ÖZGEÇMİŞ 1. Adı Soyadı : Musa Hakan ASYALI 2. Doğum Tarihi : 10 Şubat 1969 3. Unvanı : Prof. Dr. 4. Öğrenim Durumu: Derece Alan Üniversite Yıl Lisans Elektrik Elektronik Mühendisliği Bilkent Üniversitesi 1990 Doktora Biyomedikal Mühendisliği University of Southern California, A.B.D. 1998 5. Akademik Unvanlar Arş.Gör. Elektrik Elektronik Mühendisliği Bilkent Üniversitesi 1990 1992 Arş.Gör. Department of Biomedical University of Southern 1992 1998 Engineering Yrd.Doç.Dr. Elektrik Elektronik Mühendisliği 1998 2000 California, A.B.D. Ege Üniversitesi Doç.Dr. Elektrik Elektronik Mühendisliği Ege Üniversitesi 2000 2001 Prof.Dr. Bilgisayar Mühendisliği Yaşar Üniversitesi 2006 2008 Prof.Dr. Biyomedikal Mühendisliği Erciyes Üniversitesi 2008 2009 Prof.Dr. Elektrik Elektronik Mühendisliği Zirve Üniversitesi 2009 2010 Prof.Dr. Biyomedikal Mühendisliği Erciyes Üniversitesi 2010 2011 Prof.Dr. Biyomedikal Mühendisliği Abdullah Gül Üniversitesi 2011-2012
6. Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri 6.1. Yüksek Lisans Tezleri Uzun, İ.S., Kalp Atış Değişkenliğinin Nonlineer Analizi Ege Üniversitesi, 2001. 6.2. Doktora Tezleri Ersan, F., Akselerometrik Tremor Ölçümü ve Analizi, Ege Üniversitesi, 2007. Aksebzeci, H., Mikroorganizmaların Elektronik Burun Teknolojisi Kullanılarak Tanımlanması ve Sınıflandırılması, Erciyes Üniversitesi, 2011. Okkesim, Ş., Anjiyografinin Yol Açtığı Stresin Elektrofizyolojik Metotlarla Objektif Olarak Belirlenmesi, Erciyes Üniversitesi, 2011. Kayaaltı, Ö., Karaciğerin Bilgisayarlı Tomografi Görüntülerinde Doku Analizi Kullanılarak Kistik ve Sirozlu Yapıların Tanısı, Erciyes Üniversitesi, ( Devam etmekte ). 7. Yayınlar 7.1. Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler Asyalı, M. H., M. Yılmaz, M. Tokmakçı, K. Sedef, B.H. Aksebzeci, R. Mittal, Design and implementation of a voice-controlled prosthetic hand, Turkish Journal of Electrical Engineering & Computer Sciences, Vol.19, No.1, p. 33-46, 2011. Asyalı, M. H., Design of optimal sampling times for pharmacokinetic trials via spline approximation, Turkish Journal of Electrical Engineering & Computer Sciences, Vol.18, No.6, p. 1019-1030, 2010. Aksebzeci, B.H., M.H. Asyalı, Y. Kahraman, Ö. Er, E. Kaya, H. Özbilge, S. Kara, Classification of root canal microorganisms using electronic-nose and discriminant analysis, BioMedical Engineering OnLine, 9:77, 2010. Yılmaz, B., M.H. Asyalı, E. Arıkan, S. Yetkin, F. Özgen, Sleep stage and obstructive apneaic epoch classification using single-lead ECG, BioMedical Engineering OnLine, 9:39, 2010. Alci, M., M.H. Asyali, Nonlinear system identification via Laguerre network based fuzzy systems, Fuzzy Sets and Systems, Vol. 160, Issue 24, Pages 3518-3529, 2009. Asyali, M.H., Gene expression profile class prediction using linear Bayesian classifiers, Comp. Biol. Med., Vol. 37, No. 12, pp.1690-1699, 2007. Asyali, M.H., R.B. Berry, M.C.K. Khoo, and A. Altinok, Determining a continuous marker for sleep depth, Comp. Biol. Med., Vol. 37, No. 11, pp.1600-1609, 2007.
