Mersin İlinde Farklı Su Kaynaklarında Cryptosporidium spp. Varlığının Araştırılması



Benzer belgeler
Van İli içme sularının Cryptosporidium spp. ookistleri yönünden incelenmesi


Bir üniversite hastanesi parazitoloji laboratuvarında belirlenen intestinal ve hepatik parazitler

Mersin İlinde İçme Suyu, Kullanma Suyu, Atık Su ve Deniz Sularında Cryptosporidium spp. Ookistlerinin Araştırılması

TÜBERKÜLOZUN MOLEKÜLER TANISINDA GÜNCEL DURUM

Cyclospora cayetanensis in Neden Olduğu İki Diyare Olgusu

ABSTRACT. Türkiye Halk Sağlığı Kurumu, Tüketici Güvenliği Laboratuvarları ve Biyolojik Ürünler Daire Başkanlığı, ANKARA 2

Giresun da Su ÖrneklerindeToxoplasma gondii nin i Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve İlmiğe Dayalı İzotermal Amplifikasyon Yöntemleriyle Araştırılması*

SULARLA BULAŞAN PROTOZOONLARIN SÜRVEYANSINDA GELİŞMELER Dr.Mehmet TANYÜKSEL GATA Askeri Tıp Fakültesi, Tıbbi Parazitoloji BD, Ankara Dr.

Mutalip Çiçek 1, Hasan Yılmaz 2. Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

UZM. DR. SALİH MAÇİN Şırnak Devlet Hastanesi

:Harran Üniversitesi Sağlık Hizmetleri MYO Şanlıurfa. Derece Alan Üniversite Yıl Sağlık Hizmetleri Meslek Ön lisans

Entamoeba histolytica nın Tanısında Direkt Mikroskopi, Kültür, ELISA ve Moleküler Yöntemlerin Karşılaştırılması*

Aydın da İnsanlardan İzole Edilen Giardia intestinalis Suşlarının Genotiplendirilmesi*

Yoğun Bakım Ünitesinde Gelişen Kandida Enfeksiyonları ve Mortaliteyi Etkileyen Risk Faktörleri

GİRİŞ. Kan dolaşımı enfeksiyonları (KDE) önemli morbidite ve mortalite sebebi. ABD de yılda KDE, mortalite % 35-60

Olgularla Parazitoloji. Doç. Dr. Gülay ARAL AKARSU Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Parazitoloji Bilim Dalı

UZAMIŞ İSHALLİ HAMİLE BİR KADINDA CYCLOSPORA CAYETANENSIS VE CRYPTOSPORIDIUM PARVUM KOENFEKSİYONU*

Asist. Dr. Ayşe N. Varışlı

SERVİKAL YETMEZİĞİNDE MCDONALDS VE MODDIFIYE ŞIRODKAR SERKLAJ YÖNTEMLERININ KARŞILAŞTIRILMASI

Hidrazon Yapısındaki On Adet Bileşiğin Antileishmanial Aktivitesinin Araştırılması

NEVŞEHİR İLİNDE HEPATİT C VİRÜS GENOTİP DAĞILIMI İLE SERUM ALANİN AMİNOTRANSFERAZ VE KANTİTATİF SERUM HCV RNA DÜZEYLERİ İLİŞKİSİ*

Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi nde Yılları Arasında Saptanan Bağırsak Parazitlerinin Dağılımı

Trakya da İnsanlarda Cryptosporidium ve Giardia Enfeksiyonları

Steril pyrüili böbrek nakli hastalarında gerçek zamanlı multipleks polimeraz zincir reaksiyon test sonuçları

Nevşehir Yöresindeki Yeni Doğan İshalli Buzağılarda Cryptosporidiosis in Real Time PCR ve Nested PCR Yöntemleri ile Saptanması*

Erzincan ve Çevresindeki fiehir fiebeke Sular ndan Membran Filtrasyon Yöntemi le Escherichia coli zolasyonu

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Giardia intestinalis Genotiplerinin, Real-Time PCR Yöntemi ile Dışkı Örneklerinden Belirlenmesi

Enzimlerinin Saptanmasında

ÖZGÜN MAKALE/ORIGINAL ARTICLE

Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri. Bölüm 9. MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması

ASSESSMENT OF SUDAN-NYALA City s WATER HEALTH IN UNUSUAL LIFE

Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Cerrahi Yoğun Bakım Ünitesinde Yıllarında İzole Edilen Mikroorganizmalar ve Antibiyotik Duyarlılıkları

GEREÇ VE YÖNTEM BULGULAR

Sivas Belediyesi Çevre-Gıda ve Tıbbi Tahlil Laboratuvarına Yıllarında Başvuran Hastalarda Bağırsak Parazit Dağılımlarının İncelenmesi

Serkan BAŞTEMİR*, Koray ÖNCEL**, Kor YERELİ**, Ali Ahmet KİLİMCİOĞLU**, Cüneyt BALCIOĞLU**, Nogay GİRGİNKARDEŞLER**

İçme Sularında Protozoon Parazitlerin Dezenfeksiyonu Dezenfection of Protozoan Parasites in Drinking Water

İstanbul daki El Ayak Ağız Hastalığı Vakalarında Coxsackievirus A6 ve Coxsackievirus A16 nın Saptanması

Akreditasyon Sertifikası Eki (Sayfa 1/11) Akreditasyon Kapsamı

Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi nde Yılları Arasında Saptanan Bağırsak Parazitlerinin Dağılımı

POYRAZ TIBBİ CİHAZLAR EDVOTEK

TÜRKiYE'DEKi ÖZEL SAGLIK VE SPOR MERKEZLERiNDE ÇALIŞAN PERSONELiN

Human Papillomavirüs DNA Pozitif ve E6/E7 mrna Negatif, Anormal Sitolojili Servikal Örneklerin Genotiplendirilmesi

Van Bölge Eğitim ve Araştırma Hastanesi nde Giardia intestinalis ve Entamoeba histolytica/dispar prevalansı: Dört yıllık izlem

daha çok göz önünde bulundurulabilir. Öğrencilerin dile karşı daha olumlu bir tutum geliştirmeleri ve daha homojen gruplar ile dersler yürütülebilir.

