İZMİR İLİ NDE DOĞAL VE KLİNİK CRYPTOCOCCUS NEOFORMANS KÖKENLERİNİN VARYETE VE SEROTİPLERİ

Benzer belgeler
SEDİMENTASYON VE EKÜVYON YÖNTEMLERİ İLE OKALİPTÜS AĞAÇLARINDA CRYPTOCOCCUS SPP. VARLIĞININ ARAŞTIRILMASI

TÜRKİYE DE İNSAN KRİPTOKOKKOZUNUN EPİDEMİYOLOJİSİ ( )*

CRYPTOCOCCUS TÜRLERĠNĠN ĠDENTĠFĠKASYONU. Süleyha HĠLMĠOĞLU POLAT Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Kriptokokkozis. Crryptococcosis

N. Tiryakioğlu, B. Aksu, M. U. Hasdemir. Marmara Üni. Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İstanbul

UZMANIYLA TARTIŞALIM MİKOLOJİ LABORATUVARINDA YAŞANAN SORUNLAR

Yoğun Bakım Ünitesinde Gelişen Kandida Enfeksiyonları ve Mortaliteyi Etkileyen Risk Faktörleri

Ege Mikrobiyoloji Günleri-3. Santral Sinir Sisteminde Özellikli Enfeksiyonlar

SALUBRIS Gateway to Health Worldwide Dünya Çapında Sağlığa Açılan Kapı

Türkiye nin Güney-Batı Anadolu Bölgesindeki Ilgın (Genus: Tamarix L.) Ağaçlarında Cryptococcus neoformans Kolonizasyonu Takibi

GİRİŞ. Kan dolaşımı enfeksiyonları (KDE) önemli morbidite ve mortalite sebebi. ABD de yılda KDE, mortalite % 35-60

Mine Doluca Dereli Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim

Enzimlerinin Saptanmasında

Aşı İçeriği ve Ülkemize Uyumu

Candida Türlerinin İdentifikasyonunda Fermentasyon-Asimilasyon Testleri ve Otomatize Sistemler. Dr Beyza Ener Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi

Dünyada ve Türkiyede Tularemi. Prof. Dr. Okan Töre Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D.

Deneysel Hayvan Modelinde Candida Tropicalis Peritonitinin Tedavisinde Kaspofungin ve Amfoterisin B Etkinliğinin Karşılaştırılması

İmmun sistemi baskılanmış hasta popülasyonunun artması Tanı yöntemlerinin gelişmesi 1990 lı yıllardan sonra yayın sayısında artış Son beş yılda pik

DENİZLİ ŞEHİR MERKEZİNDE KOVUKLU AĞAÇ GÖVDELERİNDEN CRYPTOCOCCUS NEOFORMANS İZOLASYONU*

Çevresel Örneklerde Cryptococcus neoformans Taramaları İçin Patlıcan (Solanum melongena) Agarın Yeni Bir Besiyeri Olarak Değerlendirilmesi*

MİKROBİYOLOJİ LABORATUVARINDA UYULMASI GEREKEN KURALLAR

BD Sabouraud GC Agar / CHROMagar Candida Medium (Biplate)

Çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis izolatlarının hızlı tespitinde nitrat redüktaz testinin değerlendirilmesi: Çok merkezli bir çalışma

ANTİFUNGAL DİRENÇ ve ANTİFUNGAL DUYARLILIK TESTLERİ

Temas kurulacak kiģiler: Uzm. Dr. Belkıs LEVENT Tel: E-posta:

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Candida Kökenlerinin İdentifikasyonu ve Antifungal Duyarlılıklarının Araştırılması

Rutin Laboratuvarda Candida albicans Tanısı Almış İzolatlarda Üç Farklı Yöntemle Candida dubliniensis Araştırılması(*)

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Kandida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları

Yöntem ve Test Seçimine Yaklaşım. Dr. Alpay Özbek Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji AD. Dokuz Eylül Üni. Tıp Fak. İZMİR

Çeşitli Klinik Örneklerden Soyutlanan Kandidaların Tür Dağılımı ve Antifungal Direnci*

MİKOBAKTERİYOLOJİ LABORATUVARI ÇALIŞILAN TESTLER

YOĞUN BAKIM ÜNİTELERİNDEN DÖRT YILLIK DÖNEMDE İZOLE EDİLEN MAYALARIN TÜR DAĞILIMININ DEĞERLENDİRİLMESİ*

Fungal Etkenler. Toplantı sunumları Dr.AyşeKalkancı. Santral Sinir Sistemi Enfeksiyonlarında Tanı. Ege Mikrobiyoloji Günleri-3

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

M47 MICROGEN STREP MICROGEN

S İ S T E M İ K M İ K O Z L A R

Asist. Dr. Ayşe N. Varışlı

Dr. Emel UZUNOĞLU, Giresun Ömer Hekim Tıp Fakültesi

Uzm. Dr. Muammer ÇELİK XIX. TÜRK KLİNİK MİKROBİYOLOJİ VE İNFEKSİYON HASTALIKLARI KONGRESİ Gloria Golf Resort, Belek/ANTALYA Mart 2018

Dilara YILDIRAN. Candida İzolatlarının Tür Düzeyinde. ve MALDI-TOF MS Sistemlerinin Karşılaştırılması. Mikr. Uzm.

Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida sp kökenlerinde slime faktör üretimi

Bölgemizden Soyutlanan Salmonella ve Shigella Bakterileri ve Antibiyotik. Duyarlılıkları

DR ALPAY AZAP ANKARA ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ İNFEKSİYON HASTALIKLARI ve KLİNİK MİKROBİYOLOJİ AD

PROSEDÜR İLKELERİ VE AÇIKLAMASI

YIL ÜRETİM ALANI(da) ÜRETİM(ton)

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI. LİSE2 (Çalıştay 2012) BİYOLOJİ GRUP TELOMER

MAYALARIN ANTİFUNGAL DUYARLILIKLARININ ARAŞTIRILMASINDA HIGH RESOLUTION BESİYERİ KULLANILAN MİKRODİLÜSYON YÖNTEMİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

DISTRIBUTION OF CANDIDA SPECIES IN VAGINAL SPECIMENS AND EVALUATION OF CHROMAGAR CANDIDA MEDIUM. Berna GÜLTEKİN**, Vesile YAZICI**, Neriman AYDIN**

Antifungal duyarlılık testleri

PNÖMOKOKLARDA DİRENÇ EPİDEMİYOLOJİSİ DR. BURÇİN ŞENER HACETTEPE ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ TIBBİ MİKROBİYOLOJİ AD

BRUSELLOZDA KAN VE KEMİK İLİĞİ KÜLTÜRLERİNİN TANI DEĞERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI

TÜBERKÜLOZ TANISINDA TÜBERKÜLOZ LABORATUVARININ ROLÜ : TANI VE İLAÇ DUYARLILIK TESTLERİNDE RUTİN LABORATUVAR YÖNTEMLERİNİN DEĞERİ

«Bakteriyoloji Laboratuvarında Yeni

TÜBERKÜLOZUN MOLEKÜLER TANISINDA GÜNCEL DURUM

TÜRKİYE DEKİ ÜÇ TIP FAKÜLTESİNİN SON ÜÇ YILDAKİ YAYIN ORANLARI THE THREE-YEAR PUBLICATION RATIO OF THREE MEDICAL FACULTIES IN TURKEY

Kriptokok infeksiyonlarında etken Cryptococcus

İdrar Örneklerinden İzole Edilen Bakteriler ve Antibiyotiklere Duyarlılıkları

OLGU SUNUMLARI. Dr. A. Nedret KOÇ. Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Kayseri

GERM TÜP TESTİNİN MÜELLER HİNTON AGAR VE SERUMDA KARŞILAŞTIRILMASI EVALUATION OF MUELLER-HINTON AGAR FOR GERM TUBE TEST

Doç.Dr. SERAP SAVAŞAN

Metschnikowia pulcherrima Türü Mayaların İzolasyonu ve Pulcherrimin in Antimikrobiyal Aktivitelerinin Araştırılması. Prof. Dr.

Klinik Örnekten Sonuç Raporuna: Mantar Enfeksiyonlarına Laboratuvar Yaklaşımı

Moleküler Yöntemlerin Klinik Mikrobiyolojide Kullanımı Ne zaman? Nerede? Ne kadar? Klinik Parazitoloji

YARA YERİ ÖRNEKLERİNDEN İZOLE EDİLEN MİKROORGANİZMALAR VE ANTİBİYOTİK DUYARLILIKLARININ DEĞERLENDİRİLMESİ*

1.5 Kalite Kontrol Bölüm Fiziksel Kalite Kriterleri Bölüm Mikrobiyolojik Kalite Kriterleri Mikrobiyal Kontaminasyon

Tüberkülozun Mikrobiyolojik Tanısı. Süheyla SÜRÜCÜOĞLU

İstanbul daki El Ayak Ağız Hastalığı Vakalarında Coxsackievirus A6 ve Coxsackievirus A16 nın Saptanması

T.C. SÜLEYMAN DEMİREL ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ISPARTA İLİ KİRAZ İHRACATININ ANALİZİ

Adenovirüs serotip 5 ve adenovirüs serotip 36 nın Colo-320 hücre hattında adipojenik etkilerinin gösterilmesi

S.Ü. Ziraat Fakültesi Dergisi 18 (33): (2004) 17-22

Komplike deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni çoklu dirençli patojenlerin bakteriyofaj duyarlılıklarının araştırılması

Hakan KALENDER* Isolation of Salmonella spp. from Laboratory Animals

2- MİKOLOJİ LABORATUVARI İŞLEYİŞ SÜREÇLERİ

Dr Emel TÜMBAY Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Em. Öğretim Üyesi

Manisa Bölgesinde Otomikoz Etkenleri,

YEDİ YILLIK DÖNEMDE KAN KÜLTÜRLERİNDEN İZOLE EDİLEN CANDIDA TÜRLERİNİN RETROSPEKTİF OLARAK İNCELENMESİ*

BİRİNCİ BASAMAKTA DİYABETİK AYAK İNFEKSİYONLARI EPİDEMİYOLOJİSİ VE ÖNEMİ. Doç. Dr. Serap Çifçili Marmara Üniversitesi Aile Hekimliği Anabilim Dalı

