Katkılarından dolayı Koç Üniversitesi Translasyonel Tıp Uygulama ve Araştırma Merkezi ne teşekkür ederiz.

Transkript

1 AZİZ SANCAR DENEYSEL TIP ARAŞTIRMA ENSTİTÜSÜ SİNİRBİLİM ANABİLİM DALI İSTANBUL ÜNİVERSİTESİ Katkılarından dolayı Koç Üniversitesi Translasyonel ne teşekkür ederiz. (0212) / /molekulersinirbilim

2 Sevgili MeslektaĢlarımız, Organizasyon komitesi olarak bu yıl 13 ġubat-16 Mart 2018 tarihleri arasında ikincisini düzenleyeceğimiz II. Deneysel Sinirbilim Yöntemleri Kursuna sizleri davet etmekten onur duyarız. Ülkemizde son yıllarda önemi giderek artan sinirbilimin geliģimine katkıda bulunmak, temel ve güncel yöntemler konusunda bu alanda çalıģanlara ve ilgi duyanlara bilgi aktarımına yardımcı olmak temel hedeflerimiz. Bu kursumuzda 4 temel alanda 6 eğitim modülü hazırladık. Bu modüller sırası ile Deneysel Sinirbilimde Hayvan Modelleme, Temel ve Ġleri Hücre Kültürü Teknikleri, Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik, Yeni Nesil Dizileme Teknolojileri, Temel Nöroimmünoloji ve Ġleri Nöroimmünoloji dir. Hedefimiz ilerdeki yıllarda sinirbilim ile ilgili alt çalıģma alanlarını geniģletmek ve içeriğini daha da zenginleģtirmektir. Sizlerden alacağımız geri dönüģler ve istekler bu konuda bizlere yol gösterecektir. Sınırlı sayıda katılımın olacağı bu kursumuzun sizler için yeterli ve keyifli olmasını diler, Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar DETAE, Sinirbilim AD, organizasyon komitesi olarak sevgi ve saygılarımızı sunarız. Prof. Dr. Erdem TÜZÜN

3 Organizasyon Komitesi ABACI Neslihan ARICIOĞLU Feyza ERDAĞ Ece KÜÇÜKALĠ Cem Ġsmail ÖZTÜRK-BAKIRER Gül SIRMA-EKMEKÇĠ Sema ġanli Elif ġekerdağ Emine TAġKIN Ali Cihan TÜZÜN Erdem ULUSOY Canan Aysel YAPICI-ESER Hale YILMAZ Vuslat YÜCEER Hande Bilimsel Komite ABACI Neslihan, Doç. Dr. ARICIOĞLU Feyza, Prof. Dr. ARMUTAK Elif Ġlkay, Prof. Dr. ATASOY Deniz, Yrd. Doç. Dr. BALCI Fuat, Doç. Dr. BAġTAN-TÜZÜN Birgül, Doç. Dr. ÇARÇAK Nihan, Yrd. Doç. Dr. ERGÜL Emel, Doç. Dr. GÜRSOY-ÖZDEMĠR Yasemin, Prof. Dr. KÜÇÜKALĠ Cem Ġsmail, Yrd. Doç. Dr. ORER Hakan Sedat, Prof. Dr. ÖZKÖK Elif, Prof. Dr. SIRMA-EKMEKÇĠ Sema, Doç. Dr. SOLAROĞLU Ġhsan, Prof. Dr. TAġKIN Ali Cihan, Dr. Kurs Sekreterleri ġanli Elif YÜCEER Hande TÜZÜN Erdem, Prof. Dr. YAPICI-ESER Hale, Doç. Dr. ZEYBEK Ümit, Prof. Dr.

4 Bilimsel Konular Nörogenetik Hücre Kültürü Nöroimmünoloji Hayvan Modelleme Dil Türkçe, Ġngilizce* *Temel ve İleri Hücre Kültürü kursunun eğitim dili İngilizcedir. Kurs Adı Kurs Sorumlusu Kdv Dahil Fiyat Öğrenci Uzman Kurs Tarihi Deneysel Sinirbilimde Hayvan Modelleme Yrd. Doç. Dr. Cem İsmail Küçükali 1000 TL 1250 TL Şubat 2018 Temel ve İleri Hücre Kültürü Yrd. Doç. Dr. Cem İsmail Küçükali Prof. Dr. Yasemin Gürsoy Özdemir 750 TL 1000 TL Şubat 2018 Teorik ve Uygulamalı Nörogenetik Yeni Nesil Dizileme Teknolojileri Prof. Dr. Elif Özkök 300 TL 500 TL Şubat 2018 Prof. Dr. Elif Özkök 400 TL 600 TL 1-2 Mart 2018 Temel Nöroimmünoloji Prof. Dr. Erdem Tüzün 500 TL 700 TL 5-9 Mart 2018 İleri Nöroimmünoloji Prof. Dr. Erdem Tüzün 600 TL 800 TL Mart 2018