Aydın İlinde Elde Edilen Blastocystis İzolatlarının Alt Tip Dağılımı ve Klinik Semptomların Değerlendirilmesi

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D

Protozoonların Tanısında İlmiğe Dayalı İzotermal Çoğaltma Yöntemi (LAMP)

Konjenital CMV Enfeksiyonu: Türkiye deki Durum

Celal Bayar Üniversitesi Hastanesi Parazitoloji Polikliniği nde Yılları Arasında Saptanan Bağırsak Parazitlerinin İnsidansı

CLOSTRIDIUM DIFFICILE ENFEKSİYONUNDA GLUTAMAT DEHİDROGENAZ VE TOKSİN A/B TESTLERİNİN TANI DEĞERİ VE MALİYET ETKİNLİĞİ

Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Parazitoloji Laboratuvarı na yılları arasında başvuran hastalarda bağırsak parazitlerinin dağılımı *

MANTARLARIN EPİDEMİYOLOJİK TİPLENDİRİLMESİ. Dr. Ayşe Kalkancı Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara

KLİNİK ÖRNEKLERDE GERÇEK ZAMANLI MULTİPLEKS POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU YÖNTEMİYLE AKUT BAKTERİYEL MENENJİT TANISI

İmmün Yetmezlikli Hastalarda İntestinal Protozoonların Tanısı

Ekinokokkozis. E. granulosus Kistik Ekinokokkozis. E. multilocularis Alveoler Ekinokokkozis. E. vogeli ve E. oligoarthrus Polikistik Ekinokokkozis

Akut Gastroenteritli Çocuklarda Rotavirus Prevalansı, Serotip ve Elektroferotip Dağılımı*

ÜRÜN KULLANIM KILAVUZU

HASTA GÜVENLİĞİNDE ENFEKSİYONLARIN KONTROLÜ VE İZOLASYON ÖNLEMLERİ. Dr. Nazan ÇALBAYRAM

Çocuk ve Yetişkin Üriner Escherichia coli İzolatlarında Plazmidik Kinolon Direnç Genlerinin Araştırılması

Bir Eğitim Araştırma Hastanesi nde üç yıllık bağırsak parazitlerinin dağılımı: Retrospektif bir Çalışma

DNA Đzolasyonu. Alkaline-SDS Plasmit Minipreleri. Miniprep ler bakteri kültüründen plasmit DNA sı izole etmenizi sağlar.

Nadir Hastalıklar-Yetim ilaçlar. bir sağlık sorunu. Uğur Özbek İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü (DETAE) Orphanet-Türkiye

VİRUS HASTALIKLARINDA TANI YÖNTEMLERİ

LEGIONELLA: NE YAPMALI?

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİLERİN TANIMLANMASINDA PCR-RFLP VE DNA SEKANS ANALİZİ SONUÇLARININ KARŞILAŞTIRILMASI

Bir yıllık sürede dışkı örneklerinde ELISA ile Entamoeba histolytica araştırılması

Moleküler Yöntemlerin Klinik Mikrobiyolojide Kullanımı Ne zaman? Nerede? Ne kadar? Klinik Parazitoloji

ENFEKSİYON RİSKİNİ AZALTMA YÖNTEMLERİ. Prof.Dr.Halis Akalın Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları AD

Antalya Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Kronik Hepatit C Hastalarının Genotip Dağılımının Araştırılması

Gülay BÖREKÇİ, Asiye ÜZEL. Mersin Üniversitesi, Sağlık Yüksekokulu, Mersin, Türkiye

Teoman Zafer APAN 1 Ayşegül TAYLAN ÖZKAN 2 Ümran DAĞAŞAN ÖZLÜK 3 ÖZET

Enfeksiyon Hastalıkları Tanısında Sendromik Yaklaşım: Avantaj ve Dezavantajları: İshal

Kutanöz Leyşmanyazis Tanısında Direkt Mikroskopi, Kültür ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemlerinin Karşılaştırılması*

Olgularla Klinik Bakteriyoloji: Antibiyotik Duyarlılık Testleri Yorumları. Dilara Öğünç Gülçin Bayramoğlu Onur Karatuna

T.C. Hitit Üniversitesi. Sosyal Bilimler Enstitüsü. İşletme Anabilim Dalı

Bağışıklık Sistemi Baskılanmış Bireylerde Cryptosporidium un ELISA ve Modifiye Aside Dirençli Boyama Yöntemi ile Araştırılması

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİ ENFEKSİYONLARI. Tanı ve Sorunlar. Süheyla SÜRÜCÜOĞLU. Celal Bayar Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD Manisa

SALGIN ARAŞTIRMASINDA KULLANILAN TİPLENDİRME YÖNTEMLERİ

Su Kaynaklı Bir Parazit: Cryptosporidium

T.C. SÜLEYMAN DEMİREL ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ISPARTA İLİ KİRAZ İHRACATININ ANALİZİ

İdrar Tahlilinde Mitler U Z. DR. B O R A ÇEKMEN ACIL Tı P K L I NIĞI O K MEYDANı E Ğ I T IM VE A R A Ş Tı R MA HASTA NESI S AĞ L ı K B ILIMLERI Ü

SERVİKAL ÖRNEKLERDE HPV DNA ve SİTOLOJİK İNCELEME SONUÇLARININ DEĞERLENDİRİLMESİ

Kayseri Bölgesinde Hepatit C Virüs Enfeksiyonunun Genotip Dağılımı

SUYLA İLİŞKİLİ SALGINLARDA LABORATUVAR HİZMETLERİNİN ÖNEMİ VE YÖNETİMİ. Prof. Dr. Betigül ÖNGEN

Kırım Kongo Kanamalı Ateş hastalarında ağırlık ve ölüm riskinin tahmininde plazma cell-free DNA düzeyinin önemi

Viral gastroenteritlere bağlı salgınlar Türkiye ve Dünyada Güncel Durum

YILLARI ARASI EDİRNE BÖLGE HIFZISSIHHA MÜDÜRLÜĞÜ GIDA GÜVENLİĞİ İNCELEME SONUÇLARININ DEĞERLENDİRİLMESİ.

