I.DENEYSEL SİNİRBİLİM YÖNTEMLERİ KURSU 3-25 NİSAN 2017 AZİZ SANCAR DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ SİNİRBİLİM ANABİLİM DALI İSTANBUL ÜNİVERSİTESİ İSTANBUL, TÜRKİYE İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Ünitesi Katkılarıyla
Sevgili Meslektaşlarımız Organizasyon komitesi olarak bu yıl 3-26 Nisan 2017 tarihleri arasında ilkini düzenleyeceğimiz 1. Deneysel Sinirbilim Yöntemleri Kursuna sizleri davet etmekten onur duyarız. Ülkemizde son yıllarda önemi giderek artan sinirbilimin gelişimine katkıda bulunmak, temel ve güncel yöntemler konusunda bu alanda çalışanlara ve ilgi duyanlara bilgi aktarımına yardımcı olmak temel hedeflerimiz. Bu kursumuzda 3 temel alanda eğitim modülü hazırladık. Bu modüller sırası ile Temel Hücre Kültürü Teknikleri ve Primer Nöron Kültürü Kursu, Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik Kursu ve Teorik ve Uygulamalı Nöroimmünoloji Kursu dur. Hedefimiz ilerdeki yıllarda sinirbilim ile ilgili alt çalışma alanlarını genişletmek ve içeriğini daha da zenginleştirmektir. Sizlerden alacağımız geri dönüşler ve istekler bu konuda bizlere yol gösterecektir. Sınırlı sayıda katılımın olacağı bu kursumuzun sizler için yeterli ve keyifli olmasını diler, İstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar DETAE, Sinirbilim AD, organizasyon komitesi olarak sevgi ve saygılarımızı sunarız. Prof. Dr. Erdem TÜZÜN
Organizasyon Komitesi ABACI Neslihan ÇAKİRİS Aris DURSUN Erdinç EKMEKÇİ Sema Sırma EMRENCE Zeliha GEZEN-AK Duygu KÜÇÜKALİ Cem İsmail ORHAN Nurcan PAÇAL Ferda Perçin ULUSOY Canan Aysel YILMAZ Vuslat YILMAZ Canan Uğur Bilimsel Komite ABACI Neslihan, Doç. Dr. ERGÜL Emel, Doç. Dr. EKMEKÇİ Sema Sırma, Doç. Dr. DURSUN Erdinç, Doç. Dr. GEZEN-AK Duygu, Doç. Dr. KÜÇÜKALİ Cem İsmail, Yrd. Doç. Dr. ÖZKÖK Elif, Prof. Dr. TÜZÜN Erdem, Prof. Dr. YILMAZER Selma, Prof. Dr. Kurs Sekreteri YILMAZ Canan Uğur
Kurs Sekreter Asistanları Ece AKBAYIR Melis ŞEN BİLİMSEL KONULAR Nörogenetik Hücre Kültürü Primer Nöron Kültürü Nöroimmünoloji ÖNEMLİ TARİHLER Kurs Adı Kurs Sorumlusu KDV Dahil Fiyat Kurs Tarihi Öğrenci Uzman Teorik ve Uygulamalı Nöroimmünoloji Prof. Dr. Erdem Tüzün 400 TL 600 TL 3-8 Nisan 2017 Temel Hücre Kültürü ve Primer Nöron Kültürü Yrd. Doç. Dr. Cem İsmail Küçükali 750 TL 1000 TL 17-21 Nisan 2017 Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik Prof. Dr. Elif Özkök 300 TL 500 TL 24-25 Nisan 2017 Ön Kayıt : Kurslara katılım kontenjanla sınırlıdır. Ön kayıt mail yolu ile yapılacaktır. Bu safhadaki değerlendirmede başvuru sırası esas alınacaktır. Olumlu yanıt alanlar kayıt döneminde ilgili hesaba parasını yatırıp, dekontu mail yolu ile gönderecektir. Ön kayıt dönemi 15 Mart 2017 tarihinde başlayacak olup, her bir kurs için başlangıç tarihinin 5 gün öncesine kadar devam etmektedir.
