2-Aminoasitlerin Yapısı ve Kimyasal Özellikleri,Aminoasitlerin Metabolizması,

DERS ADI TIBBİ BİYOKİMYA Yarıyıl Teori/Ders Anlatımı Uygulama Eğitim Öğretim Yöntemleri Lab. Proje/Alan Çalışması Seminerler/ Çalışma Grupları BÖLÜMÜ TEMEL BİLİMLER Diğer* Toplam Kredi Krediler 2 222-111 - 27 180 540 15 18 Ders Sorumluları Ders Dili Zorunlu/ Seçmeli Ön Koşul Dersin Tanımı Prof.Dr. LEVENT KARACA, Prof.Dr. KONÇUY MERGEN, Prof.Dr. SELDA DEMİRTAŞ TÜRKÇE ZORUNLU YOK TIBBİ BİYOKİMYA AKTS Kredisi Dersin Amacı İnsan vücudunu oluşturan temel elementlerle makromoleküllerin yapısı, çeşitleri, sentez ve yıkım yolları, her bir makromolekülün oxidasyonu sırasında biribiri ile olan ilişkileri, makromoleküllerin en küçük yapı ünitelerinden depo formlarının oluşum yolları ve metabolizma ile ilişkileri. Eser elementler ve vitaminlerin metabolik yollardaki fonksiyonları.insan hücresinde gerçekleşen biyokimsal olaylar.insan hücre zarı sitozolü ve nükleusunda gerçekleşen biyokimyasal olaylar.hücre kompartmanlarının ve organellerinin bu olaylardaki yeri. Proteinlerin yapısı fonksiyonları, hücre içi ve hücre dışında bulunan proteinlerin yapı fonksiyon ve çeşitlilikleri. Kan proteinlerin yapısı, çeşitleri ve fonksiyonları, hastalıklar ve organ fonksiyonları ile olan ilişkisi.proteinleri oluşturan aminoasitlerin yapısı çeşitleri metabolik yolları, amino gruplarının girdiği yollar.karbon iskeletinden enerji üretim yolları.azotlu atık ürünlerinin sentezi metabolik ve atılım yolları. Böbrek fonksiyon testleri.vücuttaki su ve elektrolit metabolizması idrar oluşumu.böbreklerin ekskresyonu, asit- baz dengesi, elektrolit metabolizmasıyla olan ilişkisi.enzimlerin özellikleri,kinetiği,izoenzimler ve bulunduğu dokular.izoenzim ve organ fonksiyonları ilişkisi.izoenzimlerin hastalıkların tanılarında kullanılması durumu.vitaminlerin çeşitleri,insan organizmasında girdikleri yollar, fonksiyonları ve yetmezlikleri ile ilgili hastalıkların tanısında kullanılan testler.insan organizmasında enerjinin özelliği, korunması ve şekil değiştirmesi.atp oluşum mekanizması,solunum zincirinin tanımı,fonksiyonu ve bileşenleri, elektron nakli ve solunum zincirinin düzenlenmesi. Karbonhidrat metabolizması, sindirimi, emilimi ve enerji kaynağı olarak kullanılmaları.polisakkaritlerin çeşitleri ve vücuttaki fonksiyonları.vücutta glukozun enerji üretmek üzere kullanılması ve diğer kaynaklardan glukoz oluşturması ile ilgili yollar, bu yolları düzenleyen hormonlar, glukoz metabolizmasının hormonal kontrolü, bununla ilgili hastalıklar, glukoz intleransı ve bunun ölçüm metodları.lipidlerin sentezi çeşitleri