Anahtar kelimeler: Kronik böbrek yetmezliği, MTHFR, A1298C, C677T



Benzer belgeler
Akut İnme Hastalarında Risk Faktörü Olan Homosistein Düzeyine MTHFR Gen Polimorfizmlerinin Etkisi*

MTHFR geninde c677t ve/veya a1298c polimorfizmi tespit edilen bireylerde bu polimorfizm sıklıklarının incelenmesi

ARAŞTIRMA (Research Report)

Metilentetrahidrofolat Redüktaz (Mthfr) C677t ve A1298c Gen Polimorfizmleri

Metilen Tetrahidrofolat Redüktaz Enzim Polimorfizmlerinde Perinatal Sonuçlar DR. MERT TURGAL

Parkinson Hastalığı ile α-sinüklein Geni Polimorfizmlerinin İlişkisinin Araştırılması

KRONİK BÖBREK HASTALIĞI (YETMEZLİĞİ) OLAN TÜRK HASTALARINDA TÜMÖR NEKROZ FAKTÖR ALFA ve İNTERLÖKİN-6 PROMOTER POLİMORFİZMLERİNİN ETKİSİ

Metilentetrahidrofolat Redüktaz (MTHFR) Enziminin Moleküler Biyolojisi ve Hastalıklarla İlişkisi*

Muş İlinde Tekrarlayan Gebelik Kayıpları İle Mthfr C677t ve A1298c ve Pai-1 4g/5g Polimorfizmleri Arasındaki İlişki ve Alel Frekansları

Erkek infertilitesinde metiyonin sentaz A2756G ve metiyonin sentaz redüktaz A66G gen polimorfizmlerinin etkisi

IL28B genotip tayini kronik hepatit B hastalarında oral antiviral tedavi cevabını öngörmede kullanılabilir mi?

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

KRONİK VİRAL HEPATİT C Lİ HASTALARDA IL28B NİN İNTERFERON TEDAVİSİNE YANITLA İLİŞKİSİ. Dr. Gülay ÇEKİÇ MOR

attomol apo B-100 quicktype

SNP TEK NÜKLEOTİD POLİMORFİZMLERİ (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS)

Dr. Nilay HAKAN Muğla Sıtkı Koçman Üniv. Tıp Fak. Neonatoloji Bilim Dalı Perinatal Medicine Nisan 2017, İZMİR

AİLESEL AKDENİZ ATEŞİ (AAA-FMF)

HEMODİYALİZ HASTALARINDA TOTAL VE SERBEST PSA DÜZEYLERİNİN ARAŞTIRILMASI

Tükürük kreatinin ve üre değerleri kullanılarak çocuklarda kronik böbrek hastalığı tanısı konulabilir mi? Dr. Rahime Renda

Böbrek nakli hastalarında akut rejeksiyon gelişiminde CTLA-4 tek gen polimorfizmlerinin ve soluble CTLA-4 düzeylerinin rolü varmıdır?

Anensefalide Gebelerin Folat ve Vitamin B12 Düzeyleri ile Faktör V Leiden, Faktör II G20210A, MTHFR C667T ve MTHFR A1298C Polimorfizlerinin Önemi

Light Cycler Real Time PCR Teknolojisi ile Faktör V Geninde Yeni Mutasyon Taranması

MOLEKÜLER TANISI DÜZEN GENETİK HASTALIKLAR TANI MERKEZİ. SERPİL ERASLAN, PhD

Pulmoner ve ekstrapulmoner tüberküloz hastalarında CCL1 rs T/A gen polimorfizminin araştırılması

HOMOSİSTEİN ve KRONİK BÖBREK YETMEZLİĞİ

Major Depresif Bozukluk (MDD) Dünyada maluliyete sebep olan en sık ikinci hastalık Amprik tedavi yaklaşımı İlaca yanıt Yan etki bireysel farklılıklar

α1-antitrypsin quicktype

ETKİN İLAÇ KULLANIMINDA GENETİK FAKTÖRLER. İlaç Kullanımında Bireyler Arasındaki Genetik Farklılığın Mekanizması

Dr. Semih Demir. Tez Danışmanı. Doç.Dr.Barış Önder Pamuk

SEREBRAL TROMBOZLU ÇOCUKLARDA KLİNİK BULGULAR VE TROMBOTİK RİSK FAKTÖRLERİ

Özgün makale / Original article Şilfeler ve ark. 1

Trombofili nin Tekrarlayan Gebelik Kayıplarındaki Rolü. Dr. Ayhan SUCAK

Diyaliz tedavisinde ilk seçenek: Periton diyalizi. Neslihan SEYREK, Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Nefroloji BD

ARAŞTIRMA. MTHFR Geni C677T ve A1298C Polimorfizmlerinin Diyabetik Nöropati Etiyopatogenezindeki Rolü *,**

AF Konusunda Klinik Pratikte Kullanılan Genetik Çalışmalar Türkiye de Durum Ne?

