ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ ÖZGEÇMİŞ Adı Soyadı: Halil KURT Tel; 0 506 5783491 E-mail: halilkurt@itu.edu.tr, peziza@yahoo.com Doğum Tarihi: 28.08.1976 İngilizce: 80 (Mayıs 2015 YDS) Öğrenim Durumu: Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Lisans Biyoloji Bölümü Gazi Üniversitesi 2000 Y. Lisans Sağlık bilimleri Enst. İstanbul Üniversitesi 2005 Genetik programı Fen Bilimleri Enst. Doktora/S.Yeterlik/ Moleküler Biyoloji Tıpta Uzmanlık Genetik ve biyoteknoloji İstanbul Teknik Üniversitesi 2013 Yüksek Lisans Tez Başlığı (özeti ekte) ve Tez Danışman(lar)ı : Tez konusu: Kümen Hidroperoksitin Genotoksik Etkisinin Comet ve Micronucleus Testleri İle Karşılaştırılması, Doç.Dr. Ayhan Deviren Doktora Tezi/S.Yeterlik Çalışması/Tıpta Uzmanlık Tezi Başlığı (özeti ekte) ve Danışman(lar)ı : Amonyağı Oksitleyen Arke lerin Atıksu Arıtımındaki Rolünün Moleküler Tekniklerle Belirlenmesi, Yard.Doç.Dr. Alper Tunga Akarsubaşı Görevler: Görev Unvanı Görev Yeri Yıl Biyolog İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ABD Genetik Lab. Biyolog İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Acil Biyokimya Lab Laboratuvar ve İTÜ-MOBGAM Endüstriyel ilişkiler Lab. İstanbul Eğitim Akreditasyon No : AB-0567-T sorumlusu 2001-2007 2007-- 2011-2014 Projelerde Yaptığı Görevler : 2011-2014 Göl Kıyısı Güncel Biomineralizasyon Oluşum Alanlarının ve Göl Havzası Hidrojeokimyasal Parametrelerinin Yerinde ve Uzaktan Algılama Yöntemleriyle Değerlendirilmesi: Acıgöl, Denizli, Batı Anadolu, Türkiye ; Bursiyer, Destekleyen kuruluş: TUBİTAK 110Y255

2009-2011 Amonyağı Oksitleyen Arkelerin Atık su Arıtımındaki Varlığının Gösterilmesi ve Rolünün Diğer Nitrojen Döngüsü Mikroorganizmalarına Karşın Moleküler Tekniklerle Belirlenmesi. Araştrıcı, Destekleyen kuruluş: İTÜ Bilimsel Araştırma ve Geliştirme Destekleme Programı Projeleri 2008-2011 Anaeorobik Amonyum Oksidasyonu (Anammox) Prosesi İle Atıksulardan Biyolojik Olarak Azot Gideriminin İncelenmesi Destekleyen kuruluş: TUBİTAK 108Y120 2008-2011 Amonyağı Oksitleyen Arke lerin Atıksu Arıtımındaki Rolünün Moleküler Tekniklerle Belirlenmesi ; doktora tez çalışması Destekleyen kuruluş: TUBİTAK 1001 (107T680) ESERLER A1. Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler : A1. Seval Sözen, Ilke Pala-Ozkok, Merve Aysel, Senem Teksoy-Basaran, Alper Akarsubası, Ipek Ergal, Halil Kurt, Emine Ubay-Çokgör, Derin Orhon. Performance and microbial behavior of submerged membrane bioreactor at extremely low sludge ages. Desalination and Water Treatment. 2014 http://dx.doi.org/10.1080/19443994.2014.941016 A2. Nurullah Uykun, İpek Ergal, Halil Kurt, Argun T Gökçeören, İkilem Göcek, Burçak K Kayaoğlu, Alper T Akarsubaşı, A Sezai Sarac. Electrospun antibacterial nanofibrous polyvinylpyrrolidone/cetyltrimethylammonium bromide membranes for biomedical applications Journal of Bioactive and Compatible Polymers: Biomedical Applications 2014 vol 29: 382-397 A3. S. Sözen, E.U. Çokgör, S. Teksoy Başaran, M. Aysel, A. Akarsubaş ı, I. Ergal, H. Kurt, I. Pala-Ozkok, D. Orhon. Effect of high loading on substrate utilization kinetics and microbial community structure in super fast submerged membrane bioreactor, Bioresource Technology