Kayıt : Kayıt için olumlu yanıt alanlar 25 Mart 2017 tarihinden itibaren kurs ücretlerini ilgili hesaba yatırıp dekontlarını mail ile göndereceklerdir. Kayıt her bir kurs için, kursun ilk gününe kadar devam etmektedir. Ödeme Şekilleri: İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi, Aziz Sancar DETAE, Sinirbilim AD veya Halk Bankası Beyazıt Şubesi, Hesap No: 06200407 IBAN:TR060001200982000006200407 NOT:Banka yolu ile kayıt yapanlar açıklama kısmına ilgili kursu yazıp, dekontu mail ile yollayacaktır. Sertifika Dağıtımı: Her Kursun Son Günü (Sınavları geçenler BAŞARI, geçemeyenler ise KATILIM sertifikası alacaklardır.) YER İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi, DETAE Sinirbilim AD, İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD., Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Laboratuvarı DİL Türkçe İLETİŞİM BİLGİLERİ Telefon: (0212)4142000/33321 Mail: sinirbilimyontemlerikursu@gmail.com Teşekkür: Kursumuzun hazırlığında, tanıtımında ve yapılmasında katkıda bulunan İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Ünitesi ne, Nöroimmunoloji Derneği ne ( NiMDER), Medsantek ve Molgen firmalarına katkılarından dolayı teşekkür ederiz.
Teorik ve Uygulamalı Nöroimmünoloji Kurs Programı
1.GÜN (3 Nisan 2017 Pazartesi) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-09.10 Açılış Prof. Dr. Erdem TÜZÜN 09.10-10.00 İmmünohistokimya (IHK) Teorik Eğitim Nöroimmünolojik Hastalıklar ve Otoantikorların Tanısal Önemi İHK Genel Bakış / Uygulamalar ve Genel Protokol Epitop Açığa Çıkarma Non-spesifik Boyamanın Önlenmesi Dondurulmuş Dokuda Çalışm Parafinli Dokuda Çalışma Hücrelerle Çalışma İF Genel Bakış / Uygulamalar ve Genel Protokol Ko-lokalizasyon Prof. Dr. Erdem TÜZÜN 10.00-10.15 Kahve arası 10.15-13.00 Uygulama Deparafinizasyon Dehidratasyon Yıkama Antijen iyileştirme Blokaj Primer Antikor Uygulaması 13.00-14.00 Öğle yemeği 14.00-15.30 Uygulama Sekonder Antikor Uygulaması Kromojen Nukleus boyaması Dehidratasyon ve Kapama 15.30-17.00 Uygulama IF- fiksasyon Blokaj Primer antikor uygulaması Araş. Gör. Dr. Nurcan ORHAN Araş. Gör. Dr. Nurcan ORHAN Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY Tıp Araştırma Enstitüsü
2.GÜN (4 Nisan 2017 Salı) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-11.00 Uygulama IF sekonder antikor uygulaması Lamların kapatılması 11.00-11.15 Kahve arası 11.15-12.00 Uygulama Görüntüleme Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY 12.00-13.00 Öğle yemeği 13.00-15.00 ELISA Teorik Eğitim 15.00-15.15 Kahve arası 15.15-16.30 Uygulama Plate kaplama Yıkama Blokaj Örneklerin hazırlanması, kuyulara konulması Gece boyu inkübasyon Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
3.GÜN (5 Nisan 2017 Çarşamba) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-11.00 Uygulama Sekonder antikor uygulanması Kit ile Elısa uygulanması 11.00-11.15 Kahve arası 11.15-12.00 Uygulama Yıkama Sonuçların okunması 12.00-13.00 Öğle yemeği 13.00-15.00 Uygulama Kit sekonder antikor uygulama Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY 15.00-15.30 Kahve arası 15.30-16.30 Uygulama Yıkama Sonuçların okunması Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