HİPERHOMOSİSTEİNEMİ VE KRONİK BÖBREK YETMEZLİĞİ

Mthfr, Vkorc1 Gen Mutasyonlu Tek Yumurta İkizlerinde Pulmoner Tromboemboli

NON NÖROJENİK NÖROJENİK MESANE ve ÜROFASİAL (OCHOA) SENDROM OLGULARINDA HPSE2 GEN DEĞİŞİMLERİNİN ARAŞTIRILMASI

attomol lactose intolerance C>T quicktype

Kırım Kongo Kanamalı Ateş hastalarında ağırlık ve ölüm riskinin tahmininde plazma cell-free DNA düzeyinin önemi

KONU 24A HEPATİT C. Tekin AKPOLAT, Cengiz UTAŞ

Farmakogenetikte Kullanılan Temel Yöntemler

GENETİK POLİMORFİZMLER. Prof. Dr. Filiz ÖZBAŞ GERÇEKER

ARAŞTIRMA (Research Report)

SÜT ÇOCUKLARINDA UZUN SÜRELİ PERİTON DİYALİZİNİN SONUÇLARI

Dr. U ur DEL GEZER, Dr. Ebru E. AKIfiIK, Dr. Nejat DALAY. stanbul Üniversitesi Onkoloji Enstitüsü Temel Onkoloji AbD

MEME KANSERİ HASTALARINDA JAM-A VE LFA-1 GEN VARYASYONLARININ ETKİSİNİN İNCELENMESİ

GÖĞÜS HASTALIKLARINDA GENETİK ARAŞTIRMA. Prof. Dr. Nejat Akar Ankara Üniversitesi

Sebahat Usta Akgül 1, Yaşar Çalışkan 2, Fatma Savran Oğuz 1, Aydın Türkmen 2, Mehmet Şükrü Sever 2

İskemik İnmeli Hastalarda Plazma Homosistein Düzeyleri. Plasma Homocysteine Levels in Patients with Ischemic Stroke. Özet

T.C. SELÇUK ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ

Topaloğlu R, ÖzaltınF, Gülhan B, Bodur İ, İnözü M, Beşbaş N

Spina bifida hastalarında metilen tetrahidrofolat redüktaz, TEAD2 ve PAX3 gen polimorfizmlerinin araştırılması

IV. FAKTÖR VII EKSİKLİĞİ TANI VE TEDAVİ KILAVUZU BÖLÜM ULUSAL TANI VE TEDAVİ KILAVUZU 2013

İnsülin Tedavisi ve Böbrek Hastalıkları. Dr Rahmi Yilmaz Hacettepe Üniversitesi Nefroloji Bilim Dalı

Mide kanseri hastalarında survivin gen polimorfizmi araştırılması

ETKİN İLAÇ KULLANIMINDA GENETİK FAKTÖRLER. İlaç Kullanımında Bireyler Arasındaki Genetik Farklılığın Önemi

Mide Kanserli Hastalarda Siklin D1 (G870A) Gen Polimorfizminin Araştırılması ARAŞTIRMA

NEFROTİK SENDROMLU ÇOCUKLARDA MDR 1 CEVABIN BELİRLENMESİNDE ROLÜ

Hiperkoagülabilite Trombofili Tarama ve Tedavi DR ERMAN ÖZTÜRK

REKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL

Malnutrisyon ve İnflamasyonun. Hasta Ötiroid Sendromu Gelişimine imine Etkisi

PRİMER HİPEROKSALÜRİ TİP 1 DE GENETİK TANI

BÖBREK NAKİLLİ ÇOCUKLARDA GEÇ DÖNEM AKUT REJEKSİYONUN GREFT SAĞKALIMI ÜZERİNE ETKİLERİ. Başkent Üniversitesi Çocuk Nefroloji Dr.

Farmakogenetik Dr. Pınar Saip İ.Ü.Onkoloji Enstitüsü

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİLERİN TANIMLANMASINDA PCR-RFLP VE DNA SEKANS ANALİZİ SONUÇLARININ KARŞILAŞTIRILMASI

Bugün Neredeyiz? Dr. Yunus Erdem Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Nefroloji Ünitesi

HEMODİYALİZE GEÇ BAŞLAMAK GEREKLİDİR. Dr. Rümeyza Kazancıoğlu Bezmialem Vakıf Üniversitesi Tıp Fakültesi Nefroloji Bilim Dalı

RENAL TRANSPLANT ALICILARINDA C5aR 450 C/T GEN POLİMORFİZMİ: GREFT ÖMRÜ İLE T ALLELİ ARASINDAKİ İLİŞKİ

MOLEKÜLER BİYOLOJİ LABORATUVARI

VIII. FAKTÖR XII EKSİKLİĞİ TANI VE TEDAVİ KILAVUZU BÖLÜM ULUSAL TANI VE TEDAVİ KILAVUZU 2013

NEVŞEHİR İLİNDE HEPATİT C VİRÜS GENOTİP DAĞILIMI İLE SERUM ALANİN AMİNOTRANSFERAZ VE KANTİTATİF SERUM HCV RNA DÜZEYLERİ İLİŞKİSİ*

HEMODİYALİZ VE PERİTON DİYALİZİ UYGULANAN HASTALARIN BEDEN İMAJI VE BENLİK SAYGISI ALGILARININ KARŞILAŞTIRILMASI

T.H. Morgan ve A.H. Sturtevant 1911

Erişkin Dikkat Eksikliği Ve Hiperaktivite Bozukluğu nda Prematür Ejakülasyon Sıklığı: 2D:4D Oranı İle İlişkisi

PEDİATRİK MAKROTROMBOSİTOPENİLİ OLGULARDA MYH9 & TUBB1 GEN MUTASYONLARI

hs-troponin T ve hs-troponin I Değerlerinin Farklı egfr Düzeylerinde Karşılaştırılması

