Doç. Dr. Ayça Arslan-Ergül

Transkript

1 Doç. Dr. Ayça Arslan-Ergül Hacettepe Üniversitesi Kök Hücre Merkezi Ankara, Türkiye aycaergul at hacettepe.edu.tr Eğitim Doktora, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Bilkent Üniversitesi, Ankara Kapsamlı Burslu Danışman: Prof. Mehmet Öztürk Tez: Hepatoselüler karsinogenez belirteci olarak yaşlanma ve ölümsüzlük genleri Yüksek Lisans, Temel Hepatoloji, Ankara Üniversitesi, Ankara Araştırma Görevlisi Danşman: Prof. Hakan Bozkaya Tez: B hepatiti etiolojisinde konağa ait genetik faktörler Lisans, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Boğaziçi Üniversitesi, Istanbul Mersin Fen Lisesi, İçel 2018-Halen Deneyim Hacettepe Üniversitesi, Kök Hücre Merkezi, Ankara Uzman Hacettepe Üniversitesi, Transgenik Hayvan Teknolojileri Merkezi, Ankara Uzman TED Üniversitesi, Temel Bilimler Birimi, Ankara Okutman Bilkent Üniversitesi, Disiplinlerarası Sinirbilim Programı, Ankara Okutman Bilkent Üniversitesi, Michelle Adams Lab, Ankara Doktora sonrası araştırmacı, EMBO projesi Bilkent Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Ankara Okutman Strathclyde Üniversitesi, Strathclyde Eczacılık ve Biyomedikal Bilimleri Enstitüsü, Glasgow, Birleşik Krallık Araştırma Görevlisi Bilkent Üniversitesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, Ankara Araştırma ve Öğretim Asistanı Bilkent Laboratuvar ve Uluslararası Okulu, Fen Bölümü, Ankara Öğretmen Ankara Üniversitesi, Hepatoloji Laboratuvarı, Ankara HCV tanı testleri Bogazici Üniversitesi, Psikobiyoloji Laboratuvarı, Istanbul Staj 1/8

2 1998 Yaz Düzen Laboratuvarı, MolekülerBiyoloji Ünitesi, Istanbul Staj Proje and Destekler Yürütücü, Van Gölü İnci Kefali Genom Projesi Kapsamında İnci Kefali Balığının (Chalcalburnus tarichi) Genom ve Transkriptom Düzeylerinde Karakterizasyonu, TÜBİTAK 1001, Ulusal Yürütücü, İnsan htert Geni Promotor Bölgesinin Beyin Kanseri Hücre Hatlarında İncelenmesi, Hacettepe Üni. BAP, Ulusal Yürütücü, Yaşlanan Zebrabalığı Beyninden Kök Hücre Eldesi, TUBITAK 1001, Ulusal Danışman, Sinirsel Yaşlanma Sürecinde Hareket Algısı ve Anahtar Sinaptik Hedefler Arasındaki Fonksiyonel Bağlantılar, TUBITAK 1001, Ulusal Danışman, Mtor Mutantlarında Kalori Kısıtlaması Ve Yaş Arasındaki Etkileşim, TUBITAK 1001, Ulusal Araştırmacı, Zebra Balığı Modellerinde Yaşlanma Sürecinde Nörogenezis Karşılaştırması, TUBITAK 1002, Ulusal; Yürütücü: Michelle Adams Araştırmacı, Impact of Caloric Restriction on Age-Related Alterations in Synaptic Integrity Underlying Cognitive Decline in Zebrafish, EMBO Yerleşim Desteği, Michelle Adams, Uluslarası Bursiyer, Siroz ve Hepatoselüler Kanserde Yaşlanma ve Ölümsüzlük Genleri ve İşlevsel Ağlar, TUBITAK 1001, Ulusal; Yürütücü: Mehmet Ozturk Lab Cihaz Bilgisayar Beceriler Mikroarray deneyleri, mikroarray data analizi, hücre ve doku kültürü, RNA izolasyonu, eş zamanlı PCR, western blot, HCV ve HBV