ve fonksiyonları.lipidlerin depo formları organizmada yapı taşı olarak görevleri enerji kaynağı yolları,yağ asitleri yıkımından elde edilen enerji ve bununla ilişkili metabolik yollar, kanda lipidlerin taşınma şekilleri,lipoprotein trafiği, metabolizması ve bunlarla ilgili bozuklukların yol açtığı hastalıklar.basit ve bileşik lipidler ve bunların vücuttaki fonksiyonları.ateroskleroz oluşum mekanizması, lipid metabolizması ile ateroskleroz ilişkisi, MI(Myokard İnfaktüsü), metabolik sendrom ve koroner arter hastalığının biyokimyasal temeli ve tanı kriterleri. Hedeflenen Kazanımlar 1- Canlılığın Biyokimyasal Temeli Organik Yapılar,Hücre ve Hücre Membran Yapısı,,Hücre membranında oluşan biyokimyasal olaylar 2-Aminoasitlerin Yapısı ve Kimyasal Özellikleri,Aminoasitlerin Metabolizması,

Transaminasyonu,,Aminoasitlerin Karbon İskeletlerinin Yıkımı ve Metabolik Defektler 3- Aminoasitlerin Sentezi,,Aminoasitlerin Spesifik Ürünlere Çevrilmesi 4-Proteinlerin Yapısı ve Kimyasal Özellikleri,Kollagen, Keratin ve Hemoglobin 5-Plazma Proteinleri,,Akut Faz Reaktanları ve Immunglobulinler,Protein Elektroforezi 6-Üre Siklusu,Enzimlere giriş,enzim Yapısı7-Enzimlerin Özellikleri,Enzim Kinetiği,Enzim 4 İnhibisyonu 8-Allosterizim,Enzimlerin Klinik Biyokimya daki Yeri,Vitaminlere Giriş 9-A-D Vitaminleri,Diğer Yağda Çözünen Vitaminler 10-B Kompleks Vitanimnleri,C- Vitaminleri,Vitamin Benzeri Moleküller 11-Biyoenerjetik ve Metabolizma,Fosforile bileşikler ve ATP oluşum mekanizması Solunum Zincirinde Görev Alan Redoks Sistemleri Biyolojik Oksidasyon Reaksiyonları 12-Solunum Zinciri Elektron Nakli, Solunum Zincirinin Düzenlenmesi ve Zincirin İnhibitörleri,Vücudun Su ve Elektrolit Kapsamı,İdrar Oluşumunun Biyokimyasal Temeli 13-Su ve Elektrolit Dengesi,Asit-Baz Dengesi 14-Asit- Baz Denge Bozukluğu,KarbohidratlarınYapısı,Özellikleri Monosakkaritlere Ait Reaksiyonlar, Disakkaridler, Homopolisakkaridler 15-Karbohidratların Sindirimi ve Emilimi,Glikoliz Reaksiyonları ve Düzenlenmesi Glikoneogenez, glikoliz ve Glukoneogenezde Müşterek ve Farklı Reaksiyonlar 16- Glukoneogenezde Kullanılan Maddeler ve Reaksiyonlarının Düzenlenmesi Glikojen Sentezi, Yıkılımı ve Yıkılımın Düzenlenmesi,Sitrik Asit Siklusu Reaksiyonları ve Ara Maddelerinin Başka Metabolik Yollarda Kullanılması, Kazanılan Enerji ve Reaksiyonların Düzenlenmesi 17-Glukoz Toleransı ve Tolerans Testleri Üronik Asit Yolu ve Diğer Hekzosların Metabolizması,Lipidlerin Biyolojik Fonksiyonları ve Sınıflandırılması 18-Trigliseritler ve Gliserofosfatidler,Sfingolipidler Kolesterol Yapısı,Kolesterol ve Safra Asitlerinin