4.GÜN(5 Nisan 2017 Perşembe) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/ Uygulayıcı Yer 09.00-10.30 Western Blot Teorik Eğitimi 10.30-10.45 Kahve arası 10.45-12.00 Western Blot Uygulama Örneklerin Hazırlanması (Doku veya Hücre Ekstraktı) Protein Konsantrasyon Ölçümü 12.00-13.00 Öğle yemeği Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY 13.00-14.30 Uygulama SDS-PAGE Elektroforez Proteinlerin Membrana Transferi (Blotlama) ve Ponceau S Boyama Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY 14.30-14.45 Kahve arası 14.45-17.00 Uygulama Bloklama Primer Antikor ile İnkübasyon Yıkama Sekonder Antikor ile İnkübasyon 17.00-17.15 Kahve arası 17.15-18.00 Uygulama Yıkama Kemiluminesans Görüntüleme Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY Dr. Sevgin DEĞİRMENCİOĞLU Araş. Gör. Canan Aysel ULUSOY
5.GÜN(7 Nisan 2017Cuma) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/ Uygulayıcı Yer 09.00-10.30 Lenfosit Uyarım Testleri Teorik Eğitimi 10.30-10.45 Kahve arası 10.45-12.00 Lenfosit Uyarım Testleri Uygulama Lenfosit İzolasyonu Lenfositlerin Antijenik Uyarımı Prof. Dr. Erdem TÜZÜN Uzm. Dr. Vuslat YILMAZ 12.00-13.00 Öğle yemeği 13.00-15.00 Uygulama CFSE İle Proliferasyon Tayini Sonuçların Değerlendirilmesi Uzm. Dr. Vuslat YILMAZ 15.00-15.15 Kahve arası 15.15-16.15 Sınav 16.15-17.15 Sınav Değerlendirilmesi 17.15-17.30 Sonuçlarının Açıklanması
Temel Hücre Kültürü Teknikleri ve Primer Nöron Kültürü Kurs Programı
1.GÜN (17 NİSAN 2017 PAZARTESİ) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-09.10 Açılış Prof.Dr.Selma YILMAZER Doç. Dr. Duygu GEZEN AK Doç.Dr.Erdinç DURSUN İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 09.10-10.15 Bir Hücre Kültürü Laboratuvarı Nasıl Olmalı? Bir kültür laboratuvarında olması gereken fiziki koşullar. Kullanılan temel cihazlar. Temel sterilizasyon yöntemleri ve kontaminasyondan korunma yolları. 10.15-10.30 Kahve arası 10.30-12.00 Hücre Kültürünün Temel Prensipleri 12.00-13.00 Öğle yemeği 13.00-15.00 Uygulama Hücre kültürü tipleri. Devamlı hücre soyları ve primer hücre kültürü, benzerlikleri ve farkları. Kültürü yapılacak dondurulmuş hücrelerin çözülmesi, sayımı, ekimi, pasajlanması ve dondurulması. Çapraz-kontaminasyondan korunma yolları. Nöroblastoma hücreleri için petrilerin kaplanması, medyumların hazırlanması Primer nöron kültürü için petrilerin kaplanması, medyumların hazırlanması Doç.Dr.Erdinç DURSUN Doç. Dr. Duygu GEZEN AK Doç. Dr. Erdinç DURSUN MSc. İrem ATASOY BSc. Büşra ŞENGÜL İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 15.00-15.30 Kahve arası 15.30-18.00 Uygulama Nöroblastoma hücreleri için petrilerin yıkanması Nöroblastoma hücrelerinin pasajlanması (hücrelerin sayımı ve ekimi). Doç. Dr. Duygu GEZEN AK MSc. Merve ALAYLIOĞLU BSc. Büşra ŞENGÜL BSc. Ebru KESKİN İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
2.GÜN (18 NİSAN 2017 Salı) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 08.30-10.00 Primer Nöron Kültürünün Prensipleri Nöron kültürü tipleri. Hücrelerin alınacağı canlı türünün, ilgili beyin bölgesinin ve gelişim gününün seçimi. Disseksiyon-hücre ayrıştırma yöntemleri. Bir nöronun kültürde yaşatılması ve olgunlaşması. Kullanılan medyum tipleri. Doç. Dr. Duygu GEZEN AK İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 10.00-10.15 Kahve arası 10.15-12.00 Uygulama Primer nöron kültürü için hazırlanan petrilerin yıkanması Disseksiyon öncesi hazırlıkların tamamlanması Doç. Dr. Duygu GEZEN AK MSc.İrem ATASOY MSc. Merve ALAYLIOĞLU İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 12.00-13.00 Öğle yemeği 13.00-15.00 Uygulama Sezeryan ile embriyoların çıkarılması Embriyolardan beyinlerin disseksiyonu Stereo-zoom mikroskopu kullanılarak beynin neokorteks bölgelerinin disseksiyonu. Doç. Dr. Duygu GEZEN AK MSc.İrem ATASOY MSc. Merve ALAYLIOĞLU İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 15.00-15.30 Kahve arası 15.30-18.00 Uygulama Elde edilen neokorteks bölgelerinin hücrelerine ayrıştırılması Hücre sayımı ve ekimi. Doç. Dr. Erdinç DURSUN MSc. İrem ATASOY MSc. Merve ALAYLIOĞLU İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
