BİYOKİMYA I. Final Ek Not. N- ve O- glikozidik bağ
|
|
- Asli Koray
- 5 yıl önce
- İzleme sayısı:
Transkript
1 BİYOKİMYA I Final Ek Not Dr. Naşit İĞCİ Temel kaynak olarak kitap kullanılacaktır. Bu notta derste anlatılan ancak kitapta yer almayan konular bulunmaktadır. Sınavda hem kitaptan hem de ek notlardan soru çıkacaktır. N- ve O- glikozidik bağ Glikozidik bağ genel olarak, bir şekerin veya şeker türevinin hemiasetal veya hemiketal grubuyla başka bir molekülün (ör: alkol, şeker) OH grubu arasında oluşur. Bu durumda glikozidik bağlar tek bir monosakkaritin üzerinde kurulabileceği gibi (molekül içi), iki monosakkarit arasında da kurulabilir. Monosakkaritler birbirlerine glikozidik bağlar ile bağlanırlar.bu durumda glikozit bağları (glikozidik bağlar), bir monosakkarit ile diğer bir monosakkaritin hidroksil grupları arasında meydana gelir. (1 molekül su açığa çıkar) Glikozidik bağlar bazlara karşı dayanıklı olmasına karşın, asidik ortamlarda kaynatıldığında hidrolize olur. 1
2 N- ve O- glikozidik bağ Bir şekerin anomerik karbonuna bağlı hidroksil grubu ile herhangi bir hidroksil grubu (başka bir monosakkarite ait veya değil) arasında su çıkışı ile oluşan kovalent bağa O-glikozidik bağ denir. Diğer bir çeşit glikozit bağı ise bir şekerin anomerik karbonuna bağlı hidroksil grubu ile amin grubundaki azot atomuna bağlı hidrojenin su oluşturarak ayrılmasıyla anomerik C ile N atomu arasında meydana gelir. Buna da N-glikozidik bağ denir. (Nükleotitlerde bu tip bağ bulunur.) Örneğin disakkaritler ise genellikle O-glikozidik bağı ile oluşur. 2
3 Glikozaminoglikanlar Bazal membran, epitel hücrelerin temelini oluşturan özelleşmiş bir ECM olup kollajen, laminin ve heteropolisakkaritleri içerir. Glikozaminoglikanlar (mukopolisakkaritler) olarak adlandırılan bu heteropolisakkaritler, tekrarlanan disakkarit birimlerinden oluşmuş düz zincirli bir polimer ailesidir. Bunlar hayvanlara ve bakterilere özgü olup, bitkilerde bulunmazlar. Glikozaminoglikanlarda iki monosakkaritten birisi her zaman ya N-asetil glukozamin ya da N-asetilgalaktozamindir. Diğeri de çoğu durumda bir uronik asittir (genellikle D- glukuronik veya L-iduronik asittir). Diğer önemli yapısal heteropolisakkaritler Bazı alg türleri de C-3 ve C-6 arasında eter bağlı D- galaktoz ve bir L-galaktoz türevinden oluşmuş, sülfatlanmış bir heterosakkarit karışımı olan agar içerirler. Agar, değişen miktarlarda sülfat ve pirüvat gruplarının yerleştiği bir iskelete sahip karmaşık bir polisakkarit karışımıdır. Agaroz ise çok az yüklü grupları (sülfatlar, pirüvatlar) olan agar bileşenidir. Agarozun jel oluşturabilme özelliği onu biyokimya laboratuvarlarında kullanışlı kılar. 3
4 Glikokonjugatlar Polisakkaritler yakıt deposu ve yapısal özelliklerinin yanı sıra bilgi taşıyıcısıdırlar. Bazıları hücreler ve hücre dışı çevreleri arasındaki iletişimi sağlarken, diğer bazıları proteinleri işaretleyerek onların belirli organellere taşınmasını veya yıkımlarının gerçekleştirilmesini sağlarlar. Bazıları ise hücre dışı sinyal molekülleri (ör: büyüme faktörleri) ve hücre dışı parazitler (bakteriler veya virüsler) için tanıma yerleri olarak görev yaparlar. Glikokonjugatlar Hücreyi çevreleyen glikokaliks yapısındaki oligosakkaritler hücre-hücre tanıma, hücre adhezyonu ve göçü, kan pıhtılaşması, immün cevap, yara iyileşmesi gibi birçok önemli hücresel faaliyette rol oynarlar. Bu durumların çoğunda bilgi taşıyan karbonhidrat, biyolojik aktif molekül olan glikokonjugatı oluşturmak üzere bir protein veya lipit molekülüne kovalent olarak bağlanır. Bu anlamda biyolojik aktif olan 3 tip glikokonjugattan bahsedilebilir: proteoglikanlar, glikoproteinler ve glikolipitler. 4
5 Proteoglikanlar Hücre yüzeyi ve hücre dışı matrikste glikozaminoglikanlar proteinlerle kovalent bağlanarak çok büyük agregatlar oluştururlar. Bu yapılara proteoglikanlar (mukoproteinler) denir. Proteoglikanlar çoğunlukla (%95 veya daha fazla oranda) polisakkaritten oluşmuştur. Proteoglikanlar tüm hücre dışı matrikslerin temel bileşenidir. Çoğu proteoglikan hücre dışı matrikse salgılanır, bununla birlikte bazıları integral zar proteinleri olarak görev yapar. 5
6 Glikoproteinler Glikokonjugatların önemli bir grubu da glikoproteinlerdir. Peptit zincirlerine kovalent bağlı olarak karbonhidrat grupları bulunduran glikoproteinlerin biyolojik önemi büyüktür ve canlılarda yaygın olarak bulunan heteropolisakkaritlerdir. Bazı glikoproteinler tek bir oligosakkarit zincirine sahipken bazılarınınki birden fazladır. Değişik glikoproteinlerdeki karbonhidrat oranı farklılık gösterir; bu oran genellikle %1-70 arasında değişir. Glikoproteinlerde birçok monosakkarit tipi ve türevleri bulunabilir. Bunlar 2 veya daha fazla şekerin düz veya dallanmış zincirlerini bulundurabilir. Glikoproteinler Omurgalılardaki hemen hemen bütün glikoproteinlerin fonksiyonu hücredışıdır.omurgalılardaki önemli glikoproteinler olarak; Hücre çeperi glikoproteinleri Kan glikoproteinleri Antikorlar Bağırsaktan salgılanan çeşitli sindirim enzimleri Ekstraselüler bazal membran glikoproteinleri Bazı protein yapısındaki hormonlar sayılabilir 6
7 Glikoproteinler Glikoproteinlerdeki karbonhidrat grupları polipeptit zincirine genelde 2 farklı şekilde bağlanmıştır: Ovalbümin ve immünoglobülinlerde görülen 1. tip glikoproteinlerde; oligosakkaridin N-asetil-Dglukozamin bileşeninin anomerik karbonu ile peptit zincirindeki asparagin amino asidinin amit grubu arasında N-glikozit bağı oluşur. Submaksillar mukoproteinlerde görülen 2. tip glikoproteinlerde oligosakkaridin N-asetil-Dgalaktozamin bileşeninin anomerik karbonu ile polipeptit zincirinin serin veya treonin amino asitlerinin hidroksil grupları arasında O-glikozit bağı oluşur. 7
8 Glikoproteinler Hücrede en çok bu iki tip bağlanma görülür. Ancak daha nadir olarak bulunsa da bunlar dışında da bağlanma tipleri vardır: C-glikolizasyon: Mannoz, triptofan amino asidinin indol halkasına bağlanır Glipiasyon: Merkezde bulunan glikan grubu bir tarafında protein, bir tarafında da lipit kuyruğunu bağlar Fosfoglikozilasyon: Oligosakkarit serin amino asidine fosfodiester bağı ile bağlanır. Glikoproteinler Müsinler, salgılanan ve çok sayıda O-bağlı oligosakkarit zincirleri içerebilen zar glikoproteinleridir. Müsinler çoğunlukla salgıda bulunurlar ve mukusa tipik kaygan özelliğini kazandırırlar. Tüm memeli proteinlerinin yaklaşık yarısı glikozillenmiş durumdadır (bağlı karbonhidrat grupları içerirler) (ör: kan proteinleri, immünoglobülinler, bazı hormonlar) ve tüm memeli genlerinin yaklaşık %1 i bu oligosakkarit zincirlerinin sentezi ve bağlanmasında yer alan enzimleri kodlar. 8
