEVLER AYDIN DOĞAN MESLEKİ VE TEKNİK ANADOLU LİSESİ. Coğrafya Öğretmenliği Grubu Numarası Adı Soyadı BAHÇELİEVLER AYDIN DOĞAN MESLEKİ VE TEKNİK ANADOLU LİSESİ Coğrafya Öğretmenliği Grubu PF09140891 SEVDA ORTAÇ PF09140911 EBRU ŞENER PF09140916 GÜLAY TEKELİ PF09140842 SEYFULLAH YAZICI PF09140168 KÜBRA KARACA

Detaylı

GRUP. Devam Çizelgesi UYGULAMA OKULU KOORDİNATÖRÜ UYGULAMA SINIFI. ÖĞRETMEN ADAYININ NUMARASI Kübra Nur SAYAN Bircan ÇAM. 1.

GRUP. Devam Çizelgesi UYGULAMA OKULU KOORDİNATÖRÜ UYGULAMA SINIFI. ÖĞRETMEN ADAYININ NUMARASI Kübra Nur SAYAN Bircan ÇAM. 1. Kübra Nur SAYAN Bircan ÇAM Tülay SANCAR Özlem ESEN Yeliz KUMAŞ Kübra TUNCA Vasfiye KALAMAN 7 Mart Ortaokulu Orhun BÜYÜK Şehmuz BULUT Yrd. Doç. Dr. Mustafa CANSIZ Engin SÖNMEZ Murat YÖNDEM (İ.Ö.) Sultan

Detaylı

22 140205012 Büşra Şensoy 23 140107043 Emre Palabıyık 24 140103042 Melike Acar 25 140205056 Furkan Sait Özdemir

22 140205012 Büşra Şensoy 23 140107043 Emre Palabıyık 24 140103042 Melike Acar 25 140205056 Furkan Sait Özdemir 1-B2 ÖĞRENCİ NO ADI SOYADI 1 130107014 Kıvanç Şeviker 2 140101026 Elif Arda 3 140201016 Ezgi Selen Şanoğlu 4 140201022 Pelin Aktop 5 140201017 Cemre Nur Yılmaz 6 140109019 İsmet Kırgıl 7 130206007 Merve

Detaylı

T.C. AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI

T.C. AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI KARAR 2012/012 01: 2011-2012 Eğitim-Öğretim Yılı Bahar Yarıyılı itibariyle Tez Savunma Sınavına girecek öğrencilerin Anabilim Dalları Kurul Kararlarınca önerilen ve Enstitümüz Yönetim Kuruluna sunulan

Detaylı

YARASA VE ÇİFTLİK GÜBRESİNİN BAZI TOPRAK ÖZELLİKLERİ ve BUĞDAY BİTKİSİNİN VERİM PARAMETRELERİ ÜZERİNE ETKİSİ

YARASA VE ÇİFTLİK GÜBRESİNİN BAZI TOPRAK ÖZELLİKLERİ ve BUĞDAY BİTKİSİNİN VERİM PARAMETRELERİ ÜZERİNE ETKİSİ ATATÜRK ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ DOKTORA TEZİ YARASA VE ÇİFTLİK GÜBRESİNİN BAZI TOPRAK ÖZELLİKLERİ ve BUĞDAY BİTKİSİNİN VERİM PARAMETRELERİ ÜZERİNE ETKİSİ TARIMSAL YAPILAR VE SULAMA ANABİLİM

Detaylı

UYGULAMA ÖĞRETİM ELEMANI DOÇ. DR. EMRE ÜNAL DOÇ. DR. EMRE ÜNAL DOÇ. DR. EMRE ÜNAL

UYGULAMA ÖĞRETİM ELEMANI DOÇ. DR. EMRE ÜNAL DOÇ. DR. EMRE ÜNAL DOÇ. DR. EMRE ÜNAL 2012-2013 EĞİTİM YILI BAHAR YARIYILI ÖĞRETMENLİK SI II DERSİ PROGRAMI 1 090301001 NİLAY BOSTANCI 2 090301002 ZÜLBETTİN EMLİ 3 080301093 MUSTAFA TOK 4 090301004 EMİNE NAR 5 090301005 RABİYE KILINÇARSLAN

Detaylı

2014-2015 Pedagojik Formasyon Eğitimi Sertifika Programı Bahar (Ek) Dönemi II. Dönem Derslerine Ait Muafiyet Listesi

2014-2015 Pedagojik Formasyon Eğitimi Sertifika Programı Bahar (Ek) Dönemi II. Dönem Derslerine Ait Muafiyet Listesi Sıra No Öğrencini n Adı Soyadı Bölümü Muaf Olunan Ders Muafiyet Durumu 1 Fuat YILMAZ Beden Eğitimi Öğretmenlik Uygulaması Muaf 2 Murat PEKTAŞ Türk Dili ve Edebiyatı (TDE) Öğretmenlik Uygulaması Muaf 3

Detaylı

SIRA NO PROJE NO ADI SOYADI BÖLÜMÜ ÜNİVERSİTE EŞLEŞTİĞİ ÜLKE

SIRA NO PROJE NO ADI SOYADI BÖLÜMÜ ÜNİVERSİTE EŞLEŞTİĞİ ÜLKE 1 2013-1-TR1-COM04-47097 Adem TOPRAK İngilizce Öğretmenliği Anadolu Üniversitesi POLONYA 2 2013-1-TR1-COM04-46886 Adem CELEP Mütercim Tercümanlık Anadolu Üniversitesi POLONYA 3 2013-1-TR1-COM04-46419 Adnan

Detaylı

ANABİLİM EĞİTİM KURUMLARI 2013-2014 EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI VELİ-ÖĞRETMEN GÖRÜŞME GÜNLERİ VE SAATLERİ

ANABİLİM EĞİTİM KURUMLARI 2013-2014 EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI VELİ-ÖĞRETMEN GÖRÜŞME GÜNLERİ VE SAATLERİ SINIF ÖĞRETMENLERİ YÖNETİM / KOORDİNATÖR / REHBER ANABİLİM EĞİTİM KURUMLARI 2013-2014 EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI Nazmi ERCAN Lise Müdür Yardımcısı Tüzün ULUKAN Ortaokul Müdür Yardımcısı 7-8 Gürkan PİŞKİN Ortaokul