(Hastane Kökenli) SAĞLIK HİZMETİ İLİŞKİLİ İNFEKSİYONLARIN EPİDEMİYOLOJİSİ VE RİSK FAKTÖRLERİ

Kanatlılarda Salmonella İnfeksiyonları ve Kontrolünde Temel Prensipler

Prof. Dr. Selma GÖKAHMETOĞLU Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ABD, Kayseri

FARKLI KLİNİK TANILI HASTALARDAKİ DERMATOFİTİK AYAK ETKENLERİ DERMATOPHYTIC FOOT AGENTS IN PATIENTS WITH DIFFERENT CLINICAL DIAGNOSIS

Yoğun Bakım Ünitesi nden Gelen Hasta Örneklerinden İzole Edilen Kandida Türleri ve Antifungal Duyarlılıkları

Dünya ve 20 Gelişmiş Ülke Ekonomisinde Hayvancılığın Yeri

Yoğun Bakımlarda İnfeksiyon Kontrolü: Haricen Klorheksidin Uygulanmalı mı?

Servikal smearlerde RİA etkisinin incelenmesi

Bor, atom numarası 5 ve kimyasal sembolü B olan bir elementtir. Yarı metal olan bor doğada tek başına element haliyle bulunmaz

FEN TEDAVİSİNDE GENEL ANTİBİYOTERAPİ EĞİLİMİ

VERİFİKASYON. Dr. Tijen ÖZACAR. Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD - İZMİR

MARMARA ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK HİZMETLERİ MESLEK YÜKSEKOKULU

Dermatofit cinsleri. 1.Microsporon. 2.Trichophyton. 3.Epidermophyton

ÖZGEÇMİŞ. I- Kişisel Bilgiler. II-Yabancı Dil. III-Eğitim: Doğum yeri ve tarihi : Ankara, 7 Şubat : Medical Park Bahçelievler Hastanesi

Kan Dolaşım Enfeksiyonlarında Karar Verme Süreçleri. Prof. Dr. Aynur EREN TOPKAYA Namık Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD

T"RK~YE B~L~MSEL YE TEKNOLOJ~K ARASTIRMA KURUMU

T.C. Ödemiş Belediyesi

İzolasyon ve İdentifikasyon

AÇIKÖĞRETİM FAKÜLTESİ ÖĞRETİM YILI UZAKTAN EĞİTİM ÖNLİSANS PROGRAMLARI DERS PLANI GIDA KALİTE KONTROLÜ VE ANALİZİ ÖNLİSANS PROGRAMI

Maya türlerinin tanımlanmasında ticari testlerin karşılaştırılması

PROJE DANIŞMANLARI Prof. Doç. Dr. Güven Özdemir Doç. Dr. Murat TOSUNOĞLU. PROJE EKİBİ Seval ŞAHİN Berrin ÖZCAN 25 OCAK 02 ŞUBAT 2014 ÇANAKKALE

Bakteri ve Mantarların MALDI TOF ile Tanımlanması Tanıl Kocagöz Mikroorganizmaların Tanımlanmasında Spektroskopik Yöntemler Çağrı Ergin Nükleik Asit

Transkript:

Tülay-Sarıbaş ve Hoşgör-Limoncu İnfeksiyon Dergisi (Turkish Journal of Infection) 2008; 22 (1): 53-58 İZMİR İLİ NDE DOĞAL VE KLİNİK CRYPTOCOCCUS NEOFORMANS KÖKENLERİNİN VARYETE VE SEROTİPLERİ VARIETY AND SEROTYPES OF CRYPTOCOCCUS NEOFORMANS STRAINS ISOLATED FROM CLINICAL SPECIMENS AND ENVIRONMENTAL SOURCES IN IZMIR, TURKEY Yeşer KARACA DERİCİ 1 ve Emel TÜMBAY 2 Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi, Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, İzmir Anahtar Sözcükler: Cryptococcus neoformans, varyete, serotip, klinik örnekler güvercin dışkısı, ökaliptus debrisi Keywords: Cryptococcus neoformans, variety, serotype, clinical specimens, pigeon droppings, eucalyptus debris Geliş: 26 Kasım 2007 Kabul: 03 Ocak 2008 ÖZET Bu çalışma, Cruptococcus neoformans için doğal kaynak olarak kabul edilen güvercin dışkısından ve ökaliptus debrisinden mantarı izole edip bu doğal kökenlerin ve ayrıca bölgemizdeki kriptokokkozlu hastalardan izole edilmiş olan C. neoformans klinik suşlarının varyete ve serotiplerini saptamak amacıyla yapıldı. İzmir ve çevresinden toplanan toplam 90 güvercin dışkısı örneğinden plak yöntemi ile sekiz (%8.8) C. neoformans kökeni izole edilip bunların tümünün kanavanin-glisin-bromtimol agar yöntemi ile var. neoformans ve Crypto-check lam aglütinasyonu testi ile beşinin (%62.5) serotip D ve üçünün (%37.5) serotip A olduğu saptandı. Ökaliptus debrisi örneklerinden C. neoformans izole edilemedi. Bölgemizdeki kriptokokkozlu hastalardan izole edilen beş klinik suşun tümünün yine sırasıyla aynı yöntemler kullanılarak C. neoformans var. neoformans ve serotip A olduğu belirlendi. Çalışmamızda doğal C. neoformans kökenlerinin A ve D serotipinde, klinik kökenlerin ise A serotipinde olduğu ilk kez ortaya konulmuş olmakla birlikte, konuya ilişkin çok merkezli çalışmalara gereksinim vardır. SUMMARY The aim of this study was to isolate Cryptococcus neoformans from pigeon droppings and eucalyptus debris which are known as the natural sources for this yeast and to determine the varieties and serotypes of these natural strains as of well as of the clinical strains isolated in cryptococcosis patients in Izmir, Turkey. In 90 pigeon dropping samples collected from Izmir and its environment eight (%8.8) C. neoformans strains were isolated using plate method and all of them were found as var. neoformans by canavanineglycine-bromthymol agar method and five of these were of serotype D (%62.5) while three were of serotype A (%37.5) by Cryptocheck slide aglutination method. From the eucalyptus debris samples no strain could be isolated. All of the five clinical strains isolated in cryptococcosis patients were determined as C. neoformans var. neoformans and serotype A using the same methods, respectively. It is concluded that, although for the first time it is determined that the natural C. neoformans strains are of serotypes A and D and clinical strains are of serotype A, multicenter studies are required on the subject. GİRİŞ Cryptococcus neoformans, kriptokokkoz etkeni kapsüllü bir maya mantarı olup fenotipik, serolojik, biyokimyasal, epidemiyolojik ve genetik farklılıklara dayanarak C. neoformans var. neoformans ve C. neoformans var. gattii olmak üzere iki varyeteye ayrılmıştır. Cryptococcus neoformans var. neoformans tüm dünyada yaygın olup toprakta, çeşitli kanatlı dışkısında ve özellikle güvercin dışkısında bulunur ve A, D ve AD serotiplerini içerir (1-5). Cryptococcus neoformans var. gattii ise, tropikal ve 53