Yılmaz, S., A. Alkan, and M.H. Asyali, Applications of Parametric Spectral Estimation Methods on Detection of Power System Harmonics, Electric Power Systems Research, doi:10.1016/j.epsr.2007.05.011 (In Press, Available online 2 July 2007). Zheng L, Polavieja GG, Wolfram V, Asyali MH, Hardie RC, Juusola M, Feedback network controls photoreceptor output at the layer of first visual synapses in Drosophila, Journal of General Physiology, 127 (5): 495-510, May 2006. Asyali, M.H., D. Colak, O. Demirkaya, M.S. Inan, Gene Expression Profile Classification: A Review, Current Bioinformatics, Vol. 1, No. 1, pp. 55-73, 2006. Demirkaya, O., M.H. Asyali, Segmentation of cdna Microarray Spots using Markov Random Field Modeling, Bioinformatics, Vol. 21, No. 5, pp. 644-649, 2005. Asyali, M.H., M. Alci, Reliability analysis of microarray data using fuzzy C-means and normal mixture modeling based classification methods, Bioinformatics, Vol. 21, No. 5, pp. 644-649, 2005. Asyali, M.H., M. Juusola, Use of the Meixner Functions in Estimation of Volterra Kernels of Nonlinear Systems with Delay, IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Vol. 52, No. 2, pp. 229-237, 2005. Asyali, M.H., M.M. Shoukri, O. Demirkaya, K.S.A. Khabar, Assessment of reliability of microarray data and estimation of signal thresholds using mixture modeling Nucleic Acids Research, Vol. 32, No. 8, pp. 2323-2335, 2004. Alci, M., M.H. Asyali, Assessment of Reliability of Microarray Data Using Fuzzy C-Means Classification, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 3316, pp. 1322-1327, 2004. Demirkaya, O., M.H. Asyali, Determination of image bimodality thresholds for different intensity distributions, Signal Processing: Image Communication, Vol. 19, No. 6, pp. 507-516, 2004. Shoukri, M.M., M.H. Asyali, Statistical Inference on Mixture of Two Binomial Distributions with Applications in Genetic Linkage, Far East Journal of Theoretical Statistics, Vol. 13, No. 1, pp. 81-100, 2004. Shoukri, M.M., M.H. Asyali, A. Donner, Sample Size Requirements for the Design of Reliability Study: Review and New Results, Statistical Methods in Medical Research, Vol. 13, No. 4, pp. 251-271, 2004. Shoukri, M.M., M.H. Asyali, R. VanDorp, and D. Kelton, The Poisson Inverse Gaussian Regression Model in the Analysis of Clustered Counts Data, Journal of Data Science, Vol. 2, No.1, pp. 17-32, 2004. Shoukri, M.M., M.H. Asyali, S.D. Walter, Issues of Cost and Efficiency in the Design of Reliability Studies, Biometrics, Vol. 59, No. 4, pp.1107-1112, 2003.
Shoukri, M.M., M.A Chaudhary, M. H. Asyali, Confidence Intervals for the Limiting Availability Assuming Correlated Rayleigh Random Variables, Journal of Statistical Research, Vol. 37, No. 2, pp. 183-191, 2003. Asyali, M.H., M.C.K Khoo, R.B. Berry, Assessment of Closed-Loop Ventilatory Stability in Obstructive Sleep Apnea, IEEE Transactions on Biomedical Engineering, Vol. 49, No. 3, pp. 1434-1441, Mar. 2002. Khoo, M.C.K., J.J. Shin, M.H. Asyali, T.S. Kim and R.B. Berry, Ventilatory Dynamics of Transient Arousal in Patients with Obstructive Sleep Apnea, Respiration Physiology, Vol. 85, No. 4, pp. 1434-1441, 1998. Berry, R.B., M.H. Asyali and M.C.K Khoo, Within Night Variation in Respiratory Effort Proceeding Apnea Termination and EEG Delta Power in Sleep Apnea, Journal of Applied Physiology, Vol. 112, pp. 291-303, 1998. 7.2. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceeedins) basılan bildiriler. Aksebzeci, B.H., M. H. Asyalı, Y. Kahraman, Ö. Er, E. Kaya, H. Özbilge, S. Kara. Classification of Microorganism Species using Electronic Nose and Support Vector Machines, The 1st International Symposium on Computing in Science & Engineering ISCSE 2010, June 3-5, 2010, Kusadasi, Turkey. Alcı, M., M. H. Asyalı, Fuzzy-ARMAX Modeling for Nonlinear System Identification, 1 st International conference on Soft Computing Techniques in Economy, Nov. 19-21, 2007, Baku, Azerbaijan. Asyalı, M.H., M. Alcı, Obtaining Volterra Kernels from Neural Networks World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering 2006 (WC 2006) Seoul, Korea, Aug. 27- Sep. 1, 2006. Asyalı, M.H., M. Alcı, Comparison of Fuzzy and Volterra Series Based Nonlinear System Modeling International Symposium on Mathematical Methods in Engineering Çankaya University, Ankara, April 27-29, 2006. Pirim, H., M. H. Asyalı, Self-Organization Inspired from Biological Cell International Conference on Modeling and Simulation (AMSE 06) Selcuk University, Konya, August 28-30, 2006. Alci, M., Y. Becerikli, M.H. Asyali, Orthogonal Fuzzy System Approximation and its Application to Time Series Prediction, Proceedings of the Turkish Symposium on Artificial Intelligence and Neural Networks (TAINN 2005), pp. 431-438, Izmir, 2005.