Kemoterapi Alan Kanserli Hastalarda Encephalitozoon intestinalis ve Enterocytozoon bieneusi Prevalansı

Canlı Legionella pneumophila Tespiti ve MLST için Gerçek Zamanlı PCR ve HRM Analizi Tabanlı Yöntemlerin Geliştirilmesi

Çocuk Yuvası ve Yetiştirme Kurumundaki Çocuklarda Bağırsak Parazitleri Yaygınlığının İncelenmesi

Paraziter diyare tedavisi

ELAZIĞ YÖRESİNDE TÜBERKÜLOZLU HASTALARIN BALGAM ÖRNEKLERİNDE MİKOBAKTERİ TÜR DAĞILIMININ PCR-RFLP YÖNTEMİ İLE BELİRLENMESİ

TÜRKİYE DEKİ ÜÇ TIP FAKÜLTESİNİN SON ÜÇ YILDAKİ YAYIN ORANLARI THE THREE-YEAR PUBLICATION RATIO OF THREE MEDICAL FACULTIES IN TURKEY

Niğde il merkezinde bir ishal salgınının incelenmesi, Mart 2014

Hatay da Yurt Dışı Kaynaklı Sıtma Olgularının Moleküler Yöntem Kullanarak Değerlendirilmesi

Ordu ilinde bağırsak parazitleri sıklığı

Yöntem ve Test Seçimine Yaklaşım. Dr. Alpay Özbek Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji AD. Dokuz Eylül Üni. Tıp Fak. İZMİR

Dışkı Örneklerinde Blastocystis spp. Varlığının Mikroskobik, Kültür ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması*

Transkript:

Özgün Çalışma/Original Article Mikrobiyol Bul 2012; 46(1): 93-100 Mersin İlinde Farklı Su Kaynaklarında Cryptosporidium spp. Varlığının Araştırılması Investigation of the Presence of Cryptosporidium spp. in Different Water Sources in Mersin Province, Turkey Gönül ASLAN 1, Gül BAYRAM 2, Feza OTAĞ 1, Şahin DİREKEL 1, Ayşegül TAYLAN ÖZKAN 3, Kemal ÇEBER 4, Gürol EMEKDAŞ 1 1 Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin. 1 Mersin University Faculty of Medicine, Department of Medical Microbiology, Mersin, Turkey. 2 Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Laboratuvar Hizmetleri Bölümü, Mersin. 2 Mersin University Faculty of Medicine, Department of Medical Laboratory Services, Mersin, Turkey. 3 Refik Saydam Hıfzıssıhha Merkezi Başkanlığı, Parazitoloji Laboratuvarı, Ankara. 3 Refik Saydam National Public Health Agency, Parasitology Laboratory, Ankara, Turkey. 4 Niğde Devlet Hastanesi, Mikrobiyoloji Bölümü, Niğde. 4 Nigde State Hospital, Department of Microbiology, Nigde, Turkey. Geliş Tarihi (Received): 15.06.2011 Kabul Ediliş Tarihi (Accepted): 28.11.2011 ÖZET Cryptosporidium, insan ve hayvanlarda enterit etkeni olan hücre içi bir protozoondur. Oral-fekal yolla bulaşan parazitin en önemli kaynağı kontamine su ve besinlerdir. Gelişmekte olan ülkelerde kriptosporidiyoz prevalansının gelişmiş ülkelere oranla daha yüksek olduğu ve bu durumun içme sularının sanitasyon ve dezenfeksiyonunda uygulanan kuralların yetersiz olmasından kaynaklandığı bildirilmektedir. Cryptosporidium türleri arasında en sık saptanan enfeksiyon etkeni Cryptosporidium parvum olup, enfeksiyon sağlıklı kişilerde yüksek morbidite, immün sistemi baskılanmış hastalarda ise yüksek mortalite ile seyredebilir. Kriptosporidiyozun laboratuvar tanısında genellikle aside dirençli boyama tekniği kullanılmaktadır. Günümüzde geliştirilen moleküler yöntemler sayesinde, epidemiyolojik verilerin elde edilmesine yönelik olarak su kaynaklarında ve asemptomatik taşıyıcılarda Cryptosporidium saptanması ve tür düzeyinde tanımlanması mümkün olmuştur. Bu çalışmada, Mersin ilindeki farklı su kaynaklarında Cryptosporidium ookistlerinin varlığının belirlenmesi ve bunların tiplendirilmesi amaçlanmıştır. Mart 2007-Mayıs 2009 tarihleri arasında gerçekleştirilen çalışmada, Mersin şehir merkezi (n= 25) ile Tarsus (n= 32), Mezitli (n= 33) ve Karaduvar (n= 45) ilçelerinden alınan toplam 135 farklı su kaynağına ait örnekler (70 musluk suyu, 50 kuyu suyu, 15 atık su) değerlendirilmiştir. Su örnekleri 10 ar litrelik hacimlerde alınarak por çapı 0.45 µm olan selüloz asetat membran filtresi bulunan vakum pompalı filtrasyon cihazında süzülmüştür. Süzüntü- İletişim (Correspondence): Prof. Dr. Gönül Aslan, Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Mersin, Türkiye. Tel (Phone): +90 324 337 4300/2182, E-posta (E-mail): drgaslan@gmail.com