Detaylı

EMLAK KONUT GAYRİMENKUL YATIRIM ORTAKLIĞI A.Ş. EMLAK KONUT ISPARTAKULE EVLERİ YEDEK LİSTESİ

EMLAK KONUT GAYRİMENKUL YATIRIM ORTAKLIĞI A.Ş. EMLAK KONUT ISPARTAKULE EVLERİ YEDEK LİSTESİ EMLAK KONUT GAYRİMENKUL YATIRIM ORTAKLIĞI A.Ş. EMLAK KONUT ISPARTAKULE EVLERİ YEDEK LİSTESİ BASVURU GRUBU SOY ÖZEL DURUM 1+1 *******6134 NEVRUZ PARLAZ 1 ÖZEL DURUM 1+1 *******7022 HÜSNÜ SAVAŞ 2 ÖZEL DURUM

Detaylı

DERSHANE EĞİTİM BİLİMLERİ NET LİSTESİ

DERSHANE EĞİTİM BİLİMLERİ NET LİSTESİ 1 0 HASAN YAĞCI 30 0 30,00 29 1 28,75 26 1 25,75 17 1 16,75 15 0 15,00 16 0 16,00 4 0 4,00 4 0 4,00 4 0 4,00 12 0 12,00 15 1 14,75 11 1 10,75 12 0 12,00 2 0 AHMET ARMAĞAN 24 6 22,50 23 4 22,00 20 5 18,75

Detaylı

Sıra Fakülte No Adı ve Soyadı Ek Sınava Gireceği Ders

Sıra Fakülte No Adı ve Soyadı Ek Sınava Gireceği Ders Sıra Fakülte No Adı ve Soyadı Ek Sınava Gireceği Ders No 1 061308889 Emrah ÇORAK PFS 1104 Eğitim Tarihi 2 0613082322 Pınar ÇELİK PFS1006 Rehberlik PFS1015 Öğretim İlke ve Yöntemleri 3 0613082568 Ahmet

Detaylı

ALES PUAN KADRO ÜNVANI KAD. DER. 1 Gökhan ÖZBİÇİCİ Yabancı Diller Yüksekokulu Okutman 5 87,82383 93,75 52,694298 37,5 90,194298

ALES PUAN KADRO ÜNVANI KAD. DER. 1 Gökhan ÖZBİÇİCİ Yabancı Diller Yüksekokulu Okutman 5 87,82383 93,75 52,694298 37,5 90,194298 Sr. Sr. BAġVURANIN ADI SOYADI MEHMET AKİF ERSOY ÜNİVERSİTESİNİN 02-16 EYLÜL 2013 TARİHLERİ ARASINDA YAYIMLANAN AKADEMİK KADRO İLANI YABANCI DİLLER YÜKSEKOKULU OKUTMAN (9611) İLANI ÖN DEĞERLENDİRME SONUCU

Detaylı

Kimya Mühendisliği Bölümü D1 No.lu Sınıf

Kimya Mühendisliği Bölümü D1 No.lu Sınıf MÜHENDİSLİK VE FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ANABİLİM DALLARININ ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ KADROLARINA BAŞVURAN ADAYLAR ARASINDAN YAPILAN ÖN DEĞERLENDİRME SONUCUNDA YAZILI GİRİŞ SINAVINA ALINMAYA HAK KAZANANLARIN

Detaylı

Karar 1- Biyoloji bölümü öğrencisi 081210001 Naile SELİM in transkripti incelendi. İngilizce hazırlık sınıfı okuyarak başarılı olan öğrencimizin,

Karar 1- Biyoloji bölümü öğrencisi 081210001 Naile SELİM in transkripti incelendi. İngilizce hazırlık sınıfı okuyarak başarılı olan öğrencimizin, Karar 1- Biyoloji bölümü öğrencisi 081210001 Naile SELİM in transkripti incelendi. İngilizce hazırlık sınıfı okuyarak başarılı olan öğrencimizin, 2013-2014 ders planlarına uygun olarak ders kaydını yapmasının

Detaylı

SIRA NO PROJE NO AD SOYAD İKAMET İLİ ÜNİVERSİTE BÖLÜM

SIRA NO PROJE NO AD SOYAD İKAMET İLİ ÜNİVERSİTE BÖLÜM 1 2013-1-TR1-COM04-47097 Adem TOPRAK ZONGULDAK Anadolu Üniversitesi İngilizce Öğretmenliği 2 2013-1-TR1-COM04-46886 Adem CELEP MANİSA Anadolu Üniversitesi Almanca Öğretmenliği 3 2013-1-TR1-COM04-46419

Detaylı

EĞİTİM BİLİMLERİ ENSİTİTÜSÜ 2014-2015 BAHAR YARIYILI LİSANSÜSTÜ BAŞVURU SONUÇLARI

EĞİTİM BİLİMLERİ ENSİTİTÜSÜ 2014-2015 BAHAR YARIYILI LİSANSÜSTÜ BAŞVURU SONUÇLARI EĞİTİM BİLİMLERİ ENSİTİTÜSÜ 2014-2015 BAHAR YARIYILI LİSANSÜSTÜ BAŞVURU SONUÇLARI AFET EĞİTİMİ VE YÖNETİMİ (TEZLİ YÜKSEK LİSANS) 1 JALE YAZGAN BAŞARILI HAYIR 2 X FIRAT ORUÇ BAŞARILI EVET 3 X BÜLENT KAYA

Detaylı

T.C. ANKARA BATI ADLİ YARGI İLK DERECE MAHKEMESİ ADALET KOMİSYONU BAŞKANLIĞI

T.C. ANKARA BATI ADLİ YARGI İLK DERECE MAHKEMESİ ADALET KOMİSYONU BAŞKANLIĞI T.C. ANKARA BATI ADLİ YARGI İLK DERECE MAHKEMESİ ADALET KOMİSYONU BAŞKANLIĞI 2015 Yılı Yazı İşleri Müdürlüğü Görevde Yükselme Sınavı Başvuru Değerlendirme Formu Sıra No Adı Soyadı Sicili Görev Yeri Eğitim

Detaylı

KONGRE BAŞKANI DÜZENLEME KURULU

KONGRE BAŞKANI DÜZENLEME KURULU KONGRE BAŞKANI Prof. Dr. Sebahattin ÖZCAN Ankara Üniversitesi DÜZENLEME KURULU Prof. Dr. Mehmet KARATAŞ Düzenleme Kurulu Başkanı Prof. Dr. Dilek TURGUT BALIK Düzenleme Kurulu Başkan Yardımcısı Doç. Dr.