9 Glikoproteinler Plazma zarının dış yüzeyi çeşitli karmaşıklıkta kovalent bağlı oligosakkarit dizileri içeren birçok zar glikoproteinine sahiptir. İnsan kan grubu proteinleri de bunlara bağlı oligosakkaritleri bulundurur (glikoprotein yapısındadırlar). Bu oligosakkaritler L-fukoz, D- galaktoz, N-asetil-D-glukozamin ve N-asetil-Dgalaktozaminden oluşmaktadır. Glikoproteinler Kutuplarda yaşayan balıkların kan plazmasında bulunan antifriz proteinleri ilgi çekicidir. Bunların polipeptit zinciri tekrarlayan Ala-Ala-Thr dizileri içerir. Her bir treonin amino asidine galaktozil-nasetilgalaktozamin disakkaridi bağlanmıştır. Antifriz proteinleri su içerisinde muhtemelen esnek bir yapı oluşturarak buz oluşumunda kristal yapıyı etkiler. Sonuç olarak suyun donma noktasını düşürerek bu balıkların hayatlarını sürdürmelerini mümkün kılar. 9
10 Glikolipitler ve lipopolisakkaritler Hücrede oligosakkarit zinciri taşıyan glikokonjugatlar sadece glikoproteinler değildir. Bazı lipitler de bunlara bağlı oligosakkarit zinciri içerirler. Bu kompleks moleküller glikolipit olarak adlandırılır. Ökaryotik hücrelerin membran lipitleri olan gangliyositlerde, zarın dış yüzeyini oluşturan polar baş kısmı sialik asit ve diğer bazı monosakkarit birimleri içeren kompleks bir oligosakkarittir. İnsan kan gruplarının belirlenmesinde de gangliyositlerin önemi vardır. Glikolipitler ve lipopolisakkaritler Lipopolisakkaritler, Escherichia coli ve Salmonella typhimirium gibi Gram negatif bakterilerin dış zarının temel yüzey bileşenidir. Bu zarlardaki lipopolisakkaritler, bakteriyel enfeksiyonlara yanıt olarak omurgalı bağışıklık sistemi tarafından üretilen antikorların birincil hedefidir 10
11 Glikozamin S. typhimirium un dış zar lipopolisakkaritinin şematik gösterimi. Karbonhidratlar ve bunların diğer biyolojik makromoleküllerle oluşturduğu kompleks moleküller (glikokonjugatlar) verilen örneklerde de görüldüğü gibi sadece depo ve yapısal olarak değil, temel hücresel fonksiyonlar açısından da çok önemlidir. Tüm proteinlere de lipitlere bağlı karbonhidratlar da dahil olmak üzere belli bir hücre veya dokudaki tüm karbonhidrat içeriğini, bunların fonksiyonlarını ve diğer moleküllere nereden ve ne zaman bağlandıklarını ortaya koymak için yapılan çalışmalar glikomiks olarak adlandırılır. Bu alan ise özel olarak glikobiyoloji olarak isimlendirilir. 11
12 Bilgi Molekülleri Olarak Karbonhidratlar: Şeker Kodu Bilgi molekülleri olarak karbonhidratlar Karbonhidratların ve glikokonjugatların yapı ve işlevleriyle ilgilenen glikobiyoloji, biyokimyanın ve hücre biyolojisinin en aktif ve heyecan verici alanlarından birisidir. Giderek daha iyi anlaşıldığı üzere hücreler, hücre içi proteinlerin hedeflenmesi, hücre-hücre etkileşimleri, hücre farklılaşması ve doku gelişimi, hücre dışı sinyalizasyon gibi birçok olayda bilgilerin şifrelenmesinde özgül oligosakkaritleri kullanırlar. 12
13 Bilgi molekülleri olarak karbonhidratlar Daha önce bahsedildiği gibi farklı şekerler ve şeker türevleri çeşitli pozisyonlarda bağ yapabilirler (1 2, 1 3, 1 4, 1 6, 2 3, 2 6) ve farklı anomerik şekilllere sahip olabilirler. Ayrıca nükleik asitlerde ve proteinlerde karşımıza çıkmayan dallanmış yapılar oligosakkaritlerde yaygın olarak bulunur. Glikanlardaki bu zengin yapısal çeşitlilik, örneğin kendileriyle etkileşime giren proteinler tarafından okunabilen kendine özgü 3 boyutlu bir yapı oluşturmasını sağlar. Bu yapı da belli bir bilgiyi şeker koduyla sunmaktadır. 13
14 Lektinler Bahsedildiği gibi, her bir karmaşık oligosakkarit polimeri belli bir bilgiyi kodlar. Bu bilginin anlaşılabilmesi ve iletilmesi de hücrelerde genellikle proteinler ile gerçekleştirilir. Bütün organizmalarda bulunan lektinler, karbonhidratlara yüksek özgüllük ile bağlanan, bu sayede şeker kodunu okuyabilen proteinlerdir ve bir çok biyolojik işleme aracılık ederler. Lektinler hücre-hücre tanıma, sinyalleşme, hücre adhezyonu, yeni sentezlenen proteinlerin hücre içinde hedefine yöneltilmesinde görev alırlar. 14
15 Lektinler Tohumlarda bol miktarda bulunan bitkisel lektinler, muhtemelen böcekler ve diğer yırtıcılar için bir çeşit savunma mekanizmasıdır. Laboratuvar çalışmaları ile saflaştırılmış bitki lektinleri farklı oligosakkarit gruplarına bağlanma özelliklerinden dolayı çeşitli glikan ve glikoproteinlerin teşhis ve ayrılmasında kullanılırlar. Lektinler Hayvanlarda lektinlerin işlevlerine örnek olarak bazı peptit hormonların yapısında bulunan oligosakkaritleri tanımaları verilebilir. Kan dolaşımındaki bazı peptit hormonlar, dolaşımdaki yarı ömürlerini kuvvetle etkileyen oligosakkarit gruplarına sahiptirler. Örneğin lüteinleştirici hormon ve tirotropin, peptit yapıda hormonlar olup N-bağlı oligosakkaritlere sahiptir. Bunlarda bulunan oligosakkaritler hepatositlerde sentezlenen bir lektin tarafından yüksek özgüllükle tanınır. Lektin-hormon etkileşimi, bu hormonların hücre içine alınmasına ve yıkımına aracılık ederek kandaki derişimlerini düşürür ve denge sağlar. 15
16 Lektinler İnsanda bazı hastalıkların gelişmesinde hastalıklara verilen immün cevapta hücre yüzeyi lektinleri çok önemlidir. Selektinler, hücre-hücre tanınmasına ve hücre adhezyonuna aracılık eden plazma zar lektinleri ailesidir. Selektinlerin işlevlerine örnek olarak bazı immün sistem hücrelerinin (nötrofiller) enfeksiyon ve iltihaplanma bölgelerinde kapiller duvardan geçerek kandan dokulara hareketi verilebilir. Lektinler İnsanda bazı hastalıkların gelişmesinde hastalıklara verilen immün cevapta hücre yüzeyi lektinleri çok önemlidir. Selektinler, hücre-hücre tanınmasına ve hücre adhezyonuna aracılık eden plazma zar lektinleri ailesidir. Selektinlerin işlevlerine örnek olarak bazı immün sistem hücrelerinin (nötrofiller) enfeksiyon ve iltihaplanma bölgelerinde kapiller duvardan geçerek kandan dokulara hareketi verilebilir. 16
17 Lektinler İnfluenza (grip) virüsü de dahil olmak üzere çeşitli hayvan virüsleri konak hücrelerine, konak hücre yüzeyinde bulunan oligosakkaritlerle gerçekleşen etkileşimler aracılığıyla bağlanırlar. Hemaglütinin (HA) olarak bilinen grip virüsü lektini, konak hücre yüzeyindeki özgül oligosakkaritleri tanır ve virüsün hücreye girmesi ve enfeksiyon gelişimi için gereklidir. Virüs konak hücreye girdikten ve çoğaldıktan sonra viral bir sialidaz enzimi (nöraminidaz) hücreyle etkileşerek viral partiküllerin açığa çıkmasını sağlar ve ikinci bir enfeksiyon döngüsü başlar. Lektinler Antiviral ilaçlar olan oseltamivir (Tamiflu) ve zanamivir (Relenza) grip tedavisinde kullanılır. Bu ilaçlar şeker türevi olup, viral lektinlere bağlanmak için konak hücre oligosakkaritleriyle yarışarak viral sialidazı inhibe eder. Benzer şekilde virüs lektinleri ve konakçı yüzey oligosakkaritleri arasındaki tanımayı yarışmalı bir şekilde baskılayan şeker türevleri de antiviral ilaç olarak kullanılmaktadır. 17
18 Lektinler Lektinlerin bütün işlevlerinde ve lektinoligosakkarit etkileşimlerinin neden olduğu işlemlerde lektin tanınmasının yüksek derecede özgül olması, oligosakkaritlerin özgün yapılara sahip olmasıyla sağlanır. Her bir farklı oligosakkarit yapısı, şeker kodunda farklı kelime leri ifade eder. Lektinlerin bu özgül tanıma özellikleri, etkileşime girdikleri oligosakkaritler ile geometrik ve fizikokimyasal parametreler yönünden yüksek uyum gerçekleşmesiyle mümkün olur. 18