Tip 2 Diyabetli Bireylerde Mthfr C677T ve A1298C Gen Polimorfizmleri ile Diyabetik Retinopati Arasındaki İlişkinin İncelenmesi

Arşiv Kaynak Tarama Dergisi

GERİATRİK HEMODİYALİZ HASTALARINDA KOMORBİDİTE VE PERFORMANS SKORLAMALARININ PROGNOSTİK ÖNEMİ; TEK MERKEZ DENEYİMİ

Tekrarlayan düşükleri olan ailede herediter mthfr c677t mutasyonunun olası rolü

ADIM ADIM YGS LYS Adım EKOLOJİ 15 POPÜLASYON GENETİĞİ

Periferik Arter Hastalığı Olan Erkek Hastalarda Trombofilik Mutasyonların Yaygınlığı

FARMAKOGENETİK. Prof. Dr. Nejat Akar TOBB-ETÜ Hastanesi

Türkiye Endokrinoloji ve Metabolizma Derneği En İyi Genç Araştırıcı Ödülü-2011

Antalya İlindeki Beta-Talasemi Gen Mutasyonları, Tek Merkez Sonuçları

HAFTA III Bağlantı, Asosiyasyon, Haritalama

Hemodiyaliz ve Sürekli Ayaktan Periton Diyalizi Hastalar nda Protein C, Protein S ve Antitrombin III Düzeyleri

Tüberküloz Hastalarında Sitokin Gen Polimorfizmi ve Genetik Yatkınlığın Belirlenmesi*

Pernisyöz Anemi li Bir Olguda Pulmoner Emboli: Kal t msal Trombofili ve Kazan lm Risk Faktörlerinin Etkileri

Prediyaliz Kronik Böbrek Hastalarında Kesitsel Bir Çalışma: Yaşam Kalitesi

PERİTON DİYALİZİ HASTALARINDA AKIM ARACILI DİLATASYON VE ASİMETRİK DİMETİLARGİNİN MORTALİTEYİ BELİRLEMEZ

Diyaliz Hastalarında Kan Basıncı Ölçümü Hangi Pozisyonlarda Yapılmalıdır?

Habituel Abortus Nedeniyle Takip Edilen ki Olguda MTHFR Defekti: Olgu Sunumu

Agaroz jel elektroforezi

LAMİVUDİN TEDAVİSİ ALAN KRONİK HEPATİT B OLGULARINDA INNO-LIPA HBV DR YÖNTEMİ İLE SAPTANAN YMDD MOTİF DEĞİŞİKLİKLERİ

HIV İLE ENFEKTE OLMUŞ HASTALARDA M41L DİRENÇ MUTASYONUNUN REAL- TİME POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU İLE SAPTANMASI

KAPİLLER ELEKTROFOREZ DNA SEKANSLAMA

ÇOCUKLARDA KRONİK BÖBREK HASTALIĞI Küçük yaş grubunda doğumda başlayabilen Kronik böbrek yetersizliği Son evre böbrek yetmezliği gelişimine neden olan

KALITSAL TROMBOFİLİ NİN MOLEKÜLER ANALİZİ

Transkript:

ARAŞTIRMA (Research Report) Emiroğulları EF, Saatçi Ç, Ünal A, Özkul Y ARTERİYO-VENÖZ FİSTÜL TROMBOZU GELİŞEN VE GELİŞMEYEN KRONİK BÖBREK YETMEZLİĞİ OLAN HASTALARDA METİLENTETRAHİDROFOLAT REDÜKTAZ POLİMORFİZMLERİNİN ARAŞTIRILMASI * Researching Methylenetetrahydrofolate Reductase Polymorphisms in Chronic Renal Failure Patients with Developing and Non-Devoloping Arterio-Venous Thrombosis Elif Funda EMİROĞULARI 1, Çetin SAATÇİ 2, Aydın ÜNAL 3, Yusuf ÖZKUL 4 Özet : Metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR), folat döngüsünde önemli bir rol oynar ve homosistein metabolizmasına katkıda bulunur. MTHFR genindeki bazı mutasyonlar, MTHFR geninin enzim aktivitesinde azalmaya neden olabilir. MTHFR geninde yaygın olarak C677T ve A1298C polimorfizmleri görülür. Bu çalışmada kronik böbrek yetmezlikli (KBY) hastalarda MTHFR C677T ve MTHFR A1298C polimorfizmlerinin etkisi araştırılmıştır. Bu amaçla nedeni bilinmeyen arteriyovenöz fistül trombozu gelişen KBY li 31 kişi hasta grubu ve fistül tıkanması görülmeyen KBY li 51 kişi kontrol grubu olarak çalışıldı. Periferal kan örnekleri alınarak DNA izole edildi. MTHFR C677T ve MTHFR A1298C polimorfizmi PCR-RFLP yöntemi ile belirlendi. MTHFR C677T polimorfizminin hasta ve kontrol grubunda normal genotipli birey sayısı sırasıyla 27 (%87.09) ve 44 (% 86.27), heterozigot genotipli birey sayısı 4 (%12.90) ve 6 (%11.76) olarak tespit edildi. Hasta grubunda homozigot mutant genotip bulunmazken kontrol grubunda bir kişide (%2) tespit edildi. MTHFR A1298C polimorfizminin hasta ve kontrol grubunda normal genotipli birey sayısı sırasıyla 12 (%38.70) ve 14 (%27.50) olarak; heterozigot genotipli birey sayısı sırasıyla 12 (%38.70) ve 25 (%49), homozigot mutant genotipli birey sayısı 7 (%22.60) ve 12 (%23.50) olarak tespit edildi. Araştırma sonucunda kronik böbrek yetmezlikli hasta ve kontrol grubu arasında MTHFR C677T ve A1298C genotipleri ve allel sıklıkları açından önemli bir fark bulunamadı. Elde edilen bulgular KBY li hastalarda MTHFR C677T ve MTHFR A1298C polimorfizmlerinin tromboz riskini etkilemediğini işaret etmektedir. Anahtar kelimeler: Kronik böbrek yetmezliği, MTHFR, A1298C, C677T Summary : Methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) plays an important role in the folate cycle and contribures to the metabolism of the aminoacid homocysteine. Some of the mutations in the MTHFR gene cause a decrease in MTHFR activity. Particularly C677T and A1298C mutations in MTHFR gene are two common polymorphisms. The aim of this study is to find out the relationship between MTHFR C677T/A1298C mutations and chronic renal failure patients. Thirty-one chronic renal failure patients with developing arteriovenous thrombosis and 51 chronic renal failure patients with nondeveloping arterio-venous thrombosis were chosen. DNA was extracted from peripheral blood samples of the patients and controls. MTHFR C677T and MTHFR A1298C polymorphisms was identified by PCR (polymerase chain reaction)-rflp (restriction fragment length polymorphism) methods. MTHFR C677T polymorphism in patients and control group normal genotype was found in 27 (87.09%) and 44 (86.27%), heterozygote genotype 4 (12.90%) and 6 (11.76%). No homozygote subjects were found in patients group but one subject were detected in the control group (2%). MTHFR A1298C polymorphism in patients and control group normal genotype was found in 12 (38.70%) and 14 (27.50%), heterozygote genotype 12 (38.70%) and 25 (49%), homozygote genotype 7 (22.60%) and 12 (23.50%). MTHFR C677T and MTHFR A1298C genotype and allele frequency were not significantly different in patients and control groups with chronic renal failure. As a result, MTHFR C677T and MTHFR A1298C polymorphisms are not a risk factor for thrombosis in chronic renal failure patients. Key words: Chronic renal failure, MTHFR, A1298C, C677T 1 Arş.Gör.Erciyes Ün.Sağ.Bil.Ens.Tıbbi Genetik AD, Kayseri 2 Yrd.Doç.Dr.Erciyes Ün.Tıp Fak.Tıbbi Genetik AD, Kayseri 3 Uzm.Dr.Erciyes Ün.Tıp Fak.Nefroloji AD, Kayseri 4 Prof.Dr.Erciyes Ün.Tıp Fak.Tıbbi Genetik AD, Kayseri Geliş Tarihi : 29.08.2007 Kabul Tarihi : 20.12.2007 * Bu çalışma Erciyes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından TSA.07.195 nolu proje ile desteklenmiştir 121

