Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu

Benzer belgeler
Batı Akdeniz sahil kuşağında yaygın yonca (Medicago sativa L.) populasyonlarının toplanması ve morfolojik karekterizasyonu *

YÜKSEKÖĞRETİM KURULU YARDIMCI DOÇENT : Sinop Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü Sinop

Domuz Ayrığı (Dactylis glomerata L.) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi

DNA MİNİSATELLİT MARKIRLARINDAN YARARLANILARAK FİĞDE (Vicia sativa L.) TANE VERİMİNİN ÖNCEDEN BELİRLENMESİ OLANAKLARI

Araştırma Makalesi (Research Article)

GÖREV YERLERİ(Tarih/Unvan/Kurum) Araştırma Görevlisi Uludağ Üniversitesi Ziraat Fakültesi

I. Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri İvesi Koyunlarında mikrosatellite lokuslarında polimorfizmin tespiti Güneydoğu Anadolu Tarımsal Araştı

Ege Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı / 2010

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü

KARADENİZ BÖLGESİNDEN SEÇİLEN BAZI KIRMIZI AHUDUDU (Rubus ideaus L.) TİPLERİNİN GENETİK FARKLILIĞININ RAPD TEKNİĞİ İLE BELİRLENMESİ

T.C. SÜLEYMAN DEMİREL ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ISPARTA İLİ KİRAZ İHRACATININ ANALİZİ

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Sebze Islahında Moleküler Markırların Kullanımı

ISSR Primerleri ile Kültürü Yapılan Bazı Yonca (Medicago sativa L.) Ekotiplerinde Moleküler Farklılıkların Belirlenmesi

BAZI KARPUZ GENOTİPLERİNİN SSR ve SRAP MARKÖRLERİ ile KARAKTERİZASYONU 1. Characterization of Some Watermelon Genotypes by SSR and SRAP Markers

Öğr. Gör. Tuğba GÜLEÇ

Isparta Ekolojik Koşullarında Bazı Yonca (Medicago sativa L.) Çeşitlerinin Ot Verim ve Kalitelerinin Belirlenmesi

YONCA ISLAHINDA YEREL POPÜLASYONLARIN DEĞERLENDİRİLMESİ

Antalya Doğal Florasında Bulunan Yonca (Medicago sp.) Türlerinin Toplanması ve Morfolojik Özelliklerinin Belirlenmesi

Tritikale (X Triticosecale Wittmack) Genotiplerinin ISSR-PCR Yöntemi ile Moleküler Düzeyde Tanımlanması

Bazı Ekmeklik Buğday (Triticum aestivum L.) Çeşit ve Hatlarının Genetik Uzaklıklarının Belirlenmesi

Bazı Ceviz (Juglans regia L.) Çeşitlerinin Çimlenme ve Çöğür (Anaçlık) Gelişme Performanslarının Belirlenmesi

TÜRKİYE DE BULUNAN BAZI YERLİ SIĞIR IRKLARININ GENETİK YAPILARININ KARAKTERİZASYONU

ISSN: Yıl /Year: 2017 Cilt(Sayı)/Vol.(Issue): 1(Özel) Sayfa/Page: Araştırma Makalesi Research Article

Orta Karadeniz Bölgesi nden Toplanan Yerel Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Populasyonlarında Biyoçeşitlilik Üzerine Bir Araştırma


İpek 607 Pamuk (G. hirsitum L.) Çeşidinde Farklı Gama Işını (Cobalt 60) Dozlarının M2 Popülasyonunda Lif Kalite Özellikleri Üzerine Etkisi

*Yaşar Tuncer KAVUT Ahmet Esen ÇELEN Ş. Emre ÇIBIK M. Ali URTEKİN

Bazı aspir genotiplerinin pas hastalığına karşı reaksiyonları hakkında ön çalışma 1

Orta Karadeniz Bölgesi nden Toplanan Yerel Kuru Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Genotiplerinde Morfolojik Varyabilitenin İstatistiksel Analizi

ISSN: Yıl /Year: 2017 Cilt(Sayı)/Vol.(Issue): 1(Özel) Sayfa/Page: Araştırma Makalesi Research Article

TÜRKİYE ACURLARININ (CUCUMIS MELO VAR. FLEXUOSUS) GENETİK VE MORFOLOJİK KARAKTERİZASYONU *

ÖZET. Yüksek Lisans Tezi. Đmge Đ. TOKBAY. Adnan Menderes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Tarla Bitkileri Anabilim Dalı

Medicago truncatula EST Veri Tabanından EST SSR Markörlerinin Geliştirilmesi

Nesrin AKTEPE TANGU. Ege Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı 2012

Bazı Makarnalık Buğday Çeşitleri ile Yeni Geliştirilen Hatlarda Genetik İlişkilerin RAPD Markörleriyle İncelenmesi 1

Kendilenmiş Mısır Hatlarının Tane Verimi ve Diğer Bazı Özellikler Bakımından Kombinasyon Yeteneklerinin Yoklama Melezlemesi Yöntemiyle Belirlenmesi

1. ÖZGEÇMİŞ. Selahattin ÇINAR EĞİTİM BİLGİLERİ. Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi (Tarım Ekonomisi)

ANTEPFISTIĞI SSR LOKUSLARINDAN YENİ ISSR PRİMERLERİNİN GELİŞTİRİLMESİ. Development Of New ISSR Prımers From Pıstachıo SSR Locı

