ÖZGEÇMİŞ. Doç. Dr. Fatih Erdoğan Sevilgen

Transkript

1 ÖZGEÇMİŞ Doç. Dr. Fatih Erdoğan Sevilgen İş Adresi Bilgisayar Mühendisliği Bölümü Gebze Teknik Üniversitesi PK: 141, Gebze-Kocaeli Tel: (262) FAX: (262) E-Posta: sevilgen (at ) gtu.edu.tr URL: Öğrenim Durumu: Derece Alan Üniversite Yıl Lisans Bilgisayar Müh. Boğaziçi Üniversitesi 1990 Bitirme Projesi: Design & Implementation of a Bar-code System Proje Danışmanı: Dr. Oğuz Tosun Sistem ve Kontrol Müh. Boğaziçi Üniversitesi 1993 Y. Lisans Tez Konusu: Open-Loop and Closed-Loop Observer Design for Generalized Linear Time-Invariant Systems Tez Danışmanı: Dr. Kadri Özçaldıran Y. Lisans Bilgisayar Bilimleri Syracuse Üniversitesi, NY, A.B.D Bilgisayar Bilimleri Syracuse Üniversitesi, NY, A.B.D Doktora Tez Konusu: Distribution Independent Data Structures and Algorithms With Applications Tez Danışmanı: Dr. Srinivas Aluru ve Dr. Kishan Mehrotra 1

2 Akademik Görevler: Kasım Ocak 2012 Ocak 2014 Ağustos 2000 Kasım 2012 Temmuz 2006 Haziran 2010 Haziran 1993 Ağustos 2000 Temmuz Ağustos 1999 Bahar 1998 Mayıs Aralık 1997 Bahar 1996 Bahar 1995 Güz 1994 Şubat Şubat 1993 Doçent Bilgisayar Mühendisliği Bölümü Gebze Teknik Üniversitesi Danışman Araştırmacı Bilişim Teknolojileri Enstitüsü TÜBİTAK - BİLGEM Yardımcı Doçent Bilgisayar Mühendisliği Bölümü Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü Danışman Araştırmacı (DATAS Projesi) Bilişim Teknolojileri Enstitüsü TÜBİTAK - MAM Araştırma Görevlisi Bilgisayar Mühendisliği Bölümü Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü Araştırma Görevlisi Bilgisayar Mühendisliği Bölümü New Mexico State University NM, A.B.D. Araştırma Görevlisi (Intr. to Algorithms) Bilgisayar Bilimleri Bölümü Syracuse University NY, A.B.D. Araştırma Görevlisi Bilgisayar Mühendisliği Bölümü New Mexico State University NM, A.B.D. Araştırma Görevlisi (P. of Databases Systems) Bilgisayar Bilimleri Bölümü Syracuse University NY, A.B.D. Notlandırıcı (Intr. to Algorithms) Bilgisayar Bilimleri Bölümü Syracuse University NY, A.B.D. Tutor (Computer Architecture) Bilgisayar Bilimleri Bölümü Syracuse University NY, A.B.D. Araştırma Görevlisi Bilgi İşlem Merkezi Boğaziçi Üniversitesi 2

3 İdari Görevler : Akademik Değerlendirme ve Kalite Geliştirme Kurulu Üyesi Gebze Teknik Üniversitesi Bilgisayar Müh. Kuramsal Temelleri Anabilim Dalı Başkanı Gebze Teknik Üniversitesi Grup Yürütme Komitesi Üyesi TÜBİTAK - SAVTAG Fakülte Yönetim Kurulu Üyesi Mühendislik Fakültesi Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü Fakülte Kurulu Üyesi Mühendislik Fakültesi Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü Bölüm Başkan Yardımcısı Bilgisayar Mühendisliği Bölümü Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü 3

4 Verdiği Dersler: Lisans Bilgisayar Bilimlerine Giriş Bilgisayar Programlama (C, Java) Veri Yapıları ve Algoritmalar Algoritma Tasarımına Giriş Bilgisayar Mimarisi Lisans Proje 1-2 Hesaplama Teorisi Sistem Benzetimi Paralel ve Dağıtık Sistemler Sezgisel Optimizasyon Lisansüstü Algoritma Analizi ve Tasarımı Paralel Hesaplama Sezgisel Optimizasyon Dağıtık Benzetim Algoritmalarda İleri Konular - Çizge Algoritmaları 4

