AKADEMİK ÖZGEÇMİŞ VE YAYIN LİSTESİ 1. Adı Soyadı : Haydar ÖZKAN İletişim Bilgileri Adres : Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi Telefon : (0212) 521 81 00 Mail : hozkan@fsm.edu.tr 2. Doğum - Tarihi : 1979 3. Unvanı : Yrd. Doç. Dr. 4. Öğrenim Durumu : Doktora 5. Yabancı dil : 91.25 (2008 UDS) Derece Alan Üniversite Yıl Lisans Elektrik Fırat Üniversitesi 1996-2000 Bölüm 1. si Fakülte 2. si Yüksek Lisans Elektrik Marmara Üniversitesi 2001-2004 Doktora Elektronik ve Bilgisayar Bilimleri Sakarya Üniversitesi 2006-2011 Post-doc Elektrik Mühendisliği University of California, Los Angeles ABD 2014-2015
6. Akademik Unvanlar: Derece Alan Üniversite Yıl Yardımcı Doçent Doçent Profesör Biyomedikal Mühendisliği Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi 2012-7. Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri : 6.1- Yüksek Lisans Tezleri Osman Semih Kayhan Hızlı hastalık teşhis testlerinin bilgisayar tabanlı otomatik okunması ve hekimlerin e-rapor ile bilgilendirilmesi İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2016 (Eş danışman) 6.2- Doktora Tezleri 8. Yayınlar : 8.1- Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler 1. ATES, M., ULUDAG, N., GURKAN, Y.Y., OZKAN, H., MERAL, K., Supercapacitor testing of Poly(3,6-bis(2,3-dihydrothieno[3,4-b][1,4]dioxin-5-yl)-9-tosyl-9Hcarbazole)/Graphene oxide-fe3o4 and Modelling (Submitted) 2. OZKAN, H., TULUM, G., OSMAN, O., ŞAHİN, S., Automatic detection of pulmonary embolism in CTA images using machine learning Elektronika ir Elektrotechnika (Accepted) 3. OZKAN, H., A Comparison of Classification Methods for Telediagnosis of Parkinson s Disease, Entropy, 18, 115, 2016. doi:10.3390/e18040115 4. OZKAN, H., and KAYHAN, O.S., A Novel Automatic Rapid Diagnostic Test Reader Platform, Computational and Mathematical Methods in Medicine, vol. 2016, Article ID 7498217, 1-10, 2016. doi:10.1155/2016/7498217 5. ATES, M., KAMER, L., OZKAN, H., Comparative analysis of poly (N-methylpyrrole) and its titanium dioxide nanocomposite film formations against equivalent electrical circuit model for the their corrosion-inhibition effects, High Performance Polymers, vol. 28, no. 1, 75-84, 2016. doi: 10.1177/0954008315571682 6. BERG, B., CORTAZAR, B., TSENG, D., OZKAN, H., FENG, S., WEI, Q., CHAN, R., BURBANO, J., FAROOQUI, Q., LEWINSKI, M., CARLO, D.D., GARNER, O.B., and OZCAN, A., Cellphone-Based Hand-Held Micro-Plate Reader for Point-of-Care Testing of Enzyme-Linked Immunosorbent Assays, ACS Nano, 9 (8), pp 7857 7866, 2015. doi: 10.1021/acsnano.5b03203
7. WEI, Q., LUO, W.,HIANG, S., KAPPEL, T., MEJIA, C., TSENG, D., CHAN, R.Y.L., YAN, E., QI, H., SHABBIR, F., OZKAN, H., FENG, S and OZCAN A., Imaging and Sizing of Single DNA Molecules on a Mobile Phone, ACS Nano, 8 (12), pp 12725 12733, 2014. doi: 10.1021/nn505821y 8. OZKAN, H., OSMAN, O., ŞAHİN, S., BOZ, A.F., A Novel method for pulmonary embolism detection in CTA images Computer Methods and Programs in Biomedicine, 113, pp. 757-766, 2014. doi: http://dx.doi.org/10.1016/j.cmpb.2013.12.014 9. OZKAN, H., 3D Lung vessel segmentation in computed tomography angiography images Istanbul University Journal of Electrical & Electronics Engineering, IUJEEE Vol. 12(1), 1437-1443, 2012. 