ÖZGEÇMİŞ 1. Adı Soyadı : Mehmet Demirci İletişim Bilgileri Adres Mail :Adnan Kahveci Mah. Sayaca Cad. Seyran Sok. No.3 İmka Royal Sitesi C Blok Daire 19 - Beylikdüzü - İSTANBUL : mehmetdemirci@beykent.edu.tr 2. Doğum Tarihi : 23 / 07 / 1979 3. Unvanı : Tıbbi Mikrobiyoloji Doktoru 4. Öğrenim Durumu : Doktora (Ph.D.) Derece Alan Üniversite Yıl Lisans Tıbbi Biyolojik Bilimler İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Bölümü Fakültesi 2000 İstanbul Üniversitesi Sağlık Yüksek Lisans Tıbbi Mikrobiyoloji Bilimleri Enstitüsü Cerrahpaşa Tıp 2003 Fakültesi Doktora Tıbbi Mikrobiyoloji İstanbul Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Cerrahpaşa Tıp Fakültesi 2015 5. Akademik Unvanlar İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fak. Tıbbi Mikrobiyoloji ABD Araştırma Görevlisi 2001-2003 6. Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri 6.1. Yüksek Lisans Tezleri 6.2. Doktora Tezleri 7. Yayınlar 7.1. Uluslar arası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler I. Original (Research) Articles (Özgün araştırma, makale, derleme) 1. Bahar H, Torun MM, Demirci M, Kocazeybek B. 2005. Antimicrobial resistance and β- lactamase production of clinical isolates of Prevotella and Porphyromonas species. Chemotherapy, 51,9-14. doi: 10.1159/000084017
2. Torun MM, Namal N, Demirci M, Bahar H, Kocazeybek B. 2007. Pharyngeal carriage and antimicrobial resistance of Haemophilus influenzae in nontype- b-vaccinated healthy children attending day care centers in Turkey. Chemotherapy. 53(2):114-7.doi: 10.1159/000099982 3. Arvas A,Gur E, Bahar H, Torun MM, Demirci M, Aslan M, Kocazeybek B. 2008. Haemophilus influenzae type b antibodies in vaccinated and non-vaccinated children. Pediatrics International. 50(4), 469-473 (2008). doi: 10.1111/j.1442-200X.2008.02591.x. 4. Akay HK, Bahar Tokman H, Hatipoglu N, Hatipoglu H, Siraneci R, Demirci M, Borsa BA, Yuksel P, Karakullukcu A, Kangabaa AA, Sirekbasan S, Aka S, Torun MM, Kocazeybek BS. 2014. The relationship between bifidobacteria and allergic asthma and/or allergic dermatitis: A prospective study of 0 3 years-old children in Turkey. Anaerobe (2014);28: 98-103. doi: 10.1016/j.anaerobe.2014.05.006 5. Tokman HB, Iskeleli G, Gungordu Dalar Z, Kangaba AA, Demirci M, Akay HK, Borsa BA, Çalışkan RA, Kocazeybek BS, Torun MM, Kiraz N. 2014. Prevalence and Antimicrobial Susceptibilities of Anaerobic Bacteria Isolated from Perforated Corneal Ulcers by Culture and Multiplex PCR: An Evaluation in Cases with Keratitis and Endophthalmitis. Clin.Lab.2014;60:1879-1886. doi: 10.7754/Clin.Lab.2014.131113 6. Caliskan R, Tokman HB, Erzin Y, Saribas S, Yuksel P, Bolek BK, Sevuk EO, Demirci M, Yılmazli O, Akgul O, Kalayci F, Cakan H, Salih B, Bal K, Kocazeybek B. 2015. Antimicrobial resistance of Helicobacter pylori strains to five antibiotics, including levofloxacin, in Northwestern Turkey. Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical 05/2015; 48(3):278-84. doi:10.1590/0037-8682-0027-2015. 