1. Dönem İSTİNYE ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ KÖK HÜCRE VE DOKU MÜHENDİSLİĞİ TEZLİ YÜKSEK LİSANS PROGRAMI DERS İÇERİKLERİ

Transkript

1 İSTİNYE ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ KÖK HÜCRE VE DOKU MÜHENDİSLİĞİ TEZLİ YÜKSEK LİSANS PROGRAMI DERS İÇERİKLERİ 1. Dönem Erişkin Kök Hücre Biyolojisi (5 AKTS) Bu derste yetişkin bireylerde bulunan Mezenkimal Kök Hücreler, Hematopoietik Kök Hücreler ve daha da farklılaşmış olan unipotent kök hücrelerin karakteristik özellikleri, etkili hücre içi yolakları, farklılaşması anlatılacaktır. Ek olarak bu hücrelerin izolasyon, karakterizasyon, kültür ve farklılaştırma işlemleri anlatılacaktır. Temel Hücre Kültürü ve Aseptik Teknikleri (5 AKTS) Hücre kültürü laboratuvarlarına girişte uyulması gereken kurallardan, laboratuvardaki cihazların içeriği ve kullanımına, aseptik şartlarda hücre kültüründen, farklı hücre kültürü tekniklerine kadar konunu tüm içeriği, uygulama ağırlıklı olarak, önce yap, sonra düzelt metodu ile verilecektir. İleri Hücre Biyolojisi (5 AKTS) Hücre çekirdeğinden zarına dek tüm hücre içi yapılar ayrıntıları ile ele alınacaktır. Aynı zamanda DNA dan hücrelerarası alana dek fonksiyon gösteren önemli sinyal mekanizmaları yüksek lisans seviyesinde işlenecektir. Doku Mühendisliğinde Yapı İskeleleri (5 AKTS) Doku mühendisliğinde kullanılan hücrelerin tutunmasına yarayan tüm kalıp (scaffold) tipleri, özellikleri, hangi durumlarda kullanıldıkları işlenecektir. Ayrıca bunlardan kök hücreler ile uyumlu olarak doku mühendisliğinde kullanılabilme yöntemleri tartışılacaktır. Yüksek Lisans Tez Danışmanlığı I (1 AKTS) Öğrencinin ilgi alanını da dikkate alarak danışmanı ile birlikte görüşmelerin gerçekleştirilmesi. Literatür çalışmalarının tez konusunu dikkate alarak yapılması. Nihai tez konusunun planlanması. Yüksek Lisans Uzmanlık Alan Dersi I (4 AKTS) Tez çalışmasına hazırlanan öğrencinin tezi ile ilgili konularda temel bilgilerinin aktarılmasını takiben tezine hakim olmasını, tezini yürütmesine, mali açıdan takibine, deneylerin yapılmasına, sonuçların yorumlanmasına, raporlanmasına, tez haline getirilmesine ve yayın sürecinde rol almasına dair konularda öğrencilerin eğitilmesi ve tez konusunda ait malzeme temininin sağlanması.

