Doğu Anadolu Kırmızısı Melez Sığırlarda Prolaktin Geni Polimorfizmi 1

Benzer belgeler
T.C SELÇUK ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ. Selçuk KAPLAN YÜKSEK LİSANS TEZİ ZOOTEKNİ ANABİLİM DALI

I. Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri İvesi Koyunlarında mikrosatellite lokuslarında polimorfizmin tespiti Güneydoğu Anadolu Tarımsal Araştı

ZOOTEKNİ BÖLÜMÜ. Araş. Gör. Ertuğrul KUL

Detection of Akirin 2 Gene Polymorphism with PCR-RFLP Method in Some Cattle Breeds Reared in Turkey

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ DERGİSİ Journal of Faculty of Veterinary Medicine, Erciyes University

Niyazi DEMİRCİ 1, Bilal AKYÜZ 2!

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

Türkiye de Yetiştirilen Anadolu Mandalarında Butirofilin (BTN1A1) Gen Polimorfizminin HaeIII Restriksiyon Enzimi ile Araştırılması

TÜRKİYE DE BULUNAN BAZI YERLİ SIĞIR IRKLARININ GENETİK YAPILARININ KARAKTERİZASYONU

Yasemin ÖNER * Murat PULLU * Oya AKIN ** Cengiz ELMACI *

YERLİ SIĞIR IRKLARINDA MYOSTATİN GENİNE AİT III. EKZON BÖLGESİNİN NT 821(DEL11) POLİMORFİZMİ BAKIMINDAN KARŞILAŞTIRILMASI

Türkiye de Yetiştirilen Holştayn ve Bazı Yerli Sığır Irklarında Citrullinemia Allelinin Belirlenmesi

Doğu Anadolu Kırmızısı ve Melezi Sığırların Büyüme Hormonu Geni Genetik Varyasyonunun İncelenmesi

Prof.Dr. Recep AYDIN

Domuz Ayrığı (Dactylis glomerata L.) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi

A8. Kul, E., Erdem, H., Relationships Between Somatic Cell Count and Udder Traits in Jersey Cows. J. Appl. Anim. Res. 34 (2008):

RESEARCH ARTICLE. Türkiye de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması

ARAŞTIRMA MAKALESİ. Türkiye de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması. DOI: /EurasianJVetSci.2016.

HLA Tiplendirmesi PCR-SSP. Türker Duman PhD

Anahtar Kelimeler: Kalıtsal hastalık, miyofosforilaz, RFLP, Şarole

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

ANKARA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ YÜKSEK LİSANS TEZİ

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Esmer ve Siyah Alaca Irkı Sığırlarda Bazı Ekonomik Özellikler ile İlişkili Gen Bölgelerinin PCR-RFLP Tekniği ile İncelenmesi

Afyon Kocatepe Üniversitesi Veteriner Fakültesi Zootekni Anabilim Dalı, Afyonkarahisar 2

Türkiye de Yetiştirilen Esmer ve Siyah Alaca Sığırlarda Süt Verimi, İlk Buzağılama Yaşı ve Servis Periyodu *

Siyah Alaca Sığırlarda Kuruda Kalma Süresi, Servis Periyodu ve İlkine Buzağılama Yaşı ile Bazı Süt Verim Özellikleri Arasındaki İlişkiler

Mandalarda Alyuvar Potasyum Polimorfizmi Üzerine Bir Araştırma

Prof.Dr. Recep AYDIN

İvesi Koyunlarında Mitokondriyal 16S rrna Gen Bölgesi Polimorfizmlerinin PCR-RFLP Yöntemiyle İncelenmesi

Siyah Alaca Sığırlarda Kısmi Süt Verimlerinden Yararlanılarak 305 Günlük Süt Veriminin Tahmini

Sığırların Verim Özellikleri Üzerine Etkili Önemli Moleküler Markörler

ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

Agaroz jel elektroforezi

Bornova Tipi Keçilerde Kan Proteinleri Polimorfizmi ile Bazı Süt Verim Özellikleri Arasındaki İlişkiler *

İstatistiki Bölge Birimleri Sınıflamasına Göre Düzey 2 (TRA1 ve TRA2) Bölgelerinde Büyükbaş Hayvan Varlığı ve Süt Üretiminin Karşılaştırılması

FIRAT ÜNİVERSİTESİ/VETERİNER FAKÜLTESİ/ZOOTEKNİ VE HAYVAN BESLEME BÖLÜMÜ/VETERİNERLİK GENETİĞİ ANABİLİM DALI)

FIRAT ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ/ZOOTEKNİ (DR) (VETERİNER)

Doç.Dr. Bilal AKYÜZ ÖZGEÇMİŞ DOSYASI

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

Doç.Dr. Yasemin ÖNER. Biyometri ve Genetik Anabilim Dalı ÖĞRENİM DURUMU. GÖREVLER Görev Unvanı Görev Yeri Yıl