5 Çalışma Alanları: Paralel ve Dağıtık Hesaplama Yöntemleri ve Algoritmalar Bilimsel Problemler için Algoritma Tasarımı Paralel Hesaplama Modelleri Dağıtık Simülasyon Teknikleri HLA (High Level Architecture) Simulasyonların Performans Problemleri ve Birlikte Çalışabilirlik Veri Dağıtımı Zaman Yönetimi Sezgisel Optimizasyon Yöntemleri Parçacık Sürü Optimizasyonu Uygulama alanları Oryentiring Problem Sensor Yerleştirme Problemi Bilgisayarla Görme Biyoinformatik N-Cisim Metotları Paralel N-Cisim Algoritmaları N-Cisim Ağacı Oluşturma ve Güncelleme Algoritmaları Alternatif Kümeleme Metotları Moleküler Dinamik Simülasyonu Çok çekirdekli sistemler için algoritmalar Alternatif Hücreleme yöntemleri Dağılımdan Bağımsız Metotlar Uzaysal Veri Yapıları Bilimsel Hesaplama Uygulamaları Ödüller Syracuse University Graduate Fellowship, Scholarship for graduate study in USA from Gebze Institute for Advance Technologies, Gebze,

6 Araştırma Projeleri: 1. Veri Merkezli Savaş Yönetim Sistemi, HAVELSAN, Danışman, (2/ /2016) 2. Omik Verilerinden Hücresel Ağyapıların Çıkarımı için Yeni Bir Hesaplamalı Yöntemin Geliştirilerek İyileştirilmesi ve Kök hücrelere uygulanması, TÜBİTAK-ARDEB 1002, No:215M201, TL, Yardımcı Araştırmacı, (1/2016 6/2017) 3. Pathogen-Host Protein-Protein Interactions Prediction Using Machine Learning Techniques, TÜBİTAK 2216, TL, Danışman, (12/2015-9/2016) 4. Patojen-Konak Etkileşimleri Web Platformu ve İlgili Biyoinformatik Hizmetlerin Geliştirilmesi, TÜBİTAK TEYDEB 1507, No: , TL, Araştırmacı, (7/2015, 1/2017) 5. Beyin metabolizmasının karakterizasyonu için genom-ölçekli yeni bir metabolik model geliştirilmesi ve beyin tümörlerine uygulamaları, GTU-BAP, No:, TL, Yardımcı Araştırmacı (7/2015 6/2017) 6. Talep Tahmini Verilerine Dayalı Ürünlerin Lokasyonlar Arası Optimum Hareket Karar Mekanizmasının Geliştirilmesi, TÜBİTAK TEYDEB 1501, No: , Danışman, (9/2014-5/2016) 7. Hedefmetre: Hızlı, Tam ve Kişiye Özgü (Adaptif) Öğrenme, TÜBİTAK TEYDEB 1507, No: , TL, Danışman, (7/ /2016) 8. Yeşil Ağlar için Kaynak Planlaması ve Rotalama, TÜBİTAK-ARDEB 3501, No:113E567, TL, Yardımcı Araştırmacı, (4/2014 4/2017) 9. Patojen-İnsan Protein Etkileşimleri Web Platformu, KOSGEB ArGe İnovasyon Destek Programı, TL, Yardımcı Araştırmacı, (1/2014 6/2015) 10. Patojen-İnsan Protein Etkileşimleri Web Platformu, TÜBİTAK TEYDEB 1512, No: , TL, Yardımcı Araştırmacı, (1/2014 1/2015) 11. İHA Kullanarak Afet Ortamı Görüntüleme ve Analiz Sistemi, TÜBİTAK BİLGEM, TL, Yardımcı Araştırmacı, (4/2013-4/2014) 12. Bloom Taksonomileri Çerçevesinde Kişisel Zihin Haritaları Odaklı Ölçme Değerlendirme Sistem Yazılımlarının Geliştirilmesi, TÜBİTAK TEYDEB 1507, No: , TL, Danışman, (10/ /2013) 13. Termik Santral Performans İzleme ve Değerlendirme Sistemi Tasarımı ve Uygulaması (PERİDSİS), TÜBİTAK-ARDEB 1007, No:110G092, Danışman, (3/2011 9/2013) 14. Devlet Su İşleri Su Veri Tabanı (DSİ-SVT), TUBİTAK-ARDEB 1007, No:106G001, Yardımcı Araştırmacı, TL, (2/2006 8/2008) 15. N-Cisim Ağaçlarının Hızlı Oluşturulması ve Güncellenmesi, GYTE-BAP, No:2005-A- 04, Proje Yöneticisi, (6/ /2006) 16. Dağıtık Savaş Simulasyon Sistemleri, DPT, Yardımcı Araştırmacı, ( ) 17. Hızlı Küresel Filtrenin Paralel Bilgisayar Ortamında Uygulanması, GYTE-BAP, No:00- B , TL, Yardımcı Araştırmacı ( ) 6