5 Ön Kayıt ve Kayıt Kurslara katılım kontenjanla sınırlıdır. Ön kayıt mail adresi üzerinden yapılacaktır. Bu safhadaki değerlendirmede baģvuru sırası esas alınacaktır. Olumlu yanıt alanlar verilecek hesap numarası ve IBAN bilgilerine göre kurs ücretini yatıracaktır. Bu iģlemi takiben banka dekontu, kursiyer öğrenci ise öğrenci olduğuna dair belge mail yolu ile iletilecek ve kesin kayıt tamamlanmıģ olacaktır. Kurs Ücretine Dahil Hizmetler Kayıt Ücreti, Öğle Yemeği, Kahve Molaları ve Sertifika Sertifika Dağıtımı Her Kursun Son Günü (Sınavları geçenler BAġARI, geçemeyenler ise KATILIM sertifikası alacaklardır. Ġletişim Bilgileri Telefon: (0212) / Mail: sinirbilimyontemlerikursu@gmail.com Yer Ġstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi, Aziz Sancar DETAE Sinirbilim AD Tıp Uygulama ve AraĢtırma ; Koç Üniversitesi Hastanesi, Nöroloji AD

6

7 1.GÜN (13 ŞUBAT 2018 SALI) Açılış Cem İsmail KÜÇÜKALİ Biomedikal Modelleme Nedir? Ümit ZEYBEK Kahve Arası Deney Hayvanlarında Model Oluşturma Yöntemleri Spontan Modeller İndükleme Modelleri Cerrahi Modeller Transgen Modeller Elif İlkay ARMUTAK Öğle Yemeği Deneysel Modellemede İnsan, Fare ve Sıçanların Karşılaştırılması Fuat BALCI Deney Hayvanlarının Bakımı, Beslenmesi ve Barındırılması Ali Cihan TAŞKIN Kahve Arası Deney Hayvanlarının Bakımı, Beslenmesi ve Barındırılması Ali Cihan TAŞKIN

8 2.GÜN (14 ŞUBAT 2018 ÇARŞAMBA) Deney Hayvanı Çalışma Tasarımı Hakan ORER Kahve Arası Deney Hayvanı Çalışmasında İstatistiksel Yöntemler Hakan ORER Hayvan Davranış Çalışmalarına Yaklaşım Hale YAPICI ESER Öğle Yemeği Temel Hayvan Davranışı I Hale YAPICI ESER Temel Hayvan Davranışı II Ece ERDAĞ Kahve Arası Video Üzerinden Skorlama ve Open Source Skorlama Sistemlerinin Kullanımı Hale YAPICI ESER

9 3.GÜN (15 ŞUBAT 2018 PERŞEMBE) Deney Hayvanlarında Bilişsel Testler Hale YAPICI ESER Kahve Arası Depresyon Modeli Kronik Stres Modelleri Korku Koşullaması Modelleri Depresyonun Farklı Alt Belirtilerinin Modellenmesi Hale YAPICI ESER Ece ERDAĞ Feyza ARICIOĞLU Öğle Yemeği Depresyon Modeli Kronik Stres Modelleri Korku Koşullaması Modelleri Depresyonun Farklı Alt Belirtilerinin Modellenmesi Hale YAPICI ESER Ece ERDAĞ Feyza ARICIOĞLU Şizofreni Modeli Feyza ARICIOĞLU Kahve Arası Makale Tartışma Erdem TÜZÜN Cem İsmail KÜÇÜKALİ Hale YAPICI ESER Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Feyza ARICIOĞLU

10 4.GÜN (16 ŞUBAT 2018 CUMA) İmmünizasyon Temelli Nöroimmünoloji Modelleri Erdem TÜZÜN Kahve Arası Deneysel Migren ve İnme Modellemesi Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Öğle Yemeği Sinirbilimde Yeni Deneysel Teknikler Optogenetik Multiunit Recordings Deniz ATASOY Kahve Arası Hayvan Deneyi Dizaynı Erdem TÜZÜN Cem İsmail KÜÇÜKALİ Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Deniz ATASOY

11 5.GÜN (17 ŞUBAT 2018 CUMARTESİ) Epilepside Deneysel Modeller Nihan ÇARÇAK Pentilentetrazol (PTZ) ile Farede Akut Nöbet İndüksiyonu Nihan ÇARÇAK Kahve Arası Stereotaksi Protokolü Nihan ÇARÇAK Öğle Yemeği Orta Serebral Arter İskemi Modeli Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Birgül BAŞTAN TÜZÜN Kahve Arası Otoimmün Hayvan Modelinde İmmünizasyon ve Otoimmün Hayvan Modelinin Geçerliliğinin Değerlendirilmesi Vuslat YILMAZ Canan ULUSOY 6.GÜN (19 ŞUBAT 2018 PAZARTESİ) Sınav Kahve Arası Sınav Sonuçlarının Değerlendirilmesi Sınav Sonuçlarının Açıklanması

12

13 1.GÜN (19 Şubat 2018 Pazartesi) Açılış Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Bir Hücre Kültürü Laboratuvarı Nasıl Olmalı? Bir Kültür Laboratuvarında Olması Gereken Fiziki Koşullar Kullanılan Temel Cihazlar Temel Sterilizasyon Yöntemleri ve Kontaminasyondan Korunma Yolları Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Kahve Arası Hücre Kültürünün Temel Prensipleri Hücre Kültürü Tipleri Devamlı Hücre Soyları ve Primer Hücre Kültürü, Benzerlikleri ve Farkları Kültürü Yapılacak Dondurulmuş Hücrelerin Çözülmesi, Sayımı, Ekimi, Pasajlanması ve Dondurulması Çapraz-kontaminasyondan Korunma Yolları Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Öğle Yemeği Nöroblastoma Hücreleri İçin Petrilerin Kaplanması, Medyumların Hazırlanması Primer Nöron Kültürü İçin Petrilerin Kaplanması, Medyumların Hazırlanması Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Kahve Arası Nöroblastoma Hücreleri İçin Petrilerin Yıkanması Nöroblastoma Hücrelerinin Pasajlanması (Hücrelerin Sayımı ve Ekimi) Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ

14 2.GÜN (20 Şubat 2018 Salı) Primer Nöron Kültürünün Prensipleri Nöron Kültürü Tipleri Hücrelerin Alınacağı Canlı Türünün, İlgili Beyin Bölgesinin ve Gelişim Gününün Seçimi Disseksiyon-hücre Ayrıştırma Yöntemleri Bir Nöronun Kültürde Yaşatılması ve Olgunlaşması Kullanılan Medyum Tipleri Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Kahve Arası Primer Nöron Kültürü İçin Hazırlanan Petrilerin Yıkanması Disseksiyon Öncesi Hazırlıkların Tamamlanması Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Öğle Yemeği Sezeryan ile Embriyoların Çıkarılması Embriyolardan Beyinlerin Disseksiyonu Stereo-zoom Mikroskopu Kullanılarak Beynin Neokorteks Bölgelerinin Disseksiyonu Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Kahve Arası Elde Edilen Neokorteks Bölgelerinin Hücrelerine Ayrıştırılması Hücre Sayımı ve Ekimi Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ

15 3.GÜN (21 Şubat 2018 Çarşamba) Hücre Kültüründe Canlılık Testleri Hemositometre ve Trypan Blue Boyama LDH, MTT, DAPI, TUNEL Yöntemleri ile Hücre Canlılık/Ölüm Tayinleri Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Kahve Arası Kültür Hücrelerine Yapılacak Uygulamalar ve Deney Gruplarının Oluşturulması Kimyasal/İlaç Uygulamaları Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Öğle Yemeği Nöroblastoma Hücrelerinin Mikroskopta İncelenmesi Deney Gruplarının Oluşturulması ve MTT Yönteminin Uygulanması Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Kahve Arası 15: Plate Reader ile MTT İçin Ölçüm Yapılması ve Data Analizi Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ

16 4.GÜN (22 Şubat 2018 Perşembe) Kültürdeki Hücrelerin Mikroskopta İncelenmesi İmmün İşaretlemede Temel Prensipler Antikor Çeşitleri ve Seçimi İmmünositokimyasal İşaretleme Yöntemleri Problemler ve Çözümleri Kültür Tabağına Yapışan (Adherent) hücreler İçin İmmün İşaretleme Protokolü Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Kahve Arası Canlı Hücre Görüntüleme Canlı Hücrelere Yapılan Uygulamalar ve Takip Yöntemleri Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Öğle Yemeği Primer Kortikal Nöronların ve Nöroblastoma Hücrelerinin Faz-kontrast Mikroskopta İncelenmesi Fiksatif Hazırlanması Primer Kortikal Nöronların ve Nöroblastoma Hücrelerinin Fiksasyonu Primer Kortikal Nöronların Mikroskopta İncelenmesi İmmünfloresan İşaretleme Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ Kahve Arası İmmünfloresan İşaretleme Deneylerinin Devamı Floresan Mikroskopta Görüntüleme Yasemin GÜRSOY ÖZDEMİR Emine ŞEKERDAĞ

17 5.GÜN (23 Şubat 2018 Cuma) Sınav Kahve Arası Sınav Sonuçlarının Değerlendirilmesi Öğle Yemeği Sınav Sonuçlarının Açıklanması

18

19 1.GÜN (27 Şubat 2018 Salı) Açılış Neslihan ABACI Sema SIRMA EKMEKÇİ Nörogenetiğe Giriş DNA ve RNA Temelli Genetik Yöntemler -1 Aris ÇAKİRİS Kahve Arası Nörogenetiğe Giriş DNA ve RNA Temelli Genetik Yöntemler -2 Ferda PERÇİN PAÇAL Zeliha EMRENCE Hücre Kültürü Örneklerinden (Veya Kan) DNA İzolasyonu PCR-RFLP Analizi Sonuçlarının Yorumlanması Ferda PERÇİN PAÇAL Melda SARIMAN Burcu SALMAN N.Ece BİBEROĞLU Öğle Yemeği Sanger Dizileme Neslihan ABACI Kahve Arası Bakteriyel Gen Klonlama Aris ÇAKİRİS Zeliha EMRENCE Klonlama Ligasyon -Transformasyon Aris ÇAKİRİS Zeliha EMRENCE Atilla GÜLER Kübra TÜREGÜN

20 2.GÜN (28 Şubat 2018 Çarşamba) RNA Temelli Nörogenetik Yöntemler Real-Time PCR Zeliha EMRENCE Kahve Arası RNA Temelli Nörogenetik Yöntemler Kantitatif Real-Time PCR Ekspresyon Analizi Sema SIRMA EKMEKÇİ RNA Temelli Genetik Yöntemler Hücre Kültürü Örneklerinden (Veya Kan) RNA İzolasyonu cdna Sentezi Aris ÇAKİRİS Zeliha EMRENCE Öğle Yemeği RNA Temelli Genetik Yöntemler Kantitatif Real-Time PCR ve Sonuçların Analizi Aris ÇAKİRİS Ferda PERÇİN PAÇAL Zeliha EMRENCE İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp RNA Temelli Nörogenetik Yöntemler Mikroarray: Gen Ekspresyon Analizi Emel ERGÜL İ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp Kahve Arası Sınav Sınav Sonuçlarının Değerlendirilmesi Sınav Sonuçlarının İlan Edilmesi

