İTÜ LİSANSÜSTÜ DERS KATALOG FORMU (GRADUATE COURSE CATALOGUE FORM) Dersin Adı İleri Moleküler Genetik Course Name Advanced Molecular Genetics Kodu Yarıyılı Kredisi AKTS Kredisi Ders Türü (Course Type) (Code) (Semester) (Local Credits) (ECTS Credits) MBG527E Güz 3.0 7.5 Yüksek Lisans M.Sc. Bölüm / Program (Department/Program) Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Programı Molecular Biology, Genetics and Biotechnology Program Dersin Türü (Course Type) Seçmeli (Elective) Dersin Dili (Course Language) İngilizce (English) Dersin İçeriği (Course Description) Genetik materyaller, viral ve bakteri kromozomları, ökaryotik kromozomlarda DNA organizasyonu, DNA replikasyonu, biyolojik olarak aktif DNA nın in vivo sentezi, gen regulasyonu, mutasyonlar ve DNA onarımı, protein sentezi; modern moleküler biyoloji teknikleri ve güncel uygulamalar, proje bazında bilgiler ışığında teknik ve temel bilgilerin uygulanması Genetic materials, viral and bacterial chromosomes, DNA organization in eukaryotic chromosomes, DNA replication, in vivo synthesis of biologically active DNA, gene regulation, mutations and DNA repair, protein synthesis, modern molecular biology techniques and their applications, research project based application of what has been learnt Dersin Amacı (Course Objectives) Dersin Öğrenme Çıktıları (Course Learning Outcomes) 1. Genetik materyaller ve mekanizmalar son araştırmaların ışığında tartışılacaktır. 2. Hücrelerdeki bu mekanizmaların moleküler genetik teknikleri kapsamında nasıl kullanıldığı kıyaslamalı olarak incelenecektir. 1. To inform students about genetic materials and mechanisms in the light of advance research topics 2. Those cellular mechanisms will be discussed with the usage of advanced molecular genetics methodologies Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler aşağıdaki konularda bilgi, beceri ve yetkinlik kazanırlar: 1. Temel genetik materyallerin (DNA/RNA) ileri boyutta incelenmesi 2. DNA-RNA-Protein yolağındaki reaksiyonların incelenmesi 3. Güncel Moleküler Biyoloji tekniklerinin incelenmesi 4. Bu bilgiler doğrultusunda moleküler tekniklerle çözülecek genetik problemlerin incelenmesi 5. Moleküler biyoteknoloji yöntemleri ve temel bilgiler kullanılarak bu problemleri çözecek orijinal proje yaratılması. Students who successfully pass this course gain knowledge, skills and proficiency in the following subjects 1. Investigation of basic genetic materials (DNA/RNA) at advanced level. 2. Investigation of DNA-RNA-Protein pathway reactions 3. Investigation of recent molecular biology techniques 4. In the light of these information investigation of genetic problems that can be approached with molecular techniques 5. Application of molecular biotechnology techniques and basic information to solve above mentioned problems via creation of unique projects.
Kaynaklar (References) Ödevler ve Projeler (Homework & Projects) Laboratuar Uygulamaları (1.) Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, and Walter P. 2002. Molecular Biology of the Cell, 4th edition, Garland Science, New York. USA. (2.) Lewin B, 2008. The Gene IX.ed. Jones and Bartlett Publishers, Sudbury, USA. (3.) Lodish H, Berk A, Zipursky SL, et al. 2000, Molecular Cell Biology. 4th edition. W. H. Freeman, New York. USA. (4.) Strachan T ve Read A. 2010. Human Molecular Genetics, 4ed, Bios Scientific Publishers, New York, USA (5.) Russel PJ. 2009. igenetics: Molecular Approach (3 rd ed). Benjamin Cumming Pub., New York USA. Öğrencilerden bireysel ya da grup halinde güncel makaleler temel alınaraköğrendikleri bilgiler ışığında araştırma projesi hazırlayıp sunuması istenecektir Students are required to make a presentation based on a research project created by them with the help of recent manuscripts (Laboratory Work) Bilgisayar Kullanımı (Computer Use) Diğer Uygulamalar (Other Activities) Başarı Değerlendirme Sistemi Faaliyetler (Activities) Adedi* (Quantity) Değerlendirmedeki Katkısı, % (Effects on Grading, %) (Assessment Criteria) Yıl İçi Sınavları (Midterm Eams) 2 (2 X % 20 = % 40) (2 20 % = 40 %) Kısa Sınavlar (Quizzes) Ödevler (Homework) 1 % 20 (20 %) Projeler (Projects) Dönem Ödevi/Projesi (Term Paper/Project) Laboratuar Uygulaması (Laboratory Work) Diğer Uygulamalar (Other Activities) Final Sınavı (Final Eam) 1 % 40 (40 %) *Yukarıda Belirtilen Sayılar Minimum Olup Yerine Getirilmesi Zorunludur. Gerekli Görüldüğü Takdirde Arttırılabilir.
