Doğu Anadolu Kırmızısı ve Melezi Sığırların Büyüme Hormonu Geni Genetik Varyasyonunun İncelenmesi

Benzer belgeler
Yasemin ÖNER * Murat PULLU * Oya AKIN ** Cengiz ELMACI *

TÜRKİYE DE BULUNAN BAZI YERLİ SIĞIR IRKLARININ GENETİK YAPILARININ KARAKTERİZASYONU

Niyazi DEMİRCİ 1, Bilal AKYÜZ 2!

ZOOTEKNİ BÖLÜMÜ. Araş. Gör. Ertuğrul KUL

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

YERLİ SIĞIR IRKLARINDA MYOSTATİN GENİNE AİT III. EKZON BÖLGESİNİN NT 821(DEL11) POLİMORFİZMİ BAKIMINDAN KARŞILAŞTIRILMASI

I. Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri İvesi Koyunlarında mikrosatellite lokuslarında polimorfizmin tespiti Güneydoğu Anadolu Tarımsal Araştı

Detection of Akirin 2 Gene Polymorphism with PCR-RFLP Method in Some Cattle Breeds Reared in Turkey

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ DERGİSİ Journal of Faculty of Veterinary Medicine, Erciyes University

A8. Kul, E., Erdem, H., Relationships Between Somatic Cell Count and Udder Traits in Jersey Cows. J. Appl. Anim. Res. 34 (2008):

Prof.Dr. Recep AYDIN

Siyah Alaca Sığırlarda Kuruda Kalma Süresi, Servis Periyodu ve İlkine Buzağılama Yaşı ile Bazı Süt Verim Özellikleri Arasındaki İlişkiler

Sığırların Verim Özellikleri Üzerine Etkili Önemli Moleküler Markörler

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Türkiye de Yetiştirilen Anadolu Mandalarında Butirofilin (BTN1A1) Gen Polimorfizminin HaeIII Restriksiyon Enzimi ile Araştırılması

Prof.Dr. Recep AYDIN

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

Türkiye de Yetiştirilen Holştayn ve Bazı Yerli Sığır Irklarında Citrullinemia Allelinin Belirlenmesi

Farklı Kondisyon Puanlarına Sahip Simmental Irkı Sığırlardan Elde Edilen Sütlerin AB Standartlarına Uygunluğunun Belirlenmesi

Araş. Gör. Şeniz ÖZİŞ ALTINÇEKİÇ

Türkiye de Yetiştirilen Esmer ve Siyah Alaca Sığırlarda Süt Verimi, İlk Buzağılama Yaşı ve Servis Periyodu *

ARAŞTIRMA. Anahtar Kelimeler: Saanen, Kıl keçisi, Melezleme, Büyüme, Yaşama Gücü

Anahtar Kelimeler: Kalıtsal hastalık, miyofosforilaz, RFLP, Şarole

Siyah Alaca Sığırlarda Kısmi Süt Verimlerinden Yararlanılarak 305 Günlük Süt Veriminin Tahmini

Parkinson Hastalığı ile α-sinüklein Geni Polimorfizmlerinin İlişkisinin Araştırılması

Ezgi KARA*, Murat ÇİMEN**, Servet KAYA*, Ümit GARİP*, Mehmet ŞAHİNSOY*

Ankara keçilerinde süt verimi ve oğlaklarda büyümeye etkisi

ESMER SIĞIRLARDA ÇEŞİTLİ FORM ÖZELLİKLERİNİN KALITIMI VE İLK LAKTASYON SÜT VERİMİ İLE İLGİSİ

Hayvansal Üretim 49(2): 1-6, 2008 Araştırma Makalesi

Comparison of Adaptation Levels of Cultural Cattle in Kahramanmaras Province in Terms of Insurance Claims Compensation

Batı Anadolu İçin Bir Süt Keçisi: Bornova Keçisi

ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

İstatistiki Bölge Birimleri Sınıflamasına Göre Düzey 2 (TRA1 ve TRA2) Bölgelerinde Büyükbaş Hayvan Varlığı ve Süt Üretiminin Karşılaştırılması

Hakan ÇETİN Atakan KOÇ

Siyah Alaca neklerde Süt Protein Polimorfizminin Geneti i ve Süt Verim Özellikleriyle liflkisi

Ankara Keçisi Oğlaklarının Büyüme Özelliklerine Bazı Çevre Faktörleri ile Amilaz ve Transferrin Tiplerinin Etkisi

Domuz Ayrığı (Dactylis glomerata L.) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Esmer Irk Sığırlarda Süt Verim Özelliklerine İlişkin Genetik Yönelim Unsurlarının ve Genetik Korelasyonun Tahmini

Siyah Alaca ve Esmer Sığırlarda Fazla Meme Başı Sayısına Ait Gen Frekansı, Kalıtım Derecesi ve Süt Verimi ile İlişkileri [1]

Uluslararası Hayvancılık 99 Kongresi, Eylül 1999, İzmir

Mandalarda Alyuvar Potasyum Polimorfizmi Üzerine Bir Araştırma

Sönmez Koyunlarında Tip Sabitleştirilmesi 1 (2. Kimi Vücut Ölçüleri ve Süt Verim Özellikleri )