8.2- Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceeding) basılan bildiriler. 1. B. Berg, B. Cortazar, D. Tseng, H. Ozkan, S. Feng, Q. Wei, R. Y. Chan, J. Burbano, Q. Farooqui, M. Lewinski, D. Di Carlo, O. B. Garner, and A. Ozcan, Cellphone-based hand-held microplate reader for point-of-care ELISA testing (Conference Presentation). Proc. SPIE 9699, Optics and Biophotonics in Low-Resource Settings II, 969905 (May 3, 2016); doi:10.1117/12.2209125. 2. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, N. Nguyen, D. Tseng, R. Y. L. Chan, E. Yan, H. Qi, F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, Single DNA imaging and length quantification through a mobile phone microscope Proc. SPIE 9699, Optics and Biophotonics in Low-Resource Settings II, 969903 (March 7, 2016); doi:10.1117/12.2208836. 3. B. Berg, B. Cortazar, D. Tseng, H. Ozkan, S. Feng, Q. Wei, R. Y. Chan, J. Burbano, Q. Farooqui, M. Lewinski, D. Di Carlo, O. B. Garner, and A. Ozcan, "A Smartphone-based Microplate Reader for Point-of-Care ELISA Quantification," in Conference on Lasers and Electro-Optics, OSA Technical Digest (online) (Optical Society of America, 2016), paper ATu1O.4. 4. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, N. Nguyen, D. Tseng, R. Y. L. Chan, E. Yan, H. Qi, F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, Field-Portable Smartphone Microscopy Platform for Wide-field Imaging and Sizing of Single DNA molecules CLEO: Applications and Technology, Optical Society of America 2015. 5. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, N. Nguyen, D. Tseng, R. Y. L. Chan, E. Yan, H. Qi, F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, "3D Printed Microscopy on a Mobile-phone for Imaging and Sizing of Single DNA Molecules," 16th Annual UC Systemwide Bioengineering Symposium, June 22-24, 2015, University of California, Santa Cruz, CA, USA 6. A. Feizi, A. Greenbaum, Y. Chan, B. Berg, Y. Zhang, H. Ozkan, P. Chung, M. Wu, and A. Ozcan, "Portable and Cost-effective Cell Viability Analysis Using Lensfree On-Chip Imaging," 16th Annual UC Systemwide Bioengineering Symposium, June 22-24, 2015, University of California, Santa Cruz, CA, USA 7. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, D. Tseng, R. Yan Lok Chan, E. Yan, H. Qi, F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, Mobile-Phone Based Microscopy for
Imaging and Sizing of Single DNA Molecules, BMES (Biomedical Engineering Society) Annual Meeting, (October 7-10, 2015), Tampa, Florida, USA 8. Q. Wei, W. Luo, S. Chiang, T. Kappel, C. Mejia, D. Tseng, R. Y. L. Chan, E. Yan, H. Qi, F. Shabbir, H. Ozkan, S. Feng, and A. Ozcan, "Mobile Phone based Microscopy for Imaging and Sizing of Single DNA Molecules," ACS National Meeting, March 22-16, 2015, Denver, Colorado, USA 9. H.Ozkan, O. Osman, S. Şahin, Computer Aided Detection of Pulmonary Embolism in Computer Tomography Angiography Images, IEEE Conference on Electronics, Computer and Computation (ICECCO 13), 359-362 November 7-8, 2013, Ankara DOI: http://dx.doi.org/10.1109/icecco.2013.6718301 10. H.Ozkan, Segmental and Subsegmental Lung Vessel Segmentation in CTA Images, World Academy of science Engineering end Technology (ICBCBBE 2012), 65, 153-155, May 13-14, 2012, Amsterdam. 