Araş. Gör. Şeniz ÖZİŞ ALTINÇEKİÇ

M. Kerem ÇALGIN 1, Fikret ŞAHİN 1, Melike ATASEVER 2, Deniz KÖKSAL 2, Djursun KARASARTOVA 1, Mehmet KIYAN 1. AÜTF Tıbbi Mikrobiyoloji ABD 2

Ezgi KARA*, Murat ÇİMEN**, Servet KAYA*, Ümit GARİP*, Mehmet ŞAHİNSOY*

KAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA

KRONİK BÖBREK HASTALIĞI (YETMEZLİĞİ) OLAN TÜRK HASTALARINDA TÜMÖR NEKROZ FAKTÖR ALFA ve İNTERLÖKİN-6 PROMOTER POLİMORFİZMLERİNİN ETKİSİ

Konuklar Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Esmer Sığırların Döl Verim Özellikleri *

ESMER SIĞIRLARDA ÇEŞİTLİ FORM ÖZELLİKLERİNİN KALITIMI VE İLK LAKTASYON SÜT VERİMİ İLE İLGİSİ

SNP TEK NÜKLEOTİD POLİMORFİZMLERİ (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)

DOĞU ANADOLU KIRMIZISI SIĞIRLARINDA TRANSFERRİN VE HEMOGLOBİN POLÎMRFİZMÎ ÜZERİNE BİR ARAŞTIRMA

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

Hakan ÇETİN Atakan KOÇ

Comparison of Adaptation Levels of Cultural Cattle in Kahramanmaras Province in Terms of Insurance Claims Compensation


Farklı Kondisyon Puanlarına Sahip Simmental Irkı Sığırlardan Elde Edilen Sütlerin AB Standartlarına Uygunluğunun Belirlenmesi

Journal of Cell and Molecular Biology 12(1&2): 39-45, 2014 Research Article 39 Haliç University, Printed in Turkey.

Ankara Keçisi Oğlaklarının Büyüme Özelliklerine Bazı Çevre Faktörleri ile Amilaz ve Transferrin Tiplerinin Etkisi

MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI

FIRAT ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ/ZOOTEKNİ (DR) (VETERİNER)

Türkiye Yağlı Kuyruklu Koyun Irklarında DNA Parmak Đzinin RAPD-PCR Yöntemi Kullanılarak Saptanması

Esmer Irk Sığırlarda Süt Verim Özelliklerine İlişkin Genetik Yönelim Unsurlarının ve Genetik Korelasyonun Tahmini

Siyah Alaca neklerde Süt Protein Polimorfizminin Geneti i ve Süt Verim Özellikleriyle liflkisi

ARAŞTIRMA. 2008: 22 (5): Nihat YILDIZ 1 Selami AYGEN 2 Mahiye ÖZÇELİK 3

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

GENETİK POLİMORFİZMLER. Prof. Dr. Filiz ÖZBAŞ GERÇEKER

Türkiye Süt Sığırcılığında Islah ve Destekleme Politikalarının Bölgesel Etkileri Üzerine Bir Araştırma

Hayvansal Üretim 49(2): 1-6, 2008 Araştırma Makalesi

SİYAH ALACA SIĞIRLARDA 305 GÜNLÜK SÜT VERİMİ ÜZERİNE ETKİLİ FAKTÖRLERİN PATH ANALİZİ İLE İNCELENMESİ

Siyah Alaca İneklerde Yağ, Protein, Toplam ve Yağsız Katı Madde Verimleri Üzerine Etkin Faktörler ve Bu Verimlere Ait Kalıtım Derecesi Tahminleri

Parkinson Hastalığı ile α-sinüklein Geni Polimorfizmlerinin İlişkisinin Araştırılması

Siyah Alaca Sığırlarda Kısmi Süt Verimlerinden Yararlanılarak 305 Günlük Süt Verimini Tahmin Etme İmkanları *,1

Genom analizi için belirteç olarak kullanılan DNA dizileri

SİYAH ALACA SIĞIRLARDA LAKTASYONUN İLK 10 GÜNÜNDE SÜTÜN BİLEŞİMİNDE MEYDANA GELEN DEĞİŞİM

FEN EDEBİYAT FAKÜLTESİ MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK BÖLÜMÜ

T.C. SELÇUK ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

İzmir İli Bal Arısı (Apis mellifera L.) Populasyonlarında Enzim Polimorfizmi*

REKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL

Prof.Dr. Bilal AKYÜZ

2.KAYNAK ÖZETLERİ. 2.1 Sığır Lökosit Adhezyon Yetersizliği (BLAD)

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ DERGİSİ Journal of Faculty of Veterinary Medicine, Erciyes University

Doğu Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsünde Yetiştirilen Siyah Alaca Buzağılarda Büyüme Performansı ve Yaşama Gücü