Elazığ İli Karakoçan İlçesinden Elde Edilen Sütlerde Yağ ve Protein Oranlarının AB ve Türk Standartlarına Uygunluklarının Belirlenmesi

DOĞU ANADOLU KIRMIZISI SIĞIRLARINDA TRANSFERRİN VE HEMOGLOBİN POLÎMRFİZMÎ ÜZERİNE BİR ARAŞTIRMA

Edirne İlinden Kış Aylarında Elde Edilen Sütlerde Toplam Yağ ve Protein Değerlerinin Türk Standartlarına Uygunluğunun Belirlenmesi

Türkiye de Simental Genotipinin Yaygınlaştırılması. Araş. Gör. Ayşe Övgü ŞEN Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi

SNP TEK NÜKLEOTİD POLİMORFİZMLERİ (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)

Türkiye Süt Sığırcılığında Islah ve Destekleme Politikalarının Bölgesel Etkileri Üzerine Bir Araştırma

GÖKHÖYÜK TARIM İŞLETMESİNDE YETİŞTİRİLEN SİYAH ALACA SIĞIRLARIN SÜT VE DÖL VERİM ÖZELLİKLERİ 1. SÜT VERİM ÖZELLİKLERİ

Đsviçre Esmeri Sığırlarda Akrabalı Yetiştirme Düzeyi ve Akrabalı Yetiştirmenin Süt Verim Özellikleri Üzerine Etkileri*

REKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

Bornova Tipi Keçilerde Kan Proteinleri Polimorfizmi ile Bazı Süt Verim Özellikleri Arasındaki İlişkiler *

Sarımsaklı Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah-Alaca Irkı Süt Sığırlarının Döl Verim Özellikleri

Sönmez Koyunlarında Tip Sabitleştirilmesi 1 (1. Döl Verimi ve Gelişme Özellikleri)

KEMER BARAJ GÖLÜ'NDEKİ Cypr nus carpio L., 1758'NUN BAZI BİYOLOJİK ÖZELLİKLERİ

ARAŞTIRMA MAKALESİ. Türkiye de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması. DOI: /EurasianJVetSci.2016.

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ DERGİSİ Journal of Faculty of Veterinary Medicine, Erciyes University

SİYAH ALACA SIĞIRLARDA LAKTASYONUN İLK 10 GÜNÜNDE SÜTÜN BİLEŞİMİNDE MEYDANA GELEN DEĞİŞİM

Doğu Anadolu Kırmızısı Melez Sığırlarda Prolaktin Geni Polimorfizmi 1

Süt Tipi Oğlakların Doğum, 30. Gün ve 60. Gün Canlı Ağırlıkları Üzerine Sistematik Çevre Etmenlerinin Etkileri

G i r i ş. Araştırma Makalesi

Siyah Alaca Sığırlarda Kısmi Süt Verimlerinden Yararlanılarak 305 Günlük Süt Verimini Tahmin Etme İmkanları *,1

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

AİLESEL AKDENİZ ATEŞİ (AAA-FMF)

GÖKHÖYÜK TARIM İŞLETMESİNDE YETİŞTİRİLEN SİYAH ALACA SIĞIRLARIN SÜT VERİMİ ÜZERİNE BAZI DÖL VERİM ÖZELLİKLERİNİN ETKİLERİ

T.C SELÇUK ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ. Selçuk KAPLAN YÜKSEK LİSANS TEZİ ZOOTEKNİ ANABİLİM DALI

Prof.Dr.Serap GÖNCÜ Ç.Ü. Ziraat Fak. Zootekni Böl.

Islah Stratejileri ve Türkiye Ulusal Sığır Islah Programı

YÜKSEKÖĞRETİM KURULU YARDIMCI DOÇENT : Sinop Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Sinop

Öğr. Gör. Tuğba GÜLEÇ

İvesi Koyunlarında Mitokondriyal 16S rrna Gen Bölgesi Polimorfizmlerinin PCR-RFLP Yöntemiyle İncelenmesi

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

RESEARCH ARTICLE. Türkiye de bulunan bazı sığır ırklarının DGAT1 ve PRNP gen polimorfizminin araştırılması

TÜRKİYE DE SİMMENTAL YETİŞTİRİCİLİĞİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

ARAŞTIRMA. Holştayn İneklerde Laktasyon Süt Verimini Tahmin Eden En İyi Doğrusal Regresyon Modelinin Belirlenmesi

KORUMA ALTINDAKİ ÇİNE ÇAPARI KOYUNLARDA GENETİK ÇEŞİTLİLİK* Pelin BİNBAŞ1, İbrahim CEMAL2

Konuklar Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Esmer Sığırların Döl Verim Özellikleri *

ARAŞTIRMA. 2008: 22 (5): Nihat YILDIZ 1 Selami AYGEN 2 Mahiye ÖZÇELİK 3

1. Zootekni ve Hayvan Besleme Bölüm Başkan Yardımcısı. 2. Ankara Üniversitesi, Ankara İşleri Araştırma ve Uygulama Merkezi Yönetim Kurulu Üyesi