7. Çakan H, Güven K, Çevik FE, Demirci M, Saribas S. 2015. Investigation of human DNA profiles in house dust mites: Implications in forensic acarology. Romanian Journal of Legal Medicine 09/2015; 23:187-192. doi: 10.4323/rjlm.2015.187 8. Ormeci AC, Akyuz F, Baran B, Soyer OM, Gokturk S, Onel M, Onel D, Agacfidan A, Demirci M, Yegen G, Gulluoglu M, Karaca C, Demir K, Besisik F, Kaymakoglu S. 2016. Steroid-refractory inflammatory bowel disease is a risk factor for CMV infection. Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2016 Mar;20(5):858-65. 9. Köksal MO, Beka H, Demirci M, Kadioglu A, Agacfidan A, Akgül B. 2016. Prevalence and genotyping of Chlamydia trachomatis in symptomatic male patients from Istanbul, Turkey. SpringerPlus. 2016;5(1):1706. doi:10.1186/s40064-016-3370-3. 10. Altun SK, Yiğin A, Gürbilek SE, Gürbüz S, Demirci M, Keskin O, Tel OY, 2017. An enzyme-linked immunosorbent assay for brucella specific antibody and real-time PCR for detecting Brucella Spp. in milk and cheese in Şanliurfa, Turkey. Pak Vet J, 37(1): 39-42. 11. Demirci M, Tombul F, Yiğin A, Altun SK, 2017. Investigation of Staphylococcus aureus enterotoxins A to E via real-time PCR from various food samples in Turkey. Pak Vet J, 37(1): 100-104. 12. Altun SK, Yiğin A, Demirci M, Daş A, Aydın SS. 2017. Detection of Listeria monocytogenes and Brucella spp. in a Turkish home-made çeçil cheese by real-time PCR. Res. J. Biotech, 12 (1) 78-83. II. Letters to editor, Technical note, Case reports or Short communication articles (Editöre mektup, teknik not ve sağlık bilimlerinde vaka takdimi)
1. Torun MM, Bahar H, Demirci M, Altaş K, Bağdatlı Y, Kocazeybek B, Kapi M., Hiramatsu K. Two heterogeneously vancomycin-intermediate clinical isolates of methicillin-sensitive and methicillin-resistant Staphylococcus aureus in a Turkish university hospital: brief report of a surveillance study. Int J Antimicrob Agents. Dec;26(6):508-10 (2005).doi: 10.1016/j.ijantimicag.2005.09.001 2. Torun M M, Namal N, Demirci M, Bahar H. Nasopharyngeal Carriage and Antibiotic Resistance of Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae and Moraxella catarrhalis,in healthy school children in Turkey. Indian J of Med Microbiol. 27(1):86-88 (2009) 3. Torun MM, Tokman HB, Demirci M, Ozdemir S, Altinkum SM, Cilingir H, Saglam FY. Haemophilus influenzae Infections with Abscess Formation in Adults: a Retrospective Study Covering an Eleven-Year Period. Clin lab. Vol 61. 07/2015. 7.2. Uluslar arası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceeding) basılan bildiriler. 1. Mamal Torun M., Demirci M, Bahar H. Nasopharyngeal Carriage and Antimicrobial Susceptibility of Streptococcus pneumoniae in Healthy Turkish Children, 5th European Congres of Chemotherapy and Infection, Abstract Book, 84, Rhodes,2003. 2. Mamal Torun M., Demirci M, Bahar H. Antimicrobial Susceptibilities of Nasopharyngeal H. influenzae Strains Isolated From Healthy Turkish Children, 5th European Congres of Chemotherapy and Infection, Abstract Book, 84,Rhodes,2003. 