Kutanöz Leyşmanyazis Tanısında Direkt Mikroskopi, Kültür ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemlerinin Karşılaştırılması*



Benzer belgeler
Uzm. Dr. Serkan DEMİRKAN Şanlıurfa-Birecik Devlet Hastanesi

Diyarbakır Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Dokuz Yıllık Kutanöz Leyşmanyazis Olgularının Değerlendirilmesi*

Kutanöz Leyşmanyazis Tanısında Alternatif Bifazik Nutrient Besiyeri*

Suriye İç Savaşı Sonrası Nizip te Kutanöz Leyşmanyazis Olguları

Moleküler Yöntemlerin Klinik Mikrobiyolojide Kullanımı Ne zaman? Nerede? Ne kadar? Klinik Parazitoloji

Sıtma ve Ülkemizdeki Son Durumu Doç.Dr. Özlem MİMAN

Bir Pediatrik Kutanöz Leishmaniasis Olgusu

Manisa İli 3 Yerli Kutanöz Leishmaniasis Olgusu

Emrah Salman, Zeynep Ceren Karahan Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Leishmania nın Türkiye deki Epidemiyolojisi ve Tanısı

Kutanöz leishmaniasis ve Hatay İlindeki durumu

:Harran Üniversitesi Sağlık Hizmetleri MYO Şanlıurfa. Derece Alan Üniversite Yıl Sağlık Hizmetleri Meslek Ön lisans

Ülkemizin Endemik Olmayan Bir İlinde (Ankara) Saptanan Leishmania infantum a Bağlı Bir Kütanöz Leyşmanyazis Olgusu

TÜBERKÜLOZUN MOLEKÜLER TANISINDA GÜNCEL DURUM

Leishmaniasis. Türkiye deki Durum ve Tanı

VİRUS HASTALIKLARINDA TANI YÖNTEMLERİ

KLİNİK ÖRNEKLERDE GERÇEK ZAMANLI MULTİPLEKS POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU YÖNTEMİYLE AKUT BAKTERİYEL MENENJİT TANISI

Diyarbakır da Şark Çıbanı Epidemiyolojisi

VİRAL TANI KİTLERİ (GFJ-480)

ETKEN BELİRLEMEDE KLASİK YÖNTEMLER, MOLEKÜLER YÖNTEMLER. Doç. Dr. Gönül ŞENGÖZ 9 Mayıs 2014

Doğrudan klinik örnekte hızlı tanı. Prof. Dr. Cengiz ÇAVUŞOĞLU Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Bornova, İZMİR

Enterobacteriaceae Ġzolatlarında Karbapenemazların Saptanmasında Modifiye Hodge Testi ve Carba NP Testlerinin Karşılaştırılması

Enzimlerinin Saptanmasında

Asist. Dr. Ayşe N. Varışlı

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİ ENFEKSİYONLARI. Tanı ve Sorunlar. Süheyla SÜRÜCÜOĞLU. Celal Bayar Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD Manisa

SERVİKAL YETMEZİĞİNDE MCDONALDS VE MODDIFIYE ŞIRODKAR SERKLAJ YÖNTEMLERININ KARŞILAŞTIRILMASI

İlaç direnci saptanmasında yeni yöntemler. Prof. Dr. Cengiz ÇAVUŞOĞLU Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji AD, Bornova, İZMİR

Hatay da Yurt Dışı Kaynaklı Sıtma Olgularının Moleküler Yöntem Kullanarak Değerlendirilmesi

REVİZYON DURUMU. Revizyon Tarihi Açıklama Revizyon No

Human Papillomavirüs DNA Pozitif ve E6/E7 mrna Negatif, Anormal Sitolojili Servikal Örneklerin Genotiplendirilmesi

Ekinokokkozis. E. granulosus Kistik Ekinokokkozis. E. multilocularis Alveoler Ekinokokkozis. E. vogeli ve E. oligoarthrus Polikistik Ekinokokkozis

HPV Moleküler Tanısında Güncel Durum. DNA bazlı Testler KORAY ERGÜNAY 1.ULUSAL KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ

Entamoeba histolytica nın Tanısında Direkt Mikroskopi, Kültür, ELISA ve Moleküler Yöntemlerin Karşılaştırılması*

Aydın da İnsanlardan İzole Edilen Giardia intestinalis Suşlarının Genotiplendirilmesi*

Şanlıurfa da İlköğretim Okullarında Aktif Tarama Yöntemiyle Kütanöz Leyşmanyaz Araştırması*

Acinetobacter baumannii'de kolistin direncine yol açan klinik ve moleküler etkenler

GİRİŞ. Kan dolaşımı enfeksiyonları (KDE) önemli morbidite ve mortalite sebebi. ABD de yılda KDE, mortalite % 35-60

TÜBERKÜLOZ DIŞI MİKOBAKTERİLERİN TANIMLANMASINDA PCR-RFLP VE DNA SEKANS ANALİZİ SONUÇLARININ KARŞILAŞTIRILMASI

Global Leishmaniasis. Leishmaniasis. Türkiye de leishmaniasis. Leishmaniasis. Leishmaniasis

Halis Akalın, Nesrin Kebabcı, Bekir Çelebi, Selçuk Kılıç, Mustafa Vural, Ülkü Tırpan, Sibel Yorulmaz Göktaş, Melda Sınırtaş, Güher Göral

Prof. Dr. Ahmet Özbilgin Celal Bayar Üniversitesi Tıp Fakültesi Parazitoloji Anabilim Dalı,Manisa

Aydın İlinde Elde Edilen Blastocystis İzolatlarının Alt Tip Dağılımı ve Klinik Semptomların Değerlendirilmesi

HİPERVİRÜLAN ESCHERİCHİA COLİ ST131 KLONU ÜLKEMİZDE YENİ Mİ?