Major Depresif Bozukluk (MDD) Dünyada maluliyete sebep olan en sık ikinci hastalık Amprik tedavi yaklaşımı İlaca yanıt Yan etki bireysel farklılıklar

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Renkli Tiftik Keçisi ve Ankara Keçisi x Renkli Tiftik Keçisi F 1 Oğlaklarında Yaşama Gücü ve Büyüme Performanslarının Araştırılması

Doç.Dr. HAYRİYE DEĞER ORAL TOPLU

Tahirova Tarım İşletmesindeki Siyah Alaca İneklerin Süt ve Döl Verimi Özelliklerinin Genetik Parametreleri

Edirne İlinde Elde Edilen Sütlerin Dünya Sağlık (Who) Standartlarına Uygunluğu

Dr. Nilay HAKAN Muğla Sıtkı Koçman Üniv. Tıp Fak. Neonatoloji Bilim Dalı Perinatal Medicine Nisan 2017, İZMİR

YERLİ KEÇİ SÜTLERİNİN STANDARTLARA UYGUNLUKLARININ KONTROLÜ

İzmir İli Seferihisar İlçesinde Yetiştirilen Keçilerden Elde Edilen Sütlerde Biyokimyasal Parametrelerin Türk Standartlarına Uygunluğunun Belirlenmesi

Holştayn Irkı Sığırlarda Bazı Verim Özellikleri

T.C. SELÇUK ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

Tunceli İli Pertek İlçesinden Elde Edilen Akkaraman Koyunu ve Yerli Kıl Keçi Sütlerinde Temel Lezzet Parametreleri

KRONİK BÖBREK HASTALIĞI (YETMEZLİĞİ) OLAN TÜRK HASTALARINDA TÜMÖR NEKROZ FAKTÖR ALFA ve İNTERLÖKİN-6 PROMOTER POLİMORFİZMLERİNİN ETKİSİ

RESEARCH ARTICLE. Limuzin ırkı sığırlarda besi başlangıcındaki canlı ağırlığın ekonomik açıdan besi performansına etkisi

TÜRKİYE YERLİ KEÇİ IRKLARININ MİTOKONDRİAL DNA ÇEŞİTLİLİĞİ VE FİLOCOĞRAFYASI

Simental x Güney Anadolu Kırmızısı sığırlarına ait beden ölçüleri için basit doğrusal ve lojistik büyüme modeli

Batı Anadolu ve Trakya da Melezleme ile Elde Edilen Yeni Koyun Tipleri

Dr. Öğretim Üyesi Yüksel AKSOY

Tunceli ili Pertek ilçesinde Yetiştirilen Koyun ve Keçi Sütlerinin Kaliteli Peynir Yapım Standartlarına Uygunluğu

Transkript:

Atatürk Üniv. Ziraat Fak. Derg., 42 (2): 159-163, 2011 J. of Agricultural Faculty of Atatürk Univ., 42 (2): 159-163, 2011 ISSN : 1300-9036 Araştırma Makalesi/Research Article Doğu Anadolu Kırmızısı ve Melezi Sığırların Büyüme Hormonu Geni Genetik Varyasyonunun İncelenmesi Memiş ÖZDEMİR Atatürk Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Zootekni Bölümü, 25240 Erzurum, Türkiye (ozdemirm@atauni.edu.tr) Geliş Tarihi : 05.09.2011 Kabul Tarihi : 18.01.2012 ÖZET : Bu çalışmada, Doğu Anadolu bölgesinde farklı çiftliklerde yetiştirilen yerli gen kaynağı olarak korunan Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK) yerli sığır ırkı (N=76) ve melezlerinde (51) Büyüme Hormonu (bgh) geni AluI polimorfizmi incelenmiştir. Çalışmada AluI enzimi uygulanan sığır Büyüme Hormonu genine ait üç genotip (LL, LV ve VV) PCR-RFLP metodu kullanılarak tanımlanmıştır. L allel frekansı saf DAK da 0.78, melezlerinde ise 0.79 olarak tespit edilmiştir. Üç genotipin dağılımı saf DAK larda; LL %59, LV %37 ve VV %4, ve melezlerde ise LL %63, LV %33 ve VV %4 şeklinde olmuştur. İncelenen populasyonların CHW dengesinde oldukları gözlendi. Anahtar kelimeler: Büyüme Hormonu, AluI polimorfizmi, Doğu Anadolu Kırmızısı, Sığır, Gen kaynağı. Investigation of Genetic Variation of Growth Hormone Gene on East Anatolian Red and Their Crosses ABSTRACT : The aim of this paper was to genotype the AluI polymorphism of bovine growth hormone (bgh) gene on the 76 native resource EAR and 51 their crosses breeds reared from different farms over the East Anatolian region. Three genotypes (LL, LV and VV) of the bovine growth hormone gene digested with AluI enzyme were identified by Polymerase Chain Reaction Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) in the experiment. For native EAR and Crosses the frequency data of L allele were 0.78 and 0.79 respectively. Distribution of the three genotypes were for native EAR and their Crosses 59% (LL), 37% (LV) and 4% (VV), and 63% (LL), 33% (LV) and 4% (VV) respectively. The studied populations were in CHW equilibrium considering the genotype distribution. Keywords: Growth Hormone, AluI polymorphism, East Anatolian Red, Cattle, Genetic resource GİRİŞ Çiftlik hayvanlarında ırk alt grupları arasındaki genetik benzerliklerinin yada farklılıkların ölçülmesi çeşitli ıslah programlarının etkinliğini ölçmek için gereklidir. Çeşitli allel genlerin ve genotiplerin populasyonlar arasında gösterdiği varyasyon ilgili gen, genotip frekanslarının bir fonksiyonu olarak incelenebilmektedir. Populasyonlarda mevcut genetik varyasyonun araştırılması başarılı yetiştirme stratejilerinin geliştirilmesinde yetiştiricilere yardımcı olabilir (Özdemir ve Doğru, 2007). Geçtiğimiz yarım yüzyıl içerisinde Türkiye de çiftlik hayvanları gen kaynakları bakımından kayıplar olduğu bilinmektedir. Bu süreç günümüzde de artan bir ivme ile devam etmekte, farklı türlerden çeşitli genotiplerde hızlı bir azalma yaşanmaktadır. Oysa yerli ırklar yüzyıllardır yetiştirildikleri çevrenin kendine özgü koşullarına çok iyi uyum sağlamış, verimleri düşük olsa bile özgün nitelikleri olan, dayanıklı, kanaatkâr, yetersiz çevre koşullarında üreyebilen hayvanlardan oluşur. Yerli ırkların yok olması, taşıdıkları bu ayırıcı özelliklerin de yok olması anlamına gelmektedir. Gelecekte bu özelliklerin hangisine gereksinim duyulacağı şimdiden tahmin etmek güç veya olanaksızdır. Kaldı ki bu gen kaynaklarının bugün saptanmamış olan olası özellikleri de ancak bunların varlıklarını sürdürebilmesi halinde elde tutulabilir (Ertuğrul vd., 2000). Gen kaynağı olarak koruma altına alınmış olan yerli sığır ırklarımızdan, Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK), Boz ırk ve Kilis sığırı tehdit altında, Yerli Kara ve Zavot sığır ırkları ise ağır tehdit altında bulunan gen kaynaklarımız olarak bildirilmektedir (Ertuğrul ve ark., 2010). Doğu Anadolu Kırmızısı nın özgün yapısı; yetiştirici tercihleri, hayvan transferleri, çeşitli ıslah programları gibi birçok yöntemle generasyondan generasyona değişime uğramakta ve Doğu Anadolu bölgesinin hakim sığır ırkını kaybetmeyle karşı karşıya bulunmaktayız. Öyle ki elde bulunan ve gen kaynağı olarak koruma altında tutulan ırkların saflığından bile şüphe duyulmaya başlanmaktadır. Bu da yerli gen kaynaklarının kaybolmasındaki artan risk karşısında bunlara dair en doğru genetik bilgiyi içerecek araştırma ve tanımlamaların yapılmasını kaçınılmaz kılmaktadır. Bu genetik varyasyonların bilinmesi sürünün ıslahı ve yönlendirilmesi hususunda da önemlilik arz etmektedir. Sığırlarda Büyüme Hormonu (bgh) 19. kromozom üzerinde 5 ekzon ve 4 introndan oluşan kısımlarıyla 1793 baz çiftinden oluşmaktadır (Fries vd., 1993). Bu haritalama bilgisi, GH geni üzerindeki polimorfik yapıların tespiti ve bu polimorfik yapıların çeşitli verim unsurları üzerine etkilerinin incelenmesi ile ilgili çalışmaları başlatmıştır.

