GENEL ŞARTLAR HÜCRE KÜLTÜRÜ ÜRETİM VE ANALİZ KİTİ

Transkript

1 GENEL ŞARTLAR 1- Kesinlikle Japonya haricinde uzak doğu menşeili olamamalıdır. 2- Firmalar malzemeleri oluşturan markaların tek yetkili ya da Türkiye distrübütörü olmak zorunda değildir. Ancak verilen her malzemeye firma tam garanti verecektir. Yapılacak ilk muayenede, sonrasında çalışma sırasında yaşanacak herhangi bir sorunda kayıtsız şartsız iade alınacaktır. Firmalar bu konuda bu şartı yerine getireceklerine dair teminat mektubunu verecekleri teklif ile birlikte sunmak zorundadırlar. 3- Bu kapsamda ilgili denemler çalışmanın ilk 2 ayını kapsayacaktır, malzemeler teslim edildikten sonra bir sorunla karşılaşılmadığı takdirde ödeme 3 ay sonra yapılacaktır. Firma bu şartı Kabul ettiğini beyan edecektir. 4- Tüm malzemeler birbiriyle uyumlu çalışabilmesi için aynı marka olacaktır. Farklı marka ile sunulan seçeneklerin, tarafımızdan istendiği takdirde uyumlu çalışıp çalışmadığı ile ilgili demo mutlaka yapılmalıdır. Demo ile ilgili tüm masraflar firma tarafından karşılanacaktır. Demo yapacak personelin mutlaka moleküler biyoloji genetik lisans ya da yüksek lisans diploması olacaktır. 5- Firma bu kitler ile ilgili çalışmalar için gerekli olan 10 luk, 100 lük, 200 lük ve 1000 lik her birinden 2 şer adet Gilson marka veya birebir muadili (idareye demo yapılacak) toplamda 8 adet otomatik pipet ve tüm çalışmaya yetecek olan racklı ve filtreli her bir pipet boyutu için 5000 er adet pipet ucunu ücretsiz verecektir. 6- En az 10 ar reaksiyon yapacak ücretsiz demo kitler verilecek, kit içeriğimde plate, seal, ve diğer gerekli sarf cihazlarının tümü bulanacak ve mevcut real time PCR (ABI Quant studio 5) ile uyumlu çalışırsa diğerleri teslim alınacaktır. HÜCRE KÜLTÜRÜ ÜRETİM VE ANALİZ KİTİ 1- İçerisinde, birbiriyle uyumlu olarak üretilmiş ve uyum testleri yapılmış aynı marka ürünleri içeren, 500 pasaj için yeterli miktarda DMEM, EMEM, HAMS F2, FETAL BOVİN SERUM(Heat İnactivated özelikte), L-Glutamin (10 adet), Pen-Strep (10 Adet), kryovialler (1 paket), steril pipetler (5 ve 10 ml 500 er adet), hücre kültür flaskları (75 ve 25 cm2 500 er adet), 96 lik, 24 lük, 6 lık hücre kültür well playtleri (50 şer adet), DMSO (2 litre), özel modifiye edilmiş besi yerleri (20 adet 500 ml), sub kültür için besi yerleri (20 adet 500 ml), MTT test solüsyonu (1 kutu) ve yeteri miktarda pipet ucu ve diğer sarfları içeren set olacaktır. Ayrıca hücre serisi firma tarafından ATCC den temin edilerek getirilecektir. 2- T/G HA-VSMC (ATCC CRL-1999 )hücre serisi için, atcc.org/products/cells_and_microorganisms/by_tissue/aorta/crl aspx?geo_country=tr#culturemethod