Yoğun Bakım Ünitesinde Gelişen Kandida Enfeksiyonları ve Mortaliteyi Etkileyen Risk Faktörleri

HIV: ALGORİTMALAR VE DİRENÇ: HIV Anti-Retro Viral Direnç: Ülkemizdeki Son Durum

Giriş Güncel cerrahide tanı ve tedavi planlamalarında ultrasonografinin önemli bir yeri bulunmaktadır. Ultrasonografinin cerrah tarafından gerçekleşti

Tüberkülozun Mikrobiyolojik Tanısı. Süheyla SÜRÜCÜOĞLU

Riskli Ünitelerde Yatan Hastalarda Karbapenemaz Üreten Enterobacteriaceae taranması

MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS İZOLATLARININ PRİMER ANTİTÜBERKÜLOZ İLAÇLARA DUYARLILIKLARININ ÇİKOLATALI AGARDA SAPTANMASI: BİR ÖN ÇALIŞMA

Denizli Merkez İlkokullarında Yıllarında Yapılan Tüberkülin Taramasının Sonuçları #

Mikrobiyolojide Moleküler Tanı Yöntemleri. Dr.Tuncer ÖZEKİNCİ Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji A.D

TOKSOPLAZMA İNFEKSİYONUNUN LABORATUVAR TANISI UZM.DR.CENGİZ UZUN ALMAN HASTANESİ

REKOMBİNANT DNA TEKNOLOJİSİ. Araş. Gör. Dr. Öğünç MERAL

Canlı Legionella pneumophila Tespiti ve MLST için Gerçek Zamanlı PCR ve HRM Analizi Tabanlı Yöntemlerin Geliştirilmesi

IV. KLİMUD Kongresi, Kasım 2017, Antalya

Akciğer Tüberkülozunda Balgam Numunelerinden Mycobacterium tuberculosis in Direkt Mikroskopi, Kültür ve PCR ile Saptanması #

Bir üniversite hastanesi parazitoloji laboratuvarında belirlenen intestinal ve hepatik parazitler

LENF NODU ve DİĞER DOKU BİYOPSİLERİNDE TÜBERKÜLOZ BASİLİ İZOLASYONU

Parazitolojide Laboratuvar. Editörler: Prof. Dr. Metin Korkmaz ve Prof. Dr. Ülgen Zeki Ok Dizgi ve Baskı: META Basım, Bornova, İzmir

Akreditasyon Sertifikası Eki (Sayfa 1/11) Akreditasyon Kapsamı

SAĞ VE SOL KOLON YERLEŞİMLİ TÜMÖRLER: AYNI ORGANDA FARKLI PATOLOJİK BULGULAR VE MİKROSATELLİT İNSTABİLİTE DURUMU

Kayseri ve Civarında Köpeklerde Leishmaniosisin Nested-PCR ile Araştırılması

Serum ALT Düzeyleri, HCV RNA Ve Anti-HCV Arasındaki İlişki #

Postmenopozal Kadınlarda Vücut Kitle İndeksinin Kemik Mineral Yoğunluğuna Etkisi

Yöntem ve Test Seçimine Yaklaşım. Dr. Alpay Özbek Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji AD. Dokuz Eylül Üni. Tıp Fak. İZMİR

İstanbul daki El Ayak Ağız Hastalığı Vakalarında Coxsackievirus A6 ve Coxsackievirus A16 nın Saptanması

TÜBİTAK BİDEB LİSE ÖĞRETMENLERİ FİZİK, KİMYA, BİYOLOJİ, MATEMATİK- PROJE DANIŞMANLIĞI EĞİTİMİ ÇALIŞTAYI LİSE3 (Çalıştay 2013) BİYOLOJİ GRUP TUHAF

Diyarbakır Dicle İlçesi Dedeköy ve Durabeyli de Kutanöz Leishmaniasis Olgularının İncelenmesi

Hidrazon Yapısındaki On Adet Bileşiğin Antileishmanial Aktivitesinin Araştırılması

Dr. Özlem Erdem Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Patoloji AD 22. ULUSAL PATOLOJİ KONGRESİ

ÖZGEÇMİŞ. Derece Alan Üniversite Yıl

Steril pyrüili böbrek nakli hastalarında gerçek zamanlı multipleks polimeraz zincir reaksiyon test sonuçları

TÜM MİDE BİYOPSİLERİNE RUTİN OLARAK GIEMSA VE ALCIAN BLUE UYGULAMALI MIYIZ?

ISSN : mkaplan101@yahoo.com Elazig-Turkey

Makrolid dirençli Staphylococcus aureus ile kolonize kistik fibrozis hastalarında MLS B direnç genlerinde yıllar içerisinde değişim var mı?