Mersin linde Farkl Su Kaynaklar nda Cryptosporidium spp. Varl n n Araflt r lmas den Cryptosporidium ookistleri, modifiye Kinyoun nun aside dirençli (soğuk) boyama yöntemi (MKSA) ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile saptanmış ve RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) yöntemiyle tiplendirilmiştir. Çalışmamızda MKSA yöntemiyle üç, PCR ile yedi örnekte Cryptosporidium varlığı saptanmış ve tüm suşlar C.parvum olarak tanımlanmıştır. MKSA ile Cryptosporidium ookistlerinin saptandığı üç örneğin hepsi PCR ile de pozitif sonuç vermiş, buna karşın dört örnek MKSA ile negatif bulunmuştur. Buna göre bölgemizdeki su kaynaklarında C.parvum prevalansı %5.2 (7/135) olarak tespit edilmiştir. Pozitifliğin saptandığı yedi örnekten biri şehir merkezinden alınan atık su örneği, altısı (iki musluk suyu, iki kuyu suyu, iki atık su) ise Karaduvar dan alınan örnekler olup, bu sonuç dikkat çekici bulunmuştur. Karaduvar bölgesinde parazit oranının yüksek (6/45; %13.3) olması, bölgedeki alt yapının yetersiz olmasından ve kuyu sularının içme ve kullanma suyu olarak kullanılmasından kaynaklandığını düşündürmektedir. Gelecekte planlanacak epidemiyolojik çalışmalarla Cryptosporidium spp. genotiplendirmesi ve filogenetik ilişkinin belirlenmesi bulaş kaynaklarının saptanmasında yararlı olacaktır. Anahtar sözcükler: Cryptosporidium parvum; polimeraz zincir reaksiyonu; modifiye Kinyoun boyama yöntemi; su kaynağı; Mersin. ABSTRACT Cryptosporidium is an intracellular protozoon that causes enteritis in human and animals. Contaminated water and food are the major sources for the transmission of oocysts via oral-fecal route. It is reported that the prevalence of cryptosporidiosis is higher in developing countries than developed countries because of inefficient sanitation and disinfection facilities for drinking water. The most frequently detected species is Cryptosporidium parvum leading to high morbidity in healthy subjects and also fatal infections in immunocompromised patients. The acid-fast staining method is widely used in the diagnosis of cryptosporidiosis. Nowadays, Cryptosporidium could easily be detected in water supplies and asymptomatic carriers by molecular techniques to obtain epidemiological data. In this study it was aimed to detect and identify Cryptosporidium oocysts in different water sources in Mersin province, Turkey. A total of 135 water samples (70 taps, 50 wells and 15 sewage) collected from city center (n= 25) and from Tarsus (n= 32), Mezitli (n= 33) and Karaduvar (n= 45) counties between March 2007 and May 2009 were included in the study. Water samples in 10 liter volumes, were filtered by 0.45 µm pore-sized membrane filter vacuum/pressure pumping technique. Cryptosporidium oocysts in filtrates were detected by modified cold Kinyoun acid-fast stain (MCK) technique and also identified and typed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. MCK yielded three and PCR yielded seven positive results. All the strains were identified as C.parvum by PCR-RFLP method. All of the three MCK-positive samples were also found positive with PCR, however four PCR positive samples were MCK-negative. Thus, the prevalence of C.parvum was estimated as 5.2% (7/135) in our region. Of seven positive samples, one was a sewage water sample collected from the city center, while the remaining (two tap water, two well water and two sewage water samples) belonged to the samples collected from Karaduvar county, interestingly. It was thought that deficient infrastructure and use of well water as drinking water supply in Karaduvar region might be the cause of high rate of Cryptosporidium (6/45; 13.3%). Further studies which will determine the genotypes and investigate the phylogenetic relationship between these Cryptosporidium spp., might aid to the epidemiology of cryptosporidiosis in our region. Key words: Cryptosporidium parvum; polimerase chain reaction; modified Kinyoun s staining method; water source; Turkey. GİRİŞ İlk kez 1907 yılında tanımlanan Cryptosporidium bir hücre içi paraziti olup, insan ve ekonomik değeri olan birçok hayvanda enteritin en önemli nedenlerinden biri olarak ka- 94