KARADENİZ BÖLGESİNDEN SEÇİLEN BAZI KIRMIZI AHUDUDU (Rubus ideaus L.) TİPLERİNİN GENETİK FARKLILIĞININ RAPD TEKNİĞİ İLE BELİRLENMESİ

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

GÖKHÖYÜK TARIM İŞLETMESİNDE YETİŞTİRİLEN SİYAH ALACA SIĞIRLARIN SÜT VE DÖL VERİM ÖZELLİKLERİ 1. SÜT VERİM ÖZELLİKLERİ

Farklı Irk ve Farklı Ağırlıktaki Sığırların Sütlerinde Yağsız Kuru Madde Değerlerinin Belirlenmesi

HAFTA III Bağlantı, Asosiyasyon, Haritalama

Research Article / Araştırma Makalesi GENOTYPING AND ANALYSIS OF rs POLYMORPHISM FOR PROSTATE CANCER

16S rrna Analizi. Doç. Dr. Zeynep Ceren KARAHAN. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Öğr. Gör. Tuğba GÜLEÇ

Kahverengi Yumurtacı Saf Hatların Yumurta Verim Özellikleri Bakımından Seleksiyonu. Selection for Egg Production Traits in Purebred Brown Egg Layers

Clarias gariepinus (Burchell, 1822) un İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması

112 Araştırma Makalesi. Comparison of Some Body Measurements of South Anatolian Red and Native Southern Yellow Cattle*

Yrd. Doç. Dr. Yüksel AKSOY

PCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi

Populasyon Genetiği. Populasyonlardaki alel ve gen frekanslarının değişmesine neden olan süreçleri araştıran evrimsel bilim dalı.

Sarımsaklı Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah-Alaca Irkı Süt Sığırlarının Döl Verim Özellikleri

Şanlıurfa Yöresi Halep Keçilerinde Mitokondriyal 12S rrna Gen Sekansına Göre Filogenetik Analizler

LAKTASYON VE SÜT VERİMİ

Dr. Öğretim Üyesi Yüksel AKSOY

Transkript:

Atatürk Üniv. Ziraat Fak. Derg., 46 (2): 119-123, 2015 Atatürk Univ., J. of the Agricultural Faculty, 46 (2): 119-123, 2015 ISSN : 1300-9036 Araştırma Makalesi/Research Article Doğu Anadolu Kırmızısı Melez Sığırlarda Prolaktin Geni Polimorfizmi 1 Zeynep SÖNMEZ Memiş ÖZDEMİR Atatürk Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Zootekni Bölümü, 25240 Erzurum, Türkiye Geliş Tarihi : 04.03.2015 Kabul Tarihi :24.06.2016 ÖZET : Bu çalışmada, yerli Doğu Anadolu Kırmızısı melezi sığırlarında Prolaktin genine ait polimorfik bölgeler PCR-RFLP yöntemiyle incelenmiş ve bölgelere ait gen ve genotip frekansları belirlenmiştir. Analizde 5 UTR bölgesi için HaeIII, 4.ekzon bölgelesi için RsaI restriksiyon enzimleri kullanılmıştır. PCR-RFLP analizi sonucunda PRL geni 5 UTR bölgesinde populasyon monomorfik bulunmuştur. PRL geni 4.ekzon bölgesinde AA, AB ve BB genotip frekansları melez populasyonda sırasıyla 0.49, 0.44. ve 0.07 olarak tespit edilmiştir. Prolaktin geni 4. ekzon RsaI polimorfizm bölgesinde populasyonun Hardy-Weinberg dengesinde (p>0.05) olduğu görülmüştür. Anahtar Kelimeler: Prolaktin, Polimorfizm, DAK melezi, PCR-RFLP. Polymorphism of Prolactin Gene in the East Anatolian Red Crosbreds ABSTRACT : In this study, in the native East Anatolian Red Crosbreds, different polymorphic site of Prolactin gene was examined by PCR- RFLP method and the gene and genotype frequencies were determined. In the analysis of 5 UTR, we used HaeIII while RsaI restriction enzyme for exon 4. PCR-RFLP analysis was resulted with monomorphic genotype for 5 UTR in the population. AA, AB and BB genotype frequencies in exon 4 were 0.49, 0.44 and 0.07 for crosbreeds EAR. In RsaI polymorphic site of the prolactin exon 4 the population was in the H-W equilibrium (p>0.05). Keywords: Prolactin, Polymorphism, EAR Crosbred, PCR-RFLP. GİRİŞ Moleküler genetik teknolojilerindeki gelişmelerle birlikte çiftlik hayvanlarında verimi etkileyen genetik yapıyı tanımlamada özellikle genetik kaynak olarak kullanılabilen populasyonların belirlenebilmesi ve tanımlanmasında kullanılan, koruma programlarında kolaylık sağlayan moleküler düzeyde markır olarak adlandırdığımız genetik belirteçlerin tanımlanmasıyla Markır Destekli Seleksiyon (MAS = Marker Assisted Selection) programlarında kullanılmak üzere farklı moleküler belirteçler ve her bir belirtecin moleküler düzeyde tanımlanmasını sağlayan çeşitli moleküler genetik yöntemler geliştirilmiştir (Öner vd. 2011). Süt verimi üzerinde etkili olduğu bilinen Prolaktin (PRL) hormonu beynin ön pitiutari bezi (hipofizin ön lobu) tarafından salgılanan çok fonksiyonlu bir polipeptitdir. PRL geni 23. kromozom üzerinde (Hallerman vd., 1987) 10 kb uzunluğunda 5 ekzon ve 4 intron bölgesi içerir (Camper vd., 1984). 30 u sinyal amino asiti 199 aktif amino asit olmak üzere toplam 229 amino asit sentezler (Cao vd., 2002; Bachelot and Binart 2008). Prolaktin, hipofiz bezinin ön lobu tarafından salgılanan iç salgı hormonu olmasının yanı sıra bağışıklık hücreleri tarafından da üretilir (Orbach ve Shoenfeld, 2007). Prolaktin için hedef organ meme bezidir, burada gelişimi ve diferansisyonu uyarır (Schradin ve Pillay, 2004). Kandaki yüksek düzeyleri, overlerde steroid sentezini ve hipofizer gonadotropinlerin sentez ve sekresyonlarını inhibe eder. Süt salgısını uyarmasının yanı sıra büyüme, üreme, ozmoregülasyon, immünoloji, cinsel bezlerin gonadotropin salgılamasını, böbreklerden su, sodyum ve potasyum atılması, laktasyonun başlaması ve devamlılığı aynı zamanda, meme bezi büyümesi ve laktogenezisten sorumludur (Horseman vd., 1997; Semprini vd., 2012). Erkeklerde fizyolojik dozlarda normal testesteron üretiminin devamlılığına katkıda bulunur, sperm motilitesini ve fertiliteyi etkileme gibi 300'den fazla etkiye sahiptir (Horseman vd., 1997). PRL geni üzerinde yapılan polimorfizm çalışmaları RsaI kesim bölgesi üzerinde yoğunlaşırken, incelenen varyantların frekans dağılımı çalışmalar arasında farklılık göstermektedir (Miceikiene vd., 2006; Akyüz vd. 2012). Çeşitli sığır ırkları ve Bufalolar üzerinde PRL gen polimorfizminin incelendiği çalışmaların bazıları Çizelge 1 de verilmiştir. Yaptığımız bu çalışmada Türkiye de Doğu Anadolu Bölgesinde yaygın şekilde yetiştiriciliği yapılan Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK) Melezi sığırlarında PRL gen lokusunun PCR-RFLP yöntemi kullanılarak Prolaktin genine ait polimorfik gen bölgeleri incelenmiş ve gen ve genotip frekansları belirlenmiştir. 1 Bu makale, Zeynep SÖNMEZ tarafından hazırlanan Doğu Anadolu Kırmızısı ve Melezi Sığırlarda Prolaktin Geni Polimorfizmi başlıklı yüksek lisans tezinden üretilmiştir.