Detaylı

ÖZGEÇMİŞ. Dr. Murat BİNGÜL

ÖZGEÇMİŞ. Dr. Murat BİNGÜL ÖZGEÇMİŞ Dr. Murat BİNGÜL Kisisel Bilgiler: Doğum Yeri ve Tarihi: Kocaeli 25 Ocak 1983. Medeni Hali: Evli Adres: Yeniköy Merkez Mah. Komutan Sok. No: 19 Güvenliköy Konutları C-1 Başiskele Kocaeli E-mail:

Detaylı

TÜRKIYE ÜNIVERSITELER ATICILIK SAMPIYONASI 17-20 MART 2011 / KARA HARP OKULU

TÜRKIYE ÜNIVERSITELER ATICILIK SAMPIYONASI 17-20 MART 2011 / KARA HARP OKULU TÜRKIYE ÜNIVERSITELER ATICILIK SAMPIYONASI 17-20 MART 2011 / KARA HARP OKULU ERKEKLER TABANCA YARISMASI 5 6 3 Abdulkadir TEMURTAS 2 94 98 94 95 94 96 571 15* 2 Furkan DÜZEN 1 93 92 93 96 93 93 560 10*

Detaylı

EK 1 MSGSÜ ADEK ÇALIŞMA GRUPLARI

EK 1 MSGSÜ ADEK ÇALIŞMA GRUPLARI EK 1 MSGSÜ ADEK ÇALIŞMA GRUPLARI Mimar Sinan Güzel Sanatlar Üniversitesi Stratejik Planı hazırlıkları üniversitemiz Akademik Değerlendirme ve Kalite Geliştirme Çalışma gruplarının hazırlamış olduğu öz

Detaylı

2012 / 2013 ÜNİVERSİTELERİ KAZANAN ÖĞRENCİLERİMİZ

2012 / 2013 ÜNİVERSİTELERİ KAZANAN ÖĞRENCİLERİMİZ 2012 / 2013 ÜNİVERSİTELERİ KAZANAN ÖĞRENCİLERİMİZ MİMAR SİNAN ÜNİVERSİTESİ LAÇİN BERKE ERDAY-İÇMİMARLIK M.NESEİ SERTAY-ÇMİMARLIK MİTHATCAN HALICI-SERAMİK BARIŞ ÇİFTÇİ-SERAMİK NESLİHAN BALAMTEKİN-SERAMİK

Detaylı

ÖZGEÇMİŞ. Adresi : Dumlupınar Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Kimya Bölümü

ÖZGEÇMİŞ. Adresi : Dumlupınar Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Kimya Bölümü ÖZGEÇMİŞ Adı Soyadı : Halil İLKİMEN Doğum Tarihi : 13 Ekim 1982 Doğum Yeri : Tavas/DENİZLİ Adresi : Dumlupınar Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Kimya Bölümü Unvan : Araştırma Görevlisi Doktor Öğrenim

Detaylı

ODTÜ Biyoteknoloji 25.yıl Etkinliği 14 Kasım 2014

ODTÜ Biyoteknoloji 25.yıl Etkinliği 14 Kasım 2014 ETKİNLİĞİMİZE HOŞGELDİNİZ... Etkinlik Amacımız EABD mizin biyoteknoloji araştırmalarına yaptığı katkıları gözler önüne sermek Bundan sonra yapılacak çalışmalara yön vererek ivme kazandırmak Mezunlarımızın

Detaylı

T.C. GALATASARAY ÜNİVERSİTESİ SOSYAL BİLİMLER ENSTİTÜSÜ 2014-2015 EĞİTİM ÖĞRETİM YILI GÜZ YARIYILI LİSANSÜSTÜ EĞİTİM GİRİŞ SINAVI SONUÇLARI

T.C. GALATASARAY ÜNİVERSİTESİ SOSYAL BİLİMLER ENSTİTÜSÜ 2014-2015 EĞİTİM ÖĞRETİM YILI GÜZ YARIYILI LİSANSÜSTÜ EĞİTİM GİRİŞ SINAVI SONUÇLARI T.C. GALATASARAY ÜNİVERSİTESİ SOSYAL BİLİMLER ENSTİTÜSÜ 2014-2015 EĞİTİM ÖĞRETİM YILI GÜZ YARIYILI LİSANSÜSTÜ EĞİTİM GİRİŞ SINAVI SONUÇLARI PROGRAMIN ADI : İŞLETME TEZSİZ YÜKSEK LİSANS KONTENJAN 30 / ASGARİ

Detaylı

2011-2012 ÖĞRETĐM YILI YATAY GEÇĐŞ SONUÇLARI

2011-2012 ÖĞRETĐM YILI YATAY GEÇĐŞ SONUÇLARI 2011-2012 ÖĞRETĐM YATAY GEÇĐŞ LARI Yükseköğretim Kurumlarında Önlisans ve Lisans Düzeyindeki Programlar Arasında Geçiş, Çift Anadal, Yan Dal ile Kurumlar Arası Kredi Transferi Yapılması Esaslarına Đlişkin

Detaylı

UZMAN TOLGA BAAHDIR ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

UZMAN TOLGA BAAHDIR ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ UZMAN TOLGA BAAHDIR ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ Doğum Tarihi : 15 Şubat 1979 İletişim Bilgileri: İş Adresi : Aksaray Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Çevre Mühendisliği Bölümü 68100 AKSARAY Cep Telefonu

Detaylı

2005 OKS de ORTAÖĞRETİM KURUMLARINA KAYIT HAKKI KAZANAN ÖĞRENCİLERİMİZ VE KAZANDIKLARI OKULLAR

2005 OKS de ORTAÖĞRETİM KURUMLARINA KAYIT HAKKI KAZANAN ÖĞRENCİLERİMİZ VE KAZANDIKLARI OKULLAR 2005 OKS de ORTAÖĞRETİM KURUMLARINA KAYIT HAKKI KAZANAN ÖĞRENCİLERİMİZ VE KAZANDIKLARI OKULLAR TAYLAN ÖZONUK ELİF TUĞÇE ÜNALAN KORER ÖZDERVİŞOĞLU NAZ SÜRÜCÜ ÖZGÜR YAĞBASAN ELİF ŞAHSUVAROĞLU ÖZLEM AYDOĞAN

Detaylı

T.C. DÜZCE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI

T.C. DÜZCE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI TOPLANTI TARİHİ : 09.11.2015 TOPLANTI SAYISI : 2015/ 31 KARAR NO: 2015 / 970 T.C. DÜZCE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI Enstitümüz Makine Mühendisliği Anabilim Dalı Doktora