Geliş Tarihi:

Çoklu Melez Parsellerinde Yer Alan Yonca Genotiplerinin Tohum Tutma Özelliklerinin Belirlenmesi

A. SCI, SCI-Expanded KAPSAMINDA ULUSLARARASI HAKEMLİ. A1. Beyhan M.A., A. Tekgüler, T. Yıldız and H. Sauk Investigation

ÖZGEÇMİS Doç. Dr. Nevzat AYDIN

Fen Edebiyat Fak. Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü Kütahya 1977

BATI AKDENİZ SAHİL KUŞAĞINDA SORGUM

Proje Yürütücüsü Prof. Dr. Erdoğan Eşref Hakkı Selçuk Üniversitesi Toprak Bilimi ve Bitki Besleme Bölümü

ORMAN AĞACI ISLAHI. Yrd. Doç. Dr. DENİZ GÜNEY ( GÜZ DÖNEMİ)

Konya Bölgesinden Toplanan Phaseolus vulgaris (Leguminosae) Populasyonları Arasındaki Genetik Çeşitliliğin SDS-PAGE Yöntemi ile Belirlenmesi

TRAKYA BÖLGESİ FLORASINDAKİ YABANİ HARDAL (Sinapis sp.) GENOTİPLERİNİN MOLEKÜLER VE MORFOLOJİK KARAKTERİZASYONU, TARLA KOŞULLARINDAKİ VERİMİ İLE

YARASA VE ÇİFTLİK GÜBRESİNİN BAZI TOPRAK ÖZELLİKLERİ ve BUĞDAY BİTKİSİNİN VERİM PARAMETRELERİ ÜZERİNE ETKİSİ

EGE ÜNİVERSİTESİ BİLİMSEL ARAŞTIRMA PROJE KESİN RAPORU EGE UNIVERSITY SCIENTIFIC RESEARCH PROJECT REPORT

HARCAMALARIN %'LİK DAĞILIMI

ORMAN AĞACI ISLAHI. Yrd. Doç. Dr. DENİZ GÜNEY ( GÜZ DÖNEMİ)

BAHÇE Özel Sayı: VII. ULUSAL BAHÇE BİTKİLERİ KONGRESİ BİLDİRİLERİ - Cilt I: Meyvecilik

BATI AKDENİZ VE EGE BÖLGESİ NDE YABANİ VE KÜLTÜR FORMUNDA YETİŞEN KEÇİBOYNUZU TİPLERİNİN SELEKSİYONU

BATI AKDENİZ BÖLGESİNDE TARLA BİTKİLERİ TARIMI. Akdeniz üniversitesi Ziraat Fakültesi Tarla Bitkileri Bölümü, Antalya

KORUMA ALTINDAKİ ÇİNE ÇAPARI KOYUNLARDA GENETİK ÇEŞİTLİLİK* Pelin BİNBAŞ1, İbrahim CEMAL2

Selekte Edilmiş Bazı Yerel Taze Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Genotiplerinin Moleküler Karakterizasyonu

Kimi Yembezelyesi Çeşitlerinde (Pisum arvense L.) Sıra Arası Mesafelerinin Tohum Verimi ile Bazı Verim Özelliklerine Etkisi Üzerinde Bir Araştırma

BAZI SARIMSAK GENOTİPLERİNİN (Allium sativum L.) VE MUTANTLARININ RAPD BELİRLEYİCİLERİ İLE TANIMLANMASI

Assist. Prof. Dr. Hilal Betül Kaya Akkale

Derece Bölüm/Program Üniversite Yıl. Lisans Tarla Bitkileri Çukurova Üniversitesi Y. Lisans Tarla Bitkileri Çukurova Üniversitesi 1998

Türkiye Yağlı Kuyruklu Koyun Irklarında DNA Parmak Đzinin RAPD-PCR Yöntemi Kullanılarak Saptanması

Seleksiyon Islahı. Toplu seleksiyon Teksel seleksiyon Klon seleksiyonu

ANKARA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ DÖNEM PROJESİ TAŞINMAZ DEĞERLEMEDE HEDONİK REGRESYON ÇÖZÜMLEMESİ. Duygu ÖZÇALIK

Türkiye de Yetiştirilen Bazı Makarnalık Buğday Çeşitlerinde Genetik Farklılıkların Belirlenmesi a

ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

KURU FASULYE ISLAH ÇALIŞMALARINDA TARTILI DERECELENDĐRME SĐSTEMĐNĐN KULLANILMASI

ÖZGEÇMİŞ VE YAYIN LİSTESİ. : Batı Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü, 07100, ANTALYA Tlf: 0 (242) , ayseserpil.kaya@gthb.gov.

Mısırda (Zea mays indentata Sturt.) Line x Tester Analiz Yöntemiyle Uyum Yeteneği Etkilerinin ve Heterosisin Belirlenmesi

ATDİŞİ MISIRDA (Zea mays indentata Sturt.) UYUM YETENEĞİ ETKİLERİ VE HETEROSİSİN BELİRLENMESİ

ORDU NUN ÜNYE İLÇESİNDE PALAZ FINDIK ÇEŞİDİNİN KLON SELEKSİYONU. * Geliş Tarihi: Kabul Tarihi:

SAMSUN KOŞULLARINDA GELİŞTİRİLEN BAZI TEK MELEZ MISIR ÇEŞİTLERİ ÜZERİNE ARAŞTIRMALAR

Mustafa Kemal SOYLU. Yüksek Mühendis.

MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI

KİŞİSEL BİLGİLER EĞİTİM BİLGİLERİ

Diyarbakır Ekolojik Koşullarında Bazı Koca Fiğ Genotiplerinin Verim ve Verim Unsurları

Güneydoğu Anadolu Bölgesinde Yetiştirilen Farklı Buğday Tiplerinin Yaş Gluten Miktarları Bakımından Kalitelerinin Belirlenmesi

Araştırma Makalesi (Research Article)

Mısırda (Zea mays indentata Sturt.) Kombinasyon Yeteneği ve Melez Gücü Üzerine Araştırmalar

Biyoetik ve Genetik Kaynakların Kullanılması

KIRAÇ ARAZİLERE UYGUN ALTERNATİF BİR TAHIL TRİTİKALE YETİŞTİRİCİLİĞİ

Iğdır İlinin Hayvansal Atık Kaynaklı Biyogaz Potansiyeli. Biogas Potential from Animal Waste of Iğdır Province

Patateste Genotip x Çevre İnteraksiyonları ve Yorumlanması

The Possibilities of the Direct Seeding of Watermelon Seed By Pneumatic Precision Planter

SAMSUN EKOLOJİK KOŞULLARINDA BAZI BURÇAK (Vicia ervilia L.) HATLARININ OT VE TOHUM VERİMLERİNİN BELİRLENMESİ

Karbapeneme Dirençli Acinetobacter baumannii Suşlarının PFGE Yöntemiyle Genotiplendirilmesi

Ege Sahil Kuşağına Uygun Kavuzsuz Yulaf Çeşidinin Geliştirilmesi Beslenme Yaklaşımı

Farklı Soya Fasulyesi (Glycine max L. Merr.) Hatlarının Bursa Ekolojik Koşullarında Bazı Verim ve Kalite Özelliklerinin Belirlenmesi

Prof. Dr. Önder TUZCU'nun Özgeçmişi 2016

ÖZGEÇMİŞ Adı Soyadı Doğum Yeri DoğumTarihi Yabancı Dili İletişim Tel Öğrenim Durumu: Derece Bölüm/ Program Üniversite Yıl Y.

Triticum dicoccoides ile Triticum durum Melezlerinin F 4 Neslinde ve Ebeveynlerinde RAPD Yöntemiyle Genotip Belirlenmesi

FEN ve MÜHENDİSLİK BİLİMLERİ DERGİSİ

FEN ve MÜHENDİSLİK BİLİMLERİ DERGİSİ

Araştırma Makalesi. Selçuk Üniversitesi Selçuk Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi 25 (2): (2011) ISSN:

Karadeniz Bölgesi Yerel Sivri Biber Genotiplerinin Toplanması ve Morfolojik Özelliklerinin Belirlenmesi Üzerine Bir Araştırma

DİYARBAKIR İLİ DOĞAL MERALARINDAN TOPLANAN BAZI TEK YILLIK YONCA TÜRLERİNDE (Medicago spp.) KALİTE ÖZELLİKLERİNİN BELİRLENMESİ*

YABANCI DİL BİLGİSİ Yabancı Dil / Derecesi KPDS ÜDS TOEFL IELTS

Farklı Ekocoğrafik Kökenli Bamya Genotiplerinin Verim Değerlerinde Görülen Heterosis Üzerinde Bir Araştırma 1

Türkiye de Yetiştirilen Bazı Önemli Biber Genotiplerinin Morfolojik Variyabilitesi Üzerinde Bir Araştırma

Transkript:

Süleyman Demirel Üniversitesi Süleyman Demirel University Fen Bilimleri Enstitüsü M. Öten, S. Albayrak Dergisi / Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu Journal of Natural andappliedsciences Cilt, Sayı,, 1 Volume, Issue,, 1 DOI: 1.1911/sdufbed.99 Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu Mehmet ÖTEN *1, Sebahattin ALBAYRAK 1 Batı Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü, 1, Antalya Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Bafra Meslek Yüksek Okulu,, Samsun (Alınış / Received:.1.1, Kabul / Accepted: 1..1, Online Yayınlanma / Published Online:..1) Anahtar Kelimeler Yonca, Medicago sativa L., Moleküler karakterizasyon Özet: Medicago tür ve populasyonlarında moleküler markırlar kullanılarak genotipik varyasyon seviyesini belirlemek yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada; Batı Akdeniz sahil kuşağında yer alan, Antalya iline ait 1 ilçede, farklı lokasyonda, doğal vejetasyondan toplanan üstün yonca genotipleri klon yöntemi ile çoğaltılmıştır. Elde edilen genotip ve standart çeşidin aralarındaki benzerlikler, Basit Tekrarlı Sekanslar (SSR) moleküler analiz tekniğiyle, 1 adet primer kullanılarak belirlenmiştir. SSR primerlerinin % 99, si polimorfik bant vermiştir. Araştırma sonucunda; kümeleme analizi sonucu oluşan dendograma göre yonca genotipleri ana ve alt gruba ayrılmıştır. Birinci ana grup %, ikinci ana grup ise % seviyesinde kendi içerisinde iki alt gruba ayrılmıştır. Benzerlik katsayıları. değerleri arasında değişim göstermiştir. En yakın genetik benzerlik Kaş ve Çeşit 1 arasında bulunurken, en uzak ise Gazipaşa 1 Kumluca genotipleri arasında bulunmuştur. Elde edilen bu sonuca göre Batı Akdeniz sahil kuşağından toplanan yonca genotipleri arasında genetik olarak önemli bir varyasyonun olduğu tespit edilmiştir. Molecular Characterization of Alfalfa(Medicago sativa L.) Populations Collected From West Mediterranean Coastal Zone Keywords Alfalfa, Medicago sativa L., Molecular characterization Abstract: Molecular markers are widely used to determine the level of genetypic variation in Medicago species and populations. In this study, superior alfalfa genotypes collected from different locations of 1 districts of Antalya province in the Western Mediterranean Coastal Zone were reproduced via clonal method. 1 different SSR primers were used to determine the similarities among genotypes at molecular level. SSR primers yielded polymorphic bands at a rate of 99. %. According to research results; alfalfa genotypes were divided into main groups and sub clusters. In the first main group genotypes were divided into two sub clusters at % similarity level while second group were divide two sub clusters at % level. Similarity coefficient changed between and. among genotypes. The nearest genetic similarity was detected between Kas and Variety 1. On the other hand, Gazipaşa 1 and Kumluca genotypes were found to be the most distant genotypes. The results of the study revealed a wide genetic variation in the genotypes collected from Western Mediterranean Coastal Zone. 1. Giriş Yonca (Medicago sativa L.) kuru ve sulu şartlarda yetiştirilen önemli bir yem bitkisidir. Birçok kaynakta diğer yem bitkilerinden ayrı bir yere konarak Yem bitkilerinin kraliçesi olarak isimlendirilmektedir []. Bunun başlıca sebebi, geniş adaptasyon kabiliyetine sahip olması, toprağa azot bağlaması, birim alandan *İlgili yazar: moten@hotmail.com kaldırdığı protein miktarının fazlalığıdır. Buna ilave olarak yonca mineral madde ve vitaminler bakımından da çok zengin bir besin kaynağıdır [1]. Yonca, yabancı döllenen ve kromozomlu autotetraploid bir türdür. Buna göre kültürü yapılan çeşitler hetorojen populasyonlardır [1]. Yonca bitkisinin çiçekleri çok küçüktür dolayısıyla

melezleme zor ve zaman alıcıdır. Diğer yandan kendilenen bitkilerde tohum tutma oranı çok zayıftır [1]. Tüm bu nedenlerden dolayı yoncada sentetik varyete ıslahı uygulanmaktadır. Sentetik çeşit oluşumu için klon seçimine özellikle dikkat edilmelidir. Her şeyden önce verimi düşürücü kendileme etkilerinden sakınmak için akraba genotiplerin birbirleriyle kombinasyonundan kaçınmak gerekir. Bu nedenle sentetik varyete ıslahına katılacak hatların kromozom özelliklerinin incelenerek yakın akraba olmayan hatlardan sentetik çeşit oluşturulmalıdır []. Islahta kullanılacak materyallerin yakın akraba olup olmadığının belirlenmesinde ise morfolojik ve biyokimyasal işaretleyicilerin yerine, son yıllarda DNA işaretleyicileri kullanılmaya başlanmıştır. RAPD, AFLP, SSR ve ISSR DNA işaretleyicileri, kültür bitkilerinde genetik çeşitliliğin saptanmasında yoğun olarak kullanılmaktadır. DNA markırları yardımıyla araştırıcılar morfolojik olarak çok benzerlik gösteren tür, çeşit veya tipler ve ebeveynleri hakkında kesin bilgiler elde edebilmektedir [11],[1],[1]. Ayrıca [], moleküler belirteçlerin heterosisten yararlanmak için çeşitli fırsatlar sunduğunu, [] ise yonca genomunda bol miktarda SSR DNA nın bulunduğunu kalıtımının Mendel kurallarına uygun olduğunu ortaya koymuş ve Medicago türlerinde SSR ların rahatlıkla kullanılabileceğini ortaya koymuştur. Özetle; bitkisel gen kaynağının kullanılabilmesi için kültüre alınmış türlerin ve bunların yabani akrabalarının genetik çeşitliliğinin dağılımının detaylı olarak bilinmesi gerekmektedir []. Ülkemiz Medicago türü için mikro gen merkezi konumunda [1] olmasına rağmen populasyonlar arasındaki ilişkiler kısmen morfolojik olarak tanımlanmakla birlikte, moleküler yöntemlerle tanımlama çalışmaları oldukça sınırlıdır. Bu çalışma ile Antalya doğal vejetasyonundan toplanan genotipler arasında akrabalık derecelerinin moleküler yöntemlerle belirlenmesi ve ıslah çalışmalarında kullanılacak bireylerin seçiminin kolaylaştırılması amaçlanmıştır.. Materyal ve Metot.1. Bitkisel materyal Çalışmada bitkisel materyal olarak, lokasyondan toplanıp, klonla çoğaltılmış farklı genotip ile iki adet çeşit (Verdor ve Elçi) kullanılmıştır. Antalya ili sahil kuşağındaki 1 ilçenin doğal vejetasyonundan, her ilçeden şer lokasyon olmak üzere toplam lokasyondan toplanan genotipler, klonla çoğaltılarak, Batı Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü arazilerinde yetiştirilmiştir. Genotiplerin tamamı ot tipi yonca olup, toplandığı lokasyonlara ait rakım ve koordinatlar Çizelge 1 de verilmiştir... DNA ekstraksiyonu ve SSR analizi Moleküler karakterizasyon işlemleri tarlada gelişen klonların çiçeklenme döneminde yapılmıştır. Çalışmada kullanılan yonca bitkilerine ait DNA lar [] yöntemi kullanılarak izole edilmiştir. Her populasyonu temsil eden 1 farklı klondan birer yaprak örneği alınarak populasyonlara ait toplam DNA izole edilip, kullanılıncaya kadar derin dondurucuda C de saklanmıştır. Populasyonlara ilave olarak yonca çeşidinden de DNA elde edilmiş ve çalışmada kullanılmıştır. DNA ların kalitesi ve konsantrasyonları, lamda DNA kontrolü kullanarak ve etidyum bromid ile boyanarak, % 1 lik agaroz jelde tespit edilmiştir. PCR reaksiyon ve amplifikasyon koşulları, [] ve [] e göre yapılmıştır. PCR ürünlerine bromophenol blue eklenerek ve % lik agaroz jellere yüklenmiş, 1xTAE bufferı içinde saat boyunca sabit akımda ayrıştırılmıştır. Jeller etidyum bromit ile boyanarak jel görüntüleme sistemi ile fotoğrafları alınmıştır. Moleküler datanın analizi için bantların var olup olmamasına göre 1/ matriksi oluşturulmuştur. Genotipler arasındaki genetik çeşitlilik için pairwise genetik benzerlik simple matching coefficent metoduna göre yapılmıştır [1]. Dendogram unweighted pair group metod average (UPGMA) gruplandırma metoduna göre NTSYS pc (Numerical Taxonomy Multivariate Analysis System) istatistik programı kullanılarak yapılmıştır [19]. Çizelge 1. Lokasyonlara ait rakım ve koordinatlar No Lokasyon Koordinat Rakım(m) 1 Gazipaşa 1 S 1/UTM1 Gazipaşa S /UTM1 Alanya 1 S 91/UTM1 Alanya S 1/UTM9 Manavgat 1 S 99/UTM9 1 Manavgat S 9/UTM1 1 Serik 1 S /UTM1 Serik S 191/UTM99 1 9 Aksu 1 S 91/UTM99 1 Aksu S 1/UTM999 1 11 Kepez 1 S 919/UTM19 9 1 Kepez S 91/UTM99 9 1 Döşemealtı 1 S 9/UTM119 9 1 Döşemealtı S 1/UTM11 9 1 Konyaaltı 1 S /UTM1 1 Konyaaltı S 9/UTM11 1 Kemer 1 S /UTM 1 Kemer S /UTM 1 19 Kumluca 1 S 1/UTM1 Kumluca S 99/UTM9 1 Finike 1 S /UTM9 Finike S 1/UTM 1 Demre 1 S 119/UTM1 Demre S /UTM1 Kaş 1 S 9/UTM1 Kaş S 11/UTM11 19 1

