Bala GÜR DEDEOĞLU. EGFR Odaklı Meme Kanseri Tedavilerinde mirna Yanıtının Profillenmesi

Transkript

1 Bala GÜR DEDEOĞLU Doğum Tarihi : 14 Şubat 1978 Doğum Yeri : Denizli Adres : Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarları Tandoğan Yerleşkesi (Rektörlük Yanı) Beşevler /ANKARA Telefon : e-posta : gurbala@yahoo.com EĞİTİM Bilkent Universitesi, Doktora ( ) Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü (Not ortalaması: 3.71/4.00) Orta Doğu Teknik Üniversitesi (ODTÜ), Yüksek Lisans ( ) Biyoloji Bölümü (Not ortalaması: 3.10/4.00) Orta Doğu Teknik Üniversitesi (ODTÜ), Lisans ( ) Biyoloji Bölümü BURSLAR UNESCO - L'OREAL Ulusal Genç Bilim Kadınlarına Destek Bursu (2014) Bilkent Universitesi Mühendislik ve Fen Fakültesi Doktora Eğitim Bursu ( ) TÜBİTAK proje bursu ( ) The European Association for Cancer Research (EACR), U.K. EACR19, 2006, Kongre katılım bursu (2006) ARAŞTIRMA PROJELERİ Poli kistik over sendromlu (PKOS) hastaların ve normal kontrollerin granülosa hücrelerinde mikrorna (mirna) ifade profillerinin araştırılması (TUBITAK No: 112S579, Yürütücü) Meme kanserinin histolojik ve patolojik alt tiplerinin meta-analiz yöntemine dayalı mirna imzaları ile sınıflandırılması (TUBITAK No: 112T679, Yürütücü) Tamoxifen ve Trastuzumab a duyarlı meme kanseri hücrelerinde Tamoxifen ve Trastuzumab a cevap veren mirna profillerinin araştırılması (BAP No: 13B , Yürütücü) EGFR Odaklı Meme Kanseri Tedavilerinde mirna Yanıtının Profillenmesi ÖĞRETİM TECRÜBESİ Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü (2012- ) Yaşam Bilimlerinde Biyoinformatik

2 Orta Doğu Teknik Üniversitesi Enformatik Enstitüsü (2010- ) Yarı zamanlı öğretim görevliliği, BIN711 Applications of Bioinformatics in Molecular Biology Bilkent Universitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü ( ) Lisans dersleri öğretim asistanlığı ve laboratuvar asistanlığı: Molecular Biology of the Gene ( ), Microbiology (2002), Molecular Biology of the Cell (2003), Techniques used in Molecular Genetics (2008). Lisans üstü ders asistanlığı: Advanced Molecular Biology ( ), Computational Biology (2006). Stajer ve bitirme projelerinde asistanlık ( ). BECERİLER Yabancı diller: İngilizce (KPDS:89; ÜDS:91.25), Almanca (Temel) Bilgisayar bilgisi: MATLAB, MINITAB (İstatistik programı), MS uygulamaları İŞ TECRÜBESİ Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü (2011- ) Öğretim üyesi (Yrd. Doç. Dr.) Orta Doğu Teknik Üniversitesi Enformatik Enstitüsü (2010- ) Yarı zamanlı öğretim görevliliği, BIN711 Applications of Bioinformatics in Molecular Biology Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü ( ) Doktora sonrası araştırmacı (PostDoc) AG Biyoinformatik ( ) Kurucu ortak, yönetici İntergen Genetik Araştırma ve Tanı Merkezi, ANKARA ( ) Moleküler biyolog KONGRELER VE ÇALIŞTAYLAR 13. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi (2013) Meme kanserinin patolojik alt tiplerinin meta-analiz yöntemine dayalı mirna imzaları ile sınıflandırılması (Poster sunumu) Polikistik over sendromunda kumulus ve granülosa hücrelerinin gen ifade profillerinin belirlenmesi (Poster sunumu) 8th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT 2013) Let-7 cluster as a meta-signature for grade classification in breast cancer (Poster sunumu) The International Congress on Bioinformatics and Biomics (ICBB 2011) Analysis of micrornaome profiles in C. elegans Developmental and Dauer stages by Deep Sequencing (sözlü bildiri) 2

