ÖZLEM DİLEK, Ph.D. Istanbul Kemerburgaz Universitesi, Tıp Fakültesi, Mahmutbey Dilmenler Cad. No: 26, Bağcılar, İstanbul 34217 E-mail: ozlem.dilek@kemerburgaz.edu.tr EĞİTİM ve ÖĞRETİM Kasım 2009-2012 Kuzey Karolina Üniversitesi, Chapel Hill/ Tıp Fakültesi ve SUNY-Binghamton (birleşik Amerikan Ulusal Sağlık Enstitüsü Projesi) Doktora-üstü araştırmacı-kimyasal Biyoloji Danışman: Prof. Klaus M. Hahn and Prof. Susan L. Bane 2009 Cornell Üniversitesi, Kimya ve Kimyasal Biyoloji Bölümü, Ithaca, NY ABD Doktora-üstü araştırmacı- Kimyasal Biyoloji 2004-2009 New York Eyalet Üniversitesi, Binghamton, NY ABD Doktora, Kimyasal Biyoloji Danışman: Prof. Susan L. Bane Tez: Synthesis and spectroscopic characterization of fluorescent boron dipyrromethenes probes for site-specific bioorthogonal imaging of proteins in live cells. 1998-2001 ODTÜ-Kimya Bölümü, Ankara, Türkiye Yüksek Lisans, Organik Kimya Danışman: Prof. Lemi Turker Tez: 1,3-dipolar cycloaddition reactions of some 3-arylphthalazinium-1-olates. 1992-1997 ODTÜ-Kimya Bölümü, Ankara, Türkiye Lisans, Kimya Danışman: Prof. Mahinur S. Akkaya Lisans bitirme araştırma projesi: Preparation of size-selected wheat genomic DNA library. AKADEMİK ÖDÜLLER VE BURSLAR 2012 American Society for Cell Biology (ASCB), Doğa Bilimleri Doktora-üstü Ödülü 2010 American Chemical Society (ACS), Zappert Ödülü En Üstün Doktora Öğrencisi Ödülü 1
2009 American Chemical Society (ACS), Organik Kimya Birimi, Amerikan Ulusal Öğrenci Seyahat Ödülü 2009 American Chemical Society (ACS), Binghamton,NY birimi, Öğrenci Seyahat Ödülü 2008 American Chemical Society (ACS), Binghamton, NY birimi, Öğrenci Seyahat Ödülü 2007 SUNY-Binghamton, Yüksek Lisans Organizasyonu Öğrenci Seyahat Ödülü 2007-2009 SUNY-Araştırma Enstitüsü, Tam Araştırma Bursu 2004-2007 SUNY-Binghamton, Amerika-Kimya Bölümü, Tam burslu araştırma görevliliği ve tam burslu doktora eğitimi İŞ TECRÜBESİ Mart 2013-halen İstanbul Kemerburgaz Üniversitesi, Tıp Fakültesi Yrd. Doç. Tıbbi Biyokimya Kasım 2009-2012 Kuzey Karolina-Chapel Hill Tıp Fakültesi ve SUNY- Binghamton, ABD Doktora-üstü araştırmacı-kimyasal Biyoloji 2009 Cornell Üniversitesi, Ithaca, NY ABD Doktora-üstü araştırmacı-kimyasal Biyoloji 2002-2004 TÜBİTAK-ULAKBİM Uzman 1999-2002 TÜBİTAK-ULAKBİM Uzman Yardımcısı 1996 Eczacibaşi-Baxter, Hastane Ürünleri Inc., İstanbul, Turkey Stajyer PROJELERDE YAPTIĞI GÖREVLER Amerikan Ulusal Sağlık Enstitüsü- R15-GM09394 Doktora-üstü Araştırmacı, 2010-2012 Amerikan Ulusal Sağlık Enstitüsü-R01-CA69571-Araştırmacı, 2007-2009 VERDİĞİ DERSLER VE DANIŞMANLIKLAR 2008-2012 Mentör, SUNY-Binghamton, Yüksek Lisans ve Lisans Öğrenci Bağımsız Araştırma Proje ve Dönem Araştırma Dersleri 2007-2008 Mentör, SUNY-Binghamton, Lisans Öğrenci Bağımsız Araştırma Proje ve Dönem Araştırma Dersleri 2005-2007 Öğretim Görevlisi SUNY-Binghamton, Organik Kimya 332, 335 2004-2005 Öğretim Görevlisi, SUNY-Binghamton, Genel Kimya Lab107,108 2
