Arşiv Kaynak Tarama Dergisi Archives Medical Review Journal. Biosensors and their Medical Applications



Benzer belgeler
İnfeksiyon tanısında yeni yaklaşımlar Biyosensörler. Barış OTLU İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Malatya.

DERS 01. Biyosensör Tanımı. Duyu Sistemi. Duyu Sistemi. Duyu Reseptörleri. Duyu Sistemi 11/3/2016

Hücrelerde gerçekleşen yapım, yıkım ve dönüşüm olaylarının bütününe metabolizma denir.

IDC Savunma Sanayii. Antikor tabanlı tanımlama sistemleri birçok üstün özellikler sahiptir. Yüksek hassasiyette ve kısa sürede hızlı sonuç üretme.

1.ÜNİTE:KİMYA BİLİMİ KİMYA NE İŞE YARAR? KİMYA DİSİPLİNLERİ KİMYANIN BAŞLICA UYGULAMA ALANLARI

Yeni Nesil Optik ve Elektronik Malzemeler: Tasarım Sentez ve Uygulamalar

Biochemistry Chapter 4: Biomolecules. Hikmet Geçkil, Professor Department of Molecular Biology and Genetics Inonu University

Biyosensörler farklı bir bakış açısıyla Analizlenecek Madde-Biyoaktif Biyoaktif Bileşen ilişkisine göre aşağıdaki şekilde de sınıflandırılabilirler;

BİYOTEKNOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL

TIBBİ BİYOKİMYA ANABİLİM DALI LİSANSÜSTÜ DERS PROGRAMI

ADIM ADIM YGS-LYS 55. ADIM CANLILARIN SINIFLANDIRILMASI-15 VİRÜSLER

DÖNEM 1- A, 3. DERS KURULU ( )

Organik Bileşikler. Karbonhidratlar. Organik Bileşikler YGS Biyoloji 1

BİYOKİMYA ANABİLİM DALI LİSANSÜSTÜ DERS PROGRAMI

Canlının yapısında bulunan organik molekül grupları; o Karbonhidratlar o Yağlar o Proteinler o Enzimler o Vitaminler o Nükleik asitler ve o ATP

FAQ-TIENS DICHO II.Nesil Meyve&Sebze Temizleyici

İMMUNİZASYON. Bir bireye bağışıklık kazandırma! Bireyin yaşı? İmmunolojik olarak erişkin mi? Maternal antikor? Konak antijene duyarlı mı? Sağlıklı mı?

6. BÖLÜM MİKROBİYAL METABOLİZMA

KİMYA-IV. Yrd. Doç. Dr. Yakup Güneş

Doç. Dr. Fatih ÇALIŞKAN Sakarya Üniversitesi, Teknoloji Fak. Metalurji ve Malzeme Mühendisliği EABD

Aktivasyon enerjisi. Enzim kullanılmayan. enerjisi. Girenlerin toplam. enerjisi. Enzim kullanılan. Serbest kalan enerji. tepkimenin aktivasyon

13 HÜCRESEL SOLUNUM LAKTİK ASİT FERMANTASYONU

AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ KİMYA ANABİLİM DALI BAŞKANLIĞI DOKTORA PROGRAMI

Prof.Dr.Gül ÖZYILMAZ

BMM307-H02. Yrd.Doç.Dr. Ziynet PAMUK

ÇANAKKALE ONSEKİZ MART ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ Eğitim Yılı

YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #16

GİRESUN ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ KİMYA ANABİLİM DALI YÜKSEK LİSANS TEZİ FENOLLERE DUYARLI POTANSİYOMETRİK MİKRO BİYOSENSÖRLER

00220 Gıda Biyokimyası

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü AKTS Hafta Teorik

Niçin PCR? Dr. Abdullah Tuli

AFYON KOCATEPE ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ KİMYA ANABİLİM DALI BAŞKANLIĞI DOKTORA PROGRAMI

ELEKTROKİMYA Elektrokimya: Elektrokimyasal hücre

TÜBİTAK. İçme sularında hızlı, basit ve hassas Arsenik ve Bisfenol-A Tayini için yeni bir el cihazı

KİMYANIN UĞRAŞI ALANLARI NELER KAZANACAĞIZ

EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI KİMYA ANABİLİM DALI DERS PLANI Güz Yarı yılı HAFTALIK DERSİN ADI

HÜCRE FİZYOLOJİSİ Hücrenin fiziksel yapısı. Hücre membranı proteinleri. Hücre membranı

İLAÇ, KOZMETİK ÜRÜNLER İLE TIBBİ CİHAZLARDA RUHSATLANDIRMA İŞLEMLERİ ECZ HAFTA

Biyomühendislik nedir?

Pınar AKALIN Fatma Neşe KÖK Zeliha GÜLER, Sezai SARAÇ Yıldız ULUDAĞ, Merkez: Şube: Tel: Web:

-- Giriş -- Enzimler ve katalizörler -- Enzimlerin isimlendirilmesi -- Enzimlerin etki mekanizması -- Enzimlerin yapısı -- Enzimler ve prostetik

YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf

TEST 1. Hücre Solunumu. 4. Aşağıda verilen moleküllerden hangisi oksijenli solunumda substrat olarak kullanılamaz? A) Glikoz B) Mineral C) Yağ asidi

12 HÜCRESEL SOLUNUM GLİKOLİZ VE ETİL ALKOL FERMANTASYONU

ECF201 ANATOMİ II Dersin Amacı:

Mikotoksin nedir? En sık karşılaşılan mikotoksinler; Aspergillus Penicillium Fusarium Alternaria

BİYOKİMYAYA GİRİŞ: ATOM, MOLEKÜL, ORGANİK BİLEŞİKLER

DÜŞÜK SICAKLIK STRESİ

PEYNİR ALTI SUYU VE YOĞURT SUYUNDA Zn Ve TOPLAM ANTİOKSİDAN KAPASİTESİ TAYİNİ DANIŞMANLAR. 29 Haziran-08 Temmuz MALATYA

YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #22

YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #12

ORGANİZMALARDA BAĞIŞIKLIK MEKANİZMALARI

ADIM ADIM YGS LYS Adım DOLAŞIM SİSTEMİ 5 İNSANDA BAĞIŞIKLIK VE VÜCUDUN SAVUNULMASI

Hücreler, kimyasal yasaların geçerli olduğu kimyasal fabrikalar olarak da kabul edilmektedir.

