Floresan Temelli Yeni Nesil Genetik

Transkript

1 ~ubital-.ham Floresan Temelli Yeni Nesil Genetik Analiz Uygulamalarl: DNA Dizi Analizi, Molekuler Markor Uygulamalarl ve Coklu Gen Anlatlm Analizleri Uygulamall Egitimi TOBiT AK MAM GMBE P.K.21, 41470, Gebze I KOCAELi ~.~QY-M

2 AMAC Molek(jler biyolojinin giderek ivme kazanan inanllmaz geli~imi dogrultusunda ve son ylllarda floresan i~aretleyicilerin geli~tirilmesi, robotik sistemlerin kullanlml ile DNA dizi analizi, yeni nesil molek(jler mark6r uygulamalarl (fragment analizi) ve ~oklu gen anlatlm analizleri teknik anlamda daha kolay ve klsa s(jrede sonu~ verir hale gelmi~tir. Son birka~ ylldlr grubumuz taraflndan yogun olarak kullanllan bu analizlere ait bilgi birikimi ve deneyimlerimizi (jlkemizde ya~am bilimleri alanlnda faaliyet g6steren bilim insanlarlmlzla payla~mak temel hedefimizdir. Egitimimiz hem teorik hem de uygulamall b61(jmler ~eklind.e organize edilecektir. i~erik: Egitim soresince a~aglda verilen ba~llklarda teorik bilgilendirme ve uygulamalar yapllacaktlr. 1. Floresan ve Molekuler Biyolojideki Uygulamalarl 2. DNA Dizi Analizi ve Genom Projeleri 3. Molekuler Mark6rler ve Uygulama Alanlarl (Mark6r Yardlmlyla Se<;:im ve QTL Analizleri) 4. Genetik ve Fiziksel Haritalama 5. Nukleik asitler ve izolasyon Y6ntemleri 6. Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) 7. Real-time PZR ve Uygulama Alanlarl 8. Floresan Temelli Qoklu Gen Anlatlm Analizleri UYGULAMALAR: -Farkll Kaynaklardan (bitki, bakteri, hocre koltoro) DNA izolasyon Y6ntemi -NanoDrop Spektrofotometre ile DNA Miktar ve Kalite Tayini -Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve DNA Dizi Analizi i<fin brneklerin Hazlrlanmasl -Kapiller Elektroforez Teknigine Dayall DNA Dizi Analizi -"GeXP Genetic Analysis System", Beckman Coulter -Mikrosatellit (SSR) Analizi o Agaroz Jel Elektroforezi ile o "GeXP Genetic Analysis System" ile -Qoklu Gen Anlatlm Analizleri o RNA izolasyonu o Qip Destekli "Bioanalyser" Sisteminde RNA Miktar ve Kalite Tayini o Qoklu Primer Tasarlml o Gene bzgo cdna Sentezi o Gen icin Kantitatif PZR

3 SON BA~VURU TARiHi: 27 Mayls 2011 MAKSiMUM KATlLIMC' SAY'S': 12 KATlliMCI PROFiLi Biyolojik Bilimler, Sagllk Bilimleri, Veteriner, Ziraat ve Su OrOnleri fakoltelerinin ilgili ana bilim dallarlnda lisansosto programlarda ogrenim goren ogrenciler, Bakanllklar, kamu AR-GE kurulu~larl ve ozel sektorde 9all~an ilgili ki~iler egitime katllabilirler. EGiTiM OCRETi: Katlllmcl Turu Egitim Ocreti TL (%18 KDV dahil) bgrenci ve Ara!?tlrma Gorevlileri 700 bgretim Oyesi/Diger Kamu Qall~anlarl 850 bzel Sektor 9all~anlarl 1000 Egitim ucretlerinin yatlrllmasl hakklnda detayll bilgi, egitime kabul edilen katlllmcllara iletilecektir.

4 KONAKLAMA VE DiGER BiLGiLER* Gunluk misafirhane konaklama ucreti Oniversite ve kamu kurum/kurulu~ personeli: 30 TL (KDV dahil, ki~i ba~1 kall~) Kahvaltl: 6 TL (KDV dahil) Yemek:.Fiyatlar bir ay oncesinden kesinle$ecektir 7 TL (KDV dahil) Egitim dili TOrkge'dir. Katlllmcllar egitimin dozenlenecegi TOBiTAK MAM GMBE'den istanbul, izmit ve Gebze'ye gidi~ d6no~lerde kurum servislerinden Ocretsiz olarak yararlanabileceklerdir. Egitime katllmak isteyen adaylarln son ba~vuru tarihinden 6nce ba~vularlnl a~aglda belirtilen web adresinden yaparak GMBE Egitim Sorumlusu Zehra Pek~en'e e-posta yolu ile iletmeleri gerekmektedir. Egitim ile ilgili diger sorularlnlzl iletebilirsiniz. Dr. bzge Karaka~'a e-posta yolu ile Web: : zehra.peksen@mam.gov.tr ozge.karakas@mam.gov.tr Dr. Ozge Karaka~ Tel: (0-262) Faks : (0-262)