Asyali, M.H., Discrimination Power of Long-Term Heart Rate Variability Measures, Proceedings of the 25th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, pp. 200-203, Cancun, 2003. Demirkaya, O., M.H. Asyali, M.M. Shoukri, and K.S. Abu-Khabar, Segmentation of Microarray cdna Spots Using MRF-Based Method, Proceedings of the 25th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, pp. 674-677, Cancun, 2003. Uzun, I.S., M.H. Asyali, G. Çelebi, and M. Pehlivan, Nonlinear Analysis of Heart Rate Variability, Proceedings of the 23th Annual IEEE EMBS International Conference, pp. 1581-1584, Istanbul, 2001. Asyali, M.H., Introduction of a New Technique to Estimate Volterra Kernels of Physiological Systems and its Associated Application Mathematical Tool, Proceedings of the Biomedical Engineering National Meeting BIYOMUT, pp. 66-71, Kayseri, 1999. Asyali, M.H., O. Mermer and I.S. Uzun, Simulation of Nonlinear Dynamics of the Nerve Membrane through the Hodgkin-Huxley Model (Part I), Proceedings of the Biomedical Engineering National Meeting BIYOMUT, pp. 121-130, Kayseri, 1999. Asyali, M.H., State and Respiratory Variability in Obstructive Sleep Apnea: A Modeling Perspective, Proceedings of the Biomedical Engineering National Meeting BIYOMUT, pp. 31-45, Istanbul, 1998. Oğuz, S.H., M.H. Asyali, A Morphology Based Algorithm for Baseline Wander Elimination in ECG Records, Proceedings of the IEEE International Biomedical Engineering Days, pp. 157-160, Istanbul, 1992. Karaman, M., C. Aydin, E. Kolagasioglu, M. Toygar, A. Baktir, E. Erzin, R. Tahboub, F. Kilic, M.H. Asyali, and A. Atalar, VLSI Design of a Digital Beam Former for Phased Array Medical Ultrasound Imaging, Proceedings of the Bilkent University Electrical Electronics and Computer Engineering Conference, pp. 297-300, Ankara, 1991. 7.3. Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler Signals and System Lab Using Matlab (İngilizce, 200 sayfa) Matlab Kullanarak Sinyaller ve Sistemler Laboratuarı Web sitesi: http://asyali.org/matlab.asp Image Processing with MATLAB: Applications in Medicine and Biology, CRC Press (İngilizce, 488 sayfa, 22 Aralık, 2008 #ISBN-10: 0849392462, #ISBN-13: 978-0849392467) Web sitesi: http://www.biomedimaging.org/
Celebi, G., I. S Uzun, M.H. Asyali, and M. Pehlivan, Nonlinear Analysis of Heart Rate Variability. Book Chapter in Nonlinearity and Disorder: Theory and Applications, pp. 387-396, Kluwer Publishers, 2001, New York (Editors: Abdullaev F.; Bang, O.; Sørensen, M.P.) ISBN: 9781402001918. Asyalı, M.H., M.Alcı, Comparison of Fuzzy and Volterra Series Nonlinear System Modeling Approaches Book Chapter in Mathematical Methods in Engineering, pp. 335-345, Springer, 2007, Dordrecht, (Editors: Tas, K.; Tenreiro Machado, J.A.; Baleanu, D.), 2007, ISBN: 9781402056772. 7.4. Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler Kutlu, K., Ç. Sel, M.H. Asyalı, S. Öztayfun, Ses Kontrollü Elektrik Anahtarı, Yaşar University e-journal, Vol 1, No: 3, 2006. Kumova Metin, S., M.H. Asyalı, T. Dalbastı, Spektrometre ve Kolorimetre Uygulamaları İçin CCD Array Verisi Okunması ve İşlenmesi, Yaşar University e- Journal, Vol 1, No: 3, 2006. Asyalı, M.H., M. Dokumacı, M. Özden, T. Dalbastı, Tomografik Görüntüleme Yöntemiyle Cisimlerin Yerinin İki Boyutlu Düzlemde Algılanması (Sensing the Location of an Object over Two Dimensional Plane Using Tomographic Imaging Method), Yaşar University e-journal, Vol 1, No: 2, 2006. Turgutalp, E.R., M. H. Asyali, A New Proof of Pythagorean Theorem, Yaşar University e-journal, Vol 1, No: 2, 2006. Gultekin, A.T., M.H. Asyali, Pi Sayısının Monte-Carlo Metodu ve Gregory/Leibniz Formülüyle Hesaplanması, Yaşar University e-journal, Vol. 2, No: 7, 2007. Asyali, M.H., T. Dalbasti, An Image Analysis Based Method for the Quantification of Tremor, Yaşar University e-journal, Vol. 2, No: 7, 2007. 