19 Nükleotitler: Nükleik asitlerin yapı taşları Nükleotitler Nükleotitlerin hücredeki işlevleri özetlenecek olursa; Metabolik donüşümlerde enerji birimidirler, Hücrelerin hormonlara ve diğer hücre dışı uyaranlara verdiği yanıtta aracı moleküllerdir, Bazı enzimlerin kofaktörüdürler, Metabolik ara bileşiklerin yapısal bileşenidirler, Genetik bilginin kaynağı olan nükleik asitlerin monomeridirler. 19
20 Nükleik asitler Nükleik asitler DNA ve RNA bazı kimyasal ve fiziksel özellikler yönünden birbirine çok benzer makromoleküllerdir. DNA deoksiribonükleotitlerin, RNA ise ribonükleotitlerin kovalent bağlanmış zincirlerinden meydana gelmiştir. Zincirler, bir nükleotitdin 5 fosfat grubu ile bunu takip eden nükleotidin 3 -OH grubu arasında fosfodiester köprüsü (bağı) ile oluşturulur. Dolayısıyla nükleik asitlerin omurgaları fosfat ve pentozun tekrarları şeklindedir ve azotlu bazlar omurgaya tutunmuş yan gruplar gibi düşünülebilir. 20
21 Nükleik asitler Nükleik asit zincirlerinde 5 ve 3 uçları bulunur. Bunlar fosfodiester bağını değil, nükleotit bulunmayan açıktaki uçları ifade eder. Bu zincirlerin baz dizilişleri verilirken genellikle 5 3 yönü kullanılır. DNA ve RNA, farklı tip pentozları ve urasil veya timin bulundurmaları bakımından birbirinden ayrılsa da nükleotidin kimliğini belirleyen içerdiği pentozdur. Bir nükleik asit pentoz olarak 2 -deoksi- D-riboz içeriyorsa, birkaç urasil bulundursa da DNA olarak tanımlanır. Aynı şekilde baz içeriğine bakılmaksızın D-riboz şekeri içeren nükleik asit de RNA olarak tanımlanır. 21
22 Nükleik asitler Nükleik asit zincirlerinin dizilimleri verilirken her bir nükleotitin bulundurduğu baz belirtilir ve 5 3 yönünde dizi yazılır. Ör: ATGCCG pa-t-g-c-c-g OH paptpgpcpcpg Kısa bir nükleik aside (genellikle 50 veya daha az sayıda monomer içeren) oligonükleotit denir. Daha uzun ise polinükleotit olarak adlandırılır. DNA (Deoksiribonükleik Asit) 22
23 DNA (Deoksiribonükleik asit) DNA, organizmaların ebeveynlerinden kalıtımla kazandığı genetik maddedir. Bir DNA molekülü çok uzun olup, genellikle yüzlerce ya da binlerce gen içerir. Hücre bölünerek çoğalırken DNA molekülleri kopyalanır (kendini eşler) ve bir hücre kuşağından bir sonrakine aktarılır. Bütün moleküller içerisinde sadece DNA kendi replikasyonunu yönetebilir. 23
24 DNA (Deoksiribonükleik asit) Farklı hücrelerin ve virüslerin DNA molekülleri, 4 nükleotidi değişik oranlarda bulundurur. Yine DNA moleküllerinin nükleotit monomer sayıları ve dizilişleri de canlı türüne göre farklılık gösterir. Bütün DNA çeşitlerinde bulunan adenin (A), guanin (G), sitozin (C) ve timin (T) bazlarının yanında, bazı DNA molekülleri bu bazların metil türevlerini de bulundurur. Bu metil türevleri DNA sentezlendikten sonra oluşmuştur. 24
25 DNA (Deoksiribonükleik asit) Prokaryotik hücrelerin genetik materyali tek bir molekül ikili heliks şeklindeki DNA dan oluşur. Ökaryotik hücreler ise birden fazla kromozoma sahiptir. Bir kromozom/kromatit, bir DNA molekülü demektir. Ökaryotik hücrelerde DNA moleküllerinin tamamına yakını hücre çekirdeğinde yer alır ve bazik özellikteki histon proteinleriyle kompleks yapmış haldedir. Bu hücrelerin mitokondrilerinde ve varsa kloroplastlarında prokaryotik hücre DNA larına benzer özelliklere sahip olan DNA molekülleri bulunur. 25
26 DNA (Deoksiribonükleik asit) Antiparalel ikili sarmal DNA modeli James Dewey Watson ve Francis Crick tarafından keşfedilmiştir ve 1953 yılında yayınlanmıştır. Bu keşiflerinde Rosalind Franklin ve Murice Wilkins tarafından ortaya koyulan X-ışını kırınımı sonuçları önemli rol oynamıştır. Watson, Crick ve Wilkins 1962 yılında Nobel ödülü almıştır. DNA (Deoksiribonükleik asit) Çeşitli koşullar altında DNA nın 3 boyutlu yapısında bazı değişiklikler olan farklı formları bulunabilir (A- DNA, B-DNA, Z-DNA gibi). Biyolojik olarak genetik materyali oluşturan, yani yaygın olan form B-DNA formudur. Watson ve Crick tarafından 3 boyutlu yapısı tanımlanan form da B formudur. 26
27 DNA (Deoksiribonükleik asit) DNA molekülleri, birbirini tamamlayıcı, antiparalel ikili sarmal (heliks) şeklinde düzenlenmiş iki zincir halindedir. Küçük oluk (minor groove) Büyük oluk (major groove) Hidrofobik etkileşimler, hidrofobik özellikteki azotlu bazların DNA molekülünün içine doğru, hidrofilik fosfat ve şeker gruplarının ise DNA nın dışına doğru yönelmesinde etkilidir. 27
28 Aralıkları nedeniyle, yalnızca bazı bazlar birbirleriyle eşleşebilir. DNA (Deoksiribonükleik asit) İki zincir birbirine, azotlu bazlar arasında kurulan H bağları ile tutunur. A ve T arasında 2, G ve C arasında 3 H bağı vardır. Çift zincirli helikste A daima T ile, C ise G ile hidrojen bağı yapar. DNA ısıtılırsa belli bir sıcaklıkta aradaki H bağları kırılır. Bu heliks yapısının açıldığı sıcaklığa DNA nın erime derecesi (TM) (ikili sarmalın yarısının açıldığı sıcaklık) denir. Bu olaya (DNA çift zincirinin açılması) DNA nın denatürasyonu denir. 28
29 DNA (Deoksiribonükleik asit) B-DNA her döngüde yaklaşık 10 baz çifti içerir. Sarmalın çapı 2.37 nm, birbirini takip eden iki baz arasındaki mesafe ise 0.34 nm dir. Bir dönüş tamamlandığında aralık 3.4 nm olarak hesaplanır. 29
30 DNA nın farklı formları DNA oldukça esnek bir moleküldür. Şeker-fosfat iskeleti etrafındaki çeşitli bazlar için dönüş mümkün olduğu gibi sıcaklık değişimleri de kıvrılma, esneme, çözülme gibi değişimlere neden olabilir. Bu gibi durumların sonucunda Watson ve Crick tarafından tanımlanan B-DNA modelinden sapmalar olabilir. Bu durumların çoğunda baz eşleşmeleri ve antiparalel durum yine aynıdır ancak 3 boyutlu yapıda bazı değişiklikler olur. 30
31 DNA nın farklı formları Watson ve Crick tarafından tanımlanan B şekli fizyolojik koşullarda en kararlı durum olduğu için referans olarak alınır. Bunun dışında 3 boyutlu yapısı iyi aydınlatılmış diğer iki önemli örnek de A- DNA ve Z-DNA formlarıdır. 31
32 DNA nın farklı formları: A-DNA A şekli suyun kısmen az olduğu ortamlarda aldığı şekildir. B-DNA kristallerinden su uzaklaştırılmasıyla veya tuz oranının azaltılmasıyla B-DNA kısalıp kalınlaşarak A-DNA'yı oluşturur. B-DNA gibi A-DNA da sağa dönüşlü sarmal yapar. Sarmalın çapı 2.3 nm. dir ve her bir tam dönüşte 10.7 (~11) baz çifti yer alır. Tam bir dönüş 2.8 nm. uzunluktadır. Dar ve derin bir büyük çöküntüye(major groove), geniş ve sığ bir küçük çöküntüye(minor groove) sahiptir. 32