CANLILARIN YAPISINDA BULUNAN TEMEL BİLEŞENLER

Yrd. Doç. Dr. FİLİZ ALTAY

YGS ANAHTAR SORULAR #1

12. SINIF KONU ANLATIMI 7 GENETİK MÜHENDİSLİĞİ VE BİYOTEKNOLOJİ ÇALIŞMA ALANLARI

EĞİTİM ÖĞRETİM YILI DÖNEM I TFT 102 Hücre Bilimleri II

MİNERALLER. Dr. Diyetisyen Hülya YARDIMCI

FARMASÖTİK NANOTEKNOLOJİ ANABİLİM DALI * Farmasötik Nanoteknoloji Programı

Gıda Kaynaklı Patojenlerin Belirlenmesinde Yenilikçi Yaklaşımlar: Nanopartiküllerin Kullanımı

Sensörler. Yrd.Doç.Dr. İlker ÜNAL

18.Eyl Rektörlük Programı Eğitim Köyü Pazartesi Rektörlük Programı Eğitim Köyü Rektörlük Programı Eğitim Köyü

2. Kanun- Enerji dönüşümü sırasında bir miktar kullanılabilir kullanılamayan enerji ısı olarak kaybolur.

ADIM ADIM YGS-LYS 27. ADIM HÜCRE 4- HÜCRE ZARINDAN MADDE GEÇİŞLERİ

ANADOLU SAĞLIK / SAĞLIK MESLEK LİSESİ TIBBİ LABORATUVAR ALANI TIBBİ LABORATUVAR TEKNİSYENLİĞİ DALI BECERİ EĞİTİMİ DEĞERLENDİRME FORMU

1,3-bis-(p-iminobenzoik asit)indan Langmuir-Blodgett filmlerinin karakterizasyonu ve organik buhar duyarlılığı

Lab Cihazları Dersi Çalışma Soruları

HAYVAN BESLEMEDE ENKAPSÜLASYON TEKNOLOJİSİ VE ÖZELLİKLERİ. Prof.Dr. Seher KÜÇÜKERSAN

EĞİTİM ÖĞRETİM YILI DÖNEM I TFT 102 Hücre Bilimleri II

Biyokimya ya ya Giriş. Prof. Dr. Arif Altınta

AR-GE LABORATUARLARI FAALİYET FORMU (2014) Laboratuarın Adı: Biyoteknoloji Laboratuvarı. Laboratuarın Koordinatörü: Yrd. Doç.Dr.

İ Ç İ NDEKİ LER. Çevre Mühendisliği ve Bilimi İçin Kimyanın Temel Kavramları 1. Fiziksel Kimya ile İlgili Temel Kavramlar 52.

ELEKTROANALİTİK KİMYA VE NANOMALZEMELER ARAŞTIRMA LABORATUVARI

İlaçta Ar Ge Kamu Üniversite Sanayi İşbirliğinin Önemi. Prof. Dr. Sedef Kır Hacettepe Üniversitesi Eczacılık Fakültesi

1. ÜNİTE: YAŞAM BİLİMİ BİYOLOJİ...10

YGS ANAHTAR SORULAR #2

İLAÇ ETKEN MADDESİ ARAŞTIRMA VE GELİŞTİRME YÖNTEMLERİ. Prof. Dr. Esin AKI Farmasötik Kimya Anabilim Dalı

Hücre. 1 µm = 0,001 mm (1000 µm = 1 mm)!

Biyokimya (CEAC 212) Ders Detayları

Stres Koşulları ve Bitkilerin Tepkisi

TEMEL ECZACILIK BİLİMLERİ ANABİLİM DALI Temel Eczacılık Bilimleri Programı

Nitrik Oksit Sentaz ve Nitrik Oksit Ölçüm Yöntemleri

7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ

ADIM ADIM YGS- LYS 92. ADIM KALITIM 18 GENETİK MÜHENDİSLİĞİ VE BİYOTEKNOLOJİ ÇALIŞMA ALANLARI

FEN ve TEKNOLOJİ / GENETİK MÜHENDİSLİĞİ ve BİYOTEKNOLOJİ. GENETİK MÜHENDİSLİĞİ ve BİYOTEKNOLOJİ

M. (arpa şekeri) +su S (çay şekeri) + su L.. (süt şekeri)+ su

Biyoteknolojinin Temelleri

Can boğazdan gelir.. Deveyi yardan uçuran bir tutam ottur..

