Anahtar Kelimeler: Kalıtsal hastalık, miyofosforilaz, RFLP, Şarole

Benzer belgeler
Türkiye de Yetiştirilen Holştayn ve Bazı Yerli Sığır Irklarında Citrullinemia Allelinin Belirlenmesi

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

TÜRKİYE DE BULUNAN BAZI YERLİ SIĞIR IRKLARININ GENETİK YAPILARININ KARAKTERİZASYONU

Islah Stratejileri ve Türkiye Ulusal Sığır Islah Programı

2.KAYNAK ÖZETLERİ. 2.1 Sığır Lökosit Adhezyon Yetersizliği (BLAD)

Detection of Akirin 2 Gene Polymorphism with PCR-RFLP Method in Some Cattle Breeds Reared in Turkey

BÜYÜKBAŞ HAYVANCILIK ARAŞTIRMALARI ÇALIŞMA GRUBU. Önder SÖZEN Koordinatör

ZOOTEKNİ BÖLÜMÜ. Araş. Gör. Ertuğrul KUL

Niyazi DEMİRCİ 1, Bilal AKYÜZ 2!

YERLİ SIĞIR IRKLARINDA MYOSTATİN GENİNE AİT III. EKZON BÖLGESİNİN NT 821(DEL11) POLİMORFİZMİ BAKIMINDAN KARŞILAŞTIRILMASI

I. Projenin Türkçe ve İngilizce Adı ve Özetleri İvesi Koyunlarında mikrosatellite lokuslarında polimorfizmin tespiti Güneydoğu Anadolu Tarımsal Araştı

AİLESEL AKDENİZ ATEŞİ (AAA-FMF)

MOLEKÜLER TANISI DÜZEN GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ. SERPİL ERASLAN, PhD

Agaroz jel elektroforezi

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

Türkiye de Yetiştirilen Anadolu Mandalarında Butirofilin (BTN1A1) Gen Polimorfizminin HaeIII Restriksiyon Enzimi ile Araştırılması

attomol apo B-100 quicktype

α1-antitrypsin quicktype

KAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA

Simental sığır ırkının anavatanı İsviçre dir. Simental hem süt ve hemde etçi olmalarından dolayı kombine bir sığır ırkıdır. Dünyada bir çok ülkede

A8. Kul, E., Erdem, H., Relationships Between Somatic Cell Count and Udder Traits in Jersey Cows. J. Appl. Anim. Res. 34 (2008):

Comparison of Adaptation Levels of Cultural Cattle in Kahramanmaras Province in Terms of Insurance Claims Compensation

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

İstatistiki Bölge Birimleri Sınıflamasına Göre Düzey 2 (TRA1 ve TRA2) Bölgelerinde Büyükbaş Hayvan Varlığı ve Süt Üretiminin Karşılaştırılması

Doç.Dr. Bilal AKYÜZ ÖZGEÇMİŞ DOSYASI

Çiftlik Hayvanlarında Cinsiyetin Denetimi

Adıyaman İlinden Eylül Ayında Elde Edilen İnek Sütlerinin Doğu Afrika Kaliteli Çiğ İnek Sütü Standartlarına Uygunluklarinin Belirlenmesi

KOP BÖLGESİ BÜYÜKBAŞ HAYVANCILIĞINDA GENETİK İLERLEMENİN SAĞLANMASI

SIĞIR YETİŞTİRİCİLİĞİ VE BESİCİLİĞİ

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ DERGİSİ Journal of Faculty of Veterinary Medicine, Erciyes University

AYDIN İLİ DAMIZLIK SIĞIR YETİŞTİRİCİLERİ BİRLİĞİ OCAK 2016 KAYE EĞİTİM TOPLANTISI SEDA EMİNE PAYIK TEKNİK İŞLER ŞUBE MÜDÜRÜ

ARAŞTIRMA. Anahtar Kelimeler: Saanen, Kıl keçisi, Melezleme, Büyüme, Yaşama Gücü

EMBRIYO TRANSFERIYLE BIR INEKTEN?100 BUZAGI ALINACAK

Batman İlinden Elde Edilen Sütlerde Toplam Yağın Türk ve Avrupa Birliği Standartlarına Uygunluğunun Belirlenmesi

SPERMA,OVUM VE EMBRİYO İTHALATINDA UYULMASI GEREKEN USUL VE ESASLAR HAKKINDA TALİMAT

Türkiye de hayvancılık sektörünün önündeki sorunları iki ana başlık altında toplamak mümkündür. Bunlar;

ARAŞTIRMA. 2008: 22 (5): Nihat YILDIZ 1 Selami AYGEN 2 Mahiye ÖZÇELİK 3

TÜRKİYE DE SIĞIR YETİŞTİRİCİLİĞİ

attomol lactose intolerance C>T quicktype

2013 YILI TARIMSAL DESTEKLEMELER

HLA Tiplendirmesi PCR-SSP. Türker Duman PhD

GÖKHÖYÜK TARIM İŞLETMESİNDE YETİŞTİRİLEN SİYAH ALACA SIĞIRLARIN SÜT VE DÖL VERİM ÖZELLİKLERİ 1. SÜT VERİM ÖZELLİKLERİ

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ DERGİSİ Journal of Faculty of Veterinary Medicine, Erciyes University

BİRLİĞİN KURULUŞU: 1995 yılında 13 kişi. Türkiye nin 2. Birliği.