Aslan G, Bayram G, Ota F, Direkel fi, Taylan Özkan A, Çeber K, Emekdafl G. bul edilmektedir 1. Kriptosporidiyoz, immün sistemi zayıf/baskılanmış kişilerde ve özellikle AIDS li hastalarda ciddi morbidite ve hatta mortaliteye neden olabilir 2,3. İnsanlarda yedi Cryptosporidium türünün (C.parvum, C.hominis, C.meleagridis, C.felis, C.canis, C.suis, C.muris) enfeksiyon yaptığı belirlenmiş olmasına rağmen en sık saptanan tür C.parvum dur 2. C.parvum un özellikle gelişmekte olan ülkelerde yaygın olarak görülen ishal olgularına neden olduğu bildirilmiştir 3. Zoonotik bir enfeksiyon olan kriptosporidiyoz, insanlara hayvanlardan bulaşabildiği gibi kontamine yiyecek, içecek ve su tüketimiyle de bulaşabilir 2. Parazitin enfekte insan ve hayvan dışkısından çevreye yayılıp, döngü içerisinde doğrudan ya da dolaylı yollarla gıda maddeleri veya yeraltı sularını kontamine ederek, bu sularda aylarca enfektivitesini koruyabildiği bildirilmiştir 4,5. Cryptosporidium un en önemli özelliği, içme ve kullanma sularına uygulanan klorlama işlemine karşı dirençli olmasıdır. Özellikle gelişmekte olan ülkelerde, tarım alanlarında atık suların sulama amaçlı kullanılmasının Cryptosporidium ookistlerinin bulaşında önemli olduğu bildirilmiştir 6. Alt yapı problemi olan ve şebeke sularının kullanıldığı bölgelerde bu parazitlere rastlanabilmektedir 1,2. Kriptosporidiyozun tanısı, genellikle dışkı örneklerinde aside dirençli ookistleri saptayan Kinyoun veya Ziehl-Neelsen gibi boyama yöntemleriyle konulmaktadır 7. Uygulama ve değerlendirmesi deneyimli uzmanlarca yapılan bu boyama yöntemleri, bazen boya almayan ookistler ve az sayıda ookist içeren örnekler nedeniyle yanlış negatif sonuçlar verebilmektedir. Mikroskobik tanıdaki bu sorunlar nedeniyle, son yıllarda geliştirilen tanı yöntemlerinden polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) nun duyarlı bir yöntem olduğu ve boyanmada sorun yaşanan olgularda alternatif olarak kullanılabileceği bildirilmektedir 8,9. PCR ile Cryptosporidium türlerinin saptanması, bunların genotiplendirilmesi ve filogenetik analizine de olanak sağlamaktadır. Bu amaçla PCR-RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), PCR-RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA) ve dizi analizi gibi yöntemler, su kaynaklarında insan ve hayvan kökenli Cryptosporidium türlerinin saptanmasında kullanılmaktadır 4. Bu çalışmada, Mersin ilindeki içme ve kullanma suyu kaynaklarında, Cryptosporidium spp. araştırılması ve izole edilen türlerin PCR-RFLP ile genotiplendirilerek bölgemizdeki Cryptosporidium türlerinin dağılımının belirlenmesi amaçlanmıştır. GEREÇ ve YÖNTEM Örneklerin Toplanması, İşlenmesi ve Boyanması Mersin ilinde Mart 2007-Mayıs 2009 tarihleri arasında, 135 farklı musluk, kuyu ve atık su kaynağından (şehir merkezi, Tarsus, Mezitli ve Karaduvar) 10 L hacimde olacak şekilde su örnekleri toplandı. Örnekler, por çapı 0.45 µm olan selüloz asetat membran filtresi bulunan vakum pompalı filtrasyon cihazında (Millipore) süzüldükten sonra filtre üzerinde kalan süzüntü yine aynı su örneğinin 20 ml si içerisinde yıkandı ve 2500 rpm de 10 dakika santrifüj edildi. Dipteki sedimentin 1.5 ml si ependorf tüpüne alındı ve buradan lam üzerine 100 µl konularak modifiye Kinyoun un aside dirençli (soğuk) boyama yöntemi (MKSA) ile boyandı. Bu amaçla lam üzerinde kurutulan 100 µl örnek saf meta- 95

Mersin linde Farkl Su Kaynaklar nda Cryptosporidium spp. Varl n n Araflt r lmas nolde bir dakika tesbit edildi. Kinyoun un karbol fuksin boyasıyla beş dakika boyandıktan sonra %50 etanolde 3-5 saniye tutuldu ve su ile yıkanıp %1 lik sülfürik asitle iki dakika muamele edildi. Tekrar su ile yıkanan preparat metilen mavisi ile bir dakika boyandı; su ile yıkanıp, kuruması beklendikten sonra x100 objektifte incelendi 7. PCR-RFLP Filtre üzerindeki kalan süzüntüden fenol-kloroform yöntemiyle DNA ekstraksiyonu yapıldı 10. Daha sonra Cryptosporidium a özgül primerler kullanılarak PCR ile amplifikasyon uygulandı. PCR karışımı 50 µl olacak şekilde; steril distile su, PCR reaksiyon tamponu (10 mm Tris-HCI, ph 8.3, 50 mm KCI) (promega), 4.5 mm MgCl 2 (Promega), 200 mm her bir dntp (Promega), 25 pm her bir primer [F: 5 GCC TTG AAT ACT CCA GCA TG 3 (MOLBIOL, 50 pm/µl); R: 5 GCA GGT TAA GGT CTC GTT CG 3 (MOLBIOL, 50 pm/µl)], Taq DNA polimeraz (2.5 U/ml) (Promega) ve ekstrakte edilen 5 µl örnek DNA sı konularak hazırlandı 11. Amplifikasyonda kullanılan PCR programı; başlangıç denatürasyonu 94 C de beş dakika, 40 döngü olacak şekilde denatürasyon 94 C de bir dakika, primer bağlanması 62 C de bir dakika zincir uzaması 72 C de bir dakika ve son uzatma 72 C de beş dakika olacak şekilde uygulandı. PCR ürünleri etidyum bromür içeren %1.5 lik agaroz jelde elektroforez yapıldıktan sonra ultraviyole transilüminatöre yerleştirilerek (312 nm) görüntülendi 12. PCR ürünleri 552 baz çifti (bp) uzunluğunda olan örnekler Cryptosporidium DNA sı pozitif olarak kabul edilerek, tür düzeyinde tanımlama amacıyla MaeI ve VspI restriksiyon endonükleaz enzimleriyle kesildi 12 (Resim 1). Marker 1 2 Marker 552 bp 299 bp 252 bp 372 bp 104 bp 600 500 400 300 200 100 73 bp Resim 1. C.parvum saptanan bir örneğin MaeI ve VspI enzimleriyle kesimleri [Marker: Ağırlık belirteci; Hat 1: MaeI kesim ürünleri (299, 252); Hat 2: VspI kesim ürünleri (372, 104, 73)]. 96