3 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT 2011) Mikrodizi analizi çalıştayı (davetli eğitmen) 5th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT 2010) Biyoinformatik çalıştayı (davetli eğitmen) Summer Computer Simulation Conference (SCSC'09), Istanbul, Türkiye (2009) Biyoinformatik çalıştayı (davetli eğitmen) Ankara Üniversitesi Nanoteknoloji Günleri (2009) Mikrodizi ve mikrodizi analizi (davetli konuşmacı) Bilkent Üniversitesi Nanoteknoloji Günleri (2009) Biyoinformatiğe giriş ve mikrodizi analizi (davetli konuşmacı) EMBO Practical Course on Quantification of Gene Expression by Real-Time qrt-pcr EMBL Heidelberg, (2005) Çalıştaya katılım ve sözlü sunum Analysis of the Genes Induced by Breast Cancer Susceptibility Gene, BRCA1. YAYINLAR Dedeoğlu BG. High-Throughput Approaches for MicroRNA Expression Analysis. Methods Mol Biol. (2014) 1107: doi: / _6. Yashar Esmaeilian, Bala Gur Dedeoglu, Arzu Atalay, Esra Erdemli. Investigation of stem cells in adult and prepubertal mouse ovaries Advances in Bioscience and Biotechnology (2012) 3: Nelisa Lacin, Guldem Utkan, Tulin Kutsal, ErhanPiskin, Bala Gur Dedeoglu, Isık G. Yulug TIMP-2 gene transfer by positively charged PEG-lated monosized polycationic carrier to smooth muscle cells J Nanopart Res (2012) 14:694 Mumcuoglu M, Bagislar S, Yuzugullu H, Alotaibi H, Senturk S, Telkoparan P, Gur-Dedeoglu B, Cingoz B, Bozkurt B, Tazebay UH, Yulug IG, Akcali KC, Ozturk M. The ability to generate senescent progeny as a mechanism underlying breast cancer cell heterogeneity. PLoS One 2010 Jun 24;5(6):e11288 Bala Gur-Dedeoglu, Ozlen Konu, Betul Bozkurt, Gulusan Ergul, Selda Seckin, Isik G Yulug, Identification of suitable endogenous reference genes for gene expression analysis in breast tumor tissues Oncology Research (8): B. Gur-Dedeoglu, O. Konu, S. Kir, A. R. Ozturk, I. G. Yulug. A Resampling Based Meta-Analysis for Detection of Differential Gene Expression in Breast Cancer BMC Cancer Dec 30;8:396. 3