3.GÜN (19 NİSAN 2017 Çarşamba) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-10.30 Hücre Kültüründe Canlılık Testleri Toma lamı ile hücre sayımı ve hesaplanması LDH, MTT, DAPI, TUNEL yöntemleri ile hücre canlılık/ölüm tayinleri Doç. Dr. Erdinç DURSUN İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 10.30-10.45 Kahve arası 10.45-12.30 Kültür Hücrelerine Yapılacak Uygulamalar ve Deney Gruplarının Oluşturulması I Peptid uygulamaları, Kimyasal/İlaç uygulamaları Doç. Dr. Erdinç DURSUN İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 12.30-13.30 Öğle yemeği 13.30-15.00 Kültür Hücrelerine Yapılacak Uygulamalar ve Deney Gruplarının Oluşturulması II 15.00-15.30 Uygulama sirna aracılı gen susturma Primer kortikal nöronların mikroskopta incelenmesi Nöroblastoma hücrelerinin mikroskopta incelenmesi Doç. Dr. Duygu GEZEN AK MSc. İrem ATASOY MSc. Merve ALAYLIOĞLU İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
4.GÜN (20 NİSAN 2017 Perşembe) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-10.30 Kültür Hücrelerinden RNA ve Protein İzolasyonları RNA ve protein izolasyonu protokolleri ve dikkat edilmesi gereken adımlar. Doç. Dr. Duygu GEZEN AK İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 10.30-10.45 Kahve arası 10.45-12.00 Kültürdeki Hücrelerin Mikroskopta İncelenmesi İmmün işaretlemede temel prensipler Antikor çeşitleri ve seçimi, İmmünositokimyasal işaretleme yöntemleri Problemler ve çözümleri. Kültür tabağına yapışan (adherent) hücreler için immün işaretleme protokolü. Prof. Dr. Selma Yılmazer İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 12.00-13.00 Öğle yemeği 13.00-15.00 Uygulama Primer kortikal nöronların ve nöroblastoma hücrelerinin fazkontrast mikroskopta incelenmesi. Fiksatif hazırlanması primer kortikal nöronların ve nöroblastoma hücrelerinin fiksasyonu Doç. Dr. Duygu GEZEN AK MSc. Merve ALAYLIOĞLU BSc. Büşra Şengül BSc. Ebru Keskin İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 15.00-15.30 Kahve arası 15.30-18.00 Uygulama (Devam) İmmünfloresan işaretleme Doç. Dr. Erdinç DURSUN M.Sc.İrem ATASOY İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı
5.GÜN (21 NİSAN 2017 Cuma) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-12.00 Uygulama İmmünfloresan işaretleme deneylerinin devamı Floresan mikroskopta görüntüleme Doç. Dr. Erdinç DURSUN MSc. İrem ATASOY MSc. Merve ALAYLIOĞLU İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Beyin ve Nörodejeneratif Hastalıklar Araştırma Laboratuvarı 12.00-13.00 Öğle yemeği 13.00-14.00 SINAV 14.00-15.00 Kahve arası / Sınav Sonuçlarının Değerlendirilmesi
Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik Kurs Programı
1.GÜN (24 Nisan 2017 Pazartesi) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-09.10 Açılış Prof. Dr. Elif ÖZKÖK 09.10-10.00 Nörogenetiğe Giriş DNA ve RNA Temelli Genetik Yöntemler Varyasyon analizi Araş. Gör. Dr. Aris ÇAKİRİS Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) 10.00-10.15 Kahve Arası Uygulama DNA Temelli Nörogenetik Yöntemler 10.15-11.00 Hücre Kültürü Örneklerinden (Veya Kan) DNA İzolasyonu 11.00-12.00 12.00-13.00 Öğle Yemeği Uygulama PCR-RFLP analizi Sonuçlarının Yorumlanması MSc. Melda SARIMAN Biyomühendis Burcu SALMAN Biyomühendis N.Ece BİBEROĞLU Dr. Ferda PERÇİN PAÇAL MSc. Melda SARIMAN Biyomühendis Burcu SALMAN Biyomühendis N.Ece