Karaca Derici ve Tümbay subtropikal bölgelerde bulunur ve kaynağı ökaliptus ağacı olup B ve C serotiplerini içerir (6-8). Kriptokokkoz olgularında etken çoğunlukla C. neoformans var. neoformans tır (1, 2). Cryptococcus neoformans var. gattii nin neden olduğu infeksiyon ise tropikal ve subtropikal bölgelerle sınırlıdır. Türkiye de kriptokokkoz olguları sınırlı sayıda olup bu yayınlarda etken varyetesi ve serotipi saptanmamıştır (9-12). Bu çalışma, doğal kaynak olarak kabul edilen güvercin dışkısından ve ökaliptus debrisinden C. neoformans izole etmek, izole edilen doğal suşların ve ayrıca bölgemizdeki hastalardan izole edilmiş olan C. neoformans klinik suşlarının varyete ve serotiplerini saptamak amacıyla yapıldı. GEREÇ VE YÖNTEM Cryptococcus neoformans için doğal kaynak olan güvercin dışkısı örnekleri için, Nisan-Eylül 2002 tarihlerinde İzmir de güvercin yetiştiricilerinin çok sayıda bulunduğu Bayraklı, Gültepe, Yenişehir, Ferahlı, Bornova, Aliağa, Urla, Fahrettin Altay ve Buca semtlerindeki güvercin besleyicilerin evlerine gidilerek toplam 90 güvercin dışkısı örneği toplandı. Her bir örnek, güvercin kümesinin toprak zeminindeki kuru gübre yığınından 25-30 g miktarda spatülle alınıp steril Petri kutularına konularak laboratuvara getirildi. Bir diğer doğal kaynak olan ökaliptus örnekleri için ise Ocak-Haziran 2002 tarihlerinde İzmir in Bornova, Menemen, Foça, Karşıyaka, Buca, Konak ve Güzelbahçe semtlerine gidilerek toplam 50 ökaliptus debris örneği (yaprak, tohum, çiçek) toplandı. Örnekler ağaç altındaki toprak zeminde bulunan yaprak, tohum gibi döküntülerden 20-25 g miktarda alınarak plastik torbalar içinde laboratuvara getirildi. Tüm örnekler inceleninceye değin +4 C de saklandı. Klinik C. neoformans kökenleri olarak Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi nde 1996-2002 yılları arasında yatan kriptokokozlu hastalardan izole edilen ve mikotekte korunan beş köken incelemeye alındı. Standart Cryptococcus neoformans ATCC 90112 kökeni, soyutlanan her kuşkulu mayanın mikolojik incelemesinde kontrol suş olarak kullanıldı. Güvercin dışkısı ve ökaliptus debrisinden yaklaşık 5 g örnek 250-500 ml lik steril Erlenmayer şişesine konulup üzerine 25 ml antibiyotikli tuzlu su (amikasin 500 mg + serum fizyolojik 1000 ml) katıldı. Erlenmayer 5 dakika vortekslenip daha sonra kaba partiküllerin dibe çökmesi için 20-30 dakika oda ısısında bırakıldı. Çökeltinin üstündeki sıvı bölüm üç kat steril gaz bezinden süzülerek steril bir tübe alınıp ve bu süzüntüden ekimler yapıldı. Cryptococcus neoformans izolasyonunda, Littman ve Schneierson (5), Bergman (13), Staib ve Seeliger (14) in önerdiği yöntemler doğrultusunda, Tümbay (15) ın önerdiği bazı küçük modifikasyonlar yapılarak direkt plak yöntemi kullanıldı. Besiyeri olarak Staib-Seeliger besiyeri (Guizotia abyssinica kre-atinin agar) kullanıldı. Kuşkulu kahverengi kolonilerden yapılan preparatlarda kapsüllü maya hücresi görülünce sırasıyla, Staib-Seeliger besiyerinde saf kültür, tek bir kahverengi koloniden Saboraud-Dekstroz-Agar (SDA) plağına saf kültür, üreaz deneyi, mısır unu agarda morfoloji kontrolü, 37 C de üreme kontrolü, hızlı nitrat indirgeme deneyi yapıldı. Morfolojik ve kimyasal özellikleri C. neoformans ınkine uyan maya suşunun otoma-tize sistem olan API 20C AUX (bio Mérieux, Fransa) ile de doğrulanması yapıldı. Varyete saptamak için, kanavanin-glisin bromtimol agar (KGBA) a ekim yapıldı (16). Her plağa C. neofomans suşu öze ile zigzag ekim yapılarak yoğun olmayacak şekilde ekildi. Ekili plaklar 26 C de 5 gün süre ile inkübe edilip, inkübasyonun 2 ve 5. günlerinde üreme kontrolleri yapılarak renk değişikliği arandı. Serotip saptama için, Crypto-check kit (Iatron Co., Japonya) ile lam aglütinasyonu yapıldı. A, B, C, D ve AD serotiplerine ilişkin her bir bağışık serumdan ve serum fizyolojikten birer damla lama dağıtılıp ve 26 C de inkübe edilen maya kolonilerinden plastik öze ile küçük bir miktar alınıp karıştırıldı. Lam nazikçe elde çalkalanarak 2 dakika içinde gözle aglütinasyon arandı. Bu deney ile maya suşunun antijenik formülüne bakılarak serotipi belirlendi. Kriptokokkozlu hastalardan izole edilen beş C. neoformans kökeni için yeniden identifikasyon testleri ve doğrulandıktan sonra varyete ve serotipleri aynı yöntemler kullanılarak belirlendi. BULGULAR Doğal kaynak olarak incelenen toplam 90 güvercin dışkısı örneğinin sekizinden (%8.8) C. neoformans izole edildi. Bu kökenlerin tümü C. neoformans laboratuvar tanı göstergelerinin hepsine uyan özellikler gösterdiler (Tablo 1). Doğal C. neoformans kökenlerinin tümü ilk izolasyonlarında klinik kökenlerden farklı olarak ince kapsüllü olup besiyerinde pastöz koloni oluşturdular. Bir diğer doğal kaynak olarak incelenen toplam 50 ökaliptus debrisinde C. neoformans bulunmadı. Tüm doğal C. neoformans suşları, var. neoformans olarak saptandı. Bu doğal kökenlerden beşi (%62.5) 54 İnfeksiyon Dergisi (Turkish Journal of Infection)

İzmir de Cryptococcus neoformans serotip D ve üçü (%37.5) serotip A olarak saptandı (Tablo 2). Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Mikoteği nde bulunan beş klinik kökenin C. neoformans olduğuna dair tanısal özellikler (Tablo 3) tekrar gösterildikten sonra varyete ve serotip tayini yapıldı. Tüm klinik kökenler var. neoformans ve serotip A (%100) olarak saptandı (Tablo 4). Tablo 1. Doğal kaynaklardan izole edilen C. neoformans kökenlerinin tanısal özellikleri 1 2 3 4 5 6 7 8 Koloni P p p p p p P p m Kapsül i i i i i i İ i o 37 C de üreme + + + + + + + + + Kahverengi koloni + + + + + + + + + Üreaz + + + + + + + + + Mısır unu agarda hif yok hif yok hif yok hif yok hif yok hif yok hif yok hif yok hif yok KGBA da üreme yok yok yok yok yok yok Yok yok yok Nitrat indirgeme _ Cn= C. neoformans, KGBA= Kanavanin-glisin-bromtimol agar p= Pastöz koloni, m= Mukoit koloni, i= İnce kapsül, o= Orta kalınlıkta kapsül Tablo 2. İzole edilen sekiz doğal C. neoformans suşunun varyete ve serotip dağılımı 1 2 3 4 5 6 7 8 Varyete neo neo neo neo neo neo neo neo Serotip D A A D A D D D neo= C. neoformans var. neoformans Tablo 3. Klinik C. neoformans kökenlerinin tanısal özellikleri 1 2 3 4 5 Cn kontrol Koloni m m M m m m Kapsül o o O o o o 37 C de üreme + + + + + + Kahverengi koloni + + + + + + Üreaz + + + + + + Mısır unu agarda hif yok hif yok hif yok hif yok Hif yok hif yok Nitrat indirgeme - - - - - - KGBA da üreme yok yok Yok yok yok yok Cn= C. neoformans, KGBA= Kanavanin-glisin-bromtimol agar p= Pastöz koloni, m= Mukoit koloni, i= İnce kapsül, o= Orta kalınlıkta kapsül Tablo 4. Beş klinik C. neoformans kökeninin varyete ve serotip dağılımı 1 2 3 4 5 Varyete neo neo neo Neo neo Serotip A A A A A neo= C. neoformans var. neoformans Cilt 22, Sayı 1, Ocak 2008 55

