GENEL HÜKÜMLER. Lipopolysaccharides from Escherichia coli O111:B4 (L MG) Teknik Şartnamesi

Transkript

1 GENEL HÜKÜMLER 1. Real time PCR sarfları için teklif veren firma çalışma süresi boyunca Real Time PCR cihazını bölüme bırakmalıdır. Çalışma bütünlüğü açısında real time sarflarının hepsi aynı marka olmalıdır. 2. Western Blot sarfları için; Jellerle birlikte; jellerin çalışması için uygun olan XCell SureLock Mini-Cell elektroforez tankı çalışma süresi boyunca kuruma bırakılmalıdır. Western Blot çalışması için kullanılacak antikorlar çalışma bütünlüğü açısından aynı marka olmalıdır. 3. ELISA kitleri 450 nm de okuma yapmalıdır ve çalışmanın bütünlüğü açısından hepsi aynı marka teklif edilmelidir. 4. Çalışmada kullanılacak olan tüm plastik sarflar hücre kültürü çalışmaları için uygun özelliklerde olmalıdır. 5. Verilen katalog numaraları bilgi amaçlı olup, ürünün birebir muadili veya üst özellikte alternatifi teklif edilebilir. ARPE-19 (ATCC CRL-2302) Teknik Şartnamesi İnsan organizmasında çalışmaya uygun olmalıdır. Epitel hücre tipinde, insan göz dokusunda çalışmaya uygun olmalıdır. Depolama koşulları sıvı azot buhar fazında gerçekleşmelidir. Karyotipi diploit olmalıdır. Hücre dizisi, Dulbecco'nun modifiye Eagles ortamı ve Ham's F12 ortamı, % 20 sığır fetüsü serumu, 56 mm nihai konsantrasyonda sodyum bikarbonat ve 2 mm L-glutamin içeren HEPES tamponu ile 1:1 oranında bir karışım içinde kurulmuş olmalı ve 37 C'de % 10 C0 2 'de inkübe edilmiş olmalıdır. Ürünün biyogüvenlik seviyesi 1 olmalıdır. Teklif veren firma hücre teslimatı ile birlikte açılışta kullanılacak olan; 0.25 % (w/v) Trypsin/EDTA (100 ml, 2 adet), Dulbecco's modified Eagles medium and Ham's F12 (500ml, 5 adet), fetal bovine serum (500 ml, 2 adet) birlikte vermelidir. Esculetin ( mg) Teknik Şartnamesi Ürünün CAS Numarası olmalıdır. Ürünün eş anlamlıları 6,7-Dihidroksikomarin, Cichorigenin, Esculetin olmalıdır. Moleküler ağırlığı g olmalıdır. % 97.5 (HPLC), % (NT) assay leri olmalıdır. Son kullanma tarihi etikette belirtilmiş olmalıdır. Mp değeri: C olmalıdır. Ürün boyutu 50 mg olmalıdır. Lipopolysaccharides from Escherichia coli O111:B4 (L MG) Teknik Şartnamesi EC numarası: olmalıdır. MDL numarası: MFCD olmalıdır. Ürün 100 mg ağırlığında olmalıdır. Liyofilize toz formunda olmalıdır. Fenol ekstraksiyonu ile saflaştırılmış olmalıdır. Depolama sıcaklığı 2-8 C arasında olmalıdır. RPMI MEDIUM 1640 (A ) TEKNİK ÖZELLİKLERİ Ürün içeriğinde indirgeyici bir ajan olan glutatyon ve yüksek konsantrasyonlarda vitamin bulunmalıdır. Ürün L-Glutamine, düşük konsantrasyonlarda sodyum bikarbonat, fenol red, yüksek oranda glikoz, sodyum pirüvat ve HEPES içermelidir. Ürün 500 ml ambalajlar halinde olmalıdır. Teklif hazırlayan firmanın yetki belgesi bulunmalıdır. 1/8