21

22 1.Gün (1 Mart 2018 Perşembe) Açılış Neslihan Abacı Sema Sırma Ekmekçi Yeni Nesil Dizilemeye Giriş Yeni Nesil Dizileme Yöntemleri Yeni Nesil Dizilemenin Kazandırdıkları, Avantajları, Dezavantajları Neslihan Abacı Kahve Arası Yeni Nesil Dizilemeye Giriş Dizileme Örneklerinden Kütüphane Hazırlama Ferda Perçin Paçal Yeni Nesil Dizileme Uygulamaları Rna Dizileme Melda Sarıman Öğle Yemeği Yeni Nesil Dizileme Uygulamaları Ekzom Dizileme Zeliha Emrence Kahve Arası Yeni Nesil Dizileme Uygulamaları Chıp Dizileme Sema Sırma Ekmekçi Yeni Nesil Dizileme Data Analizi Yeni Nesil Dizilemede Kullanılan Data Formatları Data Kalite Kontrol/Referans Karşılaştırma/Varyant Calling Homozigot Haritalama Aris Çakiris Burcu Salman N.Ece Biberoğlu

23 2.Gün (2 Mart 2018 Cuma) Kahve Arası Tüm Ekzom Dizileme Analizi Tüm Ekzom Dizilemede Kullanılan Biyoinformatik Yöntemler, Akış Şeması ve Tanımlamaları Burcu Dursun Atasu Zeliha Emrence Tüm Ekzom Dizileme Analizi "Gatk's Best Practices" Data Analiz Aşamaları Burcu Dursun Atasu Aris Çakiris Tüm Ekzom Dizileme Analizi Ham Data Kalite Kontrolü (Fastqc) ve Uygulaması Ham Datanın Referans Genoma Haritalanması ve Uygulaması Çift Kopya Okumaların İşaretlenmesi ve Nukleotid Kalite Rekalibrasyonu Burcu Dursun Atasu Burcu Salman Öğle Yemeği Tüm Ekzom Dizileme Analizi Vcf Datalarının Birleştirilmesi, Varyant Kalite Kontrol Rekalibrasyonu ve Kalite Kontrol Sonrası Varyant Elenmesi Standart Kalite Kontrol Aşamaları ve Yöntemleri Burcu Dursun Atasu Aris Çakiris Tüm Ekzom Dizileme Analizi Varyantlara Özgü Özelliklerin Belirlenmesi Klinik Verilere Özgü Filtreleme Yöntemleri ve Uygulaması Tüm Ekzom Dizilemeye Özgü Kopya Sayısı Varyasyonu (Cnv) Belirleme Yöntemleri Burcu Dursun Atasu Burcu Salman Kahve Arası Tüm Ekzom Dizileme Analizi Analizlerde Sıklıkla Kullanılan Veri Bankaları ve Veri Tabanları Burcu Dursun Atasu Sınav Sınav Sonuçlarının Değerlendirilmesi Sınav Sonuçlarının İlan Edilmesi

24

25 1.Gün (5 Mart 2018 Pazartesi) Açılış Erdem Tüzün İmmünohistokimya (Ihk) Teorik Eğitim Nöroimmünolojik Hastalıklar ve Otoantikorların Tanısal Önemi İhk Genel Bakış / Uygulamalar ve Genel Protokol Epitop Açığa Çıkarma Non-Spesifik Boyamanın Önlenmesi Dondurulmuş Dokuda Çalışma Parafinli Dokuda Çalışma Hücrelerle Çalışma İf Genel Bakış / Uygulamalar ve Genel Protokol Ko-Lokalizasyon Erdem Tüzün Kahve Arası Deparafinizasyon Dehidratasyon Yıkama Antijen İyileştirme Blokaj Primer Antikor Uygulaması Ece Erdağ Öğle Yemeği Sekonder Antikor Uygulaması Kromojen Nukleus Boyaması Dehidratasyon Ve Kapama Ece Erdağ If- Fiksasyon Blokaj Primer Antikor Uygulaması Canan Aysel Ulusoy

26 2.Gün (6 Mart 2018 Salı) If Sekonder Antikor Uygulaması Lamların Kapatılması Canan Aysel Ulusoy Kahve Arası Görüntüleme Canan Aysel Ulusoy Öğle Yemeği Elısa Ve Luminex Teorik Eğitim Canan Aysel Ulusoy Vuslat Yılmaz Kahve Arası Plate Kaplama Yıkama Blokaj Örneklerin Hazırlanması, Kuyulara Konulması Gece Boyu İnkübasyon Canan Aysel Ulusoy

27 3.Gün (7 Mart 2018 Çarşamba) Yıkama Sekonder Antikor Uygulanması Canan Aysel Ulusoy Luminex Vuslat Yılmaz Kahve Arası (ELISA İÇİN) Yıkama Sonuçların Okunması Canan Aysel Ulusoy Öğle Yemeği Kit ile Elısa Uygulama Luminex Devam Canan Aysel Ulusoy Vuslat Yılmaz Kahve Arası (ELISA VE LUMİNEX) Yıkama Sonuçların Okunması Canan Aysel Ulusoy Vuslat Yılmaz

28 4.Gün (8 Mart 2018 Perşembe) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/ Uygulayıcı Yer Western Blot Teorik Eğitimi Canan Aysel Ulusoy Kahve Arası Western Blot Örneklerin Hazırlanması (Doku Veya Hücre Ekstraktı) Protein Konsantrasyon Ölçümü Canan Aysel Ulusoy Öğle Yemeği Sds-Page Elektroforez Canan Aysel Ulusoy Kahve Arası Transfer Aşaması Bloklama Pirmer Antikor Canan Aysel Ulusoy