II. BÖLÜM TABİİ TOHUMLAMA MANDA BOĞALARININ SAĞLIK TESTLERİNDE UYULMASI GEREKEN ŞARTLAR

/ Mayıs 2009 CUMA. Resmî Gazete. Sayı : TEBLİĞ. Köyişleri Bakanlığından: HAYVANCILIĞIN DESTEKLENMESİ HAKKINDA

Polimeraz Zincir Reaksiyonu. Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

AMASYA İLİ DAMIZLIK SIĞIR YETİŞTİRİCİLERİ BİRLİĞİ

ARAŞTIRMA MAKALESİ. Türkiye ye 2015 yılında sperması ithal edilen boğalardaki kalıtsal kusurlar. Şeref İnal*, Mustafa Çam

Siyah Alaca Sığırlarda Kısmi Süt Verimlerinden Yararlanılarak 305 Günlük Süt Verimini Tahmin Etme İmkanları *,1

2014 YILI TARIMSAL DESTEKLEMELER

REKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL

T. C. DİCLE ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ KAMU HİZMET STANDARTLARI TABLOSU

GÖKHÖYÜK TARIM İŞLETMESİNDE YETİŞTİRİLEN SİYAH ALACA SIĞIRLARIN SÜT VE DÖL VERİM ÖZELLİKLERİ 2. DÖL VERİM ÖZELLİKLERİ

Ders Adı Kodu Yarıyılı T+U Saati Ulusal Kredisi AKTS HAYVAN SAĞLIĞI VE HASTALIKLARDAN KORUNMA

ÖZGEÇMİŞ VE ESERLER LİSTESİ

Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR: Polymerase Chain Reaction) Ayten AŞKIN KILINÇ Veteriner Hekim

PEDİATRİK MAKROTROMBOSİTOPENİLİ OLGULARDA MYH9 & TUBB1 GEN MUTASYONLARI

Süt Sığırcılığında Döl Verimi Kayıplarının İşletme Gelirine Etkisi

Sperma DNA İçeriği. Cinsiyeti Belirlenmiş Sperma Gebelik Oranları?

Elazığ İli Karakoçan İlçesinden Elde Edilen Sütlerde Yağ ve Protein Oranlarının AB ve Türk Standartlarına Uygunluklarının Belirlenmesi

RESEARCH ARTICLE. Limuzin ırkı sığırlarda besi başlangıcındaki canlı ağırlığın ekonomik açıdan besi performansına etkisi

Birlikle el ele, Hayvancılıkta daha ileriye

Kanatlı Hayvan Hastalıkları

Türkiye de Yetiştirilen Esmer ve Siyah Alaca Sığırlarda Süt Verimi, İlk Buzağılama Yaşı ve Servis Periyodu *

DNA Dizileme (Sekanslama)

Hayvansal Üretim 49(2): 1-6, 2008 Araştırma Makalesi

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D

Irkların Sınıflandırılması

Türk Tarım - Gıda Bilim ve Teknoloji Dergisi

Türkiye de Simental Genotipinin Yaygınlaştırılması. Araş. Gör. Ayşe Övgü ŞEN Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi

Süt Tipi Oğlakların Doğum, 30. Gün ve 60. Gün Canlı Ağırlıkları Üzerine Sistematik Çevre Etmenlerinin Etkileri

Holştayn Irkı Sığırlarda Bazı Verim Özellikleri

2 Nisan 2015 PERŞEMBE. Resmî Gazete. Sayı : TEBLİĞ. Gıda, Tarım ve Hayvancılık Bakanlığından:

T.C. GIDA TARIM VE HAYVANCILIK BAKANLIĞI Hayvancılık Genel Müdürlüğü

Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Zootekni ABD /1998. Diğer Eğitimleri

Mitokondrial DNA Analiz Paneli

KRONİK BÖBREK HASTALIĞI (YETMEZLİĞİ) OLAN TÜRK HASTALARINDA TÜMÖR NEKROZ FAKTÖR ALFA ve İNTERLÖKİN-6 PROMOTER POLİMORFİZMLERİNİN ETKİSİ

Hakan ÇETİN Atakan KOÇ

(ZORUNLU) MOLEKÜLER İMMÜNOLOJİ I (TBG 607 TEORİK 3, 3 KREDİ)

Parkinson Hastalığı ile α-sinüklein Geni Polimorfizmlerinin İlişkisinin Araştırılması