izolasyonu ve PCR, yaşlanma ve çoğalma deneyleri, PBMC izolasyonu, immunofluoresan, immunoperoksidaz, akış sitometrisi, bakteri transformasyonu, geçici ve kalıcı transfeksiyon, sitotoksisite deneyleri, zebrabalığı deneyleri, doku eldesi, beyin doku kesitleri ve boyamaları. Affymetrix GeneChip Instruments, Agilent 2100 Bioanalyzer, Techne 512 thermal cycler, Invitrogen XCell blotting system, Perkin Elmer 9600 thermal cycler, Stratagene qpcr, NanoDrop spectrophotometer, BD FACSCalibur, BioRad qpcr, Leica microscope, Zeiss microscope (light/fluorescent/axiocam), Roche Amplicor HCV monitor, Leica Vibratome MS Office, L A TEX, BRB Array Tools, Photoshop CS, iwork Ödüller 2017 BAGEP, Bilim Akademisi, Istanbul 2015 Fark Yaratanlar, Sabancı Vakfı, Istanbul 2008 İkincilik, Poster Ödülü, EMBO Genç Araştırmacılar Toplantısı, Istanbul 2007 Birincilik, Poster Ödülü, II. Moleküler Tıp, Istanbul 2007 Burs, EASL Temel Hepatoloji Okulu, Lisbon 2005 Burs, 40th EASL Yıllık Toplantısı, Paris 2/8

3 Eylül 2016 Mart 2016 Ocak 2016 Nisan 2015 Mart 2015 Ocak 2015 Kasım 2014 Davetli Konuşmalar Haydi Arkadaşlar Bilim Başına. TRT Radyo 1, Ankara Haydi Arkadaşlar Bilim Başına. Türkiye İnovasyon Haftası, İzmir Haydi Arkadaşlar Bilim Başına. TRT Radyo 1, Ankara Zebrabalığı beyninde kalori kısıtlamasının hücre bölünmesine etkisi. ITQB, Universidade NOVA de Lisboa Lisbon, Portugal Beyin Yaşlanması ve Yeni Hücre Oluşumu. Ankara Sanayi Odasi, Ankara Kalori kısıtlamasının zebrabalığı beyninde hücre bölünmesine etkisi, Bilkent Üniversitesi, EMBO-MBD Kış İnzivası, Ankara Daha az yiyerek daha çok beyin hücresi yapabilir miyiz? Bilkent Üniversitesi, MBG, Ankara Haziran 2014 Daha az yiyerek daha çok beyin hücresi yapabilir miyiz? IYTE, Biyolojik Bilimler Bölümü, İzmir Haziran 2014 Aralık 2013 Haziran 2013 Mayıs 2013 Aralık 2012 Mart 2012 Ekim 2011 Daha az yiyerek daha çok beyin hücresi yapabilir miyiz? 9 Eylül Üniversitesi, Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü, İzmir Yaşlanma, Nörogenez ve Zebrabalığı Beyni. ODTÜ, Biyolojik Bilimler, Ankara Kanser, Yaşlanma, ve Zebrabalığı. Dışkapı Yıldırım Beyazıt Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Ankara Yaşlanma, Nörogenez ve Zebrabalığı Beyni. Arel Üniversitesi, 1. Uluslarası Moleküler Biyoloji ve Genetik Öğrenci Kongresi, Istanbul Yaşlanma, Kalori Kısıtlaması, ve Zebrabalığı Beyni, Bilkent Üniversitesi, Moleküler Biyoloji and Genetics, Ankara Stem Cells. Notre Dame High School, Glasgow, UK Being a Molecular Biologist. Turnbull High School, Glasgow, UK Motivasyon Konuşmaları Haydi Arkadaşlar Bilim Başına Ankara, Samsun, Denizli de, 4000 e yakın öğrenciye 35 lisede 55 konuşma. BIO 110 NSC 516 NSC 513 MBG 222 MBG 223 MBG 110 Öğretim Deneyimi Okutman TED Üniversitesi, Ankara, Turkey Introduction to Modern Biology; 2 dönem Güz, 2017 Bahar Bilkent Üniversitesi, Ankara, Turkey Neurobiology of Aging; 1 dönem Bahar Behavioral Neuroscience; 3 dönem Güz, 2015 Güz, 2014 Güz Fundamentals of Molecular Genetics; 3 dönem Bahar, 2014 Bahar, 2013 Bahar Molecular Genetics; 3 dönem Bahar, 2014 Bahar, 2013 Bahar Introduction to Modern Biology; 2 dönem Bahar, 2013 Güz Öğretmen Bilkent Laboratuvar ve Uluslararsı Okulu, Ankara 2008 Güz IGCSE Kimya, 8, 9, 10. Sınıflar 3/8