Doğu Anadolu Kırmızısı ve Melezi Sığırların Büyüme Hormonu Geni Genetik Varyasyonunun İncelenmesi GH geninin ürünü olan GH, memelilerde doğum sonrası büyüme ve metabolizmanın ana düzenleyicisidir. GH, büyüme hızını, vücut kompozisyonunu, sağlığı, süt verimini ve bu işlemlerde görev alan birkaç genin ekspresyonunu düzenleyerek yaşlanmayı etkilemektedir (Ge vd., 2003). Bu nedenle GH geni çiftlik hayvanlarında süt üretimi, büyüme regülasyonu, karkas ve immun sistemi ile ilgili genetik markör tanımlamak için iyi bir aday gen olarak düşünülmüştür. ( Yao vd., 1996; Ge vd., 2003). bgh genindeki polimorfizmler sığırlarda birkaç verim özelliği ile; süt verimi ve kalitesiyle (Lucy vd., 1993; Lagziel vd., 1996; Sabour vd., 1997; Dybus, 2002; Pal vd., 2005; Kovacs vd., 2006; Zhou vd., 2006; Pawar vd., 2007; Sadeghi vd., 2008), büyümeyle (Rocha vd., 1992; Falaki vd., 1996; Unanian vd., 2000), dölverim özellikleriyle (Mullen vd., 2011) ve karkas kompozisyonu ve kalitesiyle (Schlee vd., 1994a, b; Taylor vd., 1998; Lagziel vd., 1999; Grochawska vd., 2001) ilişkili olarak bildirilmiştir. bgh, doğum sonrası büyüme ve genel metabolizmada ayrıca laktasyonda önemli rol oynadığı için önemlidir. Mevcut bilgiler, besin kullanımında (Bauman, 1992), meme gelişiminde (Sejrsen vd., 1986) ve büyümede (Bass vd., 1991) bgh nun çok önemli bir güce sahip olduğunu göstermektedir. Mevcut çalışmada amaç, bazı işletmelerde koruma altında tutulan saf Doğu Anadolu Kırmızısı ırkı ve bölgede yetiştirilen Melezlerinin bgh geni AluI polimorfizmi genetik varyasyonunu PCR-RFLP yöntemi ile incelemek, ırk gruplarına ait bgh geni bakımından genetik farklılıkları ortaya koymaktır. MATERYAL VE METOD Araştırmada gen kaynağı olarak yerinde koruma programında yer alan işletmelerden 54 baş ve Doğu Anadolu Tarımsal Araştırma Enstitüsü nden 22 baş olmak üzere toplam 76 baş saf Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK) sığırın kan örneği ile Erzurum iline bağlı çeşitli köylerde yetiştirilen 51 baş Doğu Anadolu Kırmızısı Melezi sığırın kan örnekleri vakumlu K 3 EDTA lı tüplere alınmıştır. Genomik DNA, Purgene DNA izolasyon kiti (Gentra Systems, Minnesota, USA) vasıtasıyla elde edilmiş ve 4 o C de saklanmıştır. NCBI (National Centre for Biotechnology Information) GenBank dizilerinden (Genbank Giriş no: M57764) primer3 programı (Rozen ve Skaletsky, 2000) vasıtasıyla sığır Büyüme Hormonuna sipesifik bir çift primer (5 -GTA GGG GAG GGT GGA AAA TG-3 ve 5 -TGA CCC TCA GGT ACG TCT CC- 3 ) 245 bazçifti bölgeyi çoğaltmak için oluşturuldu. PCR reaksiyonu; 1 µm her bir Primer, 1 µl dntp (D7595: Sigma, St. Louis, MO, USA), 0.5 U Taq DNA Polimeraz (D1806: Sigma, St. Louis, MO, USA), yaklaşık 200 ng DNA, 3µl 10x PCR Buffer (100mM Tris-HCl, ph 8.3, 500mM KCl, 15 mm MgCl 2 ve 0.01% jelatin), 1µl 25 mm lık MgCl 2 ve distile su ilavesiyle 30 µl hacimde gerçekleştirilmiştir. PCR reaksiyon şartları; 94 o C de5 dk, 94 o C de 45 s, 58 o C de 45 s ve 72 o C de 45 s 30 döngü, ve son olarak 72 o C de 7 dk dır. Çoğaltma işlemi tamamlanan ürünler sonraki adımda kullanılıncaya kadar -20 o C de depolanmıştır. 0.2 µl lik ependorf tüp içerinden her bir PCR ürününün 7-10 µl si 5 U AluI enzimiyle reaksiyona sokularak 37 o C de inkübasyona bırakılmıştır. Her bir kesim ürünü %2 lik agaroz jelde 45 V da 2 saat yürütülerek Etidyum Bromür varlığında UV ışıkta görüntülenmiştir. Her bir sığır ırkına ait bgh allel gen frekansları sayılarak hesaplanmıştır. Genotip frekanslarının Castle Hardy-Weinberg dengesinde olup olmadığı Ki-kare (χ 2 ) testiyle incelenmiştir. SONUÇ VE TARTIŞMA Toplam 245 baz çifti uzunluğundaki her bir PCR ürünü, AluI restriksiyon enzimi ile kesilerek bant sayılarına göre genotiplenmiştir. Teorik olarak VV genotipi 208 ve 37 bp, LL genotipi 157, 51 ve 37 bp ve heterozigot LV genotipi 208, 157, 51 ve 37 bp bantlara sahiptir. İncelenen her iki populasyonda da her üç genotip gözlenmiştir (Şekil 1). Şekil 1: Agaroz jelde bgh geni AluI Genotipleri 160