HAFTA II Mendel Genetiği

MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI

Gıda Tarım Hayvancılık Bakanlığının Kontrolüne Tabi Ürünlerin İthalat Denetimi Tebliği (Ürün Güvenliği ve Denetimi Tebliği 2013/5)

DAMIZLIK SIĞIR YETİŞTİRİCİLİĞİNDE KADININ ROLÜ. Zerrin KUMLU. Salahattin KUMLU. DGRV Eğitim Ekibi Ankara, 2016

Moleküler Nematoloji. Eğitim Süresi: 6 ay (29 Aralık Haziran 2014) Eğitim Yeri: Kaliforniya Üniversitesi, Davis Bitki Bilimleri Bölümü

Türkiye Süt Sığırcılığında Islah ve Destekleme Politikalarının Bölgesel Etkileri Üzerine Bir Araştırma

BRCA 1/2 DNA Analiz Paneli

Rekombinant DNA Teknolojisi-II

GENETİK LABORATUVARI

İLİMİZDE HAYVANCILIĞIN DURUMU

Mutasyon: DNA dizisinde meydana gelen kalıcı değişiklik. Polimorfizm: iki veya daha fazla farklı fenotipin aynı tür popülasyonunda bulunmasıdır.

PCR Bir reaksiyonun kurulması ve optimize edilmesi

Kazova Vasfi Diren Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Sığırların Döl Verimi Özellikleri *

Dr. Nilay HAKAN Muğla Sıtkı Koçman Üniv. Tıp Fak. Neonatoloji Bilim Dalı Perinatal Medicine Nisan 2017, İZMİR

Domuz Ayrığı (Dactylis glomerata L.) Populasyonlarında Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi

Kazova Vasfi Diren Tarım İşletmesinde Yetiştirilen Siyah Alaca Buzağılarda Büyüme Performansı ve Yaşama Gücü *

MENDEL DIŞI KALITIM. Doç. Dr. Bengi ÇINAR KUL. Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Genetik Anabilim Dalı

ERCİYES ÜNİVERSİTESİ VETERİNER FAKÜLTESİ DERGİSİ Journal of Faculty of Veterinary Medicine, Erciyes University

M. Kerem ÇALGIN 1, Fikret ŞAHİN 1, Melike ATASEVER 2, Deniz KÖKSAL 2, Djursun KARASARTOVA 1, Mehmet KIYAN 1. AÜTF Tıbbi Mikrobiyoloji ABD 2

Transkript:

J Fac Vet Med Univ Erciyes 5(1) 21-25, 2008 B. AKYÜZ, D. BAYRAM, O. ERTUĞRUL, Araştırma K. M. Makalesi İŞCAN Research Article Kayseri Bölgesinde Yetiştirilen Şarole Irkı Sığırlarda ve Türkiye Yerli Sığır Irklarında Miyofosforilaz Eksikliği (Glikojen Depo Hastalığı Tip V) Allelinin PCR-RFLP ile Belirlenmesi Bilal AKYÜZ 1, Davut BAYRAM 1, Okan ERTUGRUL 2, Kaan M. İŞCAN 1 1 Erciyes Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Zootekni Anabilim Dalı, Kayseri-TÜRKİYE 2 Ankara Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Genetik Anabilim Dalı, Ankara-TÜRKİYE Özet: Bu çalışmanın amacı Türkiye de yetiştirilen saf ve melez Şarole ırkı sığırlar ile Türkiye yerli sığır ırklarında miyofosforilaz eksikliği allelinin bulunup bulunmadığının araştırılmasıdır. Araştırmada, on baş Şarole, 15 baş Şarole- Simmnetal melezi, 20 baş Yerli Kara, 20 baş Boz Irk, 20 baş Güney Anadolu Kırmızısı, 20 baş Doğu Anadolu Kırmızısı ve kontrol grubu olarak da 20 baş Simmental sığırı toplam 125 sığır kullanılmıştır. PCR ürünleri StyI restriksiyon enzimi ile kesilmiştir. Elde edilen parçacıklarda StyI restriksiyon bölgesinin varlığı veya yokluğu % 3 lük NuSieve agaroz jel elektroforezi ile bakılmıştır. İncelenen Şarole, Şarole melezi ve yerli sığırlarda miyofosforilaz eksikliği alleline rastlanılmamıştır. Anahtar Kelimeler: Kalıtsal hastalık, miyofosforilaz, RFLP, Şarole Detection of Myophosphorylase Deficiency (Glycogen Storage Disease Type V) with PCR-RFLP in Charolais Cattle in Kayseri Region and in Turkey Native Cattle Breeds Summary: The aim of this study was to investigate whether or not the myophosphorylase deficiency allele exists in Charolais and in Turkish native cattle breeds in Turkey. Ten Charolais, 15 Charolais-Simmental crossbreds, 20 Native Black, 20 Gray Steppe, 20 South Anatolian Red, 20 East Anatolian Red and 20 Simmental breed for the control group comprised the 125 cattle used in this study. The PCR products were digested by StyI restriction enzyme. The resulting fragments were analyzed on 3 % NuSieve agarose gel for the presence or absence of a StyI restriction site. There were no positive results indicating the presence of myophosphorylase deficiency allele in Charolais, Charolais crossbreed and Turkish native cattle breeds. Key Words: Charolais, hereditary disease, Myophosphorylase, RFLP Giriş Glikojen depo hastalığının tip II ve tip V olarak iki tipi bulunmaktadır ve dokularda patolojik olarak glikojen birikmesi ile karakterize kalıtsal bir hastalıktır (14). Glikojen depo hastalığı tip V, glikojen metobolizmasını bozarak hücre içinde glikojen birikmesine neden olan otozomal resesif kalıtsal bir hastalıktır (7,8). Kas glikojen fosforilaz veya miyofosforilaz yetmezliği olarak da adlandırılan hastalık birkaç aylığa kadar olan buzağılarda görülmektedir (7,13). Hastalık kaslarda egzersiz intolerans, kas ağrısı, tekrarlayan miyolglobinüri, kahve renkli idrar ve plazma kreatin kinaz seviyesinde artış ile kendini göstermektedir (14,21). Benzer kalıtsal hastalık insanlarda McArdle s hastalığı olarak adlandırılmakta ve hastalık kaslarda glikojenin glikoz 1 fosfat a çevrilmesini sağlayan miyofosforilaz enziminin eksikliğine neden olmaktadır (7,13,14,21). Hastalık sığırlardaki formuna benzer şekilde, egzersiz intolerans, kas krampları ve Geliş Tarihi/Submission Date : 11.11.2008 Kabul Tarihi/Accepted Date : 09.03.2009 * Bu araştırma EÜBAP- VA-07-04 no lu proje ile Erciyes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından desteklenmiştir. miyoglobilüri ile kendini göstermektedir (13). Sığırlarda glikojen depo hastalığı tip V, ilk olarak Kuzey Amerika da yetiştirilen Şarole ırkı sığırlarda bildirilmiştir (6,13). Şarole sığırlarında glikojen depo hastalığı tip V in klinik belirtileri genellikle birkaç aylık buzağılarda eksersize bağlı olarak ortaya çıkmaktadır (13). Glikojen depo hastalığı tip V, sığır miyofosforilaz geninin 489. kodonun 12. ekzonunda meydana gelen bir nokta mutasyonundan (C T yer değişimi) kaynaklanmaktadır. Bu mutasyon, genin 489. kodonunun kodladığı arjinin amino asitinin (CGG), triptofan animo asitine (TGG) dönüştürmesine neden olmaktadır (10,13,19,21). Bu mutasyon sonucunda miyofosforilaz geninde daha önce bulunmayan bir StyI restriksiyon enzim tanıma bölgesi oluşmakta ve bu değişim polimeraz zincir reaksiyonurestriksiyon parçacık büyüklük polimorfizmi (PCR- RFLP) yardımıyla belirlenebilmektedir (13,19). Çiftlik hayvanlarının kalıtsal hastalıkları ya verim düşüklüğüne ya da embriyonik ölümlere neden olarak ekonomik kayıplara neden olmaktadır (7,14). Bu nedenle erkek ve dişi damızlıkların ırka özgü kalıtsal hastalıklar yönünden taranarak taşıyıcıların belirlenmesi ve yetiştirmeden çıkarılması gerekmektedir. Geçen elli yıldan fazla bir süredir 21