Karaca Derici ve Tümbay TARTIŞMA Cryptococcus neoformans var. neoformans, kanatlı dışkısı bulaşmış toprakta ve özellikle kuru güvercin dışkısı olmak üzere çeşitli kanatlı dışkılarında bulunur (1-5). Cryptococcus neoformans var. gattii nin kaynağı ise ökaliptus ağacı olup özellikle tropikal ve subtropikal bölgelerle görülür (6-8). Amerika Birleşik Devletler inde mantarın güvercin dışkısından izolasyon oranı %10-69 arasında olduğu bildirilmektedir (5, 17-21). Avrupa da ise daha düşük izolasyon oranları elde edilmiş olup, bu oran %0.7-39 arasında değişmektedir (13, 22-24). Bu çalışma, Türkiye de C. neoformans ın kuş dışkısından izolasyonuna ilişkin dokuzuncu çalışmadır. Türkiye de güvercin dışkısından C. neoformans izolasyon oranları %1-18.9 arasında yer almakta olup (25-31), çalışmamızda bu oran %8.8 bulundu. Cryptococcus neoformans doğal ve klinik kökenlerinin varyete ve serotip açısından incelenmesi sonucu tüm Amerika kıtası değerlendirildiğinde, tüm serotiplere doğal ve klinik olarak rastlanmakla birlikte en yaygın serotip A dır. Güney Kaliforniya eyaleti ve bazı Güney Amerika ülkelerinde var. gattii B ve C serotiplerine, B serotipi daha baskın olmak üzere Amerika nın diğer bölgelerine oranla daha fazla rastlanmaktadır (32-35). Avrupa da, Kuzey İtalya, Danimarka dışında en yaygın olan doğal ve klinik serotip var. neoformans serotip A olarak bildirilmektedir (32-34, 36-38). Asya kıtasında da en yaygın olan C. neoformans, serotip A dır, ancak coğrafik özelliği nedeniyle serotip B de görülmektedir (33, 39-42). Afrika kıtasından doğal C. neoformans izolasyonuna ilişkin çalışmaya rastlanmamıştır, ancak klinik kökenlere ilişkin iki araştırmanın verilerine göre Afrika da en yaygın serotipin A olduğu görülmektedir, ancak bu kıtada %20 ye varan var. gattii özellikle serotip B varlığı dikkate değer bir bulgudur (32, 34). Ökaliptus ağaçları açısından zengin olan Avustralya da var. gattii (serotip B) yaygın olarak bulunmakta ve var. neoformans a hemen hemen eşit sıklıkta kriptokokkoza neden olmaktadır (6, 43). Türkiye de doğal C. neoformans kökenlerinin varyetelerinin saptandığı ilk çalışma Yıldıran ve ark. (26) tarafından yapılmıştır. Yazarlar, Türkiye de 54 ilden topladıkları toplam 634 güvercin dışkısı örneğinin 29 undan (%4.6) C. neoformans var. neoformans izole etmişler, ancak kökenlerin serotiplerini belirlememişlerdir. Çalışmamızda, Türkiye de ilk kez doğal ve klinik C. neoformans kökenlerinin serotiplendirilmesi yapıldı ve izole edilen sekiz C. neoformans ın beşi (%62.5) serotip D, üçü (%37.5) serotip A olarak saptandı. İncelenen 50 ökaliptus ağacı debrisinden C. neoformans var. gattii izole edilemedi. Bunun nedeni, örnek sayısının sınırlı olması olabilir. Ancak var. gattii nin izolasyonu kolay değildir. Ellis ve Pfeiffer (6), 2100 ökaliptus debrisi örneğinin ancak ikisinde var. gattii, Ergin ve ark. (44) ise 1175 ökaliptus debrisi örneğinin sadece birinde var. grubii serotip A izole ettiklerini bildirmektedirler. Ancak ökaliptus türleri, özellikle ilk var. gattii izolasyonunun yapıldığı E. camaldulensis Türkiye de de bulunduğundan, gelecekteki çalışmalarda var. gattii izolasyonu üzerinde de durulmalıdır. Amerika Birleşik Devletleri, Güney İtalya ve İspanya da var. neoformans serotip A nın en yaygın doğal serotip olduğunu gösterilmiştir (33, 36, 37, 40). Bunun yanında Danimarka ve Kuzey İtalya da ise, en yaygın serotip D olarak saptanmıştır (33). Her iki ülkede incelenen köken sayısının sırasıyla 12 ve 5 gibi düşük olması doğal serotip dağılımı konusunda kesin bir sonuca varılması için yeterli değildir. Bu durum, bu çalışmada saptanan doğal köken serotipleri için de geçerlidir. Ege Bölgesi nin, Güney İtalya ve İspanya nın yer aldığı Orta Akdeniz Bölgesi nin bir parçası olması, bu çalışmada her ne kadar serotip D egemen gibi görülse de, serotip A nın en yaygın serotip olabileceği kuşkusunu uyandırmaktadır. Sonuç olarak, bu çalışmada doğal C. neoformans kökenlerinin A ve D serotipinde, klinik kökenlerin ise A serotipinde olduğu ilk kez ortaya konmaktadır. Türkiye de farklı coğrafi bölgelerde, çok sayıda kökenin incelenmesi ile serotip dağılımı konusunda daha sağlıklı bilgiler elde edilecektir. KAYNAKLAR 1. Tümbay E. Cryptococcus neoformans. Ustaçelebi Ş, ed. Temel ve Klinik Mikrobiyoloji de. Ankara: Güneş Kitabevi, 1999: 1087-91. 2. Casadevall A, Perfect JR, eds. Cryptococcus neoformans. Washington, DC: American Society for Microbiology, 1998. 3. Emmons CW. Isolation of Cryptococcus neoformans from soil. J Bacteriol 1951; 62: 685-90. 4. Emmons CW. Saprophytic sources of Cryptococcus neoformans associated with the pigeon. Am J Hyg 1955; 62: 227-32. 5. Littman ML, Schneierson SS. Cryptococcus neoformans in pigeon excreta in New York City. Am J Hyg 1959; 69: 49-59. 56 İnfeksiyon Dergisi (Turkish Journal of Infection)