Bu çalışmada farklı duraklardan toplanan ve klonla çoğaltılarak elde edilen yonca genotiplerinin moleküler karakterizasyonu SSR markır sistemi kullanılarak yapılmıştır. DNA amplifikasyonu için kullanılan primer sekansları Çizelge de verilmiştir. Primer sekansları daha önce farklı çalışmalarda kullanılan ve yüksek polimorfizm gösteren sekanslar arasından seçilmiştir. Çalışmada populasyonlar arasındaki polimorfizmleri tespit etmek için ve anchored 1 adet primer kullanılmıştır. Yonca çeşidi ve populasyona ait DNA lar tüm primer sekansları ile taranarak, en yüksek polimorfizm açığa çıkaran primer sekansları tespit edildikten sonra tüm populasyonlar bu primerler ile taranmıştır. Çizelge. Çalışmada kullanılan SSR primerlerinin sekansları Primerin Baz dizilimi Adı FMT1 GATGAGAAAATGAAA CAAAAACTCACTCTAACA AGAAC CAC MTIC1 GGACAAAATTGGAAG AATTACGTTTGTTTGGAT AAAAA GC MTIC19 CAAACCCTTTTCAATT ATGTTGGTGGATCCTTCT TCAACC GC MAA GGGTTTTTGATCCAGA GGTGGTCATACGAGCTCC TCTTAA B1B GCTTGTTCTTCTTCAA CTGACTTGTGTTTTATGC GCTCAC MTIC9 AGCAGGATTTGGGACA ACCGTAGCTCCCTTTTCC GTTGT A MTIC TGGAATTTGGGATAT GCCATAAGAACTTCCACT AGGAAG T MTIC99 AGGCTGTTGTTACACC AAATGCTTAAATGACAAA TTTGTC T AFat1 TTACGGGTCTAGATTA CAAAATGAGTATAGGGAG GAGAGTATAG TGG AFca1 CGTATCAATATCGGGC TGTTATCAGAGAGAGAAA AG GCG AFctt1 CCCATCATCAACATTT TTGTGGATTGGAACGAGT TCA AFct TAAAAAACGGAAAGA GCCATCTTTTCTTTTGCT GTTGGTTAG TC AFca1 GGTCGAACCAAGCATG TAAAAAACATTACATGAC T CTCAAA AFct CCTCCCTAACTTTCCA TGGATCAACGTGTCTTTC ACA A AFca11 CTTGAGGGAACTATTG AACGTTTCCCAAAACATA TTGAGT CTT. Bulgular Moleküler çalışmada elde edilen değerler ile yapılan kümeleme analizi sonucu oluşan dendogram, Şekil 1. de verilmiştir. Dendogramın incelenmesinden de anlaşılacağı üzere, kullanılan M. sativa L. genotipleri benzerlik seviyesinde ana gruba ayrılmıştır. Birinci ana grup, % seviyesinde iki alt gruba ayrılmıştır. Bu grupta Gazipaşa 1, Gazipaşa, Alanya 1, Alanya, Manavgat 1, Kepez 1 ve Finike yer alırken, birinci ana gruba bağlı diğer alt grupta Aksu ve Konyaaltı genotipleri yer almıştır. İkinci grupta kendi içerisinde % seviyesinde iki alt gruba ayrılmıştır. İkinci gruba bağlı birinci alt grupta Manavgat, Serik 1, Serik, Aksu 1, Demre 1, Kepez, Döşemealtı 1, Demre, Döşemealtı, Konyaaltı 1, Kaş 1, Kemer 1, Kemer, Kaş, Çeşit 1 ve Çeşit olurken, ikinci alt grupta ise Kumluca 1 ve Kumluca genotipleri yer almıştır. Şekil 1. M. sativa L. genotiplerinin UPGMA ya göre kümeleme dendogramı Çalışmada kullanılan tüm primerler bant üretmiş ve toplamda banttan ü polimorfik olarak tespit edilmiştir. Ancak polimorfizm oranları bakımından primerler arasında önemli farklılıklar gözlenmiştir. En fazla bant ve polimorfizm üreten primerler Afca1, MTIC9 ve MTIC1 olmuştur. En çok bant üreten primerlerden biri olan Afca1 e ait jel görüntüsü Şekil de verilmiştir. Şekil. Afca1 primerine ait jel görüntüsü Çizelge. Yonca hat ve çeşitlerinde polimorfizm üretmek için kullanılan primerler ve primer başına üretilen toplam bant sayıları, polimorfik bant sayısı ve polimorfizm oranları. Primer adı Toplam bant sayısı (Adet) Polimorfik bant sayısı (Adet) Polimorfizm oranı (%) AFAT1 1 AFca1 1 AFca11 1 AFca1 1 AFct 1 AFct. AFctt1 1 B1B 1 FTM1 1 MAA 1 1 1 MTIC9 1 MTIC99 1 1 1 MTIC 1 MTIC1 1 MTIC19 1 Toplam Ortalama.. 9.