Sığır Miyofosforilaz Eksikliği Erciyes Üniv Vet Fak Derg 5(1) 21-25, 2008 genetik iyileştirme programları süt ve et üretiminde büyük katkılar sağlamıştır. Gelişmiş ülkelerde damızlık olarak seçilen hayvanlarda seçim kıstasları süt verimi, ırk özellikleri, ağırlık artışı ve karkas özellikleri olmuştur. Fakat son 10 20 yılda bu kıstaslara ilaveten döl verimi, uzun ömürlülük ve hastalıklara direnç de eklenmiştir (8). Et ve süt sığırı yetiştiriciliğinde yaygın olarak kullanılan suni tohumlama yöntemi bu özellikler yönünden en iyi birkaç hayvanın seçilerek damızlık olarak kullanılmasına olanak vermektedir. Suni tohumlama yönteminin yaygın olarak kullanılması genetik ilerlemede hızlı bir artış sağlamaktadır. Ancak az sayıdaki erkek damızlıkların tüm dünyada yaygın olarak kullanılması ırk içindeki genetik havuzun daralmasına neden olmaktadır. Bunun sonucunda, ırk içindeki akrabalık derecesi artmakta, kalıtsal hastalıkların frekansı yükselmekte ve tüm dünyaya yayılabilmektedir (2,3,11). Sığırlarda belirlenen kalıtsal hastalıkların % 87 si çekinik kalıtım şekli gösterir ve bu kalıtsal bozuklukların birçoğu ırka özeldir (11). Dolayısıyla, kalıtsal kusurların kontrol edilmesi ve popülâsyondan temizlenmesi için taşıyıcı bireylerin belirlenerek sürüden ayıklanması gerekmektedir. Bu da ancak moleküler genetik yöntemlerle belirlenmektedir (2). Özellikle, suni tohumlama ve embriyo nakli amacıyla kullanılan damızlık ve damızlık adaylarının kalıtsal hastalıklar yönünden kontrol edilmesi ve kalıtsal hastalıkları taşımadıklarının kesin olarak belirlenmesi zorunluluğunu doğurmuştur (11). Benzer şekilde ekonomik verimlilik açısından öncelikle Türkiye de yetiştirilen damızlık ve damızlık adaylarının verimi olumsuz yönde etkileyen kalıtsal kusurlar yönünden genetik yapılarının belirlenmesi gerekmektedir. Daha sonra Türkiye yerli sığır ırklarının da bu kalıtsal kusurlar yönünden genetik yapılarının belirlenmesinin faydalı olacağı düşünülmektedir. Çünkü ırka özgü olduğu düşünülen birçok kalıtsal bozukluk yönünden Türkiye yerli gen kaynakları incelenmemiştir. Daha önce Holştanlarda, önemli verim kayıplarına neden olan kalıtsal hastalıklardan sığır lökosit bağlanma yetmezliği (BLAD) ve üridin monofosfat senteaz yetmezliği (DUMPS) yönünden Türkiye de yetiştirilen dişi ve erkek damızlıklar incelenmiştir. Bu hastalıklardan sadece BLAD a neden olan mutant allelin Türkiye Holştayn populasyonunda varlığı tespit edilmiştir (2,3,15). Daha önce Türkiye de yetiştirilen Şaroleler ve yerli sığır ırkları glikojen depo hastalığı tip V yönünden incelenmemiştir. Bu çalışma ile Kayseri ve civarında yetiştirilen saf Şarole ve Şarole melezleri ile Türkiye yerli sığır ırklarında glikojen depo hastalığı tip V hastalığına neden olan mutant allelin varlığı araştırılmıştır. Gereç ve Yöntem Araştırmanın hayvan materyalini toplam 125 baş sığır oluşturmaktadır. Bunlardan 10 baş Şarole ve 15 baş Şarole-Simmental melezi Kayseri ve civarından temin edilmiştir. Araştırma materyali yerli ırklar 20 baş Yerli Kara (YK, Hayvancılık Merkez Araştırma Enstitüsü Lalahan/Ankara), 20 baş Güney Anadolu Kırmızısı (GAK, Çukurova Tarımsal Araştırma Enstitüsü Karataş/Adana), 20 baş Doğu Anadolu Kırmızısı (DAK, Doğu Anadolu Tarımsal Araştırma Enstitüsü Gezköy/Erzurum) ve 20 baş Boz Irk (BI, Marmara Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Bandırma/Balıkesir) sığırından oluşmuştur. Kontrol grubu olarak da daha önce glikojen depo hastalığı tip V in kalıtsal varlığının saptanmadığı (7) ve Damızlık Sığır Yetiştiriciler Merkez Birliğinden temin edilen 20 baş Simmental sığırı kullanılmıştır. DNA izolasyonu için Şarole ve Şarole melezleri ile Simmental ırkı hayvanlardan antikoagulanlı tüplerle vena jugularis ten kan alınmıştır. Yerli ırklarda ise daha önce yapılan bir çalışmadan kalan DNA örneklerinden yararlanılmıştır (2). DNA izolasyonu için fenol-kloroform ekstraksiyon yöntemi kullanılmıştır (1). Glikojen depo hastalığı tip V e neden olan alleli belirlemek için yapılan PCR de primer olarak, forward: 5 -CCA GGA AGA CCC TCA TTC CA 3 ; reverse: 5 -AGG GAA ACA CAC ACA CTC 3 olacak şekilde bir primer seti kullanılmıştır (21). PCR karışımı Soethout ve arkadaşları (21) tarafından bildirildiği şekilde, her primerden 40 pmol, 1 X PCR tampon solüsyonu (KCl lü), 100 µm dntp (Fermentas) ve 2 U Taq DNA polimeraz (Fermentas) konularak hazırlanan karışım steril ddh 2 O ile toplam hacim 25 µl ye tamamlanmıştır. Bu karışımın üzerine 200 ng genomik DNA dan 3 µl ilave edilerek PCR karışımı hazırlanmıştır. PCR reaksiyonu, hazırlanan karışım ısı düzenleme aletinde 95 o C de 10 dk tutulduktan sonra bir döngüsü 94 o C de 15 sn, 34 o C de 30 sn, 72 o C de 30 sn olacak şekilde 35 döngü, son döngüyü takiben tüpler 72 o C de 5 dakika tutularak yapılmıştır. Elde edilen ürünler 45 dakika 80 volt elektrik gerilimi uygulanarak % 2 lik agaroz jel elektroforezi ile ayrılmıştır. Elektroforezde 252 baz çifti (bç) uzunluğunda bantların görüldüğü PCR ürünleri, RFLP için StyI restriksiyon enzimi (Fermentas) ile kesilmiştir. Bu işlem her bir örnek için toplam hacmi 25 µl olacak şekilde (StyI 20 U, 10 x Buffer 3 µl, ddh 2 O 16 µl, 5 µl PCR ürünü) hazırlanan karışımın ısı düzenleme aletinde 37 O C de 4 saat tutularak yapılmıştır. Bu sürenin sonunda enzimi inaktive etmek için karışım 65 O C de 20 dk bekletilmiştir. Elde edilen RFLP ürünleri % 3 lük NuSieve agaroz jel elektroforezi ile gözlenmiştir. Elektroforez sonunda homozigot normal bireylerde 252 bç lik tek bant, homozigot hasta bireylerde 133 ve 22