4 2008 Güz 8. Sınıf Öğretmeni Bilim Fuarı Proje Danışmanı MBG 502 MBG 338 MBG 101 MBG 301 MBG 302 Assistan Bilkent Üniversitesi, Molecular Biology and Genetics, Ankara, Turkey Advanced Cell Biology; 1 dönem Bahar Microbiology; 4 dönem Bahar, 2007 Bahar, 2006 Bahar, 2004 Güz, Biology; 1 dönem Güz Molecular Biology of the Cell I; 2 dönem Güz, 2005 Güz Molecular Biology of the Cell II; 1 dönem Bahar Ankara Üniversitesi, Basic Hepatology, Ankara, Turkey 2003/2004 Recombinant DNA Teknolojisi Karaciğer hücreleri ve biyolojisi 2002/2003 Hepatit C virusü moleküler biyolojisi Temel Genetik Kavramlar Yayınlar Dergi Yayınları 13 Oskay Y, Cetin B, Serifoglu N, Arslan-Ergül A, Adams MM. A novel, low-cost anesthesia and injection system for zebrafish researchers. Zebrafish 2017 Dec Karoglu ET, Halim DO, Erkaya B, Altaytas F, Arslan-Ergül A, Konu O, Adams MM. Aging alters the molecular dynamics of synapses in a sexually dimorphic pattern in zebrafish (Danio rerio). Neurobiol Aging Feb 20;54: Arslan-Ergül A, Erbaba B, Karoglu ET, Halim DO, Adams MM. Short-term dietary restriction in old zebrafish changes cell senescence mechanisms.neuroscience 2016 Oct 15;334: Arslan-Ergül A, Adams MM. Gene expression changes in aging Zebrafish (Danio rerio) brains are sexually dimorphic. BMC Neuroscience Feb 18, Arslan-Ergul A, Halim DO, Adams M. Bromodeoxyuridine (BrdU) labeling and immunohistochemical detection in adult zebrafish brain. Protocol Exchange, 2013; doi: /protex Online Publication 8 Arslan-Ergül A, Ozdemir AT, Adams MM. Aging, neurogenesis, and caloric restriction in different model organisms. Aging and Disease Jun 17;4(4): Karatayli SC*, Ulger ZE*, Ergul AA*, Keskin O, Karatayli E, Albayrak R, Ozkan M, Idilman R, Yalcin K, Bozkaya H, Uzunalimoglu O, Yurdaydin C, Bozdayi AM. Tumour necrosis factor-alpha, interleukin-10, interferon-gamma and vitamin D receptor gene polymorphisms in patients with chronic hepatitis delta. J Viral Hepat 2013, July 22. (*: equal contribution) 6 Yildiz G*, Arslan-Ergul A*, Bagislar S*, Konu O, Yuzugullu H, Gursoy-Yuzugullu O, Ozturk N, Ozen C, Ozdag H, Erdal E, Karademir S, Sagol O, Mizrak D, Bozkaya H, Ilk HG, Ilk O, Bilen B, Cetin-Atalay R, Akar N, Ozturk M. Genome-wide transcriptional reorganization associated with senescence-to-immortality switch during human hepatocellular carcinogenesis. Plos ONE 8(5): e64016 (*equal contribution) 5 Ergül O, Arslan-Ergül A, Gürel L. Computational study of scattering from healthy and diseased red blood cells. J Biomedical Optics 2010 Jul-Aug;15(4): /8