7 Yönetilen Doktora Tezleri: 1. Aişe Zülal Şevkli, En Fazla Kazanç Sağlayan Rota Bulma Probleminin Sezgisel Yöntemlerle İncelenmesi, Onur Destanoğlu, Paralel İşlerin Enerji Etkin Yapıda Çizelgelenmesi Yönetilen Yüksek Lisans Tezleri: 1. F.Koray Atsan, LDAP Erişiminde Kullanılan Güvenlik Protokolleri ve Özgün Bir Güvenlik Protokol (ELIAC) Tasarımı, Kemal Yılmaz, Dağıtık Web Önbellek Mimarileri, Burak İnner, N-Cisim Algoritmalarının Performans Karşılaştırması ve Veri Yapılarının İncelenmesi, Ersin Ünsal, Yüksek Seviyeli Mimari Uyumlu Benzetim Modelleme Ve Uygulama Geliştirme Aracı, Ramazan Cengiz, Dağıtık Benzetim Altyapıları İçin Performans Analiz Sistemi, Bilge Soran, Hücre Yapısının Çok Hücreli Olay Temelli Molekül Dinamiği Simülasyonlarındaki Etkisi, Ali Tozan, Sensör Yerleştirme Probleminin Genetik Algorima Ve Parçacık Sürü Optimizasyonu İle Çözümü, Münibe Şimşek, Abdominal MR Görüntülerinde Hareket Tahmini, Tolga Baştürk, Dağıtık Sistemlerde Nedensel Sıralı Mesaj Dağıtım Algoritmaları Ve Yeni Bir Yaklaşım, Onur Destanoğlu, Paralel Algoritmalar için Dinamik Yük Dengeleyici Tasarımı ve Uygulamaları, Ömer Eroğlu, Dağıtık Simülasyonlarda Veri Dağıtım Yönetimi ve Yeni Bir Yaklaşım, 2008, İkinci danışman 12. Emrah Kaya, HLA Tabanlı Dağıtık Benzetimler İçin Tam Dağıtık Kayıt ve Yeniden Oynatma Mimarisi, Umut Demirtaş, Çok çekirdekli işlemciler için moleküler dinamik simülasyonu, Salih Cebeci, Altküme bulma tabanlı ayrık optimizasyon problemleri için ayrık parçacık sürü optimizasyonu modelleri, Burak Işıklı, Sosyal Ağlarda Etkileşim Örüntüleri Kullanılarak Bağlantı Tahmini, Maimaitiming Mahemuti, Uygurca Optik Karakter Tanıma 17. Metin Akdere, Data Structures for Ray Tracing on GPUs 18. Mehmet Emin Paça, Havaalanlarında Yerdeki Uçak Trafiğinin Optimizasyonu 19. Hayri Tolga Çubukçuoğlu, Sosyal Medya Paylaşım Öner Sistemi 20. Murat Melül, Dinamik Nokta Özellikli Nesnelerin Etiketlenmesi 7