3. Bahar H., Mamal Torun M., Demirci M. Antimicrobial Resistance of Prevotella and Porphyromonas strains Isolated from Clinical Samples of Turkish Patients, 5th European Congres of Chemotherapy ans Infection, Abstract Book, 113, Rhodes, 2003. 4. Demirci M., Bahar H., Mamal Torun M. Antimicrobial Susceptibilities of Nosocomial Methicillin Resistant Staphylococcus aureus, 3rd Balkan Conference of Microbiology, Abstract Book 533, İstanbul, 2003. 5. Mamal Torun M., Yanık S, Bahar H.,Demirci M. Beta- lactamase Activity and Antimicrobial Resistance of Gram Negative Rods Isolated from Clinical Samples of Turkish Patients, 5th European Congres of Chemotherapy and Infection, Abstract Book, 89, Rhodes, 2003. 6. Mamal Torun M.,BaharH., Demirci M. Antimicrobial Resistance of Anaerobic Cocci Isolated from Clinical Samples of Turkish Patients, 5th European Congres of Chemotherapy and Infection, Abstract Book, 110, Rhodes, 2003. 7. Bahar H., Hatemi G,Mamal Torun M, Demirci M., Yazıcı H,Altaş K. Erytromycin, Clindamycin and Tetracycline Resistance of Propionibacteriumspecies Isolated From Skin Lesions of Turkish Patients with Behçet s Syndrome, 5th European Congres of Chemotherapy and Infection,Abstract Book, 85, Rhodes, 2003. 8. Bahar H, Iskeleli G, Gungordu Z, Borsa B.A, Demirci M, Kocazeybek B, Kiraz N, Mamal Torun M. Bacteriologic evaluation of contact lens storage cases: determination of bacterial contamination according to their usage form. P966, ECCMID 2013, 27 30 April Berlin, Germany. 2013 9. Bahar H, Develioglu ON., Ipek HD, Ozdemir S, Guven E, Borsa B.A, Demirci M, Kulekci M, Kocazeybek B, Kiraz N, Mamal Torun M. Anaerobic bacteria in adenoid core specimens of children with adenoid hypertrophy: a polymerase chain reaction (PCR)-based detection in 16 cases. R2935, Abstract Publication only, ECCMID 2013, 27-30 April Berlin, Germany. 2013 10. Kocazeybek B, Demirci M, Taner Z, Çalışkan RA, Karakullukcu A, Can K, Yuksel P, Tokman HB. The role of anaerobic bacteria in bite wound abscesses: Results of 53 young
adult patients. 16th ICID Abstracts / International Journal of Infectious Diseases 21S (2014) p.355. doi:10.1016/j.ijid.2014.03.1153 11. Demir C, Demirci M, Yigin A, BaharTokman H. Genotypic and phenotypic characterization of antimicrobial resistance in Staphyloccoccus aureus strains isolated from wound infections in Mardin, Southeastern Turkey. 17th International Congress on Infectious Diseases / International Journal of Infectious Diseases 45S (2016)p. 83. doi: 10.1016/j.ijid.2016.02.227 12. Taner Z, BaharTokman H, Velidedeoglu M, Göksoy E, Celik V, Demirci M, Dal F, Kücük Y, Mete B, Yemisen M, Vehid S, Kocazeybek B, Günaydın M, Kiraz N. Aerobic bacteria in infected breast of Turkish woman: Prevalence and antimicrobial resistance evaluated in cases with lactational mastitis, periductalmastititis and granulomatous mastitis. 17th International Congress on Infectious Diseases / International Journal of Infectious Diseases 45S (2016) p.134. doi: 10.1016/j.ijid.2016.02.330 13. Caliskan R, BaharTokman H, Nepesov S, Karakullukcu A, Demirci M, Ayaz G, Saribas S, Dinc O, Taner Z, Vehid S, Uysal HK, Bonabi E, Çokuğraş H, Kocazeybek B. The gene expression of Helicobacter pylori neutrophil-activating protein (HP-NAP), an immunomodulator in allergic asthma: The first case control study conducted in children living in Istanbul-Turkey. 