MİKOBAKTERİYEL DNA İZOLASYONUNDA ÜÇ FARKLI YÖNTEMİNİN KARŞILAŞTIRILMASI* COMPARISON OF THREE DIFFERENT MYCOBACTERIAL DNA ISOLATION METHODS

Fungal Etkenler. Toplantı sunumları Dr.AyşeKalkancı. Santral Sinir Sistemi Enfeksiyonlarında Tanı. Ege Mikrobiyoloji Günleri-3

İSTANBUL MEDENİYET ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ TIBBİ MİKROBİYOLOJİ ANABİLİM DALI MEZUNİYET SONRASI (UZMANLIK) EĞİTİMİ DERS MÜFREDATI

Toplum başlangıçlı Escherichia coli

Celal Bayar Üniversitesi Tıp Fakültesi. Temel Tıp Bilimleri Bölümü Parazitoloji Anabilim Dalı. Parazit Bankası. Proje Yöneticisi Ahmet ÖZBİLGİN

T.C. SÜLEYMAN DEMİREL ÜNİVERSİTESİ FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ ISPARTA İLİ KİRAZ İHRACATININ ANALİZİ

Cumhuriyet Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma ve Uygulama Hastanesinin Beş Yıllık ( ) Kansere Bağlı Ölüm Kayıtlarının Değerlendirilmesi

PREİMPLANTASYON GENETİK TANIDA KULLANILAN YÖNTEMLER ve ÖNEMİ

Afrika Seyahati Sonrası İmporte Bir Sıtma Olgusu. A Case Imported Malaria After a Travel to Africa


Çocuk ve Yetişkin Üriner Escherichia coli İzolatlarında Plazmidik Kinolon Direnç Genlerinin Araştırılması

Yoğun Bakımlarda İnfeksiyon Kontrolü: Haricen Klorheksidin Uygulanmalı mı?

SERVİKAL ÖRNEKLERDE HPV DNA ve SİTOLOJİK İNCELEME SONUÇLARININ DEĞERLENDİRİLMESİ

Serkan BAŞTEMİR*, Koray ÖNCEL**, Kor YERELİ**, Ali Ahmet KİLİMCİOĞLU**, Cüneyt BALCIOĞLU**, Nogay GİRGİNKARDEŞLER**

POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU (PZR-PCR) VE RESTRİKSİYON PARÇA UZUNLUĞU POLİMORFİZMİ (RFLP)

İNÖNÜ ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK HİZMETLERİ MESLEK YÜKSEKOKULU TIBBİ LABORATUVAR TEKNİKLERİ PROGRAMI II DERS İÇERİKLERİ:

ALT SOLUNUM YOLU ENFEKSİYONU OLAN ÇOCUKLARDA SOLUNUM SİNSİTYAL VİRUS VARLIĞININ ÜÇ FARKLI YÖNTEMLE ARAŞTIRILMASI

Tokat Halk Sağlığı Laboratuvarında Ocak 2007 Aralık 2009 Yılları Arasında Saptanan Bağırsak Parazitlerinin Dağılımı

İMMÜN SİSTEMİ BASKILANMIŞ BİR ÇOCUKTA MICROSPORIDIUM SPP. ENFEKSİYONUNUN POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU İLE TANIMLANMASI

ISSN : mkaplan101@yahoo.com Elazig-Turkey

Yeliz Çağan Appak¹, Hörü Gazi², Semin Ayhan³, Beyhan Cengiz Özyurt⁴, Semra Kurutepe², Erhun Kasırga ⁵

EK-4 ÖRNEK ÖZGEÇMİŞ. Derece Alan Üniversite Yıl. Biyoteknoloji (ing) Yeditepe Üniversitesi Biyoloji (ing) Abant İzzet Baysal Üniversitesi

KRONİK BÖBREK HASTALIĞI (YETMEZLİĞİ) OLAN TÜRK HASTALARINDA TÜMÖR NEKROZ FAKTÖR ALFA ve İNTERLÖKİN-6 PROMOTER POLİMORFİZMLERİNİN ETKİSİ

ÖZGEÇMİŞ. Cep Tel : : Marmara Bölgesi 31. Sok. No:6 / Lefkoşa KKTC : ayseseyer@hotmail.com ayseseyer@gau.edu.tr

Gıda Örneklerinde Genetiği Değiştirilmiş Organizma Analizleri. Bölüm 9. MON810 Mısır, Bt-176 Mısır ve Roundup Ready Soya nın PCR ile Nitel Saptanması

Transkript:

Özgün Çalışma/Original Article Mikrobiyol Bul 2015; 49(1): 77-84 Kutanöz Leyşmanyazis Tanısında Direkt Mikroskopi, Kültür ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemlerinin Karşılaştırılması* Comparison of Direct Microscopy, Culture and Polymerase Chain Reaction Methods for the Diagnosis of Cutaneous Leishmaniasis Hatice ERTABAKLAR 1, Serçin ÖZLEM ÇALIŞKAN 2, Erengül BODUÇ 1, Sema ERTUĞ 1 1 Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Parazitoloji Anabilim Dalı, Aydın. 1 Adnan Menderes University, Faculty of Medicine, Department of Parasitology, Aydin, Turkey. 2 Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Biyofizik Anabilim Dalı, Aydın. 2 Adnan Menderes University, Faculty of Medicine, Department of Biophysics, Aydin, Turkey. * Bu çalışmanın bir bölümü, 7. Ulusal Moleküler ve Tanısal Mikrobiyoloji Kongresi (5-8 Haziran 2012, Ankara) nde poster olarak sunulmuştur. Geliş Tarihi (Received): 25.08.2014 Kabul Ediliş Tarihi (Accepted): 22.10.2014 ÖZ Kutanöz leyşmanyazis (KL), ülkemizde başta Güneydoğu Anadolu Bölgesi olmak üzere endemik olarak görülmekte ve son yıllarda Ege Bölgesi de dahil olmak üzere pek çok bölgeye yayılım göstermektedir. KL nin tanısı, epidemiyolojik veriler, klinik belirtiler ve laboratuvar bulgularının birlikte değerlendirilmesine dayanmaktadır. Rutin tanıda en sık direkt mikroskopi ve kültür yöntemleri tercih edilmekte, moleküler yöntemler ise daha ziyade araştırma amaçlı olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada, KL şüpheli olgulardan alınan örneklerde Leishmania spp. varlığının, direkt mikroskopi, kültür ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemleri ile araştırılarak sonuçların karşılaştırması amaçlanmıştır. Çalışmaya, Adnan Menderes Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi Parazitoloji Laboratuvarına 2012-2014 yılları arasında başvuran 55 olgu dahil edilmiştir. Olguların deri lezyonlarından alınan örneklerden yayma hazırlanmış ve Giemsa ile boyanarak amastigot varlığı açısından direkt mikroskopik olarak incelenmiştir. Ayrıca alınan örnekler kültür için NNN besiyerine ekilmiş ve PCR için örneklerden DNA izolasyonu ticari bir kit (NucleoSpin Tissue Kit, Macherey-Nagel, Almanya) kullanılarak yapılmıştır. PCR yönteminde, Leishmania spp. kinetoplast DNA sının 116 baz çiftlik kısmını çoğaltan 13A ve 13B primerleri kullanılmıştır. Çalışmamızda, 55 örneğin 29 (%53) unda direkt incelemede amastigot varlığı görülmüş, 34 (%62) ünün kültüründe promastigot varlığı saptanmış ve 30 (%55) unda PCR ile parazite özgül bant İletişim (Correspondence): Prof. Dr. Hatice Ertabaklar, Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi, Parazitoloji Anabilim Dalı, 09010 Aydın, Türkiye. Tel (Phone): +90 505 605 5541, E-posta (E-mail): ertabaklarhatice@gmail.com

Kutanöz Leyşmanyazis Tanısında Direkt Mikroskopi, Kültür ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemlerinin Karşılaştırılması oluşumu gösterilmiştir. Olguların 24 ünde her üç yöntem ile de pozitif, 18 inde her üç yöntem ile de negatif sonuç alınmıştır. Yöntemlerden en az birinde pozitiflik saptanması dikkate alındığında 55 olgunun 37 (%67) si KL tanısı almıştır. Buna göre, KL tanısı alan olguların %78.4 (29/37) ünde direkt mikroskopi, %92 (34/37) sinde kültür ve %81.1 (30/37) inde PCR pozitifliği olduğu izlenmiş; KL tanısında kültür yönteminin en duyarlı yöntem olduğu saptanmıştır. Kültür yöntemi altın standart olarak kabul edildiğinde, direkt mikroskopinin duyarlılığı %76.4, özgüllüğü %86; PCR nin duyarlılığı %85.3, özgüllüğü ise %95 olarak hesaplanmıştır. Sonuç olarak, KL tanısında birden fazla yöntemin kullanılmasının duyarlılık ve özgüllüğü artıracağı ve daha çok sayıda olgunun tanımlanmasına olanak sağlayacağı düşünülmüştür. Anahtar sözcükler: Kutanöz leyşmanyazis; tanı; kültür; direkt mikroskopi; polimeraz zincir reaksiyonu. ABSTRACT Cutaneous leishmaniasis (CL) is an endemic disease especially in Southeastern Anatolia of Turkey and recently shows a trend for spread to other regions of the country including the Aegean region. The diagnosis of CL is based on combined evaluation of epidemiological data with the clinical symptoms and laboratory findings. Direct microscopic examination and culture methods are mainly used in the routine diagnosis of CL, while molecular methods are mainly used for research. The aim of this study was to detect the presence of Leishmania spp. in samples obtained from CL-suspected patients by using direct microscopy, culture and polymerase chain reaction (PCR) methods and to compare the results. A total of 55 patients who were admitted to Parasitology Laboratory of Adnan Menderes University Hospital, Aydin (located at Aegean region in Turkey), between 2012-2014 were included in the study. Smear preparations from the skin lesions of cases were fixed and stained with Giemsa, and the presence of amastigote forms were evaluated by direct microscopy. NNN medium was used for the cultivation of samples. Total genomic DNA of Leishmania from the samples were extracted with a commercial kit (NucleoSpin Tissue Kit, Macherey-Nagel, Germany) and PCR was performed by using 13A and 13B primers to amplify the 116 base pair fragment of Leishmania spp. specific kinetoplast DNA. Amastigotes were observed in 29 (53%) of the 55 samples by direct microscopy, promastigotes were detected among 34 (62%) samples in culture, and parasite-specific amplicons were revealed in 30 (55%) samples by PCR. All assays were positive in 24 patients while in 18 patients all of the tests yielded negative results. Thirty-seven (67%) out of 55 cases were diagnosed as CL when reactivity in at least one of these three methods were considered as positive. Accordingly the positivity rates of the methods were 78.4% (29/37) for direct microscopy, 92% (34/37) for culture and 81.1% (30/37) for PCR in CL-diagnosed patients, indicating culture as the most sensitive method. Regarding the culture method as gold standard, the sensitivity and specificity of direct microscopy were calculated as 76.4% and 86%, respectively, while PCR presented with 85.3% sensitivity and 95% specificity. In conclusion, it was thought that the usage of more than one method for CL diagnosis leads to increase the sensitivity and specificity which enables the diagnosis of a wide range of patients. Keywords: Cutaneous leishmaniasis; diagnosis; culture; direct microscopy; polymerase chain reaction. GİRİŞ Kutanöz leyşmanyazis (KL) Leishmania türlerinin etken olduğu, vektör kum sinekleri tarafından bulaştırılan tropikal ve subtropik ülkelerde sık görülen bir deri hastalığı olup, hastalık halk arasında şark çıbanı, halep çıbanı, sene yarası gibi isimlerle de anılmaktadır 1. Ülkemizde Güneydoğu Anadolu Bölgesinde endemik olarak görülmekte ve etkenin sıklıkla Leishmania tropica olduğu bilinmektedir. Son yıllarda Ege Bölgesi de dahil olmak 78