Detaylı

İstanbul Gelişim Üniversitesi İstanbul Gelişim Meslek Yüksekokulu Öğretim Görevlisi Başvuruları Ön Değerlendirme Sonuçları

İstanbul Gelişim Üniversitesi İstanbul Gelişim Meslek Yüksekokulu Öğretim Görevlisi Başvuruları Ön Değerlendirme Sonuçları İstanbul Gelişim Üniversitesi İstanbul Gelişim Meslek Yüksekokulu Öğretim Görevlisi Başvuruları Ön Değerlendirme Sonuçları NOT: Öğretim Üyesi Dışındaki Öğretim Elemanı Kadrolarına Naklen Veya Açıktan Yapılacak

Detaylı

BES 451-01 Onkoloji EAH Cansu Dölek Sema Akyüz Hatice Kanıbir Merve Merter Merve İnel Öznur Aydın Tuğba Ekici Huriye Saygılı BES 451-01 Atatürk EAH

BES 451-01 Onkoloji EAH Cansu Dölek Sema Akyüz Hatice Kanıbir Merve Merter Merve İnel Öznur Aydın Tuğba Ekici Huriye Saygılı BES 451-01 Atatürk EAH BES 451 H.Ü. DIŞI HASTANE VE KURUM STAJI - GÜZ DÖNEMİ - BAHAR DÖNEMİ 14 EYLÜL 05 KASIM 08 ŞUBAT- 24 MART 2. GRUP 1. GRUP 4. GRUP 3. GRUP Onkoloji EAH Onkoloji EAH Onkoloji EAH Onkoloji EAH Cansu Dölek

Detaylı

PFESP MEZUN ÖĞRENCİLER ÖN KAYIT LİSTESİ KAYIT NO ADI SOYADI BÖLÜM/ANABİLİM DALI GANO ÖSYM PUANI 195 EMRE KARABIYIK ANTRENÖRLÜK 2,49 237,894 127 KEMAL

PFESP MEZUN ÖĞRENCİLER ÖN KAYIT LİSTESİ KAYIT NO ADI SOYADI BÖLÜM/ANABİLİM DALI GANO ÖSYM PUANI 195 EMRE KARABIYIK ANTRENÖRLÜK 2,49 237,894 127 KEMAL PFESP MEZUN ÖĞRENCİLER ÖN KAYIT LİSTESİ KAYIT NO ADI SOYADI BÖLÜM/ANABİLİM DALI GANO ÖSYM PUANI 195 EMRE KARABIYIK ANTRENÖRLÜK 2,49 237,894 127 KEMAL SEYHAN KARAKAŞ ANTRENÖRLÜK 2,4 201,314 128 RAMİZ ZEVKER

Detaylı

KOMİTE ÜYELERİ İSİM LİSTESİ BEYİN ÖLÜMÜ TESPİT KURULU KOMİTESİ. Anestezi Uzmanı BİLGİ YÖNETİMİ KOMİTESİ BİLGİ GÜVENLİĞİ SORUMLU EKİBİ EĞİTİM KOMİTESİ

KOMİTE ÜYELERİ İSİM LİSTESİ BEYİN ÖLÜMÜ TESPİT KURULU KOMİTESİ. Anestezi Uzmanı BİLGİ YÖNETİMİ KOMİTESİ BİLGİ GÜVENLİĞİ SORUMLU EKİBİ EĞİTİM KOMİTESİ KOMİTE ÜYELERİ İSİM LİSTESİ BEYİN ÖLÜMÜ TESPİT KURULU KOMİTESİ Başkan Dr. Enis GÜMÜŞTEKİN Organ ve Doku Nakli Koordinatörü Dr. Mustafa ŞİMŞEK Anestezi Uzmanı Sekreterya Meltem YILDIZ Organ ve Doku Nakli

Detaylı

ÖZLEM DİLEK, Ph.D. 2009 Cornell Üniversitesi, Kimya ve Kimyasal Biyoloji Bölümü, Ithaca, NY ABD Doktora-üstü araştırmacı- Kimyasal Biyoloji

ÖZLEM DİLEK, Ph.D. 2009 Cornell Üniversitesi, Kimya ve Kimyasal Biyoloji Bölümü, Ithaca, NY ABD Doktora-üstü araştırmacı- Kimyasal Biyoloji ÖZLEM DİLEK, Ph.D. Istanbul Kemerburgaz Universitesi, Tıp Fakültesi, Mahmutbey Dilmenler Cad. No: 26, Bağcılar, İstanbul 34217 E-mail: ozlem.dilek@kemerburgaz.edu.tr EĞİTİM ve ÖĞRETİM Kasım 2009-2012 Kuzey

Detaylı

İZMİR FEN LİSESİ 2006-2007 EĞİTİM ÖĞRETİM YILI ÖSS SONUÇLARI

İZMİR FEN LİSESİ 2006-2007 EĞİTİM ÖĞRETİM YILI ÖSS SONUÇLARI İZMİR FEN LİSESİ 2006-2007 EĞİTİM ÖĞRETİM YILI ÖSS SONUÇLARI sıra şube AD- SOYAD: ÜNİVERSİTE: BÖLÜM: no: adı: 1 11A ALİ İBRAHİM BOSTANCIOĞLU ODTÜ ELEKTRİK- ELEKTRONİK MÜHENDİSLİĞİ 2 11A KENAN BARIŞ BİNGÜL

Detaylı

T.C. İSTANBUL AYDIN ÜNİVERSİTESİ 13.07.2015 TARİHİNDE YAYIMLANAN ÖĞRETİM ELEMANI İLANI ÖN DEĞERLENDİRME SONUÇLARI

T.C. İSTANBUL AYDIN ÜNİVERSİTESİ 13.07.2015 TARİHİNDE YAYIMLANAN ÖĞRETİM ELEMANI İLANI ÖN DEĞERLENDİRME SONUÇLARI 3.07.008 tarihli ve 6953 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan Öğretim Üyesi Dışındaki Öğretim Elemanı SINAV TARİHİ : 0.08.05 SALI Saat :0:00 SINAV YERİ : - FLORYA YERLEŞKESİ - B BLOK NO: 60-603 ADAYLARIN SINAV

Detaylı

2012-2013 EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI BAHAR YARIYILI ANESTEZİ VE REANİMASYON DERSİ SINIF LİSTESİ 2 1101020023 KAAN ERTUĞRUL DEVAM ETMEYECEK

