Grid Veri Yönetimi Aslı Zengin asli@ulakbim.gov.tr www.grid.org.tr
Grid Veri Yönetimi Nedir? Kullanıcı ve uygulamaların ürettiği ya da ihtiyaç duyduğu verilerin Grid ortamında saklanması amaçlanır. Grid verilerle dosya seviyesinde ilgilenir. Veri yapıları ele alınmıyor. Depolama kaynaklarında saklanan Grid dosyaları saltokunurdur: (read-only) Değiştirilemez. Silinip yerine yenisi konulabilir. Dosyalar heterojen yapıdadır. (ascii, binary...)
Depolama Elemanları (Storage Element) Storage Element kullanıcı ya da uygulamanın gelecekte kullanmak üzere Grid de veri depolamasını sağlayan Grid servisidir. Storage Element tarafından kullanılan protokoller: GSIFTP Storage Element ve kullanıcı arasında güvenli, hızlı ve verimli dosya transferini sağlar. RFIO(Remote File Input/Output protocol) ve Gsidcap(GSI dcache Access Protocol) farklı tip Storage Element lerde depolanan dosyalara direk uzaktan erişimi sağlar.
Depolama Elemanları (Storage Element) Grid de 4 farklı tip Storage Element mevcut: 1. 2. 3. 4. Classic SE (Şu an TR-Grid altyapısında kullanılan SE tipi. GSIFTP sunucusunu içerir.) CASTOR dcache LCG Disk Pool Manager Depolama Kaynak Yönetimi (Storage Resource Management SRM): Classic SE dışındaki SE tipleri SRM arayüzü içerir. SRM arayüzü, depolama kaynaklarının karmaşıklığını kullanıcıdan gizler.
glite Ortakatmanında Dosya Adları Grid Unique IDentifier (GUID) : guid:<belirli bir dosyaya ait 36 Byte uzunluğunda character dizisi> guid:38ed3f60-c402-11d7-a6b0-f53ee5a37e1d Logical File Name (LFN) : GUID si belli olan bir dosyayı çağırmak için kullanılan, kullanıcının belirlediği alias lfn:/grid/<myvo>/<mydirs>/<myfile> Storage URL (SURL) ya da Physical File Name (PFN) : Dosyanın Storage Element teki gerçek yeri sfn://se.ulakbim.gov.tr/data/dteam/dosya1 Transport URL (TURL) : Dosyanın depolama elemanındaki anlık geçici yeri gsiftp://se.ulakbim.gov.tr/data/dteam/dosya1
glite Ortakatmanında Dosya Kataloğu (LCG File Catalogue LFC) Kullanıcılar doyalarını Grid de saklamaya ihtiyaç duyar. LFC; GUID, LFN ve SURL ler arasında eşleştirme yapmayı sağlayan Grid servisidir. LFC kendisine kaydı yaptırılmış tüm dosyaların bilgisini tutar ve bilgi servisinde yayınlar. LFC lokal çalışarak sadece belirli site ve sanal organizasyonlardan gelen dosyaların kayıtlarını tutabilir ya da global çalışarak altyapıda yer alan tüm dosyaların bilgisini tutabilir. Grid dosyası: Hem fiziksel olarak Storage Element te depolanan, hem de mantıksal olarak kaydı LFC ye yapılmış olan dosya
glite Ortakatmanında Dosya Kataloğu (LCG File Catalogue LFC) Sistem Meta Verisi Kullanıcı Meta Verisi Kullanıcı Tanımlı Meta Veri size => 10234 cksum_type => MD5 cksum => yy-yy-yy GUID grid/dteam/dir1/dir2/file1.root / Sembolik Bağlantı /grid/dteam/mydir/mylink Xxxxxx-xxxx-xxx-xxx- Replika Replika Replia srm://host.example.com/foo/bar Replika host.example.com srm://host.example.com/foo/bar host.example.com srm://host.example.com/foo/bar host.example.com sfn://host.example.com/foo/bar host.example.com
LFC Komutları Dosya kataloğunun kullanılabilmesi için, Geçerli bir proxy sertifikası oluşturmuş olmak gerekir. $LFC_CATALOG_TYPE, $LFC_HOST çevre değişkenlerinin tanımlanmış olması gerekmektedir: export LCG_CATALOG_TYPE=lfc export LFC_HOST=lfc.ulakbim.gov.tr lfc-* komutlarını kullanırken LFC üzerinde işlem yapabileceğimiz dizinin /grid/sanal_organizasyon_adi (Örn: /grid/sgdemo) olduğunu unutmamalıyız. Eğer böyle bir dizin yoksa LFC bu sanal organizasyonu desteklemiyor demektir.