Ertabaklar H, Özlem Çalışkan S, Boduç E, Ertuğ S. üzere pek çok bölgeye yayılan hastalık, Aydın ilinde de varlığını sürdürmektedir. Aydın ili KL açından endemik bölge olup 1996-2004 yılları arasında 159 KL olgusu bildirilmiştir 2. KL nin tanısı, epidemiyolojik veriler, klinik belirtiler, olgunun hikayesi ve laboratuvar uygulamalarına dayanmaktadır. Ayırıcı tanıda hastalığın endemik olarak görüldüğü bölgeler de oldukça önemlidir ve endemik bölgede yaşamak veya endemik bölgeye seyahat öyküsü, KL için önemli bir epidemiyolojik tanı kriteridir. Klinik belirtiler, parazitin türü ve konak gibi çeşitli faktörlere göre değişebilmektedir 3. Lezyonlar tipik olarak ağrısız, ülsere, kabuğu zor kalkan lezyonlar şeklinde, genellikle vücudun açıkta kalan yerlerinde bir veya daha fazla sayıda saptanabilmektedir. Hastalık pek çok deri lezyonu ile (bakteriyel deri enfeksiyonları, deri tüberkülozu, malign deri tümörleri, böcek ısırmaları, yabancı cisim granülomları, derin mikotik enfeksiyonlar, miyazis, tropikal ülser, sarkoidoz, şarbon, sporotrikoz, keratoakantoma vb.) karışabilmekte olup tanı amacıyla çok değişik teknikler kullanılmaktadır 4. Doğru tanı, komplikasyonların azaltılması ve uygun tedavinin seçilmesi açısından önem taşımaktadır 5. Parazitolojik tanı, lezyonun sağlam deri ile birleşme kenarından örnek alınarak, boyanan preparatta parazitin gösterilmesi ile konmaktadır. Alınan örnek besiyerlerine ekilirse, parazitin izolasyonu ve tanımlanması mümkün olabilmektedir. Bunlara ek olarak son yıllarda PCR gibi moleküler yöntemler de KL de tanı amaçlı kullanılmaktadır 6. Bu çalışmada, Adnan Menderes Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi Parazitoloji Laboratuvarına 2012-2014 yılları arasında başvuran KL şüpheli olgulardan alınan örneklerde Leishmania spp. varlığı, direkt mikroskopi, kültür ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemleri ile araştırılarak, sonuçların karşılaştırmalı olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. GEREÇ ve YÖNTEM Çalışmaya, Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi Parazitoloji Laboratuvarına başvuran KL şüpheli 55 olgu dahil edildi. Tanı için alınan altı adet yayma örneğinin üçü Giemsa ile boyandı; diğerleri PCR testi uygulanıncaya kadar boyanmadan -20 o C de saklandı. Örnekler, lezyon ve çevresi %70 lik alkol ile iyice temizlenip, insülin enjektörü ile 0.2 ml serum fizyolojik, sağlam deri ile lezyonun sınırındaki lezyon yatağına enjekte edilip geri çekilerek alındı. Alınan örnekler lama yayıldıktan sonra, Giemsa ile boyanarak amastigot varlığı mikroskobik olarak araştırıldı. Amastigot görülen preparatlar pozitif, görülemeyenler ise negatif olarak değerlendirildi. Ayrıca alınan örnekler NNN besiyerine ekildi ve Leishmania promastigotları saptanan kültürler pozitif, saptanamayanlar negatif olarak değerlendirildi. Saklanan yayma örneklerinden DNA izolasyonu, NucleoSpin Tissue (Macherey- Nagel GmbH & Co, Almanya) kiti kullanılarak üretici firmanın önerilerine göre yapıldı. İzole edilen DNA lar kullanılıncaya kadar -20 o C de saklandı. Leishmania kinetoplast DNA sının 116 baz çift (bç) lik kısmını çoğaltan 13A: 5 -dgtgggggaggggcgttct-3 ve 13B: 5 dattttacaccaacccccagtt-3 primerleri kullanılarak PCR uygulandı. PCR karışımı; 1-2 μl kalıp DNA, 0.4 pmol her bir primer, 0.5 U Taq DNA polimeraz, 0.2 mm 79

