ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Transkript

1 ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ ÖZGEÇMİŞ Adı Soyadı: Muhammet UZUNTARLA Doğum Tarihi: 19 EYLÜL 1981 Öğrenim Durumu: Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl Lisans Elektronik ve Haberleşme Kocaeli Üniversitesi 2003 Mühendisliği Y. Lisans Elektrik-Elektronik Mühendisliği Zonguldak Karaelmas 2006 Üniversitesi Doktora/S.Yeterlik/ Tıpta Uzmanlık Elektrik-Elektronik Mühendisliği Sakarya Üniversitesi 2011 Görevler: Görev Unvanı Arş.Görv. Doktora Sonrası Araştırmacı Yrd.Doç.Dr. Doç.Dr. Doktora Sonrası Araştırmacı Görev Yeri Mühendislik Fakültesi, Elektrik-Elektronik Mühendisliği Bölümü, Zonguldak Karaelmas Üniversitesi Krasnow Institue for Advanced Studies, George Mason University Virginia, USA Mühendislik Fakültesi, Biyomedikal Mühendisliği Bölümü, Bülent Ecevit Üniversitesi Mühendislik Fakültesi, Biyomedikal Mühendisliği Bölümü, Bülent Ecevit Üniversitesi Krasnow Institue for Advanced Studies, George Mason University Virginia, USA Yıl / / Halen Halen Yönetilen Yüksek Lisans Tezleri ve Doktora Tezleri: Ali Çalım, Heterojen biyolojik nöron ağlarında bilgi işleme, Bülent Ecevit Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2014, (Ortak Danışman: Prof. Dr. Mahmut ÖZER) Uğur İleri, Biyolojik nöron ağlarında kısa-süreli sinaptik plastisite, Bülent Ecevit Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2015, (Ortak Danışman: Prof. Dr. Mahmut ÖZER) Şükriye Nihal Ağaoğlu, Biyolojik nöron ağlarında vibrasyonel rezonans, Bülent Ecevit Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Devam ediyor (Tez aşamasında), (Ortak Danışman: Prof. Dr. Mahmut ÖZER) Ali Çalım, Parkinson Hastalığında Beta Osilasyon Dinamiklerinin Belirlenmesi, Bülent Ecevit Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Devam ediyor (Tez aşamasında), (Ortak Danışman: Prof. Dr. Mahmut ÖZER)

2 Projelerde Yaptığı Görevler : 1. Kortikal Nöronlarda Eşik-altı Gerilim Dalgalanmaları ve Sinaptik Korelasyon Arasındaki İlişkinin Belirlenmesi, Zonguldak Karaelmas Üniv. BAP 2007/ , Araştırmacı, Bülent Ecevit Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Laboratuarları Altyapısının Kurulması, Bülent Ecevit Üniv. BAP , Araştırmacı, Kısa Dönem Sinaptik Plastisitenin Nöronlarda Bilgi Kodlama Üzerine Etkilerinin Belirlenmesi, Bülent Ecevit Üniv. BAP , Yönetici, İdari Görevler : Biyoelektronik Anabilim Dalı Başkanı Biyomedikal Mühendisliği Bölüm Başkan Yardımcısı Mühendislik Fakültesi Eğitim Komisyonu Üyeliği Mühendislik Fakültesi Staj Komisyonu Üyeliği Erasmus Değişim Programları Bölüm Koordinatörü Bülent Ecevit Üniversitesi Biyomedikal Kalibrasyon Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürü Akademik Etkinlikler: Editörlük: 1.Konuk Editör, Special Issue on: 'Advances in renewable energy and energy efficiency technologies' in Turkish Journal of Electrical Engineering and Computer Sciences, Editörler Kurulu üyesi, Turkish Journal of Electrical Engineering and Computer Sciences, Hakemlik: 1. IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems, [SCI] 2. Biosystems, [SCI] 3. Turkish Journal of Electrical Engineering and Computer Science, [SCI] 4. Chaos, Solitons & Fractals, [SCI] 5. Journal of Computational Neuroscience, 2013 [SCI] 6. TUBITAK PANELIST VE DIŞ DANIŞMAN GÖREVLERİ ERASMUS Öğretim Personeli Hareketliliği Programı: 1. Granada University/ Spain- Department of Electromagnetism and Matter Physics, 10 saat ders verme, 3-7 Aralık Ghent University/ Belgium- Department of Data Analysis, 10 saat ders verme, Mart

3 Ödüller : 3. Granada University/ Spain- Department of Electromagnetism and Matter Physics, 10 saat ders verme, Eylül Rey Juan Carlos University/ Spain- Department of Physics, 10 saat ders verme, Ocak, Granada University/ Spain- Department of Electromagnetism and Matter Physics, 10 saat ders verme, Nisan Rey Juan Carlos University/ Spain- Department of Physics, 10 saat ders verme, Eylül, Berlin Technical University/ Germany, Institute for Theoretical Physics, 10 saat ders verme, 9-20 Şubat 2015 TUBİTAK- Yayın Teşvik Ödülü 2006 (1 Adet) TUBİTAK- Yayın Teşvik Ödülü 2007 (1 Adet) TUBİTAK- Yayın Teşvik Ödülü 2008 (2 Adet) TUBİTAK- Yayın Teşvik Ödülü 2009 (3 Adet) TUBİTAK- Yayın Teşvik Ödülü 2010 (1 Adet) Uluslararası Yayın Ödülü, Zonguldak Karaelmas Üniversitesi, 2011 TUBİTAK- Yayın Teşvik Ödülü 2012 (1 Adet) YÖK- Doktora Sonrası Araştırma Bursu, 2012 Uluslararası Yayın Ödülü, Bülent Ecevit Üniversitesi, 2012 TUBİTAK- Yayın Teşvik Ödülü 2013 (4 Adet) GENIL Strengthening through Short-Visits programme of Granada University, 2014 (3000 Euro) TUBİTAK- Yayın Teşvik Ödülü 2015 (2 Adet) TUBITAK-BIDEB 2219 Doktora Sonrası Araştırma Bursu, 2015 ESERLER A. Uluslararası SCI/SCIE indeksli hakemli dergilerde yayımlanan makaleler : A1. M. Uzuntarla, M. Ozer, U. Ileri, A.Calim, J. J. Torres. Effects of dynamic synapses on noise-delayed response latency of a single neuron. Physical Review E, 92, , A2. M. Uzuntarla, E. Yilmaz, A. Wagemakers, M. Ozer. Vibrational Resonance in a Heterogeneous Scale Free Network of Neurons. Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulations, 22(1-3): ,

4 A3. M. Uzuntarla, J.R. Cressmann, M. Ozer, E. Barreto, Dynamical structure underlying inverse stochastic resonance and its implications, Physical Review E, 88, , A4. M. Uzuntarla, Inverse stochastic resonance induced by synaptic background activity with unreliable synapses, Physics Letters A 373 (38): , A 5. M. Uzuntarla, R. Uzun, E. Yılmaz, M. Özer, M. Perc, Noise-delayed decay in the response of a scale-free neuronal network, Chaos Solitons & Fractals 56: , A6. E.Yılmaz, M. Uzuntarla, M. Özer, M. Perc, Stochastic resonance in hybrid scale-free neuronal networks, Physica A: Statistical Mechanics and its Applications, 392(22): , A 7. M. Uzuntarla, M. Ozer, D. Guo, Controlling the First-Spike Latency Response of a Single Neuron via Unreliable Synaptic Transmission, European Physical Journal B, 85(8): , A8. M.Ozer, M.Perc, M.Uzuntarla, E. Koklukaya, Weak signal propagation through noisy feedforward neuronal networks, NeuroReport, 