7.5. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler Kayaaltı, Ö., B.H. Aksebzeci, M.H. Asyalı, Ö.İ. Karahan, K. Deniz, M. Öztürk, Karaciğer Sirozunun Doku Analizi, 15.Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BIYOMUT 2010), Antalya, 21-24 Nisan 2010. Özdemir, A.T., K. Danışman, M.H. Asyali, FPGA Tabanlı Aritmi Sınıflandırıcı, 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BIYOMUT 2009), İzmir, 20-24 Mayıs 2009. Okkesim, Ş., M.H. Asyali, S. Kara, M.G. Kaya, İ. Ardıç, Koroner Anjiyografi Kaynaklı Anksiyetinin Deri İletkenliği ve Pletismografi ile Değerlendirilmesi, 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BIYOMUT 2009), İzmir, 20-24 Mayıs 2009.
Aksebzeci, B.H., S. Kara, M.H. Asyali, Y. Kahraman, Ö. Er, E. Kaya, H. Özbilge, M.H. Asyalı, Mikroorganizma Türlerinin Ayırma Analizi ile Sınıflandırılması, 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BIYOMUT 2009), İzmir, 20-24 Mayıs 2009. İçer, S., T. İkizceli, A. Coşkun, M.H. Asyali, Karaciğer Yağlanması Ultrasonografi Görüntülerinin Değerlendirilmesi, 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BIYOMUT 2009), İzmir, 20-24 Mayıs 2009. Kayaaltı, Ö., M.H. Asyali, İ.S. Tuna, A.C. Durak, Karaciğer Kist Hidatiğinin Doku Analizi, 14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BIYOMUT 2009), İzmir, 20-24 Mayıs 2009. Kara, S, F. Latifoglu, M.H. Asyali, Hamilelikte Fetus Gelişiminin Umbilikal Atardamar Doppler Sinyalleri İle Değerlendirilmesi, 13. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BIYOMUT 2008), ODTÜ, Ankara, 29-31 Mayıs 2008. Okkesim, Ş., S. Kara, M. H. Asyalı, T. Uysal, Sınıf 2 Malokluzyona Sahip Çocuklarda Kullanılan Apareyın 6 Ay Sonunda Çene Kaslarında Oluşturduğu Etkinin Değerlendirilmesi,13. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BİYOMUT 2008), ODTÜ, Ankara, 29-31 Mayıs 2008. Kara, S., F. Latifoglu, M. H. Asyalı, Hamilelikte Fetus Gelişiminin Umbilikal Atardamar Doppler Sinyalleri ile Değerlendirilmesi, 13. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BIYOMUT 2008), ODTÜ, Ankara, 29-31Mayis 2008. Asyalı, M.H., A. T. Özdemir, B.H. Aksebzeci, K. Danışman, Aritmi Sınıflandırmada Kullanılan Yapay Sinir Ağlarının Karmaşıklığın Azaltılması, 13. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (BIYOMUT 2008), ODTÜ, Ankara, 29-31Mayis 2008. Asyalı, M.H., A. Alkan, Identification of Epileptic Seizures Using Discriminant Analysis Genç Bilim İnsanları ile Beyin Biyofiziği; Darboğazlar ve Çözüm Arayışları Çalıştayı, 9-11 Mayıs 2007, 9 Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, Biyofizik Ana Bilimdalı, İzmir. Shoukri, M.M., M.H. Asyali, Analysis of Clustered Count Data Using Poisson Inverse Gaussian Regression, EMR Conference of International Biometric Society, Antalya, 2003. Asyali, M.H., N. Elkum, Optimization of Sampling Time Designs in Bioequivalence Tests: A Comparison of Techniques, EMR Conference of International Biometric Society, Antalya, 2003.