29 5.Gün (9 Mart 2018 Cuma) Saat Bilimsel Program Konuşmacı/ Uygulayıcı Yer 11:30-12:00 Yıkama Sekonder Boyama Canan Aysel Ulusoy Öğle Yemeği Uygulama Yıkama Görüntüleme Canan Aysel Ulusoy Kahve Arası Sınav Sınav Değerlendirilmesi Sonuçlarının Açıklanması

30

31 1.GÜN (12 Mart 2018 Pazartesi) Açılış Erdem TÜZÜN Teorik Eğitim IgG Pürifikasyon İmmünopresipitasyon Kahve Arası Teorik Eğitim Lenfosit İzolasyonu Hücre İçi Sitokin Hücre Ölüm Testleri Hücre Proliferasyon Testleri CFSE FACS/MACS Hücre İzolasyonu Vuslat Yılmaz Teorik Eğitim Anlatılan Yöntemlerle Yaptığımız Projeler/Yayınlar Erdem Tüzün Öğle Yemeği Lenfosit İzolasyonu Vuslat Yılmaz Kahve Arası Lenfosit Uyarımı CFSE Boyama Vuslat Yılmaz

32 2.GÜN (13 Mart 2018 Salı) Hücre İçi Sitokin Boyama Hücre Ölüm Testleri Vuslat Yılmaz Kahve Arası Akım Sitometrisi Uygulaması (CFSE, Hücre İçi Sitokin ve Hücre Ölüm Testleri İçin) Vuslat Yılmaz Öğle Yemeği Hücrelerin Magnetik Olarak Ayrılması (MACS) Vuslat Yılmaz Kahve Arası MACS Uygulama Devamı (Akım Sitometresinde Saflık Tayini) Vuslat Yılmaz

33 3.GÜN (14 Mart 2018 Çarşamba) Igg Pürifikasyon (Beadlerin Hazırlanması, Serum ile İnkübasyonu) İ Kahve Arası Igg Pürifikasyon Devam (Igg'lerin Beadlerden Ayrılması) Öğle Yemeği Immünopresipitasyon (Hücrelerin Flasklardan Sökülmesi, Beadlerin Hazırlanması) Vuslat Yılmaz Kahve Arası Immünopresipitasyon (Nonspesifik Bağlanmayı Azaltmak İçin Lizatın Ön Temizlenmesi, Serum İnkübasyonu) Vuslat Yılmaz

34 4.GÜN (15 Mart 2018 Perşembe) İmmunopresipitasyon (Lizatlara Bead Eklenmesi) Kahve Arası İmmünopresipitasyon (Beadlerin SDS-PAGE Uygulaması) Öğle Yemeği İmmünopresipitasyon (İmperial Boya Uygulaması) 14:30-14:45 Kahve Arası Akım Sitometresi Sonuçlarının Analizi (Flowjo Kullanımı) Vuslat Yılmaz 5.GÜN (16 Mart 2018 Cuma) Tartışma Erdem TÜZÜN Sınav Sınav Değerlendirmesi Sonuçların Açıklanması

35

36 Prof. Dr. Erdem TÜZÜN Ġstanbul Üniversitesi, Sinirbilim AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü Erdem Tüzün tıp doktoru ve nöroloji uzmanı ünvanlarını Ġstanbul Tıp Fakültesi nde aldı. Ardından Oxford, Teksas ve Pensilvanya Üniversitelerinde doktora sonrası araģtırmacı olarak çalıģtı. Halen Ġstanbul Üniversitesi, DETAE Sinirbilim AD da bölüm baģkanlığı görevini sürdürmektedir. Klinik nöroimmünoloji ve immünoloji ile ilgili SCI indeksli dergilerde yayınlanmıģ yüzden fazla makalesi vardır. Nöropsikiyatri ArĢivi nin editör yardımcısı ve Nöroimmünoloji Derneği nin kurucu üyelerindendir. Prof. Dr. Feyza ARICIOĞLU Marmara Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Farmakoloji Anabilim Dalı ve Psikofarmakoloji AraĢtırma Birimi Dr. Arıcıoğlu Ġstanbul Üniversitesi Eczacılık Fakültesinden mezun olmuģ, Ġstanbul Üniversitesi Ġstanbul Tıp Fakültesinde Farmakoloji ve Klinik Farmakoloji Anabilim Dalında Yüksek Lisansını (1989) ve Doktorasını (1993) tamamlamıģtır yılında Marmara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Farmakoloji Anabilim Dalında göreve baģlamıģ, 1997 yılında Doçent ve 2004 yılından Profesör olmuģtur. YurtdıĢında Cornell Üniversitesi, Nörobilim-New York, Mississippi Üniversitesi, Psikiyatri-Jackson, Temple Üniversitesi, Farmakoloji-Philapelphia da, Max-Planck Enstitüsü,Psikiyatri-Münih ve Londra Üniversitesi, Farmakoloji de konuk araģtırmacı veya öğretim üyesi olarak çalıģmıģtır. Dr. Arıcıoğlu nun temel araģtırma alanı nöro ve psikofarmakolojidir. Halen Marmara Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Farmakoloji Anabilim Dalı Öğretim Üyesi ve Psikofarmakoloji AraĢtırma Birimi BaĢkanı, Avrupa Sağlıkta PhD Standartları TeĢkilatı (ORPHEUS) Türkiye Büyükelçisi, The International College of Neuropsychopharmacology (CINP) Eğitim Komisyonu Üyesi ve Türk Psikofarmakoloji Derneği Uluslararası Eğitim Koordinatörü olarak çalıģmaktadır.