5 4 Ozturk M, Arslan-Ergul A, Bagislar S, Senturk S, Yuzugullu H. Senescence and immortality in hepatocellular carcinoma. Cancer Letters 2009 Dec 1;286(1): Epub 2008 Dec Koytak ES, Mizrak D, Bektas M, Verdi H, Arslan-Ergul A, Idilman R, Cinar K, Yurdaydin C, Ersoz S, Karayalcin K, Uzunalimoglu O, Bozkaya H. PPAR-alpha L162V polymorphism in human hepatocellular carcinoma. Turkish Journal of Gastroenterology 2008 Dec;19(4): Ozturk N, Erdal E, Mumcuoglu M, Akcali KC, Yalcin O, Senturk S, Arslan-Ergul A, Gur B, Yulug I, Cetin-Atalay R, Yakicier C, Yagci T, Tez M, Ozturk M. Reprogramming of replicative senescence in hepatocellular carcinoma-derived cells. Proceedings of National Academy of Sciences USA 2006;103(7): Verdi H, Koytak ES, Onder O, Arslan-Ergul A, Cinar K, Idilman R, Erden E, Bozdayi AM, Yurdaydin C, Uzunalimoglu O, Bozkaya H. Peroxisome Proliferator-Activated Receptor alpha L162V Polymorphism in Nonalcoholic Steatohepatitis and Genotype 1 Hepatitis C Virus-Related Liver Steatosis. Journal of Investigative Medicine 2005;53(7):353-9 Dergilerde Basılan Konferans Yayınları 9 Karoglu ET, Tuz MU, Burhan OP, Kinali M, Arslan-Ergul A, Konu O, Adams M. SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 (Smurf2) and its potential effects on inhibitory transmission in aging, FEBS J, 2016, 283: Arslan-Ergul A, Adams M. Gene Expression Changes In Aging Zebrafish (Danio Rerio) Brains Across Lifespan. J Neurol Sci Turk, May Ozturk N, Erdal E, Mumcuoglu M, Akcali KC, Yalcin O, Senturk S, Arslan-Ergul A, Tez M, Ozturk M. Induction of replicative senescence in hepatocellular carcinoma cells. FEBS Journal 2006;273(Suppl1):224 6 Senturk S, Arslan-Ergul A, Ozturk N, Akkiz H, Ozturk M. Role of TGF-b signaling in hepatocellular senescence. FEBS Journal 2006;273(Suppl1):225 5 Ulger Z, Emir F, Arslan-Ergul A, Idilman R, Yalcin K, Uzunalimoglu O, Bozkaya H, Bozdayi AM, Yurdaydin C. Potential role of cytokine gene polymorphisms in outcome of chronic delta hepatitis. Hepatology 2006;44(Suppl1):677A 4 Arslan-Ergul A, Yurdaydin C, Koytak ES, Idilman R, Uzunalimoglu O, Bozdayi AM, Bozkaya H. Potential role of cytokine gene polymorphisms in hepatitis B infection outcome. Journal of Hepatology 2005;42(Suppl2):230 3 Arslan-Ergul A, Yurdaydin C, Koytak ES, Idilman R, Uzunalimoglu O, Bozdayi AM, Bozkaya H. Potential role of cytokine gene polymorphisms in hepatitis B infection outcome. Turkish Journal Gastroenterology 2004:15(Suppl1):22 2 Koytak ES, Verdi H, Idilman R, Cinar K, Akbiyik F, Tuzun A, Arslan-Ergul A, Bozdayi AM, Cetinkaya H, Ozden A, Yurdaydin C, Uzunalimoglu O, Bozkaya H. Ppar-alpha L162V polimorphism in liver steatosis caused by nonalcoholic steatohepatitis and chronic hepatitis C. Turkish Journal Gastroenterology 2004;15(Suppl1):22 1 Koytak ES, Verdi H, Akbiyik F, Ergul AA, Idilman R, Cinar K, Bozdayi M, Yurdaydin C, Uzunalimoglu O, Bozkaya H. PPAR-alpha L162V polymorphism in human hepatocellular carcinoma. Gastroenterology 2004;126(Suppl2) Konferanslar 5/8