Sentezi,,, 19-Lipoproteinlerin Yapısı ve Oluşumu Apolipoproteinler, Lipoprotein Trafiği Yağ Asidi oksidasyonu ve sentezi,yağ Dokusu Metabolizması,Lipidlerin Emilimi ve Sindirimi 20-Keton Cisimlerinin Oluşumu ve Yıkılımı Doymamış Yağ Asitlerinin Metabolizması Triaçilgliserol ve Fosfolipid Metabolizması,Triaçilgliserol ve Fosfolipid Metabolizması 21-Lipoprotein Metabolizması, Lipid Metabolizması Bozuklukları ve Ateroskleroz Nükleik asit metabolizması,sindirimi ve emilimi,pürin Metabolizması Dersin Gidişatı Hafta KONULAR

1 Canlılığın Biyokimyasal Temeli Organik Yapılar Hücre ve Hücre Membran Yapısı Hücre membranında oluşan biyokimyasal olaylar 2 Aminoasitlerin Yapısı ve Kimyasal Özellikleri Aminoasitlerin Metabolizması, Transaminasyonu Aminoasitlerin Karbon İskeletlerinin Yıkımı ve Metabolik Defektler 3 Lab 1: BİYOKİMYA VE KLİNİK BİYOKİMYA LABORATUVARLARININ TANITIMI Aminoasitlerin Sentezi Aminoasitlerin Spesifik Ürünlere Çevrilmesi 4 Proteinlerin Yapısı ve Kimyasal Özellikleri Kollagen, Keratin ve Hemoglobin 5 Plazma Proteinleri Lab 2:Laboratuvar Malzeme Tanıtımı Güvenliği ve Kullanımı Akut Faz Reaktanları ve Immunglobulinler Protein Elektroforezi Üre Siklusu Lab 4: Enzim Kinetiği (Kanda Alkalen fosfataz Analizi) 6 Enzimlere giriş Enzim Yapısı 7 Enzimlerin Özellikleri Lab 5: İzoenzimler (ALP, CK- MB) Enzim Kinetiği Enzim İnhibisyonu 8 Allosterizim I. ARA SINAV Enzimlerin Klinik Biyokimya daki Yeri Vitaminlere Giriş 9 A-D Vitaminleri Lab 6: Kanda ve idrarda Protein Tayini Diğer Yağda Çözünen Vitaminler 10 B Kompleks Vitanimnleri Lab 7: İmmunolojik Metodlar (CRP, HBV b-hcg, ASO) C- Vitaminleri Vitamin Benzeri Moleküller 11 Biyoenerjetik ve Metabolizma Lab.8: İdrarda aminoasit tarama testleri

Fosforile bileşikler ve ATP oluşum mekanizması Solunum Zincirinde Görev Alan Redoks Sistemleri Biyolojik Oksidasyon Reaksiyonları Solunum Zinciri Elektron Nakli, Solunum Zincirinin Düzenlenmesi ve Zincirin İnhibitörleri Lab 9: Aminoasit kromatografisi 12 Vücudun Su ve Elektrolit Kapsamı İdrar Oluşumunun Biyokimyasal Temeli 13 14 Su ve Elektrolit Dengesi Lab 10: Karaciğer fonksiyon testleri (örnek: AST) Asit-Baz Dengesi Lab 11: Böbrek fonksiyon testleri-1 (kanda Üre analizi) Asit- Baz Denge Bozukluğu KarbohidratlarınYapısı,Özellikleri Monosakkaritlere Ait Reaksiyonlar, Disakkaridler, Homopolisakkaridler 15 Karbohidratların Sindirimi ve Emilimi Glikoliz Reaksiyonları ve Düzenlenmesi Glikoneogenez, glikoliz ve Glukoneogenezde Müşterek ve Farklı Reaksiyonlar 16 Glukoneogenezde Kullanılan Maddeler ve Reaksiyonlarının Düzenlenmesi Lab 12: Böbrek fonksiyon