8 Yönetilen Lisans Bitirme Çalışmaları: 1. Volkan Altuntaş, Lineer Diferansiyel Denklem Sistemlerinin Çözümü İçin Tasarlanmış Paralel Algoritmaların Karşılaştırılması, Özgür Keleş, Parçacık Sürü Optimizasyon Kütüphanesi, Hakan Gedek, Olay Tabanlı Moleküler Dinamik Simülasyonlarında Kullanılan Olay Kuyruklarının Karşılaştırılması, Hamide Betül Hasgür, Çok Hücreli Olay Temelli Moleküler Dinamik Simülasyonlarında Farklı Hücre ve Duvar Yapıları, Derviş Kanbur, Ekran Görüntüsü Kayıt Ve Oynatılması, Rüya Genç, Gezgin Satıcı ve Oryantiring Problemleri İçin Karınca Kolonisi Optimizasyonu, Şamil Karahan, Olay Temelli Molekül Dinamiği Simülasyonunda Görselleştirme, Yasin Geçer, Konuşma Engelliler İçin İletişim Sistemi, Yasin Yıldırım, Görüntülü Kampus Navigasyon Sistemi, Ömer Faruk Özdemir, Parçacıkların Sürü Optimizasyonu ve Paralelleştirilmesi, Osman Demir, Sonlu Otomatların Simülasyonu, Erdi Kanık, Bitki Tanıma Sistemi, İrem Çevik, İnsan Patojen Etkileşiminde Motif Analizi, Ebru Çelik, SVM Algoritması kullanılarak Biyoloji Literatüründen İnsan-Patojen Etkileşimlerinin Çıkarılması, Seldağ Özcan, İnsan Patojen Etkileşim Verilerinin Sorgulanması ve Görselleştirilmesi, Emine Çakmak, Meta-Sezgisel Yöntemler Kullanarak 2 Boyutlu Kutu Paketleme (2D Packing) Problemi için Çözüm Geliştirilmesi, Sevgi Öztürk, Randevu Alarm Uygulaması, Furkan Yavuz, 2D Convex Polygon Packing Problem Solving, İlkay Yılmaz, Kullanılabilirlik Testi Ve Veri Yönetim Sistemi, Sevgi Öztürk, Genel Dikkat Yeteneğinin Tespiti, Azat Uğurlu, 3 Boyutlu Stok Kesme Problemi, Emre Ardıç, Biyobilişsel PHI Analiz Araçları, Gülcan Çiçek, Ödev Kontrol Sistemi, Nilüfer Ceylan, Davranış Tabanlı Kalabalık Simülasyonu, Selahattin Furkan Karahan, Beyin Metabolizmasına Ait Yeni Bir Biyomolekül Etkileşim Ağının Oluşturulması, Ömer Faruk Büyükşar, Madde Tepki Kuramı Tabanlı Sınav Sorularının Zorluk Dereceleri Ve Öğrenci Yetenek Düzeyi Hesaplanması, Tuncer Oğuzhan Odabaşı, Lokasyon Tabanlı Sosyal Ağ, Erdem Bingöl, Bilimsel Makalelerin Biyomolekül Etkileşim Bilgisi İçerip İçermediğinin Tespiti,

9 ESERLER A. Uluslararası Dergilerde Yayımlanan Makaleler A1. Burak Isikli, Fatih Erdogan Sevilgen, Mustafa Kirac, Link and Annotation Prediction Using Topology and Feature Structure in Large Scale Social Networks, Communications in Computer and Information Science 424 (2014), Presented at 10th International Conference on Beyond Databases, Architectures and Structures (BDAS), Ustron, POLAND (2014). A2. Saliha Durmuş Tekir, Tunahan Çakır, Emre Ardıç, İlknur Karadeniz, Arzucan Özgür, F. Erdoğan Sevilgen, and Kutlu Ö. Ülgen. PHISTO: A New Web Platform for Pathogen- Human Interactions, Lecture Notes in Computer Science, 8130 (2013) Presented at The 11th International Conference on Computational Methods in Systems Biology: CMSB, Klosterneuburg, Austria (2013). A3. Saliha Durmuş Tekir, Tunahan Çakır, Emre Ardıç, Ali Semih Sayılırbaş, Gökhan Konuk, Mithat Konuk, Hasret Sarıyer, Azat Uğurlu, İlknur Karadeniz, Arzucan Özgür, F. Erdoğan Sevilgen, and Kutlu Ö. Ülgen, PHISTO: Pathogen-Host Interaction Search Tool, Bioinformatics, 29:10 (2013) DOI: /bioinformatics/btt137 A4. Zülal Sevkli and F. Erdoğan Sevilgen, Discrete Particle Swarm Optimization for the Team Orienteering Problem, Turkish Journal of Electrical Engineering & Computer Sciences, 20:2, (2012) DOI: /elk Presented at International Symposium on Innovations in Intelligent Systems and Applications: INISTA, Kayseri, (2010). A5. Zülal Sevkli and F. Erdoğan Sevilgen, StPSO: Strengthened Particle Swarm Optimization, Turkish Journal of Electrical Engineering & Computer Sciences, 18:6, (2010) DOI: /elk A6. İlyas Kandemir and F. Erdoğan Sevilgen, Molecular Dynamics Simulation of Helium- Argon Gas Mixture under Various Wall Conditions, Molecular Simulation, 34:8, (2008) DOI: / A7. Zülal Sevkli and F. Erdoğan Sevilgen, A Hybrid Particle Swarm Optimization Algorithm for Function Optimization, Lecture Notes in Computer Science, 4974 (2008) DOI: / _64. Presented at First European Workshop on Bio-inspired algorithms for continuous parameter optimization (EvoNUM) in EvoWorkshops 2008, Napoli, Italy (2008). A8. Zülal Sevkli and F. Erdoğan Sevilgen, Variable Neighborhood Search for the Orienteering Problem, Lecture Notes in Computer Science, 4263 (2006) DOI: / _16. Presented at The 21st International Symposium on Computer and Information Sciences: ISCIS, Istanbul (2006). A9. Fatih E. Sevilgen, Srinivas Aluru and Natsuhiko Futamura, Parallel algorithms for tree accumulations, Journal of Parallel and Distributed Computing, 65:1 (2005) DOI: /j.jpdc A10. Fatih E. Sevilgen and Srinivas Aluru, Efficient Methods for Database Storage and Retrieval Using Space-filling Curves, Lecture Notes in Computer Science, 3280 (2004) 9