DERS ĐÇERĐKLERĐ GÜZ YARIYILI: GMB 501 Uzmanlık Alan Dersi (4 0 0)

Doç. Dr. Özlem Esen KARTAL (A Şubesi) Yrd. Doç. Dr. Adil KOÇ (B Şubesi) :16:57 1

DERS BİLGİLERİ. Ders Kodu Yarıyıl T+U Saat Kredi AKTS. Maya ve Bakteri Biyoteknolojisi BTEC Yüksek Lisans ve Doktora

1 ZKÜ./ÖĞR.İŞL FEN EDEBİYAT FAKÜLTESİ KİMYA BÖLÜMÜ BÖLÜM KODU : 312. Ders Kodu

2018 MÜFREDATI ECZACILIK FAKÜLTESİ / ECZACILIK EĞİTİM PLANI. Ders Kodu Ders Adı (Türkçe) Müf.No T P K AKTS Tip Op. PSDS PSKM

ANTİJENLER VE YAPILARI

Laboratuvar Tekniği. Adnan Menderes Üniversitesi Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü TBY 118 Muavviz Ayvaz (Yrd. Doç. Dr.) 5. Hafta (14.03.

2012 MÜFREDATI ECZACILIK FAKÜLTESİ / ECZACILIK EĞİTİM PLANI. Ders Kodu Ders Adı (Türkçe) Müf.No T P K AKTS Tip Op. PSDS PSKM

1-GİRİ 1.1- BİYOKİMYANIN TANIMI VE KONUSU.-

Transkript:

Arşiv Kaynak Tarama Dergisi Archives Medical Review Journal Biyosensörler ve Tıpta Kullanım Alanları Biosensors and their Medical Applications Umut Kökbaş 1, Levent Kayrın 1, Abdullah Tuli 1 1 Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyokimya ABD, Adana, Turkey ABSTRACT Biosensors are sensor systems that are combined with biological systems. They consist of two main parts; one of them is biological recognition element and the other one is physicochemical transducer. Biological recognition element can be biocatalysts (enzyme, microorganism, tissue materials) or bioligands (antibodies, nucleic acids, lectins) that interact selectively with the target analyte. Transducer converts the physical response resulting from the interaction between the target analyte and biological recognition element into a measurable signal. Biosensors which provide monitoring biological and synthetic processes can be used besides medical measuring and analyzing, for environmental observations and controls, defense industry, agriculture, food and pharmaceutical industry. Thus, they have an important role in daily life. In this review, characteristics of biosensors that are used in medical measuring and analyzing have been determined and classifications of biosensors according different features that are found in literature are presented. Key words: Biosensor, medical measurement, biomaterial, biomedical application. ÖZET Biyosensörler biyolojik sistemler ile kombine edilmiş sensör sistemleridir. Temel olarak ikikısımdan oluşmaktadırlar; bunlardan birincisi biyolojik algılayıcı, diğeri ise fizikokimyasal dönüştürücüdür. Biyolojik algılayıcı eleman hedef analit ile seçici olarak etkileşimde bulunan biyokatalizörler (enzim, mikroorganizma, doku malzemeleri) veya biyoligandlar (antikor, nükleik asit, lektin) olabilmektedir. Dönüştürücü ise hedef analit ile biyolojik algılayıcı arasındaki etkileşime bağlı olarak ortaya çıkan fiziksel cevabı ölçülebilir bir sinyale dönüştürmektedir. Biyolojik ve sentetik süreçlerin izlenebilme ve anlaşılabilme olanağı sağlayan biyosensörler, tıbbi ölçüm ve analizlerin yanında, çevresel gözlem ve kontrollerde, savunma sanayinde, tarım, gıda ve ilaç endüstrilerindeki kullanım alanlarıyla hayatta 2013; 22(4):499-513

500 Biyosensörler önemli bir role sahip olmaktadırlar. Bu derleme makalede tıbbi ölçüm ve analizlerde kullanılan biyosensörlerin karakteristikleri tanımlanmış ve literatürde yer alan değişik sınıflandırmalara yer verilmiştir. Anahtar kelimeler: Biyosensör, tıbbi ölçüm, biyomalzeme, biyomedikal uygulamalar. Giriş Biyosensörler fizikokimyasal analiz sistemleri ile biyolojik materyallerin birleştirilmesi ile oluşan analitik sistemlerdir. Biyosensörlerde biyolojik sistemin yüksek özgüllüğü ile fiziksel analiz sisteminin tayin duyarlılığı bileştirilmiştir. Çok sayıda biyoorganik molekül ve bazı inorganik moleküllerin analizinde kullanmak amacı ile pek çok biyosensör geliştirilmiştir. Günümüzde biyosensörler, özellikle sağlık alanı başta olmak üzere; çevresel analizlerde, askeri sahada, gıda, farmasötik ve kimya endüstrilerinde kullanılmaktadır 1. Bu derlemede günümüzde kullanılan geleneksel tıbbi ölçüm yöntemlerin yanında, yeni bir yöntem olarak biyosensörlerin çalışma prensibinin anlatımı amaçlanmış olup, geleneksel tıbbi ölçüm yöntemlerinden üstünlükleri tartışılacaktır. Şekil.1. Biyosensör Bileşenlerinin Şematik Gösterimi 2 Genel Bakış Biyosensörler temel olarak; analiz edilecek maddenin biyosensör yüzeyindeki biyobileşen (biyolojik tanıma bölgesi) ile etkileşime girmesi sonucu transduser (dönüştürücü) yüzeyinde