12-16 Arteriyo-venöz yaş grubu fistül çocuklarda trombozu gelişen atletik ve performansın gelişmeyen kronik belirlenmesinde böbrek yetmezliği fiziki olan ve kardiyorespiratuar hastalarda metilentetrahidrofolat özelliklerin etkisi. Metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR), folat metabolizmasında önemli bir enzimdir (1). İnsan MTHFR geni, kromozom 1p36.3 de lokalize olmuştur ve 656 aminoasitten oluşan MTHFR enzimini kodlar. MTHFR enzimi, homosisteinin remetilasyon döngüsünde (homosistein, transsülfürasyon ve remetilasyon yollarını kullanarak metabolize olur) görev yapar (2). MTHFR geninde meydana gelen bir mutasyon (C677T polimorfizmi) enzim aktivitesini azaltmaktadır (3). Bunun sonucunda 5-metil tetrahidrofolat (5- metil THF) düzeyi azalmakta, 5,10-metilen THF miktarı ile plazma homosistein düzeyi artmaktadır (1, 3-5). Ciddi MTHFR eksikliğinde, periferal nöropati, gelişme geriliği, hipotonia, tromboz gibi klinik bulgular görülür. MTHFR eksikliğinin hafif olduğu durumlara populasyon genelinde oldukça sık rastlanmakta olup, özellikle arteriyel hastalıkların oluşumunda bir risk faktörü olduğu ileri sürülmektedir (6). C677T polimorfizmi MTHFR proteinin N terminal katalitik bölgesini etkileyen 4. ekzonda meydana gelir (7). Bu polimorfizmde, MTHFR enzimini kodlayan gende 677. nükleotid olan C (Sitozin) in T (Timin) e dönüşmesi sonucu ortaya çıkan bir nokta mutasyonu vardır. Bu mutasyon, alanin aminoasitinin yerine valin aminoasitinin geçmesine neden olur ve MTHFR enzim aktivitesi azalır (8). MTHFR geninde belirlenen diğer bir mutasyon da, enzimi kodlayan gende 1298. nükleotid olan A (Adenin) in C (Sitozin) e değişimi sonucu oluşan nokta mutasyonudur. Bu mutasyon sonucu MTHFR proteinin C terminal bölgesinde glutamat alanine dönüşmektedir (9). Bu mutasyonda da diğer mutasyon tipinde olduğu gibi MTHFR aktivitesi azalır. A1298C polimorfizminin plazma homosistein konsantrasyonundaki artışı, C677T polimorfizmi kadar etkilemediği ileri sürülse de, bu polimorfizmin önemi henüz tam olarak açıklanamamıştır (10). MTHFR C677T polimorfizmi sıklığı ırka ve coğrafi bölgeye göre büyük değişiklik gösterir. T677T oranı Amerika daki siyah populasyonda ve Güney Amerika da %1 iken Avrupa daki beyaz toplumda, Kuzey Amerika da ve Avustralya da %6-20 dir. Avrupa da kuzeyden güneye doğru görülme sıklığı artmaya meyillidir (11). Türkiye de yapılan çalışmalarda homozigot mutasyon oranı %5, heterozigot mutasyon oranı ise %35 olarak bildirilmiştir (12). MTHFR A1298C polimorfizmi için, çeşitli ülkelerde C1298C genotip sıklığı %1-12 arasında değişir. Türkiye de yapılan bir çalışmada C1298C genotip sıklığı %6 olarak tespit edilmiştir (11). Bu çalışmada kronik böbrek yetmezliği (KBY) olan hastalarda nedeni bilinmeksizin arteriyovenöz fistül (A-V fistül) trombozu gelişiminde MTHFR C677T ve A1298C polimorfizmlerinin etkilerinin araştırılması ve aralarındaki ilişkinin tespit edilmesi amaçlanmıştır. GEREÇ VE YÖNTEM Bu çalışmada KBY olan ve nedeni bilinmeyen A-V fistül tıkanması yaşayan 31 kişi hasta grubuna (20 erkek, 11 kadın), KBY olan ve fistül tıkanması görülmeyen 51 kişi de kontrol grubuna (22 erkek, 29 kadın) dahil edildi. Daha sonra gruplardan periferal kan önekleri (0.3 ml EDTA üzerine 2 ml kan) alındı, DNA izolasyon yöntemi kullanılarak hastaların DNA sı izole edildi. MTHFR C677T polimorfizmi için 5 - TGAAGGAGAAGGTGTCTGCGGGA-3 ve 5 - AGGACGGTGCGGTGAGAGTG-3 primer dizisi kullanıldı. PCR reaksiyonu için 10 pmol primer çifti, 2.5 mm dntp, 10xPCR tamponu, 1.5 mm MgCl 2, Taq DNA polimeraz (1U/ml) ve distile sudan oluşan 50 µl lik PCR karışımı hazırlandı. 94 o C 2dk, 94 o C 30 sn, 62 o C 30sn, 72 o C 30 sn, 72 o C 7dk olmak üzere 40 devirlik PCR programı hazırlanarak örnekler amplifiye edildi. PCR amplifikasyonundan sonra 15 µl PCR ürünü Hinf I restriksiyon enzimi ile kesildi. Daha sonra DNA fragmentleri %3 lik agaroz jelde görüntülendi ve genotipler belirlendi (Tablo I). MTHFR A1298C polimorfizmi için 5 - GCAAGTCCCCCAAGGAGG-3 ve 5 - GGTCCCCACTTCCAGCATC-3 primer dizisi kullanıldı. PCR reaksiyonu için 10 pmol primer çifti, 2.5 mm dntp, 10xPCR tamponu, 1.5 mm MgCl 2, Taq DNA polimeraz ( 1U/ml) ve distile 122

Emiroğulları EF, Saatçi Ç, Ünal A, Özkul Y sudan oluşan 50 µl lik PCR karışımı hazırlandı. 92 o C 2dk, 92 o C 1dk, 60 o C 1dk, 72 o C 30 sn, 72 o C 7dk olmak üzere 35 devirlik PCR programı hazırlanarak örnekler amplifiye edildi. PCR amplifikasyonundan sonra 15 µl PCR ürünü Mbo II restriksiyon enzimi ile kesilerek fragmentlere ayrılması sağlandı. Daha sonra DNA fragmentleri % 4 lük agaroz jelde görüntülendi ve genotipler belirlendi (Tablo I). Çalışılan polimorfizm sonuçlarının istatistiksel değerlendirilmesi Ki-kare testi ile yapıldı. İstatistiksel açıdan p<0.05 anlamlı kabul edildi. BULGULAR MTHFR C677T polimorfizmi hasta ve kontrol grubunda normal genotipli birey sayısı sırasıyla 27 (% 87.09) ve 44 (%86.27), heterozigot genotipli birey sayısı da 4 (%12.90) ve 6 (%11.76) olarak tespit edildi (Tablo II). Hasta grubunda homozigot mutant genotip bulunmazken kontrol grubunda bir kişide (%2) bu genotip tespit edildi. Hasta grubunda C alleli frekansı %93.54, kontrol grubunda ise %92.15 olarak belirlendi (Tablo II). MTHFR A1298C polimorfizmi hasta ve kontrol grubunda normal genotipli birey sayısı sırasıyla 12 (%38.70) ve 14 (%27.50), heterozigot genotipli birey sayısı 12 (%38.70) ve 25 (%49), homozigot mutant genotipli birey sayısı ise 7 (%22.60) ve 12 (%23.50) olarak tespit edildi. A alleli frekansı hasta grubunda %58.06, kontrol grubunda ise %51.96 şeklinde belirlendi (Tablo III). Ayrıca MTHFR C677T ve A1298C polimorfizmleri Ki-kare testi kullanılarak birbirleri ile karşılaştırıldı. (Tablo IV). Ancak her iki polimorfizm açısından gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık gözlenmedi (). Tablo I. MTHFR C677T ve A1298C polimorfizmlerinin PCR ürünleri ve RFLP uygulandıktan sonra enzim kesim ürünlerinin genotiplere göre dağılımı Çalışılan Polimorfizm Kullanılan Restriksiyon Enzimi PCR Ürünü Normal Genotip Enzim Kesim Ürünleri MTHFR C677T Hinf I 198 bp 198 bp MTHFR A1298C Mbo II 163 bp 56 bp 31 bp 30 bp 28 bp 18 bp Heterozigot Genotip Enzim Kesim Ürünleri 198 bp 175 bp 23 bp 84 bp 56 bp 31 bp 30 bp 28 bp 18 bp Homozigot Genotip Enzim Kesim Ürünleri 175 bp 23 bp 84 bp 31 bp 30 bp 18 bp 123