2 ATCC web sayfası adresleri verilen alanlar firmalar tarafından dikkatle incelenecek ve hücre kültürleri için gerekli medyum ve diğer sarfların içerikleri bu web sayfalarında verilen içerikler ile en fazla % 10 sapma içerecek şekilde birebir aynı olacaktır. 3- Tüm firmalar ihale kararı verilmeden önce 100 pasaj için yetecek kadar malzeme ile hazırlayacakları setlerden 1 adet örneği Tıbbi Biyoloji AD na getirerek demo yapacaklarıdır. 4- Ürünler ithal olacak, kendilerine ait web sayfası mutlaka bulunacak, bu web sayfası üzerinden ürünlerin kalite belgeleri, MSDS belgeleri mutlaka indirilebilecektir. 5- Çalışma kanser hücreleri ile yapılacağı için kullanılan malzemenin biyouyumluluğu mutlaka kanıtlanacaktır. WHEAT GERM AGGLUTININ- AL, 5 MG, CELLLIGHT MITOCHONDRIA-RFP, 1 ML, ALEXA FLUOR 488 PHALLO, 300 U, PREMO AUTOPHAGY LC3B-GFP, 1 KIT, CM-H2DCFDA (GENERAL OXİDATİVE STRESS INDİC.20 X TEKNİK ŞARTNAMESİ 1- Kesinlikle Japonya haricinde uzak doğu menşeili olamamalıdır. 2- Firmalar malzemeleri oluşturan markaların tek yetkili ya da Türkiye distrübütörü olmak zorunda değildir. Ancak verilen her malzemeye firma tam garanti verecektir. Yapılacak ilk muayenede, sonrasında çalışma sırasında yaşanacak herhangi bir sorunda kayıtsız şartsız iade alınacaktır. Firmalar bu konuda bu şartı yerine getireceklerine dair teminat mektubunu verecekleri teklif ile birlikte sunmak zorundadırlar. 3- Bu kapsamda ilgili denemler çalışmanın ilk 2 ayını kapsayacaktır, malzemeler teslim edildikten sonra bir sorunla karşılaşılmadığı takdirde ödeme 3 ay sonra yapılacaktır. Firma bu şartı Kabul ettiğini beyan edecektir. 4- Tüm malzemeler birbiriyle uyumlu çalışabilmesi için aynı marka olacaktır. Farklı marka ile sunulan seçeneklerin, tarafımızdan istendiği takdirde uyumlu çalışıp çalışmadığı ile ilgili demo mutlaka yapılmalıdır. Demo ile ilgili tüm masraflar firma tarafından karşılanacaktır. Demo yapacak personelin mutlaka moleküler biyoloji genetik lisans ya da yüksek lisans diploması olacaktır. 5- Floresan propların tümü ön muameleye gerek olmadan canlı hücre ile çalışabilecek özellikte olmalıdır. 6- Boyamalar için gerekli tüm malzemeler firma tarafından karşılanacaktır. 7- Boyaların tümü DAPI, FITC ve Texas RED filtrelere uygun olacaktır. 8- Son kullanma tarihleri en az 1 yıl olacaktır.

3 HÜCRE MESAJCI NÜKLEİK ASİT EKSTRAKSİYON, KOMPLEMENTER DNA KÜTÜPHANE SENTEZ VE GEN İFADESİ ANALİZ KİTİ TEKNİK ŞARTNAME Ekspresyon kiti içerinde; 1- RNA İzolasyon Kiti : İzolasyon kitleri hayvan ve bitki hücreleri, hayvan ve bitki dokusu, tam kan, maya hücreleri, bakteri hücreleri ve çeşitli vücut sıvılarından saflaştırılmış toplam RNA elde etmeye uygun olmalıdır.izolasyon kitleri spin kolon yöntemi ile çalışmalıdır. İzolasyon Kitleri 50 test ambalajlı olmalıdır ve 5 adet 2- cdna sentez kiti ; 20ul reaksiyon miktarı kullanarak total RNA nın tek iplikli cdna ya reverse transkripsiyonu için gerekli bufferları içermelidir. Cdna izolasyon kitim 200 rxn ambalajda 4 adet 3- PowerUp SYBR Green Master Mix; Mix içerisinde SYBR Green I Dye, Dual-Lock Taq DNA Polymerase, NTPs with dutp/dttp blend, heat-labile UDG, Passiv reference (rox),optimized buffer components bulunmalıdır. Komponentler tek tüp formatında premix şeklinde ve 2X olmalıdır. ( Primer, örnek ve su hariç) sybr green master mix toplamda 140 ML olarak 4- Ekspresyon kitiyle birlikte 384 kuyucuklu (Quant studio 5 Real Time Cihazına Uygun) toplamda 100 plate ve bu plate lere yetecek kadar seal 5- Ekspresyon kiti toplamda 70 gen bölgesinde çalışılacak 50 örneğin 3 tekrarlı şekilde çalışılması göz önünde bulundurularak sarf PROTEİN EKSTRAKSİYON, JEL YÜRÜTME, BLOTLAMA VE EKSPRESYON ANALİZ KİTİ 1. Protein izolasyonu içerisinde protein lizis solüsyonu ve protease inhibitörü yer almalıdır. Protein izolasyonu sırasın da homojenizasyon da kullanılacak boncuklar zirkonyum oksit olmalıdır. 2. Protein tayini için Floresan boyalı kitler kullanılmalıdır. Kitin içerisinde 3 farklı standart bulunmalıdır. Kit florometrik ölçüme uygun olmalı ve 0,5 lik ince cidarlı tüplerle ölçülmelidir. 3. Protein yüklemesi için 4-12% Bis-Tris özellikte jeller kullanılmalıdır. Bu jeller 10, 12, 15 ve 17 kuyucuklu alternatifli olmalıdır her birinden birer kutu deneme için Bölümün belirleyeceği özellikteki jellerden toplamda 6 paket Bu Jeller Bolt Mini Gel Tank uyumlu olmalıdır. 4. Yürütmede kullanılacak yürütme bufferları 20x konsantrasyonda gelmeli ve kullanıma hazır şekilde teslim edilmelidir. Bu buffer kit içerisinde MOPS running buffer, LDS