Doğu Anadolu Kırmızısı Melez Sığırlarda Prolaktin Geni Polimorfizmi Çizelge 1. Çeşitli Irklara ait Prl geni polimorfizmi PRL 5 UTR Bölgesi Kaynak Irk A B N Sonuç Ladani vd. (2003) Jaffarabad - 1.0 94 - Mehsani Surti Bufaloları Madnalwar vd. (2010) Pandharpuri Bufaloları - 1.0 50 - Sharifi vd. (2010) Najdi sığırı 0.57 0.43 84 - Tabar vd. (2010) İran Bufaloları 1.0-85 - PRL/RsaI Polimorfizmi 4. ekzon Bölgesi Kaynak Irk A B N Sonuç Dybus (2002) Siyah-Alaca 0.86 0.14 1086 AA genotipi lehine Süt verimiyle ilişki. Dybus vd. (2005) Siyah-Alaca 0.85 0.15 427 Yağ verimi ile ilişki Jersey 0.31 0.69 Miceikiene vd. (2006) Litvanya süt ırkı sığırları 0.87 0.13 396 Sütte yağ oranı ile ilişki. Alipanah vd. (2008) Rusya Siyahı Rusya Kırmızısı 0.71 0.29 170 Süt verimi ve süt yağı ile ilişki. Kepenek (2007) GAK DAK 0.66 0.34 191 Süt verimi ile ilişki. Yerli Kara Bozırk Holstein 0.56 0.86 0.44 0.14 Wojdak vd. (2008) Holstein-Friesian 0.58 0.42 720 Süt verimi ve süt yağı ile ilişki. Öztabak vd. (2008) DAK 0.56 0.44 Süt verimi ile ilişki. GAK 0.74 0.26 Kumari vd. (2008) Ekzotik ırklar (Holstein Friesian 0.77 0.23 501 - Jersey), Zebu ırkları 0.67 0.33 Ghasemi vd. (2009) Montebeliard inekleri 0.63 0.37 120 Süt verimi ile ilişki. Kaplan ve Boztepe İsviçre Esmeri 0.82 0.18 75 - (2010) Anadolu Mandası 1.0 - - Sodhi vd. (2011) Hindistan yerli ırkları 0.52 0.48 936 - Vikas vd. (2012) Frieswal süt inekleri 0.63 0.370 54 Laktasyon süresi ile ilişki Verma vd. (2012) Hindistan Murrah bufaloları 0.93 0.07 150 - Alfonso vd. (2012) Amerikan Swiss ırkı süt sığırı 0.88 0.12 417 Süt verimi ile ilişki. Akyüz vd., (2012) Boz ırk DAK Yerli Kara GAK Esmer İsviçre Holstein 0.58 0.73 0.86 0.42 0.27 0.14 259 - MATERYAL VE METOD Erzurum ve Artvin illerine ait bazı çevre köylerde yetiştirilen birbiriyle ilişkisiz 57 baş DAK Melezi sığır materyal olarak kullanılmıştır. Genomik DNA, ticari DNA izolasyon kiti (Purgene DNA kiti (Gentra Systems, Minnesota, USA)) ile elde edilmiştir. Elde edilen DNA ların çoğaltılması amacıyla PCR uygulamalarına geçmeden önce, DNA nın kalitatif ve kantitatif kontrolleri %2 lik agaroz jel elektroforezi ile yapılmıştır. Analizde 5 UTR bölgesi PRL/HaeIII Forward: 5 -CCC TAG GGG AGA CCT TTG ATC ACC-3. Revers:5 -GGA AGT GGA GAG CTG CCA AGC A-3, 4.ekzon bölgesi PRL/RsaI Forward:5'- TTC ATG AAG CTG CTC ACC TG-3,Revers:5'- TTG ATT CTT GGG TTG CTG CG-3 primerleri, Primer3 programı (Rozen and Skaletsky 2000) ile tarafımızdan dizayn edilmiş (NCBI GenBank dizilimi giriş no: AB098480 ve AF426315) ve kullanılmıştır. PCR amflifikasyonu için toplam hacim 20 µl ye tamamlanacak şekilde yaklaşık 50-100 ng genomik 120