Kökbaş ve ark. 501 analit miktarıyla orantılı bir sinyalin oluşumu ve bu sinyalin ölçüm cihazına iletilmesi ilkesine dayanır 1. Biyosensörlerde biyobileşen olarak enzimler, mikroorganizmalar, bitkisel ve hayvansal dokular, reseptörler, antikorlar ve nükleik asitler kullanılabilir. Analiz edilecek moleküle uygun olarak bir biyobileşen ve analitin dönüşümü sonucunda oluşan elektrokimyasal, optik ya da gravimetrik sinyali elektriksel sinyale çeviren uygun bir transduser seçilmelidir. Transduser ve biyobileşen birbirine uygun fiziksel ya da kimyasal yöntemle bağlanabilir. 2 Şekil.1 de bir biyosensör sisteminin birimleri şematik olarak gösterilmiştir. Günümüzde biyosensörler; biyobileşen ve transduser olarak pek çok farklı maddeyi ve sistemi içermektedir. Bunların en önemli olanları Tablo.1 de verilmiştir Tablo.1. Biyosensör Bileşenlerinin İçeriği 2. Analit Biyobileşen Sinyal İletici Sistem Metaller Elektrokimyasal Esaslı Hormonlar Enzimler Elektrokimyasal Esaslı Enzim Antikorlar Yarı iletken esaslı Koenzimler Hücre Optik esaslı Substrat Doku kesitleri Fotometri esaslı Aktivatör Reseptörler Flüorometri esaslı İnhibitör Mikrorganizmalar Flüorometri esaslı Antikor-Antijen Nükleik asitler Piyezoelektrik Nükleik asit Lipidler Kuartz kristal mikrobalans (QCM) Mikrorganizmalar Hücre organelleri Mikrokantileverlar Biyosensörlerin Sınıflandırılması Analiz edilecek madde-biyoaktif bileşen ilişkisine göre Biyosensörler farklı bir bakış açısıyla analiz edilecek madde- biyoaktif bileşen ilişkisine göre biyokatalitik esaslı ve biyoafinite esaslı olmak üzere ikiye ayrılır 3. a. Biyokatalitik esaslı biyosensörler (mikroorganizma ve enzimlerin kullanıldığı biyosensörler)

502 Biyosensörler b. Biyoafinite esaslı biyosensörler (antikor-antijen ve reseptör-ligand gibi etkileşimlerin kullanıldığı biyosensörlerdir.) Biyoaktif tabaka-iletim ve ölçüm sistemi içeriğine göre Biyosensörler ölçüm prensiplerine ve transduser türüne göre aşağıdaki gibi sınıflandırılır 4 : a. Elektrokimyasal esaslı (Amperometri, Potansiyometri) b. Optik esaslı (Fotometri, Flüorometri, Biyolüminesans) c. Piezoelektrik esaslı (Kuartz kristal mikrobalans, Mikrokantileverlar) d. Kalorimetri esaslı (Termistörler) Organ (Örneğin; koku alma organı) Doku Tüm Hücre Hücre Organeli (Örneğin; mitokondri) Biyomembran (Örneğin; reseptör) Lipozom Enzim Antikor İyonofor Şekil.2. Biyosensör teknolojisinde kullanılan biyoaktif materyal hiyerarşisinde enzimlerin yeri 4 Biyoaktif tabakada kullanılan biyobileşen türüne göre 1. Enzim temelli 2. Doku temelli 3. DNA temelli

Kökbaş ve ark. 503 4. Antikor/Antijen temelli (immünobiyosensörler) 5. Mikrobiyal kökenli 1. Enzim temelli biyosensörler Biyosensör teknolojisinin tarihsel geçmişine bakıldığında bu alandaki ilk çalışmaların enzim sensörleriyle başladığı görülmektedir. 1962 de Clark ve Lyons ve 1967 de Updike ve Hick tarafından rapor edilen glukoz tayinine yönelik glukoz oksidaz enzim elektrotları bu konudaki ilk örnekleri oluşturmaktadır 4. Biyosensör teknolojisindeki ilk örnekler özellikle amperometrik ve potansiyometrik temelli enzim elektrotları seklinde ortaya çıkmışlardır. Bu durumun en önemli nedeni o tarihteki bilgi ve teknolojik birikimin söz konusu çalışmalar için yeterli düzeye ulaşmamış olmasıdır. Biyosensör teknolojisinde kullanılan biyolojik materyaller artan karamaşıklık niteliklerine göre sıralandıklarında; iyonoforlar, antikorlar, enzimler, lipozomlar, biyomembran parçaları (Örneğin; reseptör), hücre organelleri (Örneğin: mitokondri) doku veya tüm hücreler ve organlar (Örneğin; görme ve koklama Şekil.2) şeklinde sınıflandırılabilirler. En genel anlamda bakıldığında diğer biyosensörlerde olduğu gibi enzim sensörleri de biyoaktif tabaka, iletici ve ölçüm sisteminden oluşur. 2 Diğer biyosensörlerden tek fark biyoaktif tabakada biyomolekül olarak enzimlerin yer almasıdır. Buna karşılık diğer biyosensörlerde olduğu gibi biyoaktif tabakanın iç ve dış yüzeylerinde membranlar, iletici ile ölçüm düzeneği arasında sinyal yükselticiler, mikroişlemciler veya ölçüm düzeneğiyle bağlantılı kaydedici veya bilgisayar sistemleri, gereksinimlerine göre eklenen unsurlardır 5. 2. Doku Temelli Biyosensörler Hayvansal ve bitkisel bazı dokuların ve organellerin kimi enzimlerce zengin olduğu bilinmektedir. İşte bu enzimlerin izole edilmiş preparatları yerine doğrudan yoğun bulundukları bu doku parçaları da biyobileşen olarak kullanılmaktadırlar 3,7. Özellikle uzun ve masraflı enzim saflaştırma zorluğundan kurtardığı için ve hedef analitin çok basamaklı dönüşümünde farklı enzimlerin bir arada kullanılması yerine bu enzimleri içeren dokunun kullanımı ve ilgilenilen enzim ticari olarak bulunmuyorsa doku parçalarının biyobileşen olarak kullanımı avantajlıdır. Dokuların komplekslikleri sebebiyle her yeni tip elektrot için cevap karakterleri farklı olduğundan her biyosensör için optimizasyon gereklidir.