2 DMEM F12 ( ) Teknik Özellikleri Ürün boyutu 500 ml olmalıdır. Ürün likit formda olmalıdır. Ürünün konsantrasyonu 1X olmalıdır. Osmolalite oranı mosm /kg arasında olmalıdır. ph Aralığı aralığında olmalıdır. Ürün içeriğinde L-glutamin, fenol red, sodyum pirüvat ve sodyum bikarbonat bulunmalı, HEPES bulunmamalıdır. Teklif veren firma distribütör yetkisine sahip olmalıdır. Raf ömrü imalat tarihinden itibaren 12 ay olmalıdır. Fetal Bovine Serum ( ) Teknik Şartnamesi 500 ml lik şişelerde bulunmalıdır. Saklama koşulları -5, -30 C arasında olmalı ve kuru buz ile teslimata uygun olmalıdır. Ürün ISO sertifikalı olmalıdır. İn-vitro koşullarda kullanıma uygun olmalıdır. Teklif hazırlayan firma distribütör yetki belgesine sahip olmalıdır. Penisilin Streptomisin ( ) Teknik Özellikleri 100 ml lik ambalajlarda olmalıdır. Spektrumu gram pozitif ve gram negatif bakteriler olmalıdır. 10,000 unite penicilin,10,000 µg/ml streptomycin (base)içermelidir. Teklif hazırlayan firmanın distribütör yetki belgesine sahip olmalıdır. Trypsin-EDTA (0.25%), Fenol Red ( )Teknik Özellikleri Ürün boyutu 100 ml olmalıdır. Konsantrasyonu 1X olmalıdır. Likit formda olmalıdır. PH Aralığı: aralığında olmalıdır. Ürün EDTA ve phenol red içermelidir. Raf ömrü imalat tarihinden itibaren 24 ay olmalıdır. Ürünün saklama koşulları -5 ila -20 C olmalıdır. ISO standartlarına göre sertifikalandırılmış olmalıdır. Teklif veren firma distribütör yetkisine sahip olmalıdır 25 cm 2 hücre kültür flask teknik şartnamesi Flaskın yapışma yüzeyini artırmak için pozitif ve negatif yükle yüklenmiş olmalıdır (tissue culture treated). Hücre kültürü çalışmalarına uygun olmalıdır. Flask boynu kontaminasyonu önleyecek şekilde açılı olmalıdır. Kapak ağzında sarsılma anında ıslanmayı önleyen oluk olmalıdır. Kapağında filtre olmalıdır ve PE özelliğinde olmalıdır. 50 ml kapasiteli ve 25 cm 2 taban alanına sahip olmalıdır. Steril olmalı ve flask kapağı vidalı olarak kapanmalıdır. 75 cm 2 hücre kültür flask teknik şartnamesi Flaskın yapışma yüzeyini artırmak için pozitif ve negatif yükle yüklenmiş olmalıdır (tissue culture treated). Hücre kültürü çalışmalarına uygun olmalıdır. Flask boynu kontaminasyonu önleyecek şekilde açılı olmalıdır. 2/8

3 Kapak ağzında sarsılma anında ıslanmayı önleyen oluk olmalıdır. Kapağında filtre olmalıdır ve PE özelliğinde olmalıdır ml kapasiteli ve 75 cm 2 taban alanına sahip olmalıdır. Steril olmalı ve flask kapağı vidalı olarak kapanmalıdır. 15 ml falkon tüp teknik şartnamesi FDA onaylı, ultra saf ve şeffaf polipropilenden(pp) üretilmelidir C de 20 dakika boyunca otoklavlanabilmelidir. Ayaklı ve vida kapaklı olmalıdır. Steril olmalıdır. Gövde üzerinde 0.5 ml aralıkla derecelendirme yapılmış olmalıdır. Gövde üzerinde geniş yazılım alanına sahip olup 6000 RPM ye dayanıklı olmalıdır. 15 ml hacminde olmalıdır. Sterilizasyonu, üretim ve son kullanma tarihi etiketinde bulunmalıdır. 50 ml falkon tüp teknik şartnamesi FDA onaylı, ultra saf ve şeffaf polipropilenden(pp) üretilmelidir C de 20 dakika boyunca otoklavlanabilmelidir. Ayaklı ve vida kapaklı olmalıdır. Steril olmalıdır. Gövde üzerinde 0.5 ml aralıkla derecelendirme yapılmış olmalıdır. Gövde üzerinde geniş yazılım alanına sahip olup 6000 RPM ye dayanıklı olmalıdır. 