10 DOI: / _51. Presented at The 19th International Symposium on Computer and Information Sciences: ISCIS, Kemer, Antalya (2004). A11. Srinivas Aluru and Fatih E. Sevilgen, Dynamic Compressed Hyperoctrees with Application to the N-body Problem, Lecture Notes in Computer Science, 1738 (1999) DOI: / _2. Presented at Foundations of Software Technology and Theoretical Computer Science (FSTTCS 99) Chennai, India (1999). A12. S. Aluru, G.M. Prabhu, J. Gustafson, and F.E. Sevilgen, Distribution-Independent Hierarchical Algorithms for the N-body Problem, Journal of Supercomputing, 12:4 (1998) DOI: /A: B. Uluslararası Hakemli Toplantılarda Sunulan ve Bildiri Kitabında Yayımlanan Bildiriler B1. E, Ardıç, S. Karakoç, İ. Karadeniz, A. Özgür, K. Ö. Ülgen, E. Nikerel, F. E. Sevilgen, T. Çakır, S. Durmuş Tekir PHISTO: A Web-based Platform For Studying Infection Mechanisms through Pathogen-Human Interactions, 3rd International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey (MolBioKon2014), İzmir, Türkiye (10-12 Eylül, 2014) B2. Hakan Gümüş and F. Erdoğan Sevilgen, Refining K-means Algorithm by Detecting Superfluous and Oversized Clusters, International Conference on Machine Learning and Data Analysis ( ICMLDA 2012), San Francisco, USA, (2012). B3. S. Durmuş Tekir, T. Çakır, A.S. Sayılırbaş, E. Çelik, S. Özcan, İ. Çevik, A.S. Özçelik, A. Özgür, F.E. Sevilgen, K.Ö. Ülgen, PHISTO: Pathogen-Host Interactions Search Tool, 15th European Conference on Biotechnology (ECB 12), Istanbul, Türkiye (23-26 September, 2012). B4. Umut Demirtaş and F. Erdoğan Sevilgen, Parallel EDMD Simulation for Multi-Core Architectures, Parallel and Distributed Computing and Systems (PDCS 2011) Dallas, USA, (2011). B5. Zülal Sevkli and F. Erdoğan Sevilgen, Discrete Particle Swarm Optimization for the Orienteering Problem, IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC 2010), Barcelona, Espain (2010). B6. Emrah Kaya and F. Erdoğan Sevilgen, A Fully Distributed Data Collection Method for HLA based Distributed Simulations, Summer Computer Simulation Conference (SCSC'09) in International Simulation Multi-conference (ISMc'09), İstanbul, Türkiye (2009). B7. Onur Detanoğlu and F. Erdoğan Sevilgen, Hydrodynamic Based Hybrid Dynamic Load Balancing, 23rd International Symposium on Computer and Information Sciences, ISCIS '08, İstanbul, Türkiye (2008). B8. Ömer Eroğlu, H.Ali Mantar and Fatih Erdoğan Sevilgen, Quadtree-Based Approach to Data Distribution Management for Distributed Simulations, Military Modeling & Simulation Symposium (MMS) in Spring Simulation Multiconference (SpringSim'08), Ottowa, Canada (2008). B9. İnanç Tahralı, Tolga Baştürk, F. Erdoğan Sevilgen, Theoretical and Experimental Analysis of MSES and Kshemkalyani-Singhal Algorithms under Distributed Simulation Environment, Military Modeling & Simulation Symposium (MMS) in Spring Simulation Multiconference (SpringSim'08), Ottowa, Canada (2008). 10