Aslan G, Bayram G, Ota F, Direkel fi, Taylan Özkan A, Çeber K, Emekdafl G. İstatistiksel Analiz Verilerin istatistiksel analizinde SPSS 11.5 ve MedCalc versiyon 10.3.0 programları kullanıldı. BULGULAR Çalışmada şehir merkezi, Tarsus, Mezitli ve Karaduvar bölgelerinden 70 musluk suyu, 50 kuyu suyu ve 15 atık su olmak üzere 135 su örneği toplanmıştır. Karaduvar daki bir kuyu suyu ve iki atık su örneği olmak üzere toplam üç su örneğinde (%2.2) MKSA boyama yöntemiyle Cryptosporidium ookistleri saptanmıştır. PCR-RFLP tekniği ile iki musluk suyu (Karaduvar), iki kuyu suyu (Karaduvar) ve üç atık su örneği (iki Karaduvar ve bir şehir merkezi) olmak üzere toplam 7 (%5.2) örnekte C.parvum tiplendirilmiştir (Tablo I). Mersin iline içme suyu sağlayan ve Tarsus ta bulunan Berdan içme suyu tesislerinden alınan örneklerin hiçbirinde Cryptosporidium ookistlerine rastlanmamıştır. Bölgemizdeki su kaynaklarında C.parvum prevalansı %5.2 (7/135) olarak tespit edilmiş, pozitif saptanan örneklerin büyük çoğunluğunun (6/7) Karaduvar ilçesinden alınan su kaynaklarına ait olduğu dikkati çekmiştir (Tablo I). Çalışmamızda her iki yöntemle birlikte saptanan pozitif sonuçlar dikkate alındığında; MKSA ve PCR-RFLP yöntemlerinin duyarlılığı sırasıyla %46 ve %100 olarak bulunmuştur. TARTIŞMA Özellikle gelişmekte olan ülkelerde Cryptosporidium enfeksiyonu prevalansının, gelişmiş ülkelere oranla çok daha yüksek olduğu ve bu durumun gelişmekte olan ülkelerde içme suyuna uygulanan temizlik ve dezenfeksiyon prosedürlerinin yetersizliğine bağlı olduğu ifade edilmektedir 3,13. Amerika Birleşik Devletleri (ABD) nde yapılan bir çalışmada, yılda yaklaşık 15 milyon kişinin gıda kaynaklı ishal yüzünden sağlık kuruluşlarına başvurduğu ve 30.000 kişinin Cryptosporidium enfeksiyonuna yakalandığı bildirilmiştir 14. Mac- Kenzie ve arkadaşları 15 ise, Milwaukee de şehir şebeke suyu ile bulaşan büyük bir kriptosporidiyoz salgını bildirmişlerdir. Norveç te yapılan bir çalışmada, 305 atık su örneği- Tablo I. Çeşitli Su Örneklerinde PCR-RFLP Tekniği ile Tiplendirilen C. parvum un Dağılımı Alınan örnek sayısı (Pozitif örnek sayısı) Bölge Musluk suyu Kuyu suyu Atık su Toplam Tarsus 20 (0) 10 (0) 2 (0) 32 (0) Karaduvar 20 (2) 20 (2 a ) 5 (2 b ) 45 (6) Şehir merkezi 10 (0) 10 (0) 5 (1) 25 (1) Mezitli 20 (0) 10 (0) 3 (0) 33 (0) Toplam 70 (2) 50 (2) 15 (3) 135 (7) a MKSA ile bir örnekte pozitiflik. b MKSA ile iki örnekte pozitiflik saptanmıştır. PCR: Polimeraz zincir reaksiyonu, RFLP: Restriction Fragment Length Polymorhism, MKSA: Modifiye Kinyoun un aside dirençli boyama yöntemi. 97