B. AKYÜZ, D. BAYRAM, O. ERTUĞRUL, K. M. İŞCAN 119 bç lik iki bant, taşıyıcılarda ise 252 bç, 103 bç ve 82 bç olmak üzere üç bandın görülmesi beklenmiştir (21). Bulgular Yapılan PCR sonunda, incelenen tüm örneklere ait DNA lar elde edilmesi beklenen 252 bç lik PCR ürünleri elde edilmiştir. PCR sonunda elde edilen ürünlerin belirlendiği % 2 lik agaroz jel elektroforezi şekil 1 de görülmektedir. Elde edilen PCR ürünlerinin StyI enzim kesimi ile yapılan RFLP işlemi sonunda, incelenen ırklara ve kontrol grubuna ait tüm örneklerde enzim kesiminin olmadığı görülmüştür. RFLP sonun da kesim işlemi uygulanan tüm bireylerde 252 bç lik tek bant elde edilmiştir. İncelenen 25 Şarole ve Şarole melezi ile 20 baş YK, 20 baş GAK, 20 baş DAK ve 20 baş BI ait örneklerden hiç birisinin glikojen depo hastalığı tip V taşıyıcısı olmadığı görülmüştür. PCR ürünlerinin StyI restriksiyon enzim kesimi sonunda yapılan % 3 lük NuSieve agaroz jel elektroforezi ile Şekil 2 deki görüntü elde edilmiştir. Şekil 1. PCR ürünlerinin % 2 lik agaroz jel elektroforezi. Kuyu 1: YK10, Kuyu 2: YK4, Kuyu 3: DAK10, Kuyu 4: GAK14, Kuyu 5: 100 bp plus DNA markör (Fermentas), Kuyu 6: BI2, Kuyu 7: Şarole-Simmental melezi, Kuyu 8: Şarole14, Kuyu 9: Şarole10, Kuyu 10: Şarole1. Şekil 2. StyI Endonükleaz enzimi ile elde edilen ürünlerinin % 3 lük NuSieve agaroz jel elektroforezi. Kuyu 1: Kuyu 2: YK4, Kuyu 3: DAK10, Kuyu 4: GAK14, Kuyu 5: BI2, Kuyu 6: Şarole-Simmental melezi, Kuyu 7: Şarole14, Kuyu 8: Şarole10, Kuyu 9: Şarole1. 23