11 B10. Onur Detanoğlu and F. Erdoğan Sevilgen, Randomized Hydrodynamic Load Balancing Approach, First International Workshop on Simulation and Modelling in Emergent Computational Systems (SMECS-2008) in The 2008 International Conference On Parallel Processing (ICPP-08), Portland, Oregon, USA (2008). B11. Tolga Baştürk, F. Erdoğan Sevilgen, İnanç Tahralı, A New Approach For Fast Causal Message Ordering With Central Control, 2008 Spring Simulation Interoperability Workshop (SIW), Providence, Rhode Island (2008). B12. Zülal Sevkli and F. Erdoğan Sevilgen, Particle Swarm Optimization for the Orienteering Problem, International Symposium on Innovations in Intelligent Systems and Applications: INISTA, İstanbul (2007). B13. Tolga Basturk, Yasir Kurtulus Avcibasi, Onur Destanoglu, Omer Eroglu, Hurcan Gokce Solter, F. Erdogan Sevilgen, Isa Tasdelen, Oguz Dikenelli, Federate Management Infrastructure In HLA Based Distributed Simulations, 2007 Fall Simulation Interoperability Workshop, 07F-SIW, Orlando, FL, (2007). B14. Ersin Ünsal ve F. Erdoğan Sevilgen, BEMGA: A HLA Based Simulation Modeling and Development Tool, International Conference on Systems, Computing Sciences and Software Engineering: SCSS (2006). B15. İbrahim Soğukpınar, F. Erdoğan Sevilgen, Mehmet Göktürk, İnanç Tahralı and Mustafa Coşkun, An Interface Architecture For Simulation Integration Using HLA, International Conference on Informatics: ICI, Çeşme, İzmir (2004). B16. Fatih E. Sevilgen and Srinivas Aluru, A Provably Optimal, Distribution-Independent Parallel Fast Multipole Method, IEEE International Parallel & Distributed Processing Symposium (IPDPS 00), Cancun, Mexico (2000) 77. B17. Fatih E. Sevilgen and Srinivas Aluru, A Unifying Data Structure for Hierarchical Methods, ACM/IEEE Conference on Supercomputing (SC 99), Portland, Oregon (1999). B18. Fatih E. Sevilgen, Srinivas Aluru and Natsuhiko Futamura, Distributed Memory Tree Accumulations, International Conference on Parallel and Distributed Computing Systems (PDCS 99), Fort Lauderdale, Florida (1999). B19. Srinivas Aluru and Fatih E. Sevilgen, Parallel Domain Decomposition and Load Balancing Using Space-Filling Curves, IEEE Conference on High Performance Computing (HiPC 97), Calcutta, India (1997). B20. Kıvanç Dinçer, Haluk R. Topçuoğlu, Fatih E. Sevilgen, Paul C. Coddington, and Sanjay Ranka, Parallel Simulation of Dynamically Triangulated Random Surfaces, IASTED Eighth International Conference on Parallel and Distributed Computing and Systems (PDCS 96), Chicago, Illinois, USA (1996). C. Uluslararası Toplantılarda Sunulan Bildiriler C1. V.R. Akkaya, İ. Kandemir, F.E. Sevilgen, Meta-heuristic Optimization of Regenerative Rankine Cycles with Multiple Open Feed Water Heaters, ICEM 2014 International Conference on Energy and Management, Istanbul, Turkey, (5-7 June 2014), Poster Presentation. C2. S. Durmuş Tekir, T. Çakır, A. S. Sayılırbaş, E. Ardıç, İ. Karadeniz, A. Özgür, F.E. Sevilgen, K.Ö. Ülgen, PHISTO: A New Web Platform for Pathogen - Human 11