testleri Glikojen Sentezi, Yıkılımı ve Yıkılımın Düzenlenmesi Sitrik Asit Siklusu Reaksiyonları ve Ara Maddelerinin Başka Metabolik Yollarda Kullanılması, Kazanılan Enerji ve Reaksiyonların Düzenlenmesi 17 Glukoz Toleransı ve Tolerans Testleri II. ARA SINAV Üronik Asit Yolu ve Diğer Hekzosların Metabolizması Lipidlerin Biyolojik Fonksiyonları ve Sınıflandırılması 18 Trigliseritler ve Gliserofosfatidler Sfingolipidler Lab 13: İdrarın Fiziksel,Kimyasal ve Mikroskobik İncelenmesi (1) Kolesterol Yapısı,Kolesterol ve Safra Asitlerinin Sentezi 19 Lipoproteinlerin Yapısı ve Oluşumu Apolipoproteinler, Lipoprotein Trafiği Lab 14: İdrarın Fiziksel,Kimyasal ve Mikroskobik İncelenmesi (2) Yağ Asidi oksidasyonu ve sentezi Yağ Dokusu Metabolizması Lipidlerin Emilimi ve Sindirimi 20 Keton Cisimlerinin Oluşumu ve Yıkılımı Doymamış Yağ Asitlerinin Metabolizması Lab 14: İdrarın Fiziksel,Kimyasal ve Mikroskobik İncelenmesi (2)

Triaçilgliserol ve Fosfolipid Metabolizması Triaçilgliserol ve Fosfolipid Metabolizması 21 Lipoprotein Metabolizması, Lipid Metabolizması Bozuklukları ve Ateroskleroz Lab 15: Kanda total kolesterol ve HDL-Kolesterol analizi Nükleik asit metabolizması,sindirimi ve emilimi Pürin Metabolizması Değerlendirme Ölçütleri Varsa () olarak işaretleyiniz Yüzde (%) Ara Sınavlar %40 Kısa Sınavlar %40 Ödevler Uygulamalar Laboratuar Projeler/ Alan Çalışması Seminerler/ Çalışma Grupları Dönem Sonu Sınavı %60 Diğer (Katılım, kütüphane çalışması, vb.) Dersin Kitabı ve/veya Kaynaklar *Ödevler, alan gezileri, kütüphane araştırması, internet uygulamaları, ders dışı okuma vb. DERS ADI TIBBİ BİYOKİMYA Yarıyıl Teori/Ders Anlatımı Uygulama Eğitim Öğretim Yöntemleri Lab. Proje/Alan Çalışması Seminerler/ Çalışma Grupları BÖLÜMÜ TEMEL BİLİMLER Diğer* Toplam Kredi Krediler AKTS Kredisi Ders Sorumluları Ders Dili Zorunlu/ Seçmeli Ön Koşul Dersin Tanımı Dersin Amacı Prof.Dr. LEVENT KARACA, Prof.Dr. KONÇUY MERGEN, Prof.Dr. SELDA DEMİRTAŞ TÜRKÇE ZORUNLU YOK TIBBİ BİYOKİMYA Hemoglobinin yapısı, fonksiyonu ve çeşitleri.hemoglobin yapı bozukluğu ile ilgili hastalıklar.bilirubin metabolizması,.kan ve idrar ile ilgili organlardaki metabolik yollar.bilirubin çeşitleri ve bunlarla ilgili hastalık durumları.bu hastalıkların tanısında kullanılan laboratuvar testleri.kalsiyum fosfor metabolizması ve kanda düzenlenmelerinini sağlayan hormonlar. Vücutta kalsiyum ve fosfor homeostazısını bozan hastalıklar.eser elementlerin çeşitleri, sindirim ve atılım yollarının incelenmesi Eser elementlerin kan ve organlardaki düzeyinin korunması.bunlarla ilgili aksaklıklardan oluşan hastalıklar.