504 Biyosensörler Biyosensörlerin bu türünde enzimler doğal ortamlarında bulunacaklarından katalitik sabitlik açısından çok avantajlıdır. Ancak substratın enzime ulaşması için aşması gereken difüzyon bariyerinin artmasından dolayı cevap süresi uzar 7. Bu dezavantajı kısmen de olsa azaltabilmek için dokular homojenize edilerek kullanılır. Bunun yanında dokular pek çok enzimi bünyelerinde içerdiklerinden analitin istenilen enzim dışındaki diğer enzimlerle dönüştürülmesi ile oluşacak hataları engellemek için diğer enzim sistemlerini inhibe edecek maddeler ve koşullar biyosensör hazırlanırken kullanılabilir 6. Şekil.3. Bir Enzim Sensörünün Genel Şematik Gösterimi 5. (A: Analizlenecek madde, B: İmmobilize enzim, C: İletici element, D: Ölçüm sistemi) 3. DNA Temelli Biyosensörler Biyobileşen olarak tek zincirli DNA oligomerlerinin kullanıldığı biyosensör sistemleridir. DNA yapısının ortaya çıkması, hibridizasyon, amplifikasyon ve rekombinant DNA teknolojilerinin gelişimi DNA sensörlerinin geliştirilmesine öncülük etmiştir. Genellikle DNA sensörleri transduser yüzeyine sabit haldeki tek zincirli DNA oligomeri (DNA probu) ile belli bir hastalığı, kalıtsal bir karakteri ya da bir bakteri veya virüsün patojenitesini simgeleyen bir tek zincirli

Kökbaş ve ark. 505 DNA parçasının hibridizasyonu prensibine dayanır 1,8. Bu hibridizasyonla oluşan çift zincirli DNA sayesinde bir elektrokimyasal ya da optik sinyal oluşur ve optik, piyezoelektrik, elektrokimyasal bir transduser ile sinyal okunabilir hale getirilir. Kullanılan DNA probları genellikle 20-30 bazlık kısa tek zincirli DNA lardır 9. Şekil. 4. İmmobilizasyon Yöntemlerinin Şematik Gösterimi 1 4. Antikor/Antijen(İmmüno Sensörler) Temelli Biyosensörler Biyobileşen olarak antikorların kullanıldığı biyosensörler antikor temelli biyosensörler ya da immünosensörler olarak adlandırılırlar. Vücuda giren yabancı organizmalara (virüs, bakteri ve protozoa) veya onların protein ürünlerine karşı bağışıklık sistemi hücreleri tarafından üretilen protein yapılı maddelere antikor denir. Antikorlar ve antijenler arasında özgül etkileşim olduğundan immünosensörler ile son derece özgül ve duyarlı analizler yapılabilir. Antikorlar uygun transduserler ile eşleştirilerek hormon, ilaç, virüs, bakteri ve çevresel kirletici olan diğer moleküllerin, pestisitlerin, biyomedikal maddelerin tayini için immünosensörler geliştirilebilir 16. 5. Mikrobiyal Biyosensörler

506 Biyosensörler Bir mikrobiyal biyosensör bir transduser ile canlı veya canlı olmayan mikrobiyal hücrelerin sabitlenerek (immobilize edilerek) birleşmesi ile oluşur 10. Biyosensörlerin yapımında kullanılan mikroorganizmalar bir takım avantajlara sahiptir. Mikroorganizmalar geniş bir aralıktaki kimyasal bileşikleri metabolize edebilir. Mikroorganizmalar olumsuz şartlara uyma konusunda büyük bir kapasiteye sahiptirler ve yeteneklerini geliştirerek zamanla yeni moleküller oluşturabilirler. Mikroorganizmalar aynı zamanda mutasyonla veya rekombinant DNA teknolojisi ile oluşan genetik modifikasyonlar için de ekonomik hücre içi enzim kaynağıdır 11. Şekil 5. Enzim Biyosensörünün Genel Çalışma İlkesi 3. (A: Substrat, B: Kosubstrat veya Koenzim, C ve F: Ürünler, ç: Ölçüm çözeltisi içindeki, t: biyoaktif tabakadaki ve y: elektrot yüzeyindeki derişimler. D.T: Difüzyon tabakası, Ö.Ç.: Ölçüm çözeltisi, B.T.: Biyoaktif tabaka, İ: İletici) Enzim tabanlı sensörlerle karşılaştırıldığında hücre kullanmanın ana sınırlandırıcı faktörlerinden biri substrat ve ürünlerin hücre zarından difüzyonunun daha yavaş bir cevap sağlamasıdır. Bu problemin üstesinden gelmenin bir yolu hücre geçirgenliğini arttırmaktır. Hücrelerin geçirgenliği fiziksel (dondurma-çözme), kimyasal (organik çözücüler/deterjanlar)