12 Interactions, 2 nd International Workshop on Systems Biology of Microbial Infection (SBMI 2013), Jena, Germany (19-20 September, 2013), Poster Presentation. C3. Fatih Sevilgen, Srinivas Aluru and Natsuhiko Futamura, A Provably Optimal Distribution Independent Parallel N-body Method, SIAM Annual Meeting (1999). D. Ulusal Dergilerde Yayımlanan Makaleler D1. Fatih Erdoğan Sevilgen, Dağıtık Benzetim Sistemleri, Savunma Sanayi Gündemi Dergisi, 2010/1 Sayı 11, (2010), ISSN E. Ulusal Hakemli Toplantılarda Sunulan ve Bildiri Kitabında Yayımlanan Bildiriler E1. M Bakir and FE Sevilgen, High performance online key performance indicator's calculations in oil refineries, Signal Processing and Communications Applications Conference (SIU 2015), Malatya, Türkiye (16-19 Mayıs 2015). E2. S Karahan and FE Sevilgen, CUDA implementation of the pixel based adaptive segmentation algorithm, Signal Processing and Communications Applications Conference (SIU 2015), Malatya, Türkiye (16-19 Mayıs 2015). E3. S. Durmuş Tekir, T. Çakır, A.S. Sayılırbaş, E. Çelik, S. Özcan, İ. Çevik, A.S. Özçelik, A. Özgür, F.E. Sevilgen, K.Ö. Ülgen, PHISTO: Pathogen-Host Interactions Search Tool, 17. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, Istanbul (23-26 Eylül, 2012) E4. S. Durmuş, T. Çakır, A.S. Sayılırbaş, E. Çelik, S. Özcan, İ. Çevik, A.S. Özçelik, A. Özgür, F.E. Sevilgen, K.Ö. Ülgen, PHISTO: Patojen-İnsan Protein Etkileşimleri Veritabanı, 10. Ulusal Kimya Mühendisliği Kongresi (UKMK-10), Istanbul (3-6 Eylül, 2012) E5. Hayri Tolga Çubukçuoğlu ve Fatih Erdoğan Sevilgen, Eş Olmayan Paralel Makine Çizelgelemesi Problemine VNS ve RVNS Yaklaşımı, Akıllı Sistemlerde Yenilikler ve Uygulamaları Sempozyumu (ASYU), Trabzon (2012). E6. Salih Cebeci ve Fatih Erdoğan Sevilgen, Maksimum Klik Problemi için Yeni Bir Hibrid Evrimsel Algoritma, Akıllı Sistemlerde Yenilikler ve Uygulamaları Sempozyumu (ASYU), Trabzon (2012). E7. Hayri Tolga Çubukçuoğlu ve Fatih Erdoğan Sevilgen, Cilk++ Platformunda N-Cisim Benzetimi, II. Ulusal Yüksek Başarımlı ve Grid Hesaplama Konferansı (Başarım10), İstanbul, (2010). E8. Burak İnner ve F. Erdoğan Sevilgen, Sıkıştırılmış Sekizli Ağaç ve Sekizli Ağaç Veriyapı ile Hiyerarşik Ağaç Temelli Algoritmaların Gerçekleştirilmesi ve Karşılaştırılması, I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı (Başarım09), Ankara, (2009). E9. İnanç Tahralı ve F. Erdoğan Sevilgen, Dağıtık Benzetim Sistemlerinde TENA Mimarisinin Kullanımı, Savunma Teknolojileri Kongresi (SAVTEK 08) Ankara (2008). E10. Münibe Şimşek Yıldırım ve Fatih Erdoğan Sevilgen, 3DRS Blok Karşılaştırma Algoritmasında Farklı Tarama Teknikleri ile Performans Arttırımı, Elektrik-Elektronik- Bilgisayar Mühendisliği 12. Ulusal Kongresi, Eskişehir, (2007). 12