M. Özdemir bgh AluI polimorfizmi genotip ve allel gen frekansları Çizelge 1 de gösterilmiştir. İncelenen 127 sığıra ait genotip frekansları LL genotipi 0.61, LV genotipi 0.35 ve VV genotipi 0.04 şeklindedir. Sığırların genelinde allel gen frekansları L geni için 0.78 ve V geni için 0.22 şeklindedir. Saf DAK sığırlarda bu allel gen frekanları değişmezken, Melezlerde sırasıyla 0.79 ve 0.21 olarak görülmüştür. Çizelge 1: DAK ve Melezi Sığırlarda bgh/alui Polimorfizmi Genotip Sayıları ve Gen Frekansları. Irk Grupları N Genotip Allel LL LV VV L±SE V±SE Χ 2 DAK 76 45 28 3 0.78 ±0.03 0.22 ±0.03 0.28 ns DAK Melezi 51 32 17 2 0.79 ±0.04 0.21 ±0.04 0.03 ns Genel 127 77 45 5 0.78±0.03 0.22±0.03 0.26 ns Irklar arasında Χ 2 = 0.15 ns, L= lösin V= valin, ns: önemsiz (P>0.05), SE: Standart hata Birçok araştırıcı inceledikleri ırklarda L gen frekansını daha yüksek olarak bildirmektedirler (Çizelge 2). DAK ırkında yapılan daha önceki çalışmalarda (Özdemir 2011; Özkan vd 2009;Yardibi vd 2009), bgh AluI polimorfizminin farklı frekanslarda çıkmasının nedeninin popülasyon büyüklüğü ve örneklemeden kaynaklandığı düşünülmektedir. Çizelge 2. Farklı ırklarda bgh geni AluI polimorfizmi allel gen frekansları Irklar L V Referans Irklar L V Referans Angus 0.80 0.20 Chikuni vd (1991) Guernsey 0.92 0.08 Lucy vd. (1993) Angus 0.77 0.23 Vasconcellos Hereford 0.78 0.22 Chikuni vd (1991) vd(2003) Ayrshire 0.79 0.21 Lucy vd. (1993) Holstein 0.93 0.07 Kovacs vd.(2006) Ayrshire 0.71 0.29 Sabour vd. (1997) Holstein 0.93 0.07 Lucy vd. (1993) Bozırk 0.79 0.21 Özdemir (2011) Holstein 0.90 0.10 Özdemir (2011) Bozırk 0.87 0.13 Özkan vd (2009) Holstein 0.84 0.16 Özkan vd (2009) Brown 1.00 0.00 Lucy vd. (1993) Holstein 0.75 0.25 Pawar vd (2007) Swiss Brown 0.90 0.10 Özdemir (2011) Holstein 0.91 0.09 Sabour vd. (1997) Swiss Charolais 0.72 0.28 Kemenes vd(1999) Holstein 0.94 0.06 Sadeghi vd (2008) DAK 0.95 0.05 Özdemir (2011) Holstein 0.92 0.08 Vukasinovic vd (1999) DAK 0.84 0.16 Özkan vd (2009) Jersey 0.56 0.44 Lucy vd. (1993) DAK 0.43 0.57 Yardibi vd (2009) Jersey 0.76 0.24 Sabour vd. (1997) DAK 0,78 0,22 Mevcut çalışma Simmental 0.71 0.29 Shlee vd (1994a) GAK 0.44 0.56 Yardibi vd (2009) Simmental 0.82 0.18 Vasconcellos vd (2003) DAK:Doğu Anadolu Kırmızısı, GAK:Güney Anadolu Kırmızısı Irk grupları arasında ve içinde bgh AluI polimorfizmi bakımından genetik denge söz konusudur. (Çizelge 1). Bu durum incelenen ırk gruplarının seleksiyon, akrabalı yetiştirme ve hayvan transferleri gibi dengeyi bozucu durumlardan henüz önemli derecede etkilenmediğini göstermektedir. bgh genotiplerinin ırk gruplarına homojen şekilde dağıldığı gözlenmiştir (P>0.05). Bölgede yetiştiriciliği yapılan DAK ırkının yıllarca yapılan melezleme çalışmalarına rağmen, büyüme hormonu geni polimorfizmi bakımından fazla bir değişmenin olmadığı, ya da mevcut allel gen frekanslarının bu melezleme çalışmalarından fazla etkilenmediği sonucuna varılabilir. Ancak bu durum melezlemede kullanılan kültür ırklarınında bgh AluI polimorfizmi bakımından yakın allel gen frekansına sahip olmalarından da kaynaklanmış olabilir. Her ne kadar farklı ırklarla çeşitli melezleme çalışmaları sonucu bgh geni olarak frekans değişikliği olmasa da, eskiden bölgenin hakim sığırı olan saf DAK sığırlarının sayısının giderek azaldığı gözlerden kaçmamakta, ancak yerinde koruma ile küçük de olsa bu gen kaynaklarının yok olmasının önüne geçilmeye çalışılmaktadır. Nitekim mevcut uygulamanın dahi 161