2012-2013 EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI BAHAR YARIYILI ANESTEZİ VE REANİMASYON DERSİ SINIF LİSTESİ 2 1101020023 KAAN ERTUĞRUL DEVAM ETMEYECEK 2012-2013 EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI BAHAR YARIYILI ANESTEZİ VE REANİMASYON DERSİ SINIF LİSTESİ Sıra No Fakülte No Adı-Soyadı Devam Durumu 1 1101000154 UTKU ŞAHİN DEVAM EDECEK 2 1101020023 KAAN ERTUĞRUL DEVAM

Detaylı

İSTANBUL AYDIN ÜNİVERSİTESİ

İSTANBUL AYDIN ÜNİVERSİTESİ SINAV ALANI İL İLÇE SINIF YE GÖRE LI LİSTE SAYFA LAMA ALANI SINAV TARİHİ 01.07.2014 RAPOR TÜRÜ Ders Grup 1 TC KİMLİK ADI SOYADI DOĞRU YANLIŞ NET SAYISAL SÖZEL EŞİT AĞIRLIK D Y N D Y N 1 57730254654 106-Kayıtlı

Detaylı

TÜRK ELEKTRON MİKROSKOPİ DERNEĞİ 2012-2014 DÖNEMİ ETKİNLİKLERİ

TÜRK ELEKTRON MİKROSKOPİ DERNEĞİ 2012-2014 DÖNEMİ ETKİNLİKLERİ TÜRK ELEKTRON MİKROSKOPİ DERNEĞİ 2012-2014 DÖNEMİ ETKİNLİKLERİ Prof. Dr.Yurdagül CANBERK ONURSAL BAŞKAN Prof. Dr. Selma YILMAZER BAŞKAN Prof. Dr. Serap ARBAK İKİNCİ BAŞKAN Prof. Dr. Melek ÖZTÜRK SEZGİN

Detaylı

2014 ŞEYDA ÖZMEN 107650045 MUĞLA SITKI KOÇMAN ÜNİVERSİTESİ/Muğla Meslek Yüksekokulu/Çocuk Gelişimi

2014 ŞEYDA ÖZMEN 107650045 MUĞLA SITKI KOÇMAN ÜNİVERSİTESİ/Muğla Meslek Yüksekokulu/Çocuk Gelişimi Yıl Adı Soyadı Program Kodu 2014 ŞEYDA ÖZMEN 107650045 MUĞLA SITKI KOÇMAN ÜNİVERSİTESİ/Muğla Meslek Yüksekokulu/Çocuk Gelişimi 2014 KÜBRA SELCAN DEMİRBAŞ 103350396 DÜZCE ÜNİVERSİTESİ/Akçakoca Meslek Yüksekokulu/İşletme

Detaylı

ERART Güzel Sanatlar Eğitim Merkezi 2005 YILI ÜNİVERSİTEYİ KAZANAN ÖĞRENCİLER. Ad-Soyad: Esra Boz Kazandığı Bölüm: 18 Mart Üniversitesi G.T.E.S 4.

ERART Güzel Sanatlar Eğitim Merkezi 2005 YILI ÜNİVERSİTEYİ KAZANAN ÖĞRENCİLER. Ad-Soyad: Esra Boz Kazandığı Bölüm: 18 Mart Üniversitesi G.T.E.S 4. ERART Güzel Sanatlar Eğitim Merkezi 2005 YILI ÜNİVERSİTEYİ KAZANAN ÖĞRENCİLER Bahar Kurt Anadolu Üniversitesi Seramik Esra Kara Maltepe Üniversitesi İçmimarlık Burslu Burcu Kucaloğlu Kocaeli Üniversitesi

Detaylı

ERART Güzel Sanatlar Eğitim Merkezi 1997 YILI ÜNİVERSİTEYİ KAZANAN ÖĞRENCİLER

ERART Güzel Sanatlar Eğitim Merkezi 1997 YILI ÜNİVERSİTEYİ KAZANAN ÖĞRENCİLER ERART Güzel Sanatlar Eğitim Merkezi 1997 YILI ÜNİVERSİTEYİ KAZANAN ÖĞRENCİLER Nejat Semerci Anadolu Üniversitesi Resim Nejat Semerci Tansel Diplikaya Anadolu Üniversitesi Çizgi Film Satı Gamze Erdoğan

Detaylı

T.C. DÜZCE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI

T.C. DÜZCE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI TOPLANTI TARİHİ : 25.05.2015 TOPLANTI SAYISI : 2015/ 16 KARAR NO: 2015 / 486 T.C. DÜZCE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI Enstitümüz Makine Mühendisliği Anabilim Doktora Programı

Detaylı

İstanbul Gelişim Üniversitesi İstanbul Gelişim Meslek Yüksekokulu Öğretim Görevlisi Başvuruları Ön Değerlendirme Sonuçları

İstanbul Gelişim Üniversitesi İstanbul Gelişim Meslek Yüksekokulu Öğretim Görevlisi Başvuruları Ön Değerlendirme Sonuçları İstanbul Gelişim Üniversitesi İstanbul Gelişim Meslek Yüksekokulu Öğretim Görevlisi Başvuruları Ön Değerlendirme Sonuçları NOT: Öğretim Üyesi Dışındaki Öğretim Elemanı Kadrolarına Naklen Veya Açıktan Yapılacak

Detaylı

Kişisel Bilgiler. Eğitim

Kişisel Bilgiler. Eğitim Dr. Sümeyye AYDOGAN TÜRKOĞLU Balıkesir Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı Balıkesir 10145 Türkiye Fax: +90 266 6121215 Tel: +90 266 6121278\1410 E-mail:

Detaylı

GÜZEL SANATLAR FAKÜLTESİ GÜZEL SANATLAR FAKÜLTESİ GÜZEL SANATLAR GÜZEL SANATLAR

GÜZEL SANATLAR FAKÜLTESİ GÜZEL SANATLAR FAKÜLTESİ GÜZEL SANATLAR GÜZEL SANATLAR Hafta Sonu - 1 ALİYE ERKURTULGU 2 ASLIHAN İKİZ 3 ASRIM AYDIN KEZİBAN UNİVERSİTESİ FAKULTESİ 4 ASUMAN AYDIN AKGÜN FAKUTESİ 5 ATAHAN EKER 6 AYŞE YILDIRIM 7 AYŞE PINAR UÇAK 8 AZİZE SIKDAĞ 9 BEGÜM ÖZBOZDAĞLI