Kutanöz Leyşmanyazis Tanısında Direkt Mikroskopi, Kültür ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemlerinin Karşılaştırılması her bir dntp, 3 μl 10x Taq polimeraz tamponu KCl, 2.5 mm MgCl 2 şeklinde hazırlandı ve distile su ile 30 μl ye tamamlandı. PCR amplifikasyonu için TC-312 modeli ısı döngü cihazı kullanıldı ve amplifikasyon 94 o C de 10 dakika ön denatürasyon sonrası 30 döngü (94 o C de 60 sn, 60 o C de 60 sn ve 70 o C de 60 sn) ve 72 o C de 7 dakika son uzama olarak gerçekleştirildi. 8-10 μl PCR ürünü %2 agaroz jelde Tris Borik asit-edta (TBE) tamponunda yürütüldükten sonra agaroz jel görüntüleme sistemi (Infinity ST5, Vilber Lourmat, Fransa) ile görüntülendi. BULGULAR Çalışmamızda değerlendirilen 55 olguya ait örneğin 29 (%53) unda Giemsa boyama ile direkt incelemede amastigot varlığı saptanmış, 34 (%62) ünde kültürde promastigot varlığı mikroskobik olarak gözlenmiş ve 30 (%55) unda PCR ile parazite özgül bant oluşumu gösterilmiştir (Tablo I, Resim 1). Her üç yöntem de olguların 24 ünde pozitif, 18 inde negatif sonuç vermiştir (Tablo I). Yöntemlerden en az birinde pozitiflik saptanması dikkate alındığında 55 olgunun 37 (%67) si KL tanısı almıştır. Buna göre, KL tanısı alan olguların %78.4 (29/37) ünde direkt mikroskobik inceleme ile, %92 (34/37) sinde kültür ile, %81.1 (30/37) inde ise PCR ile pozitiflik saptanmıştır (Tablo II). Kültür altın standart olarak alındığında, direkt mikroskopinin duyarlılığı %76.4, özgüllüğü %86; PCR nin duyarlılığı %85.3, özgüllüğü ise %95 olarak hesaplanmıştır. PCR yöntemi altın standart olarak kabul edildiğinde, kültürün duyarlılığı %97, özgüllüğü %80, direkt mikroskopinin duyarlılığı %83, özgüllüğü %84 olarak bulunmuştur. Direkt mikroskopi referans olarak kabul edildiğinde ise, kültürün duyarlılığı %90, özgüllüğü %70; PCR ın duyarlılığı %86, özgüllüğü %81 olarak hesaplanmıştır. TARTIŞMA KL ülkemizde bildirimi zorunlu bir hastalık olup, Sağlık Bakanlığı verilerine göre 1990-2010 yılları arasında toplam 46.003 yeni olgu saptanmış, bu olguların çoğunluğunun Güneydoğu Anadolu Bölgesi nde yoğunlaştığı bildirilmiştir 7. Aydın ilinde ise 1996 yılından 2010 yılına kadar 436 olgunun rapor edildiği izlenmektedir 2,8. Ege Bölgesi nde ve Tablo I. Leishmania Tanısında Kullanılan Yöntemlerin Karşılaştırmalı Sonuçları (n= 55) Direkt mikroskopi Kültür PCR Olgu sayısı + + + 24 - - - 18 - + + 5 - + - 3 + - - 2 + + - 2 + - + 1 29* 34* 30* 37* * Pozitif olgu sayısı. 80

Ertabaklar H, Özlem Çalışkan S, Boduç E, Ertuğ S. Resim 1. PCR yöntemi ile bazı olgulara ait Leishmania kinetoplast DNA sının gen bölgesine özgü primerler ile amplifiye edilen 116 bç PCR ürünleri (M: Belirteç; P: Pozitif kontrol örneği; N: Negatif kontrol örneği; Hat 1-17: Olgulara ait Leishmania pozitif ve negatif örnekler). Tablo II. KL Tanısı Konulan Olgularda Yöntemlerin Karşılaştırmalı Sonuçları (n= 37) Kültür Kültür Pozitif Negatif Toplam Pozitif Negatif Toplam Direkt Pozitif 26 3 29 PCR Pozitif 29 1 30 mikroskopi Negatif 8-8 Negatif 5 2 7 Toplam 34 3 37 Toplam 34 3 37 Aydın ilinde farklı Leishmania türlerinin varlığı bilinmektedir. Deri lezyonları, etken olan Leishmania türüne göre değişiklikler göstermektedir. Leishmania nın değişik türleri farklı klinik tablolara yol açabilmekte ve tanıda güçlük yaratabilmektedir. KL tanısında en sık kullanılan yöntem, lezyondan hazırlanan ve Giemsa ile boyanan yaymada amastigot formunun görülmesidir 9,10. Ancak direkt mikroskopi (DM), kültür ve histopatolojik inceleme gibi klasik laboratuvar tanı yöntemlerinin seçiciliği yüksek olmasına karşın duyarlılığı düşük ve değişken olabilmektedir 11,12. Son yıllarda KL tanısında, ribozomal, miniexon veya mini/maxicircle kdna gibi korunmuş veya değişken bölgelere ait sık tekrar eden değişik bölgeleri hedefleyen moleküler yöntemler kullanılmaktadır 12-16. Moleküler bazlı yöntemlerin en önemli avantajının, 81