Volume 159, May 2014, Pages 118 127 A4. S. Teksoy Başaran, M. Aysel, H. Kurt, İ. Ergal, A. Akarsubaşı, N. Yağcı, S. Doğruel, E. Ubay Çokgör, B. Keskinler, S. Sözen, D. Orhon. Kinetic characterization of acetate utilization and response of microbial population in super fast membrane bioreactor. Journal of Membrane Science Volume 455, 1 April 2014, Pages 392 404 A5. Murat Budakoğlu, Halil Kurt, Muhittin Karaman, Mert Kumru, Mustafa Kumral, Alper Tunga Akarsubaşı. Archaeal Microbial Diversity of Hypersaline Lake Acıgöl, Denizli, Turkey Geomicrobiology Journal (2014) 31, 454 460 A6. S. Teksoy Başaran, M. Aysel, H. Kurt, İ. Ergal, M. Kumru, A. Akarsubaşı, S. Sözen, D. Orhon. Removal of readily biodegradable substrate in super fast membrane bioreactor. Journal of Membrane Science Volumes 423 424, 15 December 2012, Pages 477 486 B. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler :

B1. Ipek Ergal, Neslihan Semerci, Bilge Alpaslan Kocamemi, Halil Kurt, Alper Tunga Akarsubasi Quantitative analysis of Candidatus Accumilibacter phosphatis on lab scale denitrifying phosphorus removal sequencing batch reactors ISME15-15th International Symposium on Microbial Ecology THE POWER OF THE SMALL 24-29 August 2014, Seul, South-Korea B2. S. Teksoy Başaran, M. Aysel, H. Kurt, İ. Ergal, A. Akarsubaşı, N. Yağcı, S. Sözen, D. Orhon (2013) Towards a Novel Biological Wastewater Treatment Concept Fate of Acetate in Superfast Membrane Bioreactor. IWA (International Water Association) 2nd Water Research Conference, January 20-23, 2013, Singapore. B3. Halil Kurt, Aslıhan Demircan, Mert Kumru, Alper Tunga Akarsubaşı Microbial community dynamics of İSTAÇ landfill leachate wastewater treatment plant in İstanbul, Turkey. ISME14-14th International Symposium on Microbial Ecology THE POWER OF THE SMALL 19-24 August 2012, Copenhagen, Denmark B4. Halil Kurt, Özgür melih Çelik, Mert Kumru, Alper Tunga Akarsubaşı The existence of ammonia-oxidizing archaea in wastewater treatment plants. ISME14-14th International Symposium on Microbial Ecology THE POWER OF THE SMALL 19-24 August 2012, Copenhagen, Denmark B5. Mehmet Sefa Ulutas*, Meltem Tatlı, Mert Kumru, Halil Kurt, Salih Süha Akan, Hakan Bermek, Alper Tunga Akarsubaşı Characterization and evolution of microbial communities in olive mill wastewater degrading microbial fuel cells. ISME14-14th International Symposium on Microbial Ecology THE POWER OF THE SMALL 19-24 August 2012, Copenhagen, Denmark B6. Ipek Ergal*, Mert Kumru, Halil Kurt, Senem Teksoy Başaran, Seval Sözen, Derin Orhon, Alper Tunga Akarsubaşı Effects of extremely short sludge retention time and short hydraulic retention time on microbial community in an external membrane bioreactor. ISME14-14th International Symposium on Microbial Ecology THE POWER OF THE SMALL 19-24 August 2012, Copenhagen, Denmark B7. Elif Esen, Duygu Dityapak, Halil Kurt, Mert Kumru, Bilge Alpaslan Kocamemi, Neslihan Semerci, Alper Tunga Akarsubaşı Molecular characterization of partial nitrification followed by anammox process. ISME14-14th International Symposium on Microbial Ecology THE POWER OF THE SMALL 19-24 August 2012, Copenhagen, Denmark