Detaylı

2013-2014 ÖĞRETİM YILI GÜZ YARIYILI %10 LİSTESİ

2013-2014 ÖĞRETİM YILI GÜZ YARIYILI %10 LİSTESİ 2013-2014 ÖĞRETİM YILI GÜZ YARIYILI %10 LİSTESİ İLKÖĞRETİM BÖLÜMÜ /OKUL ÖNCESİ EĞİTİMİ ANABİLİM DALI (İKİNCİ ÖĞRETİM) ÖĞRENCİ NO ADI SOYADI SINIFI ORTALAMA BÖLÜMÜ /ANABİLİM DALI 2013259071 BÜŞRA YAŞDALI

Detaylı

PeopleSoft Report ID: SRCLSRST CLASS ROSTER REPORT Page No. 1 Run Date 02/20/2015 Run Time 09:51:38

PeopleSoft Report ID: SRCLSRST CLASS ROSTER REPORT Page No. 1 Run Date 02/20/2015 Run Time 09:51:38 Report ID: SRCLSRST CLASS ROSTER REPORT Page No. 1 ACWR 101 BASIC ACADEMIC WRITING (Lecture) Class#/Section: 1025 / 1 Instructor: LENKER,LISA MER 0049627 AKCAN,ŞEHNAZ GRD 3.00 Coll of Admin Science and

Detaylı

2015 EYLÜL AYI HEKİM ÇALIŞMA PROGRAMI KLİNİK 1 KLİNİK 2 KLİNİK 3 KLİNİK 4 KLİNİK 5

2015 EYLÜL AYI HEKİM ÇALIŞMA PROGRAMI KLİNİK 1 KLİNİK 2 KLİNİK 3 KLİNİK 4 KLİNİK 5 20 EYLÜL AYI HEKİM ÇALIŞMA PROGRAMI KLİNİK KLİNİK 2 KLİNİK 3 KLİNİK 4 KLİNİK 5 GÜRCAN TOPUZ ÇİĞDEM DİLAVER FATMA ÇALIK HANDAN KOCALAR ARZU ARMAĞANCI (PROTEZ) RUKİYE UĞURLU ERTUĞRUL ÖZGÜR ÖZTÜRK (PROTEZ)

Detaylı

DUYURU ADAYLARIN DİKKATİNE

DUYURU ADAYLARIN DİKKATİNE DUYURU Kurumumuz Merkez teşkilatında münhal bulunan 25 TÜİK Uzman Yardımcılığı sözlü sınavına katılacak adayların sözlü sınavı 10-11-12-13/09/2013 tarihinde yapılacaktır. Sınav yeri, sınav saati ve adayların

Detaylı

T.C. İSTANBUL AYDIN ÜNİVERSİTESİ 13.07.2015 TARİHİNDE YAYIMLANAN ÖĞRETİM ELEMANI İLANI ÖN DEĞERLENDİRME SONUÇLARI

T.C. İSTANBUL AYDIN ÜNİVERSİTESİ 13.07.2015 TARİHİNDE YAYIMLANAN ÖĞRETİM ELEMANI İLANI ÖN DEĞERLENDİRME SONUÇLARI SINAV TARİHİ : 04.08.2015 SALI Saat :10:00 T.C. İSTANBUL AYDIN ÜNİVERSİTESİ 13.07.2015 TARİHİNDE YAYIMLANAN ÖĞRETİM ELEMANI İLANI ÖN DEĞERLENDİRME SONUÇLARI 31.07.2008 tarihli ve 26953 sayılı Resmi Gazetede

Detaylı

İKTİSAT (EKONOMİ) ÖĞRETİMİ ÇALIŞTAYI

İKTİSAT (EKONOMİ) ÖĞRETİMİ ÇALIŞTAYI İKTİSAT (EKONOMİ) ÖĞRETİMİ ÇALIŞTAYI YAŞAR ÜNİVERSİTESİ İKTİSADİ ve İDARİ BİLİMLER FAKÜLTESİ EKONOMİ BÖLÜMÜ 27-29 Mart 2015 Düzenleme Komitesi: Prof. Dr. N. Oğuzhan Altay Doç. Dr. Umut Halaç Arş. Gör.

Detaylı

T.C. KARADENİZ TEKNİK ÜNİVERSİTESİ EĞİTİM BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ENSTİTÜ YÖNETİM KURULU TOPLANTI TUTANAĞI

T.C. KARADENİZ TEKNİK ÜNİVERSİTESİ EĞİTİM BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ENSTİTÜ YÖNETİM KURULU TOPLANTI TUTANAĞI TARİH: 21.02.2012 SAYI : 56 KATILANLAR T.C. KARADENİZ TEKNİK ÜNİVERSİTESİ EĞİTİM BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ENSTİTÜ YÖNETİM KURULU TOPLANTI TUTANAĞI Doç. Dr. Bülent GÜVEN Yrd. Doç. Dr. Mehmet PALANCI Doç. Dr.

Detaylı

ÖLÇME SEÇME VE YERLEŞTİRME MERKEZİ BAŞKANLIĞI ÖSYM UZMAN YARDIMCISI SÖZLÜ SINAV TARİHLERİ VE SAATLERİ

ÖLÇME SEÇME VE YERLEŞTİRME MERKEZİ BAŞKANLIĞI ÖSYM UZMAN YARDIMCISI SÖZLÜ SINAV TARİHLERİ VE SAATLERİ ÖLÇME SEÇME VE YERLEŞTİRME MERKEZİ BAŞKANLIĞI ÖSYM UZMAN YARDIMCISI SÖZLÜ SINAV TARİHLERİ VE SAATLERİ Ad Soyadı Alanı Sözlü Sınav Tarihi Sözlü Sınav Saati AYŞENUR DERELİOĞLU Almanca 14.02.2013 Perşembe

Detaylı

İSTANBUL ÜNİVERSİTESİ ENDÜSTRİ MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ

İSTANBUL ÜNİVERSİTESİ ENDÜSTRİ MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ İSTANBUL ÜNİVERSİTESİ ENDÜSTRİ MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ Prof. Dr. Erhan ÖZDEMİR ve Prof. Dr. Güneş GENÇYILMAZ ın kuruculuğunda 1989-1990 döneminde eğitim öğretim faaliyetlerine başlayan İstanbul Üniversitesi

Detaylı

2014-2015 EĞİTİM ÖĞRT.YILI VELİ ÖĞRETMEN GÖRÜŞME GÜN VE SAATLERİ

2014-2015 EĞİTİM ÖĞRT.YILI VELİ ÖĞRETMEN GÖRÜŞME GÜN VE SAATLERİ Öğrenci, öğretmen ve veliyi okul sisteminin birer parçası gibi düşünüyor ve tüm çalışmalarımızı bu yönde planlıyoruz. Bu nedenle yıl boyunca sizlerin desteği ve işbirliği bizim için çok önemli. Bu işbirliğini