Kökbaş ve ark. 507 ve enzimatik (lizozim, papain) işlemlerle arttırılabilir. Bu konuda en çok kullanılan yöntem toluen, kloroform, etanol ve butanol gibi organik çözücüler ve N-asetil-N,N,N-trimetil amonyum bromit (CTAB), Na-deoksikolat ve dijitonin gibi deterjanların kullanıldığı kimyasal yöntemlerdir 12. Bu tür kimyasal işlemler hücre membranındaki bazı lipitlerin ayrılmasına neden olarak küçük molekül ağırlıklı substratların ve ürünlerin membrandan difüzyonunu, enzim gibi makromolekülleri hücre içinde tutarak, kolaylaştırır. Geçirgenlik süreci hücrelerin ölümüne neden olsa da hücre içi enzimlerin ekonomik bir şekilde kullanılmasını sağlar. Bu yöntem kofaktör rejenerasyonu veya metabolik solunum gerektirmeyen basit biyosensör yapımlarında kullanılır. Tablo.2. Biyosensör Grupları ve Kapsadıkları Analiz Alanları Biyosensör Grubu Analiz Türü Enzim sensörleri Küçük moleküllü organik ve anorganik maddeler( ilaçlar, gıda maddeleri, vitaminler, antibiyotikler.) Mikrobiyal sensörler Enzim sensörlerin kapsadığı alanlar +BOD, Toksisite, Mutajenite DNA Sensörleri Virüsler, patojen mikroorganizmalar İmmünosensörler Virüsler, patojen mikroorganizmalar, zenobiyotikler Saf enzimlerle karşılaştırıldığında hücre tabanlı biyosensörlerin düşük özgül aktiviteleri hücre kullanımını sınırlandıran bir diğer faktördür 13. Bu genel olarak hücredeki diğer enzimlerce katalizlenen istenmeyen yan reaksiyonların meydana gelmesine neden olur. Özgül olmayan tepkimeleri en aza indirmek için birtakım yaklaşımlar araştırılmaktadır. Hücre geçirgenliğinin arttırılması istenmeyen yan reaksiyonlara neden olan küçük molekül ağırlıklı kofaktörler salınımını sağlar. Bunun sonucunda örneğin laktozu etanol ve CO 2 ye dönüştüren hücre içi β- galaktozidaz enzimini içeren maya hücresi geçirgenlik işlemine tabi tutulduğunda birçok kofaktörü kaybettiğinden laktozu ancak glukoz ve galaktoza dönüştürebilir. Cansız hücrelerde hücre içindeki diğer enzimlerce gerçekleşen yan reaksiyonlar o enzimin fiziksel (ısıtmayla) ya da kimyasal olarak inaktive edilmesiyle de en aza indirilebilir. Biyosensörlerde İmmobilizasyon Yöntemleri Analizlenmesi hedeflenen örneğe uygun biyobileşen ve transduser seçildikten sonra bu iki eleman birbirine bağlanmalı yani biyobileşen transduser yüzeyine sabit edilmelidir.

508 Biyosensörler a. Sabitleştirme için kullanılan temel yöntemler: b. Adsorpsiyon (kovalent olmayan bağlama) c. Kovalent Bağlama d. Tutuklama e. Çapraz Bağlama Bu sabitleme yöntemleri şematik olarak Şekil 4 de gösterilmiştir. Biyosensörün ömrü sabitleme işlemiyle biyobileşenin transduser yüzeyinde ne kadar süre tutulabildiğine bağlı olduğundan, biyobileşenin uzun süre yüzeyden ayrılmasını engellemelidir. Enzimlerin sabitlenmesinde enzim aktif merkezi sabitleme esnasında zarar görmemeli ya da enzim aktivitesinde sterik engel nedeniyle düşüş olmamasına dikkat edilmelidir 13. Elektrokimya Esaslı Enzim Biyosensörleri Enzim temelli biyosensörlerin pek çoğunda elektrokimyasal esaslı transduserler kullanılır. Bu transduserler ile amperometri ve/veya potansiyometri ilkelerine göre ölçümler alınabildiğinden genellikle oksidoredüktaz (elektron açığa çıkaran enzimler) sınıfı enzimler kullanılır 14. Bir enzim biyosensörü Şekil 5 te şematik olarak gösterilmiştir. Şekilden de görüldüğü üzere A substratı elektrot yüzeyine sabitlenmiş enzim tarafından B koenziminin yardımıyla C ve F ye dönüştürülür. Bu dönüşüm sonrasında elektrot yüzeyindeki madde derişimlerindeki farklılaşma iletici tarafından sinyal olarak yansıtılır 15. Nitelikli Biyosensörlerde Aranan Özellikler a. Duyarlılık: Cihazın analitteki değişime birebir cevap vermesi demektir. b. Seçimlilik: Cihazın sadece analite özgünlüğünü gösterir. Cihaz başka reaktiflere ilgi göstermez ve hatalı sonuç vermez. c. Ölçüm aralığı: Cihazın ölçebildiği analit derişiminin aralığıdır. d. Ölçüm süresi: Bir tür cihazın ölçme hızını gösterir. e. Tutarlılık: Cihazın sonuçlarındaki tutarlılığı ifade eder. f. Ölçüm sınırı: Cihazın ölçüm yapabileceği en düşük analit derişimini ifade eder. g. Ömrü: Cihazın, performansında gözle görülür bir azalma olmadan verdiği hizmet ömrünü ifade eder.