Kutanöz Leyşmanyazis Tanısında Direkt Mikroskopi, Kültür ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemlerinin Karşılaştırılması deri biyopsisi, kan, kemik iliği aspiratı, Giemsa boyalı preparatlar ve parafinize materyal gibi değişik klinik örneklerde bulunan az sayıdaki Leishmania DNA sını saptayabilmesi olduğu bildirilmektedir. Doğru tanının, uygun tedavi seçiminde ve prognozun değerlendirilmesinde büyük önem taşıdığı bilinmektedir 17,18. Mohaghegh ve arkadaşları 19, 2012 yılında yaptıkları çalışmada, deri lezyonu bulunan ancak yayma preparatı negatif 81 KL şüpheli olgunun 9 (%11.1) unda PCR yöntemi ile pozitiflik saptadıklarını rapor etmişlerdir. Omidian ve arkadaşlarının 20 yaptığı çalışmada ise, yayma örneği negatif olan KL şüpheli 30 olgunun 5 (%16.4) inde PCR yöntemi ile pozitiflik saptanmıştır. Çeliksöz ve arkadaşları 21, KL li olguların %52 (11/21) sinde DM ile amastigot saptadıklarını ve %71 (15/21) inde kültür yöntemi ile promastigotları tespit ettiklerini bildirmişlerdir. Çalışmamızda ise KL li 55 olgunun 29 (%53) unda direkt mikroskobik inceleme ile amastigotlar görülmüş ve 34 (%62) ünde ise NNN besiyerindeki kültürde promastigotlar üretilmiştir. Rodriguez ve arkadaşlarının 22 233 olguda DM, kültür ve PCR yöntemlerini karşılaştırdıkları çalışmada, sırasıyla %63, %43 ve %97 oranında pozitiflik bulunmuş; Çulha ve arkadaşlarının 23 25 olguda yaptıkları çalışmada ise, DM, kültür ve PCR pozitifliği sırasıyla %44, %68 ve %100 olarak bildirilmiştir. Bizim çalışmamızda pozitiflik oranları DM, kültür ve PCR ile sırasıyla %53, %62 ve %55 olarak belirlenmiştir. Lemrani ve arkadaşları 16, 26 olgudan alınan biyopsi örneğinde PCR nin duyarlılığını %84.6, DM ve kültürün duyarlılığını %69.2 olarak saptamışlardır. Bensoussan ve arkadaşlarının 17 çalışmasında, 92 yayma örneğinde PCR nin duyarlılığı %98.7, DM ve kültürün duyarlılığı %83.3 olarak bildirilmiştir. Boggild ve arkadaşları 24 da duyarlılık oranlarını; PCR için %96.6, kültür için %84.7 ve DM için %66.1 olarak vermişlerdir. Bizim çalışmamızda ise DM, kültür ve PCR yöntemlerinin duyarlılıkları sırasıyla %78.4, %92 ve %81.1 olarak bulunmuştur. Diğer çalışmalara bakıldığında kültür yönteminin PCR yönteminden sonra ikinci duyarlı yöntem olduğu görülmekteyken, bizim çalışmamızda bu üç yöntem karşılaştırıldığında kültür yönteminin KL tanısında daha duyarlı bir yöntem olduğu saptanmıştır. Bunun sebebinin, örnek alımının uygun olması, örneklerin ekimi sırasında sterilizasyon koşullarına dikkat edilmesi, ekilen örneklerin düzenli kontrolleri ve kullanılan besiyerinin düzenli olarak yenilenmesi olduğu düşünülmüştür. KL tanısında kullanılan DM ve kültür yöntemleri için, alınan örneğin morfolojik olarak bozulmamış ve yüksek sayıda canlı parazit içermesi gereklidir. Ancak hastalığın kronik fazında canlı parazit sayısı ve morfolojik olarak sağlam parazit sayısı düşüktür. Bu nedenle, KL tanısında direkt mikroskobik inceleme, kültür ve PCR yöntemlerinin birlikte uygulanmasının, duyarlılık ve özgüllüğü artıracağı, dolayısıyla tanıda birden fazla yöntemin kullanılmasının daha çok sayıda olgunun tanımlanmasına olanak sağlayacağı düşünülmüştür. 82