Detaylı

30 MAYIS 2015 CUMARTESİ GÜNÜ ANKARA'DA

30 MAYIS 2015 CUMARTESİ GÜNÜ ANKARA'DA 30 MAYIS 2015 CUMARTESİ GÜNÜ ANKARA'DA YAPILAN ENFORMASYON MEMURLUĞU VE ENFORMASYON MEMURLUĞU YABANCI DİL SINAV SONUÇLARI AŞAĞIDA YER ALMAKTADIR. SINAVDA BAŞARI BELGESİ ALMAYA HAK KAZANANLAR BELGELERİNİ

Detaylı

Yüzey Suları Çalışma Grubu

Yüzey Suları Çalışma Grubu Yüzey Suları TÜRKİYE ULUSAL HİDROLOJİ KOMİSYONU TUHK BAŞKANI: Dr. BÜLENT SELEK ÜNİVERSİTELER TEMSİLCİSİ: Prof. Dr. HAFZULLAH AKSOY TÜBİTAK TEMSİLCİSİ: Dr. SELMA AYAZ TUHK SEKRETERİ: Dr. HAKAN AKSU Çalışma

Detaylı

2013-2014 EĞİTİM / ÖĞRETİM YILINDA İŞLETME BÖLÜMÜ YATAY GEÇİŞ BAŞVURULARI KAZANAN ÖĞRENCİ İSİM LİSTESİ

2013-2014 EĞİTİM / ÖĞRETİM YILINDA İŞLETME BÖLÜMÜ YATAY GEÇİŞ BAŞVURULARI KAZANAN ÖĞRENCİ İSİM LİSTESİ 2013-2014 EĞİTİM / ÖĞRETİM YILINDA İŞLETME BÖLÜMÜ YATAY GEÇİŞ BAŞVURULARI KAZANAN ÖĞRENCİ İSİM LİSTESİ 1 BETÜL AYAZ AKDENİZ ÜNİ. 3,72 353,788 2 KÜBRA AYDIN MALTEPE ÜNİ. 3,57 266,207 3 AHSEN KOCAMAN MEHMET

Detaylı

MEMUR KADROSU İÇİN GÖREVDE YÜKSELME SINAVINA GİRMEYE HAK KAZANANLARA İLİŞKİN KESİNLEŞEN ADAY LİSTESİ

MEMUR KADROSU İÇİN GÖREVDE YÜKSELME SINAVINA GİRMEYE HAK KAZANANLARA İLİŞKİN KESİNLEŞEN ADAY LİSTESİ 1 Özay DAL 2 Ayşe Nevbu ÇETİNKAYA ŞEKERCİOĞLU 3 Turgay TURANLIOĞLU 4 Bülent KOTLUK 5 Halil SARPKAYA 6 Canan UZUN 7 Fatma ÇAKMAK ÜNLÜ 8 Cafer KURT 9 Nusret ERSÖZ 10 Hakan BARAN 11 Mehmet DOĞAN 12 Naime

Detaylı

ODTÜ Biyoteknoloji 25. Yıl Etkinliği

ODTÜ Biyoteknoloji 25. Yıl Etkinliği TAMAY ŞEKER, PhD ODTÜ MERKEZ LABORATUVARI MOLEKÜLER BİYOLOJİ-BİYOTEKNOLOJİ AR-GE MERKEZİ (ODTÜ BİYOTEKNOLOJİ EABD- 2002) 14.11.2014 Lisans: 1990 Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Gıda Bilimi

Detaylı

Özel Medicana International İstanbul Hastanesi

Özel Medicana International İstanbul Hastanesi Özel Medicana International İstanbul Hastanesi TESİS GÜVENLİĞİ KOMİTESİ DR. YUSUF SAHİP GENEL MÜDÜR SELMA KAYABAŞ GENEL MÜDÜR YRD. ALİ EMRE KODAN GENEL MÜDÜR YRD. DR. RÜYA ŞİŞMAN BAŞHEKİM / KALİTE DİREKTÖRÜ

Detaylı

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ Adı Soyadı : Reşit YILDIZ Doğum Yeri ve Yılı : Kilis/Merkez, 20.12.1980 Çalıştığı Kurum : Mardin Artuklu Üniversitesi Ünvanı : Yardımcı Doçent Dr. e-mail Adresi : ryildiz80@gmail.com

Detaylı

T.C. Sağlık Bakanlığı GAZİANTEP ŞEHİTKAMİL DEVLET HASTANESİ Uzman Doktor Listesi

T.C. Sağlık Bakanlığı GAZİANTEP ŞEHİTKAMİL DEVLET HASTANESİ Uzman Doktor Listesi T.C. Sağlık Bakanlığı GAZİANTEP ŞEHİTKAMİL DEVLET HASTANESİ Uzman Doktor Listesi Sira No Personel Fotoğrafı Adı Soyadı Unvanı 1 ABDURRAHMAN ÖZDEMİR BEYİN CER.UZM. 2 AHMET ALPER İNAL 3 AHMET EKİNCİ ORTOPEDİ

Detaylı

Yrd. Doç. Dr. Kozet YAPSAKLI

Yrd. Doç. Dr. Kozet YAPSAKLI Yrd. Doç. Dr. Kozet YAPSAKLI Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Çevre Mühendisliği Bölümü, 34722, Göztepe, İstanbul, Türkiye. Telefon : +90 216 348 0292- dahili 290 Faks : +90 216 348 1369 e-mail

Detaylı

TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ ANABİLİM DALI YÜKSEK LİSANS PROGRAMI

TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ ANABİLİM DALI YÜKSEK LİSANS PROGRAMI TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ ANABİLİM DALI YÜKSEK LİSANS PROGRAMI ZORUNLU DERSLER: KOD DERSİN ADI DERSİ VEREN ÖĞRETİM T U K E ÜYESİ FBE Uzmanlık Alan Dersi Anabilim Dalı Öğretim Üyeleri 8 0 8 30 FBE Seminer

Detaylı

DR. BİNNAZ EGE DR. RIDVAN EGE ANADOLU LİSESİ 2013 YILI ÜNİVERSİTE YERLEŞTİRME SONUÇLARI ADI - SOYADI KAZANDIĞI ÜNİVERSİTE KAZANDIĞI BÖLÜM