33 DNA nın farklı formları: Z-DNA Z yapısındaki DNA, B yapısından daha çok uzaklaşmaktadır. En belirgin fark soldan dönüşlü olmasıdır. Bir tam dönüşte 12 baz bulunur ve yapı daha ince ve uzun bir hal almaktadır. DNA iskeleti de zikzaklı bir görünüm kazanmıştır. Büyük oluk Z-DNA da güçlükle belirlenir, küçük oluk da dar ve derindir. Bazı nükleotit dizileri (özellikle ardışık G-C içerenler) soldan dönüşlü şekle girmeye daha meyillidir. DNA nın farklı formları: Z-DNA Hücrelerde A-DNA nın varlığı bilinmemekle birlikte Z-DNA nın kısa diziler şeklinde bakteriler ve ökaryotlarda bulunduğu konusunda veriler vardır. Biyolojik işlevi kesin olarak bilinmemekle beraber bazı özel proteinlerin DNA'nın G-C baz çiftlerince zengin bölgelerine bağlanması ile B'den Z formuna geçiş olabileceği ve ayrıca da gen ekspresyonunda rol oynadığı düşünülmektedir. 33
34 DNA nın farklı formları: H-DNA Üçlü heliks yapı gösteren formdur. Bu yapılar düşük ph değerlerinde kararlıdırlar. Canlı hücrelerde seyrek olarak bulunabildiği ve gen ifadesinin düzenlenmesinde rolü olabileceği düşünülmektedir. DNA nın kısa bir bölgesinin üçlü heliks oluşturmak üzere yeniden düzenlenmesiyle oluşur. 34
35 DNA nın farklı formları: H-DNA 35
36 G-quadruplex DNA (G 4 -DNA) G-quadruplex, özellikle guanince zengin diziler içeren nükleik asit bölgelerinde görülen 4 iplikli bir tersiyer yapıdır. G-quadruplex DNA (G 4 -DNA) Dört guanin bazı Hoogsten tipi hidrojen bağı ile etkileşerek guanin tetrat (dörtlüsü) adı verilen kare bir düzlem oluşturur. Birden fazla guanin tetratı üst üste binerek G-quadruplex yapısını oluşturur. Yapının merkezindeki katyon ile stabilizasyon sağlanır. 36
37 G-quadruplex DNA (G 4 -DNA) G-quadruplex yapısı aslında sadece DNA da değil RNA da da görülebilir. Oluşan yapıdaki zincirler paralel veya antiparalel olabilir. Son yıllarda önce in vitro, daha sonra ise in vivo olarak çeşitli organizmalardaki telomerik dizilerde G-quadruplex DNA yapısı olduğu gösterildi. (ör: GGTTAG tekrarı ile oluşan G-quadruplex) Bu yapıların oluşmasının, telomeraz enziminin aktivitesini düşürdüğü ile ilgili bulgular vardır. G-quadruplex DNA (G 4 -DNA) Yine son yıllarda yapılan çalışmalarda telomer bölgelerinin dışında da G-quadruplex DNA oluşumu tespit edilmiştir. Bu yapıların özellikle genlerin promotor bölgelerinde olması nedeniyle gen düzenleyici rollerinin olabileceği ile ilgili bazı modeller önerilmiştir. 37
38 Farklı DNA formları Burada sayılanların dışında, deneysel koşullarda farklı amaçlar için üretilmiş çeşitli DNA formları/türevleri de mevcuttur. 38
39 RNA bir katalizör gibi davranabilir Ribozimler, katalitik etkiye sahip RNA molekülleridir. Bunlar genellikle transesterifikasyon tepkimelerine katılırlar ve bunların çoğu RNA metabolizması ile ilgilidir. Örnek: mrna oluşumunda snrna ların katalitik aktivitesi, telomeraz yapısındaki RNA kısmı, bir rrna bileşeninin bir aminoakil esterini hidroliz ettiği ve dolayısıyla peptit bağı işlevinde merkezi rol oynadığı saptanmıştır. RNA dünyası hipotezi 39
40 Nükleazlar DNA ve RNA nükleazların substratıdır. Nükleazlar Yani nükleazlar, nükleik asitlerdeki fosfodiester bağını koparır. Ekzonükleazlar uç nükleotitleri koparırlar. Endonükleazlar içeriden koparır (5 fosfat ya da 3 fosfat sonlarının her ikisini de koparabilir) (ör: restriksiyon endonükleazlar) 40
BİYOLOJİ DERS NOTLARI YGS-LGS YÖNETİCİ MOLEKÜLLER
www.benimdershanem.esy.es Bilgi paylaştıkça çoğalır. BİYOLOJİ DERS NOTLARI YGS-LGS YÖNETİCİ MOLEKÜLLER NÜKLEİK ASİTLER Nükleik asitler, bütün canlı hücrelerde ve virüslerde bulunan, nükleotid birimlerden
DetaylıGenetik Bilgi: DNA Yapısı, Fonksiyonu ve Replikasyonu. Dr. Mahmut Çerkez Ergören
Genetik Bilgi: DNA Yapısı, Fonksiyonu ve Replikasyonu Dr. Mahmut Çerkez Ergören Genetik materyal; Kendini çoğaltır. Bilgi depolar. Bilgiyi ifade eder. Mutasyonla varyasyonlara izin verir. Genetik Tarihçe
DetaylıIII-Hayatın Oluşturan Kimyasal Birimler
III-Hayatın Oluşturan Kimyasal Birimler MBG 111 BİYOLOJİ I 3.1.Karbon:Biyolojik Moleküllerin İskeleti *Karbon bütün biyolojik moleküllerin omurgasıdır, çünkü dört kovalent bağ yapabilir ve uzun zincirler
Detaylı12. SINIF KONU ANLATIMI 2 DNA VE RNA
12. SINIF KONU ANLATIMI 2 DNA VE RNA DNA (DEOKSİRİBONÜKLEİK ASİT) Temel nükleik asittir. Prokaryot hücrelerin sitoplazmasında, ökaryot hücrelerde çekirdek, mitokondri ve kloroplast organelinde bulunur.
DetaylıAkıllı Defter. 9.Sınıf Biyoloji. vitaminler,hormonlar,nükleik asitler. sembole tıklayınca etkinlik açılır. sembole tıklayınca ppt sunumu açılır
9.Sınıf Biyoloji 1 Akıllı Defter vitaminler,hormonlar,nükleik asitler sembole tıklayınca etkinlik açılır sembole tıklayınca ppt sunumu açılır sembole tıklayınca video açılır 1 VİTAMİNLER ***Vitaminler:
Detaylı11. Hafta: Prof. Dr. Şule PEKYARDIMCI NÜKLEOTİDLER
11. Hafta: Nükleik Asitler: Nükleik asitlerin yapısal üniteleri, nükleozitler, nükleotidler, inorganik fosfat, nükleotidlerin fonksiyonları, nükleik asitler, polinükleotidler, DNA nın primer ve sekonder
DetaylıBAKTERİLERİN GENETİK KARAKTERLERİ
BAKTERİLERİN GENETİK KARAKTERLERİ GENETİK MATERYALLER VE YAPILARI HER HÜCREDE Genetik bilgilerin kodlandığı bir DNA genomu bulunur Bu genetik bilgiler mrna ve ribozomlar aracılığı ile proteinlere dönüştürülür
DetaylıOrganik Bileşikler. Karbonhidratlar. Organik Bileşikler YGS Biyoloji 1
Organik Bileşikler YGS Biyoloji 1 Hazırladığımız bu yazıda; organik bileşikler ve organik bileşiklerin yapısını, canlılarda bulunan organik bileşikleri ve bunların görevlerini, kullanım alanlarını, canlılar
DetaylıYAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf
YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI 9. Sınıf DOĞRU YANLIŞ SORULARI Nitel gözlemlerin güvenilirliği nicel gözlemlerden fazladır. Ökaryot hücrelerde kalıtım materyali çekirdek içinde bulunur. Ototrof beslenen canlılar
DetaylıBiochemistry Chapter 4: Biomolecules. Hikmet Geçkil, Professor Department of Molecular Biology and Genetics Inonu University
Biochemistry Chapter 4: Biomolecules, Professor Department of Molecular Biology and Genetics Inonu University Biochemistry/Hikmet Geckil Chapter 4: Biomolecules 2 BİYOMOLEKÜLLER Bilim adamları hücreyi
DetaylıYAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 9. Sınıf 2 KARBONHİDRAT LİPİT (YAĞ)
YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI 9. Sınıf 2 KARBONHİDRAT LİPİT (YAĞ) DOĞRU YANLIŞ SORULARI Depo yağlar iç organları basınç ve darbelerden korur. Steroitler hücre zarının yapısına katılır ve geçirgenliğini artırır.
Detaylı2. Histon olmayan kromozomal proteinler
12. Hafta: Nükleik Asitler: Nükleik asitlerin yapısal üniteleri, nükleozitler, nükleotidler, inorganik fosfat, nükleotidlerin fonksiyonları, nükleik asitler, polinükleotidler, DNA nın primer ve sekonder
DetaylıHücre içinde bilginin akışı
Hücre içinde bilginin akışı 1 DNA Çift Zincir Heliks 2 Hücre Çekirdeği ve Çekirdek Zarının Yapısal Organizasyonu Hatırlıyor musunuz? DNA Kromatin Kromatid Kromozom RNA Protein Çekirdek Çekirdekcik Nükleotid
DetaylıOrganik bileşikler; karbonhidratlar, lipidler, proteinler, vitaminler ve nükleik asitler olmak üzere beş gruba ayrılır.
