Akraba evliliğinin SNP bazlı hücre dışı DNA test sonuçlarına etkisi

Transkript

1 Akraba evliliğinin SNP bazlı hücre dışı DNA test sonuçlarına etkisi Olgu 1, B.A., 43 y, G2 P1 Y1 İleri anne yaşı hddna Prader Willi Send. riski (FF: %5) hafta sonografisi : Normal (NT:1.2 mm) 1. derece kuzen evliliği CVS: DP + HK: Karyotip, PWS FISH: NORMAL Mikroarray: 15. kromozomun q11.2q12 bölgesinde yaklaşık 3.6 Mb boyutunda SNRPN genini de (Prader Willi sendromu ilişkili gen) içeren 18 gen bölgesinde heterozigotluk kaybı (Loss Of Heterozygosity:LOH) UPD (uniparental dizomi) olasılığı göz önünde bulundurularak metilasyon analizi yapıldı ve NORMAL sonuç alındı.

2 SNP bazlı hddna analizi: Sonuç PWS için yanlış pozitifliğin sebebi: hddna testi olarak SNP (single nukleotid polimorfizm) bazlı tekniğin kullanılması Akraba evliliklerinde DNA bölgeleri benzer SNP özellikleri gösterir, Bu durum LOH bölgelerinin artmasına yol açar Akraba evliliği olan çiftlerin gebeliklerinde SNP bazlı hddna testinin tercih edilmesi ÖNERİLMEZ.

3 Tüm ekzom sekanslamanın prenatal tanıya katkısı Olgu 2; G.B., 29 y, G2 P0 A1 27 (-) GH USG;Perimembranöz outlet VSD, ARSA, hipoplazik Timus, Sol CL AS: Karyotip, DGS için FISH ve mikroarray analizi NORMAL Fetal kraniyal MRG: IK yapılar NORMAL TBX1 geni ve DiGeorge sendromunun ayırıcı tanısındaki diğer nadir tek gen sendromlarının araştırılması amacıyla prenatal WES/Klinik Ekzom önerildi.

4 WES sonucu: CHARGE sendromu & BOR sendromu (OD) CHARGE S. ilişkili CHD7 geninde heterozigot c.6070c>t[p.arg2024*] ve BOR S. ilişkili EYA1 geninde heterozigot c.229c>t[p.arg77*] nonsense mutasyon Gebelik terminasyonu önerildi Fizik muayene 33+ GH (Postmortem); Boy :46 cm Tartı:2490 gr OFC:33 cm Geniş burun kökü, kısa burun, antevert burun delikleri, bulböz burun ucu, geniş kolumella, solda (non-midline) ala nazi sınırına ulaşan yarık dudak, bilateral kulaklar küçük, kare şeklinde, bilateral heliksler medialde düzleşmiş ve 2 adet çentik mevcut. Antiheliksler dar açılı (15-20 ) ve kalın, traguslar hipoplazik, kulak lobülleri hipoplazik ve öne dönük (cupped ears). Solda heliks ön yüzünde pit mevcut. Ellerde Bilateral hockey çizgisi ve 5. parmaklarda klinodaktili, kare şeklinde el ayaları.

5 Sonuç: WES in prenatal tanıda önemi Prenatal USG incelemesinde multiple anomali saptanan fetuslarda karyotip ve mikroarray analizleri normal sonuçlandığında WES/Klinik ekzom tekniği tek gen hastalıklarının tanısında önemli katkı sağlamakta, birden fazla tek gen hastalığının bir test ile tanısı konulabilmekte ve prenatal süreçte ailelere kesin ve doğru genetik danışma verilebilmektedir.

6 Prenatal mikrodelesyon sendromlarının taranmasında hddna nın yeri: del22q11.2 (DGS) Sendromu Olgu 3; B.K.G., 40 y, G1 25. GH USG; ARSA, timus hipoplazik, IAY hddna del22q11.2 için yüksek risk (FF: %4.8) CVS: Karyotip&FISH&Mikroarray del22q11.2 Olgu 4; G.M., 29 y, G1 10. GH USG; NT: 6 mm hddna del22q11.2 için yüksek risk (FF: %9.3) 14 (-) GH USG; TR, Fallot tetralojisi, NT:2.7 mm CVS: Karyotip+FISH del22q11.2

7 Prenatal mikrodelesyon sendromlarının taranmasında hddna analizi önerilmeli mi? 22q11.2 mikrodelesyon sendromu için noninvaziv testlerin yakalamadaki başarısı oldukça yüksektir, Hastalığı taramadaki başarısı yüksek olsa da, tanı testi olarak kullanılmadığı unutulmamalıdır USG de bulgu saptanan hastalarda invaziv test ve tanıya yönelik girişim mutlaka önerilmelidir.

8 İkiz gebeliklerde diskordan fetal anomali varlığında zigosite tayininin önemi Olgu 5; B.U.T, 35 y, G2 P1 21 (-) haftalık spontan dikoryonik diamniyotik ikiz gebelik 1. fetüste polihidramniyoz, normal fetal anatomi 2. fetüste polihidramniyoz, geniş VSD, aort koarktasyonu, timüs hipoplazik Fetüslerin cinsiyeti erkek Her iki fetüse AS: 1. fetüste karyotipleme normal 2. fetüste FISH de del22q11.2 (DiGeorge S.) 1. fetüste de FISH analizi: del22q11.2 Monozigosite tayini amacıyla STR analizi ile fetüslerin monozigotik olduğu gösterildi. Prognoz anlatılarak gebeliğin terminasyonu önerildi. Fetüslerin postmortem bulguları DiGeorge Sendromu ile uyumlu bulundu. Anne ve baba DGS açısından normaldi (%8-10 ailevi). Delesyonun de novo olduğu gösterildi

9 İkiz gebeliklerde diskordan fetal anomali varlığında zigosite tayininin önemi: Sonuç Monozigotik ikiz gebeliklerde erken postzigotik değişiklikler (mitotik non allelik homolog rekombinasyon), mozaisizme ve fenotipik varyasyonlara neden olabilmektedirler. OD kalıtım gösteren durumlarda ekspresivite değişkenliği olabilir. Diskordan fetal anomali varlığında cinsiyetler aynı ise, zigosite tayini mutlaka önerilmeli ve fenotipik varyasyonlar olabileceği bilinmelidir.