KONGRE BAŞKANI DÜZENLEME KURULU

Transkript

1

2 KONGRE BAŞKANI Prof. Dr. Sebahattin ÖZCAN Ankara Üniversitesi DÜZENLEME KURULU Prof. Dr. Mehmet KARATAŞ Düzenleme Kurulu Başkanı Prof. Dr. Dilek TURGUT BALIK Düzenleme Kurulu Başkan Yardımcısı Doç. Dr. Ekrem DÜNDAR Düzenleme Kurulu Başkan Yardımcısı SEKRETERYA Arş. Gör. Muhammet DOĞAN Arş. Gör. Buğrahan EMSEN

3 BİLİM KURULU Prof. Dr. Leyla AÇIK Prof. Dr. Burhan ARIKAN Prof. Dr. Dilek TURGUT BALIK Prof. Dr. Fevzi BARDAKÇI Prof. Dr. Rıza BASHIROV Prof. Dr. Hikmet BUDAK Prof. Dr. Kemal BÜYÜKGÜZEL Prof. Dr. Özer ÇINAR Prof. Dr. Zeynep PETEK ÇAKAR Prof. Dr. Naci DEĞERLİ Prof. Dr. Zihni DEMİRBAĞ Prof. Dr. Yusuf TURAN Prof. Dr. İsa GÖKÇE Prof. Dr. Kemal GÜVEN Prof. Dr. İbrahim IŞILDAK Prof. Dr. Nejdet KANDEMİR Prof. Dr. Sabire KARAÇALI Prof. Dr. Zeki KAYA Prof. Dr. Muhsin KONUK Prof. Dr. Feray KÖÇKAR Prof. Dr. Sebahattin ÖZCAN Prof. Dr. Hasan ÖZDEMİR Prof. Dr. Şaban TEKİN Prof. Dr. Sezai TÜRKEL Prof. Dr. Ahmet YILDIRIM Doç. Dr. Mikail AKBULUT Doç. Dr. Yüksel BÖLEK Doç. Dr. Ekrem DÜNDAR Doç. Dr. Ayşe FİLİZ GÜREL Doç. Dr. Atilla KARŞI Doç. Dr. Ahmet KOÇ Doç. Dr. İskender PARMAKSIZ Doç. Dr. Turgay ÜNVER Gazi Üniversitesi Çukurova Üniversitesi Adnan Menderes Üniversitesi Doğu Akdeniz Üniversitesi Sabancı Üniversitesi Bülent Ecevit Üniversitesi Uluslararası Saraybosna Üniversitesi İstanbul Teknik Üniversitesi Cumhuriyet Üniversitesi Karadeniz Teknik Üniversitesi Dicle Üniversitesi Ege Üniversitesi Orta Doğu Teknik Üniversitesi Afyon Kocatepe Üniversitesi Ankara Üniversitesi Atatürk Üniversitesi Uludağ Üniversitesi Erciyes Üniversitesi Sütçü İmam Üniversitesi İstanbul Üniversitesi Mississippi State University İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü Çankırı Karatekin Üniversitesi

4 SÖZLÜ BİLDİRİ ÖZETLERİ

5 Glioblastoma Multiforme Beyin Tümörleri İçin İlaç İletiminde Kullanılabilecek Aptamerlerin Geliştirilmesi Abdullah Tahir Bayraç*,1,2,3, Hüseyin Avni Öktem 2,Weihong Tan 3 1 Biyomühendislik Bölümü, Mühendislik Fakültesi,, 70100, Karaman, Türkiye 2 Biyoteknoloji Bölümü, Nanobiyoteknoloji Ar&Ge Grubu, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, 06531, Ankara,Türkiye 3 Shands Cancer Center, University of Florida, Gainesville, Florida , United States *tahirbayrac@gmail.com Özet Bu çalışmada glioblastoma multiforme yi özel olarak tanıyan aptamer probları negatif seçilim yapılmadan tekrarlı hücre SELEX i temelli bir prosedürün kullanılmasıyla oluşturulmuştur. Seçilim sonrasında 454 sekanslama teknolojisi SELEX yöntemini izlemek için, biyoenformatik araçlar ise yüksek kapasiteli verilerden yararlanılarak aptamerleri tanımlamak için kullanılmıştır. Özellikle hedef hücreye bağlanabilen ve nanomolar düzeyinde ayrılma sabitine (Kd) sahip bir grup aptamer üretilmiştir. Seçilen aptamerler glioblastoma hücre hattına ait farklı türlere yüksek bağlanma eğilimi gösterirken, diğer kanser hücre hatlarına az ya da hiç bir bağlanma göstermemektedir. Bu çalışmada üretilen aptamerler glioblastoma hücreleri için moleküler işaretleyici keşfi için araç olmanın yanı sıra teşhis için kullanılan prob ve hedeflenmiş ilaç dağıtımı gibi farklı uygulama alanlarında kullanılma potensiyeline sahiptirler. Anahtar Kelimeler: DNA Aptamer, Cell-SELEX, Glioblastoma, Kanser, İlaç İletimi Development of Aptamers for Targeted Drug Delivery to Glioblastoma Multiforme Brain Tumors Abstract In this study aptamer probes for specific recognition of glioblastoma multiforme were generated using a repetitive and broad cell-selex-based procedure without negative selection. The 454 sequencing technology was used to monitor SELEX, and bioinformatics tools were used extensively to identify aptamers from high throughput data. A group of aptamers were generated that can bind to target cells specifically with dissociation constants (Kd) in the nanomolar range. Selected aptamers showed high affinity to different types of glioblastoma cell lines, while showing little or no affinity to other cancer cell lines. The aptamers generated in this study is used as tools in some applications. First of all they were used as recognition elements for their specific target in microscopy. They displayed a distinct binding on their target with observable microscopy images. Also preliminary experiments are carried out with a selected aptamer to be used as drug delivery vehicle. Keywords: DNA Aptamer, Cell-SELEX, Glioblastoma, Cancer, Doxorubicin 57