LFC Komutları lfc-chmod LFC dosya ya da dizininin erişim haklarını değiştirir lfc-chown LFC dosya ya da dizininin sahiplik bilgilerini değiştirir lfc-delcomment LFC dosya ya da dizininin eklenmiş yorum bilgisini siler lfc-getacl lfc-ln LFC dosya ya da dizininin erişim kontrol listesini alır LFC dosya ya da dizinine sembolik Link yaratır lfc-ls LFC de dosya ve dizinleri listeler lfc-mkdir LFC dizin yaratır lfc-rename LFC dosya ya da dizininin dosya/dizin ismini değiştirir lfc-rm LFC dosya ya da dizinini siler lfc-setacl LFC dosya ya da dizininin erişim kontrol listesini tanımlar lfc-setcomment LFC dosya ya da dizininin üzerine yorum bilgisi ekler
LFC Komutları - Örnekler lfc-ls : Verilen bir dizindeki LFN leri listele. /grid/<vo_adı>/<kullanıcının oluşturduğu dizinler> LFC İsimlendirmesi Kullanıcı tarafından tanımlanır $ lfc-ls l /grid/sgdemo/... -rw-rw-r--rw-rw-r--rw-rw-r--rw-rw-r--rw-rw-r--rw-rw-r-... 1 1 1 1 1 1 4401 4401 4401 4401 4401 4401 4400 4400 4400 4400 4400 4400 0 0 0 0 0 0 Jun Jun Jun Jun Jun Jun 21 21 21 21 21 21 09:39 09:40 09:36 09:36 09:38 09:38 tutor14 tutor16-mytxt uploadfile uploadfilelfn user.example user.example2 $ lfc-ls l /grid/sgdemo/user.example -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:38 user.example $ export LFC_HOME=/grid/sgdemo/ $ lfc-ls l user.example -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:38 user.example
LFC Komutları - Örnekler lfc-ln s dosya/dizin link_adı : Sembolik link yarat. $ lfc-ln -s /grid/sgdemo/user.example /grid/sgdemo/linkler/link_to_user.example Orijinal dosya lfc-mkdir : Dizin yarat. $ lfc-mkdir /grid/sgdemo/examples Yarattığınız dizini görmek için: $ lfc-ls -l /grid/sgdemo Sembolik link
LFC Komutları - Örnekler metaveri bilgisi ekleme/çıkartma lfc-setcomment path açıklama (LFC deki bir dosya ya da dizine ilişkin açıklama ekler.) lfc-delcomment path (LFC deki bir dosya ya da dizine ait açıklamayı siler.) $lfc-setcomment /grid/sgdemo/user.example Merhaba Eklediğimiz yorumu görmek için: $lfc-ls --comment /grid/sgdemo/user.example /grid/gilda/user.example Merhaba $lfc-delcomment /grid/sgdemo/user.example Sildiğiniz yorumu görmek için: $lfc-ls l --comment /grid/sgdemo/user.example -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:38 /grid/sgdemo/user.example
Dosya ve Replika Yönetimi lcg-* komutlarını çalıştırabilmek için geçerli bir proxy sertifikasına sahip olmak gerekir. lcg-* dosya ve replika komutlarının çalışması için $LCG_GFAL_INFOSYS çevre değişkeninin tanımlanmış olması gerekmektedir: $export LCG_GFAL_INFOSYS=bdii.ulakbim.gov.tr:2170 $LCG_GFAL_VO çevre değişkeni tanımlanırsa, komutlarda kullanıcının vo opsiyonuyla dahil olduğu sanal organizasyonu belirtmesine gerek kalmaz. $export LCG_GFAL_VO=sgdemo $VO_<VO>_DEFAULT_SE çevre değişkeni tanımlanırsa, komutlarda kullanıcının Storage Element belirtmesine gerek kalmaz. $export VO_sgdemo_DEFAULT_SE=se.ulakbim.gov.tr
Dosya ve Replika Yönetimi lcg-cp Bir grid dosyasını lokale kopyalar (download) lcg-cr Lokaldeki bir dosyayı SE ye kopyalar ve LFC ye kaydeder (upload) lcg-del SE dek bir dosyayı siler (bir replika ya da tüm replikalar olabilir) lcg-rep Bir dosyayı bir SE den başka bir SE ye kopyalar ve LFC ye kaydeder (replicate) lcg-aa Verilen bir GUID ye LFC de alias ekler lcg-ra Verilen bir GUID nin LFC deki alias ını kaldırır lcg-rf SE deki bir dosyayı LFC ye kaydeder lcg-uf SE deki bir dosyanın LFC deki kaydını siler lcg-la Verilen bir LFN, GUID ya da SURL alias ları listeler lcg-lg Verilen bir LFN ya da SURL nin GUID sini getirir lcg-lr Verilen bir LFN, GUID ya da SURL nin replikalarını listeler
Dosya ve Replika Yönetimi - Örnekler lcg-cr: $lcg-cr -v -d se.ulakbim.gov.tr -l lfn:/grid/sgdemo/test.out --vo sgdemo file:///home/egitim20/test.out => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, kullanıcı arayüzündeki (lokaldeki) /home/egitim20/test.out dosyasını lfn:/grid/sgdemo/test.out LFC kaydı altında, se.ulakbim.gov.tr depolama elemanına kopyala. (-v verbose özelliğini kullanarak) Komutun çıktısı olarak bize se.ulakbim.gov.tr ye kopyalanan test.ou dosyası için oluşturulmuş GUID geri döner: guid:5dfb82d2-c26a-444a-8c83-9d2c35d84d05 gibi...