12-16 Arteriyo-venöz yaş grubu fistül çocuklarda trombozu gelişen atletik ve performansın gelişmeyen kronik belirlenmesinde böbrek yetmezliği fiziki olan ve kardiyorespiratuar hastalarda metilentetrahidrofolat özelliklerin etkisi. Tablo II. KBY tanısı konmuş A-V fistül trombozu gelişen hastalarda ve gelişmeyen kontrol rubu hastalarda MTHFR C677T genotiplerinin dağılımı ve allel sıklığı MTHFR C677T Genotipi Hasta Grubu (n: 31) Kontrol Grubu (n: 51) O.R () C677C Genotipi Sayı (%) 27 (% 87.10) 44 (% 86.30) C677T Genotipi Sayı (%) 4 (% 12.90) 6 (% 11.80) O.R= 1.074 0.287-4.014 O.R= 1.111 0.287-4.295 T677T Genotipi Sayı (%) - 1 (% 2) - C alleli Sayı (%) 58 (% 93.54) 94 (% 92.15) T alleli Sayı (%) 4 (% 6.45) 8 (% 7.84) O.R= 1.234 0.356-4.282 O.R= 0.810 0.234-2.812 O.R= odds ratio GA= güven aralığı Tablo III. KBY tanısı konmuş A-V fistül trombozu gelişen hastalarda ve gelişmeyen kontrol grubu hastalarda MTHFR A1298C genotiplerinin dağılımı ve allel sıklığı MTHFR A1298C Genotipi Hasta (n: 31) Kontrol (n: 51) O.R () A1298A Genotipi Sayı (%) 12 (% 38.70) 14 (% 27.50) A1298C Genotipi Sayı (%) 12 (% 38.70) 25 (% 49) C1298C Genotipi Sayı (%) 7 (% 22.60) 12 (% 23.50) A alleli Sayı (%) 36 (% 58.06) 53 (%51.96) C alleli Sayı (%) 26 (% 41.93) 49 (% 48.03) O.R= odds ratio GA= güven aralığı O.R= 1.699 0.646-4.311 O.R= 0.657 0.265-1.628 O.R= 0.948 0.328-2.741 O.R= 1.498 0.792-2.831 O.R= 0.668 0.353-1.262 124

Emiroğulları EF, Saatçi Ç, Ünal A, Özkul Y Tablo IV. MTHFR C677T ve A1298C polimorfizmlerin hasta ve kontrol grubundaki dağılımı MTHFR Polimorfizmleri A1298C C677T Hasta (n:31) Sayı (%) Kontrol (n:51) Sayı (%) OR (GA % 95) AA CC 9 (%29.03) 10 (%19.60) OR= 1.677 (0.594-4.740) AA CT 3 (%9.67) 3 (%5.88) OR= 1.714 (0.324-9.077) AA TT - 1(%1.96) - AC CC 11 (%35.48) 22 (%43.13) OR=0.725 (0.289-1.821) AC CT 1(%3.22) 3 (%5.88) OR= 0.533 (0.053-5.366) AC TT - - - CC CC 7 (%22.58) 12 (%23.52) OR= 0.948 (0.328-2.741) CC CT - - - CC TT - - - TARTIŞMA Plazma homosistein konsantrasyonu böbrek fonksiyonları için önemli bir belirleyicidir ve azalan böbrek rezervi ile homosistein düzeyleri arasında yakın bir ilişki vardır (13). Böbrek yetmezliği gelişen hastalarda homosistein düzeyleri normal şahıslara oranla en az üç-dört kat artmakta (14,15) ve normal populasyonda %5-7 olan hiperhomosisteinemi sıklığı KBY li hastalarda %85-90'a ulaşmaktadır (16). Literatürde bazı çalışmalar MTHFR ile venöz tromboembolizm (VTE) arasında bir ilişkinin bulunmadığını ileri sürmektedir. Couturaud ve arkadaşlarının (17) yaptığı çalışmada MTHFR C677T mutasyonunun homozigot genotipi kontrol ve hasta gruplarında birbirine yakın olarak bulunmuş ve mutasyonun VTE için risk faktörü 2.9 olarak hesaplanmıştır. Bizim yaptığımız çalışmada da benzer sonuçlar elde edilmiştir. A-V fistül trombozlu hasta grubunda homozigot genotip bulunamazken, kontrol grubunda yalnızca bir bireyde belirlenmiştir. Kontrol ve hasta grubu arasında normal ve heterozigot genotip dağılımı açısından ise anlamlı bir fark bulunamamıştır (, Tablo IV). Vychytil ve arkadaşları (18) ile Guldener ve arkadaşlarının (19) yapmış olduğu çalışmalarda MTHFR enzimindeki T677T homozigot genotipi hem hemodiyaliz hem de periton diyalizi hastalarında sağlıklı bireylerdekine benzer şekilde bulunmuş ve normal bireylerde olduğu gibi TT homozigot polimorfizmin hiperhomosisteinemi ile ilişkili olabileceği belirtilmiştir. 125