B8. Budakoglu, M., Karaman, M., Karabel, S.B., Geredeli, S.G., Bülbül,A., Kurt, H., Uzasci, S., Kan, A., Akay, A.K., Yilmaz, F.R., Gumus, L., Civas,M., Sevis, C., Kumral, M.,2012, Recent sediment geochemistry of an alkaline lake: Lake Acigol (Denizli), SW Anatolia Turkey, EGU General Assembly, Vol.14, EGU2012-5151-4, 22-27 April,Vienna,Austria B9. Ulutaş, M.S., Kumru, M. Kurt, H., Akarsubaşı A.T., 2011. Characterization Microbial Communities In Olive Oil Wastewater Degrading Microbial Fuel Cells. [Poster, 2011 ICEST International Conference on Enzyme Science and Technology (İzmir/Turkey)]. B10. Budakoglu M., Kumru M., Kurt H., Karaman M., Kular A., Esen E., Akarsubasi A.T. "Halophilic Mcrobial Diversity of Alkaline Soda Lake Acigöl" Turkey. 20th International Symposium on Environmental Biogeochemistry, ISEB 2011, Istanbul, Turkey, 2011 B11. Budakoglu M., Karaman M., Kumral M., Akarsubasi A.T., Bulbul A., Kurt H., Kumru M., Karabel S.B. " Recent Sulfur Cycle of Lake Acıgöl (Denizli) Basin, SW Turkey". 20th International Symposium on Environmental Biogeochemistry, ISEB 2011, Istanbul, Turkey, 2011

B12. Akarsubasi A.T., Kurt H., Kumru M., Kular A., Esen E., Karaman M, Budakoğlu M. "Bacterial Diversity of Hypersaline Soda Lake Acigöl Turkey" 20th International Symposium on Environmental Biogeochemistry, ISEB 2011, Istanbul, Turkey B13. Çelik M.Ö., Kurt H., Kumru M., Akarsubasi A.T. "Screening of Ammonia-oxidazing Archaea Abundance in Domestic and Industrial Wastewater Treatent Plants" 13th internatioanl symposium on microbial ecology, ISME13 Seattle, WA,USA, 2010 B14. Cirakoglu A, Tarkan-Argüden Y, Yilmaz S, Kuru D, Deviren A, Guven GS, Pasalioglu E, Gürsel IM, Eren S, Arpag S, Aydogdu F, Birinci N, Kurt H, Hacihanefioglu S.Structural chromosome abnormalities in couples with recurrent fetal losses. 6th European Cytogenetic Conference (6th ECC). 7-10 July 2007, Istanbul, Turkey. B15. Ayhan Deviren, Halil Kurt, lhan Onaran, Mehmet Güven, Gonul Kanigur, Seniha. Hacıhanefioğlu Assesment of hydroperoxides induced DNA damage by the comet assay and the micronucleus test. 2006 international forensic science symposium, Abb. Book. P234 B16. S. Yilmaz, Y.T. Arguden, A. Çırakoğlu, D. Kuru, G. Güven, H. Kurt, N. Birinci, A. Çınar, I. Öngören, Ü. Üre, I.İ. Güner A. Deviren, S. Hacıhanefioğlu Cytogenetic finding of adult ALL cases XXXth word congress of the international society of hematology Istanbul, Turkey, T. Journal of Haemotology, Suppl:22 Abs 413, p181-182, 2005. B17. S. Yilmaz, Y.T. Arguden, A. Çırakoğlu, A. Deviren, D. Kuru, G. Güven, E.Y.Fenerci, H. Kurt, A.Yüksel, S. Hacıhanefioğlu: A case with partial trisomy 7p and monosomy 9p choromosome Cromosome Research, Vol 12 (Supl 1) PO:08:77, p145, 2004 C. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler : C1. Bilge Alpaslan Kocamemi, Duygu Dityapak, Neslihan Semerci, Cansu Tepe, Birgül Bilgin, Halil Kurt, Mert Kumru, Alper Tunga Akarsubaşı Türkiye deki bir evsel atıksu arıtma tesisinden alınan aktif çamur ile Anaeorobik Amonyum Oksidasyon (ANAMMOX) prosesinin işletmeye alınması. Türkiye'de Çevre Kirlenmesi Öncelikleri Sempozyumu VII 22-23 KASIM 2012. Kocaeli, Türkiye C2. Şükriye Yılmaz, Ayşe Çırakoğlu, Başak Aslaneli, Emre Eşkazan, Dilhan Kuru, Cem Ar, Yelda Tarkan-Argüden, Şeniz Öngören, Sibel Penbe Yentür, Halil Kurt, Nazlı Birinci, Gülgün Güven, Aslı Silahtaroğlu, Ayhan Deviren, Zafer Başlar, Teoman Soysal, Burhan Ferhanoğlu, Yıldız Aydın, Seniha Hacıhanefioğlu, Asım Cenani. Hematolojik Kanserlerde Sitogenetik Çalışmalar.9. Ulusal Tıbbi Genetik Kongresi 1-5 Aralık 2010 İstanbul C3. Ş.Yılmaz, Y.Tarkan-Argüden, D.Kuru, A.