50 ml hacminde olmalıdır. Sterilizasyonu, üretim ve son kullanma tarihi etiketinde bulunmalıdır. 96 kuyulu plaka teknik şartnamesi 96 kuyucuktan oluşmalıdır. Kuyucukların tabanı düz olmalıdır. Plakanın yapışma yüzeyini artırmak için pozitif ve negatif yükle yüklenmiş olmalıdır (tissue culture treated). RNA, DNA free olmalı Tekli paketlerde ve kapaklı olmalı Steril olmalı ve bu belgelendirilmeli Plate okuyucuda kullanıma uygun olmalıdır. 5 ml ve 10 ml serolojik pipet teknik şartnamesi Tek tek paketlenmiş, steril, şeffaf ve tek kullanımlık olmalıdır. Polipropilen malzemeden üretilmiş olmalıdır. Listede yer alan talebe göre 5 ml ve 10 ml hacimli olmalıdır. 10 µl, 200 µl ve 1000 µl Pipet ucu teknik şartnamesi DNase-, RNase-free özellikte, şefaf ve steril olmalıdır. Listede yer alan talebe göre 10 µl, 200 µl ve 1000 µl hacimlerinde olmalıdır. Laboratuvarımızda mevcut Gilson marka mikropipetlere tam uyumlu olmalıdır. 3/8

4 0.5 ve 1.5 ml mikrosantrifüj teknik şartnamesi DNase-, RNase-free özellikte, şefaf ve steril olmalıdır. Listede yer alan talebe göre 0.5 ve 1.5 ml hacimlerinde olmalıdır g devire kadar dayanabilmelidir. Otoklavlanabilir malzemeden yapılmış olmalıdır RNA İzolasyon Kiti ( A) Teknik Şartnamesi Kit bakteri, kan, hücre, sıvı halde ki örneklerden (serum vb.), bitki örneklerinden doku ve kültüre edilmiş hücrelerden izolasyon yapabilme özelliğine sahip olmalıdır. 50 reaksiyonluk orijinal ambalajında olmalıdır Kit içeriğinde Lysis Buffer, Wash Buffer I ve II, RNase-Free Water, Spin Cartridges ile collection tubes, Collection Tubes ve Recovery Tubes olmalıdır. Ürün laboratuvarımızda daha önce test edilmiş ve teknik özellikleri onaylanmış olmalıdır. Ambalaj üzerinde son kullanma tarihi, katalog numarası, üretici firma adı ve lot numarası gibi bilgiler bulunmalıdır. Kit, en çok 1.2 ml sıvı örneklerden, en çok 5x10 7 hayvan veya bitki hücrelerinden, en çok 200 mg hayvan dokularından, en çok 250 mg bitki dokularından, en çok 0.2 ml tam kandan, 5x10 8 maya hücrelerinden veya en çok 1x10 8 bakteri hücrelerinden RNA elde etmeye uygun olmalıdır. Teklif veren firma distribütör yetkisine sahip olmalıdır High-Capacity cdna Reverse Transcription Kit ( ) Teknik Şartnamesi Kit RNA dan cdna eldesini sağlamalıdır. Kit, 200 testlik olmalıdır. Elde edilen cdna gen ekspresyon master mix, sybr gren master mix ve real time uygulamalarında kullanılan diğer master mixler ile uyumlu olmalıdır. Kit 1 tüp 1 ml lik 10X RT Buffer, 1 tüp 1 ml lik 10X RT Random Primer, 1 tüp 0.2 ml lik 25X dntp Mix (100 mm), 1 tüp 0.2 ml lik MultiScribe Reverse Transcriptase (50 U/µL) içermelidir. Reaksiyon hacmi 20 µl olmalıdır. Kit 0.02 ile 2 µg arasındaki total RNA dan cdna çevirebilmelidir. Elde edilen cdna büyüklüğü 7 kb ye kadar ulaşabilmelidir. Reaksiyon süresi 0,5-1 saat olmalıdır. Teklif veren firmalar yetki belgelerini sunmalıdırlar. Orijinal ambalajında ve -20 C saklama koşullarında