İzmir de Cryptococcus neoformans 6. Ellis DH, Pfeiffer TJ. Natural habitat of Cryptococcus neoformans var. gattii. J Clin Microbiol 1990; 28: 1642-4. 7. Pfeiffer TJ, Ellis DH. Environmental isolation of Cryptococcus neoformans var. gattii from Eucalyptus tereticornis. J Med Vet Mycol 1992; 30: 407-8. 8. Chen SC, Currie BJ, Campbell HM, et al. Cryptococcus neoformans var. gattii infection in northern Australia: existence of an environmental source other than known host eucalypts. Trans R Soc Trop Med Hyg 1997; 91: 547-50. 9. Anğ Ö, Tümbay E, Büget E, Güvener Z. Balgamdan izole edilen Cryptococcus neoformans suşu. İstanbul Tıp Fak Mec 1973; 36: 850-5. 10. Söyletir G, Bayık M, Ener B, Göral M. Hairy cell lösemili bir hastada Cryptococcus neoformans menenjiti. İnfek Derg 1989; 3: 291-6. 11. Leblebicioğlu H, Saniç A, Günaydın M, Emirler N, Özdemir Ş. Bir Cryptococcus neoformans menenjiti olgusu. Mikrobiyol Bült 1995; 29: 203-7. 12. Akıncı E, Öngörü P, Çolpan A, Erbay A, Balaban N, Bodur H. Kriptokok menenjitli bir olgu. İnfek Derg 2004; 18: 539-42. 13. Bergman F. Occurence of Cryptococcus neoformans in Sweden. Acta Med Scand 1963; 174: 651-5. 14. Staib F, Seeliger HPR. Zur Selektivzüchtung von Cryptococcus neoformans. Mykosen 1968; 11: 267. 15. Tümbay E. İzmir yöresinde Cryptococcus neoformans ve Kriptokokkoz. 1. Kısım: Cryptococcus neoformans ın doğal kaynaklarından izolasyonu. TÜBİTAK 6. Bilim Kongresi, Tıp Araştırma Grubu Tebliğleri (17-21 Ekim 1977, Ankara) kitabında. TÜBİTAK Yayınları No. 429. Ankara: TÜBİTAK, 1979: 839-66. 16. Kwon-Chung KJ, Polacheck I, Bennett JE. Improved diagnostic medium for separation of Cryptococcus neoformans var. neoformans (serotypes A and D) and Cryptococcus neoformans var. gattii (serotypes B and C). J Clin Microbiol 1982; 15: 535-7. 17. Emmons CW. Prevalance of Cryptococcus neoformans in pigeon habitats. Public Health Rep 1960; 75: 362-4. 18. Felton FG, Muchmore HG, McCarthy MA. Epidemiology of cryptococcosis: Evaluation of patients environment. Health Lab Sci 1974; 11: 205-9. 19. Denton JF, Di Salvo EF. The prevalance of Cryptococcus neoformans in various natural habitats. Sabouraudia 1968; 6: 213-17. 20. Halde C, Fracher MA. Cryptococcus neoformans in pigeon faeces in San Francisco. Calif Med 1966; 104: 188-90. 21. McDonough ES, Lewis AL, Penn LA. Relationship of Cryptococcus neoformans to pigeon in Milwaukee-Wisconsin. Public Health Rep 1966; 81: 1119-26. 22. Mishra SK, Staib F, Folkens U, Fromtling R. Serotypes of Cryptococcus neoformans strains isolated in Germany. J Clin Microbiol 1981; 14: 106-7. 23. Partridge BM, Oxon VA, Winner HI, Cantab FC. Cryptococcus neoformans in bird droppings in London. Lancet 1965; 15: 1060-1. 24. Hubalek Z, Dvorak J, Kubik V. Isolation of Cryptococcus neoformans from pigeon excreta in the South Moravia region. Cesk Epidemiol Mikrobiol Imunol 1971; 20: 212-5. 25. Karaman A, Tümbay E, Demir O. Bursa da güvercin ve çeşitli kuş dışkısı örneklerinde Cryptococcus neoformans aranması. Türk Mikrobiyol Cem Derg 1980; 10: 31-40. 26. Yıldıran ST, Saraclı MA, Gonlum A, Gun H. Isolation of Cryptococcus neoformans var. neoformans from pigeon droppings collected throughout Turkey. Med Mycol 1998; 36: 391-4. 27. Yılmaz A, Göral G, Helvacı S, Kılıçturgay K, Gökırmak F. Cryptococcus neoformans ın güvercin dışkılarında dağılımı. Mikrobiyol Bült 1989; 23: 121-6. 28. Sivrel A, Tümbay E. İzmir de güvercin dışkısından izole edilen Cryptococcus neoformans suşları ve bunların amfoterisin B ye in-vitro duyarlılıkları. İnfek Derg 1993; 7: 107-13. 29. Aygün G. İstanbul da Cryptococcus neoformans ın doğal kaynaklarda varlığının araştırılması. Cerrahpaşa Tıp Dergisi 1998; 29: 18-22. 30. Koç AN, Durkut S. Kayseri yöresindeki güvercinliklerde Cryptococcus neoformans, diğer medikal önemli üreaz üreten mayaların ve Histoplasma capsulatum un araştırılması. İnfek Derg 2001; 15: 335-40. 31. Tümbay E, Demir O, Önder M. Use of soybean waste-hydrolysate medium in mycology. Part 4: Its use in routine cultures. KÜKEM Derg 1985; 8: 17. 32. Kwon-Chung KJ, Bennett JE. Epidemiologic differences between the two varieties of Cryptococcus neoformans. Am J Epidemiol 1984; 120: 123-30. 33. Bennett JE, Kwon-Chung KJ, Howard DH. Epidemiological differences among serotypes of Cryptococcus neoformans. Am J Epidemiol 1977; 105: 582-6. 34. Dromer F, Gueho E, Ronin O, Dupont B. Serotyping of Cryptococcus neoformans by using a monoclonal antibody specific for capsular polysaccharide. J Clin Microbiol 1993; 31: 359-63. 35. Rozenbaum R, Goncalves AJR, Wanke B, et al. Cryptococcus neoformans varieties as agents of cryptococcosis in Brazil. Mycopathologia 1992; 119: 133-6. 36. Criseo G, Gallo M. Serotyping of Cryptococcus neoformans isolates from environmental and clinical sources in extreme southern Italy (Calabria and Sicily, central Mediterranean area). Mycoses 1997; 40: 95-100. Cilt 22, Sayı 1, Ocak 2008 57