Elkum, N., M.H. Asyali, Design of Optimal Sampling Times in Bioequivalence Studies: A Simulation Approach, EMR Conference of International Biometric Society, Antalya, 2003. Asyali, M.H., O. Demirkaya, Noise Reduction in 3-D PET Images Using Anisotropic Diffusion Filtering, 5th International Congress of Nuclear Oncology and 15th National Congress of Turkish Society of Nuclear Medicine, Kusadasi, 2002. Khoo, M.C.K., M.H. Asyali and R.B. Berry, Fluctuations in state and respiratory variability during sleep: A modeling perspective, FASEB JOURNAL 12 (4): 1895 Part 1 Suppl. S Mar 17, 1998. (SCI indexed) Asyali, M.H., M.C.K. Khoo, Closed-Loop Modeling of the Ventilatory Response to Transient Arousal from Sleep, Annals of Biomedical Engineering, Vol. 25, Supplement 1, pp. S18, 1997 IEEE BMES Annual Fall Meeting, San Diego, 1997. Berry, R.B., M.H. Asyali, M.C.K. Khoo, Cyclic Variability in the Arousal Threshold to Airway Occlusion in Obstructive Sleep Apnea, Proceedings of the American Lung Association and American Thoracic Society International Conference, San Francisco, 1997. Khoo, M.C.K., R.B. Berry, J.W. Shin, M.H. Asyali, R. Woo and P. Sadowsky, Ventilatory Dynamics of Arousal in Obstructive Sleep Apnea Syndrome During CPAP Application, Proceedings of American Lung Association International Conference, New Orleans, 1996. Shin, J.W., R.B. Berry, M.H. Asyali and M.C.K. Khoo, Quantitative Assessment of Sleep Disordered Breathing Using a Fuzzy Logic Based Algorithm, Proceedings of American Lung Association International Conference, New Orleans, 1996. 7.6. Diğer yayınlar Asyali, M.H., An Introduction to Wavelet Analysis and Edge Detection on Medical Images Using Discrete Wavelet Transform, Research Report, submitted to Biomedical Engineering Dept., University of Southern California, Los Angeles, May 1996. ( Rapor ) Asyali, M.H., Power Spectrum Analysis of Heart Rate Variability Signal and Computer Simulation of Interaction Between Heart Rate Variability and Respiration, Research Report, submitted to Biomedical Engineering Dept., University of Southern California, Los Angeles, December 1993. ( Rapor ) Asyali, M.H., Computer Simulation Experiments on the Nonlinear Dynamics of the Nerve Membrane Through the Hodgkin-Huxley Model, Research Report, submitted ( Rapor )
8. Projeler Yurtdışı Kaynaklı Tamamlanmış Proje King Faisal Specialist Hospital & Research Center Biostatistics, Epidemiology and Scientific Computing Bölümündeki bilim adamı/araştırmacı görevim sırasında aşağıda İngilizce isimleri ve kısa açıklamaları sunulan projelerde, proje yöneticisi (PI), yönetici yardımcısı (co-pi) ya da araştırmacı (co-i) olarak görev yaptım. Bu projeler hakkında daha fazla bilgi aşağıdaki internet adresinden alınabilir. http://www.asyali.org/research.htm (RAC # xxxx-yyy: Projeye King Faisal Research Center tarafından verilen onay kodunu göstermektedir.) Asyalı, M.H., PI; M. Juusola, co-i, Estimation of Volterra Kernels of Physiological Systems Using Meixner Functions, RAC # 2020-018, Cambridge University, Physiology Lab) Asyali, M.H., PI, Diagnostic Power of Different Heart Rate Variability Measures in Detecting Cardiac Health