5 ~OBiTAL- MAM TOBiTAK MAM GMBE P.K.21, 41470, Gebze I KOCAELi

6 Biyoinformatik; bilgisayar, bili~im teknolojileri ve matematik bilimlerini kullanarak, biyolojik problemleri 9bzmeyi ama9layan, 9ok disiplinli yeni bir bilim dalldlr. Son yl"arda biyolojik bilimlerde elde edilen buyuk miktarlardaki veri birikiminin analizi i9in duyulan gereksinimden biyoinformatik alanln dogmaslna sebep olmu~tur. Ya~am bilimleriyle ugra~anlar, geni~ veritabanlarlnda biriken verileri kendi ama91arl dogrultusunda yeni hipotezler olu~turmak maksadlyla, ya da kendi geneylerinden elde ettikleri verileri yorumlamak i9in biyoinformatigi ku"anmaktadlrlar. Bu egitim, biyoinformatigin bir9ok alanlndan sadece ikisi uzerinde yogunla~acaktlr; biyolojik veri tabanlarl ve dizi analiz ybntemleri. Gunden gune sayllarl artan veritabanlarl katlllmcllara sunulduktan sonra, kendi ara~tlrmalarlnl yaparken ku"anabilecekleri en bnemli dizi analiz ybntemleri uzerinde durulacaktlr. Egitimin % 40'1 teorik, % 60'1 uygulama ~eklinde olacaktlr. Egitimin amaci, temel biyoinformatik yazlllmlarlnda deneyim kazandlrmak ve biyolojide ku"anllan temel matematiksel yakla~lmlar hakklnda bilgi saglamak olarak bzetlenebilir. icerik VE UYGULAMALAR 1) Biyolojik veri tabanlarlna genel giri~, 2) Biyolojik veri tabanlarlndan istenilen enformasyona ula~ma y6ntemleri, 3) Biyolojik dizilerin analiz y6ntemleri (dizi kar~lla~tlrma kavramlarlnln tanlmlanmasl, yerel ve global) 4) Benzerlik temelli algoritmalar (blast), 5) Qoklu biyolojik dizi kar~lla~tlrmalarlnln yaratllmasl ve kullanlml (pop(jler yazlllmlarln nasll kullanlcagl 6rneklerle ac;lklanacaktlr.) 6) Temel filogenetik y6ntemler ve filogenetik yazlllmlarln kullanlml, 7) Protein dizilerinin karakterizasyon y6ntemleri (yaplsal ve fonksiyonel karakterizasyonlarlnda kullanllan y6ntemler) Eqitim sonunda katlllmcllann:.biyolojik veri tabanlarl araslndaki farklar ve bu veri tabanlarlnda kendi ara~tlrmalarlnda faydall olabilecek bilgiye nasll ula~abilecekleri konusunda yeterli deneyim kazanmalarl,.biyolojik verilerin, ara~tlrllmasl, eldesi ve analizi konusunda deneyim kazanmalarl,.molekuler biyolojik problemlerin ge~itli biyoinformatik yakla~lmlarla nasll g6zulebilecegi konusunda fikir sahibi olmalarl,.qe~itli biyoinformatik araglarlnln limitlerini 6grenmeleri ve bu araglar kullanllarak elde edilecek sonuglarl kritik bir g6zle degerlendirebilmeleri beklenmektedir.

