T. C. İSTANBUL BİLİM ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ TIBBİ BİYOLOJİ VE GENETİK ANABİLİM DALI YÜKSEK LİSANS PROGRAMI 2017-2018 EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI DERS İÇERİKLERİ I. YARIYIL MOLEKÜLER HÜCRE BİYOLOJİSİ I (TBG 601, ZORUNLU, TEORİK 3, 3 KREDİ) 1. Hücrenin Genel Özellikleri ve Hücreyi İnceleme Yöntemleri 2. Hücre Membranı, Hücre Zarında Taşınma 3. Hücre Zarında Serbest, Yan ve Bazal Yüzey Farklılaşmaları 4. Hücre İskeleti 5. Ekstrasellüler Matriks ve Reseptörleri 6. Nükleus, Nükleolus, Mitokondri 7. Endoplazmik Retikulum, Ribozom, Golgi Cisimciği 8. Lizozom ve Peroksizom, Vakuol, Sentrozom ve Plastid 9. Nükleik Asitler (DNA)- DNA Replikasyonu 10. Nükleik Asitler (RNA ve Çeşitleri) 11. Transkripsiyon-TranslasyoN-Rekombinasyon MOLEKÜLER İMMÜNOLOJİ I (TBG 607, ZORUNLU, TEORİK 3, KREDİ 3) 1. İmmün Yanıtların Genel Özellikleri 2. İmmün Sistem Elemanları 3. Antikor ve Antijenler 4. B Lenfosit Matürasyonu 5. İmmünglobulin Genlerinin Ekspresyonu 6. Majör Histokompatibilite Kompleksi (MHC) 7. T Hücre Antijen Tanıma 8. Aktivasyonunun Moleküler Temeli 9. T Hücre Matürasyonu 10. B Hücre Aktivasyonu 11. Antikor Üretimi
İNSAN GENETİĞİ (TBG 606, ZORUNLU, TEORİK 3, KREDİ 3 ) 1. Tıpta genetiğin yeri ve klinik genetiğe giriş. 2. Otozomal dominant kalıtılan hastalıklar. 3. Otozomal resessif kalıtılan hastalıklar. 4. X e bağlı kalıtılan hastalıklar. 5. Non mendelian kalıtılan hastalıklar. 6. Maternal kalıtılan hastalıklar (Mitokondriyal kalıtım). 7. Multifaktoriyel kalıtım ve örnekleri. 8. Prenatal/Preimplantasyon Genetik Tanı 9. İnfertilitede Genetik Yaklaşım 10. Fetal Kayıpda Genetik Yaklaşım 11. Kanser Genetiği KÖK HÜCRE BİYOLOJİSİ (ZORUNLU, TEORİK 3, KREDİ 3) 1- Kök Hücrelere Giriş; 2- Kök Hücrelerin Özellikleri: Kendini Yenileme, Güç, 3- Klonalite; Kök Hücrelerin Tanımlanması, İzolasyonu ve Karakterizasyonu; 4- Embriyonik Kök Hücreler: Kökeni ve Özellikleri; 5- Amniyotik Sıvı ve Plesenta Kaynaklı Kök Hücreler; 6- Mezenkimal Kök Hücreler; 7- Epitelyal Deri Kök Hücreleri 8- Hematopoetik Kök Hücreler; Periferal Kan Kök Hücreleri; 9- Pankreatik Kök Hücreler ve Nöral Kök Hücreler; 10- Çoklu Potansiyele Sahip Erişkin Öncül Hücreler; Erişkin Karaciğer Kök Hücreleri; 11- IPS hücreleri
TIBBİ BİYOLOJİDE KULLANILAN LABORATUVAR YÖNTEMLERİ (TBG-618, SEÇMELİ, TEORİK 2, UYGULAMA 4, KREDİ 4) 1. Genel Laboratuvar organizasyonu, Moleküler Biyoloji Laboratuvarında Kullanılan Aletlerin Tanıtılması 2. Işık, Floresan, Konfokal ve Elektron Mikroskopu 3. Laboratuvarda solüsyon ve tampon çözelti hazırlama, saklama ve atık kontrolü 4. Ökaryotik Hücre/Bakteri Kültürü, ve Sterilizasyon Teknikleri 5. Doku ve hücreden DNA/RNA İzolasyonu, Nükleik Asitlerin Kalitatif ve Kantitatif Tayini 6. Agaroz Jel Elektroforezi, Polimeraz Zincir Reaksiyonu Tipleri ve Uygulamalı Gen Amplifikasyonu 7. Gen Polimorfizmlerinin Restriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi (RFLP) Yöntemi İle Tayini 8. DNA İşaretleme