Doğu Anadolu Kırmızısı ve Melezi Sığırların Büyüme Hormonu Geni Genetik Varyasyonunun İncelenmesi ileriki yıllarda homozigotlaşmaya yol açacağı gerçeği göz önüne alınmalı, her özgün genotipik yapıya sahip sığırın itina ile korunmasına hem kurumlar hem de yetiştiriciler olarak gereken özen gösterilmelidir. Sonuç olarak, incelenen ırk gruplarında allel gen frekanslarındaki mevcut polimorfizmin tespiti genetik çeşitliliğin ortaya konması bakımından önemlilik arz etmektedir. Ancak Büyüme Hormonu genine ilave olarak diğer polimorfik olduğu bildirilen genlerinde araştırılması ve bu genotipler ile sığırlara ait et ve süt gibi önemli verim özelliklerinin ilişkilendirilmesi ve ıslah amaçlı kullanılabilmesi için daha ileri çalışmaların yapılmasına ihtiyaç duyulmaktadır. TEŞEKKÜR Bu çalışma Atatürk Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri (BAP Proje no:2009/45) Müdürlüğü tarafından desteklenmiştir. Desteklerini esirgemeyen BAP çalışanlarına teşekkürlerimi sunarım. KAYNAKLAR Bass, J.J., Oldham, J.M., Hodgkinson, S.C., Fowke, P.J., Sauerwein, H., Molan, P., Breier, B.H., Gluckman, P.D. 1991. Influence of nutrition and bovine growth hormone (GH) on hepatic GH binding, insulin-like growth factor-i and growth of lambs. J. Endocrinol, 128(2):181-186. Bauman, D.E., 1992. Bovine somatotropin: review of an emerging animal technology. J. Dairy Sci. 75 (12):3432-3451. Chikuni K., Terada, F., Kageyama, S., Koishikawa, T., Kato, S., Ozutsumi, K., 1991. Identification of DNA sequence variants for amino acid residues 127 of bovine growth hormone using the polymerase chain reaction method. Animal Science and Technology 62, 660-666. Dybus, A., 2002. Associations between Leu/Val polymorphism of growth hormone gene and milk production traits in Blackand-White cattle. Arch. Tierz. Dummerstorf 45 (5): 421-428. Ertuğrul, M., Akman, N., Dellal, G., Goncagül, T., 2000. Hayvan Gen Kaynaklarının Korunması ve Türkiye Hayvan Gen Kaynakları. Türkiye Ziraat Mühendisliği V. Teknik Kongresi. Yayın No:38, Ankara. Ertuğrul, M, Dellal G., Elmacı C., Akın O.A., Pehlivan, E., Soysal, M.İ., Arat, S., 2010. Çiftlik hayvanları genetik kaynaklarının korunması ve sürdürülebilir kullanımı. Türkiye Ziraat Mühendisliği VII. Kongresi. Ankara. Falaki, M., Gengler, N., Sneyers, M., Prandi., A, Massart, S., Formigoni, A., Burny, A., Portetelle, D., Renaville, R., 1996. Relationships of polymorphisms for growth hormone and growth hormone receptor genes with milk production traits for Italian Holstein-Friesian bulls. J. Dairy Sci.79(8):1446-1453. Fries, R., Egen, A., Womack, J.E. 1993. The bovine genome map. Mamm. Genome. 4:405. Ge, W., Davis, M.E., Hines, H.C., Irvin, K.M., Simmen, C.M. 2003. Association of single nucleotide polymorphisms in the growth hormone and growth hormone receptor genes with serum insulin-like growth factor I concentration and growth traits in Angus cattle. J. Anim. Sci., 81:641 648. Grochowska, R., Lunden, A., Zwierzchowski, L., Snochowski, M., Oprzadek, J., 2001. Association between gene polymorphism of growth hormone and carcass traits in dairy bulls. Anim. Sci. 72: 441-447. Kemenes, P.A., Reginato, L.C.A., Rosa, A.J.M., Parker, I.U., Razook G.A., 1999. β-casein, κ-lactoglobulin and growth hormone allele frequencies and genetic distances in Nelore, Gyr, Guzer, Caracu, Charolais, Canchin and Santa Gertrudis cattle. Genet. Mol. Biol., 22: 539-541. Kovacs, K., Volgyi-Csik, J., Zsolnai, A., Gyorkos I. and Fesus, L., 2006. Associations between the AluI polymorphism of growth hormone gene and production and reproduction traits in a Hungarian Holstein-Friesian bull dam population. Archiv fur Tierzucht, 49, 236 249. Lagziel, A., Lipkin, E., Soller, M., 1996. Association between SSPC haplotypes at the bovine growth hormone gene and milk protein percentage. Genetics, 142: 946-951. Lagziel, A., Lipkin, E., Ezra, E., Soller, M., Weller, J.I. 1999. An MspI polymorphism at the bovine growth hormone (bgh) gene is linked to a locus affecting milk protein percentage. Animal Genetics, 30: 296-299. Lucy, M.C., Hauser, S.D., Eppard, P.J., Krivi, G.G., Clark, J.H., Bauman, D.E., Collier, R.J., 1993. Variants of somatotropin in cattle- gene frequencies in major dairy breeds and associated milk-production. Domestic Animal Endocrinology, 10(4): 325-333. Abst. Mullen, M.P., Lynch, C.O., Waters, S.M., Howard, D.J., O Boyle, P., Kenny, D.A., Buckley, F., Horan B., Diskin, M.G. 2011.Single nucleotide polymorphisms in the growth hormone and insulin-like growth factor-1 genes are associated with milk production, body condition score and fertility traits in dairy cows. Genetics and Molecular Research 10 (3): 1819-1830. Özdemir, M., 2011. Determination of allele frequencies of growth hormone AluI polymorphism in Brown Swiss, Holstein, native East Anatolian Red and Turkish Grey breeds. International Journal of Dairy Technology. 64(3):350 352. Özdemir, M, Doğru U., 2007. Genetik karakterizasyonda mitokondriyal DNA kullanımı. Atatürk Üniv. Zir. Fak. Derg. 38 (1) 105-111. Özkan, E., Soysal, M.İ., Dinç, H., Sönmez, G., Okyar, M., Togan İ., 2009.Türkiye sığır ırklarında büyüme hormonu AluI ve MspI polimorfizminin PZR-RFLP yönteminin kullanılarak belirlenmesi. 6. Ulusal Zootekni Kongresi, 24-26 Haziran, Erzurum, 93-102. Pal, A., Chakravarty, A.K., Bhattacharya, T.K., Sharma, A. 2005. Polymorphism of growth hormone gene and its association with expected milk production traits in dairy bulls. J. Appl. Anim. Res. 27(1): 29-33. Pawar, R.S., Tajane, K.R., Joshi, C.G., Rank, D.N., Bramkshtri, B.P., 2007. Growth hormone gene polymorphism and its association with lactation yield in dairy cattle. Indian J. Anim Sci. 77(9):884-888. Rocha, J. L., Baker, J. F., Womack, J. E., Sanders, J. O., Taylor, J. F. 1992. Statistical associations between restriction fragment length polymorphisms and quantitative traits in beef cattle. J. Anim.Sci. 70: 3360 3370. Rozen, S., Skaletsky, H.J., 2000. Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers. In Bioinformatics Methods and Protocols: Methods in Molecular Biology, pp 365 386. Krawetz S, Misener S, eds. Totowa, NJ, USA: Humana Press, Source code available at http://fokker.wi.mit.edu/primer3/. (27/04/2005). Sabour, M.P., Lin,C.Y., Smith, C.1997. Association of genetic variants of bovine growth hormone with milk production traits in Holstein cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics, 114 : 435-442. Sadeghi, M., Moradi Shahr-e-Babak, M., Rahimi G., Javaremi, A. N. 2008. Association Between Gene Polymorphism of Bovine Growth Hormone and Milk Traits in the Iranian Holstein Bulls. Asian Journal of Animal Sciences, 2:1-6. Schlee, P., Graml, R., Rottmann, O., Pirchner, F. 1994a. Influence of growth hormone genotypes on breeding values of Simmental bulls. Journal of Animal Breeding and Genetics, 111: 253-256. 162