DERS PLANI Hafta Konular Dersin Çıktıları 1 Genetik materyaller, DNA ve RNAnın yapısı, 1 2 İkili sarmalın termodinamiği, DNA konformasyon çeşitleri, 1 3 Viral, bakteriyel ve ökaryotik kromozomlarda DNA organizasyonu 2 4 DNA replikasyonu, replikasyon orijini, replikasyon enzimleri, DNA nın in vivo sentezi 2 5 Gen regulasyonu, 3 6 Mutasyonlar, DNA onarımı, rekombinasyon, protein sentezi, 3 7 DNA onarımı, rekombinasyon, protein sentezi 4 8 Moleküler biyoloji yöntemlerinin anlatılan bilgiler ışığında uygulamaları, Polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) 5 9 Gerçek zamanlı kantitatif PZR güncel örneklerle 5 10 Klonlama güncel uygulama örnekleriyle 5 11 metodların güncel genetik problemlerde uygulamaları I 5 12 güncel genetik problemlerde uygulamaları II 5 13 problemin çözümüne dayalı orijinal proje üretimi 5 14 projelerin sunularak çözümlerin uygulanabilirliğinin tartışılması 5 COURSE PLAN Weeks Topics Course Outcomes 1 Genetic materials, Structure of DNA-RNA in advance level 1 2 Thermodynamics of double heli, DNA conformations 1 3 DNA organization in Viral,Bacterial and Eukaryotic chromosomes 2 4 DNA replication, origin of replication, replication enzymes, in vivo synthesis of DNA 2 5 Gene regulation 3 6 Mutations, DNA repair, recombination, protein synthesis 3 7 DNA repair, recombination, protein synthesis 4 8 Application of molecular biology techniques, Polymerase chain reaction (PCR) 5 9 Real time quantitative PCR with recent samples 5 10 Cloning with recent samples 5 11 Application of methods for solving genetic problems I 5 12 Application of methods for solving genetic problems II 5 13 Project proposals for hypothetical problems 5 14 Presentation of project proposals and discussion of applicability of the projects. 5
1: Az, 2. Kısmi, 3. Tam Dersin Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Programıyla İlişkisi Katkı Programın mezuna kazandıracağı bilgi, beceri ve yetkinlikler (programa ait çıktılar) Seviyesi 1 2 3 i. Lisans düzeyi yeterliliklerine dayalı olarak, ilgili program alanında bilgilerini uzmanlık düzeyinde geliştirebilme ve derinleştirebilme (yeterli bilgi birikimi) (bilgi). ii. Alanının ilişkili olduğu disiplinler arası etkileşimi kavrayabilme (bilgi). iii. Alanında edindiği uzmanlık düzeyindeki kuramsal ve uygulamalı bilgileri kullanabilme (beceri). iv. Alanında edindiği bilgileri farklı disiplin alanlarından gelen bilgilerle bütünleştirerek yorumlayabilme ve yeni bilgiler oluşturabilme (beceri). v. Alanını ile ilgili karşılaşılan sorunları araştırma yöntemlerini kullanarak çözümleyebilme (beceri). vi. Alanını ile ilgili uzmanlık gerektiren bir çalışmayı bağımsız olarak yürütebilme (Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği). vii. Alanı ile ilgili uygulamalarda karşılaşılan ve öngörülemeyen karmaşık sorunların çözümü için yeni stratejik yaklaşımlar geliştirebilme ve sorumluluk alarak çözüm üretebilme (Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği). viii. Alanı ile ilgili sorunların çözümlenmesini gerektiren ortamlarda liderlik yapabilme (Bağımsız Çalışabilme ve Sorumluluk Alabilme Yetkinliği). i. Alanında edindiği uzmanlık düzeyindeki bilgi ve becerileri eleştirel bir yaklaşımla değerlendirebilme ve öğrenmesini yönlendirebilme (Öğrenme Yetkinliği).. Alanındaki güncel gelişmeleri ve kendi çalışmalarını, nicel ve nitel veriler ile destekleyerek, alanındaki ve alan dışındaki gruplara, yazılı, sözlü ve görsel olarak sistemli biçimde aktarabilme (İletişim ve Sosyal Yetkinlik). i. Sosyal ilişkileri ve bu ilişkileri yönlendiren normları eleştirel bir bakış açısı ile inceleyebilme, geliştirebilme ve gerektiğinde değiştirmek üzere harekete geçebilme (İletişim ve Sosyal Yetkinlik). ii. Bir yabancı dili en az Avrupa Dil Portföyü B2 genel düzeyinde kullanarak sözlü ve yazılı iletişim kurabilmek (İletişim ve Sosyal Yetkinlik). iii. Alanının gerektirdiği düzeyde bilgisayar yazılımı ile birlikte bilişim ve iletişim teknolojilerini ileri düzeyde kullanabilme (İletişim ve Sosyal Yetkinlik). iv. Alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, uygulanması ve duyurulması aşamalarında toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerleri gözeterek denetleyebilme ve bu değerleri öğretebilme (Alana Özgü Yetkinlik). v. Alanı ile ilgili konularda strateji, politika ve uygulama planları geliştirebilme ve elde edilen sonuçları, kalite süreçleri çerçevesinde değerlendirebilme (Alana Özgü Yetkinlik). vi. Alanında özümsedikleri bilgiyi, problem çözme ve/veya uygulama becerilerini, disiplinlerarası çalışmalarda kullanabilme (Alana Özgü Yetkinlik). vii Alanının gelişmesinde yer alan önemli kişileri, olay ve olguları, alanının uygulamalarına etkileri açısından değerlendirir (Alana Özgü Yetkinlik)(Doğa/Yaşam Bilimleri-Yüksek Lisans- Akademik,Gerekli Temel Alan Yeterlilikleri) viii Tezli programlarda, kendi çalışmalarını, alanındaki uluslararası platformlarda, yazılı, sözlü ve/veya görsel olarak aktarabilme (Alana özgü yetkinlik).
Relationship between the Course and Molecular Biology, Genetics and Biotechnology Program Level of Program Outcomes Contribution 1 2 3 i. Developing and intensifying knowledge in the related program s area, based upon the competency in the undergraduate level (sufficient knowledge) (knowledge). ii. Grasping the inter-disciplinary interaction related to one s area (knowledge). iii. The ability to use the epert-level theoretical and practical knowledge acquired in the area (skill). iv. Interpreting and forming new types of knowledge by combining the knowledge from the area and the knowledge from various other disciplines (skill). v. Solving the problems faced in the area by making use of the research methods (skill). vi. The ability to carry out a specialistic study related to one s area independently. (Competence to work independently and take responsibility). vii. Developing new strategic approaches to solve the unforeseen and comple problems arising in the practical processes of one s area and coming up with solutions while taking responsibility (Competence to work independently and take responsibility). viii. Fulfilling the leader role in the environments where solutions are sought for the problems related to the area (Competence to work independently and take responsibility). i. Assessing the specialistic knowledge and skill gained through the study with a critical view and directing one s own learning process (Learning Competence).. Systematically transferring the current developments in the area and one s own work to other groups in and out of the area; in written, oral and visual forms (Communication and Social Competency). i. Ability to see and develop social relationships and the norms directing these relationships with a critical look and the ability to take action to change these when necessary. (Communication and Social Competency). ii. Proficiency in a foreign language at least European Language Portfolio B2 Level- and establishing written and oral communication with that language (Communication and Social Competency). iii. Using the computer software together with the information and communication technologies efficiently and according to the needs of the area (Communication and Social Competency). iv. Paying regard to social, scientific, cultural and ethical values during the collecting, interpreting, practicing and announcing processes of the area related data and the ability to teach these values to others (Area Specific Competency). v. Developing strategy, policy and application plans concerning the subjects related to the area and the ability to evaluate the end results of these plans within the frame of quality processes (Area Specific Competency). vi. Using the knowledge and the skills for problem solving and/or application (which are processed within the area) in inter-disciplinary studies (Area Specific Competency). vii Evaluating key people, events and facts taking role in the development of the area on the basis of their effect on applications in the area( Area Specific Competency ) viii In the programs with thesis, the ability to present one s own work within the international environments orally, visually and in written forms (Area Specific Competency). 1: Little, 2. Partial, 3. Full Düzenleyen (Prepared by) Y.Doç.Dr.Alper Tunga Akarsubaşı Tarih (Date) 21.10.2011 İmza (Signature)