7 MAKSiMUM KA" nc AYISI: 12 KATlLIMCI PROFit Katlllmcllarln, temel molekuler genetik ve biyokimya konularlnl bilmeleri ve temel olaslllk ve istatistik konularl hakklnda bilgi sahibi olmalarl beklenmektedir. Biyolojik bilimler; molekuler genetik, botanik, veterinerlik gibi; ziraat bilimleri, tlbbi bilimler ve benzeri alanlarda 9all~an, lisansustu egitim yapan ve ara~tlrmalarl slraslnda biyolojik veri analizi y6ntemlerini kullanma gereksinimi duyabilecek butun bilim insanlarlmlzln egitime katllmasl uygundur. Egitim ingilizce ve Turkge olarak yurutuleceginden dolayl katlllmcllarln orta seviyede ingilizce bilmesi gerekmektedir. Egitime kabul edilen katlllmcllann, getirmeleri gerekmektedir. kendi dizustu bilgisayarlarlnl EGiTiM OCRETi Katlllmcl Turu Egitim Ocreti TL (%18 KDV dahil) bgrenci ve Ara~tlrma Gorevlileri bgretim Uyesi/Diger Kamu Qall~anlarl bzel Sektor <;all~anlarl Egitim ucretlerinin yatlrllmasl hakklnda detayll bilgi, egitime kabul edilen katlllmcllara iletilecektir.

8 KONAKLAMA VE DiGER BiLGiLER* Gunluk misafirhane konaklama ucreti Oniversite ve kamu kurum/kurulu!? personeli: 30 TL (KDV dahil, ki!?i ba!?1 kall!?) Kahvaltl 6 TL (KDV dahil) Yemek: * Fiyatlar bir ay oncesinden kesinle$ecektir 7 TL (KDV dahil) Egitim dili inqilizce'dir. ~atlllmcllar egitimin dozenlenecegi TOBiTAK MAM GMBE'den Istanbul, Izmit ve Gebze'ye gidi~ d6no~lerde kurum servislerinden Ocretsiz olarak yararlanabileceklerdir. Egitime katllmak isteyen adaylarln son ba~vuru tarihinden 6nce ba~vularlnl a~aglda belirtilen web adresinden yaparak GMBE Egitim Sorumlusu Zehra Pek~en'e e-posta yolu ile iletmeleri gerekmektedir. Egitim ile ilgili diger sorularlnlzl Dr. Bayram Yuksel'e e-posta yolu ile iletebilirsiniz. Web: : zehra.peksen@mam.gov.tr : bayram.yuksel@mam.gov.tr Dr. Bayram Yuksel Tel: (0-262) Faks : (0-262)

9 TUBITAK Marmara Arastlrma Merkezi, Gen Muhendisligi ve Biyoteknoloji Enstitusu Nisan 2011 TOBiTAK MAM GMBE P.K.21, 41470, Gebze I KOCAELi

10 AMAC;: Planlanan konu igerigine paralel olarak bu egitimin iki temel amacl bulunmaktadlr. ilk olarak, genetik 9all~malarda ara~tlrmacllarln slkllkla ihtiya9 duyduklarl verilerin elde edilmesini saglayan belli ba~11 genom veri bankalarlnln ve biyoinformatik ara91arln tanltllmasl, uygulamall 9all~malarla s6z konusu veri bankalarlndan ve ara91ardan nasll ve ne ~ekilde yararlanllabileceginin katlllmcllara aktarllmasl ama9lanmaktadlr. ikinci ama9 ise, deneysel 9all~malarla elde edilen DNA dizilerinin analiz edilmesinde kullanllan temel DNA dizi analiz programlarl hakklnda bilgi vermek ve kullanlmlarlnl g6stermektir. B6ylelikle verilecek olan bu egitim ile katlllmcllara hem genom veri bankalarl hem de DNA dizi analiz y6ntemleri a91slndan yetkinlik kazandlrllmasl hedeflenmektedir. i<;erik:.genom veri bankalarlna eri~im ve kullanlm.metabolik yolak ve gen fonksiyonu veri bankalarlna eri~im ve kullanlm.internet uzerinden eri~ilebilen biyoinformatik ara91ar ve kullanlmlarl: DNA dizi d6nu~turuculer, primer tasarlml, DNA dizilerini hizalama (alignment) ve dizi benzerliklerini belirleme.gen promotor b61gelerinin tespiti ve analizi.temel DNA dizi analizi programlarl: Bioedit, MEGA, DnaSP, Arlequin, Network, TreeView UVGULAMALAR: Her katlllmclya internet baglantlsl saglanacak ve g6sterilecek programlar 6nceden katlllmcllarln ~ahsi bilgisayarlarlna y(jklenecektir. B6ylelikle t(jm derslerin uygulamall olarak gerqekle~tirilmesi saglanacaktlr. Katlllmcllar, anlatlm slraslnda dahi her i~lemi bire bir uygulayacak ve anlatlm sonrasl ek all~tlrma yapllacaktlr. Bu baglamda her katlllmcl a~aglda belirtilen uygulamalarl gerqekle~tirecektir:.egitim kapsamlnda anlatllan genom veri bankalarlnl ku"anarak her hangi bir genomik b61ge ya da gen hakklnda farkll tipte verilerin toplanmasl ve farkll veri bankalarlndan toplanan benzer bilgilerin kar~lla~tlrllarak dogrulanmasl,.internet (jzerinden eri~ilebilen biyoinformatik araqlarl kullanarak DNA dizilerinin hizalanarak kar~lla~tlrllmasl, primer tasarlanmasl ve DNA dizilerinin farkll formatlara Qevrilmesi,.G6sterilen DNA dizi analiz programlarlnl kullanarak verilen DNA dizi 6rneklerinin analizlerinin gerqekle~tirilmesi ve sonuqlarin yorumlanmasl.