12-16 Arteriyo-venöz yaş grubu fistül çocuklarda trombozu gelişen atletik ve performansın gelişmeyen kronik belirlenmesinde böbrek yetmezliği fiziki olan ve kardiyorespiratuar hastalarda metilentetrahidrofolat özelliklerin etkisi. MTHFR geninin homosistein metabolizmasındaki rolü tam olarak aydınlatılamamakla birlikte son yıllarda MTHFR geninde ekzon 7'de yeni bir mutasyon tanımlanmıştır. Bu polimorfizmde enzim aktivitesi normalin %60'ına indiği halde hiperhomosisteinemi veya folat eksikliği saptanamadığı belirtilmektedir (20). Yaptığımız çalışmada MTHFR A1298C mutasyonunun heterozigot genotip dağılımı hasta ve kontrol grubunda sırası ile %38.70 ve %49 şeklindedir ve bu mutasyon açısından iki grup arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark yoktur (, Tablo III). Ancak yüzde olarak bakıldığında iki grup arasında % 10 luk bir farklılık görülmektedir. Bununla birlikte literatür bilgileri (6) dikkate alındığında tromboz riski açısından C allelinin hasta grubunda daha yaygın olması beklenmektedir. Födinger ve arkadaşları (21) tarafından yapılan bir çalışmada renal transplantasyon uygulanan 733 hastada MTHFR A1298C polimorfızminin plazma total homosistein ve folat düzeylerine etkisi araştırılmış, çalışmada birleşik heterozigotların plazma homosistein düzeylerinin artmadığı, buna karşın bu hastalarda folat düzeyinin düşük olduğu gösterilmiştir. Yine aynı çalışmada T677T (1298AA) genotipinin plazma homosistein düzeylerini etkilediği ve bu hastaların plazma folat düzeylerinin düşük olduğu gösterilmiştir. Dikmen ve arkadaşlarının (22) yapmış oldukları bir çalışmada 203 hasta ve 55 kontrol kullanılmış, iki grup arasında C677T ve A1298C genotip ve allelsayı yüzde değerleri bakımından istatistiksel olarak () anlamlı bir fark bulunamamıştır. Aynı çalışmada, hasta ve kontrol grupları arasında C677T genotipi ve homosistein düzeyleri ile A1298C genotipi ve homosistein düzeyleri bakımından da anlamlı bir farklılık () bulunamamıştır. Van der Put ve arkadaşları (23) C677T genotip dağılımının plazma homosistein seviyesini etkilemediğini bildirmişlerdir. A1298C polimorfizminin homosistein düzeyine etkisini araştıran Friedman ve arkadaşları (24) da C1298C homozigot genotipine sahip olan bireylerde plazma total homosistein düzeyinin artmadığını rapor etmişlerdir. Dikmen ve arkadaşlarının (22) yaptığı çalışmanın sonuçları da bu raporla uyumlu olmakla birlikte C1298C homozigot genotipinin homosistein artışında T677T genotipi kadar etkili olmadığı sonucuna varmışlardır. Bu çalışmaların aksine Van der put ve arkadaşları (23) A1298C/C677T polimorfizmi olan bireylerde total plazma homosistein konsantrasyonunun önemli derecede arttığını belirlemişlerdir. Bizim çalışmamızda da MTHFR C677T/A1298C polimorfizmleri hasta ve kontrol grubunda karşılaştırıldığında her iki mutasyon açısından heterozigot genotipli bireyler hasta grubunda 1 (%3.22), kontrol grubunda 3 (%5.88) olarak bulunmuştur. Her iki mutasyon açısından homozigot genotipli birey tespit edilememiştir. Yapılan Ki-kare analizi sonucunda her iki polimorfizm açısından KBY li hasta ve kontrol grubu arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunamamış () olup, bulgularımız Dikmen ve arkadaşlarının (22) sonuçları ile uyum göstermektedir. Domagala ve arkadaşları (25) MTHFR C677T ve A1298C mutasyonları ile ilgili yapmış oldukları araştırmada 146 venöz trombozlu hasta grubu ve 100 kişilik kontrol grubu ile çalışmışlardır. Her iki mutasyon bakımından heterozigot genotipli bireyler kontrol grubunda %15, hasta grubunda %11 olarak bulunmuştur. Aynı çalışmada MTHFR mutasyonları ile VTE riski arasında bir ilişki de saptanamamıştır. Bizim çalışmamızda da çift heterozigotluk açısından gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark () bulunamamıştır. Sonuç olarak, elde edilen bulgular KBY li hastalarda MTHFR C677T ve A1298C polimorfizmlerinin tromboz riskini etkilemediğini işaret etmektedir. 126