Condition, RAC # 2030 032 Asyali, M.H., PI; M. M. Shoukri, co-i; O. Demirkaya, co-i) Estimation of Signal Thresholds for Microarray Data Using Mixture Modeling, RAC # 2030 030 Elkum, N., PI; M.H. Asyali, co-pi; M.M. Shoukri, co-pi, Design of Optimal Sampling Times in Bioequivalence Studies Using Computer Simulations, RAC # 2021 025 Shoukri, M.M., PI; M.H. Asyali, co-i, Modeling Correlated Data from Cluster Randomization and Observational Studies, RAC # 990 011 Shoukri, M.M., PI; M.H. Asyali, co-i, Planning a Reliability Study: Cost and Efficiency Consideration, RAC # 2011 063, Shoukri, M.M., PI; M.H. Asyali, co-pi, Sample Size Requirements for the Design of Inter-Observer and Intra-Observer Agreement Studies: A Review and Some New Results, RAC # 2030 036 Demirkaya, O., PI; M.H. Asyali, co-pi, Automated Segmentation of Microarray cdna Spots, RAC # 2030 031 Yurtiçi kaynaklı tamamlanmış proje Ege Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı tarafından desteklenen İzmir de Elektromanyetik Alan Kirlenmesinin Ölçümü ve Değerlendirmesi isimli proje (Nisan 2000-Ekim 2001). Ege Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı tarafından desteklenen Texas TMS320- C6000 Serisi Sayısal Sinyal İşleme/Değerlendirme Kıymığı Üzerinde Örnek Sinyal İşleme Uygulamaların Gerçeklenmesi isimli proje (Nisan 1999-Nisan 2001).
Ege Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı tarafından desteklenen Bilgisayar Destekli Bir Elektrokardiyografi Sinyali Algılama, Saklama ve Değerlendirme Sisteminin Tasarlanması/Geliştirilmesi isimli proje. (Kasım 1998-Kasım 1999). 9. İdari Görevler Rektör Abdullah Gül Üniversitesi 2011-2012 Dekan Mühendislik Fakültesi Zirve Üniversitesi 2009-2010 Bölüm Başkanı Biyomedikal Mühendisliği Erciyes Üniversitesi 2008-2009 Bölüm Başkanı Bilgisayar Mühendisliği Yaşar Üniversitesi 2006-2008 Müdür Araştırma ve Uygulama Yaşar Üniversitesi 2005-2008 Merkezi Müdür Yard. Bilim ve Teknoloji Araş. Ege Üniversitesi 2000 yılı ve Uygulama Merkezi 10. Bilimsel Kuruluşlara Üyelikler Boğaziçi Üniversitesi (B.Ü) Biyo-Medikal Mühendisliği Enstitüsü ve B.Ü. - UNESCO İstanbul Bölgesel Biyomedikal Mühendisliği Merkezi tarafından düzenlenen 1999 Yılı Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (Biyomut 1999) için Program Kurulu Üyeliği Boğaziçi Üniversitesi (B.Ü) Biyo-Medikal Mühendisliği Enstitüsü ve B.Ü. - UNESCO İstanbul Bölgesel Biyomedikal Mühendisliği Merkezi tarafından düzenlenen 2000 Yılı Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı (Biyomut 2000) için Program Kurulu Üyeliği Current Bioinformatics Journal (Bentham Science Publisher) için Editorial Advisory Board üyesi http://www.bentham.org/cbio/ebm.htm Turkish Journal of Electrıcal Engineerıng & Computer Sciences (TÜBİTAK) için Editorial Board üyesi 11. Ödüller King Abdulaziz City of Science and Techology City (Suudi Arabistan) tarafından Quantification of Movement Disorder Tremors Using Digital Image Analysis isimli proje icin 60,000 USD destek ödülü (Ağustos 2005) (Türkiye ye döndüğüm için bu fonu kullanamadım.). 2004 Yılı Tanınmış/Başarılı Araştırmacı Ödülü (8,000 USD), King Faisal Specialist Hospital and Research Center (Şubat 2005).
