ÖZGEÇMİŞ. Yard. Doç. Dr. Esra ÇAĞAVİ

Transkript

1 ÖZGEÇMİŞ Yard. Doç. Dr. Esra ÇAĞAVİ İstanbul Medipol Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ABD, Rejeneratif ve Restoratif Tıp Araştırmaları Merkezi Atatürk Bulvarı No:27, Unkapanı-Fatih İstanbul Tel: , ARAŞTIRMA ALANLARI Embriyonik ve indüklenmiş kök hücre sistemi kullanarak kalp-damar gelişimi ve hastalıklarının moleküler temellerinin araştırması ve tedavi yöntemleri geliştirilmesi. Embriyonik kök hücrelerden kalp kök hücresi ve kardiyomiyosit elde edilmesi Kalp kök hücrelerinin farklılaşma ve kendini yenilemesinde gerekli sinyal ileti mekanizmalarının tanımlanması Kalp ve damar hastalıkları tedavisinde kullanılmak üzere yeni kalp doku mühendisliği uygulamalarının geliştirilmesi Hastaların deri dokusundan uyarılmış pluripotent kök hücre elde edilmesi ve in vitro modelleme yapılarak hastalık mekanizmasının araştırılması EĞİTİM Doktora: Kaliforniya Üniversitesi, Los Angeles, ABD Biyolojik Kimya Bölümü Lisans: Boğaziçi Üniversitesi, İstanbul, Türkiye ARAŞTIRMA TECRÜBESİ 09/2013- Yardımcı Doçent Doktor Rejeneratif ve Restoratif Tıp Araştırmaları Merkezi Tıbbi Biyoloji ABD, Tıp Fakültesi İstanbul Medipol Üniversitesi, İstanbul 02/ /2013 Yardımcı Doçent Doktor Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü, Çayırova, İzmit Doktora Sonrası Araştırmacı Danışman: Dr. Yibing Qyang Kalp ve Damar Araştırma Merkezi, Kök Hücre Merkezi Yale Üniversitesi, New Haven, ABD Proje konusu: Embriyonik kök hücreden kardiyomiyosit elde edilmesi, farklılaşma mekanizmasının tanımlanması ve kalp dokusu geliştirilmesi Proje konusu: İnsan dokusundan indüklenmiş pluripotent kök hücre (ipsc) elde edilmesi ve in vitro hastalık modellemesi Doktora Tez Öğrencisi ve Araştırma Görevlisi Yard. Doç. Dr. Esra Çağavi 1

2 Doktora Tez Danışmanı: Dr. Gerry Weinmaster Biyolojik Kimya Bölümü Kaliforniya Üniversitesi, Los Angeles, ABD Doktora tez konusu: Memeli Notch sinyal iletiminde Kuzbanian/ADAM10 ve Alfa-Tümör Nekroz faktörü/adam17 metalloproteinazlarının görevlerinin tanımlanması 2001 Stajyer Araştırmacı Danışman: Dr. Douglas L. Black Mikrobiyoloji, İmmunoloji ve Moleküler Genetik Bölümü Kaliforniya Üniversitesi, Los Angeles, ABD Proje konusu: c-src geni ifadesinin alternatif kırpılma mekanizmasıyla düzenlemesinde rol alan proteinlerin incelenmesi Lab Yardımcısı ve Özel Proje Öğrencisi Danışman: Prof. Dr. Aslı Tolun Boğazici Universitesi, İstanbul, Türkiye EĞİTİM TECRÜBESİ Proje konusu: GJB2 (Connexin 26) geninde kalıtsal sağırlığa neden oluşturabilecek mutasyonların taranması Bahar 2015 Bahar 2014 Bahar 2015 Güz 2014 Güz 2013 Bahar 2013 Öğretim Üyesi Tıbbi Biyoloji ABD, Tıp Fakültesi İstanbul Medipol Üniversitesi Ders Adı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik (Lisans-Tıp Fakültesi) Ders Adı: Tıbbi Biyoloji (Lisans-Biyomedikal Mühendisliği) Ders Adı: Moleküler Biyoloji I (Doktora) Yarı Zamanlı Öğretim Üyesi Boğaziçi Üniversitesi Ders Adı: Kök Hücre Biyolojisi (Lisans, Yüksek Lisans, Doktora) Öğretim Üyesi Tıbbi Biyoloji ABD, Tıp Fakültesi İstanbul Medipol Üniversitesi Ders Adı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik (Lisans) Öğretim Üyesi Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü, Çayırova, İzmit Ders adı: Mesleki İngilizce (Lisans) Öğretim Görevlisi Moleküler, Hücre ve Gelişim Biyolojisi Bölümü Kaliforniya Üniversitesi, Los Angeles, ABD Ders adı: Moleküler Biyolojiye Giriş (Lisans) Yard. Doç. Dr. Esra Çağavi 2