Sığır Miyofosforilaz Eksikliği Erciyes Üniv Vet Fak Derg 5(1) 21-25, 2008 Tartışma ve Sonuç Glikojen depo hastalığı tip V sığırlarda günümüze kadar sadece Şarole sığır ırkında belirlenmesine rağmen (7,21), hastalık insanlarda farklı ırklarda bildirilmiştir (21). Bu nedenden dolayı çalışmada yerli sığır ırklarında da glikojen depo hastalığı tip V alleli yönünden incelenmesi düşünülmüştür. Ancak, incelenen Türkiye yerli sığır ırklarında bu kalıtsal hastalığa neden olan mutant allelin belirlenememesi hastalığın Şarole ırkına özgü bir kalıtsal hastalık olduğu bilgisini desteklemektedir. Çek Cumhuriyeti nde Şarole dışında diğer etçi ırklarda glikojen depo hastalığı tip V in aranmasını amaçlayan bir çalışmada da benzer sonuca ulaşılmıştır. Ayrıca bu ülkede yetiştirilen Şarole ırkı sığırlarda da taşıyıcılara rastlanılmamıştır (6,7). Glikojen depo hastalığı tip V e neden olan mutant allel ilk kez ABD de yetiştirilen Şarole ırkı sığırlarda belirlenmesine rağmen, Avrupa, Avustralya ve Yeni Zelanda da taşıyıcı ve hasta bireylere rastlanılmıştır (13). Bu çalışmada, incelenen Şarole ve Şarole melezlerinde glikojen depo hastalığı tip V e sebep olan mutant alleli taşıyan bireylere rastlanılmamıştır. Örnek sayısını artırmanın Türkiye de yetiştirilen Şarolelerin glikojen depo hastalığı tip V yönünden genetik yapıları daha kesin olarak belirlenebileceği düşünülmüştür. Çalışmanın yapıldığı bölgede yetiştirilen Şarolelerde bu hastalığa ait mutant allele rastlanılmamış olması hastalığın Türkiye Şarole populasyonunda olmadığı veya sonraki yıllarda bu mutant allelin Türkiye ye gelemeyeceği anlamına gelmez. Dolayısıyla, bu kalıtsal hastalığın görüldüğü ülkelerden ithal edilecek canlı hayvan ve spermalarda bu kalıtsal hastalığın bulunmadığının belgesinin aranması gereklidir. Doğal tohumlama ile bir boğa senede 80 100 inek tohumlayabilirken, yaygınlaşan suni tohumlama sayesinde bu sayı yılda 20 bin ineğe çıkabilmektedir (4). Bu durum sığır yetiştiriciliğinde kullanılan damızlık boğa sayısını azaltmaktadır. Suni tohumlamanın sığır yetiştiriciliğinde yaygın olarak kullanılmaya başlanmasından beri birey başına alınan verim artmıştır. Fakat, yöntem gerek et ve gerekse süt sığırı yetiştiriciliğinde en yaygın kullanılan ırklarda genetik yakınlığı arttırmıştır (12). Ayrıca yaygın olarak kullanılan bir damızlıkta var olan ve teşhisi yapılana kadar bilinmeyen kalıtsal bir bozukluk kısa sürede tüm dünyaya yayılabilmektedir. Bu tür kalıtsal hastalıklara en güzel örnek Holştaynlarda görülen BLAD hastalığı verilebilir. Daha önce granülositopati sendromu olarak adlandırılan bu hastalığın, kalıtsal bir hastalık olduğu ve bu hastalığa sebep olan mutant allelin ilk olarak 1952 yılında doğan Osborndale Ivanhoe isimli boğada bulunduğu 1989 yılında belirlenmiştir (15,16). Geçen 37 yıllık sürede üstün verim özelliklerine sahip bu boğa, boğanın oğulları ve torunlarının Holştayn yetiştiriciliğinde çok yaygın kullanılması sonucunda hastalık ABD den Japonya ya kadar tüm dünyaya yayılmıştır (9,17,16). İnsanlarda genetik temeli bilinen 200 den fazla enzim yetmezliğine sebep olan kalıtsal bozukluk tanımlanmışken sığırlarda bu sayı yedidir (8,20). Ayrıca çiftlik hayvanlarında görülen kalıtsal hastalıklar çoğunlukla çekinik kalıtım şekli göstermektedir (11). Dolayısıyla bilinen ve verimi olumsuz etkileyen kalıtsal bozukluklar yönünden damızlık ve damızlık adaylarını kontrol etmeyen ülkelere kalıtsal hastalıklar kolay yayılabilmektedir. Tarım Bakanlığı verilerine göre Türkiye de suni tohumlamada 1999 yılında yurt içinde üretilen 1 570 325 doz ve yurt dışından ithal edilen 357 987 doz, toplam 1 928 312 doz, sperma kullanılmıştır (5). Türkiye de saf Şarole ırkı sığırların yanında yetiştiriciler pazarın durumuna göre Holştayn, Simmental ve yerli ırkların dişilerini kullanarak Şarole melezleri de elde etmektedirler. Sonuç olarak Kayseri ve civarında yetiştirilen Şarole ve melezlerinde glikojen depo hastalığı tip V neden olan mutant allel bulunamamıştır. Ancak bu durum bu kalıtsal hastalığın Türkiye de yetiştirilen Şarole populasyonunda da bulunmadığı anlamına gelmez. Çünkü Türkiye de yetiştirilen evcil hayvanlarda, gelişmiş ülkelerin daha önce belirlediği ve kontrol altına aldığı birçok kalıtsal hastalık hakkında yeterli tarama yapılmamıştır. Bu nedenle yetiştirici birlikleri ile birlikte Türkiye deki Şarole populasyonunun taranması düşünülebilir. Suni tohumlamada kullanılması düşünülen damızlık adaylarının ve annelerinin IBR, BVD, sığır lökozu ve sığır tüberkülozu gibi enfeksiyöz hastalıkları taşımadıklarının belgelenmesi zorunludur. Benzer şekilde damızlık adayları ve annelerinin glikojen depo hastalığı tip V, DUMPS, BLAD, CVM gibi üretimde problem yaratacak ırka özgü kalıtsal hastalıklar yönünden de taşıyıcı olup/olmadıkları belirlenmesi gereklidir. Kaynaklar 1. Akyüz B, 2004. Türkiye deki Holştayn sığırlarında sığır lökosit bağlanma yetmezliğinin (bovine leukocyte adhesion deficiency, BLAD) restriksiyon parçacık uzunluk polimorfizmi (restriction fragment length polymorphism, RFLP) ile belirlenmesi. Doktora Tezi. Ankara Üniv Sağlık Bil Enst, Zootekni Programı. Ankara. 2. Akyüz B, Ertuğrul O, 2006. Detection of bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD) in Turkish native and Holstein cattle. Acta Vet Hung, 54(2): 173 178. 24