Prof. Laurence Freedman Genç Araştırmacı Destek Ödülü, the 2nd International Biometric Society Conference of the Eastern Mediterranean Region, Antalya (Ocak 2003). İzmir de Elektromanyetik Alan Kirlenmesinin Ölçümü ve Değerlendirmesi isimli proje için Ege Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı tarafından teçhizat alım desteği. (Süre: Nisan 2000-Ekim 2001, Destek: 2,000 USD). Texas TMS320-C6000 Serisi Sayısal Sinyal İşleme/Değerlendirme Kıymığı Üzerinde Örnek Sinyal İşleme Uygulamaların Gerçeklenmesi isimli proje için Ege Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı tarafından teçhizat alım desteği. (Süre: Nisan 1999-Nisan 2001, Destek: 2,000 USD). Bilgisayar Destekli Bir Elektrokardiyografi Sinyali Algılama, Saklama ve Değerlendirme Sisteminin Tasarlanması/Geliştirilmesi isimli proje için Ege Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı tarafından teçhizat alım desteği. (Süre: Kasım 1998-Kasım 1999, Destek: 1,500 USD). University of Southern California, Center for Excellence in Teaching tarafından düzenlenen Öğretimde Yenilikçi Projeler Yarışmasında Development of an Interactive Software Tool for Teaching Nerve Cell Physiology isimli projeye destek ödülü (Süre: Mayıs 1993-Mayıs 1995, Destek: 10,000 USD). 12. Son iki yılda verdiğiniz lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler için aşağıdaki tabloyu doldurunuz. Akademik Haftalık Saati Öğrenci Dönem Dersin Adı Yıl Teorik Uygulama Sayısı 2011-2012 Güz Görüntü İşleme 3-10 Uluslararası bilimsel indekslerce taranan dergilerdeki yayınlarının aldığı atıf sayıları: Title Authors Source Title Publication Year Feedback network controls photoreceptor output at the layer of first visual synapses in Drosophila Zheng, L; Polavieja, GG; Wolfram, V; Asyali, MH; Hardie, RC; Juusola, M JOURNAL OF GENERAL PHYSIOLOGY Volume Issue Total Citations 2006 127 5 28 Gene expression profile classification: A review Asyali, Musa H.; Colak, Dilek; Demirkaya, Omer; Inan, Mehmet S. CURRENT BIOINFORMATI CS 2006 1 1 26
Sample size requirements for the design of reliability study: review and new results Shoukri, MM; Asyali, MH; Donner, A STATISTICAL METHODS IN MEDICAL RESEARCH 2004 13 4 25 Segmentation of cdna microarray spots using Markov random field modeling Demirkaya, O; Asyali, MH; Shoukri, MM BIOINFORMATI CS 2005 21 13 24 Assessment of reliability of microarray data and estimation of signal thresholds using mixture modeling Asyali, MH; Shoukri, MM; Demirkaya, O; Khabar, KSA NUCLEIC ACIDS RESEARCH 2004 32 8 21 Reliability analysis of microarray data using fuzzy c-means and normal mixture modeling based classification methods Asyali, MH; Alci, M BIOINFORMATI CS 2005 21 5 18 Assessment of closedloop ventilatory stability in obstructive sleep apnea Asyali, MH; Berry, RB; Khoo, MCK IEEE TRANSACTION S ON 2002 49 3 14 Ventilatory dynamics of transient arousal in patients with obstructive sleep apnea Khoo, MCK; Shin, JJW; Asyali, MH; Kim, TS; Berry, RB RESPIRATION PHYSIOLOGY 1998 112 3 9 Use of Meixner functions in estimation of Volterra kernels of nonlinear systems with delay Asyali, MH; Juusola, M IEEE TRANSACTION S ON 2005 52 2 9 Issues of cost and efficiency in the design of reliability studies Shoukri, MM; Asyali, MH; Walter, SD BIOMETRICS 2003 59 4 6 Determining a continuous marker for sleep depth Asyali, Musa H.; Berry, Richard B.; Khoo, Michael C. K.; Altinok, Ayse COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE 2007 37 11 6 Determination of image bimodality thresholds for different intensity distributions Demirkaya, O; Asyali, MH SIGNAL PROCESSING- IMAGE COMMUNICATI ON 2004 19 6 5