11 SON BA$VURU T ARiHi: 25 Mart 2011 MAKSiMUM KATlLIMCI SAYISI: 10 KATlLIMCI PROFiLi: Biyolojik Bilimler, Sagllk Bilimleri, Tip, Veteriner ve Ziraat fakoltelerinin ilgili ana bilim dallarlndaki lisansosto programlarlnda bgrenim gbren bgrenciler, Bakanllklar, kamu AR-GE kurulu~larl ve bzel sektbrde c;:all~an ilgili ki~iler egitime katllabilirler. Egitime kabul edilen katlllmcllann getirmeleri gerekmektedir. kendi dizustu bilgisayarlarlnl EGiTiM OCRETi: Katlllmcl Turu Egitim Ocreti TL (%18 KDV dahil) bgrenci ve Ara~tlrma Gorevlileri 500 bgretim Oyesi/Diger Kamu <;all~anlarl 600 bzel Sektor Qall~anlarl 800 Egitim ucretlerinin yatlrllmasl hakkmda detayll bilgi, egitime kabul edilen katlllmcllara iletilecektir.

12 KONAKLAMA VE DiGER BiLGiLER* Gunluk misafirhane konaklama ucreti Oniversite ve kamu kurum/kurulu~ personeli: 30 TL (KDV dahil, ki~i ba~1 kall~) Kahvaltl: 6 TL (KDV dahil) Yemek:.Fiyatlar bir ay oncesinden kesinle$ecektir 7 TL (KDV dahil) Egitim dili T(jrkQe'dir. Katlllmcllar egitimin d(jzenlenecegi TOBiTAK MAM GMBE'den istanbul, izmit ve Gebze'ye gidi~ d6n(j~lerde kurum servislerinden (jcretsiz olarak yararlanabileceklerdir. Egitime katllmak isteyen adaylarln son ba~vuru tarihinden 6nce ba~vularlnl a~aglda belirtilen web adresinden yaparak GMBE Egitim Sorumlusu Zehra Pek~en'e e-posta yolu ile iletmeleri gerekmektedir. Egitim ile ilgili diger sorularlnlzl yolu ile iletebilirsiniz. Dr. Digdem Aktoprakllgil Aksu'ya e-posta Web: : zehra.peksen@mam.gov.tr : digdem.aktoprakligil@mam.gov.tr Dr. Digdem Aktoprakllgil Aksu Tel: (0-262) Faks : (0-262)

13 'fr -1UBiTAL- MAM TUBITAK Marmara Arastlrma. Merkezi Gen Muhendisligi ve Biyoteknoloji Enstitusu 28 Mart -01 Nisan 2011 TOBiTAK MAM GMBE P.K.21, 41470, Gebze I KOCAELi