17th International Congress on Infectious Diseases / International Journal of Infectious Diseases 45S (2016) p.135. doi: 10.1016/j.ijid.2016.02.332 14. Oner YA, Saribas S, Okullu SÖ, Nepesov S, Demirci M, Karakullukcu A, Uysal HK, Bonabi E, Cokugras H, Kurt Ö, Ayaz G, BaharTokman H, Kocazeybek B. Comparison of the incidence of Dientamoeba fragilis in a cohort of pediatric children with allergic asthma and controls: Is it a pathogen or protector? 17th International Congress on Infectious Diseases / International Journal of Infectious Diseases 45S (2016) p.373.doi: 10.1016/j.ijid.2016.02.802 15. Saribas S, Demirci M, Toprak S, Ozer N, Caglar E, Ortakoylu G, Yuksel P, Ayaz G, Bonabi E, Bahar Tokman H, Kiraz N, Kocazeybek B. Diagnostic performance of RTqPCR method by targeting 85B mrna in the laboratory diagnosis of Mycobacterium tuberculosis infection: A preliminary study in Turkish patients. 17th International Congress on Infectious Diseases / International Journal of Infectious Diseases 45S (2016) p.409.doi: 10.1016/j.ijid.2016.02.874 16. Kocazeybek B, Habip Z, Sohrabi P, Saribas S, Caliskan R, Demirci M, Karakullukcu A, Atalik K, Bonabi E, Yuksel P, Vehid S, Kosan E, Bahar Tokman H. In-vitro problems of screening (Anti-HCV) and confirmatory tests (RIBA) for the diagnosis of HCV infections : The relation of neopterin and scd14 with low Anti-HCV reactivity and different RIBA patterns. 17th International Congress on Infectious Diseases / International Journal of Infectious Diseases 45S (2016) p.440.doi: 10.1016/j.ijid.2016.02.935 17. Aslan S, Yoldas A, Yigin A, Demirci M, Yarimcam Saglam F. Quantitative analysis of brucellaspp in aborted bovine fetuses by real-time PCR. 17th International Congress on Infectious Diseases / International Journal of Infectious Diseases 45S (2016) p.477.doi: 10.1016/j.ijid.2016.02.1006 18. Bahar-Tokman H, Taner Z, Velidedeoglu M, Goksoy E, Celik V, Demirci M, Dal F, Kucuk Y, Mete B, Yemisen M, Kocazeybek B, Gunaydın M, Kiraz N. Prevalence and Antimicrobial Resistance of Anaerobic Bacteria in Infected Breasts of Turkish Women with Lactational Mastitis, Periductal and Granulomatous Mastitis PI-3, Poster Presentation only, Anaerobe, Nashville, 2016 19. Demirci M, Temeloglu-Keskin E, Cagatay P, Taner Z, Ozyazar M, Kocazeybek B, Kiraz N, Bahar-Tokman H. Bacteroidetes and Firmicutes Numbers in Gut Microbiota of Adult Type 1 Diabetes Patients and Healthy Turkish People: Effects on Hosts Tlr2 & Tlr4 Gene