İnsanda hücre içine sinyallerin iletimi ve bununla ilgili moleküller.hormonların çeşitleri ve fonksiyonları.hormonların salınımlarının düzenleyicileri ve bu mekanizmalardaki bozuklukların yol açtığı hastalıklar.beslenme biyokimyası.bazal metabolizma, Açlıkta Toklukta Diyabet hastalığında metabolizma.obezite biyokimyası. Extraselüler matrix bileşenleri.hücre dışı proteinler ile hücre içi ve hücreler arası iletişim yolları. Epitelyum dokusu bileşenleri.bağ ve destek dokusu bileşenleri.kemik, kas ve sinir dokusu biyokimyası ve kas kasılmasının biyokimyasal temeli.duyu sistemi ve örnek olarak; görme biyokimyası. Metabolik integrasyon. Nükleik asit metabolizması, purin ve purimidin bazlarının oluşumu, fonksiyonları ve yıkımları. Metabolizmaları ile ilgili hastalıklar ve farmakolojide bunlarla ilgili kimyasalların kullanımı, DNA ve RNA nın sentezi,foksiyonları, protein sentezi moleküler biyoloji ile ilgili tanı testleri. 1-Pürin Metabolizma Bozuklukları,Pürin Metabolizmasın,Pirimidin Metabolizma Bozuklukları 2-Pirimidin Metabolizması,DNA nın yapısı ve özellikleri,dna nın replikasyonu 3-RNA nın yapısı, çeşitleri ve fonksiyonları,dna nın transkripsionu,protein Biyosentezi Pofirnler ve Porfirin Sentezi 4-Porfirialar,Hemoglobin Yapısı ve Fonksiyonları 5-Hemoglobinopatilerin Kimyasal Temeli,Bilirubin Yapısı,Bilirubinopatiler 6-Kalsiyum-Fosfor-Mg Metabolizması, Eser Elementler Çinko, Bakır ve Demir Metabolizması 7-Biyosinyal İletimi ve Sinyal transduksiyonu Hormonların Özellikleri, Hormon Reseptörleri ve Etki Mekanizmaları Hipotalamus ve Ön Hipofiz Hormonları, Hipofiz Arka Lob Hormonları Hedeflenen Kazanımlar 8-Tiroit Hormonları,Pankreas Hormonları,Adrenal Medulla Hormonları, 9-Glukokortikoidler, Mineralokortikoidler,Gonad Hormonları : Erkek ve Dişi Seks Hormonları Gastrointestinal Hormonlar, ve Doku Hormonları 10-Bazal Metabolizma, Beslenme, Besin Maddeleri,Yetersiz Beslenme,Açlık ve Obesite Heteropolisakkaritler,Serbest Radikaller ve Antioksidan sistem 11-Ekstraselüler Matriks,Doku Biyokimyası(Epitel Dokusu, Bağ ve Destek Dokuları), 12-Doku Biyokimyası(Kemik Dokusu, Sinir Dokusu, ve Kas Dokusu),Kas Kasılması Duyu Sistemi (Örnek: Görme Biyokimyası), 13-Metabolik İntegrasyon Dersin Gidişatı Hafta 1 Pürin Metabolizma Bozuklukları Lab 16: Eritrositte Glikolizin takibi (1) Pürin Metabolizmasın Pirimidin Metabolizma Bozuklukları KONULAR 2 Pirimidin Metabolizması Lab 17: Eritrositte Glikoliz takibi (2) DNA nın yapısı ve özellikleri DNA nın replikasyonu 3 RNA nın yapısı, çeşitleri ve fonksiyonları Lab 18: Kanda Ürik asid analizi DNA nın transkripsionu

Protein Biyosentezi Pofirnler ve Porfirin Sentezi 4 III. ARA SINAV Porfirialar Hemoglobin Yapısı ve Fonksiyonları 5 Hemoglobinopatilerin Kimyasal Temeli Lab 19: Hemoglobin Tayini Bilirubin Yapısı Bilirubinopatiler 6 Kalsiyum-Fosfor-Mg Metabolizması Lab 20- Kanda keton cisimcikleri analizi (beta hidroksi bütirat) Kalsiyum-Fosfor-Mg Metabolizması Eser Elementler Çinko, Bakır ve Demir Metabolizması 7 Biyosinyal İletimi ve Sinyal transduksiyonu Lab 21: Kanda ve idrarda Glukoz Tayini Hormonların Özellikleri, Hormon Reseptörleri ve Etki Mekanizmaları Hipotalamus ve Ön Hipofiz Hormonları, Hipofiz Arka Lob