14 AMA<;:: Hayvan genetik kaynaklarl biyolojik <;:e~itliligin bir par<;:aslnl olu~turmaktadlr. Olkemizde hayvan genetik kaynaklarl yeterince degerlendirilememi~ hatta bazllarl ya hi<;: tanlmlanmadan ya da tam olarak tanlmlanmadan yok olmu~ veya yok olma tehlikesi ile kar~1 kar~lya kalml~tlr. Oysa genetik kaynaklar gelecekte <;:ok 6nemli sosyal ve ekonomik fonksiyonlara sahip olabilecekleri i<;:in gelecegin sigortalarl olarak degerlendirilmektedir. in vitro embriyo Oretim y6ntemleri (in vitro Maturasyon, in vitro Fertilizasyon ve NOklear Transfer) ile nesli tokenmekte olan bireylerin <;:ogaltllmasl ve/veya uston genetik yaplya sahip canlllarln olu~turulmaslnda olduk<;:a 6nemli bir teknolojidir. Grubumuz taraflndan yogun olarak kullanllan bu analizlere ait bilgi birikimi ve deneyimlerimizi ulkemizde ya~am bilimleri alanlnda faaliyet g6steren bilim insanlarlmlzla payla~mak temel hedefimizdir. Egitimimiz hem teorik hem de uygulamall b61umler ~eklinde organize edilecektir. icerik:./ Laboratuar Hayvanlarlnln Baklml, Oretimi ve Deneysel Uygulamalarl./ Qiftlik Hayvanlarlnda Embriyo Oretimi ve Transferi Teknikleri./ Hayvanlarda Klonlama Teknikleri./ Embriyolarda Kriyoprezervasyon Teknikleri./ Transgenik Hayvan Oretim Teknikleri./ Hucre Kultur Teknikleri UYGULAMALAR:.I Farelerde SOperovulasyon.I Degi~ik D6nemlerdeki Fare Embriyolarln Eldesi.I Embriyo KOltOrO ve Embriyo Boyama.I Embriyonun Allcllara Transferi.I Farelerde Allcl Hayvanlarln Hazlrlanmasl.I Slglrlarda in Vitro Maturasyon.I Slglrlarda in Vitro Fertilizasyon.I Slglrlarda NOklear Transfer.I NOklear Transfer i9in Donor HOcrelerin Hazlrlanmasl

15 ON BA$VURU TAR ii: 25 $ubat 201 MAKSiMUM KATlLIMCI SAYISI: KAT' MCI PROF Biyolojik bilimler, sagllk bilimleri, tlp, veteriner ve ziraat takultelerinin ilgili ana bilim dallarlndaki lisansustu programlarlnda ogrenim goren ogrenciler, Bakanllklar, kamu AR-GE kurulu~larl ve ozel sektorde 9all~an ilgili ki~iler egitime katllabilirler. EGiTiM OCRE' Katlllmcl Turu Egitim Ocreti TL (%18 KDV dahil) bgrenci ye Ara~tlrma Goreylileri 550 bgretim Oyesi/Diger Kamu Qall~anlarl 700 bzel Sektbr Qall~anlarl 1000 Egitim ucretlerinin yatlrllmasl hakklnda detayll bilgi, egitime kabul edilen katlllmcllara iletilecektir.

16 KONAKLAMA VE DiGER BiLGiLER* Gunluk misafirhane konaklama ucreti Oniversite ve kamu kurum/kurulu~ personeli: 30 TL (KDV dahil, ki~i ba~1 kall~) Kahvaltl : 6 TL (KDV dahil) Yemek: * Fiyatlar bir ay oncesinden kesinle$ecektir 7 TL (KDV dahil) Egitim dili T(jrk<;;edir. Katlllmcllar egitimin d(jzenlenecegi TOBiTAK MAM GMBE'den istanbul, izmit ve Gebze'ye gidi~ d6n(j~lerde kurum servislerinden (jcretsiz olarak yararlanabileceklerdir. Egitime katllmak isteyen adaylarln son ba~vuru tarihinden 6nce ba~vularlnl a~aglda belirtilen web adresinden yaparak GMBE Egitim Sorumlusu Zehra Pek~en'e e-posta yolu ile iletmeleri gerekmektedir. Egitim ile ilgili diger sorularlnlzl Arzu Qaput<;:u'ya e-posta yolu ile iletebilirsiniz. Web: : zehra.peksen@mam.gov.tr : arzu.tas@mam.gov.tr Arzu <;:aput~u Tel: (0-262) Faks : (0-262)

17 "" ~UBiTAL- MAM TUBITAK Marmara Arastlrma Merkezi. Gen Muhendisligi ve Biyoteknoloji Enstitusu Teknikleri Nisan2011 TOBiTAK MAM GMBE P.K.21, 41470, Gebze I KOCAELi