Expression Levels. PI-26, Poster Presentation only, Anaerobe, Nashville, 2016 7.3. Yazılan Uluslar arası kitaplar veya kitaplarda bölümler. 7.4. Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler 1. Bahar H, Mamal Torun M, Demirci M, Sever N, İstanbullu A: Çocuk hastaların abse cerahatlerinden izole edilen anaerop bakteriler ve antimikrobiklere direnç durumları. ANKEM Derg, 16, 486-491,2002 2. Bahar H, Mamal Torun M, Demirci M: Yara infeksiyonlarında Anaerop Bakterilerin Dağılımı. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 33,42-46, 2003. 3. Bahar H, Demirci M, Kahraman P, Sever Sönmez N, Mamal Torun M: Çeşitli vücut sıvılarından infeksiyon etkeni olarak izole edilen anaerop bakteriler. İnfeksiyon Derg, 18,193-197,2004. 4. Mamal Torun M, Altınkum SM, Bahar H, Kocagöz S, Biçer P, Demirci M. Vankomisin dirençli Enterococcus faecium kökenlerinde genotipik ve fenotipik özelliklerin araştırılması. Türk Mikrobiol Cem Derg.35, 153-158, 2005. 5. Istanbullu Tosun A, Demirci M, Yılmaz M, Şen H, Sirekbasan L, Şaylan EG, Gökçeağaçlı C, Şengil AZ. İdrar yolu infeksiyonlarından izole edilen Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antimikrobiyal direnç oranları. ANKEM Derg 2016;30(1):1-6. doi: 10.5222/ankem.2016.001 6. Yiğin A, Demirci M, Altun SK, Yoldaş A. Şanlıurfa da Satışa Sunulan Yoğurtlarda Lactobacillus spp. lerin qpcr Miktarlarının Belirlenmesi. Etlik Vet Mikrobiyol Derg, 2016; 27 (2): 82-87 7.5. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan bildiri kitabında basılan bildiriler 1. Altınkum SM, Bahar H, Mamal Torun M, Kocagöz S, Piçer P, Demirci M: Nozokomiyal infeksiyon etkeni olarak saptanan vankomisin dirençli enterokok kökenlerinin genotipik ve fenotipik özelliklerinin değerlendirilmesi (5. Antimikrobik ve Kemoterapi Günleri kitapçığı s.163, 1-3 Nisan 2002, İstanbul) 2. Bahar H, Mamal Torun M, Demirci M, Sever N, İstanbullu A: Çocuk hastaların abse cerahatlerinden izole edilen anaerop bakteriler ve antimikrobiklere direnç durumları (5. Antimikrobik ve Kemoterapi Günleri kitapçığı s. 165, 1-3 Nisan 2002, İstanbul) 3. Bahar H, Mamal Torun M, Demirci M: Yara İnfeksiyonlarında Anaerop Bakterilerin Dağılımı. (XXX. Türk mikrobiyoloji Kongresi Kitapçığı p.03-03 s.300. 30 Eylül 5 Ekim 2002 Göynük/Kemer, Antalya) 4. Sever Sönmez N, Mamal Torun M, Demirci M, Çetinkale O, Bahar H: Yanık Yarası infeksiyonlu hastalarda üretilen Pseudomonas türlerinin antimikrobiklere direnç durumları. (XI. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi (KLİMİK) kitapçığı P- 13/28 s.349. 30 Mart 3 Nisan 2003 İstanbul) 5. Sever Sönmez N, Mamal Torun M., Demirci M, Çetinkale O, Bahar H: Yanık Yarası infeksiyonlu hastalarda üretilen Staphylococcus aureus türlerinin antimikrobiklere direnç durumları (XI. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi (KLİMİK) kitapçığı P-13/48 s. 356. 30 Mart 3 Nisan 2003 İstanbul) 6. Bahar H, Demirci M, Kahraman P, Sever Sönmez N, Mamal Torun M: Çeşitli vücut sıvılarından infeksiyon etkeni olarak izole edilen anaerop bakteriler. (XI. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Kongresi (KLİMİK) kitapçığı P-14/04 s.360. 30 Mart 3 Nisan 2003 İstanbul)