3 YAYINLAR A) Uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleler: 1) Cagavi E., Bartulos O., Suh C. Y., Sun B., Yue Z., Jiang Z., Yue L., Qyang Y. Functional cardiomyocytes derived from Isl1 cardiac progenitors via Bmp4 stimulation Plos One 9(12): e doi: /journal.pone (2014). 2) Dunworth W. P., Cardona-Costa J., Cagavi E., Kim J. D., Meadows S., Fisher J. C., Wang Y., Cleaver O., Qyang Y., Ober E. A., and Jin S. W. Bone Morphogenetic Protein 2 Signaling Negatively Modulates Lymphatic Development in Vertebrate Embryos Circ Res 114 (1) :56-66 (2014). 3) Ge X., Ren Y., Bartulos O., Lee M. Y., Yue Z, Kim K. Y., Li W., Amos P. J., Cagavi E.B., Iyer A., Zheng W., Zhao H., Martin K. A., Kotton D. N., Tellides G., Park I. H., Yue L., Qyang Y. Modeling Supravalvular Aortic Stenosis Syndrome Using Human Induced Pluripotent Stem Cells Circulation 126(14): (2012). 4) Alcon A., Cagavi E. B., Qyang Y. Regenerating Functional Heart Tissue for Myocardial Repair Cell Mol Life Sci 69(16): (2012). 5) Amos P. J., Cagavi E. B., Qyang Y. Methods of Cell Purification: A Critical Juncture for Laboratory Research and Translational Science Cells Tissues Organs 195(1-2):26-40 (2012). 6) Lee M. Y., Cagavi E. B., Schliffke S., Amos P. J., Ren Y., Ge X., Ehrlich B. E., Qyang Y. High Density Cultures of Embryoid Bodies Enhanced Cardiac Differentiation of Murine Embryonic Stem Cells Biochem Biophys Res Commun 416, (2011). 7) Lee M. Y., Sun B., Schliffke S., Yue Z., Ye M., Paavola J, Cagavi E. B., Amos P.J., Ren Y., Ju R., Jung Y. W., Ge X., Yue L., Ehrlich B. E., Qyang Y. Derivation of Functional Ventricular Cardiomyocytes Using Endogenous Promoter Sequence from Murine Embryonic Stem Cells Stem Cell Res 8, (2011). 8) Cagavi E. B., Weinmaster G. Selective Use of ADAM10 and ADAM17 in Activation of Notch1 Signaling Mol Cell Bio 29(21), (2009). 9) Rooke N., Vadim M., Cagavi E., Black D. L. Roles for SR Proteins and hnrnp A1 in the Regulation of c-src Exon N1 Mol Cell Bio 23(6), (2003). B) Hazırlık aşamasındaki makaleler: BURSLAR, ÖDÜLLER VE DİĞER BAŞARILAR TÜBİTAK 1003 Genetik Kökenli Kalp Ritim Bozukluklarının Uyarılmış Pluripotent Kök Hücre Kullanılarak Modellenmesi ve Hücresel Tedavi Yöntemleri Geliştirilmesi Doktora Tez Ögrenci Bursu Jonsson Kanser Vakfı, Yard. Doç. Dr. Esra Çağavi 3

