Solunum Sistemi Mikrobiyotası. Dr. Haluk Türktaş Gazi Üniversitesi Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı Ankara

Transkript

1 Solunum Sistemi Mikrobiyotası Dr. Haluk Türktaş Gazi Üniversitesi Göğüs Hastalıkları Anabilim Dalı Ankara

2 NIH Human Microbiome Project (2007)

3 Microbial communities in healthy controls and asthmatic airways Markus Hilty PLoS ONE 2010:5; Bacteroides 2. Streptococcus 3. Veilonella 4. Neisseria 5. Haemophilus

4 1- Üst solunum yolu mikrobiyotası ile alt solunum yolu mikrobiyotası aynı mıdır? 2- Alt solunum yollarının örneklenmesi için uygun yöntem hangisidir?

5 Topographical Continuity of Bacterial Populations in the Healthy Human Respiratory Tract Charlson ES. Am J Respir Crit Care Med 2011:184;

6 Analysis of the Upper Respiratory Tract Microbiotas as the Source of the Lung and Gastric Microbiotas in Healthy Individuals Bassis CM. mbio 2015:6;e

7 Analysis of the Upper Respiratory Tract Microbiotas as the Source of the Lung and Gastric Microbiotas in Healthy Individuals Bassis CM. mbio 2015:6;e

8 Comparison of the Respiratory Microbiome in Healthy Nonsmokers and Smokers Morris A Am J Respir Crit Care Med 2013:187;

9 Üst solunum yolu mikrobiyotasının bronkoskopik örnek mikrobiyotasına etkisi Lancet 2014:23; 384(9944):

10 Bassis CM. mbio 2015:6;e

11 1. Alt solunum yolları mikrobiyotası üst solunum yolları mikrobiyotasına büyük oranda benzerlik göstermekle birlikte farklılıklar da mevcuttur 2. Alt solunum yollarında bakteri yükü ve diversity çok daha düşüktür 3. Alt solunum yollarının örneklenmesinde bronş lavajı ve fırçalama uygun bir yöntemdir

12 Ecological determinants of the respiratory microbiome PLOS Pathogens 2015

13 Sağlıklı kişilerde, astım ve KOAH da solunum yolları mikrobiyotası (en sık görülen yedi genera) Markus Hilty PLoS ONE 2010:5;8578

14 Solunum sistemi mikrobiyotası Astım KOAH Bronşektazi Kistik fibrozis İPF Patogenez Prognoz Fenotipler Ataklar Tedaviye yanıt

15 Maternal antibiyotik kullanımı Çevresel mikroplarla karşılaşma Yaşanan ortam Çiftlik Şehir astım patogenezi Diversity Kardeş sayısı Evde hayvan besleme Temizlik alışkanlıkları Emzik Bulaşık vb Microbiota 0 12 ay Doğum şekli Vaginal Sezaryen Hastanede Evde Neonatal antibiyotik kullanımı Bebeğin beslenmesi Anne sütü Formula Ek gıda Disbiozis

16 Early life enviroment and potential microbial exposures Living environment Mode of birth Animal or pet keeping Antibiotic use Breast feeding Respiratory infections Shaping of gut microbiome Immune system development Shaping of airway microbiome? Asthma and/or Allergy Curr Allergy Asthma Rep 2013:13;

17 Airway Microbiota in Severe Asthma and Relationship to Asthma Severity and Phenotypes Zhang Q. PLoS ONE 2016:11(4): e

18 Features of the bronchial bacterial microbiome associated with atopy, asthma and responsiveness to inhaled corticosteroid treatment Durack J J Allergy Clin Immunol 2016 in press

19 Features of the bronchial bacterial microbiome associated with atopy, asthma and responsiveness to inhaled corticosteroid treatment Durack J J Allergy Clin Immunol 2016 in press

20 Features of the bronchial bacterial microbiome associated with atopy, asthma and responsiveness to inhaled corticosteroid treatment Durack J J Allergy Clin Immunol 2016 in press

21 Potentially Pathogenic Airway Bacteria and Neutrophilic Inflammation in Treatment Resistant Severe Asthma Benjamin J. Green. PlosOne 2014:9; tedaviye dirençli astımlı hastanın onyedisi Moraxella catarrhalis, Haemophilus, Streptococcus ile kolonize

22 Lung microbiome dynamics in COPD exacerbations Wang Z. Eur Respir J 2016; 47: Stable state Exacerbation Two weeks post-therapy Six weeks recovery

23 Lung microbiome dynamics in COPD exacerbations Wang Z. Eur Respir J 2016; 47: B: bacterial V: viral E: eosinophilic BE: bacterial and eosinophilic BV: bacterial and viral Pauci: pauci-inflammatory

24 The Role of Bacteria in the Pathogenesis and Progression of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Molyneaux PL. Am J Respir Crit Care Med 2014:190;

25 The Role of Bacteria in the Pathogenesis and Progression of Idiopathic Pulmonary Fibrosis Molyneaux PL. Am J Respir Crit Care Med 2014:190;

26 Microbial Diversity Microbial Load Inflammatory Triggers Viral infection Allergic exposure Toxic inhalation Air pollution Dysbiosis Microbial metabolites Inflammation Increased nutrient density Increased temperature Local anoxic zones Selective growth promotion Selective killing and clearance Increased mucus production Vascular permeability Catecholamines Inflammatory cytokines Free ATP Inflammatory cell recruitment and activation Lancet 2014:23; 384: , Ann Am Thorac Soc 2014:11;