teslim edilmelidir. Power SYBR Green Master Mix ( ) Teknik Özellikleri Optimize edilmiş formülasyon, klasik SYBR Green PCR ana karışıklığa kıyasla daha yüksek hassasiyet sunmak için yüksek saflıkta AmpliTaq Gold DNA Polymerase, LD içermelidir. Power SYBR Green PCR Master Mix, taşıma kirliliğini en aza indirgemek için AmpErase UNG ile uyumlu bir dttp / dutp karışımı içermelidir. qpcr metodu ile çalışmaya uygun olmalıdır. Ürün ROX boyası içermelidir. Ürün boyutu 1 x 5 ml olmalıdır. LD (Düşük DNA) saflık ve kalite derecesinde olmalıdır. DNA (Genomik) ve cdna örnek tiplerinde çalışabilmelidir. 2X konsantrasyonunda, SYBR Green 1 Dye, AmpliTaq Gold DNA Polymerase LD, dutp / dttp harmanlı dntp'ler, Pasif Referans 1 ve optimize edilmiş tampon bileşenleri içermelidir. Her biri 25 µl'lik son hacimde 400 reaksiyon için yeterli 1x5 ml içermelidir. Teklif veren firmalar yetki belgelerini sunmalıdırlar. 4/8

5 Primer 200 nmol ( ) Teknik Özellikleri Sulandırma sonrası konsantrasyonu HPLC 200 nmol olmalıdır. Primerler liyofilize olarak kullanıcıya teslim edilmelidir. Primerlerin optimizasyonu yapılmış ve çalışır durumda teslim edilmelidir. Primerler çalışmadığı takdirde yenisi ile ücretsiz değiştirilmelidir. İthalatçı firmanın yetki belgesi bulunmalıdır. Tali Apoptosis Kiti (A10788) Teknik Özellikleri Apoptoz Kiti, bir popülasyonda apoptotik hücrelerin tanımlanmasını ve apoptotik maddenin nekrotik ve canlı hücrelerden ayrımcılığını mümkün kılmalıdır. Ürün floresans boyama yöntemi ile çalışmaya uygun olmalıdır. Kit içerisinde yeşil renk sağlayan Annexin V Alexa Fluor 488, Annexin Bağlayıcı solüsyon, kırmızı renk sağlayan Propidium Iodide (PI) solüsyonu bulunmalıdır. Annexin V-Alexa Fluor 488 ve Propidium Iodide ile Tali Apoptosis Test Kitini kullanılarak bir hücre popülasyonunu boyadıktan sonra; apoptotik hücreler yeşil floresan görüntü, ölü hücreler kırmızı ve yeşil floresan görüntü ve canlı hücreler az veya hiç floresan görüntüler göstermelidir. Orijinal ambalajında teslim edilmelidir ve 2-6 C de muhafaza edilebilmelidir. Teklif veren firmalar yetki belgelerini sunmalıdırlar. Kit ile birlikte çalışmak için Tali Cytometer Cihazı bölüme kurulmalıdır. Tali Hücresel Analiz Slaytları (T10794) Teknik Özellikleri Ürün pre-steril ve tek tek paketlenmiş halde olmalıdır. 1 kutu içerisinde 50 slayt mevcut olmalıdır. Her slayt kuyucuk başına 25 μl numuneyi barındıracak şekilde tasarlanmış iki ayrı, kapalı analiz bölmeleri içermelidir. Tali Image-Based Cytometer cihazı ile kullanıma uygun olmalıdır. DNase/RNase-Free Distilled Water ( ) Teknik Şartnamesi 500 ml ambalajında olmalıdır. Dnase Rnase Free olmalıdır. 0.1-µm membrane-filtreden geçerek test edilmiş olmalıdır. Oda ısısında saklanmalıdır. Teklif veren firma yetki belgelerini sunmalıdırlar. Beta Aktin Antikoru (NB ) Teknik Özellikleri Antikor insan, fare, sıçan, domuz, kuş, tavuk, hamster, balık, pirimat ve tavşan hedef canlılarına spesifik olmalıdır. Western Blot, Simple Western, B/N, EIA, ICC/IF, IHC, IHC-P, IP ve PLA aplikasyonlarında çalışılabilmelidir. Antikor rabbit poliklonal olmalıdır. Konsantrasyonu 1 mg/ml olmalıdır. 