Terapötik Hedef Validasyonu:

Benzer belgeler
RNAi Teknolojisinin Deneysel Aşamaları ve Tedavideki Geleceği

1. Giriş - Mesane kanseri - Tanı ve evrelendirme - Mesane kanseri ve iyon kanalları 3. Gereç ve yöntem 4. Bulgular 5. Tartışma

Ders 10 - Diğer küçük kodlamayan RNA lar

Hücre. 1 µm = 0,001 mm (1000 µm = 1 mm)!

SANKO ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI DERS KURULU 103: HÜCRE VE DOKU SİSTEMLERİ GELİŞİMİ

SANKO ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI DERS KURULU 103: HÜCRE VE DOKU SİSTEMLERİ GELİŞİMİ

Yeni Nesil Genomik Sistemler. ve Uygulamaları

HÜCRE SĠNYAL OLAYLARI PROF. DR. FATMA SAVRAN OĞUZ

Moleküler biyolojiye giriş. Doç.Dr.Pınar AKSOY SAĞIRLI

Türk Farmakoloji Derneği Prof. Dr. Alaeddin Akcasu Farmakoloji Eğitiminde Kuşaklararası Bilimsel Etkileşme Seminerleri Programı

SANKO ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI DERS KURULU 103: HÜCRE VE DOKU SİSTEMLERİ GELİŞİMİ

b. Amaç: Hücre zarının yapı ve fonksiyonları ile ilgili genel bilgi öğretilmesi amaçlanmıştır.

İlaçta Ar Ge Kamu Üniversite Sanayi İşbirliğinin Önemi. Prof. Dr. Sedef Kır Hacettepe Üniversitesi Eczacılık Fakültesi

Biyoteknoloji ve Genetik I Hafta 13. Ökaryotlarda Gen İfadesinin Düzenlenmesi

GENETĐK EPĐGENETĐK. Doç. Dr. Hilâl Özdağ EPĐGENETĐK

PODOSİT HÜCRE MODELİNDE PROTEİNÜRİDE, SLİT DİYAFRAM PROTEİNLERİ GENLERİNİN EKSPRESYONU VE FARMAKOLOJİK MODÜLASYONU

Non-coding RNA Molekülleri

MEME KANSERİ KÖK HÜCRELERİNİN GEN EKSPRESYON PROFİLİ

HANDAN TUNCEL. İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Biyofizik Anabilim Dalı

Hücre Proliferasyonu ve Testleri

Hücreler arası Bağlantılar ve Sıkı bağlantı. İlhan Onaran

Chapter 10. Summary (Turkish)-Özet

TAURİNİN İSKEMİ REPERFÜZYON HASARINDA MMP-2, MMP-9 VE İLİŞKİLİ SİNYAL İLETİ YOLAĞI ÜZERİNE ETKİLERİ

İstanbul Yeni Yüzyıl Üniversitesi Tıp Fakültesi Prof. Dr. Demir Budak Dekan

ÇOK HÜCRELİ ORGANİZMALARIN GELİŞİMİ

Model Organizmalar. Yusuf DOĞAN

PROKARYOTLARDA GEN EKSPRESYONU. ve REGÜLASYONU. (Genlerin Gen Ürünlerine Dönüşümünü Kontrol Eden Süreçler)

YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #18

Beyin Yaşlanması ve Yeni Hücre Oluşumu

KOLOREKTAL KANSERLERİN MOLEKÜLER SINIFLAMASI. Doç.Dr.Aytekin AKYOL Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı 23 Mart 2014

CANLILIK NEDİR? Fizyolojide Temel Kavramlar

İLAÇ, KOZMETİK ÜRÜNLER İLE TIBBİ CİHAZLARDA RUHSATLANDIRMA İŞLEMLERİ ECZ HAFTA

Kalp Fonksiyonları KALP FİZYOLOJİSİ. Kalp Fonksiyonları. Kalbin Lokalizasyonu ve Ölçüleri. Kalbin Lokalizasyonu ve Ölçüleri. Dolaşım Sistemleri

Doksorubisin uygulanan PARP-1 geni silinmiş farelerde FOXO transkripsiyon faktörlerinin ekspresyonları spermatogenez sürecinde değişiklik gösterir

1. Sınıf Güz Dönemi I. Hafta Pazartesi Salı Çarşamba Perşembe Cuma Ders Saati

ÇANAKKALE ONSEKİZ MART ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ Eğitim Yılı

DERS BİLGİLERİ. Ders Kodu Dönem T+U Saat Kredi AKTS. V. Ders Kurulu TIP Kurul Dersleri Teorik Pratik Toplam.