2 SEÇMELİ DERSLER Klinik Kök Hücre Uygulamaları I (5 AKTS) Kök hücrelerin klinik alanda hangi branşlarda ne şekilde kullanıldığı, avantaj ve dezavantajları ile incelenecek, dünyadaki iyi ve kötü örnekler etik yönleri ile ele alınacaktır. Dersin birinci dönemki kısmı Ortopedi, Dermatoloji ve Plastik Cerrahi alanlarına yönelik planlanmıştır. Moleküler Biyolojik Teknikler I (5 AKTS) Moleküler biyolojik analizlerde kullanılan yöntemlerden PCR, elektroforez, RT-PCR, sekanslama gibi DNA ve RNA temelli analiz yöntemleri üzerinde durulacaktır. Ders hem teorik hem uygulama aşamalarını kapsamaktadır. Biyobozunur & Biyouyumlu Polimerler (5 AKTS) Bu derste doku mühendisliğinde kullanılan polimerik biyomaddeler incelenecektir. Biyouyumlu ve biyobozunur polimerik iskelet (scaffolds) yapıları, örneğin poli(laktik asit) ve poli(glikolik asit) gibi poli(α-hidroksi esterler), bu polimerlerin porözlük dereceleri, bozunma kimyaları ve fabrikasyonları bu derste işlenecektir. 3-boyutlu doku rejenerasyonu için gerekli polimerik kriterler, enjeksiyonlanabilir polimerler, kollajen-benzeri nanofibröz polimer iskeletler, kemik oluşumunu tetikleyen polimerler, kıkırdak oluşumunu tetikleyen polimerler, kemik yapı mühendisliğinde kullanılan polimer/inorganik faz nanokompozitler, polimerik vasküler yapılar, miyokard doku mühendisliğinde kullanılan polimerik biyomaddeler, böbrek doku mühendisliğinde kullanılan polimerler, diğer organ mühendisliklerinde kullanılan polimerler bu ders içeriği arasında olacaktır. Temel Hematoloji, İmmunoloji ve Kemik İliği Transplantasyonu (5 AKTS) Derste öncelikle hücrelerin immünogenetik özelliklerinden başlanarak hücresel ve humoral bağışıklığa ilişkin konular ele alınacaktır. Ardından temel hematoloji bilgisi verilerek hematopoietik kök hücreler, ilişkili hastalıklar ve kemik iliği nakli konularına değinilecektir. 3 Boyutlu Doku Mühendisliği - I (5 AKTS) Üç boyutlu hücre kültür yöntemleri ile başlanarak, hücrelerin scaffoldlar üzerine ekilerek doku mühendisliği çalışmaları yapılması ile ilgili bilgiler verilecektir. Ardından 3B yazıcılar ve bunların doku mühendisliği uygulamaları üzerinde durulacaktır. Teorik eğitim ile birlikte 3D laboratuvarında uygulamalar yaptırılacaktır. İleri Mikroskopi Teknikleri (5 AKTS) Kök hücre analizlerinde en önemli yöntem olan mikroskobik inceleme, farklı mikroskop çeşitlerinin tanıtımı ve kullanılması konularının ardından mikroskobi ile ilgili tekniklerin kök hücrelerde uygulaması ile sürdürülecektir. Ders sonunda öğrencilerin tüm yaygın mikroskop tipleri ile hücre analiz etmeyi öğrenmiş olmaları. Temel Polimer Kimyası (5 AKTS) Bu derste polimerlerin genel yapısı, polimerleşme süreçleri ve doku mühendisliğinde kullanılan polimerik malzemeler temel hatları ile incelenerek özellikle sağlık temelli kişilerin polimer kimyası, biyokimyasal süreçleri ve polimerlerin kullanım alanları konusunda bilgilenmesi sağlanacaktır.

3 Biyoistatistik (2 AKTS) Bilimsel araştırmanın temel bileşeni olan istatistik ile sağlık alanında kullanılan biyoistatistik uygulamaları öğretilecektir. Çalışma planlanması, örnek sayısının belirlenmesi gibi işlemler de dersin kapsamında yer almaktadır. İstatistik hesaplamaları için en yaygın kullanılan programlar olan Microsoft Excel ile SPSS programlarının da kullanımı anlatılacaktır. 2. Dönem Pluripotent Kök Hücreler (5 AKTS) Sadece embriyoda bulunan Embriyonik Kök Hücreler ile farklı yöntemlerle oluşturulan uyarılmış Pluripotent Kök Hücreler gibi kök hücre tiplerinin karakteristik özellikleri, etkili hücre içi yolakları, farklılaşması anlatılacaktır. Ek olarak bu hücrelerin elde edilme veya oluşturulma yöntemleri, karakterizasyon, kültür ve farklılaştırma aşamaları ele alınacaktır. Seminer (2 AKTS) Öğrencinin tez konusu ile ilgili topladığı literatürlerin derlenmesi ve sunulmasından oluşan bir derstir. Öğrenci dönem boyunda yaptığı çalışmaları dönem sonunda bölüme sunum yapar. Ek olarak seminer kitapçığı hazırlayarak Enstitüye teslim eder. Doku Mühendisliği ve Uygulamaları (5 AKTS) Bu derste kök hücreler kullanılarak yapılan mevcut doku mühendisliği örnekleri kullaılan malzemeler, hücre tipi ve yöntemi ile incelenecektir. Ayrıca öğrenciler dilerlerse kendi fikirleri doğrultusunda laboratuvarda doku mühendisliği uygulamaları gerçekleştirilebilecektir. Bilimsel Araştırma Teknikleri ve Yayın Etiği (3 AKTS) Ders kapsamında doğru bir bilimsel araştırma için gerekli süreçler adım adım ele alınacak, doğru ve yanlış bilimsel araştırma örnekleri verilecek ve deneyler öncesi, sırası ve sonrasındaki aşamalarda karşılaşılan problemler ve çözüm yolları ele alınacaktır. Son olarak bilimsel araştırmaların yayınlanmasında uyulması gereken etik kurallar ile bunların ihlallerine ilişkin örnekler üzerinde durulacaktır. Yüksek Lisans Tez Danışmanlığı II (1 AKTS) Öğrencinin ilgi alanını da dikkate alarak danışmanı ile birlikte görüşmelerin gerçekleştirilir. Tez konusunu dikkate alarak literatür analizi yapılır. Nihai tez konusunun planlanarak tez önerisi hazırlanır. Yüksek Lisans Uzmanlık Alan Dersi II (4 AKTS) Tez çalışmasına hazırlanan öğrencinin tezi ile ilgili konularda temel bilgilerinin aktarılmasını takiben tezine hakim olmasını, tezini yürütmesine, mali açıdan takibine, deneylerin yapılmasına, sonuçların yorumlanmasına, raporlanmasına, tez haline getirilmesine ve yayın sürecinde rol almasına dair konularda öğrenciler eğitilir. Son aşamada tez başvuru formu hazırlanır.