ORGANİK BİLEŞİKLER **Organik bileşikler: Canlılar tarafından sentezlenirler. Yapılarında C, H, atomlarını bulundururlar. Organik bileşikler; karbonhidratlar, lipidler, proteinler, vitaminler ve nükleik
DetaylıCanlının yapısında bulunan organik molekül grupları; o Karbonhidratlar o Yağlar o Proteinler o Enzimler o Vitaminler o Nükleik asitler ve o ATP
Tamamı karbon ( C ) elementi taşıyan moleküllerden oluşan bir gruptur. Doğal organik bileşikler canlı vücudunda sentezlenir. Ancak günümüzde birçok organik bileşik ( vitamin, hormon, antibiyotik vb. )
DetaylıKloroform, eter ve benzen gibi organik çözücülerde çözünen bunun yanı sıra suda çözünmeyen veya çok az çözünen organik molekül grubudur.
Kloroform, eter ve benzen gibi organik çözücülerde çözünen bunun yanı sıra suda çözünmeyen veya çok az çözünen organik molekül grubudur. Yağların suda çözünmemesi canlılığın devamı içi önemlidir. Çünkü
DetaylıÖKARYOTLARDA GENETİK MATERYALİN YAPISI VE ORGANİZASYONU
ÖKARYOTLARDA GENETİK MATERYALİN YAPISI VE ORGANİZASYONU Doç. Dr. Bengi ÇINAR KUL Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Genetik Anabilim Dalı İnsan genomu 3 x 10 9 bp (n) İnsan diploidtir (2n) her çekirdek
DetaylıM. (arpa şekeri) +su S (çay şekeri) + su L.. (süt şekeri)+ su
KARBONHİDRATLAR Karbonhidratlar yapılarında.. (C),.. (H) ve. (O) atomu bulunduran organik bileşiklerdir. Karbonhidratların formülü ( ) ile gösterilir. Nükleik asitlerin, ATP nin, hücre, bitkilerde yapısına
DetaylıReplikasyon, Transkripsiyon ve Translasyon. Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ
Replikasyon, Transkripsiyon ve Translasyon Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ DNA replikasyonu DNA nın replikasyonu, DNA molekülünün, sakladığı genetik bilgilerin sonraki nesillere aktarılması için kendi kopyasını
DetaylıTRANSLASYON VE DÜZENLENMESİ
TRANSLASYON VE DÜZENLENMESİ TRANSLASYON Translasyonda nükleik asit kullanılır fakat son ürün bir nükleik asit değil proteindir. Translasyon mekanizması 4 ana bileşenden oluşmaktadır: 1. mrnalar 2. trnalar
DetaylıRNA Yapısı ve Katlanması, Hücrede Bulunan RNA Çeşitleri
RNA Yapısı ve Katlanması, Hücrede Bulunan RNA Çeşitleri RNA (Ribonükleik Asit) Nükleik asitler, Friedrich Miescher tara2ndan 1869'da keşfedildi. İl=haplı bandajlardan izole edilen bu maddeye nüklein adını
DetaylıChapter 10 Lecture. Genetik Kavramlar Concepts of Genetics Tenth Edition. 1. DNA Yapısı. Çeviri: Aslı Sade Memişoğlu
Chapter 10 Lecture Genetik Kavramlar Concepts of Genetics Tenth Edition 1. DNA Yapısı Çeviri: Aslı Sade Memişoğlu Genetik malzeme nedir? Çoğunlukla genetiğin ikili sarmalın keşfiyle başladığı düşünülür
DetaylıMAKROMOLEKÜLLERİN YAPI VE İŞLEVLERİ
MAKROMOLEKÜLLERİN YAPI VE İŞLEVLERİ Polimerlerin yapısı Polimer, birbirinin aynısı veya benzeri yapıtaşlarının kovalent bağlarla bağlanarak oluşturdukları uzun bir moleküldür. Polimerlerin yapıtaşı olarak
DetaylıORGANİK BİLEŞİKLER Karbon Dünyası
ORGANİK BİLEŞİKLER Canlı Organizmalarda bulunan büyük ve karışık yapılı moleküller yani makromoleküllerdir Makromoleküllerin hepsinde karbon vardır. Karbon Dünyası Makromoleküller birbirlerine kovalent
Detaylıayxmaz/biyoloji Adı: 1.Aşağıda verilen atomların bağ yapma sayılarını (H) ekleyerek gösterin. C N O H
Adı: 1.Aşağıda verilen atomların bağ yapma sayılarını (H) ekleyerek gösterin. C N O H 2.Radyoaktif izotoplar biyologları için önemlidir? Aşağıda radyoakif maddelerin kullanıldığı alanlar sıralanmıştır.bunlarla
DetaylıSınıf ; Çalışma yaprağı 3
Öğrencinin Adı ve soyadı ; Sınıf ; Çalışma yaprağı 3 F.8.2. DNA ve Genetik Kod / Canlılar ve Yaşam Bu ünitede öğrencilerin; DNA ve genetik kod ile ilişkili kavramları açıklamaları ve aralarındaki ilişkileri
DetaylıCANLILARIN YAPISINDA BULUNAN TEMEL BİLEŞENLER
CANLILARIN YAPISINDA BULUNAN TEMEL BİLEŞENLER Canlıların yapısında bulunan moleküller yapısına göre 2 ye ayrılır: I. İnorganik Bileşikler: Bir canlı vücudunda sentezlenemeyen, dışardan hazır olarak aldığı
Detaylı7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ
7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ Başlıklar 1. Prokaryotlar gen ifadesini çevre koşullarına göre düzenler 2. E. Coli de laktoz metabolizması 3. Lac operonu negatif kontrol 4. CAP pozitif kontrol
Detaylı7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ
7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ Başlıklar 1. Prokaryotlar gen ifadesini çevre koşullarına göre düzenler 2. E. Coli de laktoz metabolizması 3. Lac operonu negatif kontrol 4. CAP pozitif kontrol
DetaylıYAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 12. Sınıf 1 GENDEN PROTEİNE
YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI 12. Sınıf 1 GENDEN PROTEİNE Protein sentezini tüm canlılar gerçekleştirir. Bir mrna molekülünde en fazla 64 çeşit kodon bulunur. DOĞRU YANLIŞ SORULARI Canlıların heterotrof beslenenleri
Detaylı3.1. Karbonhidratların Tanımı 3.2. Karbonhidratların Sınıflandırılması 3.3. Monosakkaritler ve Monosakkarit Türevleri Monosakkaritler
3.1. Karbonhidratların Tanımı 3.2. Karbonhidratların Sınıflandırılması 3.3. Monosakkaritler ve Monosakkarit Türevleri 3.3.1. Monosakkaritler 3.3.1.1. Monosakkaritlerin isimlendirilmesi 3.3.2. Monosakkaritlerin
DetaylıKarbohidratlar. Karbohidratların sınıflandırılması. Monosakkaritler
Karbohidratlar Yeryüzünde en çok bulunan organik molekül grubudur, (CH 2 O) n genel formülüyle ifade edilebilirler. Genelde suda çözünürler, Güneş ışığının fotosentez yapan organizmalar tarafından tutulmasıyla
DetaylıHAYVANSAL HÜCRELER VE İŞLEVLERİ. YRD. DOÇ. DR. ASLI SADE MEMİŞOĞLU RESİM İŞ ZEMİN KAT ODA: 111
HAYVANSAL HÜCRELER VE İŞLEVLERİ YRD. DOÇ. DR. ASLI SADE MEMİŞOĞLU RESİM İŞ ZEMİN KAT ODA: 111 asli.memisoglu@deu.edu.tr KONULAR HAYVAN HÜCRESİ HAYVAN, BİTKİ, MANTAR, BAKTERİ HÜCRE FARKLARI HÜCRE ORGANELLERİ
Detaylı15- RADYASYONUN NÜKLEİK ASİTLER VE PROTEİNLERE ETKİLERİ
15- RADYASYONUN NÜKLEİK ASİTLER VE PROTEİNLERE ETKİLERİ İyonlaştırıcı radyasyonların biyomoleküllere örneğin nükleik asitler ve proteinlere olan etkisi hakkında yeterli bilgi yoktur. Ancak, nükleik asitlerden
Detaylıwww.demiraylisesi.com
YÖNETİCİ MOLEKÜLLER C, H, O, N, P atomlarından meydana gelir. Hücrenin en büyük yapılı molekülüdür. Yönetici moleküller hücreye ait genetik bilgiyi taşır, hayatsal faaliyetleri yönetir, genetik bilginin
DetaylıKALITSAL MOLEKÜLÜN BİÇİMİ ve ORGANİZASYONU PROF. DR. SERKAN YILMAZ
KALITSAL MOLEKÜLÜN BİÇİMİ ve ORGANİZASYONU PROF. DR. SERKAN YILMAZ Değişik canlı gruplarında kalıtsal molekülün çeşidi, sayısı, biçimi ve organizasyonu bakımından farklılıklar bulunur. Ortak özellik: nükleik
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİ DOÇ. DR. MEHMET KARACA (5. BÖLÜM)
MOLEKÜLER BİYOLOJİ DOÇ. DR. MEHMET KARACA (5. BÖLÜM) TRANSKRİPSİYONU (ÖKARYOTİK) STOPLAZMA DNA Transkripsiyon hnrna RNA nın işlenmesi mrna G AAA Eksport G AAA NÜKLEUS TRANSKRİPSİYONU (PROKARYOTİK) Stoplazma
DetaylıCanlıların yapısına en fazla oranda katılan organik molekül çeşididir. Deri, saç, tırnak, boynuz gibi oluşumların temel maddesi proteinlerdir.