Ertabaklar H, Özlem Çalışkan S, Boduç E, Ertuğ S. KAYNAKLAR 1. Özbel Y, Özensoy Töz S, Leishmaniosis, s: 199-241. Özcel MA, Özbel Y, Ak M (ed), Özcel in Tıbbi Parazit Hastalıkları. 2007, Türkiye Parazitoloji Derneği Yayını No: 22. Meta Basım Bornova, İzmir. 2. Ertabaklar H, Öncü S, Ertuğ S. A new focus for cutaneous leishmaniasis in the West Coast of Turkey. Trop Doct 2005; 35(3): 189. 3. Goto H, Lindosa JA. Current diagnosis and treatment of cutaneous and mucocutaneous Leishmaniasis. Expert Rev Anti Infect Ther 2010; 8(4): 419-43. 4. Vega-Lopez F. Diagnosis of cutaneous leishmaniasis. Curr Opin Infect Dis 2003; 16(2): 97-101. 5. Alvar J, Croft S, Olliaro P. Chemotherapy in the treatment and control of leishmaniasis. Adv Parasitol 2006; 61: 223-74. 6. Desjeux P. Leishmaniasis: current situation and new perspectives. Comp Immunol Microbiol Infect Dis 2004; 27(5): 305-18. 7. Gürel MS, Yeşilova Y, Ölgen MK, Özbel Y. Türkiye de kutanöz leishmaniasisin durumu. Turkiye Parazitol Derg 2012; 36(2): 121-9. 8. Ertuğ S, Aydın N, Gültekin B, Doyuran SE. Aydın ilindeki deri leishmaniasisi olgularının retrospektif incelenmesi. Turkiye Parazitol Derg 2002; 26(2): 140-2. 9. Turhanoğlu M, Erdal SA, Bayındır FB. Diyarbakır Eğitim ve Araştırma Hastanesinde dokuz yıllık kutanöz leyşmanyazis olgularının değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2014; 48(2): 335-40. 10. Salman İS, Vural A, Ünver A, Saçar S. Suriye iç savaşı sonrası Nizip te kutanöz leyşmanyazis olguları. Mikrobiyol Bul 2014; 48(1): 106-13. 11. Luz ZM, Silva AR, Silva Fde O, Caligiorne RB, Oliveira E, Rabello A. Lesion aspirate culture for the diagnosis and isolation of Leishmania spp. from patients with cutaneous leishmaniasis. Mem Inst Oswaldo Cruz 2009; 104(1): 62-6. 12. de Oliveira CI, Bafica A, Oliveira F, et al. Clinical utility of polymerase chain reaction based detection of Leishmania in the diagnosis of American cutaneous leishmaniasis. Clin Infect Dis 2003; 37(11): 149-53. 13. Özensoy Töz S, Özbel Y, Atay MG ve ark. İnsan ve köpeklerden alınan klinik örneklere leishmaniasis tanısı için PZR uygulanması. Turkiye Parazitol Derg 2002; 26(3): 239-44. 14. Ergin M, Erdogan S, Gumurdulu D, Tuncer I. Cutaneous leishmaniasis: evaluation by polymerase chain reaction in the Cukurova region of Turkey. J Parasitol 2005; 91(5): 1208-11. 15. Reithinger R, Dujardin JC. Molecular diagnosis of leishmaniasis: current status and future applications. J Clin Microbiol 2007; 45(1): 21-5. 16. Lemrani M, Hamdi S, Laamrani A, Hassar M. PCR detection of Leishmania in skin biopsies. J Infect Developing Countries 2009; 3(2): 115-22. 17. Bensoussan E, Nasereddin A, Jonas F, Schnur LF, Jaffe CL. Comparison of PCR assays for diagnosis of cutaneous leishmaniasis. J Clin Microbiol 2006; 44(4): 1435-9. 18. Blum J, Desjeux P, Schwartz E, Beck B, Hatz C. Treatment of cutaneous leishmaniasis among travelers. J Antimicrob Chemother 2004; 53(2): 158-66. 19. Mohaghegh M, Fata A, Salehi G, et al. Molecular identification of leishmania species using samples obtained from negative stained smears. Iran J Parasitol 2013; 8(2): 337-41. 20. Omidian M, Khosravi AD, Nazari M, Rashidi A. The comparison of histopathological findings and polymerase chain reaction in lesions with primary clinical diagnosis of cutaneous leishmaniasis with negative smear. Pak J Med Sci 2008; 24(1): 96-9. 21. Çeliksöz A, Saygı G, Özçelik S. Comparison of direct and culture methods in the diagnosis of cutaneous leishmaniasis and the investigation of the effects of both trimethoprim-sulfamethoxazole and ofloxacin on promastigotes. First World Congress on Leishmaniasis. 5-9 May 1997, Istanbul. Abstracts, 21(S1): 110. 83

Kutanöz Leyşmanyazis Tanısında Direkt Mikroskopi, Kültür ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemlerinin Karşılaştırılması 22. Rodriguez N, Guzman B, Rodas A, Takiff H, Bloom B, Convit J. Diagnosis of cutaneous leishmaniasis and species discrimination of parasites by PCR and hybridization. J Clin Microbiol 1994; 32(9): 2246-52. 23. Culha G, Uzun S, Ozcan K, Memisoglu HR, Chang KP. Comparison of conventional and polymerase chain reaction diagnostic techniques for leishmaniasis in the endemic region of Adana, Turkey. Int J Dermatol 2006; 45(5): 569-72. 24. Boggild AK, Miranda-Verastegui C, Espinosa D, et al. Optimization of microculture and evaluation of miniculture for the isolation of Leishmania parasites from cutaneous lesions in Peru. Am J Trop Med Hyg 2008; 79(6): 847-52. 84