11. H.Ozkan, Segmentation of Ascending and Descending Aorta in CTA Images, World Academy of science Engineering end Technology (ICBCBBE 2012), 65, 451-453 May 13-14, 2012, Amsterdam. 12. H. Ozkan, O. Osman, S. Şahin, M. M. Atasoy, H. Barutca, A. F. Boz., A. Olsun, Lung Segmentation Algorithm for CAD System in CTA Images World Academy of science Engineering end Technology (ICBCBBE 2011), 77, 306-309, July 24-26, 2011, Paris 8.3- Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler 1. H. Ozkan, N.F. Serteller, SCADA Sistemlerinin Eğitim amaçlı kullanılması 3e Electrotech dergisi, 10, 102-105 Ekim 2006 8.4- Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan bildiri kitabında basılan bildiriler 1. H. Ozkan, O. S. Kayhan, " Adeno-Rota Virüs Testlerinin Tablet Bilgisayar Aracılığıyla Sonuçlandırılması" Electric Electronics, Computer Science, Biomedical Engineerings Meeting (EBBT), Istanbul, Turkey,, pp. 1-3, 2016. doi: 10.1109/EBBT.2016.7483695 2. H. Ozkan, O. S. Kayhan, "Bilgisayar Tabanlı Otomatik Adeno-Rota Virüs Hızlı Hastalık Teşhis Testlerinin Sonuçlandırılması", 1. Ulusal Biyomedikal Cihaz Tasarımı ve Üretimi Sempozyumu (UBİCTÜS 2016), Istanbul, Turkiye, 2016. 3. H. Ozkan, T. Ergin, O. Osman, Ö. Dandin, U. Teomete, G Tulum Travmatik Dalak Yaralanmalarının Tespitinde Tele-Tıp Uygulaması, TIPTEKNO 2015, 130-133, Bodrum, Ekim, 2015. 4. H.Ozkan, G. Tulum, O. Osman, S. Şahin, Pulmoner Emboli Veri Setinde Özellik İndirgeme, TIPTEKNO 2014, 198-201, Kapadokya, Eylül, 2014. 5. H.Ozkan, G. Tulum, O. Osman, S. Şahin, BTA Görüntülerinde YSA ile Pulmoner Emboli Tespiti, TIPTEKNO 2013, 13, 195-198, Antalya, Kasım 2013.
6. H.Ozkan, O. Osman, S. Şahin, Bilgisayarlı Tomografi Anjiyografi Görüntülerinde Pulmoner Emboli Tespiti, TIPTEKNO 2012, 12, 49-53, Antalya, Kasım 2012. 7. H. Ozkan, O. Osman, S. Şahin, M. M. Atasoy, H. Barutca, A. F. Boz., A. Olsun, Bilgisayarlı Tomografi Anjiyografi Görüntülerinde Akciğer Damarlarının Bölütlenmesi, BİYOMUT, TIPTEKNO 2011, 11, 373-377, Antalya, Ekim 2011. 8. H. Ozkan, O. Osman, S. Şahin, M. M. Atasoy, H. Barutca, A. F. Boz., A. Olsun Bilgisayarlı Tomografi Anjiyografi Görüntülerinde Pulmoner Arter, Segment ve Subsegmentlerin Bölütlenmesi, TIPTEKNO 2010, 10, 112-117,Antalya, Ekim 2010. 9. Yurtdışı Görevlendirmeler 1. 14-26 Mart 2010 tarihleri arasında İngiltere nin başkenti Londra da bulunan University of Greenwich de Erasmus Öğretim Üyesi Hareketliliği kapsamında, araştırma ve incelemelerde bulunulmuştur. 10. İdari Görevler : Sıra Görev Görevin Başlama ve Bitiş tarihi 1 Biyomedikal Mühendisliği bölüm başkan 2015 - Halen yardımcılığı 2 3 4 5 11. Ödüller : TUBİTAK, doktora sonrası araştırma bursu: University of California, Los Angeles, Elektrik Mühendisliği bölümü, Los Angeles, California, ABD 12. Son iki yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeyindeki dersler : Akademik yıl 2012-2013 2015-2016 Dönem Dersin Adı Haftalık Saati Öğrenci Teorik Uygulama Sayısı Güz Lineer Cebir 3 0 20 Bahar Lineer Cebir 3 0 47 Matematik II 3 2 25 Devre analizi 2 2 28 Güz Introduction to Biomedical Engineering 2 0 26 Biyomedikal Sinyaller ve Sistemler 2 1 19 Medikal Mühendislik Uygulamaları 1 2 20 Devre analizi 2 2 25 Bahar Biomedical signal processing 2 2 19 Sayısal Sistemler 2 2 25