Canlıların yapısına en fazla oranda katılan organik molekül çeşididir. Deri, saç, tırnak, boynuz gibi oluşumların temel maddesi proteinlerdir. Proteinlerin yapısında; Karbon ( C ) Hidrojen ( H ) Oksijen
DetaylıYGS YE HAZIRLIK DENEMESi #12
YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #12 1) İnsanda döllenme sırasında, I. Spermdeki çekirdek, sentrozomun yumurtaya geçmesi II. Spermdeki akrozomun patlayarak zona pellusidayı eritmesi III. Yumurtadaki salgı maddelerinin
DetaylıHomo- ve heteropolisakkaritler olarak iki grupta toplanırlar. Nişaşta ve selüloz gibi polisakkaritler, 10 ve daha fazla monosakkarit biriminden
Polisakkaritler (glikanlar) Homo- ve heteropolisakkaritler olarak iki grupta toplanırlar. Nişaşta ve selüloz gibi polisakkaritler, 10 ve daha fazla monosakkarit biriminden oluşan polimerlerdir; (D)-Glukoz,
DetaylıNÜKLEİK ASİTLER. Nükleotitler, nükleik asitlerin yapı taşlarıdır. Nükleotitlerin, hücre
NÜKLEİK ASİTLER Nükleotitler, nükleik asitlerin yapı taşlarıdır. Nükleotitlerin, hücre metabolizmasında çeşitli görevleri vardır. Nükleotitler, metabolik dönüşümlerde enerji birimi, hücrelerin hormonlara
DetaylıLYS ANAHTAR SORULAR #4. Nükleik Asitler ve Protein Sentezi
LYS ANAHTAR SORULAR #4 Nükleik Asitler ve Protein Sentezi 1) İncelenen bir nükleotidin DNA ya mı yoksa RNA ya mı ait olduğu; I. Bağ çeşidi II. Pürin bazı çeşidi III. Pirimidin bazı çeşidi IV. Şeker çeşidi
DetaylıHücrelerde gerçekleşen yapım, yıkım ve dönüşüm olaylarının bütününe metabolizma denir.
METABOLİZMA ve ENZİMLER METABOLİZMA Hücrelerde gerçekleşen yapım, yıkım ve dönüşüm olaylarının bütününe metabolizma denir. A. ÖZÜMLEME (ANABOLİZMA) Metabolizmanın yapım reaksiyonlarıdır. Bu tür olaylara
DetaylıÜNİTE 6 Nükleoproteinler ve Nükleik Asitler
ÜNİTE 6 Nükleoproteinler ve Nükleik Asitler Amaçlar Bu üniteyi çalıştıktan sonra; Nükleoprotein ve nükleik asitlerin yapısını, Nükleozid, nükleotid tanımlarını, Azotlu bazları, Nükleik asitlerin metabolizmasını
DetaylıADIM ADIM YGS-LYS 55. ADIM CANLILARIN SINIFLANDIRILMASI-15 VİRÜSLER
ADIM ADIM YGS-LYS 55. ADIM CANLILARIN SINIFLANDIRILMASI-15 VİRÜSLER Virüsler Hücresel yapı da dahil olmak üzere canlıların ortak özelliklerini göstermeyen canlılardır. Prokaryotlardan daha küçüklerdir.
Detaylı9.Sınıf Biyoloji. Yaşam Bilimi Biyoloji. cevap anahtarı
9.Sınıf Biyoloji 1 Yaşam Bilimi Biyoloji cevap anahtarı 1 CANLILARIN TEMEL BİLEŞENLERİ *Canlıların temel bileşenleri: Canlıların temel bileşenleri; organik ve inorganik bileşikler olmak üzere ikiye ayrılır.
DetaylıDNA ve RNA NIN YAPISI. Yrd.Doç.Dr. Özlem KURT ŞİRİN
DNA ve RNA NIN YAPISI Yrd.Doç.Dr. Özlem KURT ŞİRİN Bu derste neler öğreneceğiz? Nükleotid tanımı ve yapısı DNA nın primer, sekonder ve tersiyer yapısı RNA çeşitleri ve yapıları Canlılarda, genetik bilginin
DetaylıYGS YE HAZIRLIK DENEMESi #18
YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #18 1) Bakterilerin gerçekleştirdiği, I. Kimyasal enerji sayesinde besin sentezleme II. Işık enerjisini kimyasal bağ enerjisine dönüştürme III. Kimyasal bağ enerjisini ATP enerjisine
Detaylı9. SINIF KONU ANLATIMI 5 CANLININ TEMEL BİLEŞENLERİ -İNORGANİK MADDELER 1- SU
9. SINIF KONU ANLATIMI 5 CANLININ TEMEL BİLEŞENLERİ -İNORGANİK MADDELER 1- SU Canlıların yapısına katılan maddeler çeşitli özellikler nedeni ile temel olarak iki grupta incelenir. Canlının Temel Bileşenleri
DetaylıYrd.Doç.Dr. Yosun MATER
* Yrd.Doç.Dr.Yosun MATER *DNA, RNA ve Protein Moleküllerinin Yapısı ve Evrimi *Burada Moleküler Biyoloji nin temelini oluşturan DNA-RNA, amino asitler ve proteinler gibi moleküllerin yapılarını hatırlayacağız.
DetaylıADIM ADIM YGS-LYS 37. ADIM HÜCRE 14- ÇEKİRDEK
ADIM ADIM YGS-LYS 37. ADIM HÜCRE 14- ÇEKİRDEK 3) Çekirdek Ökaryot yapılı hücrelerde genetik maddeyi taşıyan hücre kısmıdır. Prokaryot hücreli canlılarda bulunmaz. GÖREVLERİ: 1) Genetik maddeyi taşıdığından
DetaylıGram (+)Bakterilerde Duvar Yapısı Gram (-) Bakterilerde Duvar Yapısı Lipopolisakkaritin Önemi
Gram (+)Bakterilerde Duvar Yapısı Çoğunluğu peptidoglikan yapıdır. Bunun yanında teikoik asitte içerirler. Bu yapı gliserol veya Ribitolün PO4 gruplarına bağlanmasıyla oluşur. Teikoik asitler peptidoglikan
DetaylıADIM ADIM YGS-LYS 5. ADIM CANLININ TEMEL BİLEŞENLERİ -İNORGANİK MADDELER 1- SU
ADIM ADIM YGS-LYS 5. ADIM CANLININ TEMEL BİLEŞENLERİ -İNORGANİK MADDELER 1- SU Canlıların yapısına katılan maddeler çeşitli özellikler nedeni ile temel olarak iki grupta incelenir. Canlının Temel Bileşenleri
DetaylıDNA ve Özellikleri. Şeker;
DNA ve Özellikleri Hücrelerdeki hayatsal olayların yönetimini çekirdek sağlar. Çekirdek içinde, hücrenin beslenme, solunum, üreme gibi canlılık faaliyetlerin yönetilmesini sağlayan genetik madde bulunur.