0.09% Sodium Azide içermelidir. 4 C de saklanabilmelidir. Teklif veren firmanın yetki belgesi bulunmalıdır. RelA/NF-kB p65 Antikoru (NB ) Teknik Özellikleri Antikor insan, fare ve sıçan hedef canlılarına spesifik olmalıdır. Western Blot, ICC/IF, IHC, IHC-P, IP aplikasyonlarında çalışılabilmelidir. 5/8

6 Antikor rabbit poliklonal olmalıdır. Konsantrasyonu 0.2 mg/ml olmalıdır. 0.1 % sodyum azid içermelidir. 4 C de saklanabilmelidir. Teklif veren firmanın yetki belgesi bulunmalıdır. Goat anti-rabbit IgG (H+L) Sekonder Antikor (NB7160) Teknik Özellikleri Antikor tavşan hedef canlısına spesifik olmalıdır. Western Blot, ELISA, ICC/IF, IHC, IHC-P aplikasyonlarında çalışılabilmelidir. Antikor goat poliklonal olmalıdır. Konsantrasyonu 1 mg/ml olmalıdır ve HRP işaretli olmalıdır. 4 C de ve karanlık ortamda saklanabilmelidir. Teklif veren firmanın yetki belgesi bulunmalıdır. Bis-Tris Protein Jel (NP0321BOX) Teknik Şartnamesi Jel yüzdesi 4-12% olmalıdır. 1mm incelikte 10 well içermelidir. Oda sıcaklığında saklanabilmelidir. Jel boyutu 8 cm x 8 cm ölçülerinde olmalıdır. Örnek yükleme hacmi 25 µl olmalıdır. Protein ayrımı yapabilmelidir. Jellerle birlikte; jellerin çalışması için uygun olan XCell SureLock Mini-Cell elektoroforez tanlı çalışma süresi boyunca kuruma bırakılmalıdır. Teklif veren firmanın yetkili satıcı olduğuna dair yetki belgesi bulunmalıdır. MOPS SDS Buffer Kit (NP0050) Teknik Şartnamesi SDS Page jelde kullanıma uygun olmalıdr. Kit içeriğinde: 20X, 500 ml MOPS SDS Running Buffer, Sample Reducing Agent (10X, 250 µl) containing 500 mm Dithiothreitol, 15ml Antioxidant, 10ml LDS Sample Buffer olmalıdır. Kit, büyük ve orta boyutlu proteinlerin ayrımını yapmak için dizayn edilmiş olmalıdır. Teklif veren firmanın yetkili satıcı olduğuna dair yetki belgesi bulunmalıdır. Protein Ladder (LC5602) Teknik Özellikleri SDS Page çalışmaları için uygun olmalıdır. Range aralığı 20 to 220 kda olmalıdır. Unstained özellikte olmalıdır. 250 ul ambalajında olmalıdır. Bolt Bis-Tris Plus Gels, Novex Tricine Gels, Novex Tris-Glycine Gels, NuPAGE Bis-Tris Gels, NuPAGE Tris-Acetate Gels, SDS-PAGE Jelleri ile kullanıma uygun olmalıdır. Teklif veren firmaların yetkili satıcı belgelerini de teklifleri ile birlikte iletmeleri gerekmektedir. RIPA Lysis Buffer System (sc-24948) Teknik Şartnamesi Ürün memeli hücre ve dokularından liziz yapabilmeli. Ürünün açıklamasında liziz çözeltisinin NP-40 veya Triton X-100 'den daha güçlü denatüre etme özelliğine sahip olduğu açıkça belirtilmelidir. Ünün 500 ml olmalı ve -20 o C de saklama koşuluna sahip olmalıdır Ürün proteaz inhibitörleri ile birlikte kullanıma hazır olarak teslim edilmelidir. Ürünün içeriğinde; 1 adet 500 ml 1X lysis buffer 1 adet 5 ml (200mM) PMSF in DMSO 1 adet 5 ml protease inhibitor cocktail in DMSO 1 adet 5 ml (100mM) sodium orthovanadate sulu çözeltisi bulunmalıdır. 6/8