Mersin linde Farkl Su Kaynaklar nda Cryptosporidium spp. Varl n n Araflt r lmas nin 55 (%13.5) inde Cryptosporidium, 10 (%2.5) unda ise hem Cryptosporidium hem de Giardia varlığı tespit edilmiştir 16. Ono ve arkadaşları 17 Japonya da nehir suyu örneklerinde Cryptosporidium prevalansını %47; Rose ve arkadaşları 18 da ABD nin 17 farklı eyaletinde C.parvum prevalansını %51 olarak saptamışlardır. Lowery ve arkadaşları 12 Kuzey İrlanda da içme sularında Cryptosporidium prevalansını %1.9 olarak bildirmişler; Liu ve arkadaşları 19 ise 48 atık su örneğinde bu oranı %31.3 olarak vermiş ve dizi analiziyle suşları C.andesoni ve C.ubiquitum olarak tanımlamışlardır. Çalışmamızda Mersin ili su kaynaklarında Cryptosporidium varlığı MKSA ve PCR-RFLP yöntemleriyle araştırılmış; pozitiflik oranı %5.2 (7/135) olarak belirlenmiştir. MKSA boyama yöntemiyle Cryptosporidium ookistlerinin saptandığı üç örneğin hepsi PCR ile de pozitif sonuç vermiş, buna karşın PCR-RFLP ile C.parvum olarak tiplendirilen dört örnek MKSA ile negatif bulunmuştur. Bu durumun örneklerde ookist sayısının az olmasından kaynaklandığı düşünülmüştür. Araştırmamızda, PCR-RFLP yönteminin duyarlılığının MKSA yöntemine göre daha yüksek olduğu izlenmiş ve bu sonuç Sungur ve arkadaşlarının 8 sonuçlarıyla benzer bulunmuştur. Kriptosporidiyoz tanısında alternatif olarak kullanılan PCR temelli yöntemler, çok az sayıda ookisti saptayabilmesi nedeniyle boyama yöntemlerinden daha yüksek duyarlılığa sahiptir 8,9. Ayrıca bu yöntemler, kolay uygulanabilir olma ve çok sayıda örneğin aynı anda değerlendirilmesine olanak sağlama gibi avantajlara sahiptir. Dezavantajları arasında ise, ölü parazitlere ait nükleik asidin saptanması sonucu alınan yanlış pozitif; dışkı örneğindeki inhibitör maddelerin yoğunluğu ve uygulama sırasındaki kontaminasyonlar sonucu alınan yanlış negatif sonuçlar sayılabilir 9,20. Çalışmada Tarsus ve Mezitli den alınan tüm örnekler Cryptosporidium açısından negatif bulunmuş; ancak şehir merkezinden alınan bir atık su örneği ile Karaduvar dan alınan üç farklı su kaynağı örneğinde pozitiflik saptanmıştır. Buna göre Karaduvar bölgesindeki su kaynaklarının %13.3 (6/45) ünde Cryptosporidium kontaminasyonu gösterilmiştir. Bu sonuç, ilimizde Otağ ve arkadaşları 21 tarafından yapılan çalışmanın verileriyle birlikte değerlendirildiğinde oldukça anlamlıdır. Zira bu araştırıcılar, Mersin ilinde ilkokul öğrencilerinden alınan dışkı örneklerinde MKSA ve Auramin-O boyama yöntemleriyle Cryptosporidium ookistlerini araştırmışlar ve sadece Karaduvar da yaşayan çocuklarda pozitiflik (4/72; %5.5) saptamışlardır 21. Yine ilimizde Çeber ve arkadaşları 22 tarafından yapılan çalışmada, MKSA ve Auramin-O boyama yöntemleriyle içme sularının %11.4 (5/44) ünde, kuyu sularının %50 (1/2) sinde, atık suların %21 (4/19) inde ve deniz suyu örneklerinin %2.8 (1/35) inde olmak üzere incelenen 100 su örneğinin 11 (%11) inde Cryptosporidium ookistlerine rastlandığı bildirilmiştir. Bakır ve arkadaşlarının 23 Ankara nehrinde yaptıkları çalışmada, altı su örneğinin 1 (%16.6) i Cryptosporidium açısından pozitif bulunurken, İstanbul da yapılan bir çalışmada 24 çeşitli barajlardan toplanan 40 ham su örneğinin hiçbirisinde pozitiflik saptanmamıştır. Ülkemizde gastrointestinal yakınmaları ve/veya ishali olan olgular üzerinde yapılan çalışmalarda ise Cryptosporidium spp. pozitifliği %2.3-35.5 arasında bildirilmektedir 25-29. Cryptosporidium türlerinin dünyadaki dağılımı bölgeler arasında farklılık göstermektedir. Avrupa ülkelerinde C.parvum ve C.hominis; Orta Doğu ülkelerinde C.parvum türleri 98

Aslan G, Bayram G, Ota F, Direkel fi, Taylan Özkan A, Çeber K, Emekdafl G. yaygın olarak görülmekte, diğer bölgelerde ise C.hominis e bağlı enfeksiyonlara daha sık rastlanmaktadır 30,31. Moleküler epidemiyolojik çalışmalarda, Cryptosporidium spp. genotiplendirilmesi amacıyla PCR-RFLP yöntemi yaygın olarak kullanılmaktadır 17,19,30,31. Çalışmamızda da kullandığımız PCR-RFLP tekniğinin hızlı ve tür düzeyinde tiplendirmeyi mümkün kıldığı saptanmıştır. Bu nedenle epidemiyolojik çalışmalarda Cryptosporidium ookistlerinin tespitinde boyama tekniklerinin yanı sıra tiplendirmenin önemli olduğu durumlarda moleküler yöntemlerin kullanılabileceğini düşünmekteyiz. Sonuç olarak, Mersin ili su kaynaklarında Cryptosporidium spp. varlığının araştırılması amacıyla gerçekleştirilen bu çalışmada; çeşitli su kaynağı örneklerindeki toplam pozitiflik oranı %5.2 olarak saptanmış; tüm suşlar C.parvum olarak tanımlanmış ve özellikle Karaduvar bölgesindeki sularda parazit oranının yüksek (%13.3) olduğu gösterilmiştir. Bu durumun, Karaduvar bölgesindeki mevcut alt yapı ve su sisteminin yetersiz olması; kuyu sularının içme-kullanma suyu olarak kullanılması ve atık suların sulama amaçlı olarak kullanılmasından kaynaklandığı düşünülmüştür. İleride planlanacak moleküler epidemiyolojik çalışmalarla Cryptosporidium türlerinin genotiplendirilmesi ve filogenetik ilişkinin saptanması bulaş kaynaklarının belirlenmesinde yararlı olacaktır. KAYNAKLAR 1. Fahey T. Cryptosporidiosis. Primary Care Update for OB/GYNS 2003; 10(2): 75-80. 2. Fayer R. Cryptosporidium: a water-borne zoonotic parasite. Vet Parasitol 2004; 126(1-2): 37-56. 3. Hunter PR, Nichols G. Epidemiology and clinical features of Cryptosporidium infections in immunocomprimised patients. Clin Microbiol Rev 2002; 15(1): 145-54. 4. Brescia CC, Griffin SM, Ware MW. Cryptosporidium propidium monoazide-pcr, a molecular biology-based technique for genotyping of viable Cryptosporidium oocysts. Appl Environ Microbiol 2009; 75(21): 6856-63. 5. Moulin L, Richard F, Stefania S, et al. Contribution of treated wastewater to the microbiological quality of Seine River in Paris. Water Res 2010; 44(18): 5222-31. 6. Redder A, Dürr M, Daeschlein G, et al. Constructed wetlands-are they safe in reducing protozoan parasites? Int J Hyg Environ Health 2010; 213(1): 72-7. 7. Garcia LS (ed). Diagnostic Medical Parasitology, pp: 30-60. 2001, 4 th ed. ASM Press, Washington DC. 8. Sungur T, Kar S, Güven E, Aktaş M, Karaer Z, Vatansever Z. Detection of Cryptosporidium spp. in feces with nested PCR and carbol fuchsin staining method. Turkiye Parazitol Derg 2008; 32(4): 305-8. 9. Dirim Erdoğan D, Dağci H, Turgay N, Akarca US, Alkan MZ. The molecular diagnosis of cryptosporidiosis in fresh and formalin preserved fecal samples. Turkiye Parazitol Derg 2009; 33(2): 120-4. 10. Carraway M, Tzipori S, Widmer G. Identification of genetic heterogenity in the Cryptosporidium parvum ribosomal repeat. Appl Environ Microbiol 1996; 62(2): 712-6. 11. Robertson LJ, Campbell AT, Smith HV. Survival of Cryptosporidium parvum oocysts under various environmental pressures. Appl Environ Microbiol 1992; 58(11): 3494-500. 12. Lowery CJ, Moore JE, Millar BC, et al. Detection and speciation of Cryptosporidium spp. in environmental water samples by immunomagnetic separation, PCR and endonuclease restriction. J Med Microbiol 2000; 49(9): 779-85. 13. Fayer R, Lewis EJ, Trout JM, et al. Cryptosporidium parvum in oysters from Commercial harvesting sites in the Chesapeake Bay. Emerg Infect Dis 1999; 5(5): 706-10. 14. Mead PS, Slutsker L, Dietz V, et al. Food-related illness and death in the United States. Emerg Infect Dis 1999; 5(5): 607-25. 99