Hormonları 8 Tiroit Hormonları Lab 22: Kanda total ve direk bilirubin analizi Pankreas Hormonları Adrenal Medulla Hormonları, 9 10 Glukokortikoidler, Mineralokortikoidler Lab 23: Kanda Kalsiyum/ Fosfor Analizi Gonad Hormonları : Erkek ve Dişi Seks Hormonları Gastrointestinal Hormonlar, ve Doku Hormonları Bazal Metabolizma, Beslenme, Besin Maddeleri,Yetersiz Beslenme,Açlık ve Obesite Lab 24: Kanda Amilaz Düzeyi Heteropolisakkaritler Serbest Radikaller ve Antioksidan sistem 11 Ekstraselüler Matriks Biyokimyasal Olgu Saati Doku Biyokimyası(Epitel Dokusu, Bağ ve Destek Dokuları) 12 Doku Biyokimyası(Kemik Dokusu, Sinir Dokusu, ve Kas Dokusu) IV. ARA SINAV Kas Kasılması Duyu Sistemi (Örnek: Görme Biyokimyası) Metabolik İntegrasyon 13

Metabolik İntegrasyon Obesite Biyokimyasal Olgu Saati 14 Biyokimyasal Olgu Saati Genel Tekrar Genel Tekrar Genel Tekrar 15 Genel Tekrar Genel Tekrar Pratik Genel Tekrar Pratik Değerlendirme Ölçütleri Dersin Kitabı ve/veya Kaynaklar Varsa () olarak işaretleyiniz Yüzde (%) Ara Sınavlar %40 Kısa Sınavlar %40 Ödevler Uygulamalar Laboratuar Projeler/ Alan Çalışması Seminerler/ Çalışma Grupları Dönem Sonu Sınavı %60 Diğer (Katılım, kütüphane çalışması, vb.) *Ödevler, alan gezileri, kütüphane araştırması, internet uygulamaları, ders dışı okuma vb. Semester Theory/ Lectures Practical Activity TEaching and Learning Methods Lab. Work Projects/ Field Work Seminar/ workshops DEPARTMENT OF BIOCHEMISTRY Credits Others* Total Credits ECTS Credits 2 222-111 - 27 180 540 15 18 Teaching Staff Ders Dili Compulsory or Elective Prerequisites Description Objectives Learning Outcomes Prof.Dr. LEVENT KARACA, Prof.Dr. KONÇUY MERGEN, Prof.Dr. SELDA DEMİRTAŞ turkish compulsory none MEDICAL BIOCHEMISTRY Basic elements and structure of macromolecules,sentesis and metabolism functions.biochemistric events on human cell,cell compartmans and organels.structure and functions of proteins. Metabolism of Aminoasids.Kidney functions,urine disease,electrolits.functions of enziymes,vitamins.glucose metabolism.sentesis of lipids and functions of lipids.basics of aterosklerotic heart disease. 1-Structure of cell and biochemistric events on cell membrane 2-Structure and metabolism of aminoasids 3-Sentesis of aminoasids 4-Structure of proteins,kollagen,hamoglobine.. 5-Immunglobins and protein electroforesis 6-üre scyclus,enziymes 7-Lipids,sentesis,metabolism and disease. 8-Gluconeogenesis,glicolisys and reactions 9-Structure of lipoproteins,keton body

Course Outline Week 10-Nucleic asids and metabolism Assessment 01 Structure of cell and biochemistric events on cell membrane 02 Structure and metabolism of aminoasids 03 Sentesis of aminoasids 04 Structure of proteins 05 Immunglobins and protein electroforesis 06 Structure of enziyms 07 İzoenziymes(ALP,CK-MB) 08 1.Examination 09 Serum total proteine and urine proteine 10 İmmunologic metods 11 Aminoasids test in urine 12 Cromatografy of aminoasids 13 Liver function tests 14 Kidney function tests Mark () if present Percentage (%) Mid-Terms %40 Quizes %40 Homeworks/ Term papers Applications Lab Works Projects/ Field Work Seminars/Workshops Finals %60 Others (Attendance, library works, vb.) References