4 Kaliforniya Üniversitesi, Los Angeles, ABD Lise Birincisi Atatürk Lisesi, Bolu, Türkiye KONFERANS KATILIMLARI ve DAVETLİ KONUŞMALAR 1) International Society for Stem Cell Research (ISSCR) 2015 yılı Kongresi (Katılımcı) Stockholm, İsveç, Haziran ) Kalpten beyine, beyinden kalbe (Konuşmacı ve Düzenleyen) Moleküler Biyoloji Derneği Data Toplantısı, Medipol Üniversitesi, İstanbul, Türkiye, 08 Mayıs ) Embryonic and induced pluripotent stem cells: a platform to study heart development and disease ((Davetli konuşmacı) Kök Hücre Sempozyumu,, Haliç Üniversitesi, Türkiye, 18 Nisan ) Embryonic and induced pluripotent stem cells: a platform to study heart development, disease and to develop tissue engineering techniques (Davetli Konuşmacı) İstanbul Teknik Üniversitesi, Haftalık Seminer Serisi, Türkiye, 18 Kasım, ) BMP signaling mechanism in cardiac stem cell differentiation (Poster) Moleküler Biyoloji Derneği 3. Uluslararası Kongresi, Izmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü, 10 Eylül, ) Kişiselleştirilmiş Tıpta Kişinin Tanımı (Davetli Konuşmacı) 3 rd Biohukuk Toplantısı, Istanbul Medipol Üniversitesi, Çanakkale, 3-6 Eylül ) BMP signaling mechanism in cardiac stem cell differentiation (Sözlü Bildiri) 1. Uluslararası Katılımlı Kök Hücre ve Hücresel Tedaviler Kongresi, Kocaeli, Mart ) Embriyonik Kök Hücre ve ips (Davetli konuşmacı) İstanbul Üniversitesi, Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE), İstanbul, 19 Mart ) Genetik Kardiyolojide Temel Araştırma Alanları (Davetli konuşmacı) 10. Uluslararası Kardiyoloji ve Kardiyovasküler Cerrahide Yenilikler Kongresi, Antalya, Mart ) Genetik Durum:Neredeyiz ve Kardiyoloji de Genetik Konusunda Gelecekte Neler Var? (Davetli konuşmacı) 10. Uluslararası Kardiyoloji ve Kardiyovasküler Cerrahide Yenilikler Kongresi, Antalya, Mart ) Embryonic and induced pluripotent stem cells: a platform to study heart development and disease (Davetli konuşmacı) İÜGEN 11. Uluslararasi Katılımlı Moleküler Biyoloji ve Genetik Kış Okulu, İstanbul Üniversitesi, İstanbul, 7-9 Mart ) Ulusal Kök Hücre Politikaları Çalıştayı (Davetli panelist), Türkiye Bilimler Akadamisi (TÜBA), Kayseri, Aralık ) Kök Hücre ve Gen Terapi Sempozyumu (Katılımcı), Yeditepe Üniversitesi, Kasım Yard. Doç. Dr. Esra Çağavi 4

5 14) Moleküler Biyoloji Derneği 2. Uluslararası Kongresi (Katılımcı) İstanbul Teknik Üniversitesi, Kasım ) Embryonic and induced pluripotent stem cells: a platform to study heart development, disease and to develop tissue engineering techniques (Konuşma) Makale saati, İstanbul Medipol Üniversitesi, Ekim ) Embryonic and induced pluripotent stem cells: a platform to study heart development, disease and to develop tissue engineering techniques (Davetli konuşma) 1. Uluslararası Gen-Arel Moleküler Biyoloji ve Genetik Ögrenci Kongresi, Arel Üniversitesi, Mayıs ) Embryonic and induced pluripotent stem cells: a platform to study heart development, disease and to develop tissue engineering techniques (Davetli konuşma) Moleküler Biyoloji Derneği, Data Toplantısı, Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü, Nisan ) From embryonic or induced-pluripotent stem cells to cardiac progenitors, cardiac tissue and disease modeling (Davetli konuşma) Boğaziçi Üniversitesi, Ocak ) "Embryonic and induced pluripotent stem cells for the study of heart development, disease and for tissue engineering (Davetli konuşma) Kadir Has Üniversitesi, Kasım ) Characterization of mouse embryonic stem cell or induced-pluripotent stem cellderived cardiac progenitors and heart tissue engineering (Davetli konuşma) Sabancı Üniversitesi, Eylül ) "Characterization of mouse embryonic stem cell-derived cardiac progenitors and disease modelling by pluripotent stem cells" (Davetli konuşma) Yeditepe Üniversitesi, Eylül ) "Characterization of mouse embryonic stem cell-derived cardiac progenitors and disease modelling by pluripotent stem cells" (Davetli konuşma) Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü, Eylül ) Signaling pathways in cardiac differentiation (Konuşma) Kuzey Doğu Türk Amerikan Bursiyerleri (NETA) Beşinci Yıllık Toplantısı, Harvard Universitesi, ABD, Nisan ) Connecticut s Stem Cell Research Symposium (Katılımcı), StemCONN, Marriott Hotel, Farmington, ABD, Mart ) International Symposium Stem Cells in Biology and Disease (Katılımcı), ESTOOLS projesi, Gulbenkian vakfı, Lizbon, Portekiz, Mayıs ) Cagavi E., Miyamoto A., Weinmaster G. (Poster) KUZ or TACE Who cleaves Notch? Yıllık Biyolojik Kimya Seminerleri, Skirball Kültür Merkezi, Los Angeles, ABD, Haziran ) Cagavi E., Ladi E., He F., Sun Y.E., Weinmaster G. (Poster) The Role of Deltalike 3 in Mammalian Notch Signaling Yıllık Biyolojik Kimya Seminerleri, UCLA Konferans Merkezi, Lake Arrowhead, ABD, Mayıs ) Cagavi E., Ladi E., He F., Sun Y.E., Weinmaster G. (Poster) Comparison of cis- Yard. Doç. Dr. Esra Çağavi 5