Çizelge. Yonca hat ve çeşitleri arasında ikili karşılaştırmalarla elde edilen benzerlik katsayıları (%) 1 9 1 11 1 1 1 1 1 1 1 19 1 1 Gazipaş a1 Gazipaş a 1.. 9 1. Alanya1.. 1. Alanya. Manavg at1 Manavg at..... 1.. 1. 1. Serik1. 1. Serik.. 1. 9 Aksu1 1. 1 Aksu 1. 11 Kepez1 1. 1 1 1 1 1 Kepez Döşeme altı1 Döşeme altı Konyaal tı1 Konyaal tı... 1.. 1. 1.. 1. 1. 1 Kemer1 1. 1 19 Kemer Kumluc a1 Kumluc a. 1. 1.. 1. 1 Finike1... 1. Finike. 1. Demre1 9 1. Demre.. 1. Kaş1.. 1. Kaş... 1. Çeşit 1.... 1. Çeşit..... 1. En düşük bant ve polimorfik bant sayısı MAA ve MTIC99 primerlerinden elde edilmiştir. Primerlere ait toplam bant sayısı, polimorfik bant sayısı ve polimorfizm oranları Çizelge 'te gösterilmiştir. M. sativa L. genotiplerinin oluşturduğu dendogram ile genotiplerin toplandıkları lokasyonları karşılaştırdığımızda; kullanılan primerlere göre elde edilen dendogramda oluşan gruplarla, genotiplerin toplandığı lokasyonlar birbirine kısmen benzer bulunmuştur. Lokasyon olarak birbirine yakın olan Gazipaşa 1, Gazipaşa, Alanya 1, Alanya ve Manavgat 1 genotipleri aynı grubun aynı alt grubunda yer alırken, lokasyon olarak birbirinden uzak olan Gazipaşa 1 ve Kumluca genotipleri oluşan dendogramda en uzak ola rak tespit edilmişlerdir. Yine birinci ana grubun diğer alt grubunda ise birbirine yakın olan Aksu ve Konyaaltı lokasyonu yer almıştır. adet M. sativa L. genotipinden elde edilen genetik benzerlik değerleri Çizelge te verilmiştir. Genotipler arasında genetik benzerlik katsayıları. değerleri arasındadır. En yakın genetik benzerlik Kaş ve Çeşit 1 arasında bulunurken, en uzak benzerlik Gazipaşa 1 ile Kumluca genotipleri arasında bulunmuştur. Moleküler yöntemlerden elde edilen verilerle oluşturulan dendogram ve hesaplanan benzerlik