21(5): , A9. M. Ozer, M. Uzuntarla, M. Perc, L.J. Graham, Spike latency and jitter of neuronal membrane patches with stochastic Hodgkin-Huxley channels, Journal of Theoretical Biology, 261(1): 83-92, A10. M. Ozer, M. Perc, M. Uzuntarla, Controlling the spontaneous spiking regularity via channel blocking on Newman-Watts networks of Hodgkin-Huxley neurons, EuroPhysics Letters (EPL), 86 (4): 40008, A11. M. Ozer, M. Perc, M. Uzuntarla, Stochastic resonance on Newman-Watts networks of Hodgkin-Huxley neurons with local periodic driving, Physics Letters A, 373 (10): , A12. M. Ozer, M.Uzuntarla, T. Kayikcioglu, L.J. Graham, Collective temporal coherence for subthreshold signal encoding on a stochastic small-world Hodgkin-Huxley neuronal network, Physics Letters A, 372 (43): , A13. M. Ozer, M. Uzuntarla, Effects of the network structure and coupling strength on the noise-induced response delay of a neuronal network, Physics Letters A, 372 (25): , A14. M. Ozer, L.J. Graham, O. Erkaymaz, M. Uzuntarla, Impact of synaptic noise and conductance state on spontaneous cortical firing, NeuroReport, 18: , A15. M. Ozer, M. Uzuntarla, S.N. Agaoglu, Effect of the subthreshold periodic current forcing on the regularity and the synchronization of neuronal spiking activity, Physics Letters A, 360 (1): , B. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler : B1. A. Calim, U. Ileri, M. Uzuntarla, M.Ozer. Vibrational resonance in feed-forward neural network motifs. 24th Annual Computational Neuroscience Meeting: OCNS*2015, Prague, Czech Republic, July 18-23,

5 B2.M.Uzuntarla, J.R. Cressman, M.Ozer, E. Barreto, Inverse stochastic resonance induced by ion channel noise, 21 th Annual Computational Neuroscience Meeting: OCNS*2012, Decatur, GA, USA, BMC Neuroscience 13 (Suppl 1):P181, July 21-26, B3. M.Uzuntarla, M. Ozer, E. Koklukaya, Optimization of weak signal propagation in a feedforward network, 20 th Annual Computational Neuroscience Meeting: CNS *2011, Stockholm, Sweeden, BMC Neuroscience 2011, 12(Suppl 1): P176, July 23-28, B4. M. Uzuntarla, M. Ozer, E. Koklukaya, Propagation Of Firing Rate in a Feedforward Network of Hodgkin-Huxley Neurons, 20 th Biennial International Eurasip Conference- BIOSIGNAL2010, Brno, Czech Republic, Analysis of Biomedical Signals and Images, 20: pp , ISBN , June 27-29, B5. M. Ozer, M. Uzuntarla, L.J. Garaham, Effect of ratio of inhibitory and excitatory conductance on regularity of spontaneous cortical activity, 19 th Biennial International Eurasip Conference-BIOSIGNAL2008, Brno, Czech Republic, Analysis of Biomedical Signals and Images, pp , ISBN , June 29 July 1,2008. B6. M. Ozer, M. Uzuntarla, S.N. Agaoglu, Effect of the sub-threshold periodic current forcing with noise on the synchronization of neuronal spiking activity, 15 th Annual Computational Neuroscience Meeting: CNS*2006, Edinburgh, UK, Abstract Book, pp. 80, July 16-20, B7. M. Ozer, M. Uzuntarla, Synchronization between neuronal spiking activity and subthreshold sinusoidal stimuli based on the FitzHugh-Nagumo model, Mathematical Methods in Engineering-MME06, Ankara, Turkey, Abstract Book, pp. 42, April 27-29, B8. M. Ozer, M. Uzuntarla, Investigation of synchronization between neuronal spiking activity and subthreshold sinusoidal forcing, 18 th Biennial International Eurasip Conference- BIOSIGNAL2006, Brno, Czech Republic, Analysis of Biomedical Signals and Images, pp , ISBN , June 28-30, C. Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler : C1. M. Ozer, M. Uzuntarla, Synchronization between neuronal spiking activity and subthreshold sinusoidal stimuli based on the FitzHugh-Nagumo model, In: Mathematical Methods in Engineering, Eds. K. Tas, J.A. Tenreiro Machado and D. Baleanu, Springer, ISBN: , , D. Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler : D1. U. İleri, A. Çalım, M. Özer, M. Uzuntarla, Latency Coding in Neurons with Short- Term Synaptic Depression and Facilitation, Journal of the Istanbul Faculty of Medicine, 77(1): 72, D2. A. Çalım, M. Uzuntarla, M. Özer, Effects of Heterogenity and Synaptic Dynamics on weak signal processing, Journal of the Istanbul Faculty of Medicine, 77(1): 71, D3. M. Uzuntarla, M. Ozer, Farklı uyartım bölgeleri için nöronal gürültünün bilgi kodlama üzerine etkileri, Teknoloji, Cilt 10 (1): syf: 1-11,

6 E. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitaplarında basılan bildiriler: E1. U. İleri, A. Çalım, M. Uzuntarla, M. Özer, Kortikal Düzensiz Spayk Aktivitesinde Kısa- Dönem Sinaptik Depresyon Ve Dinamik Ateşleme Eşiğinin Rolü, IEEE 23. Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları Kurultayı (SIU2015), Malatya, Mayıs E2. A. Çalım, U. İleri, M. Uzuntarla, M. Özer, Sinaptik İletim Güvenilirliğinin Nöronal Ateşleme Düzenliliğine Etkileri, IEEE 23. Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları Kurultayı (SIU2015), Malatya, Mayıs E3. U. İleri, A. Çalım, M. Özer, M. Uzuntarla, Sinaptik Depresyon Ve Fasilitasyonun Nöronların Latans Kodlama Performansına Etkileri, 12.Ulusal Sinirbilim Kongresi, İstanbul, Mayıs E4. A. Çalım, M. Uzuntarla, M. Özer, Nöron Popülasyonlarında Sinaptik Dinamiklerin Ve Heterojenliğin Eşik Altı Sinyallerin İşlenimine Etkileri, 12.Ulusal Sinirbilim Kongresi, İstanbul Mayıs E5. A. Çalım, M. Uzuntarla, M. Özer, Effects of Heterogeneity on Information Processing in Biological Neural Networks, IEEE 22th Signal Processing and Communications Applications (SIU 2014), Trabzon, Turkey, Nisan E6.M. Uzuntarla, M. Ozer, E. Koklukaya, Gürültülü ileri yönlü biyolojik sinir ağında ateşleme oranı iletimi, IEEE 18. Sinyal işleme ve iletişim uygulamaları kurultayı-siu2010, Bildiriler Kitabı, syf: 81-84, Diyarbakır, Türkiye, Nisan, E7. M. Uzuntarla, M.Ozer, Biyolojik nöral ağda ağ topolojisi ve iyon kanal gürültüsünün uzaysal senkronizasyona etkileri, Elektrik-Elektronik ve Bilgisayar Mühendisliği Sempozyumu- ELECO 2008, Bildiriler Kitabı, syf: , Bursa, Türkiye, Kasım, E8. M. Ali Özsoy, M. Ozer, M. Uzuntarla, Gürültü ve sinaptik etkileşimin nöron ağı senkronizasyonuna etkileri, XIII. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı- BIYOMUT2007, Bildiriler Kitabı, syf: , İstanbul, Türkiye, Mayıs, E 9. M. Uzuntarla, M. Ozer, Membran potansiyelindeki eşik-altı dalgalanmaların nöron ateşleme eşiğine etkisi, XIII. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı- BIYOMUT2007, Bildiriler Kitabı, syf: , İstanbul, Türkiye, Mayıs, E10. M. Ozer, O. Erkaymaz, M. Uzuntarla, Sinaptik arkaplan aktivitesinin istatistiksel parametrelerinin kortikal nöronların ateşleme düzenliliğine ve etkin bekleme periyoduna etkisi, XIII. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı- BIYOMUT2007, Bildiriler Kitabı, syf: , İstanbul, Türkiye, Mayıs, E11. M. Ali Özsoy, M. Uzuntarla, M. Ozer, Nöron populasyonları cevap sürelerinin gürültü, sinaptik etkileşim ve uyartım frekansı ile değişimi, IEEE 15. Sinyal işleme ve iletişim uygulamaları kurultayı-siu2007, Bildiriler Kitabı, syf: , Eskişehir, Türkiye, Haziran, E12. M. Ozer, O. Erkaymaz, M. Uzuntarla, Sinaptik arkaplan girdilerdeki korelasyonun neokortikal nöron ateşleme aktivitesinin düzenliliğine etkisi, IEEE 15. Sinyal işleme ve iletişim uygulamaları kurultayı-siu2007, Bildiriler Kitabı, syf: , Eskişehir, Türkiye, Haziran, E13. O. Erkaymaz, M. Uzuntarla, M. Ozer, Effect of the correlation in synaptic background activity on the latency of neocortical neurons, 6. Ulusal Sinirbilim Konferansı, Neuroanatomy, Vol 6 (suppl. 1): p. 6, Safranbolu/ Karabük, Türkiye, 9-13 Nisan,

7 E14. M. Uzuntarla, M. Özer, Nöronların iletişiminde sezgisel senkronizasyon, Elektrik- Elektronik ve Bilgisayar Mühendisliği Sempozyumu-ELECO 2006, Bildiriler Kitabı, syf: , Bursa, Türkiye, 6-10 Aralık, E15. M. Uzuntarla, M. Özer, Yapısal gürültü karakteristiğinin nöron çalışma dinamiklerine etkisi, Elektrik-Elektronik ve Bilgisayar Mühendisliği Sempozyumu- ELECO 2006, Bildiriler Kitabı, syf: , Bursa, Türkiye, 6-10 Aralık, E 1 6. M. Uzuntarla, M. Özer, Synchronization between neuronal spiking activity and subthreshold periodic stimulus for two different noise models, 5. Ulusal Sinirbilim Konferansı, Neuroanatomy, Vo l 5 (suppl.1): p. 17, Zonguldak, Türkiye, Nisan, F. Son iki yılda verdiği lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler Akademik Yıl Dönem Güz- Bahar Güz- Bahar Dersin Adı Haftalık Saati Teorik Uygulama Öğrenci Sayısı BMM103 Temel Bilgisayar Teknolojisi EEM209 Elektronik Elemanlar EEM209 Elektronik Elemanlar (İ.Ö.) EEM213 C Programming EEM211 C Programlama (İ.Ö.) EEM301 Elektronik I EEM309 Elektronik Laboratuvarı I EEM415 Tıp Elektroniği EEM714 Nöron Modellemede Sayısal Yöntemler (Yüksek Lisans) EEM717 Matematiksel Fizyoloji (Yüksek Lisans) EEM807 Biyolojik Sistemlerde Modelleme (Doktora) BMM104 Bilgisayar Programlama EEM714 Nöron Modellemede Sayısal Yöntemler (Yüksek Lisans) EEM717 Matematiksel Fizyoloji (Yüksek Lisans) EEM807 Biyolojik Sistemlerde Modelleme (Doktora) BMM101 Biyomedikal Mühendisliğine Giriş ZBC237 Kalibrasyon ZBC237 Kalibrasyon (İ.Ö) BMM 309 Elektronik BMM 304 Mikroişlemciler EEM713 Elektrofizyoloji (Yüksek Lisans) EEM807 Biyolojik Sistemlerde Modelleme (Doktora) 7