Emiroğulları EF, Saatçi Ç, Ünal A, Özkul Y KAYNAKLAR 1. Rosenblatt DS. Metyhlenetetrahydrofolate reductase. Clin Invest Med 2001, 24:56-59. 2. Homberger G, Linnebank M, Winter C, et al. Genomic structure and transcript variants of the human metyhlenetetrahydrofolate reductase gene. Eur J Hum Gen 2000, 8:725-729. 3. Weisberg I, Tran P, Christensen B, et al. A second genetic polymorphism in metyhlenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) associated with decreased enzyme activity. Mol Genet Metab 1998, 64:169-172. 4. Bailey LB, Duhaney RL, Maneval DR, et al. Vitamin B-12 status is inversely associated with plasma homocysteine in young women with C677T and/or A1298C metyhlenetetrahydrofolate reductase polymorphisms. J Nutr 2002, 132:24665-24709. 5. Bagley PJ, Jacob S. A common mutation in the Metyhlenetetrahydrofolate reductase gene is associated with an accumulation of formylated tetrahydrofolates in red blood cells. Med Sci 1998, 95:13217-13220. 6. Goyette P, Pai A, Milos R, et al. Gene structure of human Mouse metyhlenetetrahydrofolate reductase (MTHFR). Mammalian Genome 1998, 9:652-656. 7. Tonetti C, Burtscher A, Bories D, et al. Metyhlenetetrahydrofolate reductase deficiency in four siblings: A clinical, biochemical and molecular study of the familiy. Am J Med Genet 2000, 91:363-367. 8. Sell SM, Lugemwa PR. Development of a highly accurate, rapid PCR-RFLP genotyping assay for the metyhlenetetrahydrofolate reductase gene. Genet Test 1999, 3:287-289. 9. Taşçıoğlu N, Taheri S, Saatçi Ç, Özkul Y. Gastrointestinal Sistem Kanserlerinde Metilentetrahidrofolat Redüktaz Geni 677CàT Polimorfizminin İncelenmesi. Erciyes Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi 2006, 15(1):41-45, 10. Födinger M, Horl WH, Sunder-Plassman G. Molecular biology of 5,10- methylenetetrahydrofolate reductase. J Nephrol 2000, 13 (1) 20-33. 11. Sharp L, Little J. Polymorphism in genes involved in folate metabolism and colorectal neoplasia: A HuGE Review Am J Epidemiol 2004, 159:423-443. 12. Güleç S, Aras O, Akar E ve ark. MTHFR gene polymorphism and risk of premature myocardial infarction. Clinical Cardiology 2001, 24 (4):281-4. 13. Chauveau P, Chadefaux B, Coude M et al. Hyperhomocysteinemia, a risk factor for atherosclerosis in chronic uremic patients. Kidney Int Suppl 1993, 43:S72-77. 14. Hultberg B, Andersson A, Arnadottir M. Reduced, free and total fractions of homocysteine and other thiol compounds in plasma from patients with renal failure. Nephron 1995, 70:62-67. 15. Hörl WH. Genesis of the ureamic syndrome. In: Davison AM, Cameron JS, Grünfeld.IP, Kerr DNS, Ritz E, Winearls CG (eds). Oxford Textbook of Clinical Nephrology. Oxford Medical Publications Oxford 1998, pp 1822-1836. 16. Bostom AG, Lathrop L. Hyperhomocysteinemia in endstage renal disease: Prevalence, etiology, and potential relationship to atherosclerotic outcomes. Kidney Int 1997, 52:10-20. 17. Couturaud F, Oger E, Abalain JH, et al. Methylenetetrahydrofolate reductase C677T genotype and venous thromboembolic disease. Respiration 2000, 67:657-661. 18. Vychytil A, Födinger M, Wolf G, et al. Major determinants of hyperhomocysteinemia in peritoneal dialysis patients. Kidney Int 1998, 53:1775-1782. 19. Guldener CV, Robinson K. Homocysteine and Renal disease. Sem Thrombos Hemostasis 2000, 26 (3):313-324. 127

12-16 Arteriyo-venöz yaş grubu fistül çocuklarda trombozu gelişen atletik ve performansın gelişmeyen kronik belirlenmesinde böbrek yetmezliği fiziki olan ve kardiyorespiratuar hastalarda metilentetrahidrofolat özelliklerin etkisi. 20. Födinger M, Wagner OF, Hörl WH, et al. Recent insights into the molecular genetics of the homocysteine metabolism. Kidney Int Suppl 2001, 59:238-242. 21. Födinger M, Buchmayer H, Heinz G, et al. Effect of MTHFR 1298 A C and MTHFR 677C T genotypes on total homocysteine, folate, and vitamin B 12 plasma concentrations in kidney graft recipients. J Am Soc Nephrol 2000, 11:1918-1925. 22. Dikmen M, Gülel B, Güneş HV ve ark. Akut inme hastalarında risk faktörü olan homosistein düzeyine MTHFR gen polimorfizmlerinin etkisi. Kocatepe Tıp Dergisi, 2004, 5:55-61. 23. Van Der Put NM, Gabreels F, Stevens EMB, et al. A second common mutation in the methylenetetrahydrofolate reductase gene: An additional risk factor for neural-tube defects. Am J Hum Genet 1998, 62:1044-1051. 24. Friedman G, Goldschmidt N, Friedlander Y, et al. Common mutation A1298C in human methylenetetrahydrofolate reductase gene: association with plasma total homocystein and folate concentrations. J Nutr 1999, 129:1656-1661. 25. Domagala TB, Adamek L, Nizankowska E, et al. Mutations C677T and A1298C of the 5,10- methylenetetrahydrofolate reductase gene and fasting homocysteine levels are not associated with the increased risk of venous thromboembolic disease. Blood Coagulation and Fibrinolysis 2002, 13:423-431. 128