13 E11. Bilge Esra Soran ve F. Erdoğan Sevilgen, Hücre Yapısının, Çok Hücreli, Olay Temelli, Molekül Dinamiği Simülasyonuna Etkisi, Elektrik-Elektronik-Bilgisayar Mühendisliği 12. Ulusal Kongresi, Eskişehir, (2007). E12. Ali Tozan, F. Erdoğan Sevilgen ve Onur İnce, Sensör Yerleştirme Probleminin Parçacık Sürü Optimizasyonu ile Çözümü, Elektrik-Elektronik-Bilgisayar Mühendisliği 12. Ulusal Kongresi, Eskişehir, (2007). E13. Tolga Baştürk, Yasir Kurtuluş Avcıbaşı, Onur Destanoğlu, Ömer Eroğlu, Hürcan Gökçe Solter, F. Erdoğan Sevilgen, İsa Taşdelen ve Oğuz Dikenelli, HLA Tabanlı Dağıtık Simülasyonlarda Federe Yönetim Altyapısı, Ulusal Savunma Uygulamaları Modelleme ve Simülasyon Konferansı (USMOS 07), Ankara (2007). E14. Ramazan Cengiz ve F. Erdoğan Sevilgen, Dağıtık Benzetim Sistemleri İçin Performans Analizi Yönteminin Geliştirilmesi, Ulusal Savunma Uygulamaları Modelleme ve Simülasyon Konferansı (USMOS 07), Ankara (2007). E15. Ersin Ünsal ve F. Erdoğan Sevilgen, Yüksek Seviyeli Mimari İçin Modelleme Ve Uygulama Geliştirme Aracı, Savunma Teknolojileri Kongresi (SAVTEK 06), Ankara (2006). E16. Burak İnner ve F.Erdoğan Sevilgen, N-Cisim Algoritmalarının Performans Karşılaştırılması, Elektrik - Elektronik ve Bilgisayar Mühendisliği Sempozyumu (ELECO 2004), Bursa, (2004). E17. İbrahim Soğukpınar, F. Erdoğan Sevilgen, Mehmet Göktürk, İnanç Tahralı ve Mustafa Coşkun, Taktik Analiz Modelleme ve Benzetimi, Havacılıkta İleri Teknolojiler ve Uygulamaları Sempozyumu (HITEK 2004), Hava Harp Okulu, Yeşilyurt, İstanbul (2004). E18. F.Koray Atsan ve F.Erdoğan Sevilgen, ELIAC Güvenli LDAP Erişimi için Özgün Bir Protokol Tasarımı, TBD 20. Bilişim Kurultayı, Taksim, İstanbul (2003). E19. Kemal Yılmaz ve F.Erdoğan Sevilgen, Dağıtık Web Önbellek Sunucusu Tasarımı Ve Gerçeklenmesi, Elektrik, Elektronik, Bilgisayar Mühendisliği 10. Ulusal Kongresi, İstanbul (2003). E20. F.Koray Atsan ve F.Erdoğan Sevilgen, ELIAC - A Custom Protocol Design for Secure LDAP Access, 9. "Türkiye'de İnternet" Konferansı, İstanbul (2003). F. Ulusal Toplantılarda Sunulan Bildiriler F1. Onur Detanoğlu and F. Erdoğan Sevilgen, Normal Mod Yönteminin Dağıtık Ortamda Paralel Olarak Çalıştırılması, 8. Ulusal Akustik Kongresi, Antalya (2008). G. Kitaplar G1. F. Erdoğan Sevilgen ve Hasan Sadıkoğlu (Editörler), "Yüksek Performanslı Bilişim", 1. Ulusal YPBS 2002 Sempozyum Kitapcığı, GYTE Matbaası, Gebze, Türkiye, H. Teknik Raporlar 13

14 H1. Fatih E. Sevilgen, Srinivas Aluru and Natsuhiko Futamura, A Provably Efficient, Distribution-Independent Parallel Fast Multipole Method, Technical Report, NMSU- CSTR-9901, İ. Diğer Sunumlar İ1. Introduction to Parallel and Distributed Simulations, Bielska Wyższa Szkoła im. J. Tyszkiewicza, Polonya, Erasmus Değişim Programı, Mayıs İ2. Particle Swarm Optimization with Applications to TSP Variations, Anadolu Üniversitesi, Kasım İ3. Introduction to Parallel Computing, EPITA : Ecole d'ingénieurs en Informatique, Fransa, Erasmus Değişim Programı, Haziran İ4. A New Dynamic Hierarchical Data Structure: Distribution-Independent Adaptive Tree, Yeditepe Universitesi, Istanbul, 14 Haziran