Prof. Dr. Muhsin KONUK

Ebat: px

Şu sayfadan göstermeyi başlat:

Download "Prof. Dr. Muhsin KONUK"

Ece Kent
8 yıl önce
İzleme sayısı:

1 AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü Prof. Dr. Muhsin KONUK

2 Grubumuzdaki Çalışmalar Enzimoloji (Endüstriyel ve biyosensör), Bitki Doku kültürü (mikro çoğaltım), Genotoksisite, Genetik polimorfizm (RAPD belirteçlerle), proteomik, biyoremediasyon, durum saptama (pestisit, ağır metal, bazı metabolitlerin mevsimsel değişimi, flora ve fauna çalışmaları gibi)

belirteçlerle), proteomik, biyoremediasyon, durum saptama (pestisit, ağır

3 Çalışmalarımızdan örnekler AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

4 OKSİDASYONA BAĞLI TOKSİSİTE VE ANTİOKSİDAN İLİŞKİLERİ

5 Eroin ve tiner bağımlılığının oluşturduğu hasarlar (Oksidasyon çeşitleri, DNA hasarı gibi) ve bunların giderilmesinde değişik antioksidanların etkilerinin araştırıldığı TÜBİTAK destekli proje çalışmaları AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

giderilmesinde değişik antioksidanların etkilerinin

7 MUTAJENİTE, GENOTOKSİSİTE TESTLERİ (Ames Testi, Allium testi, Hordeum testi, Comet Assay, MTT)

8 Salmonella typhimurium AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

9 Ames Testi 100 µl

11 Allium ve Hordeum testi AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

13 Anafaz safhalarındaki köprüler AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

14 Genotoksisite için Allium testi AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

16 "Comet Assay" ile genotoksisite belirlenmesi Comet Assay

18 ANTİK-DNA VE POLİMORFİZM ÇALIŞMALARI (RAPD belirteçleriyle)

19 TÜBİTAK-EVRENA (Güney Afrika ile) projesi; Fosil DNA'ları ile günümüz akraba örneklerinin karşılaştırılması

20 ENZİMOLOJİ (BİYOSENSÖR, ENDÜSTRİYEL) VE PROTEOMİK

"ALAD (δ-aminolevulinic Acid Dehydratase) as Biosensor for Pb Contamination" Muhsin Konuk, İbrahim Hakkı Ciğerci and Safiye Elif Korcan Source: Intelligent and Biosensors ISBN 978-953-7619-58-9

21 "ALAD (δ-aminolevulinic Acid Dehydratase) as Biosensor for Pb Contamination" Muhsin Konuk, İbrahim Hakkı Ciğerci and Safiye Elif Korcan Source: Intelligent and Biosensors ISBN Edited by: Vernon S. Somerset Publisher: InTech, January 2010 Usage: 549 views, 346 downloads es/show/title/alad-aminolevulinicacid-dehydratase-as-biosensor-forpb-contamination

22 ALAD (δ-aminolevulinic Acid Dehydratase) as Biosensor for Pb Contamination Muhsin Konuk, İbrahim Hakkı Ciğerci and Safiye Elif Korcan Aminolevulinate, delta-, dehydratase

23 δ-alad The ALAD enzyme is composed of 8 identical subunits and catalyzes the condensation of 2 molecules of deltaaminolevulinate to form porphobilinogen (a precursor of heme, cytochromes and other hemoproteins). ALAD catalyzes the second step in the porphyrin and heme biosynthetic pathway; zinc is essential for enzymatic activity. ALAD enzymatic activity is inhibited by lead and a defect in the ALAD structural gene can cause increased sensitivity to lead poisoning and acute hepatic porphyria. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified.

25 DİOKSİJENAZ'LAR (PAH PARÇALANMASI)

PAH (Polisiklik Aromatik/PoliAromatik Hidrokarbonlar (Polycyclic Aromatic Hydrocarbons/Polararomatic Hydrocarbons (PAHs) - Karbon ve hidrojenden oluşan stabil organik bileşikler.

26 PAH (Polisiklik Aromatik/PoliAromatik Hidrokarbonlar (Polycyclic Aromatic Hydrocarbons/Polararomatic Hydrocarbons (PAHs) - Karbon ve hidrojenden oluşan stabil organik bileşikler. Bu moleküller çok karsinojenik ve çok yaygın olarak bulunurlar. PAH grubunda 100 den fazla kimyasal molekül bulunur. Bunlar kömür, benzin, mazotun tam yanmadığı durumda ortaya çıkar, tütünde ve kömürde pişirilmiş et üzerinde (benzopiren) de bulunurlar. PAH karışım olarak kurum un yapısında bulunur, bazıları özel olarak saf şekilde üretilir. Bir bölümü ilaçlar, boyalar, plastik ve pestisitlerin yapısında bulunurlar. Deniz trafiğinin yoğun olduğu yörelerde de bulunurlar. Bazı özellikleri şöyle sıralanabilir:

27 PAH volkanlar, orman yangınları, kömür dumanları, egzoz dumanları ile havaya karışırlar. PAH toz partiküllerinin yapısında da bulunur. Bazıları yüzey suları ve topraktan buharlaşan su içinde havaya karışır. PAH havada güneş ışığı ve diğer kimyasalların etkisiyle yıkıma uğrayabilirler. PAH endüstriyel ve atık su işleme tesislerinden de suya karışır. PAH ın çoğu suda kolaylıkla çözülmez, katı partiküllere yapışır, nehir ve göllerin dip kısımlarına çökerek birikir. Topraktaki ve sudaki mikroorganizmalar haftalar, aylar devam eden bir süreçte PAH ı yıkıma uğratır. Toprakta partiküllere sıkıca bağlanır ve bazı PAH topraktan yeraltı sularına karışarak kirlenmeye neden olurlar. PAH ın bitki ve hayvan dokularındaki miktarı bu canlıların üzerinde yaşadığı toprak ve içtikleri sudan daha yüksek olabilmektedir, bu durum PAH ın dokulara da birikme eğilimini gösterir.

28 Structure of naphthalene dioxygenase with the active site and substrate shown right. (from A. Karlsson et al. Science, 2003, 299, 1039). AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

29 Tek karbon kaynağı PAH olan besiyerinde Haloferax sp. nin üremesi Tek karbon kaynağı PAH olan besiyerinde Halorubrum sp. nin üremesi

32 BİYOTEKNOLOJİK ÇALIŞMALAR Biyoremediasyon, Bitki Doku kültürü (Mikroçoğaltım tekniği), Antimikrobiyal madde üreten mikroorganizma izolasyonu, Endüstriyel enzim üretimi çalışmaları

34 Thermopsis turcica (Eber sarısı, Piyan, Acı piyan) 'nın doku kültürü (Mikro çoğaltım) ile yetiştirilerek tekrar doğaya döndürülmesi AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

37 Thermopsis turcica 'nın mikroçoğaltımla üretilmesi çalışmaları AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

40 Ekipten bazı arkadaşlar AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

41 Brassica rapa L.var. rapa da Pb birikimi Kurşun stresinin 6. gününde kontrol (a) ve 5 mm Pb (b) uygulamasına maruz bırakılmış yem şalgamı fidelerinden yaprak örnekleri

Altı gün süre ile farklı kurşun konsantrasyonlarına maruz bırakılmış yem şalgamı fidelerinin yapraklarından elde edilen genomik DNA ların OPB 14 ve

42 Altı gün süre ile farklı kurşun konsantrasyonlarına maruz bırakılmış yem şalgamı fidelerinin yapraklarından elde edilen genomik DNA ların OPB 14 ve OPB 15 primerleri ile elde edilen RAPD profilleri. M: markör, a: kontrol, b: 0.5 mm Pb, c: 1 mm Pb, d: 3 mm Pb, e: 5 mm Pb AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

Bu türler: P ostreatus, P sajor-caju P florida Slaytlarda görülen çalışmada ile tekstil

43 Beyaz Çürükçül (White rot fungi) mantarlar aracılığıyla Biyoremediasyon çalışmaları: Bu çalışmalar; Pleurotus türleri ile gerçekleştirilmektedir. Bu türler: P ostreatus, P sajor-caju P florida Slaytlarda görülen çalışmada ile tekstil sanayiinde kullanılan bir boya nın (Lanaset Blue 2R) Pleurotus türleri ile giderilmesi çalışılması [BiyoTeknoloji Elektronik Dergisi, 1 : 1, 2010 (1-6)]

45 Durum saptama GC ile yapılan çalışmalar OCP tayini (içme suları, süt, kaymak vs.) Yağ asidi profilleri (değişik göllerde yaşayan balıklarda mevsimsel değişim) Canlı ve çevre ilişkisi Toprak-canlı ilişkisi Su-toprak-bitki ilişkisi Su kirliliği (Ağır metal) ve genotoksisite bağlantısı (kurbağalarda)

46 Eber Gölü GC Lab

47 Güzelçayır-Mayıs 2011(Emirdağ-Sivrihisar arası) Kurudere Mayıs 2011(Emirdağ-Bolvadin arası) Eber Gölü'nde grub vakti GC

52 Diğer çalışmalar; Etnobotanik çalışmalar Hava fungusları ve allerji ilişkileri Antimikrobiyal madde üreten mikroorganizmaların izolasyonu

54 Cladosporium cladosporioides Alternaria versicolor A. alternata

56 Afyonkarahisar Mrk. Hıdırlık eteklerinden izole edilen bir toprak izolatına ait antimikrobiyal madde belirleme çalışmaları. AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

57 L. Lilacinium (kök) methanol ekstresinin 2, 4, 6. günlerde Cladosporium oxisporum üzerine antifungal etksi AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

58 Teşekkürler AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ

Benzer belgeler

GIDALAR KANSERİN NERESİNDE?

GIDALAR KANSERİN NERESİNDE? PROF. DR. İSMAİL ÇELİK HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ KANSER ENSTİTÜSÜ Alkol %4-6 Diğer %10-15 Tütün %30-35 Şişmanlık %10-20 Enfeksiyon %15-20 Beslenme %25-30 Kansere Yol Açan Faktörler