18 AMAC: G(jn(jm(jzde memeli h(jcrelerinin in vitro ortamlarda (jretilmesi ve bu h(jcrelerin kullanlldlgl deneylerde gen ekspresyonunun izlenmesi ya da manipulasyonu, ara~tlrmacllara g(j<;:i(j bir ara<;: saglamaktadlr. Son birka<;: ylldlr grubumuzda primer h(jcre k(jlt(jrleri ve h(jcre soylarl kullanllarak farkll projeler kapsamlnda <;:all~malar y(jr(jt(jlmekte, imm(jnohistokimya, Western Blot gibi teknikler rutin olarak uygulanmaktadlr. Bu alanda olu~an bilgi birikiminin ve deneyimin yurdumuzdaki ara~tlrmacllara aktarllmasl amaclyla, Eyl(jl 2011 tarihleri araslnda bir egitim d(jzenlenecektir. Bu egitim s(jresince katlllmcllara kuramsal bilgiler verilecek ve kullanllan teknikler, uygulamalarla aktarllacaktlr. i<;erik Be~ i~ gunluk egitim suresince gunde dakika kuramsal ve 6-7 saat uygulamall 9all~ma yapllacaktlr. 1. bkaryotik Hucre Kulturu, Temel Bilgiler 2. Mikroskopide Temel Bilgiler 3. Hucre 9ogalmaslnln bl9umunde Kullanllan Teknikler 4. Gen Ekspresyonun immunohistokimyasal Y6ntemlerle incelenmesi 5. Protein Ekspresyonunun Western Blot Analizi ile izlenmesi 6. Zimografi UYGULAMALAR:.HOcre KOltOrO Uygulamalarl (Primer hocreler ve hocre sbylarlnln pasajlanmasl, dondurulmasl, 96z0lmesi ve sayllmasl).hocre 9ogalma deneyleri (MTT gibi).immonohistokimya / f.sds-page ve Western Blot Analizi.Doku ve hocrelerde proteaz aktivitesinin zimogram jeli ile 6190lmesi /

19 ON A 'URU T ARlt- 15 Mart 2011 MAKSIMUM KATlLIMCI SAYISI: 14 KATIL PROFiLI Katlllmcllarln, molekuler biyoloji bilgisine sahip olmalarl, egitimin daha verimli ve yararll ge<fmesini saglayacaktlr (bu konuda ba~langl<f a~amaslnda olan katlllmcllar oncelikle Molekuler Biyoloji Yontemleri Uygulamall Egitimi'ne ba~vurabilirler). EGiTiM OCRE" Katlllmcl Turu Egitim Ocreti TL (%18 KDV dahil) bgrenci ve Ara~tlrma Gorevlileri 600 bgretim Oyesi/Diger Kamu C;all~anlarl 800 Ozel Sektor <;all~anlarl 1000 Egitim ucretlerinin yatlrllmasl hakklnda detayll bilgi, egitime kabul edilen katlllmcllara iletilecektir.

20 KONAKLAMA VE DiGER BiLGiLER* Gunluk misafirhane konaklama ucreti Oniversite ve kamu kurum/kurulu~ personeli: 30 TL (KDV dahil, ki~i ba~1 kall~) Kahvaltl 6 TL (KDV dahil) Yemek: * Fiyatlar bir ay oncesinden kesinle~ecektir 7 TL (KDV dahil) Egitim dili Turk<fe'dir. Katlllmcllar egitimin duzenlenecegi TOBiTAK MAM GMBE'den istanbul, izmit ve Gebze'ye gidi~ d6nu~lerde kurum servislerinden ucretsiz olarak yararlanabileceklerdir. Egitime katllmak isteyen adaylarln son ba~vuru tarihinden 6nce ba~vularlnl a~aglda belirtilen web adresinden yaparak GMBE Egitim Sorumlusu Zehra Pek~en'e e-posta yolu ile iletmeleri gerekmektedir. Egitim ile ilgili diger sorularlnlzl Muge Serhatll'ya e-posta yolu ile iletebilirsiniz. Web: : zehra.peksen@mam.gov.tr : muge.serhatli@mam.gov.tr Muge Serhatll Tel: (0-262) Faks : (0-262)

21 ~UBITAK-- HAM TUBITAK Marmara Arastlrma, Merkezi Gen Muhendisligi ve Biyoteknoloji Enstitusu Nisan 2011 TOBiT AK MAM GMBE P.K.21, 41470, Gebze I KOCAELi ~ww.mam.qov.m