Kökbaş ve ark. 509 h. Kararlılık: Belirli bir süre içinde cihazın duyarlılığındaki değişimleri dikkate alan bir kalite ölçüm değeridir. Biyosensörlerin Kullanım Alanları Biyosensörler tıp, gıda, eczacılık, çevre kirliliği, savunma ve birçok endüstriyel aktivitede özellikle otomasyon, kalite kontrolü, durum tespit ve enerji saklanmasında çok önemli rol oynarlar. Bugüne kadar 180 den fazla farklı madde için biyosensör hazırlanmış olup bunlardan ancak 25 kadarı ticari olarak üretilmektedir 16. Biyosensörler olası uygulama alanları: a. Biyomedikal alan b. Proses kontrolü i. Biyoreaktör control ii. Gıda üretim ve analizi c. Tarla tarımı, bağ-bahçe tarımı ve veterinerlik d. Bakteriyel ve viral tanı e. Endüstriyel atık su kontrolü f. Çevre koruma ve kirlilik kontrolü g. Maden ve işletmelerinde toksik gaz analizleri h. Askeri uygulamalar Biyosensörlerin, ilaçların vücuttaki düzeylerinin ayarlanması ve kontrolünde kullanılması yakın bir gelecekte gerçekleştirilebilecektir. Yapay pankreas çalışmaları buna bir örnektir. Biyosensörlerin gelecekte önemli uygulamalarından biri süperoksit ve nitrikoksit gibi kısa ömürlü ve hormonlar ve nörotransmitterler gibi düşük derişimli maddelerin in vivo tayinidir 17. Ayrıca biyosüreçlerin nükleik asit düzeyinde izlenmesi, ilaçların reseptörlere etkisi ve özellikle transmitter-reseptör etkileşimi de biyosensörlerin gelecekteki önemli tıbbi uygulamaları olacaktır. Biyoteknoloji ve gıda endüstrisinde başta glikoz olmak üzere bir çok monosakkarit, amino asitler, organik asitler, üre ve alkol tayinlerinde enzim sensörleri kullanılmaktadır. Ayrıca gıdalardaki yabancı maddeler (pestisitler, toksitler ve yabancı hormonlar vb.) yanında aroma ve tazelik gibi kompleks parametreler içinde biyosensörler hazırlanabilir 18.

510 Biyosensörler Biyosensörlerin Tıpta Kullanım Alanları Tıp alanında en çok kullanılan biyosensörler enzim sensörleridir. Bunun sebepleri arasında ölçümlerindeki yüksek duyarlılık, uygulama ve kurulumdaki kolaylık ve ticari uygun transduser çeşitlerinin bolluğu yer almaktadır. Son yarım asırda yaygınlaşan diyabet hastalığını teşhis etmekte kullanılan glikoz oksidazlı enzim sensörü en fazla ilgiyi çeken biyosensördür 15. Son teknoloji ürünü sensörler çok az miktar kanda ve idrarda glikoz tayinini çok hızlı yapar. Tıp alanında kullanım söz konusu olduğunda biyouyumluluk çok önemli bir parametre haline gelmektedir. Vücut içi kullanımlar söz konusu olduğunda enzim içeren membran üzerinde fibrin birikimi ve platelet oluşumu meydana gelebilir veya vücut dokularında iltihaplanmalar olabilir 19. Bu sorunların önüne geçmek için biyosensörün dokuyla temas edecek yüzeyleri özel malzemelerle kaplanır. Diğer tıbbi biyosensörlere örnekler ise üre ve kreatinin elektrotları, kolesterol elektrotları, asetilkolin elektrotlarıdır. Bu sensörler sayesinde çok önemli hastalıkların teşhisi sağlanabilir. Örneğin üre seviyesi böbrek işlevini takip etmekte, kolestrol seviyesinin gözetimde tutulması arteriyosklerozlarının engellenmesinde, asetilkolin elektrotu kas yorulmalarının değerlendirilmesinde kullanılır 20. Medikal sektöründe mikrobiyal sensörler kullanılmaz çünkü genelde mikroorganizmalar için kültür ortamı olma özelliğini taşıyan biyolojik sıvılarla çalışılmaktadır. Biyokütlenin büyümesi, hücrelerin sızması ve örnek ortamının kontamine olmasıyla birlikte, biyokatalitik matriksi deforme eder. Bunların dışında mikrobiyal sensörler çok sayıda enzim içerirler ve pek çok medikal analiz için gerektiği kadar özgül değildirler. İmmünolojik reaksiyonların özgüllüğünün yüksek olmasından dolayı, immünolojik biyosensörler tıpta kullanılmaya çok elverişlidir. Bu sensörler ilaç etken madde ölçümünde yaygın olarak kullanırlar. Örneğin teofilin sensörü, hamilelik testi için HCG hormonu sensörü, kanser teşhisi için alfa-fetoprotein sensörü, hepatit B için yüzey antijen sensörü, tıpta kullanılan immünolojik sensörlerdir 21. Bunun yanında bu sensörlerin çalışması için sürekli substrat ilavesi gerektiğinden in vivo olarak kullanılamazlar. Antijen-antikor çiftinin oluşumu yavaştır ve çeşitli adımları kapsar, immünolojik sensörler aralıklı çalışmaktadırlar ve sürekli kontrolü sağlayamazlar.

Kökbaş ve ark. 511 Protezlere yerleştirilen biyosensörler sayesinde, protez yüzeyinde üreyen bakterilerin türleri tespit edilir ve protez içinde bulunan antibakteriyel maddeler salgılanıp ve enfeksiyon engellenir 19. Son yıllarda dünyada Çip Üzerinde Laboratuvar (Lab-on-Chip) teknolojisi olarak adlandırılan mikrosistemler üzerinde çalışılmaktadır. Bu yeni teknolojiyle; tek bir çipte tüm genomun izlenmesi ve binlerce gen arasındaki etkileşmenin aynı zamanda belirlenmesi sağlanabilir. Bu teknolojinin esası biyosensörlere dayanmaktadır ve bu çipler küçültülmüş DNA biyosensörleridir 22,23. Sonuç ve Gelecekte Beklentiler Uzun dönem içinde biyosensorik klasik fizikokimyasal ölçü aletleri yanında sensör teknolojisi sayesinde aşağıda belirtilen üstünlüklere sahip birçok yeni uygulamaya olanak sağlayacaktır 24. a. Yüksek duyarlık, b. Kısa ölçüm süresi, c. Gereksinime göre işlem akısı, d. Ölçüm ve analiz giderlerinde düşme, e. Otomatik ölçüm ve ayar sistemlerinin devreye sokulması. Biyosensörlerin, karmaşık maddelerin rasyonel ve ucuz olarak tayininde kullanımı ekonomik ve toplumsal ağırlık kazanmalarını sağlamıştır. Biyoçip teknolojisindeki gelişmelere bağlı olarak biyosensörlerin önemi ve ağırlığı gittikçe artacaktır 25,26. Özellikle yoğun bakım ünitelerinde, ameliyatlarda ve implantasyon amacı ile kullanılacak biyosensörlerde minyatürizasyon çok önemlidir. 21. yüzyılın anahtar teknolojilerinden biri olan nanoteknoloji biyosensörlerin ufkunu çok açacak ve ekonomi ve günlük yasamdaki ağırlığını daha da artıracaktır 27. Bu çerçevede ülkemizde Ulusal Biyosensör Araştırma Geliştirme Merkezinin en kısa zamanda kurulmasında büyük yarar vardır 28. Kaynaklar 1. Dinçkaya E, Enzim sensörleri. In Biyosensörler, Biyokimya Yaz Okulu Kitabı, (Ed. A Telefoncu):81-142. İzmir, Ege Üniversitesi Basımevi, 1999. 2. Akbayirli, P, Akyilmaz, E. Activation-based catalase enzyme electrode and its usage for glucose determination. Analytical Letters 2007; 40:3360-72.