BİBEROĞLU Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) 13.00-13.30 RNA Temelli Nörogenetik Yöntemler Real-Time PCR Araş. Gör. Dr. Zeliha EMRENCE Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) RNA Temelli Nörogenetik Yöntemler 13.30-14.00 Kantitatif Real-Time PCR Ekspresyon analizi 14.00-14.15 Kahve Arası Doç. Dr. Sema SIRMA EKMEKÇİ Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) 14.15-14.45 RNA Temelli Nörogenetik Yöntemler Mikroarray: Gen Expresyon Analizi Doç. Dr. Emel ERGÜL Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) 14.50-17.00 Uugulama RNA Temelli Genetik Yöntemler Hücre Kültürü Örneklerinden (Veya Kan) RNA İzolasyonu Kantitatif Real-Time PCR ve Sonuçların Analizi Araş. Gör. Dr. Aris ÇAKİRİS Araş. Gör. Dr. Zeliha EMRENCE Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
2.GÜN (25 Nisan 2017 Salı) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/Uygulayıcı Yer 09.00-09.30 Yeni Nesil Dizileme Yöntemleri Yeni nesil dizileme prensipleri Yeni nesil dizilemenin kazandırdıkları Doç. Dr. Neslihan ABACI Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) Yeni Nesil Dizileme Yöntemleri devam 09.30-10.00 Örneklerden Kütüphane Hazırlama 10.00-10.20 Kahve Arası Yeni Nesil Dizileme Uygulamaları 10.20-11.00 Ekzon Dizileme Dr. Ferda PERÇİN PAÇAL Araş. Gör. Dr. Zeliha EMRENCE Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) 11.00-12.00 Yeni Nesil Dizileme Uygulamaları RNA Dizileme MSc. Melda SARIMAN Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) 12.00-13.00 Öğle Yemeği 13.00-13.40 Yeni Nesil Dizileme Uygulamaları ChIP Dizileme Yeni Nesil Dizileme Data Analizi Yeni Nesil Dizilemede kullanılan data formatları 13.40-14.40 Data kalite kontrol/referans karşılaştırma/varyant calling Homozigot Haritalama 14.40-15.00 Kahve Arası 15.00-17.00 Sınav Sınav Sonuçlarının Değerlendirilmesi Sınav Sonuçlarının İlan Edilmesi Doç. Dr. Sema SIRMA EKMEKÇİ Araş. Gör. Dr. Aris ÇAKİRİS Biyomühendis Burcu SALMAN Biyomühendis N.Ece BİBEROĞLU Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE)
Kursta Teorik ve Uygulamalı Eğitim Verecek Bilim İnsanlarımız Prof. Dr. Erdem Tüzün İstanbul Üniversitesi, Sinirbilim AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul Erdem Tüzün tıp doktoru ve nöroloji uzmanı ünvanlarını İstanbul Tıp Fakültesi nde aldı. Ardından Oxford, Teksas ve Pensilvanya Üniversitelerinde doktora sonrası araştırmacı olarak çalıştı. Halen İstanbul Üniversitesi, DETAE Sinirbilim AD da bölüm başkanlığı görevini sürdürmektedir. Klinik nöroimmünoloji ve immünoloji ile ilgili SCI indeksli dergilerde yayınlanmış yüzden fazla makalesi vardır. Nöropsikiyatri Arşivi nin editör yardımcısı ve Nöroimmünoloji Derneği nin kurucu üyelerindendir. Doç.Dr. Duygu Gezen-Ak İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD. Lisans eğitimimi 2000 yılında İ.Ü Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünde, Yüksek lisans eğitimini 2003 yılında doktora eğitimini ise 2009 yılında İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD da tamamladı. 2000 yılından 2014 yılına kadar aynı anabilim dalında araştırma görevlisi olarak hizmet verdi. 2014 yılında doçentlik ünvanını aldı. 2007 ve 2011 yıllarında University of Medicine and Dentistry of New Jersey (UMDNJ) Department of Biochemistry and Molecular Biology, Department of Neuroscience bölümlerinde araştırma deneyimine sahip oldu. Şu ana kadar SCI ve SCI-E dergilerde yayınlanmış 22 adet makalesi 589 atıf almıştır. Halen Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı nda öğretim üyesi olarak görevine devam etmektedir.