6 Inhibition by Delta-like 1 and Delta-like 3 in Notch Signaling Yıllık Biyolojik Kimya Seminerleri, Skirball Kültür Merkezi, Los Angeles, ABD, Nisan ) Cagavi E., Yang L.T., Ting-Berreth S., Weinmaster G. (Poster) Notch Signaling and ADAM Proteases: Who is cleaving what, where and when? Yıllık Biyolojik Kimya Seminerleri, UCLA Konferans Merkezi, Lake Arrowhead, ABD, Mayıs PROFESYONEL ETKİNLİKLER 1) Pratik İstatistik Kursu, Doç. Dr. Hanefi Özbek, Sürekli Eğitim Merkezi, İstanbul Medipol Universitesi, 1-2 Şubat ) Ölçme ve Değerlendirme Eğitimi, Prof. Dr. Duygu Anıl, Sürekli Eğitim Merkezi, İstanbul Medipol Universitesi, Ocak ) Horizon 2020 Marie Sklodowska Curie Burs Veren Kuruluşlara Ek Fon Programı (COFUND) Koordinatör Yetiştirme Eğitimi (TÜBITAK), Ankara, 20 Aralık ) İleri seviye öğretim kursu (Katılımcı) Fundamentals of teaching science Yale Öğretim Merkezi, New Haven, ABD, 10 Eylül 1 Kasım ) Seminer (Katılımcı) Scientific leadership and management course Yale Doktora Sonrası Araştırmacılar Derneği, New Haven, USA, 15 Ağustos ) İleri seviye öğretim kursu (Katılımcı) Preparing future science faculty: Teaching your own course Yale Öğretim Merkezi, New Haven, ABD, 20 Mart 17 Nisan ) Seminer (Katılımcı) Taking the lead: Designing your own course Yale Öğretim Merkezi, New Haven, ABD, 30 Ocak ) Seminer (Katılımcı) Writing for biomedical publication Doktora Sonrası Araştırmacılar Ofisi, Sloan-Kettering Enstitüsü, New York, ABD, 20 Ocak ) İleri seviye öğretim kursu (Katılımcı) Learning to mentor the next generation of scientists series Yale Öğretim Merkezi, New Haven, ABD, 23 Haziran 21 Temmuz ) Seminer dizisi (Katılımcı) Responsible conduct of research for post-docs Yale Doktora Sonrası Araştırmacılar Derneği, New Haven, ABD, 11 Mayıs 6 Temmuz ) Seminer (Katılımcı) Mini-course: High throughput screening Yale Data Analiz Merkezi, New Haven, ABD, 17 Mayıs ) İleri seviye bilimsel yazı kursu (Katılımcı) Scientific writing course Yale Universitesi, 7 Ocak 25 Şubat ÜYE OLUNAN KURULUŞLAR Moleküler Biyoloji Derneği, 2013 Türk Kardiyoloji Derneği, 2013 Kök Hücre ve Hücresel Tedavi Derneği, 2014 International Society for Stem Cell Research, 2015 Yard. Doç. Dr. Esra Çağavi 6

7 YABANCI DİL BİLGİSİ İngilizce : Akıcı ve ileri seviye Fransızca : Başlangıç-orta seviye Yard. Doç. Dr. Esra Çağavi 7