Mersin linde Farkl Su Kaynaklar nda Cryptosporidium spp. Varl n n Araflt r lmas 15. Mac Kenzie WR, Hoxie NJ, Proctor ME, et al. A massive outbreak in Milwaukee of Cryptosporidium infection transmitted through the public water supply. N Engl J Med 1994; 331(3): 161-7. 16. Robertson LJ, Gjerde B. Occurrence of Cryptosporidium oocysts and Giardia cysts in raw waters in Norway. Scand J Public Health 2001; 29(3): 200-7. 17. Ono K, Tsuji H, Rai SK, et al. Contamination of river water by Cryptosporidium parvum oocysts in western Japan. Appl Environ Microbiol 2001; 67(9): 3832-6. 18. Rose JB, Gerba CP, Jakubowski W. Survey of potable water supplies for Cryptosporidium and Giardia. Environ Sci Technol 1991; 25(8): 1393-400. 19. Liu A, Ji H, Wang E, et al. Molecular identification and distribution of Cryptosporidium and Giardia duodenalis in raw urban wastewater in Harbin, China. Parasitol Res 2011; 109(3): 913-8. 20. Doğan N, Sağlik I. Cyclospora cayetanensis and Cryptosporidium parvum coinfection in a pregnant woman with prolonged diarrhoea. Mikrobiyol Bul 2010; 44(1): 155-9. 21. Otağ F, Aslan G, Emekdaş G, Aydın E, Özkan AT, Çeber K. Mersin ilinde ilkokul öğrencilerinde Cryptosporidium spp. ookistlerinin araştırılması. Turkiye Parazitol Derg 2007; 31(1): 17-9. 22. Ceber K, Aslan G, Otağ F, et al. Investigation of Cryptosporidium spp. oocysts in tap water, well water, sewage water and sea water in Mersin, Turkey. Turkiye Parazitol Derg 2005; 29(4): 224-8. 23. Bakir B, Tanyuksel M, Saylam F. Investigation of waterborne parasites in drinking water sources of Ankara. J Microbiol 2003; 41(2): 148-51. 24. Köksal F. Kaynak sularının Cryptosporidium ve Giardia yönünden incelenmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2002; 32(3-4): 275-7. 25. Över U, Söyletir G. İshalle seyreden hastalıklarda kriptosporidyumun rolü. FLORA 1997; 2(2): 98-104. 26. Akyön Y, Ergüven S, Arikan S, Yurdakök K, Günalp A. Cryptosporidium parvum prevalence in a group of Turkish children. Turk J Pediatr 1999; 41(2):189-96. 27. Babür C, Kılıç S, Taylan Ozkan A, Esen B. Refik Saydam Hıfzıssıhha Merkezi Başkanlığı Parazitoloji Laboratuvarında 1995-2000 yıllarında saptanan bağırsak parazitlerinin değerlendirilmesi. Turkiye Parazitol Derg 2002; 26(3): 286-91. 28. Nihal Doğan N, Demirüstü C, Aybey A. The prevalence of intestinal parasites according to the distribution of the patients gender and parasite species for five years at the Osmangazi University Medical Faculty. Turkiye Parazitol Derg 2008; 32(2): 120-5. 29. Uyar Y, Taylan Ozkan A. Antigen detection methods in diagnosis of amebiasis, giardiasis and cryptosporidiosis. Turkiye Parazitol Derg 2009; 33(2): 140-50. 30. Xiao L. Molecular epidemiology of cryptosporidiosis: an update. Exp Parasitol 2010; 124(1): 80-9. 31. Feng Y, Li N, Duan L, Xiao L. Cryptosporidium genotype and subtype distribution in raw wastewater in Shanghai, China: evidence for possible unique Cryptosporidium hominis transmission. J Clin Microbiol 2009; 47(1): 153-7. 100