Doç. Dr. Erdinç Dursun İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD. Lisans eğitimini 2000 yılında İ.Ü Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünde, Yüksek lisans eğitimini 2003 yılında doktora eğitimini ise 2009 yılında İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD da tamamladı.2000-2104 yılları arasında aynı anabilim dalında araştırma görevlisi olarak hizmet verdi. 2014 yılında doçentlik ünvanını aldı. 2007 ve 2011 yıllarında 1 er ay süreyle University of Medicine and Dentistry of New Jersey (UMDNJ) Department of Biochemistry and Molecular Biology / Department of Neuroscience bölümlerinde araştırma deneyimine sahip oldu. Şu ana kadar SCI ve SCI-E dergilerde yayınlanmış 21 adet makalesi 583 atıf almıştır. Halen Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı nda öğretim üyesi olarak görevine devam etmektedir. Doç. Dr. Sema Sırma Ekmekçi İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul 1996 yılında İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyolojik Bilimler Bölümünden mezun olmuştur. Yüksek Lisansını ve Doktorasını İstanbul Üniversitesi Deneysel, Genetik Anabilim Dalında tamamlamıştır. Amerika Birleşik Devletleri, St. Jude Çocuk Araştırma Hastanesi, Genetik ve Tümör Hücre Biyolojisi bölümünde tez çalışmalarını sürdürmüş aynı zamanda Doktora sonrası araştırmacı olarak çalışmıştır. 1998 yılından beri İstanbul Üniversitesi Deneysel nde görev yapmaktadır. Yeni nesil dizilemde; ChIP dizileme, Eksom dizileme ve Transkriptom çalışmalarında bulunmuştur. Bugüne kadar 26 uluslararası ve 7 ulusal makalesi bulunmaktadır. Doç. Dr. Emel Ergül Kocaeli Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD 2001 yılında Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyoloji AD. Yüksek lisansını tamamladı. 2006 yılında Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyoloji AD. Doktorasını tamamladı. 2010 yılında Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD.'na Yrd. Doç. olarak atandı. 2014 yılında Doçentlik ünvanını alarak Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD da Doç. Dr. olarak atandı. Kanser genetiği ve sitogenetik konularında çalışmakta olup uluslararası 30 adet makalesi, uluslararası ve ulusal kongre özet kitapçıklarında basılmış 45 adet bildirisi bulunmaktadır. H-indexi 12 olup Bilimsel çalışmaları 546 adet atıf almıştır.
Doç. Dr. Neslihan Abacı İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul M.Ü. Atatürk Eğitim Fakültesi Biyoloji Öğretmenliğinden (İngilizce) 1996 yılında mezun olmuştur. Yüksek lisans ve doktorasını İ.Ü. Sağlık Bilimleri Enstitüsü Genetik programında tamamlamıştır. 2009 yılında ABD de kısa süreli olarak NIH te Behçet Hastalığını ile Genom wide associaton çalışmasında bulunmuştur. Medüller Tiroid Kanseri, Hipertrofik Kardiyomiyopati ve Otoinflamatuvar hastalıklar genetiği ile ilgili çalışmalarda bulunmuştur. 2009 yılında, Aziz Sancar DETAE bünyesinde kurulan Tüm Genom Laboratuarının kurucu kadrosunda yer almıştır. 2014 yılından bu yana Tüm Genom Laboratuvarı sorumlusudur. Yeni nesil dizilemede; viral DNA, mtdna, Metagenomiks ve Transkriptom çalışmalarında ulusal ve uluslararası 13 makalede yer almıştır. Çalışma konuları ile ilgili uluslararası ve ulusal dergilerde yayınlanmış makaleleri bulunmaktadır. Araş. Gör. Dr. Aris Çakiris İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul Lisans eğitimini İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü nde 2003 de tamamladı.yine aynı üniversitenin Sağlık Bilimleri Enstitüsü nde Genetik Bölümünde 2006 yılında yüksek lisansını 2012 yılında ise doktorasını tamamladı. Çalışma alanı otoinflamatuvar hastalıkların genetiği (FMF, Behçet) olmak üzere ayrıca 2009 yılında Aziz Sancar Deneysel bünyesinde kurulmuş olan Tüm Genom Analiz Laboratuvarı nın kurucu kadrosunda bulunmuş ve bu alanda uluslararası ve ulusal birçok makalede yer almıştır. Halen aynı enstitünün Genetik bölümünde çalışmalarını sürdürmektedir. Araş. Gör. Dr. Zeliha Emrence İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul 2008 yılında Marmara Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümünden mezun olmuştur. Yüksek Lisansını (2010) ve Doktorasını (2016) İstanbul Üniverstesi Deneysel, Genetik Anabilim Dalında tamamlamıştır. 2012 yılından beri İstanbul Üniversitesi Deneysel nde görev yapmaktadır. Yeni nesil dizileme konusunda; Mitokondriyal DNA dizileme, Ekzom dizileme çalışmalarında bulunmuştur. Bugüne kadar 12 uluslararası ve 3 ulusal makalesi bulunmaktadır.