YAYINLAR Dilek O.; Bane SL, Tetrahedron Letters, Synthesis of fluorescent boron dipyrromethenes for bioorthogonal labeling 2008, 49, 1413. Dilek O.; Bane SL, Bioorganic Medicinal Chemistry Letters, Synthesis and spectroscopic properties of protein labeling of water soluble 3,5-disubstituted boron dipyrromethenes. 2009, 19, 6911. Dilek O.; Bane SL, Journal of Fluorescence, Syntheses and spectroscopic characterization of boron dipyrromethene-derived hydrazones. 2011, 21, 1, 347. Shanker N.; Dilek O.; Mukherjee K.; McGee WD.; Bane SL, Journal of Fluorescence, Aurones: Small Molecule Visible Range Fluorescent Probes for Biomacromolecules. 2011, 21, 6, 2173. Blanden A.R., Mukherjee K., Dilek O., Loew M., Bane S.L., Bioconjugate Chemistry, 4- Aminophenylalanine as a biocompatible nucleophilic catalyst for hydrazone-ligations at low temperature and neutral ph. 2011, 22, 10, 1954. Yayına hazır projeler: Dilek O., Mukherjee K., Konopko A., Bane SL, Bioorganic Medicinal Chemistry, Design and spectroscopic properties of amine/imine turn-off/on fluorescent probe systems for bioorthogonal imaging. Mukherjee K. Kong L.S., Dilek O., Bane SL, Analytical Biochemistry, High-throughput screening assay for modulators of tubulin tyrosine ligase. Dilek O., Kohn J., Konopko A., Bane SL, International Journal of Organic Chemistry, Rational design of aromatic BODIPY hydrazine/hydrazone fluorescent probe system for bioorthogonal site specific labeling of proteins Mukherjee, K., Khan S. Sabine, Dilek O, Paudel S., Bane S. L. Bioorganic Medicinal Chemistry Letters, Probing drug binding properties of the divergent tubulin β IV isotype. KİTAP BÖLÜMLERİ Dilek O.; Bane SL. Aromatic Hydrazine-Based Fluorophores: Synthesis, Spectroscopy and Bioapplications. Nova Science Publishers (2013) hazırlanmakta. KONFERANS YAYINLARI Mukherjee K., Kong S.L., Dilek O., Yoffe G. P., Bane S.L. High-throughput screening assay for modulators of tubulin tyrosine ligase at the 57 th Annual Biophysical Society, 2-6 Şubat 2013, Philadelphia, PA USA 3
Dilek O., Mukherjee K., Bane S.L. Fluorescent Probes for Carbonyl-Containing Proteins at the Annual American Society for Cell Biology, 15-19 Aralık 2012, San Francisco, LA USA Blanden A.R., Dilek O., Mukherjee K., Loew M., Kuperman R., Bane S.L. Nucleophilic catalysis expands repertoire for hydrazine-based bioorthogonal labeling of a-tubulin C- terminus presented at the 240 th National American Chemical Society, 22-26 Ağustos 2010, Boston, MA USA Dilek O, Bane S., Synthesis and spectroscopic studies on hydrazine/hydrazone turn-on fluorescent probe systems for site specific bioorthogonal labeling of proteins presented at the 238 rd National American Chemical Society, 16-20 Ağustos 2009, Washington, D.C USA Dilek O, Bane S., Syntheses and spectral characterization of water soluble 3,5- disubstituted boron dipyrromethenes for biolabeling presented at the 236 rd National American Chemical Society, 17-21 Ağustos 2008, Philadelphia, PA USA. Dilek O, Banerjee A. Bane S., Chemoenzymatic method for site specific fluorescent labeling of tubulin presented at the 9th Tetrahedron Symposium, 22-25 Temmuz 2008, Berkeley, CA USA Dilek O, Bane S., Synthesis and biological applications of water soluble 3,5- disubstituted boron dipyrromethenes presented at the 3rd Annual Binghamton Biomedical Research Conference, 3 Mayıs 2008, Binghamton, NY USA. Dilek O, Bane S., Boron dipyrromethene fluorescent probes for bioorthogonal labeling presented at the 3rd Annual Binghamton Biological Symposium, 25 January 2008, Binghamton, NY USA. Dilek O, Bane S., Boron dipyrromethene fluorescent