B. AKYÜZ, D. BAYRAM, O. ERTUĞRUL, K. M. İŞCAN 3. Akyüz B, Ertuğrul O, 2008. Türkiye de Holştayn ve yerli sığırlarda üridin monofosfat senteaz eksikliğinin (DUMPS) belirlenmesi. Ankara Üniv Vet Fak Derg, 55: 57-60. 4. Alpan O, 1993. Sığır Yetiştiriciliği ve Besiciliği. 3. Basım. Ankara: Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Zootekni Bölümü, s. 205. 5. Anonim, 2005. Erişim (06.10.2005). http://www.tarim.gov.tr/arayuz/9/icerik.asp? efl= buyukbas/buyukbas.htm&curdir=\uretim\ hayvancilik\buyukbaş&fl=sunitohumlama/ sunitohumlama.htm. 6. Citek J, Rehout V, Hajkova J, Pavkova J, 2006. Monitoring of the genetic health of cattle in the Czech Republic. Vet Med, 51(6): 333 339. 7. Citek J, Rehout V, Vecerek L, Hajkova J, 2007. Genotyping glycogen storage disease type II and type V in cattle reared in the Czech Republic. J Vet Med A, 54: 257 259. 8. Distl O, 2005. The use of molecular genetics in eliminating of inherited anomalies in cattle Arch Tierz Dummerstorf, 48(3): 209-218. 9. Fésüs L, Zsolnai A, Anton I, Bárány I, Bozó S, 1999. Short communication BLAD genotypes and cow production traits in Hungarian Holsteins. J Anim Breed Genet, 116: 169-174. 10. Fries R, Ruvinsky A, 1999. The Genetics of Cattle, CABI Publishing, Wallingford, Chapter 6, p. 59. 11. Healy PJ, 1996. Testing for undesirable traits in cattle: an Australian perspective. J Anim Sci, 74:917 922. 12. Jánosa Á, Baranyai B, Dohy J, 1999. Comparison of milk production of the progeny of BLAD-carrier and healthy Holstein bulls in Hungary. Acta Vet Hung, 47(3): 283-289. 13. Johnstone AC, McSporran KD, Kenny JE, Anderson IL, Macpherson GR, Jolly RD, 2004. Myophosphorylase deficiency (glycogen storage disease Type V) in a herd of Charolais cattle in New Zealand: confirmation by PCR-RFLP testing. N Z Vet J, 52(6): 404 408. 14. Kaneko JJ, Harvey JW, Bruss ML, 1997. Clinical Biochemistry of Domestic Animals. 5th Ed., Academic Press London, p. 46,77,434. 15. Kehrli M, Shuster DE, Ackerman MR 1992. Leukocyte adhesion deficiency among Holstein cattle. Cornel Vet, 82(2): 103-109. 16. Kriegesmann B, Jansen S, Baumgartner BG, Brenig B, 1999. Partial genomic structure of the bovine CD18 gene and the refinement of test for Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency. J Dairy Sci, 80: 2547-2549. 17. Mirck MH, von Bannisseht-Wijsmuller TH, Timmermans-Besselink WJH, Van Luijk JHL, Buntjer JB, Lenstra JA, 1995. Optimization of the PCR test for the mutation causing bovine leukocyte adhesion deficiency. Cell Mol Biol, 41(5): 695-698. 18. Nagahata H, 2004. Bovine leukocyte adhesion deficiency (BLAD). J Vet Med Sci, 66(12); 1475-82. 19. O Rourke BA, Dennis JA, Healy PJ, 2006. Internal restriction sites: quality assurance aids in genotyping. J Vet Diagn Invest, 18:195 197. 20. Padeeri M, Vijaykumar K, Grupe S, Narayan MP, Schwerin M, Kumar MH. Incidence of 1999. Hereditary citrullinemia and bovine leukocyte adhesion deficiency syndrome in Indian dairy cattle (Bos taurus, Bos indicus) and buffalo (Bubalus bubalus) population. Arch Tierz, 42: 347-352. 21. Soethout EC, Verkaar ELC, Jansen GH, Muller KE, Lenstra JA. 2002. A direct Sty l polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) test for the myophosphorylase mutation in cattle. J Vet Med A, 49: 289 90. Yazışma Adresi : Yrd. Doç. Dr. Bilal AKYÜZ Erciyes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Zootekni ABD Barış Manço C. Sümer M.38090 Kocasinan, Kayseri, Tel: 0-352-3380006/175 Fax: 0-352-3372740 E-Mail: bakyuz@erciyes.edu.tr 25