DetaylıA. DNA NIN KEŞFİ VE ÖNEMİ
DNA nın Yapısı ve Replikasyonu Biyoloji Ders Notları A. DNA NIN KEŞFİ VE ÖNEMİ İlk olarak Friedrich Miescher (1869) akyuvar hücreleri ve balık sperminde yönetici molekülleri tespit etmiştir. Çekirdekte
DetaylıTEST 1. Hücre Solunumu. 4. Aşağıda verilen moleküllerden hangisi oksijenli solunumda substrat olarak kullanılamaz? A) Glikoz B) Mineral C) Yağ asidi
1. Termometre Çimlenen bezelye tohumlar Termos Çimlenen bezelye tohumları oksijenli solunum yaptığına göre yukarıdaki düzenekle ilgili, I. Termostaki oksijen miktarı azalır. II. Termometredeki sıcaklık
DetaylıDNA Replikasyonu. Doç. Dr. Hilal Özdağ. A.Ü Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı Tel: /202 Eposta:
DNA Replikasyonu Doç. Dr. Hilal Özdağ A.Ü Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı Tel: 2225826/202 Eposta: hilalozdag@gmail.com 1 Watson ve Crick Gözümüzden kaçmamış olan bir nokta da.. Replikasyon
DetaylıTemel Biyokimya-I Karbonhidratlar. Prof. Dr. Arif ALTINTAŞ Ankara Üniv. Veteriner Fakültesi Biyokimya AD Ankara
Temel Biyokimya-I Karbonhidratlar Prof. Dr. Arif ALTINTAŞ Ankara Üniv. Veteriner Fakültesi Biyokimya AD-06110-Ankara I. MAKROMOLEKÜLLER-YAPI VE FONKSİYONLAR Hücreler büyük moleküllü organik moleküllerden
DetaylıBİYOLOJİK MOLEKÜLLERDEKİ
BİYOLOJİK MOLEKÜLLERDEKİ KİMYASALBAĞLAR BAĞLAR KİMYASAL VE HÜCRESEL REAKSİYONLAR Yrd. Doç.Dr. Funda BULMUŞ Atomun Yapısı Maddenin en küçük yapı taşı olan atom elektron, proton ve nötrondan oluşmuştur.
DetaylıBİYOKİMYAYA GİRİŞ: ATOM, MOLEKÜL, ORGANİK BİLEŞİKLER
BİYOKİMYAYA GİRİŞ: ATOM, MOLEKÜL, ORGANİK BİLEŞİKLER Biyokimyanın tanımı yaşamın temel kimyası ile ilgilenen bilim dalı (Bios, Yunancada yaşam demektir.) canlı sistemin yapısını ve fonksiyonlarını kimyasal
DetaylıHÜCRE SĠNYAL OLAYLARI PROF. DR. FATMA SAVRAN OĞUZ
HÜCRE SĠNYAL OLAYLARI PROF. DR. FATMA SAVRAN OĞUZ Çok hücreli organizmaların kompleks omurgalılara evrimi, hücreler birbirleriyle iletişim kuramasalardı mümkün olmazdı. Hücre-hücre Hücre-matriks etkileşimini
DetaylıNükleik Asitlerin İşlevi
Nükleik Asitler Nükleik Asitlerin İşlevi n n n n n Metabolik işlemlerde kullanılan enerji (ATP: Adenozintrifosfat) Hücrelerin hormonlara ve diğer hücre dışı uyarılara karşı yanıtında ana bağlantı bileşeni
DetaylıAdı ve Soyadı : Sınıfı ve Numarası : 1- DNA molekülünün görevlerini yazınız? * * 2- ATP molekülünün görevini açıklayınız?
Adı ve Soyadı : Sınıfı ve Numarası : A 1- DNA molekülünün görevlerini yazınız? 2- ATP molekülünün görevini açıklayınız? 3- Hücre teorilerinin açıklayınız? 4- Ökaryatik hücre yapısına sahip canlıları yazınız?
DetaylıKİMYA-IV. Yrd. Doç. Dr. Yakup Güneş
KİMYA-IV Yrd. Doç. Dr. Yakup Güneş Organik Kimyaya Giriş Kimyasal bileşikler, eski zamanlarda, elde edildikleri kaynaklara bağlı olarak Anorganik ve Organik olmak üzere, iki sınıf altında toplanmışlardır.
DetaylıRNA DNA. Nükleosit Baz + Şeker Riboz (RNA) Deoksiriboz (DNA) Ribonükleozitler : Adenozin, Pürinler: Pirimidinler: AveGdışında
Bazlar : Nükleik Asitlerin karakteristik Özellikleri DNA RNA Yasin EREN Recep LiMAN Muhsin KONUK Nükleik Asitlerin Yapısı Pürinler: Pirimidinler: AveGdışında TU T,U ve Sdışında d bazı theobromin, kafein,
Detaylıhendisliği BYM613 Genetik MühendisliM Tanımlar: Gen, genom DNA ve yapısı, Nükleik asitler Genetik şifre DNA replikasyonu
BYM613 Genetik MühendisliM hendisliği Hacettepe Üniversitesi Biyomühendislik BölümüB 2012-2013 2013 Güz G z DönemiD Salı 9.00-11.45, D9 Dr. Eda Çelik-AKDUR edacelik@hacettepe.edu.tr İçerik Tanımlar: Gen,
DetaylıCanlı hücrelerin bilinen kimyasal yapı taşları
anlı hücrelerin bilinen kimyasal yapı taşları rganik maddeler a) Karbonhidratlar b) Proteinler, amino asitler ve peptitler c) Enzimler d) Lipidler e) Nükleotidler ve nükleik asitler f) Vitaminler İnorganik
DetaylıYGS YE HAZIRLIK DENEMESi #21
YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #21 1) Aşağıda bazı dönüşüm tepkimeleri gösterilmiştir. a 2) Enzimlerin çalışma hızına etki eden faktörlerle ilgili; RH RH ADP + Pi ATP I II b Buna göre a ve b yönlerindeki değişimlerle
DetaylıDNA. İzolasyon Kiti. Mısırdan. Öğretmen Kılavuzu. Öğrenci Kılavuzu
DNA Mısırdan İzolasyon Kiti Öğretmen Kılavuzu a. Konu b. Kullanıcı Kitlesi c. Deney Süresi d. Materyaller e. Güvenlik f. Genel Bilgi g. Deney Öncesi Hazırlık h. Ön Bilgi i. Deneyin Yapılışı j. Deney Sonuçları
DetaylıMonosakkaridler organizmadaki metabolik reaksiyonlara tek başlarına giremezler. Bu nedenle evvela aktifleşmeleri gerekir. Monosakkaridlerin aktif
Monosakkaridler organizmadaki metabolik reaksiyonlara tek başlarına giremezler. Bu nedenle evvela aktifleşmeleri gerekir. Monosakkaridlerin aktif formu, fosforik asitle yaptığı esterlerdir Glukoz, galaktoz
DetaylıHücre zarının yapısındaki yağlardan eriyerek hücre zarından geçerler.fazlalıkları karaciğerde depo edilir.
DERS: BİYOLOJİ KONU: C.T.B(Vitaminler e Nükleik Asitler) VİTAMİNLER Bitkiler ihtiyaç duydukları bütün vitaminleri üretip, insanlar ise bir kısmını hazır alır. Özellikleri: Yapıcı, onarıcı, düzenleyicidirler.
DetaylıKARBON ve CANLILARDAKİ MOLEKÜL ÇEŞİTLİLİĞİ
KARBON ve CANLILARDAKİ MOLEKÜL ÇEŞİTLİLİĞİ Karbonun önemi Hücrenin % 70-95ʼ i sudan ibaret olup, geri kalan kısmın çoğu karbon içeren bileşiklerdir. Canlılığı oluşturan organik bileşiklerde karbon atomuna
DetaylıHücre. 1 µm = 0,001 mm (1000 µm = 1 mm)!