37 Prof. Dr. Hakan S. ORER Koç Üniversitesi Tıp Fakültesi Hakan S. Orer, 1986 yılında Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesinden mezun oldu. Farmakoloji eğitimini yıllarında Fransız Hükümeti bursuyla gittiği Paris Pitié-Salpêtrière Tıp Fakültesi ve Hacettepe Üniversitesinde tamamlayarak Bilim Doktoru unvanını aldı yıllarında doktora sonrası çalıģmalarını ABD Michigan State Üniversitesinde tamamlayan Dr. Orer, 1995 yılında Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Farmakoloji anabilim Dalında göreve baģladı, döneminde Michigan State Üniversitesinde Konuk Doç. Dr. olarak çalıģtı ve 2003 yılında Profesör olarak atandı. Hacettepe Üniversitesinde, yıllarında Sağlık Bilimleri Enstitüsü Müdürü, yıllarında Tıp Fakültesi Cerrahi AraĢtırma ve Deney Hayvanları Ünitesi BaĢkanı olarak görev yapan Dr. Orer, 2013 yılından itibaren Koç Üniversitesi Tıp Fakültesinde çalıģmaktadır. Koç Üniversitesi Etik Kurulları BaĢkanlığı görevini yürütmekte olan Hakan S. Orer, aynı zamanda Orman ve Su ĠĢleri Bakanlığı Hayvan Deneyleri Etik Kurulu ve UNESCO Milli Komisyonu Biyoetik Uzman Komitesi üyesidir TÜBĠTAK Tıp TeĢvik Ödülüne layık görülen Dr. Orer in esas araģtırma alanı kan basıncının merkezi sinir sistemi tarafından kontrolü ve preklinik ilaç geliģtirme çalıģmalarıdır. Diğer ilgi alanları arasında akılcı farmakoterapi eğitimi, biyoetik, biyoinformatik ve transgenik fare modelleri bulunmaktadır yılından itibaren TÜBĠTAK Sağlık Bilimleri AraĢtırma Grubu DanıĢma Kurulu üyeliğini de sürdüren Dr. Orer Bilim Akademisi nin yanı sıra, Türk Farmakoloji Derneği ve Amerikan Fizyoloji Derneği nin aktif üyesidir. Prof. Dr. Ümit ZEYBEK Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Moleküler Tıp AD 1967 Ġstanbul doğumluyum. Tüm eğitim, çalıģma ve sosyal hayatım Ġstanbul da geçti ve mesleki kariyerim Ġstanbul Üniversitesi nde devam etmektedir. Ġ.Ü. Aziz Sancar Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü Moleküler Tıp Anabilm Dalı nda Profesör olarak çalıģmaktayım. Uzmanlık alanlarım Tıbbi Biyokimya ve Moleküler Tıp tır. Obezite, kardiyovasküler hastalıklar, diyabet, infeksiyon, kanser, nörolojik bozukluklar ve metabolik diğer hastalıklarla genetik yapı iliģkisi çalıģma/proje konularım arasında bulunmaktadır. Özellikle sportif performans ile sağlıklı yaģam ve genetik iliģkisi, moleküler biyoloji uygulamalarında kullanılan biyomedikal enstrumanların geliģtirilmesi ve beslenmeye deneysel ve klinik yaklaģım konularında uzun süreli bir deneyim sahibiyim. Diğer yandan deneysel kanser, diyabet ve sepsis modellerinin oluģturulmasıyla bağlantılı araģtırmalarım da bulunmaktadır.

38 Doç. Dr. Emel ERGÜL Kocaeli Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD 2001 yılında Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyoloji AD. Yüksek lisansını tamamladı yılında Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Biyoloji AD. Doktorasını tamamladı yılında Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD.'na Yrd. Doç. olarak atandı yılında Doçentlik ünvanını alarak Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD da Doç. Dr. olarak atandı. Kanser genetiği ve sitogenetik konularında çalıģmakta olup uluslararası 30 adet makalesi, uluslararası ve ulusal kongre özet kitapçıklarında basılmıģ 45 adet bildirisi bulunmaktadır. H-indexi 12 olup Bilimsel çalıģmaları 546 adet atıf almıģtır. Doç. Dr. Neslihan ABACI Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Genetik AD M.Ü. Atatürk Eğitim Fakültesi Biyoloji Öğretmenliğinden (Ġngilizce) 1996 yılında mezun olmuģtur. Yüksek lisans ve doktorasını Ġ.Ü. Sağlık Bilimleri Enstitüsü Genetik programında tamamlamıģtır yılında ABD de kısa süreli olarak NIH te Behçet Hastalığını ile Genom wide associaton çalıģmasında bulunmuģtur. Medüller Tiroid Kanseri, Hipertrofik Kardiyomiyopati ve Otoinflamatuvar hastalıklar genetiği ile ilgili çalıģmalarda bulunmuģtur yılında, Aziz Sancar DETAE bünyesinde kurulan Tüm Genom Laboratuarının kurucu kadrosunda yer almıģtır yılından bu yana Tüm Genom Laboratuvarı sorumlusudur. Yeni nesil dizilemede; viral DNA, mtdna, Metagenomiks ve Transkriptom çalıģmalarında ulusal ve uluslararası 13 makalede yer almıģtır. ÇalıĢma konuları ile ilgili uluslararası ve ulusal dergilerde yayınlanmıģ makaleleri bulunmaktadır. Doç. Dr. Sema SIRMA-EKMEKÇĠ Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Genetik AD 1996 yılında Ġstanbul Üniversitesi, CerrahpaĢa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyolojik Bilimler Bölümünden mezun olmuģtur. Yüksek Lisansını ve Doktorasını Ġstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü, Genetik Anabilim Dalında tamamlamıģtır. Amerika BirleĢik Devletleri, St. Jude Çocuk AraĢtırma Hastanesi, Genetik ve Tümör Hücre Biyolojisi bölümünde tez çalıģmalarını sürdürmüģ aynı zamanda Doktora sonrası araģtırmacı olarak çalıģmıģtır yılından beri Ġstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü nde görev yapmaktadır. Yeni nesil dizilemde; ChIP dizileme, Eksom dizileme ve Transkriptom çalıģmalarında bulunmuģtur. Bugüne kadar 26 uluslararası ve 7 ulusal makalesi bulunmaktadır.