katsayı, oluşturulan bant ve polimorfik bant sayısı değerlerine göre; genotipler arasında yüksek oranda genetik varyasyon olduğu tespit edilmiştir.. Tartışma ve Sonuç Yoncada yapılan moleküler karakterizasyon çalışmalarında; Mısır ekolojik şartlarında yürütülen araştırmada,[], 1 yerel populasyon ve İtalyan çeşidiyle genotiplerin kümeleme analizi sonucunda gruba ayrıldığını bildirmişlerdir. [1], İran ve dünyanın değişik bölgelerinden yonca genotipi arasındaki genetik varyasyonu tespit etmek amacıyla yaptıkları çalışmada kümeleme analizi sonucunda farklı grup oluştuğunu, [1], İranda yaptıkları çalışmada ise farklı grup oluştuğunu tespit etmişlerdir. Çalışmada elde edilen grup sayısı [] ile benzerlik gösterirken, [1] ve [1] den düşük bulunmuştur. Yoncada farklı İtalyan ekotipiyle yaptıkları çalışmada, [1], ekotipler arasında yüksek oranda polimorfizim tespit etmişlerdir. [], çalışmalarında 1 polimorfik bant ve yüksek polimorfizim elde etmişler. [9], yaptıkları çalışmada adet primer kullanmışlar, toplam bant elde etmişler ve elde ettikleri bantlardan 1 adedini polimorfik olarak tespit etmişlerdir. [] ise toplam bant elde etmişlerdir. [1], İran da yaptıkları çalışmada ortalama. bant elde etmişlerdir. Çalışmada elde edilen polimorfik bant sayısı [] ile benzerlik gösterirken, diğer çalışmalardan düşük bulunmuştur. İran ve dünyanın değişik bölgelerinden yonca genotipi arasındaki genetik varyasyonu tespit etmek amacıyla yapılan çalışmada, [1], ekotiplerin temin edildiği ülkelere göre gruplar oluşturduğunu bildirirken, [] ve [] genetik uzaklığın tam olarak coğrafi uzaklıkla ilişkili olmadığını bildirmişlerdir. Çalışmada lokasyonlara göre genetik benzerliğin yüksek bulunması [1] ile benzerlik gösterirken [] ve [] ile benzerlik göstermemektedir. Yoncada yaptıkları çalışmalarda [], farklı yonca populasyonunda benzerlik katsayısının % 9, olduğunu, Mısırda yürüttükleri araştırmada 1 yerel populasyon ve İtalyan çeşidinde, % 9 luk bir benzerlik olduğunu [],[] ise adet yonca genotipinde % 1 arasında genetik benzerlik olduğunu tespit etmişlerdir. Çalışmada elde edilen değerler diğer çalışmalarla uyum içerisindedir. Yoncada moleküler karakterizasyon ile genetik yakınlığın tespiti amacıyla yapılan çalışmalarda, [], [1], [1], [], [1], [1], [] ve [] de uyguladıkları farklı moleküler karakterizasyon yöntemleri sonucunda populasyonlar arasında benzer şekilde yüksek seviyede genetik çeşitlilik olduğunu bildirmişlerdir. Sonuç olarak; Batı Akdeniz sahil kuşağından toplanan yonca genotipinde, SSR yöntemiyle yapılan moleküler karakterizasyon çalışmasında, DNA benzerlikleri bakımından ana grup altında adet alt grup oluşmuştur. Kümeleme analizi sonucunda genetik benzerlik katsayıları. değerleri arasında değişim göstermiştir. En yakın genetik benzerlik Kaş ve standart Çeşit 1 arasında bulunurken, en uzak benzerlik lokasyon bakımından birbirlerine uzak olan Gazipaşa 1 ile Kumluca genotipleri arasında bulunmuştur. Elde edilen bulgulara göre genotipler arasında geniş bir varyasyonun olduğu gözlemlenmiştir. Çalışmada kullanılan tüm primerler bant üretmekle birlikte, polimorfizm oranları arasında farklılık gözlemlenmiştir. En fazla sayıda bant ve polimorfizm üreten primerler er bantla Afca1, MTIC9 ve MTIC1 primerleri olmuştur. En düşük miktarda toplam bant sayısı ve polimorfik bant sayısı 1 er bantla MAA ve MTIC99 primerlerinde bulunmuştur. Moleküler karakterizasyon sonrası populasyonlar arasında yüksek seviyede genetik çeşitlilik olduğu tespit edilmiştir. Bu sonuçlar; Batı Akdeniz sahil kuşağındaki mevcut yonca genotip ve populasyonları hakkında ön bilgi edinmemizi sağlarken, aynı zamanda ileride yapılacak ıslah çalışmaları için de bu materyallerin ümitvar olduğunu göstermektedir. Teşekkür Bu çalışma Süleyman Demirel Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü nde yürütülen Doktora çalışmasının bir bölümünü içermektedir. SDÜ BAP 19 D1 1 numaralı projeyi maddi olarak destekleyen Süleyman Demirel Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Yönetim Birimi Başkanlığı na teşekkür ederim. Kaynakça [1] Brummer, E. C. 199. Defining heterotic groups in alfalfa: A molecular marker perspective. Proceedings of the th North American Alfalfa Improvement Conference. Bozeman, Montana August 199 [] Brummer, E.C., Bouton J.H., Kochert, G. 199. Analysis of annual Medicago species using RAPD markers. Genome, ;. [] Carelli, M., Gnocchi, G., Scotti, C. 9. Alfalfa germ plasmfrom a Saharaoasis: characterization by means of bio agronomic trait sand SSR markers. Plant Breeding 1, 1 (9) doi:1.1111/j.19..1.x, Berlin [] Diwan, N., Bouton, J.H., Kochert, G., Cregan, P.B.. Mapping of Simple sequencerepeat (SSR)