Yöntemleri, DNA Footprinting Hibridizasyona Dayalı Teknikler 9. DNA Dizi Analizi ve Rekombinant DNA Teknolojisi 10. Protein Ayrıştırma ve İnceleme Metodları, Western İşaretleme 11. Araştırmada İstatistiğin Önemi, Sonuçların sunumu, Literatür Yazımı II. YARIYIL MOLEKÜLER HÜCRE BİYOLOJİSİ II (TBG 602, ZORUNLU, TEORİK 3, 3 KREDİ) 1. Mitokondriyum 2. Mitokondriyal DNA ve Kalıtımı 3. Ribozom Yapısı ve Biyogenezi 4. Düz Yüzlü Endoplazmik Retikulum 5. Granüllü Endoplazmik Retikulum 6. Golgi Kompleksi Yapısı ve Fonksiyonu 7. Hücre İçi Vezikül Trafiği 8. Lizozomlar ve lizozomal hastalıklar 9. Peroksizolar ve peroksitoplazmik transport 10. Proteazom Yolu 11. Nukleus, nukleolus, nukleositoplazmik transport 12. Heterokromatin, Ökrpmatin ve kromatin ince yapısı 13. Literatür tartışması
MOLEKÜLER İMMÜNOLOJİ II (TBG 620, ZORUNLU, TEORİK 3, KREDİ 3) 1. İmmünolojik Tolerans ve İmmün Yanıtların Düzenlenmesi 2. Sitokinler 3. Hücre Aracılı İmmünitenin Efektör Hücreleri 4. Kompleman Sistemi 5. Aşırı Duyarlılık Tepkimeleri (Allerji) 6. Otoimmünite 7. Doku Uygunluk Antijenleri 8. İmmün Yetmezlik Hastalıkları 9. Transplantasyon İmmünolojisi 10. İmmün Sistemden kaçış mekanizmaları 11. Kanser İmmünolojisi KANSER BİYOLOJİSİ (TBG 604, ZORUNLU, TEORİK 3, KREDİ 3) 1. Kanserin tanımı ve kanser oluşum mekanizmaları 2. Kanserin nedenleri 3. Kanserin kalıtılabilirlik özelliği 4. DNA tamiri ve kanser 5. Kanserde epigenetik olaylar 6. Onkogenler 7. Tümör süpressör genler 8. Kanserde hücre döngüsü 9. Kanserde hücresel immortalizasyon ve telomeraz aktivitesi 10. Apopitozis
SEMİNER (TBG 640, ZORUNLU) Tıbbi Biyoloji ve Genetik alanındaki temel konuları ve son yıllardaki gelişmelerin gerçekleştiği önemli konuların seçilip, bunların son literatürlerin ışığı altında seminer haline getirilip tartışmaya açılması ile üzerinde çalışma yapılan (tez çalışması,vs.) spesifik konularda bilgilerin derinleştirilmesini hedeflenmektedir. Bunun için yabancı dilde literatür bilgilerinin taranabilmesi, laboratuvar çalışmalarının ve deneysel verilerin yorumlanabilmesi amacıyla belirlenmiş konularda, uluslararası makaleler değerlendirilerek, seminer şeklinde sunulacaktır. Bu çalışma ile öğrenciye uyumlu bir işbirliği içinde tartışılabilme, birlikte çalışma anlayışının, araştırma ve kariyer etiğinin kazandırılması amaçlanmaktadır. TEMEL GENETİK PRENSİPLER (SEÇMELİ) 1. Gen,genotip,fenotip kavramları 2. Kromozom yapısı ve organizasyonu 3. Mendel kalıtım modelleri 4. Mendel dışı kalıtım modelleri 5. Kromozom bozuklukları I 6. Kromozom bozuklukları II 7. Populasyon genetiği ve bağlantı analizleri 8. Mutasyon ve polimorfizm 9. Kromozom Analiz Endikasyonları 10. Populasyon taramaları 11. Genetik danışmanlık 12. Cinsiyet gelişim bozuklukları 13. X-inaktivasyonu