22 AMA9: MolekQler Biyoloji Y6ntemleri Egitimi ile bu alanda 9all~acak ara~tlrlcllara temel molekqler biyoloji tekniklerinin g6sterilmesi ve uygulamalarl destekleyecek temel bilgilerin verilmesi ama9ianml~tlr. Egitim boyunca yapllacak olan t;all~malar; DNA, protein ve mikrobiyolojik y6ntemleri kapsamaktadlr. Egitim programl hazlrlanlrken, kullanllacak olan teknolojilerin katlllmcllar taraflndan bireysel olarak uygulanmasl ilkesi temel allnmaktadlr. Teorik ders konularl se9ilirken ise uygulama 9all~malarlnl destekleyici bilgilerin verilmesi ama9lanmaktadlr. ic;erik: Egitim boyunca yapllacak olan 9all~malar; DNA, protein ve mikrobiyolojik ybntemleri kapsamaktadlr. Egitim boyunca gunde dakika teorik ve 4-6 saat deneysel 9all~ma yapllacaktlr. UYGULAMALAR: DNA'YA DAYALIDENEYSEL UYGULAMALAR;,I' PCR Araclllgl ile Gen C;;ogaltlml,I' Restriksiyon EndonOkleazlar ile Kesim,I' MolekOler Klonlama,I' Agaroz Jel Elektroforezi,I' Dizi Analizi (demonstrasyon) MiKROBiYOLOJiK DENEYSEL UYGULAMALAR; yi' Kimyasal Uyarlcl Araclllgi ile Gen Ekspresyonu (induksiyon) yi' Kompetan Hucre Hazlrllgl yi' Bakteriyel Transformasyon yi' Bakteriden Plazmit DNA Eldesi yi' Hedef Geni ta~lyan plazmidi iqeren bakterilerin besi ortamlndan seqimi PROTEiNE DA Y ALl DENEYSEL UYGULAMALAR; v' Gen ekspresyon urunlerinin SDS-PAGE elektroferezi ile karakterize edilmesi v' Western-Blot ybntemiyle hedef protein urunun tanlmlanmasl v' Klonlanan gen urunu fonksiyonunun ELISA ybntemiyle belirlenmesi

23 SON BA$VURU T ARiHi: 18 Mart 2011 MAKSiMUM KATlLIMCI SAYISI: 10 KATlLIMCI PROFiLi Tip doktorlarl, biyologlar, eczacllar, ziraat muhendisleri ye yeterinerler. EGiTiM OCRETi Katlllmcl Turu Egitim Ocreti TL (%18 KDV dahil) bgrenci ve Ara~tlrma Gorevlileri 900 bgretim Oyesi/Diger Kamu Qall~anlarl 1100 bzel Sektor Qall~anlarl 1400 Egitim ucretlerinin yatlrllmasl hakkjnda detaylj bilgi, egitime kabul edilen katilimcjlara iletilecektir.

24 KONAKLAMA VE DiGER BiLGiLER* Gunluk misafirhane konaklama ucreti Oniversite ve kamu kurum/kurulu~ personeli: 30 TL (KDV dahil, ki~i ba~1 kall~) Kahvaltl: 6 TL (KDV dahil) Yemek: * Fiyatlar bir ay oncesinden kesinle$ecektir 7 TL (KDV dahil) Egitim dili Turk<;;e'dir. Katlllmcllar egitimin duzenlenecegi TOBiTAK MAM GMBE'den istanbul, izmit ve Gebze'ye gidi~ d6nu~lerde kurum servislerinden ucretsiz olarak yararlanabileceklerdir. Egitime katllmak isteyen adaylarln son ba~vuru tarihinden 6nce ba~vularlnl a~aglda belirtilen web adresinden yaparak GMBE Egitim Sorumlusu Zehra Pek~en'e e-posta yolu ile iletmeleri gerekmektedir. Egitim ile ilgili diger sorularlnlzl Dr. Berrin Erdag'a e-posta yolu ile iletebilirsiniz. Web: : zehra.peksen@mam.gov.tr : berrin.erdag@mam.gov.tr Dr. Berrin Erdag Tel: (0-262) Faks : (0-262)

25 -JjjBiTAK- MAM TUBITAK Marmara Arastlrma, Merkezi Gen MuhendisliQi ve Biyoteknoloji Enstitusu Nisan 2011 TOBiT AK MAM GMBE P.K.21, 41470, Gebze I KOCAELi