7 Ürünün sayfasında en az 4 atıf olmalıdır. Firma yetkili distribütörlük belgesine ya da yetkili satış belgesine sahip olmalıdır. Transfer Stack (IB401031) Teknik Şartnamesi Membran tipi PVDF membran olmalıdır. Por büyüklüğü 0,2 mikron olmalıdır. Ürün 3 X 10 setten oluşmalıdır. Transfer stackla birlikte tüm membranlara yetecek kadar (toplamda 60 mini membran) hostu rabbit olan Chemiluminescent Kit verimelidir. Bu kit içeriğinde; blocking solusyon, primer antikor dilüent, kullanıma hazır chemiluminescent substrate, yıkama solüsyonları, inkübasyon kabı bulunmalıdır. Ürün oda sıcaklığında saklanabilmelidir. Teklif veren firmanın yetkili satıcı olduğuna dair yetki belgesi bulunmalıdır. IL-1 Beta Human ELISA Kit (KHC0011) Teknik Şartnamesi süpernatantları ve serum gibi örnek türlerinde kullanıma uygun olmalıdır. Çalışmada kullanılan örnek miktarı 50 μl olmalıdır. Kitin ölçüm aralığı: pg/ml olmalıdır. Kitin hassasiyet değeri: 1 pg/ml olmalıdır. Testin inkübasyon süresi 180 dakikayı geçmemelidir. Absorbanslar 450 nm de okutulmalıdır. IL-6 Human ELISA Kit (KAC1261) Teknik Şartnamesi süpernatantları, plazma ve serum gibi örnek türlerinde kullanıma uygun olmalıdır. Çalışmada kullanılan örnek miktarı 100 μl olmalıdır. Kitin ölçüm aralığı: pg/ml olmalıdır. Kitin hassasiyet değeri: 2 pg/ml olmalıdır. Testin inkübasyon süresi 145 dakikayı geçmemelidir. Absorbanslar 450 nm de okutulmalıdır. IL-12 Human ELISA Kit (KHC0121) Teknik Şartnamesi süpernatantları, plazma ve serum gibi örnek türlerinde kullanıma uygun olmalıdır. Çalışmada kullanılan örnek miktarı 50 μl olmalıdır. Kitin ölçüm aralığı: pg/ml olmalıdır. Kitin hassasiyet değeri: <2 pg/ml olmalıdır. Testin inkübasyon süresi 180 dakikayı geçmemelidir. Absorbanslar 450 nm de okutulmalıdır. TNF Alfa Human ELISA Kit (KHC3011) Teknik Şartnamesi süpernatantları, plazma ve serum gibi örnek türlerinde kullanıma uygun olmalıdır. Çalışmada kullanılan örnek miktarı 100 μl olmalıdır. Kitin ölçüm aralığı: pg/ml olmalıdır. 7/8

8 Kitin hassasiyet değeri: <1.7 pg/ml olmalıdır. Testin inkübasyon süresi 220 dakikayı geçmemelidir. Absorbanslar 450 nm de okutulmalıdır. VEGF Human ELISA Kit (BMS277-2) Teknik Şartnamesi süpernatantları, plazma ve serum gibi örnek türlerinde kullanıma uygun olmalıdır. Çalışmada kullanılan örnek miktarı 50 μl olmalıdır. Kitin ölçüm aralığı: ,000 pg/ml olmalıdır. Kitin hassasiyet değeri: 7.9 pg/ml olmalıdır. Absorbanslar 450 nm de okutulmalıdır. TBARS Assay (STA-330) Teknik Şartnamesi Kit 200 testlik orijinal olmalıdır. TBARS assayleri lipid peroksidasyonunun taranması ve izlenmesi işlemini gerçekleştirmelidir. Cam tüp veya cam mermere bağımsız çalışabilmelidir ve standart polipropilen tüplerinde reaksiyonlar yapabilmelidir. MDA, tiyobarbitürik asit ile 1: 2'lik bir adükt oluşturmalıdır. Assay kolorimetrik veya florimetrik çalışmalarda kullanılmaya uygun olmalıdır. Teklif veren firma yetki belgesini sunmalı ve bunu belgelemelidir. 8/8