4 SEÇMELİ DERSLER Biyomedikal Malzemeler (5 AKTS) Doku mühendisliğinde kullanılan yapı malzemelerinden, bunların üretildiği ve test edildiği cihazlara kadar geniş kapsamlı olarak biyomedikal malzemeler kimyasal, fiziksel ve biyolojik yönleri ile incelenecek, ayrıca kök hücrelerle ilişkili kullanılan cihazlar ve bunların kullanım şekilleri ele alınacaktır. 3 Boyutlu Doku Mühendisliği - II (5 AKTS) 3B biyoyazıcılar üzerinde durulacak olan derste, yazıcıların çalışma prensibinden, biyomürekkeplere, 3B doku tasarım ve modellemesinden baskı işlemlerine kadar tüm teorik bilgiler verilecek, ek olarak 3B biyoyazıcılarda uygulama yapılacaktır. Klinik Kök Hücre Uygulamaları II (5 AKTS) Kök hücrelerin klinik alanda hangi branşlarda ne şekilde kullanıldığı, avantaj ve dezavantajları ile incelenecek, dünyadaki iyi ve kötü örnekler etik yönleri ile ele alınacaktır. Dersin ikinci dönemki kısmı Kardiyoloji, Genel Cerrahi ve Nöromusküler dejeneratif hastalıklar konusuna odaklıdır. Moleküler Biyolojik Teknikler II (5 AKTS) Moleküler biyolojik analizlerde kullanılan yöntemlerden immünohistokimya, immünflorasan boyamalar, ELISA ve western blot gibi protein/antijen ağırlıklı analiz yöntemleri üzerinde durulacaktır. Ders hem teorik hem uygulama aşamalarını kapsamaktadır. Araştırma Planlama ve Uygulama (5 AKTS) Bu dersi alan öğrenciler kök hücre alanında yapılabilecek araştırma konularının kapsamını öğrenecek ve ilgilendikleri konuda makale analizinden pratik uygulamalara kadar analiz ve ön deneme yapma şansına sahip olacaklardır. Bu ders kapsamında öğrencilerin dönem sona ermeden tez konularını şekillendirmeleri hedeflenmektedir. 3. Dönem Yüksek Lisans Tez Danışmanlığı III (4 AKTS) Öğrencinin tezi ile ilgili olarak ihtiyaç duyduğu bilgilerin danışmanı tarafından sağlandığı derstir. Yüksek Lisans Uzmanlık Alan Dersi III (6 AKTS) Öğrencinin tez projesi ile ilgili süreçlerin yürütüldüğü, ihtiyaç duyulan bilimsel ve uygulamalı konuların işlendiği derstir. Tez Projesi I (20 AKTS) Öğrencin tez konusu ile ilgili literatür analizine devam ederken danışmanı gözetiminde uygulamalı tez çalışmalarını yürütür.

5 4. Dönem Yüksek Lisans Tez Danışmanlığı IV (4 AKTS) Öğrencinin tezi ile ilgili olarak ihtiyaç duyduğu bilgilerin danışmanı tarafından sağlandığı derstir. Yüksek Lisans Uzmanlık Alan Dersi IV (6 AKTS) Öğrencinin tez projesinin yürütülmesi ve tamamlanması ile ilgili işlemlerin yürütüldüğü, ihtiyaç duyulan bilimsel ve uygulamalı konuların işlendiği derstir. Tez Projesi II (20 AKTS) Öğrencin tez konusu ile ilgili literatür analizine devam ederken danışmanı gözetiminde uygulamalı tez çalışmalarını yürütür ve tamamlar.