Z. Sönmez, M.Özdemir DNA, Buffer (ph:8.5) 5.0µl (10X), F Primer; 10 pmol/µl, R Primer; 10 pmol/µl, MgCl 2; 1.2 µl, Taq; 0.5-1.0 ünite, dntp; 2.5µl alınarak ddh 2 O ile birlikte toplam hacim 20 µl e tamamlanmıştır. İncelenen PRL geni bölgelerine ilişkin PCR döngü koşulları denatürasyonun ilk adımında 94 C de 5 dak. 1 döngü, 2.denatürasyon 30 döngü olmak üzere 5 UTR ve 4. ekzon bölgelerinde sırası ile 94 C de 45 sn, 30 sn, annealing sıcaklıkları 58 C de 45 sn, 61 C de 48 sn; ilk uzama sıcaklıkları 72 C de 45 sn, ve 40 sn; son uzama sıcaklıkları 72 C de 5 dak ve 1 döngü olarak programlanmıştır. Amplifikasyonu gerçekleşen her bir örnekten yaklaşık 8-10 µl lik kısım 0,2 ml lik steril ependorf tüplere konularak, üzerine 2-5 Ü ilgili bölge için restriksiyon enzimi, 2-5 µl RE tamponu, 5 µl ddh 2 O ilave edilmiş ve sonra üzeri 10-15 µl mineral oil ile kapatılmıştır. Daha sonra etüve yerleştirilerek 37 C de 12 saat süreyle inkübasyon işlemi gerçekleştirilmiştir. İncelenen DAK Melez sığırların PRL lokusu allel gen ve genotip frekansları ile genotip frekanslarına ait H-W genetik denge testi için GenAlEx 6.5 (Peakall and Smouse, 2012) programı kullanılmıştır. BULGULAR VE TARTIŞMA PRL geninin 5 UTR bölgesine ait 432 bp lik PCR ürünün HaeIII enzimi ile kesilmesi sonucu tüm populasyon monomorfik bulunmuştur. 4. ekzon bölgesi 210 bp lik PCR ürününün RsaI enzimi ile kesime uğratılması sonucu 210,120, 90 bp (AA, AB, BB) olmak üzere üç bant elde edilmiştir. Restrüksiyon enzimlerinin tanıma ve kesim bölgeleri ile bant büyüklükleri Çizelge 2 de verilmiştir. Çizelge 2. Prolaktin geni polimorfik bölgelerinde kullanılan restrüksiyon enzimleri ve bant büyüklükleri Bölge RE PCR ürünü Tanıma Bölgesi Beklenen Genotip ve Bant (bç) (5 3 ) Büyüklüğü (bç) AA=432 5 UTR HaeIII 432 GG^CC BB=243,189 AB=432, 243, 189 Ekzon 4 RsaI 210 GT^AC AA=210 BB=120, 90 AB=210, 120, 90 PCR-RFLP analizi sonucunda PRL geni 5 UTR bölgesinde 57 örneğin tamamı monomorfik bulunmuştur. PRL geni RsaI kesim bölgesinde AA, AB ve BB genotip frekansları populasyonda sırasıyla 0.49, 0.44. ve 0.07 olarak tespit edilmiştir. İncelenen melez populasyonda 4.ekzon bölgesi A alleli gen frekansı 0.71 olarak hesaplanmıştır (Çizelge 3). Çizelge 3. DAK Melezi Sığırlarda PRL/RsaI polimorfizmine ait genotip ve allel frekansları. PRL/RsaI polimorfizmi Genotip Allel Frekansı AA AB BB A B 0.49 0.44 0.07 0.71 0.29 PRL geni RsaI polimorfizmini belirlemek için farklı ırklarla daha önce yapılan çalışmalarda Alipanah vd. (2008) Rusya Siyah Alaca ve Kırmızı süt sığır ırklarında, Wojdak vd. (2008) Holsteinfriesian süt ineklerinde, Sharifi vd. (2010) Najdi sığırlarında, Rorie vd. (2009) Holstein Friesian, Jersey ve Zebu sığırlarında, Miceikienė vd. (2006) Lithuanian sığır ırkında,vikas vd. (2012) Frieswal süt ineklerinde, Verma vd. (2012) Hindistan Murrah bufalolarında,sodhi vd. (2011) Hindistan yerli inek ırklarında (Bos indicus), Alfonso vd. (2012) American Swiss ırkında, Boleckova vd. (2012) Çek Fleckvieh sığırında, Kaplan ve Boztepe (2010), Anadolu Mandası ve İsviçre Esmeri ırklarında, Ghasemi vd. (2009) Montebeliard ineklerinde, Dybus vd. (2005), Siyah-Beyaz Alaca ve Jersey ırklarında, Dybus (2002), Holstein süt ineklerinde yapılan çalışma dahil olmak üzere PRL polimorfizmini belirlemek için yapılmış olan çalışmaların tümünde A allel frekansı yüksek, B allel frekansı düşük oranda bulunmuştur ve bulgularımız ile uyum içinde olduğu görülmüştür. 5 UTR bölgesinde bulunan 432 bç lik bölge, populasyon genelinde monomorfik ve BB genotipi şeklinde görülmüştür. PRL polimorfizmini belirleme çalışmalarında Madnalwar vd. (2010) Pandharpuri Buffalolarında polimorfizme rastlamamış, Tabar vd. (2010), İran Bufaloları üzerinde yaptıkları çalışmada bütün örnekleri monomorfik AA genotipinde bulmuşlardır. Ladani vd. (2003), Mehsani ve Surti Bufalolarının monomorfik yapıda olduğunu bildirirken, Jaffarabadi bufalosunun kesim bölgesine sahip olduğunu ve diğer Bufalo ırklarından ayrıldığını bildirmişlerdir. 121