4 I. Yulug, B. Gur-Dedeoglu, Functional Genomics in Translational Cancer Research: Focus on Breast Cancer, Brief Funct Genomic Proteomic Jan;7(1):1-7. Epub 2008 Mar 7. Review. Canbay E, Gur-Dedeoglu B, Bozkurt B. Karabeyoglu M, Unal B, Yildirim O, Cengiz O, Yulug IG Inhibition of focal adhesion kinase with her-2 targeted antibody pertuzumab (Omnitarg (R), 2C4) in breast cancer cells 2008 Gene Therapy and Molecular Biology 12B: Baran Y, Gür B, Kaya P, Ural AU, Avcu F, Gündüz U, Upregulation of multi drug resistance genes in doxorubicin resistant human acute myelogeneous leukemia cells and reversal of the resistance, Hematology 2007 Aug 15;:1 [Epub ahead of print]. Aslihan Petenkaya, Betul Bozkurt, Ozlem Akilli-Ozturk, Hatice Seda Kaya, Bala Gur-Dedeoglu and Isik G. Yulug, Lack of Association between the MDM2-SNP309 Polymorphism and Breast Cancer Risk, Anticancer Research 2006; 26: N. Ozturk, E. Erdal, M. Mumcuoglu, K. C. Akcali, O. Yalcin, S. Senturk, A. Arslan-Ergul, B.Gur, I.G. Yulug, R. Cetin-Atalay, C. Yakicier, T. Yagci, M. Tez, M. Ozturk, Reprogramming of replicative senescence in hepatocellular carcinoma-derived cells, Proc Natl Acad Sci U S A Feb 14;103(7): BİLİMSEL TOPLANTILARDA SUNULAN VE BİLDİRİ KİTABINDA BASILAN BİLDİRİLER Esmaeilian, Yashar; Gür Dedeoğlu, Bala; Atalay, Arzu; Erdemli, Esra Investigation of Stem Cells in Adult and Pre-adult Mouse Ovaries, p:77, International Society for Stem Cell Research (ISSCR) 9 th Annual Meeting, Toronto, Ontario Canada, June 15-18, O. Akilli-Ozturk, B. Gur, O. Konu, I.G. Yulug. Real-Time Quantitative RT-PCR Gene Expression Profile of Hedgehog Signaling Pathway in Epithelial Cancer Cell Lines in the proceedings of the 19 th Meeting of the European Association of Cancer Research, p.105, Budapest, Hungary, 1-4 July B. Gur, O. Konu, S. Kir, A. R. Ozturk, I. G. Yulug. A Resampling Based Meta-Analysis for Detection of Differential Gene Expression in Breast Cancer in the proceedings of the 19 th Meeting of the European Association of Cancer Research, p 158, Budapest, Hungary, 1-4 July Bala Gür, Betül Bozkurt, Özlen Konu, Selda Seckin, Işık G.Yuluğ Expression profiling of BRCA1- induced genes in primary breast tumors, in the 31 st FEBS Congress, Molecules in Health and Disease, June 2006, Istanbul-Turkey. FEBS JOURNAL 273: PP544 Suppl. 1 JUN

5 Ozlem Akıllı-Ozturk, Bala Gür, Betul Bozkurt, Selda Seckin, Isik G. Yulug Gene Expression Analysis of Hedgehog Signaling Pathway Genes in Breast Cancer, in the 31 st FEBS Congress, Molecules in Health and Disease, June 2006, Istanbul-Turkey. FEBS JOURNAL 273: Suppl. 1 JUN 2006 Betül Bozkurt, Bala Gür, Emel Canbay, Ömer Cengiz, Işık G. Yuluğ Focal adhesion kinase inhibition with her-2 pertuzumab antibody (2C4) in breast cancer cell lines. National Surgery Congress 2006, May 2006, Antalya-Turkey Ö. Konu, B. Gür, A.R. Öztürk, I.G. Yuluğ A re-sampling based meta-analysis approach for detection of differential expression in breast cancer subtypes, in the Proceedings of HIBIT 05 International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, Antalya, Turkey, November 2005, p I.G. Yulug, G. Çolakoglu, B. Bozkurt, B. Gür, Ö. Cengiz, D. Yannoukakos, I. Konstantopoulou, V. Gerassimos, G. Nasioulas, T. Özçelik p53 codon 72 and p21 codon 31 polymorphisms and susceptibility to breast cancer in the Turkish and Greek populations, in the proceedings of the European Cancer Conference ECCO 13, Paris, France, 30 October 3 November European Journal of Cancer, vol 3, No 2, October 2005, (ISSN ). B. Gur, B. Bozkurt, O. Konu, S. Seckin, I.G. Yulug Real-time PCR-Based Expression Profiling of BRCA1-Induced Genes in Primary Breast Tumors in the proceedings of the Third International Symposium on the Molecular Biology of Breast Cancer, Molde, Norway, June Breast Cancer Research, vol 7, Supplement 2, S41, P4.19, June K. Ben Haj, B. Gur, B. Bozkurt, I.G. Yulug, C. Akcali, M. Ozturk Expression profiling of Wnt pathway genes in breast cancer in the proceedings of the Third International Symposium on the Molecular Biology of Breast Cancer, Molde, Norway, June Breast Cancer Research, vol 7, Supplement 2, S41, P4.18, June