Karaca Derici ve Tümbay 37. Baro T, Rodriguez JMT, Morera Y, Alia C, Lopez O, Mendez R. Serotyping of Cryptococcus neoformans isolates from clinical and environmental sources in Spain. J Clin Microbiol 1999; 37: 1170-2. 38. Tortorano AM, Viviani MA, Rigoni AL, Cogliati M, Roverselli A, Pagano A. Prevalence of serotype D in Cryptococcus neoformans isolates from HIV positive and HIV negative patients in Italy. Mycoses 1997; 40: 297-302. 39. Hironaga M, Ikeda R, Fukazawa Y, Wanatabe S. Mating types and serotyping of Cryptococcus neoformans isolates in Japan. Sabouraudia 1983; 21: 73-8 40. Ansheng Li, Nishimuro K, Taguchi H, Tanaka R, Shaoxi Wu, Miyaji M. The isolation of Cryptococcus neoformans from pigeon droppings and serotyping of naturally and clinically sourced isolates in China. Mycopathologia 1993; 124: 1-5. 41. Padhye AA, Chakrabarti A, Chander J, Kaufman L. Cryptococcus neoformans var. gattii in India. J Med Vet Mycol 1993; 31: 165-8. 42. Ming-Long Hsu M, Chang JC, Yokoyama K, Nishimura K, Miyaji M. Serotypes and mating types of clinical strains of Cryptococcus neoformans isolated in Taiwan. Mycopathologia 1994; 125:77-81. 43. Pfeiffer TJ, Ellis DH. Serotypes of Australian environmental and clinical isolates of Cryptococcus neoformans. J Med Vet Mycol 1992; 30: 407-8. 44. Ergin C, Ilkit M, Hilmioglu S, et al. The first isolation of Cryptococcus neoformans from Eucalyptus trees in South Agean and Mediterranean Regions of Anatolia in Turkey despite Taurus Mountains alkalinity. Mycopathologia 2004;158:43-7. İLETİŞİM Dr. Yaşar KARACA DERİCİ 156 sok. No: 5/13 Bornova, İZMİR e-posta: yeserka@hotmail.com 58 İnfeksiyon Dergisi (Turkish Journal of Infection)