Çırakoğlu, G.S.Güven, H.Kurt, N.Birinci, İ.Bayazıt, İ.M.Gürsel, S.Eren, S.Arpağ, F.Aydoğdu, E.Paşalioğlu, M.Seven, A.Deviren, S.Hacıhanefioğlu.Turner Sendromu tanısıyla başvuran hastalarda gözlenen sitogenetik bulgular. X. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, Antalya, 2007 C4. Halil Kurt, Ayhan Deviren Kümen Hidroperoksitin Genotoksik Etkisinin Komet ve Mikronükleus Testleri ile Karşılaştırılması. X. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, Antalya, 2007 C5. Y.T. Arguden, D. Kuru, A. Çırakoğlu, A. Deviren, S. Yilmaz, G. Güven, A. Çınar, S. Yentür, A. Eğriboz, A.R. Beşer, H. Kurt, A. Silahtaroğlu, S. Hacıhanefioğlu İ.Ü. Getam

sitogenetik laboratuvarında 1994-2001 yıllarında çalışılan hematolojik kanser örnekleri. Turkish J Heamatology, suppl, 19(3), Bild. Özet. 202 sy:120, 2002 C6. D.Kuru, A.Çırakoğlu, Ş.Yılmaz, G.S.Güven, Y.Tarkan-Argüden, H.Kurt, Ş.Öngören, Z.Başlar, A.Deviren, S.Hacıhanefioğlu. Varyant Philadelphia Kromozom C u Gözlenen kronik Myeloid Lösemi Olguları VII.Ulusal Pretanal Tanı ve Tıbbi Genetik Kongresi, Kayseri, 2006 C7. Y.T. Arguden, D. Kuru, A. Çırakoğlu, A. Deviren, S. Yilmaz, G. Güven, A. Çınar, S. Yentür, A. Eğriboz, A.R. Beşer, H. Kurt, A. Silahtaroğlu, S. Hacıhanefioğlu İ.Ü. Getam sitogenetik laboratuvarında 1994-2001 yıllarında çalışılan hematolojik kanser örnekleri. V. Ulusal Prenatal Tanı ve Tıbbi Genetik Kongresi, 9-12 Ekim Konya, Özet Ktabı, PS 64, sy:148, 2002 D. Kurslar: D1. GenSTAT: moleküler genetikte istatistik yaklaşımlar, 12-17 Nisan 2013 D2.Strengthening The Quality Infrastructure in Turkey Project, Training for Istanbul Teknik University on ISO17025 5 March 2012 D3. Strengthening The Quality Infrastructure in Turkey Project, Training for Istanbul Teknik University on ISO17025, Method validation Validation 6 March 2012 D4. Strengthening The Quality Infrastructure in Turkey Project, Training for Istanbul Teknik University on ISO17025, Internal Quality control (IQC) 7 March 2012 D5. Strengthening The Quality Infrastructure in Turkey Project, Training for Istanbul Teknik University on ISO17025 Measurement Uncertainty 8-9 March 2012 D6. TS EN ISO/IEC 17025:2010 Temel ve Dokümantasyon Eğitimi 25.02.2011 D7. Kalibrasyon Temel Eğitimi ve Cam Malzeme Kalibrasyonu Eğitimi 04.05.2011 D8. Ölçüm Belirsizliği ve Metod Validasyonu Eğitimi 05.07.2011 D9. TS EN ISO 19011:2011 İç Tetkikçi Eğitimi 22.03.2012 Proteomik Araştırma Temel bilgiler ve Uygulama Örnekleri Eğitimi 10-11.12.2009 D10. HIBIT 08 International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, Turkey 18-20 April 2008 D11. European school of genetic medicine Hibrit kursu Integration of Cytogenetics, Microarrays and Massive Sequencing in Biomedical and Clinical research Ekim 23-27, 2008 D12. European school of genetic medicine hibrit kursu cancer genetics Ekim 01-05 2005