512 Biyosensörler 3. Akyilmaz E, Baysal SH, Dinçkay, E. Investigation of metal activation of a partially purified polyphenol oxidase enzyme electrode. Int J Environ Anal Chem. 2007; 87:755-61. 4. Akyilmaz E, Yorganci E. A novel biosensor based on activation effect of thiamine on the activity of pyruvate oxidase. Biosens Bioelectron. 2008; 23:1874-7. 5. Bartlett PN. Biosensors, (Cass, A.E.G. ed.): 42. Oxford, Oxford University Press, 2008. 6. Beilen JB., Li Z.: Enzyme technology: an overview. Curr. Opin. Biotech. 2002; 13:338-44. 7. Garipcan B, Andac M, Uzun L, Denizli A., Methacryloylamidocysteine functionalized poly(2- hydroxyethyl methacrylate) beads and its design as a metal-chelate affinity support for human serum albumin adsorption. React Func Polym. 2004; 59:119-28. 8. Budavari S. The Merck Index, 12th ed., Whitehouse Station, NJ, Merck Co., 1996. 9. Campàs M, Katakis I. DNA biochip arraying, detection and amplification strategies. Trend Anal Chem. 2004; 23:49-62. 10. Hemachandera C., Bosea N, Puvanakrishnan R. Whole cell immobilization of Ralstonia pickettii for lipase production. Process Biochem. 2001; 629:633-7. 11. Chemical Information Services. Directory of World Chemical Producers. Dallas, ChemicalInfo, 1994. 12. Guilbault GG, Kauffmann J. Enzyme-based electrodes as analytical tools. Biotech Appl Biochem. 1987; 9:95-113. 13. Cooper JC, Hall EA. The nature of biosensor technology. J Biomed Eng. 1988; 10:210-9. 14. Coulet PR, Bardeletti G. Biosensor-based instrumentation. Biochem Soc Trans. 1991; 19:1-4. 15. Dinçkaya E. Biyosensörler. İzmir, Ege Üniversitesi Fen Fakültesi Baskı Atölyesi, 1999. 16. Dong S, Chen X. Some new aspects in biosensors. J Biotechnol. 2002; 82:303-23. 17. D Souza SF. Immobilized cells: techniques and applications. Indian J. Microbiol. 1989; 29:83-117. 18. D Souza SF. Immobilized enzymes in bioprocess. Curr Sci. 1999; 77:69-79. 19. D Souza SF. Immobilization and stabilization of biomaterials for biosensor applications. Appl Biochem Biotech. 2001; 96:225-38. 20. Rainina EI, Efremenco EN, Varfolomeyev SD, Simonian AL. The development of a new biosensor based on recombinant E. coli for the direct detection of organophosphorus neurotoxins. Biosens Bioelectron. 1996; 11:991-1000. 21. McGlennen RC. Miniaturization technologies for molecular diagnostics. Clin Chem. 2001; 47:393-402. 22. Ratner BD, Hoffman AS, Schoen FJ, Lemons JE. Biomaterials Science. San Diego, CA, Academic Press, 1996. 23. Sharma SK, Sehgal N, Kumar A. Biomolecules for development of biosensor and their applications. Curr Appl Phys. 2003; 3:307-16.

Kökbaş ve ark. 513 24. Nordström M. Biosensors and BioMEMS - applications and implications. Paper presented at Små Detektiver, Aarhus, Denmark, 2005. 25. Bhushan B. Nanotribology and nanomechanics of MEMS/NEMS and BioMEMS/BioNEMS materials and devices. Microelectron Eng. 2007; 84:387-412. 26. Okandan M, Galambos P, Mani S, Jakubczak J. Development of surface micromachining technologies for microfluidics and BioMEMS. Presented at SPIE Micromachining and Microfabrication Conference, San Francisco, CA, October 2001. 27. Jianrong C, Yuqing M, Nongyue H, Xiaohua W, Sijiao L. Nanotechnology and biosensors, Biotechnology Advance. 2004; 22: 505-18. 28. Akkaya A. Pazarcıoglu N. 21.Yüzyılın Anahtar Teknolojisi: Beyaz Biyoteknoloji. İzmir, Ege Üniversitesi Fen Fakültesi Basımevi, 2004. Correspondence Address / Yazışma Adresi Umut Kökbaş Çukurova Üniv. Tıp Fak. Tıbbi Biyokimya ABD Adana, Turkey E-mail: ukokbas@cu.edu.tr