Doğu Anadolu Kırmızısı Melez Sığırlarda Prolaktin Geni Polimorfizmi Saf yetiştirilen DAK ırkı PRL/RsaI polimorfizmi bölgesinde PRL geni polimorfizmini belirlemek için daha önce yapılan çalışmalarda (Kepenek 2007; Öztabak vd. 2008; Akyüz vd. 2011) A allel frekansı yüksek, B allel frekansı düşük olarak bildirilmiş ve incelenen Melez popülasyonun benzer sonuçlar verdiği gözlenmiştir. Çizelge 4. PRL bölgelerine ait Genotip Frekansları ve Genetik Denge Testi Bölge Ekzon 4 Gözlenen Beklenen H-W N (X 2 ) AA AB BB AA AB BB 45 22 20 3 23 18 4 Yapılan Hardy-Weinberg genetik denge testine göre, DAK Melez popülasyonunun 4.ekzon bölgesi itibariyle genetik olarak dengeye ulaştığı görülmektedir (p>0.05). SONUÇ Çalışmada elde edilen sonuçlar, bölgede mevcut DAK ırkından kan almış popülasyonların Prolaktin polimorfizminin boyutlarını ortaya koyması yönünden yeterli sayılabilir. Ancak, sonraki araştırmalarda, daha geniş sayıda örnekleme yaparak araştırmanın tekrarlanmasına ve Prolaktin geni polimorfik yapıları ile hayvanların çesitli verim özellikleriyle ilişkilendirmeler yaparak çeşitli verim yönlerinde ıslah amacıyla kullanılabilecek çalışmaların yapılmasına ihtiyaç duyulmaktadır. TEŞEKKÜR Bu çalışma Atatürk Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeler Fonu (Proje no: 2011/335) tarafından desteklenerek yürütülmüştür. Atatürk Üniversitesi BAP kuruluna teşekkürlerimizi sunarız. KAYNAKLAR Akyüz, B., Ağaoglu, K.Ö., Ertuğrul, O., 2012. Genetic polymorphism of kappa-casein, growth hormone and prolactin genes in Turkish native cattle breeds. International Journal of Dairy Technology,65 (1): 38-44. Alfonso, E., Rojas, R., Herrera, J. G., Ortega, M. E., Lemus, C., Ruiz, J., Pinto, R. Gomez, H., 2012. Polymorphism of the prolactin gene (PRL) and its relationship with milk production in American Swiss cattle. African Journal of Biotechnology, 11 (29) : 7338-7343. Alipanah, M., Kalashnikova, L. A., Rodionov, G. V., 2008. Kappa-casein and PRL-RsaI genotypic frequencies in two russian cattle breeds. Journal of Animal and Veterinary Advances, 6 (6) :813-815. Bachelot, A., Binart, N., 2008. Reproductive role of prolactin. Society for Reproduction and Fertility, Doi: 10.1530/REP-06-0299 Boleckova, J., Matejickova, J., Stipkova, M., Kyselova, J., Barton, L., 2012. The association of five polymorphisms with milk production traits in Czech Fleckvieh cattle. Institute of Animal Science, 57 (2): 45 53 Camper, S. A., Luck, D. N., Yao, Y. W., Ychik, R.P., Goodwin, R. G., Lyons, R. H., Rottman, F. M., 1984. Characterization of the bovine PRL-Rsa I gene. DNA. Liebertpublishers, 3 (3): 237-249. Cao, X.,Wang, Q.,Yan, J. B., Yang, F. K., Huang, S. Z., Zeng, Y. T., 2002. Molecular cloning and analysis of bovine prolactin full-long genomic as well as cdna sequences. Yi. Chuan Xue. Bao.29(9):768-773. Dybus, A., 2002. Associations of growth hormone (GH) and prolactin (PRL) genes polymorphisms with milk production traits in Polish Black-and-White cattle.animal Science, 20 ( 4) : 203-212 Dybus, A., Grzesiak, W., Kamieniecki, H., Szatkowsk, I., Sobek, Z., Blaszczyk, P., Czerniawska, P., E., Zych, S., Muszynska, M., 2005. Association of genetic variants of bovine prolactin with milk production traits of Black-and- White and Jersey cattle. Archives of Animal Breed, 48 (2): 149-156 Ghasemi, N., Zadehrahmani, M., Rahimi, G., Hafezian, S.H., 2009. Associations between prolactin gene polymorphism and milk production in montebeliard cows. International Journal of Genetics and Molecular Biology, 1 (3) : 048-051, Hallerman, E. M., Nave, A., Kashi, Y., 1987. Restriction fragment length polymorphisms in dairy and beef cattle at the growth hormone and PRL-Rsa I loci. Animal Genetics,18: 213-222. Horseman, N. D., Zhao, W., Rodriguez, E. M., Tanaka, M., Nakashima, K., Engle, S. J., Smith, F., Markoff, E., Dorshkind, K., 1997. Defective mammopoiesis, but normal hematopoiesis, in mice with a targeted disruption of the prolactin gene. The Embo Journal, Doi:10.1093/emboj/16.23.6926 Kaplan, S., Boztepe, S., 2010. The determination of prolactin gene polymorphism using PCR-RFLP method within indigenous Anatolian Water Buffalo and Brown Swiss, 2 nd International Symposium on Sustainable Development, 8-9, 2010, Sarajevo, 168-173. Kepenek, E. Ş., 2007. Polymorphism of Prolactin (Prl), Diacylglycerol Acyltransferase (DGAT-1) and Bovine Solute Carrier Family 35 Member 3 (Slc35a3) genes in native cattle breeds and its implication for Turkish cattle breeding.a master Thesis, Biological Science Department, Middle East Technical University, Ankara Kumari, A. R., Singh, K. M., Soni, K. J., Patel, R. K., Chauhan, J. B., Sambasiva, R. K., 2008. Genotyping of the polymorphism within exon 3 of prolactin gene in various dairy breeds by PCR RFLP. Arch. Tierz., Dummerstorf,51(3):298-299 122