6 22 Serifoglu N, Adams M, Arslan-Ergul A. Analysis Of Point Mutations And Dna Methylation In Human Telomerase Promoter Region In Brain Cancer Cell Lines. 5th International Congress Of The Molecular Biology Association Of Turkey, Eylül, Erbaba B, Burhan OP, Senol E, Akilli N, Adams M, Arslan-Ergul A. Isolation, Manipulation And Transplantation Of Aged Zebrafish Brain Stem Cells. 5th International Congress Of The Molecular Biology Association Of Turkey, Eylül, Erbaba B, Burhan OP, Senol E, Akilli N, Adams M, Arslan-Ergul A. Isolation, Manipulation And Transplantation Of Aged Zebrafish Brain Stem Cells. Embo Conference On Advances In Stem Cells And Regenerative Medicine, Mayıs, Arslan-Ergul A, Adams M. Gene expression changes in old zebrafish (Danio rerio) following short-term dietary restriction. EMBO Young Scientist Forum, Eylül, Arslan-Ergul A, Halim DO, Adams M. Effect of caloric restriction on neurogenesis in zebrafish. EMBO Workshop, İstanbul, Ozturk AR, Bozlak E, Muratoglu B, Adams M, Arslan-Ergul A. Zebrafish Gene Expression Exhibit Individual and Gender Difference Independent of Conditions. Molecular Biology Association Annual Congress, İzmir, Arslan-Ergul A, Halim DO, Karoglu ET, Adams M. Cell Proliferation in Zebrafish Brain. Molecular Biology Association Annual Congress, İzmir, Arslan-Ergul A, Adams M. Gene expression is variable in the aging Zebrafish (Danio rerio) brain. 8th European Zebrafish Meeting, Barcelona, Arslan-Ergul A, Erkaya B, Altaytas F, Halim D, Konu O, Adams M. Zebrafish (Danio rerio) brain aging has a sexually dimorphic Pattern.8th European Zebrafish Meeting, Barcelona, Erkaya B, Altaytas F, Halim D, Arslan-Ergul A, Konu O, Adams M. Brain aging shows a sexually dimorphic pattern in zebrafish (Danio rerio). 4th EMBO Meeting, Nice, Arslan-Ergul A, Bagislar S, Ozturk N, Senturk S, Yuzugullu H, Bozdogan O, Mizrak D, Sayan E, Bozkaya H, Tulchinsky E, Ozturk M. Downregulation and the anti-growth effect of Zeb2 in hepatocellular carcinoma. Joint 4th EORTC Annual Meeting and 1st International Multidisciplinary Cancer Research Congress, Antalya, Arslan-Ergul A, Ozturk M. Investigating the role of protection of telomeres 1 (POT1) in reprogramming of replicative senescence in hepatocellular carcinoma cells. EMBO Young Scientist Forum, Istanbul, Arslan-Ergul A, Bagislar S, Ozturk N, Senturk S, Ozturk M. SMAD interacting protein 1 SIP1 acts as a negative regulator of growth in hepatocellular carcinoma cells. ILCA meeting, Barcelona,2008. Abstract Book: page 9 (Oral Presentation) 9 Senturk S, Arslan-Ergul A, Akkiz H, Ozturk M. TGF-b induces p53/rb-independent, but oxidative stress-dependent cellular senescence in hepatocellular carcinoma cells. ILCA meeting, Barcelona, Abstract Book: page 36 8 Bagislar