DR. BİNNAZ EGE DR. RIDVAN EGE ANADOLU LİSESİ 2013 YILI ÜNİVERSİTE YERLEŞTİRME SONUÇLARI ADI - SOYADI KAZANDIĞI ÜNİVERSİTE KAZANDIĞI BÖLÜM SIRA NO 1 2 3 ADI - SOYADI KAZANDIĞI ÜNİVERSİTE KAZANDIĞI BÖLÜM ONUR ASLAN ALİ RIZA AKGÜN SILA DENİZ ÇALIŞGAN 4 İSMAİL TAYLAN YEŞİLYURT 5 HASAN FURKAN TUNÇAY 6 SABRİ FURKAN YILMAZ 7 MERT DEMİREL 8 9 ÜLKER

Detaylı

3682715757-4377 ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ FEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ/FİZİK BÖLÜMÜ/KATIHAL FİZİĞİ ANABİLİM DALI

3682715757-4377 ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ FEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ/FİZİK BÖLÜMÜ/KATIHAL FİZİĞİ ANABİLİM DALI ZARİFE SİBEL ŞAHİN YARDIMCI DOÇENT E-Posta Adresi zarifesibel@sinop.edu.tr Telefon (İş) Telefon (Cep) Faks Adres 3682715757-4377 5464077397 Sinop Üniversitesi, Mühendislik ve Mimarlık Fakültesi, Enerji

Detaylı

T.C. DÜZCE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI

T.C. DÜZCE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI TOPLANTI TARİHİ : 01.06.2015 TOPLANTI SAYISI : 2015/ 17 KARAR NO: 2015 / 509 T.C. DÜZCE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÖNETİM KURULU KARARLARI Enstitümüz Orman Mühendisliği Anabilim Dalı Yüksek

Detaylı

Dr. Ece Ümmü DEVECİ ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ. Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Lisans Çevre Mühendisliği Mersin Üniversitesi 1998 Yüksek Lisans

Dr. Ece Ümmü DEVECİ ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ. Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Lisans Çevre Mühendisliği Mersin Üniversitesi 1998 Yüksek Lisans Dr. Ece Ümmü DEVECİ ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ Mersin de doğdu. Ilkokulumu Çiftlikköy İlköğretim Okulunda, lise öğrenimi Tevfik Sırrı Gür Lisesinde 1994 yılında tamamladı. 1998 yılında Mersin Üniversitesi,

Detaylı

3,25 21,50 492,160 29,6716 Erciyes Üniversitesi 11 Pınar Beyhan 3,92 20,50 476,762 29,1876 Yeditepe Üniversitesi 12 Veysi Kanat

3,25 21,50 492,160 29,6716 Erciyes Üniversitesi 11 Pınar Beyhan 3,92 20,50 476,762 29,1876 Yeditepe Üniversitesi 12 Veysi Kanat Yurtiçi 2.sınıf yatay geçiş sıralaması İSTANBUL ÜNİVERSİTESİ ECZACILIK FAKÜLTESİ 2012-2013 Eğitim ve Öğretim Yılı Yatay Geçiş Sonuçları ASIL 1 İbrahim Sağlam 3,96 26,00 486,441 34,8244 Yeditepe Üniversitesi

Detaylı

2014 2015 AKADEMİK YILI BAHAR DÖNEMİ ERASMUS + PROGRAMI ÖĞRENCİ ÖĞRENİM HAREKETLİLİĞİ VE 2014 2015 AKADEMİK YILI STAJ HAREKETLİLİĞİ SEÇİM SONUÇLARI

2014 2015 AKADEMİK YILI BAHAR DÖNEMİ ERASMUS + PROGRAMI ÖĞRENCİ ÖĞRENİM HAREKETLİLİĞİ VE 2014 2015 AKADEMİK YILI STAJ HAREKETLİLİĞİ SEÇİM SONUÇLARI 2014 2015 AKADEMİK YILI BAHAR DÖNEMİ ERASMUS + PROGRAMI ÖĞRENCİ ÖĞRENİM HAREKETLİLİĞİ VE 2014 2015 AKADEMİK YILI STAJ HAREKETLİLİĞİ SEÇİM SONUÇLARI ÖNEMLİ NOT: ÖĞRENCİLER İÇİN 1 KASIM 2014 TARİHİ SAAT

Detaylı

ÖZGEÇMİŞ. Yüksek Lisans Tez Başlığı ve Tez Danışmanı: 1,3-dipolar cycloaddition reactions of some 3-aryl-phthalazinium-1-olates.

ÖZGEÇMİŞ. Yüksek Lisans Tez Başlığı ve Tez Danışmanı: 1,3-dipolar cycloaddition reactions of some 3-aryl-phthalazinium-1-olates. ÖZGEÇMİŞ Adı Soyadı: Özlem Dilek Ünvan: Yrd. Doç. Dr. Öğrenim Durumu: Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Lisans Kimya Orta Doğu Teknik Üniversitesi 1997 Y. Lisans Organik Kimya Orta Doğu Teknik Üniversitesi

Detaylı

MEMUR KADROSUNDA ARANAN ŞARTLARI TAŞIYANLARA İLİŞKİN ADAY LİSTESİ

MEMUR KADROSUNDA ARANAN ŞARTLARI TAŞIYANLARA İLİŞKİN ADAY LİSTESİ 1 Özay DAL 2 Ayşe Nevbu ÇETİNKAYA ŞEKERCİOĞLU 3 Turgay TURANLIOĞLU 4 Bülent KOTLUK 5 Halil SARPKAYA 6 Canan UZUN 7 Fatma ÇAKMAK ÜNLÜ 8 Cafer KURT 9 Nusret ERSÖZ 10 Hakan BARAN 11 Mehmet DOĞAN 12 Naime

Detaylı

ADI SOYADI FİRMA ADI TARİHİ NO DURSUN KILIÇ DOSYA MASRAFI ZİRAAT BANKASI 25.03.14 330 KABUL S.NO KONUSU SONUÇ

ADI SOYADI FİRMA ADI TARİHİ NO DURSUN KILIÇ DOSYA MASRAFI ZİRAAT BANKASI 25.03.14 330 KABUL S.NO KONUSU SONUÇ T.C. TURHAL KAYMAKAMLIĞINDAN İLAN TURHAL KAYMAKAMLIĞI TÜKETİCİ SORUNLARI HAKEM HEYETİ BAŞKANLIĞI MART 2014 DÖNEMİ İÇERİSİNDE VERİLEN KARARLAR. MÜRACAT EDENİN ŞİKAYET EDİLEN KARAR S.NO KONUSU SONUÇ ADI

Detaylı