probes for bioorthogonal labeling presented at the 2nd Annual Binghamton Biomedical Research Conference, 5 Mayıs 2007, Binghamton, NY USA. Dilek O, Bane S., Boron dipyrromethene fluorescent probes for bioorthogonal labeling presented at the 233rd National American Chemical Society, 24-29 Mart 2007, Chicago, IL USA. Dilek O., Bane S., Synthesis of BODIPY-based Hydrazine Derivatives as Fluorescent Probes presented at American Chemical Society, 35th Northeast Regional Meeting (NERM), Ekim 5 7 2006, Binghamton, NY USA. Susan L. Bane, Abhijit Banerjee, Ozlem Dilek, Strategies for Site-Specific Labeling of Proteins with Fluorescent Small Molecules. presented at American Chemical Society, 35th Northeast Regional Meeting (NERM), Ekim 5 7 2006, Binghamton, NY USA A. Banerjee, T. D. Panosian, B. Cowen, O. Dilek, N. Shanker, R. Ravindra, D. L. Sackett, S. Bane, Versatile Yet Highly Specific Fluorescent Labeling of Tubulin. presented at 46th Annual American Society for Cell Biology, 9-13 Aralık 2006, San Diego, CA USA 4
DAVETLİ SEMİNERLER Fluorescent probes for site-specific turn on targeting of proteins. Boğazici Universitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Şubat 1 2013, İstanbul, Türkiye. Design of hydrazine based fluorophores for site-specific turn on targeting of proteins. Ankara Üniversitesi, Kimya Bölümü, Aralık 25 2012, Ankara, Türkiye Bioorthogonal fluorophores for turn-on targeting of proteins Bilkent Üniversitesi-ÜNAM, Ocak 24 2011, Ankara, Türkiye. Synthesis of hydrazine-based bioorthogonal fluorophores: A logical approach to turn-on targeting. ODTÜ, Biyoteknoloji Bölümü, Eylül 14 2011, Ankara, Türkiye. Boron dipyrromethene fluorophores for bioorthogonal site-specific labeling of proteins Kuzey Karolina Üniversitesi- Chapel Hill, Tıp Fakültesi, Nisan 12 2010, Chapel Hill, NC Amerika. Synthesis and characterization of fluorescent boron dipyrromethene (BDP) probes for site specific bioorthogonal labeling of proteins Cornell Üniversitesi, Weill Tıp Fakültesi, Aralık 17 2009 New York, NY Amerika Synthesis and characterization of boron dipyrromethene derivatives bioorthogonal labeling of proteins Cornell Üniversitesi, Kimya ve Kimyasal Biyoloji Bölümü, Ocak 2009 Ithaca, NY Amerika. Boron dipyrromethene fluorescent derivatives for bioorthogonal labeling of biomolecules. New York Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Ocak 2009 New York, NY Amerika BİLİMSEL KURULUŞLARA ÜYELİKLER 2010-halen 2007-halen 2006-halen 2004-halen American Society for Cell Biology Biophysical Society New York Academy of Sciences American Chemical Society İDARİ GÖREVLER 2008-2009 SUNY-Binghamton, Yüksek Lisans Kimya Organizasyonu, Sekreter 2007-2008 SUNY-Binghamton, Yüksek Lisans Organizasyonu, Kimya Bölümü Temsilcisi 2005-2006 SUNY-Binghamton, Yüksek Lisans Organizasyonu, Kimya Bölümü Temsilcisi 2004-2006 SUNY-Binghamton, Amerikan Ulusal Bilim Olimpiyatları, Gönüllü Akademisyen 5
DİĞER BİLİMSEL AKTİVİTELER Fundamentals and Applications of Fluorescence Spectroscopy in Modern Cell Biology Kursu, Koç Üniversitesi, Tıp Fakültesi, İstanbul 12-17 Ağustos 2012 Professor Kevin Burgess (Texas A&M University) Fluorescent Probes for Multiplexed Intracellular Imaging SUNY-Binghamton, NY Ocak 2009. Seminer Organizasyon Sorumlusu 6