Araş. Gör. Dr. Nurcan ORHAN, PhD. İstanbul Üniversitesi, Sinirbilim AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji bölümünden 2001 yılında mezun oldu. Aynı bölümde Zooloji Yüksek Lisansını 2004 yılında Sıçan (Rattus norvegicus) larda Akut İskemi Reperfüzyon Modeli ile Oluşturulan Böbrek Yetmezliğinde Prostoglandin E(1) in Rolü başlıklı tezi ile tamamladı. Ardından İstanbul Üniversitesi Deneysel Sinirbilim Anabilim Dalı nda Yüksek Lisans eğitimine başladı. 2007 yılında Sinirbilim Yüksek Lisansını Obsesif Kompulsif Bozukluğu Olan Kişilerde Eşleşme Bozucu Protein-2 ve Mangan Süperoksit Dismutaz Polimorfizmlerinin Oksidatif Stres İle İlişkisi başlıklı tezi ile tamamladı. 2007 yılında Sinirbilim Anabilim Dalı nda İleri Nörolojik Bilimler Doktora programını 2013 yılında "Travmatik Beyin Hasarı Oluşturulan Sıçanlarda Beta-Hidroksibütiratın Beyin Damar Geçirgenliğine Etkileri başlıklı tezi ile doktora ünvanını alarak tamamladı. 2005 yılından beri DETAE Sinirbilim Anabilim Dalı ında Araştırma Görevlisi olarak çalışmalarını sürdürmektedir. Nörolojik ve psikiyatrik hastalıklarda polimorfizm araştırmaları, kafa travması sonucu oluşan beyin hasarı, epilepsi ve kan beyin bariyeri başlıca çalışma alanlarıdır. Ulusal toplantılarda alınmış 8 adet bilimsel ödülü bulunmaktadır. Bir adet uluslararası sempozyumda sempozyum sekreteri olarak ve yedi adet ulusal bilimsel toplantıda düzenleme komitesi üyesi olarak görev almıştır. 17 adet uluslararası makalesi bulunmaktadır. Sözlü ve poster olarak sunulmuş 36 adet uluslararası ve 24 adet ulusal bildirisi vardır. Yurtdışı ortaklı ikisi devam eden 3 adet projede görev almaktadır. TÜBİTAK tarafından desteklenen 2 adet projede görev almış ve İstanbul Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından desteklenmiş yürütücülüğünü yaptığı 3 adet tez projesini tamamlamıştır. Ayrıca aynı birim tarafından desteklenen 15 adet tamamlanmış 3 adet devam eden projede görev almaktadır. Araş.Gör. Canan Aysel Ulusoy İstanbul Üniversitesi, Sinirbilim AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü nden 2010 yılında mezun olmuştur. 2010-2013 yılları arasında İstanbul Üniversitesi Deneysel Sinirbilim Anabilim Dalı nda Sinirbilim Yüksek Lisans Programı nda yüksek lisans yapmıştır. Yüksek lisans tez danışmanı Doç. Dr. Erdem Tüzün, tez başlığı Deneysel otoimmün MuSK miyastenia graviste sitokinlerin rolü dür. 2014 yılından beri İstanbul Üniversitesi Deneysel Sinirbilim Anabilim Dalı nda İleri Nörolojik Bilimler Doktora Programı nda eğitimine devam etmektedir. İlgilendiği araştırma konuları nöroimmünoloji ve deneysel hayvan modelleridir.