Discrimination power of long-term Heart Rate Variability measures Asyali, MH PROCEEDINGS OF THE 25TH ANNUAL INTERNATIONA L CONFERENCE OF THE IEEE IN MEDICINE AND BIOLOGY SOCIETY, VOLS 1-4: A NEW BEGINNING FOR HUMAN HEALTH 2003 25 3 Gene expression profile class prediction using linear Bayesian classifiers Asyali, Musa H. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE 2007 37 12 3 Applications of parametric spectral estimation methods on detection of power system harmonics Yilmaz, Ahmet S.; Alkan, Ahmet; Asyali, Musa H. ELECTRIC POWER SYSTEMS RESEARCH 2008 78 4 3 Sleep stage and obstructive apneaic epoch classification using single-lead ECG Yilmaz, Bulent; Asyali, Musa H.; Arikan, Eren; Yetkin, Sinan; Ozgen, Fuat ONLINE 2010 9 1 Fluctuations in state and respiratory variability during sleep: A modeling perspective Khoo, MCK; Asyali, MH; Berry, RB FASEB JOURNAL 1998 12 4 0 Nonlinear analysis of heart rate variability Uzun, IS; Asyali, MH; Celebi, G; Pehlivan, M PROCEEDINGS OF THE 23RD ANNUAL INTERNATIONA L CONFERENCE OF THE IEEE IN MEDICINE AND BIOLOGY SOCIETY, VOLS 1-4: BUILDING NEW BRIDGES AT THE FRONTIERS OF AND MEDICINE 2001 23 0
Segmentation of microarray cdna spots using MRF-based method Assessment of reliability of microarray data using Fuzzy c-means classification Demirkaya, O; Asyali, MH; Shoukri, MM; Abu-Khabar, KS Alci, M; Asyali, MH PROCEEDINGS OF THE 25TH ANNUAL INTERNATIONA L CONFERENCE OF THE IEEE IN MEDICINE AND BIOLOGY SOCIETY, VOLS 1-4: A NEW BEGINNING FOR HUMAN HEALTH NEURAL INFORMATION PROCESSING 2003 25 0 2004 3316 0 Obtaining Volterra Kernels from Neural Networks Asyali, Musa H.; Alci, Musa WORLD CONGRESS ON MEDICAL PHYSICS AND 2006, VOL 14, PTS 1-6 2007 14 0 Classification of Microorganism Species using Discriminant Analysis Aksebzeci, Bekir Hakan; Kara, Sadik; Asyali, Musa Hakan; Kahraman, Yasemin; Er, Ozguer; Kaya, Esma; Ozbilge, Hatice BIYOMUT: 2009 14TH NATIONAL MEETING 2009 0 Evaluation of Fatty Liver Ultrasonography Images Icer, Semra; Ikizceli, Tuerkan; Coskun, Abdulhakim; Asyali, Musa Hakan BIYOMUT: 2009 14TH NATIONAL MEETING 2009 0 Texture Analysis of Liver Hydatid Cyst Kayaalti, Oemer; Asyali, Musa Hakan; Tuna, Ibrahim Sacit; Durak, Ahmet Candan BIYOMUT: 2009 14TH NATIONAL MEETING 2009 0 Evaluation of Anxiety Related Changes in Skin Conductance and Blood Volume Pulse Signals During Coronary Angiography Okkesim, Suekrue; Asyali, Musa Hakan; Kara, Sadik; Kaya, Mehmet Guengoer; Ardic, Idris BIYOMUT: 2009 14TH NATIONAL MEETING 2009 0 Nonlinear system identification via Laguerre network based fuzzy systems Alci, Musa; Asyali, Musa H. FUZZY SETS AND SYSTEMS 2009 160 24 0
Design of optimal sampling times for pharmacokinetic trials via spline approximation Asyali, Musa Hakan TURKISH JOURNAL OF ELECTRICAL AND COMPUTER SCIENCES 2010 18 6 0 Classification of root canal microorganisms using electronic-nose and discriminant analysis Aksebzeci, Bekir H.; Asyali, Musa H.; Kahraman, Yasemin; Er, Ozgur; Kaya, Esma; Ozbilge, Hatice; Kara, Sadik ONLINE 2010 9 0 Design and implementation of a voice-controlled prosthetic hand Asyali, Musa Hakan; Yilmaz, Mustafa; Tokmakci, Mahmut; Sedef, Kanber; Aksebzeci, Bekir Hakan; Mittal, Rohin TURKISH JOURNAL OF ELECTRICAL AND COMPUTER SCIENCES 2011 19 1 0 Analysis of coronary angiography related psychophysiological responses Okkesim, Sukru; Kara, Sadik; Kaya, Mehmet G.; Asyali, Musa H. ONLINE 2011 10 0 TOPLAM 201