Z. Sönmez, M.Özdemir Ladani, D. D., Pipalia, D. L., Brahmkshtri, B. P., Rank, D. N., Joshi, C. G., Vataliya, P. H. and Solanki, J. V., 2003. PCR-RFLP polymorphism at prolactin locus in buffaloes. Buffalo Journal, 2: 237-242. Madnalwar, V. S., Sawane, M. P., Pawar, V. D., Patil, P. A., Fernandis, A. P., Bannalikar, A. S., 2010. Genotyping The Prolactın Gene In Pandharpuri Buffaloes by PCR- RFLP. Department of Animal Genetics and Breeding, Parel Mumbai, India. 29:2. Miceikiene, I., Peciulaitiene, N., Baltrenaite, I., Skinkyte, R., Indriulyte, R., 2006. Association of cattle genetic markers with performance traits. Biologija, 1:24-29. Orbach, H., Shoenfeld, Y., 2007. Hyperprolactinemia and autoimmune diseases. Autoimmun Reviews. 537-542 Öner, Y., Pullu, M., Akın O., Elmacı C., 2011. Bursa Bölgesinde Yetiştirilen İsviçre Esmeri ve Siyah Alaca Irkı Sığırlarda Beta Laktoglobulin (β-lg) ve Büyüme Hormonu (bgh) Gen Polimorfizmlerinin HaeIII ve MspI Restriksiyon Enzimleri Kullanılarak İncelenmesi. Kafkas Univ Vet. Fak. Derg. 17 (3): 371-376 Öztabak, K., Ün, C., Tesfaye, D., Akis, I., Mengi, A., 2008. Genetic polymorphisms of osteopontin (OPN), prolactin (PRL) and pituitary-specific transcript factor-1 (PIT-1) in South Anatolian and East Anatolian Red cattle. Acta Agriculturael Scand Section A, 58: 109112 ISSN 0906-4702 Taylor ve Francis Peakall, R., Smouse, P. E., 2012. GenAlEx 6.5: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics28, 2537-2539. Rozen, S., Skaletsky H. J., 2000. Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers. In Bioinformatics Methods and Protocols: Methods in Molecular Biology, pp 365 386. Krawetz S, Misener S, eds. Totowa, NJ, USA: Humana Press, Source code available at http://fokker.wi.mit.edu/primer3/. Accessed 27 04 2005. Rorie, R. W. Howland, E.M., Lester, T. D. E, 2009. Evaluation of a Polymorphism in the Prolactin Gene as a Potential Genetic Marker for Mastitis Susceptibility and Milk Production. Arkansas, Department of Animal Science http://arkansasagnews. uark.edu/1356.htm Schradin, C., Pillay, N., 2004. The striped mouse (Rhabdomys pumilio) from the succulent karoo, South Africa: a territorial group-living solitary forager with communal breeding and helpers at the nest. Journal of Comparative Psychology,118, 37 47 Semprini, S., McNamara, A. V., Awais, R., Featherstone, K., Harper, C. V., McNeilly, J. R., Patist, A., Rossi, A. G., Dransfield, I., McNeilly, A. S., Davis, J. R. E., White, M. R. H., Mullins, J. J., 2012. Peritonitis activates transcription of the human prolactin locus in myeloid cells in a humanized transgenic rat model. Endocrinology, Doi:10.1210/en.2011-1926. Sharifi, S., Roshanfekr, H., Khatami, S. R., Mirzadeh, K. H., 2010. Prolactin Genotyping of Najdi Cattle Breed Using PCR- RFLP, Journal of Animal and Veterinary Advances, 9 (2), 281-283 Sodhi, M., Mukesh, M., Mishra, B. P., Parvesh, K., Joshi, B. K., 2011. Analysis of genetic variation at the prolactin-rsai (PRL-RsaI) locus in Indian native cattle breeds (Bos indicus). Biochemical Genetics, 49(1-2):39-45. Tabar, Y. S., Fayazi, J., Roshanfekr, H., Mirzadeh, K., Sadr, A. S., 2010.Investigation of prolactin polymorphism in buffalo population of Khuzestan Iran by PCR-RFLP. Journal of Animal and Veterinary, 9(2): 284-286 Verma, A., Gupta, I. D., Gandhi, R. S., 2012. Genetıc polymorphısm in exon 3 of prolactın gene in Indian Murrah Buffaloes. Wayamba Journal of Animal Science, ISSN: 2012-578X; 2012 Vikas, M., Parmar, S. N. S, Thakur, M. S., Gurudutt, S., 2012. Association of prolactin gene polymorphism with milk production traits in Frieswal cattle. Journal of Animal Research, 2(2): 173/177 Wojdak, M. K., Kmic, M., Strzalak, J., 2008. Prolactin gene polymorphism and somatic cell count in dairy cattle. Journal of Animal and Veterinary Advances, 7(1): 35-40. 123