39 Doç. Dr. Hale YAPICI-ESER Tıp Uygulama ve AraĢtırma Lisans eğitimini Hacettepe Üniversitesi nde tamamlamıģ olup, ve Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi nde Psikiyatri bölümünde ihtisasını tamamlamıģtır. Prof. Dr. Turgay Dalkara ve Doç. Dr. Emine Eren Koçak süpervizörlüğünde Hacettepe Üniversitesinde MD-PhD programı ile Nörobilim Yüksek Lisans derecesi almıģtır. Ayrıca Kopenhag Üniversitesi Biyolojik Psikiyatri Enstitüsü ve Harvard Üniversitesi McLean Hastanesi nde misafir araģtırmacı olarak bulunmuģtur. Dr. Yapıcı Eser in araģtırma alanları, zihin ve beden iliģkisinde akut ve kronik stres etkisini ve psikiyatrik bozuklukların eģlik etmesini konularını içermektedir. Devam eden çalıģmaları; çoklu araģtırma yöntemlerinin birleģtirildiği hayvan modelleri ve insanlar üzerinde yapılan translasyonel araģtırmaları içerir. Uzm. Dr. Vuslat YILMAZ, PhD. Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Sinirbilim AD İstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü nü 1997 yılında bitirdi. Aziz Sancar, DETAE, İmmünoloji AD de 2003 yılında yüksek lisansı, yine aynı bölümde 2010 senesinde doktora eğitimini tamamladı. Bu sırada, İstanbul Tıp Fakültesi, Fizyoloji AD de özellikle Miyasthenia gravis hastalığındaki immünolojik mekanizmalara yönelik çalışmalara devam etti. Doktora sonrası bir yıl CNRS-AIM ye bağlı Kas hastalıkları Araştırma nde (Paris) Miyasthenia gravis te B hücrelerinin yeni rolleri başlıklı çalışmayı yürüttü. Halen Aziz Sancar, DETAE, Sinirbilim AD de nöroimmünoloji temelli hastalıklar ve deneysel hayvan modelleri üzerinde çalışmaktadır. Dr. Ferda PAÇAL Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Genetik AD 2001 yılında Ġstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünden mezun olmuģtur. Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji Anabilim Dalında 2004 yılında yüksek lisansını, 2010 yine aynı birimde doktorasını tamamlamıģtır yılları arasında Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünde AraĢtırma Görevlisi olarak çalıģmıģtır yılından bu güne kadar Ġstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü nde Biyolog Dr. Olarak görev yapmaktadır. Bu güne kadar multidisipliner olarak 24 makale ve 2 kitapta yazarlığı bulunup, yeni nesil dizileme konusunda Mitokondriyal genom analizi, RNA sekanslama çalıģmalarında yer almıģtır.

40 Araş. Gör. Dr. Aris ÇAKĠRĠS Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Genetik AD Lisans eğitimini Ġstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü nde 2003 de tamamladı.yine aynı üniversitenin Sağlık Bilimleri Enstitüsü nde Genetik Bölümünde 2006 yılında yüksek lisansını 2012 yılında ise doktorasını tamamladı. ÇalıĢma alanı otoinflamatuvar hastalıkların genetiği (FMF, Behçet) olmak üzere ayrıca 2009 yılında Aziz Sancar Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü bünyesinde kurulmuģ olan Tüm Genom Analiz Laboratuvarı nın kurucu kadrosunda bulunmuģ ve bu alanda uluslararası ve ulusal birçok makalede yer almıģtır. Halen aynı enstitünün Genetik bölümünde çalıģmalarını sürdürmektedir. Dr. Ece ERDAĞ Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Sinirbilim AD Ben bir nörobiyologum ve merkezi sinir sisteminde (MSS) otoimmün bozukluklara neden olan anti-nöral antikorları saptamayı amaçlayan araģtırma projelerinde doktora sonrası araģtırmacı olarak çalıģıyorum yılında Ġstanbul Üniversitesi'nden Prof. Dr. Erdem Tüzün'ün danıģmanlığında Neuro- Behcet Hastalığı üzerine doktora derecemi aldım. AraĢtırmam, MSS otoimmünitesi ve nadir görülen nörolojik sendromlar üzerine yoğunlaģıyor. Oxford Üniversitesi ve Maastricht Üniversitesi'ndeki prestijli bilim insanlarıyla, dünyaca ünlü araģtırma laboratuarlarında çalıģma fırsatı elde ettim. Maastricht Üniversitesi'nden deney hayvanlarının bir sertifikasına sahibim. Araş. Gör. Dr. Zeliha EMRENCE Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Genetik AD 2008 yılında Marmara Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümünden mezun olmuģtur. Yüksek Lisansını (2010) ve Doktorasını (2016) Ġstanbul Üniverstesi Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü, Genetik Anabilim Dalında tamamlamıģtır yılından beri Ġstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü nde görev yapmaktadır. Yeni nesil dizileme konusunda; Mitokondriyal DNA dizileme, Ekzom dizileme çalıģmalarında bulunmuģtur. Bugüne kadar 12 uluslararası ve 3 ulusal makalesi bulunmaktadır