S, Ozturk N, Arslan-Ergul A, Bilen B, Ozdag H, Ilk G, Ilk O, Akar N, Konu O, Ozturk M. Gene expression profiles reveal common features between reversal of hepatocellular malignancy and cellular senescence. ILCA meeting, Barcelona, Abstract Book: page 15 7 Ozturk M, Bagislar S, Senturk S, Arslan-Ergul A, Ozturk N. Induction of senescence as a potential therapeutic strategy in hepatocellular carcinoma. IARC meeting, Lyon, Abstract Book: page 27 6/8

7 6 Arslan-Ergul A, Bagislar S, Ozturk N, Senturk S, Lacin E, Ozturk M. Role of SMAD interacting protein 1 in reprogramming of replicative senescence. II. Congress of Molecular Medicine, Istanbul, Abstract Book: page Ozturk N, Bagislar S, Arslan-Ergul A, Ozdag H, Konu O, Ilk G, Ilk O, Bilen B, Cetin- Atalay R, Akar N, Ozturk M. Analysis of transcriptional regulatory networks in hepatocellular carcinoma cells reverting from replicative immortality to replicative senescence. Molecular Genetics of Aging Meeting, CSHL, Abstract Book: page Arslan-Ergul A, Ozturk N, Konu O, Ozturk M. Search for transformation and senescence markers. ICGEB Workshop, Antalya, Koytak ES, Verdi H, Akbiyik F, Ergul AA, Idilman R, Cinar K, Bozdayi M, Yurdaydin C, Uzunalimoglu O, Bozkaya H. PPAR-alpha L162V polymorphism in human hepatocellular carcinoma. National Gastroenterology Week, Kuşadası, Canbeyli RS, Yilmaz A, Aksoy A, Duvarci S, Celen Z, Arslan A. Moment of Despair : a critical temporal analysis of the first swim test in the learned despair model. Society for Neuroscience, San Diego, Canbeyli RS, Yilmaz A, Inan M, Aksoy A, Pancaroglu R, Arslan, A. Light exposure in the dark phase of an L:D cycle attenuates learned despair in female wistar rats. Society for Neuroscience, New Orleans, 2000 Diğer Yayınlar 4 Gürel D, Atalar M, Arslan-Ergül A. Household bacteria: Everyday elimination methods uncovered! Young Scientist Journal 2012; 5(11): Gürel D, Atalar M, Arslan-Ergül A. 5 Saniye Kuralı Mikroskop Altında. Bilim ve Teknik Dergisi 2008; 41(482): Arslan-Ergül A. Mitokondri. Güncel Gastroenteroloji 2003;7(2): Arslan-Ergül A. Hepatit Viruslerinin Moleküler Biyolojisi. Güncel Gastroenteroloji 2003;7(1): Halen Üyelikler Üye, Moleküler Biyoloji Derneği Üye, International Liver Cancer Association (ILCA) Üye, Sürekli Eğitim Merkezi, Ankara Üniversitesi Üye, Uzaktan Eğitim Merkezi, Ankara Üniversitesi 2014-Halen Aktiviteler Haydi Arkadaşlar Bilim Başına programı kurucu ve gönüllüsü, Ankara Kurucu ortak, KAMATEK Ltd. Şti. - TÜBİTAK 1512 programı ile kurulan şirket, Ankara 2011 Çalıştay Yöneticisi, Advanced Technologies in Computational Electromagnetics (AT- CEM 11), Glasgow 2009 Sosyal Program Yöneticisi, Computational Electromagnetics Workshop (CEM 09), İzmir Gönüllü, Görme Engelliler Teknoloji Merkezi (GETEM), İstanbul 7/8

8 Başkan, Öğrenci Konseyi, Molecular Biyoloji ve Genetik Bölümü, Boğaziçi Üniversitesi, İstanbul 8/8