Uzm. Dr. Vuslat Yılmaz, PhD. İstanbul Üniversitesi, Sinirbilim AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü nü 1997 yılında bitirdim. 2003 yılında Aziz Sancar, Deneysel, İmmünoloji AD de 2003 yılında yüksek lisansımı, yine aynı bölümde 2010 senesinde doktora eğitimimi tamamladım. Bu sırada, İstanbul Tıp Fakültesi, Fizyoloji AD de özellikle Miyasthenia gravis hastalığındaki immünolojik mekanizmalara yönelik çalışmalara devam ettim. Doktora sonrası bir yıl CNRS-AIM ye bağlı Kas hastalıkları Araştırma Merkezi nde (Paris) Miyasthenia gravis te B hücrelerinin yeni rolleri başlıklı çalışmayı yürüttüm. Halen Aziz Sancar, Deneysel, Sinirbilim AD de nöroimmünolojik mekanizmalararaştırmak üzere insan ve deneysel hayvan modeli üzerinde çalışmaktayım. Dr. Ferda PAÇAL İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul 2001 yılında İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünden mezun olmuştur. Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim Dalında 2004 yılında yüksek lisansını, 2010 yine aynı birimde doktorasını tamamlamıştır. 2001 2011 yılları arasında Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünde Araştırma Görevlisi olarak çalışmıştır. 2011 yılından bu güne kadar İstanbul Üniversitesi Deneysel nde Biyolog Dr. Olarak görev yapmaktadır. Bu güne kadar multidisipliner olarak 24 makale ve 2 kitapta yazarlığı bulunup, yeni nesil dizileme konusunda Mitokondriyal genom analizi, RNA sekanslama çalışmalarında yer almıştır.
Dr. Sevgin Değirmencioğlu İstanbul Üniversitesi, İstanbul Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyokimya Anabilim Dalında doktorasını tamamlamıştır. Başlıca araştırma alanları sitokinler, polimorfizm, DNA tamir genleri ve otoimmün hastalıklardır. 2011 yılından beri Molgen Biyoteknoloji firmasında Araştırma Geliştirme' den sorumlu yöneticidir. Biyomüh. Burcu Salman İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul 2015 yılında Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik (İngilizce) Bölümünden mezun olmuştur. İstanbul Üniversitesi Sağlık Bİlimleri Enstitüsü Genetik Anabilim Dalı nda yüksek lisansına devam etmektedir. Yeni nesil dizileme yöntemleri, veri analizi ve biyoinformatik alanlarına ilgi duymaktadırve bu alanlardaki çalışmalarda rol almaktadır. Biyomüh. Nezahat Ece Biberoğlu İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul 2014 yılında Yıldız Teknik Üniversitesi, Kimya-Metalurji Fakültesi, Biyomühendislik Bölümünden mezun olmuştur. İstanbul Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Genetik Anabilim Dalı nda yüksek lisansına devam etmektedir. Yeni nesil dizileme yöntemleri ve biyoinformatik alanlarına ilgi duymaktadır.
MSc. Melda SARIMAN İstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve Araştırma Enstitüsü, İstanbul 1985 yılında Bursa da doğmuştur. 2008 yılında Marmara Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümünden mezun olmuştur. 2008-2013 Yüksek Lisansını Genetik Programında Aziz Sancar Deneysel - İç Hastalıkları Tıbbi Genetik Anabilimdalında yapmış olup, 2010-2012 yılları arasında İstanbul Tıp Fakültesi Çoçuk Biyokimya Laboratuvarında çalışmıştır. 2015 yılında başladığı Doktora Genetik programına Aziz Sancar Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü Genetik Anabilimdalında halen devam etmektedir. Yeni Nesil Dizileme konusunda RNA dizileme Transkiptom konularında çalışmalarda bulunmuştur. 1 ulusal yayını 1 uluslararası makalesi bulunmaktadır. KAYIT ÜCRETLERİ Kurs Adı Kurs Sorumlusu KDV Dahil Fiyat Kurs Tarihi Öğrenci Uzman Teorik ve Uygulamalı Nöroimmünoloji Prof. Dr. Erdem Tüzün 400 TL 750 TL 3-8 Nisan 2017 Temel Hücre Kültürü Yrd. Doç. Dr. Cem 6TL 500 TL 17-21 Nisan 2017 ve Primer Nöron Kültürü İsmail Küçükali Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik Prof. Dr. Elif Özkök 300 TL 500 TL 24-25 Nisan 2017 Kurs Ücretine Dahil Hizmetler Kayıt Ücreti Kurs Çantası Öğle Yemeği Kahve Molaları Sertifika
Nöroimmunoloji Derneği NiMDER