M. Özdemir Schlee, P., Graml, R., Schallenberger, E., Schams, D., Rottmann, O., Olbrich B.A., Pirchner F. 1994b. Growth hormone and insulin like growth factor I: concentration in bulls of various growth hormone genotypes. Theoretical and Applied Genetics, 88:497-500. Sejrsen, K., Foldager, J., Sorensen, M.T., Akers, R.M., Bauman, D.E. 1986. Effect of exogenous bovine somatotropin on pubertal mammary development in heifers. J. Dairy Sci. 69(6):1528-1535. Taylor, J. F., Coutinho, L. L., Herring, K. L., Gallagher Jr, D. S., Brenneman, R. A., Burney, N., Sanders, J. O., Turner, J. W., Smith, S. B., Miller, R. K., Savell, J. W., Davis, S. K., 1998. Candidate Gene Analysis of Gh1 for effects on growth and carcass composition of cattle. Anim. Genet. 29:194-201. Unanian, M. M., Barreto, C. C., Freitas, A. R., Cordeiro, C. M. T., Josahkian, L. A., 2000. Association of growth hormone gene polymorphisms with weight traits in Nelore breed.. Rev. Bras. Zootec. 29:1380-1386. Vasconcellos, L.P.M.K., Tambasco, D.D., Pereira, A.P., Coutinho, L.L., Regitano, L.C.A. 2003. Genetic characterization of Aberdeen Angus cattle using molecular markers. Genetics and Molecular Biology. 26(2):133-137. Vukasinovic, N., Denise, S.K., Freeman, A.E., 1999. Association of growth hormone loci with milk yield traits in Holstein Bulls. Dairy Sci. 82(4):788-794. Yardibi, H., Hosturk, G.T., Paya, I., Kaygısız, F., Çiftçioğlu, G., Mengi, A., Oztabak, K., 2009. Associations of growth hormone gene polymorphism with milk production traits in South Anatolian and East Anatolian Red cattle. J Anim Vet Adv, 8, 1040-1044. Yao, J., Aggrey, S.E., Zadworny D., Hayes, J.F., Kuhnlein, U. 1996. Sequence variations in the bovine growth hormone gene characterized by single-strand conformation polymorphins (SSCP) analysis and their association with milk production traits in Holsteins. Genetics, 144:1809-1816. Zhou, G., Zhu, Q., Jin, H.G., Guo, S.L., 2006. Genetic variation of growth hormone gene and its relationship with milk production traits in China Holstein cows. Asian-Australasian J. of Anim. Sci. 19(3):315-318. 163