4 sample Buffer,Sample Reducing Agent ve Antioxidant olmalıdır. Bu bufferlerın her birinden 5 er paket 5. Yürütme de kullanılacak protein standartı birincisi kemilüminesans özellikte, diğeri ise membranda görünür özellikte olmalıdır. Kemilüminesans özellikteki standart 250 ul ambalajda 3 adet, memranda görünür özellikteki marker 500 ul ambalajda 2 adet 6. Blotlama işlemi için Tıbbi Biyoloji Bölümünde bulunan İnvitrogen iblot Blotlama cihazına uygun özellikte membranlar olmalıdır. Bu memranlar nitroselüloz ya da PVDF tercihli olmalıdır. Bölümün belirleyeceği özellikteki membranlardan toplamda 4 paket 7. Sekondar boyama aşaması için kit hazır halde gelmelidir. Kit seçilen primer antikorun hostuna bağlıolarak seçilmelidir. Kit içeriğinde ; Blotlama solüsyonu, yıkama solüsyonu ve sekonder antikor ve kemilüminesans substrat olmalıdır. Bu kitlerden toplamda 4 paket 8. Bu kitler 5 Protein bölgesine çalışmaya yetecek kadar olmalıdır. Yeteri miktarda ( 5 farklı Antibody (İçeriği ve miktarı idare tarafından belirlenecek) firma tarafından sağlanmalıdır. KEMOTERAPİ AJANLARI TEKNİK ŞARTNAMESİ 1. İrinotecan; Saflığı 97% olmalıdır. 10 mg lık ambalajlarda 5 adet 2. Folinik Asit ; Saflığı 98% olmalıdır. 10 g lık ambalajlarda 2 adet verilmelidir 3. 5-Fu; moleküler ağırlığı olmalıdır. 2.5 mg lık amblajlarda 5 adet TALI CELL CYCLE KIT VE SLAYTLARI ŞARTNAMESİ 1. Kit PI işaretli binding conjugati içermelidir. 2. Kit içeriğinde çalışma için tüm sarf malzemeler bulunmalı, çalışmada zorunlu olan ve kitde bulunmayan malzemeler firma tarafından temin edilmelidir. 3. Kit Tali Image-Based Cytometer cihazında çalışmaya uygun olmalıdır.bu cihaz firma tarafından deneme süresince Tıbbi Biyoloji AD na getirilerek kurulmalıdır. 4. Kit ile nekrotik hücreler ve hücre siklus tüm döngü tespit edilebilmelidir. 5. Kit 200 örnek çalışmaya yeterli miktarda olmalıdır. 6. Kitle birlikte gerekli sarflar ve Slaytlar çalışmaya yetecek kadar 7. Çalışma süresince kitlerin çalışılacağı Tali Cihazı Tıbbi Biyoloji AD kullanımına sunulmalıdır. PRİMERLER TEKNİK ŞARTNAMESİ 1. Primerler toplamda 1250 baz olmalıdır.

5 2. Primerler HPLC grade olmalıdır. 3. Primerler 200 nmol olmalıdır. 4. Primerler denendikten sonra faturalandırma işlemi gerçekleşecektir. Sonuç vermeyen primerler yenisi ile değiştirilecektir.