7. Aslan M, Sağlam GM, Demirci M, Sarıbaş S, Kocazeybek B, Altaş K; Hematoloji Kliniğinden Başvuran Hastalarda Varicella Zoster Virüsü (VZV) Seroprevalansının Araştırılması. Poster No.67 (1.Ulusal Viroloji Kongresi 21-25 Eylül 2003 Kuşadası, İzmir. sunulmuştur.) 8. Aslan M, Demirci M, Sağlam GM, Sarıbaş S, Kocazeybek B, Altaş K; Pediatrik Hematoloji-Onkoloji Polikliniğinden Anabilim Dalımıza Başvuran Hastalarda Parvovirüs B19 IgM, IgG Antikorlarının Dağılımı. Poster No.61 (1.Ulusal Viroloji Kongresi 21-25 Eylül 2003 Kuşadası, İzmir. sunulmuştur.) 9. Aslan M, Sağlam GM, Demirci M, Sarıbaş S, Kocazeybek B, Altaş K; İmmün Sistemi Baskılanmış Çocuklarda EBV Antikorlarının Araştırılması. Poster No.71 (1.Ulusal Viroloji Kongresi 21-25 Eylül 2003 Kuşadası, İzmir. sunulmuştur.) 10. Aslan M, Sağlam GM, Demirci M, Kocazeybek B, Altaş K; Kadın Doğum Polikliniğinden Başvuran Gebelerde Rubella IgM ve IgG Antikorlarının Araştırılması. Poster No.76 (1.Ulusal Viroloji Kongresi 21-25 Eylül 2003 Kuşadası, İzmir. sunulmuştur.) 11. Aslan M, Bilgiç V, Sağlam GM, Demirci M, Kocazeybek B, Altaş K; 1998 2003 yılları arasında Brusella öntanılı hastalarda Wright ve Rose bengal testleri ile Brusella antikorlarının araştırılması. (XIII.Ulusal Parazitoloji Kongresi kongre kitapçığı P-119 s.325, 8-12 Eylül 2003, Konya) 12. Aslan M, Sağlam GM, Demirci M, Kocazeybek B, Altaş K; Kistik Echinococcosis ön tanılı hastalarda 1996-2002 yılları arasında IHA yöntemiyle Echinococus granulosus antikorlarının varlığının araştırılması. (XIII.Ulusal Parazitoloji Kongresi kongre kitapçığı P-077 s.283, 8-12 Eylül 2003, Konya) 13. Aslan M, Demirci M, Sağlam GM, Kocazeybek B, Altaş K; Kadın doğum polikliniğinden başvuran gebelerde Toxoplasma gondii IgM ve IgG Antikorlarının Araştırılması. (XIII.Ulusal Parazitoloji Kongresi kongre kitapçığı P-052 s.258, 8-12 Eylül 2003, Konya) 14. Köksal MO, Beka H, Demirci M, Kadıoğlu A, Ağaçfidan A, Akgül B. İstanbul da Semptomatik erkek hastalarda Chlamydia trachomatis prevelansı ve genotiplendirmesi. (31. Antimikrobik ve Kemoterapi (Ankem) Kongresi 4-8 Mayıs 2016, Bodrum) 7.6 Diğer Yayınlar Yüksek Lisans Tezi : İstanbul'da çocuk yuvaları ve ilkokula giden sağlıklı çocuklarda solunum yolu patojenlerinin nazofaringeal taşıyıcılığı. (Yüksek lisans Tezi. 18.7.2003 günü savunulmuştur. Danışman: Prof.Dr.Müzeyyen Mamal Torun İ.Ü. Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Cerrahpaşa Tıp Fak. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim dalı) Doktora Tezi: Erişkin Tip 1 diyabetli ve sağlıklı kişilerin dışkı florasındaki Bacteroidetes ve Firmicutes grubu bakteri miktarının konaktaki TLR2/TLR4 gen ekspresyonları üzerine etkisi. (Doktora Tezi: 29 Aralık 2015 günü savunulmuştur. Danışman: Prof. Dr. Hrisi Bahar Tokman İ.Ü. Sağlık Bilimleri Enstitüsü Cerrahpaşa Tıp Fak. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim dalı) 8.Projeler 9.İdari Görevler 10.Bilimsel Kuruluşlara Üyelikleri Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti İmmunoloji Derneği İstanbul Bulaşıcı Hastalıklarla Savaş Derneği
11.Ödüller Sözlü Bildiri ikincilik ödülü - Köksal MO, Beka H, Demirci M, Kadıoğlu A, Ağaçfidan A, Akgül B. İstanbul da Semptomatik erkek hastalarda Chlamydia trachomatis prevelansı ve genotiplendirmesi. (31. Antimikrobik ve Kemoterapi (Ankem) Kongresi 4-8 Mayıs 2016, Bodrum) 12.Son iki yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeyindeki dersler