Dosya ve Replika Yönetimi - Örnekler lcg-rep: $lcg-rep -v --vo sgdemo d se02.grid.acad.bg guid:5dfb82d2c26a-444a-8c83-9d2c35d84d05 => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, guid:5dfb82d2-c26a-444a-8c839d2c35d84d05 ile saklanan dosyanın se02.grid.acad.bg isimli Strorage Element te replikasını oluştur. $lcg-rep -v --vo sgdemo d se02.grid.acad.bg lfn:/grid/sgdemo/test.out => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, lfn:/grid/sgdemo/test.out ile saklanan dosyanın se02.grid.acad.bg isimli Strorage Element te replikasını oluştur. $lcg-rep -v --vo sgdemo d se02.grid.acad.bg sfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/sgdemo/generated/2006-1110/filex => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, sfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/sgdemo/generated/2006-11-10/filex ile saklanan dosyanın se02.grid.acad.bg isimli Strorage Element te replikasını oluştur. Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi 16/32
Dosya ve Replika Yönetimi - Örnekler lcg-lr: $ lcg-lr --vo sgdemo lfn:/grid/sgdemo/test.out => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, LFC de lfn:/grid/sgdemo/test.out alias ı ile saklanan tüm replikaları listele. Komutun çıktısı: sfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/sgdemo/generated/ 2006-11-10/fileX sfn:// se02.grid.acad.bg /storage/sgdemo/generated/2007-02-11/filey Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi 17/32
Dosya ve Replika Yönetimi - Örnekler lcg-lg: $ lcg-lg --vo sgdemo sfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/sgdemo/generated/200611-10/filex => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, SE de sfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/sgdemo/generated/2006-11-10/filex ile saklanan dosyanın GUID sini getir YA DA $ lcg-lg --vo sgdemo lfn:/grid/sgdemo/test.out => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, LFC de lfn:/grid/sgdemo/test.out ile kayıtlı dosyanın GUID sini getir Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi 18/32
Dosya ve Replika Yönetimi - Örnekler lcg-cp: $ lcg-cp --vo sgdemo -t 100 -v lfn:/grid/sgdemo/test.out file:///tmp/test.kopya => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, LFC de lfn:/grid/sgdemo/test.out ile kayıtlı dosyayı, timeout 100 saniye olacak şekilde, lokale (kullandığım kullanıcı arayüz makinasına) /tmp/ altına test.kopya olarak kopyala. (verbose ederek) Diğer komutlarda da olduğu gibi lfn yerine guid ya da sfn de kullanılabilir. Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi 19/32
Dosya ve Replika Yönetimi - Örnekler lcg-del: $ lcg-del --vo sgdemo -s se.ulakbim.gov.tr guid:91b89dfeff95-4614-bad2-c538bfa28fac => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, 91b89dfe-ff95-4614-bad2c538bfa28fac GUID li grid dosyasının se.ulakbim.gov.tr deki replikasını sil. $ lcg-del --vo sgdemo a guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2c538bfa28fac => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, 91b89dfe-ff95-4614-bad2c538bfa28fac GUID li grid dosyasının tüm replikalarını sil. Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi 20/32
Dosya ve Replika Yönetimi - Örnekler lcg-aa: $ lcg-aa --vo sgdemo guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2c538bfa28fac lfn:/grid/sgdemo/yeni_alias => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, 91b89dfe-ff95-4614-bad2c538bfa28fac GUID li grid dosyası için LFC de lfn:/grid/sgdemo/yeni_alias isimli yeni bir alias tanımla. $lcg-la --vo sgdemo guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2c538bfa28fac (Belirtilen GUID ye ait bütün alias ları listele.) Komutun çıktısı: lfn:/grid/sgdemo/test.out (eski alias) lfn:/grid/sgdemo/yeni_alias (eklenen yeni alias) Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi 21/32
Dosya ve Replika Yönetimi - Örnekler lcg-ra: $ lcg-ra --vo sgdemo guid:91b89dfe-ff95-4614bad2-c538bfa28fac lfn:/grid/sgdemo/test.out => sgdemo VO sunun kullanıcısına ait, 91b89dfe-ff95-4614-bad2c538bfa28fac GUID li grid dosyası için LFC deki lfn:/grid/sgdemo/test.out alias ını sil. $lcg-la --vo sgdemo guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2c538bfa28fac (Belirtilen GUID ye ait bütün alias ları listele.) Komutun çıktısı: lfn:/grid/sgdemo/yeni_alias (test.out alias ı silindiği için artık listede görünmüyor.) Akademik Bilişim 2007, Dumlupınar Üniversitesi 22/32