26 AMA<;: Biyoloji. Tip, Veterinerlik ve Ziraat alanlarlnda olduk9a yaygln uygulamalar! olan populasyon genetigi 9all~malarlnda projenin ama91arlna uygun kapsaml belirlerken ve kullanllacak DNA i~aretlerini segerken g6z 6nunde tutulacak 6nemli noktalar vurgulanarak katllimcllarin konudaki yetkinliklerine katklda bulunmak hedeflenmektedir. Ayrlca, egitim dahilinde, populasyon genetigi 9all~malarlnda farkll tipteki DNA i~aretlerinden elde edilen verilerin analizi i9in kullanllan ve literaturde en 9ok tercih edilen yazlllmlar hakklnda bilgi verilecek, 6rnek veri setleri ya da katlllmcllarln kendi veri setleri uygulamall olarak analiz edilecektir. i<;:erik: 1. PopOlasyon genetigi <;;all~malarlnda deney dizaynl 2. Deney dizaynl ve veri analizinde 6nemli kavramlar: baglantl, se<;;im, mutasyon ve se<;;im dengesi, Hardy-Weinberg e~itligi ve baglantl e~itsizligi 3. Veri bankalarlndan yararlanma 4. Farkll DNA i~aretleri ve kullanlm alanlarl (RFLP, AFLP, RAPD, mikrosatelit, SNP, dizi analizi) 5. Farkll DNA i~aretlerinden elde edilen bu verilerin analizinde kullanllan temel programlar 6. Programlara ve veri tipine uygun analiz dosyasl hazlrlamak 7. Verilerin uygulamall analiz edilmesi 8. Baglantl e~itsizliginin uygulama alanlarl UYGULAMALAR: Egitimde kullanllacak programlar katlllmcllara 6nceden saglanacaktlr. Ayrlca egitim slraslnda her katlllmclnln internet baglantlsl olacaktlr. Dersler interaktif!?ekilde uygulamall olarak gergekle!?tirilecektir. Daha sonra 6rnek veri setleri ya da katlllmcllarln kendi veri setleri ile all!?tlrmalar yapllacaktlr. Uvaulama konularl: 1. Veri bankalarlna eri!?im ve veri toplama 2. Verilerin analiz dosyalarlnl hazlrlamak: internet uzerinden eri!?ilen biyoinformatik ara91ar ve hazlr yazlllmlar kullanarak 3. Analiz programlarlnln interaktif olarak 6rnek veri dosyasl ile kullanllmasl 4. brnek veri setleri ya da katlllmcllarln kendi veri setlerini kullanllarak 6grenilen programlarla all!?tlrma analizleri gergekle!?tirmek ve sonu91arln yorumlanmasl.

27 SON BA$VURU T ARiHi: 11 Mart 2011 MAKSiMUM KATlLIMCI SAYISI: 10 KATlLIMCI PROFiLi: Biyolojik Bilimler, Sagllk Bilimleri, Tip, Veteriner ve Ziraat fakoltelerinin ilgili ana bilim dallarlndaki lisansosto programlarlnda bgrenim gbren bgrenciler, Bakanllklar, kamu AR-GE kurulu~larl ve bzel sektbrde Qall~an ilgili ki~iler egitime katllabilirler. Egitime kabul edilen katlllmcllarln, getirmeleri gerekmektedir. kendi dizi.isti.i bilgisayarlannl EGiTiM OCRETi Katlllmcl Turu Egitim Ocreti TL (%18 KDV dahil) bgrenci ve Ara~tlrma Gorevlileri 450 bgretim Oyesi/Diger Kamu yall~anlarl 550 bzel Sektbr <;all~anlarl 800 Egitim ucretlerinin yatlrllmasl hakklnda detayll bilgi, egitime kabul edilen katlllmcllara iletilecektir.

28 KONAKLAMA VE DiGER BiLGiLER* Gunluk misafirhane konaklama ucreti Oniversite ve kamu kurum/kurulu~ personeli: 30 TL (KDV dahil, ki~i ba~1 kall~) Kahvaltl 6 TL (KDV dahil) Yemek: * Fiyatlar bir ay oncesinden kesinle$ecektir 7 TL (KDV dahil) Egitim dili TOrk<;:e'dir. Katlllmcllar egitimin dozenlenecegi TOBiTAK MAM GMBE'den istanbul, izmit ve Gebze'ye gidi~ d6no~lerde kurum servislerinden Ocretsiz olarak yararlanabileceklerdir. Egitime katllmak isteyen adaylarln son ba~vuru tarihinden 6nce ba~vularlnl a~aglda belirtilen web adresinden yaparak GMBE Egitim Sorumlusu Zehra Pek~en'e e-posta yolu ile iletmeleri gerekmektedir. Egitim ile ilgili diger sorularlnlzl Dr. Evren Koban'a e-posta yolu ile iletebilirsiniz. Web: : zehra.peksen@mam.gov.tr : evren.koban@mam.gov.tr Dr. Evren Koban Tel: O (262) Faks : O (262)

29 "" ~OBiTAK.- MAM TUBITAK Marmara Arastlrma, Merkezi Gen Muhendisligi ve Biyoteknoloji Enstitusu Mavis 2011 TOBiT AK MAM GMBE P.K.21, 41470, Gebze I KOCAELi

30 ~UBiTAL- MAM TUBITAK Marmara Arastlrma, Merkezi Gen Muhendisligi ve Biyoteknoloji Enstitusu Mayls 2011 TOBiTAK MAM GMBE P.K.21, 41470, Gebze I KOCAELi