HÜCRE GENOMUNUN DÜZENLENMESI (SEÇMELİ) 1. DNA ve RNA Yapısı 2. Gen, genom 3. DNA Replikasyonu 4. Transkripsiyon 5. Gen Rekombinasyonu 6. Protein Sentezi 7. Gen İfadesinin Düzenlenmesi 8. DNA Metilasyonu 9. Mutasyonlar 10. DNMA hasarı ve tamiri 11. Moleküler filogenetik 12. Literatür tartışması 13. Literatür tartışması HÜCRE FARKLILAŞMASININ MOLEKÜLER TEMELLERI (SEÇMELİ) 1. Hücre çeşitleri 2. Kök hücre tipleri 3. Farklılaşma ve çoğalma 4. Farklılaşmanın mekanizmaları 5. Farklılaşmada hücre sinyal sistemi 6. Farklılaşmanın kontrolü ve ekstraselüler faktörler 7. DNA metilasyonu 8. Homogenler ve farklılaşma 9. Hücre farklılaşmasının genetik kontrolü 10. Farklılaşma ve kanser tedavisi 11. Literatür sunumu ve tartışması 12. Literatür sunumu ve tartışması 13. Literatür sunumu ve tartışması
Hücre Laboratuvarlarının Fiziki Özellikleri Hücre Kültürünün Temel Prensipleri Primer Nöron Kültürünün Prensipleri Hücre Kültürlerinde Canlılık Testleri Hücre Kültürüne Yapılacak Peptid ve Kimyasal Uygulamaları Hücre Kültüründe sirna Aracılı Gen Susturulması Hücre Kültüründe Transfeksiyon Yöntemleri Kültür Hücrelerinden RNA izolasyonları ve qrt-pcr Kültür Hücrelerinden Protein izolasyonları ve Western Blot Kültür Hücrelerinde Immünfloresan İşaretlemeler Hücre Kültürü Deneyi Planlama Proje Sunumu ve Tartışma-1 Proje Sunumu ve Tartışma-2 Proje Sunumu ve Tartışma-3 III. YARIYIL YÜKSEK LİSANS UZMANLIK ALAN DERSİ- 1 (TBG 661, ZORUNLU, TEORİK 3, 3 KREDİ) Tez aşamasında olan öğrencilere, Tıbbi Biyoloji ve Genetik konularında planladıkları bilimsel araştırma ile ilgili bilgi ve becerilerin danışman öğretim üyesi tarafından aktarılmasını, öğrencilere bilimsel etik ve çalışma disiplininin, güncel literatürü izleyebilme ve değerlendirebilme yeteneğinin kazandırılmasını içerir. YÜKSEK LİSANS TEZ ÇALIŞMASI- 1 (TBG 663, ZORUNLU) Yüksek lisans tezi I. ve II. Yarıyılda verilen kredili derslerini ve seminer dersini başarı ile tamamlayan öğrencilerin, bir öğretim üyesi danışmanlığında, Enstitü Yönetim Kurulunun onayladığı konuda bağımsız bir çalışma yürütebilmesini içerir. Bu amaçla tez çalışması süresince yüksek lisans öğrencisi literatür tarama, veri toplama ve değerlendirme, analiz yapma ve sonuçlarını yazılı olarak sunmaya yönelik olarak danışmanının gözetiminde çalışmalar yapar.
IV. YARIYIL (YÜKSEK LİSANS UZMANLIK ALAN DERSİ -II (TBG 662, ZORUNLU, TEORİK 3, 3 KREDİ) Tez aşamasında olan öğrencilere, Tıbbi Biyoloji ve Genetik konularında planladıkları bilimsel araştırma ile ilgili bilgi ve becerilerin danışman öğretim üyesi tarafından aktarılmasını, öğrencilere bilimsel etik ve çalışma disiplininin, güncel literatürü izleyebilme ve değerlendirebilme yeteneğinin kazandırılmasını içerir. YÜKSEK LİSANS TEZ ÇALIŞMASI- II (TBG 664, ZORUNLU) Yüksek lisans tezi I. ve II. Yarıyılda verilen kredili derslerini ve seminer dersini başarı ile tamamlayan öğrencilerin, bir öğretim üyesi danışmanlığında, Enstitü Yönetim Kurulunun onayladığı konuda bağımsız bir çalışma yürütebilmesini içerir. Bu amaçla tez çalışması süresince yüksek lisans öğrencisi literatür tarama, veri toplama ve değerlendirme, analiz yapma ve sonuçlarını yazılı olarak sunmaya yönelik olarak danışmanının gözetiminde çalışmalar yapar.