HÜCRE FİZYOLOJİSİ Hücre Hücre: Tüm canlıların en küçük yapısal ve fonksiyonel ünitesi İnsan vücudunda trilyonlarca hücre bulunur Fare, insan veya filin hücreleri yaklaşık aynı büyüklükte Vücudun büyüklüğü
DetaylıTRANSLASYON ve PROTEİNLER
TRANSLASYON ve PROTEİNLER Prof. Dr. Sacide PEHLİVAN 13 Aralık 2016 mrna daki baz sırasının kullanılarak amino asitlerin doğru sıra ile proteini oluşturmasını kapsayan olayların tümüne Translasyon veya
DetaylıMembran Organizasyonu
Membran Organizasyonu Yrd. Doç. Dr. Aslı AYKAÇ Tıp Fakültesi Biyofizik AD Biyolojik Zarlar plazma zarları mitokondri, kloroplast, lizozom gibi organelleri sitoplazmadan ayıran hücre içi zarlar mitokondri
DetaylıMoleküler biyolojiye giriş. Doç.Dr.Pınar AKSOY SAĞIRLI
Moleküler biyolojiye giriş Doç.Dr.Pınar AKSOY SAĞIRLI Molecular biology terimi ilk kez Warren Weaver tarafından 1938 de kullanıldı. Hayatın fiziksel ve kimyasal olarak açıklanması olarak tanımlandı. 1977
DetaylıYrd.Doç.Dr.Yosun MATER. Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü * Glikobiyoloji son 50 yılda ortaya çıkan ve gelişmekte olan önemli bir biyoloji alt dalıdır. * Bu konuya başlarken
DetaylıYGS YE HAZIRLIK DENEMESi #6
YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #6 1) Canlılar soylarının devam ettirebilmek için üreyerek yeni bireyler meydana getirir. Bu üreme olaylarıyla ilgili olarak; I. Bakterinin ikiye bölünerek kendine benzer yeni
DetaylıBiyoloji Canlıların Temel Bileşenleri, Organik Bileşikler
Biyoloji Canlıların Temel Bileşenleri, Organik Bileşikler Canlılardaki Organik Bileşikler: Canlı vücudunda biyosentez reaksiyonları sonuncu oluşturulan maddelerdir. Organik moleküllerin vücutta çeşitli
DetaylıBiyokimya. Biyokimyanın tanımı ve önemi Organizmanın elementer yapısı Canlılık Su Kovalent olmayan bağlar (intermoleküler etkileşimler)
Biyokimya Biyokimyanın tanımı ve önemi Organizmanın elementer yapısı Canlılık Su Kovalent olmayan bağlar (intermoleküler etkileşimler) Bölüm 1: Biyokimya ve önemi: 1. Biyokimya tanımı, önemi ve boyutsal
DetaylıBiyoteknoloji ve Genetik II. Hafta 8 TRANSLASYON
Biyoteknoloji ve Genetik II Hafta 8 TRANSLASYON Prof. Dr. Hilal Özdağ A.Ü Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı Tel: 2225826/125 Eposta: hilalozdag@gmail.com TRANSLASYON Translasyon a. mrna ribozoma
DetaylıYGS YE HAZIRLIK DENEMESi #19
YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #19 1) X Ağız Mide İnce bağırsak Şekildeki grafikte insanın sindirim kanalındaki X maddesinin değişimi gösterilmiştir. Buna göre X maddesi aşağıdakilerden hangisidir? A) Glikojen
Detaylı-Kloroplast ve mitokondri bulunmaz fakat bu organellerde bulunan aynı bulunur.
BAKTERİLER GENEL ÖZELLİKLERİ: -Prokaryot hücre yapılı, tek hücreli canlılardır. -Halkasal DNA ya sahiptirler. Bazı bakterilerde plazmit bulunur. Plazmit: Küçük ve halka şeklinde DNA parçacıklarıdır. Bakterilerin
DetaylıProkaryotik ve Ökaryotik Hücre Yapısı ve İşlevi
Prokaryotik ve Ökaryotik Hücre Yapısı ve İşlevi PROKARYOTİK HÜCRE YAPISI ve İŞLEVİ Prokaryot tamamen bakterilere ait bir kavramdır. Prokaryot hücrelerde hücre zarının çevrelediği hücre içi kompartımanlaşma
DetaylıI. DÖNEM - 2. DERS KURULU ( )
Açıklamalar: I. DÖNEM - 2. DERS KURULU (2014-2015) Kısaltmalar: DK: Ders kurulu, IHU: İyi hekimlik uygulamaları, Mİng: Akademik/Medikal İngilizce, TDE: Türk Dili ve Edebiyatı, Bilgisayar Okur yazarlığı:
DetaylıYAĞLAR (LİPİTLER) Yağların görevleri:
LİPİTLER (YAĞLAR) YAĞLAR (LİPİTLER) Yapılarında C,H, O den başka N,P da bulunabilir. İçerikleri C miktarı O a göre daha fazla olduğu için çok enerji verirler. Yağlar solunumda kullanılınca çok oksijen
Detaylıo Serin o Triyonin o Sistein o Metiyonin o Arjinin o Histidin
III.PROTEİNLER Karbon,hidrojen,oksijen ve azot elementlerinden oluşmuş organik bileşiklerdir.yapısında bazen sülfür,fosfor veya demir de bulunabilir. Proteinler canlılarda en fazla bulunan organik madde
DetaylıYGS YE HAZIRLIK DENEMESi #13
YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #13 1) Canlılarda özelliklerin genlerle kontrol edildiği ve her genin en az bir özellikten sorumlu olduğu bilindiğine göre, I. Diploid canlılarda her özellik için iki gen bulunması
DetaylıBİY 315 BİYOKİMYA GİRİŞ. Yrd. Doç. Dr. Ebru SAATÇİ Güz Yarı Dönemi
BİY 315 BİYOKİMYA GİRİŞ Yrd. Doç. Dr. Ebru SAATÇİ 2008-2009 Güz Yarı Dönemi 1 Anlatım Planı 1. Makromoleküller ve Su 2. Amino asitler ve Peptidler 3. Proteinler 4. Enzimler 5. Karbohidratlar 6. Nükleik
Detaylı00220 Gıda Biyokimyası
00220 Gıda Biyokimyası Hazırlayan: Doç.Gökhan DURMAZ 00220 Gıda Biyokimyası-Şubat 2013 1 Bu notların hazırlanmasında aşağıdaki eserlerden yararlanılmıştır; Biyokimya, Engin Gözükara, Nobel Tip Kitabevi,
DetaylıYGS YE HAZIRLIK DENEMESi #16
YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #16 1) Topraktaki azotlu bileşik miktarını, I. Denitrifikasyon bakteri sayısındaki artış II. Saprofit bakterilerce gerçekleşen çürüme III. Şimşek ve yıldırım olaylarındaki artış
DetaylıNÜKLEİK ASİTLER ( DNA VE RNA)(Yönetici Moleküller)
NÜKLEİK ASİTLER ( DNA VE RNA)(Yönetici Moleküller) NÜKLEİK ASİTLERİN KEŞFİ *FRIEDRICH MIESCHER * Balık spermlerinin çekirdeklerini ve akyuvar çekirdeklerini ayrıştırarak yaptığı çalışmalarda, bu hücrelerin
DetaylıHÜCRE. Yrd.Doç.Dr. Mehtap ÖZÇELİK Fırat Üniversitesi
HÜCRE Yrd.Doç.Dr. Mehtap ÖZÇELİK Fırat Üniversitesi Hücre Canlıların en küçük yapı taşıdır Bütün canlılar hücrelerden oluşur Canlılar tek hücreli ya da çok hücreli olabilir Bitki ve hayvan hücresi = çok
Detaylı2. Kanun- Enerji dönüşümü sırasında bir miktar kullanılabilir kullanılamayan enerji ısı olarak kaybolur.
Enerji Dönüşümleri Enerji Enerji; bir maddeyi taşıma veya değiştirme kapasitesi anlamına gelir. Enerji : Enerji bir formdan diğerine dönüştürülebilir. Kimyasal enerji ;moleküllerinin kimyasal bağlarının
DetaylıKARBOHİDRATLAR. Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ
KARBOHİDRATLAR Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ Karbohidratlar (CHO) şeker, nişasta, glikojen ve selüloz olarak canlılar aleminde en geniş yeri kaplayan makromoleküllerdir. İnsanlar, hayvanlar ve mikroorganizmalar
DetaylıADIM ADIM YGS LYS Adım DOLAŞIM SİSTEMİ 5 İNSANDA BAĞIŞIKLIK VE VÜCUDUN SAVUNULMASI
ADIM ADIM YGS LYS 177. Adım DOLAŞIM SİSTEMİ 5 İNSANDA BAĞIŞIKLIK VE VÜCUDUN SAVUNULMASI İNSANDA BAĞIŞIKLIK VE VÜCUDUN SAVUNULMASI Hastalık yapıcı organizmalara karşı vücudun gösterdiği dirence bağışıklık
DetaylıAmino Asitler. Amino asitler, yapılarında hem amino grubu ( NH 2 ) hem de karboksil grubu ( COOH) içeren bileşiklerdir.
Amino Asitler Amino asitler, yapılarında hem amino grubu ( NH 2 ) hem de karboksil grubu ( COOH) içeren bileşiklerdir. 1 Fizyolojik ph da, amino asitlerin amino grubu proton taşır ve pozitif yüklüdür;
Detaylıİ. Ü İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı Prof. Dr. Filiz Aydın
İ. Ü İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı Prof. Dr. Filiz Aydın Canlının en küçük birimi Hücre 1665 yılında ilk olarak İngiliz bilim adamı Robert Hooke şişe mantarından kesit alıp mikroskopta
DetaylıKarbohidratlar. Yrd.Doç.Dr. Ahmet GENÇ Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu
Karbohidratlar Yrd.Doç.Dr. Ahmet GENÇ Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu q Karbohidratlar, insan diyetinin en önemli kısmını oluştururlar Karbonhidratlar q Doğada en bol bulunan organik moleküllerdir.
DetaylıKarbohidratlar 02.04.2012. Karbonhidratlar. Sınıflandırılması q. Sınıflandırılması. q Karbohidratlar, insan diyetinin en önemli kısmını oluştururlar
q Karbohidratlar, insan diyetinin en önemli kısmını oluştururlar Karbohidratlar Yrd.Doç.Dr. Ahmet GENÇ Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu Karbonhidratlar q Doğada en bol bulunan organik moleküllerdir.
Detaylı