41 Dr. Burcu Dursun ATASU Tübingen Üniversitesi, Hertie Enstitüsü,Alman Nörodejeneratif Hastalıkları AraĢtırma Enstitüsü (DZNE) Burcu Dursun Atasu lisans eğitimini Ankara Üniversitesi, Biyoloji Bölümü'nde 2005 yılında tamamladı. Aynı yıl Ġstanbul Üniversitesi, Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü, Genetik Bölümü'nde Yüksek Lisans eğitimi sırasında, Pierre Marie Curie Üniversitesi, Paris'de Prof. Dr. Alexis Brice'in laboratuvarında Parkinson hastalığının genetik nedenleri üzerine misafir araģtırmacı olarak çalıģtı yılında, Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsün'de doktora eğitimine baģladı yılları arasında Prof Dr. Wolfgang Berger'in Zürih Üniversitesi, Tıbbi Moleküler Genetik enstitüsü bünyesindeki laboratuvarında ziyaretçi araģtırmacı olarak Ailesel Eksudatif Vitreoretinopati'nın moleküler ve genetik nedenleri üzerine çalıģtı yılında, Tübingen Üniversitesi'ne bağlı, Hertie Enstitüsü ve Alman Nörodejeneratif Hastalıkları AraĢtırma Enstitüsü'nde (DZNE), Prof Dr. Thomas Gasser ve Prof Dr. Peter Heutink in laboratuvarlarında doktora eğitimine devam etme kararı aldı ve hala aynı enstitütü bünyesinde çeģitli nörolojik hastalıklar (Distoni, Parkinson hastalığı ve Frontotemporal demans) üzerine genetik ve biyoinformatik analizleri yürütmektedir. Araş. Gör. Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Sinirbilim AD Ġstanbul Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü nden 2010 yılında mezun olmuģtur yılları arasında Ġstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü Sinirbilim Anabilim Dalı nda Sinirbilim Yüksek Lisans Programı nda yüksek lisans yapmıģtır. Yüksek lisans tez danıģmanı Doç. Dr. Erdem Tüzün, tez baģlığı Deneysel otoimmün MuSK miyastenia graviste sitokinlerin rolü dür yılından beri Ġstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü Sinirbilim Anabilim Dalı nda Ġleri Nörolojik Bilimler Doktora Programı nda eğitimine devam etmektedir. Ġlgilendiği araģtırma konuları nöroimmünoloji ve deneysel hayvan modelleridir. Bio. Atilla Mehmet GÜLER Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Genetik AD 2013 yılında Hacettepe Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünden mezun olmuģtur. Mezuniyet sonrası özel bir ilaç Ģirketinde kanser klinik araģtırmalarında görev alırken,2017 yılından itibaren Ġstanbul Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Genetik Anabilim Dalı nda yüksek lisans programına devam etmektedir.kanser,biyoinformatik ve davranıģ genetiği alanlarına ilgi duymaktadır.

42 Biyomüh. Nezahat Ece BĠBEROĞLU Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Genetik AD 2014 yılında Yıldız Teknik Üniversitesi, Kimya-Metalurji Fakültesi, Biyomühendislik Bölümünden mezun olmuģtur. Ġstanbul Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Genetik Anabilim Dalı nda yüksek lisansına devam etmektedir. Yeni nesil dizileme yöntemleri ve biyoinformatik alanlarına ilgi duymaktadır. Biyomüh. Burcu SALMAN Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Genetik AD 2015 yılında Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik (Ġngilizce) Bölümünden mezun olmuģtur. Ġstanbul Üniversitesi Sağlık BĠlimleri Enstitüsü Genetik Anabilim Dalı nda yüksek lisansına devam etmektedir. Yeni nesil dizileme yöntemleri, veri analizi ve biyoinformatik alanlarına ilgi duymaktadırve bu alanlardaki çalıģmalarda rol almaktadır. MSc. Melda SARIMAN Ġstanbul Üniversitesi, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, Genetik AD Ġstanbul Üniversitesi, Genetik AD, Aziz Sancar Deneysel Tıp ve AraĢtırma Enstitüsü, 2008 yılında Marmara Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümünden mezun olmuģtur Yüksek Lisansını Genetik Programında Aziz Sancar Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü- Ġç Hastalıkları Tıbbi Genetik Anabilimdalında yapmıģ olup, yılları arasında Ġstanbul Tıp Fakültesi Çoçuk Biyokimya Laboratuvarında çalıģmıģtır yılında baģladığı Doktora Genetik programına Aziz Sancar Deneysel Tıp AraĢtırma Enstitüsü Genetik Anabilimdalında halen devam etmektedir. Yeni Nesil Dizileme konusunda RNA dizileme Transkiptom konularında çalıģmalarda bulunmuģtur. 1 ulusal yayını 1 uluslararası makalesi bulunmaktadır.

43