DNA markers in diploid and tetraploid alfalfa. Theor ApplGenet 11:1 1. [] Doyle, J.J., Doyle, J.L. 199. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 1, 1 1. [] Elçi, Ş.. Baklagil ve Buğdaygil Yem Bitkileri. Mart Matbası, ISBN 9 19, Ankara. [] Falahati Anbaran, M.,Habashi, A. A., Esfahany, M., Mohammadi, S. A., Ghareyazie, B.. Population genetic structure based on SSR markers in alfalfa (Medicago sativa L.) from various region scontiguousto the centres of origin of the species. Journal of Genetics, Vol., No. 1, April [] Flajoulot, S.,Ronfort, J., Baudouin, P., Barre, P., Huguet, T., Huyghe, C., Julier, B.. Genetic diversity among alfalfa (Medicago sativa) cultivars coming from a breeding program, using SSR markers. Theoretical and Applied Genetetics, 111, 1 19. [9] Habibi, B., Farshadfar, M., Safari, H. 1. Evaluation of Genetic Diversity in 1 Genotypes of Alfalfa (Medicago Sativa) Using of Molecular ISSR Markers. International Journal of Agriculture and Crop Sciences. Available online at www.ijagcs.com IJACS/1/ 1/1 1. ISSN X 1 IJACS Journal [1] Harlan, J. R. 191. Agricultural Origins Centre and non centers. Science, 1,. [11] Karaca, M., Saha, S., Zipf, A., Jenkins, J.N., Lang, D.J.. Genetic diversity among forage bermudagrass (Cynodon spp.). Evidence from chloroplast and nuclear DNA finger printing. Crop Science : 11 1 [1] Keivani, M., Ramezanpour, S. S., Soltanloo, H., Choukan, Rajab, Naghavi, M., Ranjbar, Mojtaba. 1. Genetic diversity assessment of alfalfa (Medicago sativa L.) populations using AFLP markers Australian Journal of Crop Sicience AJCS ():91 9 (1) ISSN:1 [1] Mckersie, B., Bowley, S. 199. Synthetic seeds of alfalfa. In: Redenbaugh K (ed) Synseeds: Applications of Synthetic Seeds to Crop Improvement CRC Press, Boca Raton, pp. 1. [1] Manga, Ü., Acar, Z., Ayan, İ. 199. Baklagil Yem Bitkileri. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Ziraat Fakültesi Ders Notu No. [1] Mengoni, A., Gori, A., Bazzicalupo, M.. Use of RAPD and microsatellite (SSR) variationto ases genetic relationships among populations of tetraploidalfalfa, Medicago sativa. Plant Breeding, 119, 11 1. [1] Mousavia, F., Sharifabadb, H. H., Allahdooc, M. 1. Investigation of genetic diversity in alfalfa ecotypes collection using multivariate analysis based on morphological traits. Plant Ecophysiology (1) 1 1 [1] Poehlman, J.M.19. Breeding Field Crops. Second edition. The AVI Publishing Company, Inc, Westport, Connecticut. Second Printing. [1] Qiang, H., Chen, Z., Zhang, Z., Wang, X., Gao., H., Wang, Z. 1. Molecular diversity and population structure of a worldwide collection of cultivated tetraploid alfalfa (Medicago sativa subsp.sativa L.)germplasm as revealed by micro satellite markers. PLoSOne. 1 Apr ;1():e19.doi:1.11/journal.pone. 19. [19] Rohlf, F.J. 1991. NTSYS pc. Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. Exeter Software, Setauket, NY, USA. [] Sledge, M. K., Bouton, J. H., Kochert, G. 199. Molecular marker diversity as a means of selecting parents for synthetic cultivars. Proceedings of the th North American Alfalfa Improvement Conference. Bozeman, Montana, August, 199. [1] Sneath, P.H.A., Sokal, R.R. 19. Numerical taxonomy. W.H. Freman Co., San Francisco, s, USA. [] Touil, L., Guesmi, F., Fares, K., Zagrouba, C., Ferchichi, A.. Genetic diversity of some mediterranean populations of the cultivated alfalfa (Medicago sativa L.) using SSR markers. Pakistan Journal of Biological Science, 11 (1), 19 19. [] Tucak, M., Popović, S., Čupić, T., Šimić, G., Gantner, R., Meglič, V. 9. Evaluation of alfalfa germplasm collection by multivariate analysis based on phenotypic traits. Romanian Agricultural Research, :. [] Tucak, M.,Popovic, S., Bolaric, S., Kozumplik, V.. Agronomic evaluation of alfalfa genotypes under ecological comditions of eastern Croatia. VII. Alps Adria Scientific Workshop, Cereal Research Communications,, 1. [] Tuğay, E. 199. Genel Bitki Islahı. Gazi Osman Paşa Üniversitesi Ziraat Fakültesi. Ders Notları s. Tokat. [] Ulukapı, K., Onus, A.N. 1. Selekte Edilmiş Bazı Yerel Taze Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Genotiplerinin Moleküler Karakterizasyonu. Tarım Bilimleri Dergisi 1,.