Alzheimer Hastalığı Tedavisinde Preklinik

SANKO ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI DERS KURULU 102: HÜCRE VE DOKU SİSTEMLERİ

İnsan vücudunda üç tip kas vardır: İskelet kası Kalp Kası Düz Kas

SANKO ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI DERS KURULU 102: HÜCRE VE DOKU SİSTEMLERİ

SANKO ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI DERS KURULU 102: HÜCRE VE DOKU SİSTEMLERİ

MESANE TÜMÖRLERİNİN DOĞAL SEYRİ

I. DÖNEM - 2. DERS KURULU ( )

MEME KARSİNOMLARINDA GATA 3 EKSPRESYONU VE KLİNİKOPATOLOJİK PARAMETRELER İLE İLİŞKİSİ

FİZYOLOJİ Yrd.Doç.Dr. Önder AYTEKİN

Kişisel Bilgiler. Eğitim

TIP 103 HÜCRE DERS KURULU 3.KURUL 1. HAFTA. 13 Şubat 2019 Çarşamba

Wnt/β-katenin Yolağı

TÜMÖR ANJiYOGENEZİ TUMOR ANGIOGENESIS. Reha Aydın. İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi

YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #13

Yard. Doç. Dr. Ercan ARICAN. İ.Ü. FEN FAKÜLTESİ, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü

2017 / 2018 EĞİTİM ÖĞRETİM YILI

Polikistik Böbrek Hastalığında Yeni Tedavi Yaklaşımları

MOTOR PROTEİNLER. Doç. Dr. Çiğdem KEKİK ÇINAR

Pluripotent Kök Hücreler

DÖNEM I DERS KURULU 3 GENOM VE KALITIM

SİNİR SİSTEMİ Sinir sistemi vücutta, kas kontraksiyonlarını, hızlı değişen viseral olayları ve bazı endokrin bezlerin sekresyon hızlarını kontrol eder

Hücrelerde Sinyal İletimi ve İletişim

b. Amaç: Gen anatomisi ile ilgili genel bilgi öğretilmesi amaçlanmıştır.

SANKO ÜNİVERSİTESİ TIP FAKÜLTESİ EĞİTİM-ÖĞRETİM YILI DERS KURULU 102: HÜCRE VE DOKU SİSTEMLERİ

BÖLÜM I HÜCRE FİZYOLOJİSİ...

Gen İfadesi Belirleme Çalışmaları. Doç. Dr. Feray KÖÇKAR, Balıkesir Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü

Hücre Transfeksiyonu

Bakteriyofaj ve Mikro-RNA Kullanımı

Kök Hücre ve Doku Mühendisliği

AVRASYA ÜNİVERSİTESİ

15- RADYASYONUN NÜKLEİK ASİTLER VE PROTEİNLERE ETKİLERİ

KALITSAL MADDE PROF. DR. SERKAN YILMAZ

Yeni Nesil Optik ve Elektronik Malzemeler: Tasarım Sentez ve Uygulamalar

Transgenik Hayvan Üretimi. Hayvancılıkta biyoteknoloji dersi

İ. Ü İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı Prof. Dr. Filiz Aydın

Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü Haziran 2013

POYRAZ TIBBİ CİHAZLAR EDVOTEK

ECZACILIK FAKÜLTESİ BİYOKİMYA

Fizik Antropoloji Anabilim Dalına ait dersler, Antropoloji Lisans Programı dahilinde verilmektedir. Fizik Antropolojiye Giriş.

YAŞLANMA /YAŞLANMA ÇEŞİTLERİ VE TEORİLERİ BEYZA KESKINKARDEŞLER

2)Subatomik parçacıklardan oluşan radyasyon. α, β ışınları

ÖĞLE ARASI ÖĞLE ARASI

KANSER TANIMA VE KORUNMA

ÖZGEÇMİŞ. 1. Adı Soyadı : Arzu Keskin Aktan 2. Doğum Tarihi : 29/04/ Unvanı : Doktor Öğretim Üyesi 4. Öğrenim Durumu : Doktora

LİPOPROTEİNLER. Lipoproteinler; Lipidler plazmanın sulu yapısından dolayı sınırlı. stabilize edilmeleri gerekir. kanda lipidleri taşıyan özel

Mustafa EMREM

İstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji ABD Prof. Dr. Filiz Aydın

Genetik Kavramlar Sekizinci baskıdan çeviri Klug, Cummings, Spencer

Kök Hücre ve Farklılaşma

DÖNEM 2- I. DERS KURULU AMAÇ VE HEDEFLERİ

Doç.Dr.Tuba Dal Yıldırım Beyazit Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara

YGS YE HAZIRLIK DENEMESi #21

Eczacılık Tarihi (1 0 2)

FİZYOLOJİ LABORATUVAR BİLGİSİ VEYSEL TAHİROĞLU

Teori (saat/hafta) Laboratuar (saat/hafta) BES BAHAR

KARDİYOVASKÜLER HASTALIKLARIN EPİDEMİYOLOJİSİ VE TÜTÜN KULLANIMI: MEKANİZMA. Mini Ders 2 Modül: Tütünün Kalp ve Damar Hastalıkları Üzerindeki Etkisi

ARI ÜRÜNLERİNİN SAĞLIK ÜZERİNE ETKİLERİ

2013- Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD Doçent Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD Yardımcı Doçent

Hücre Nükleusu, Nükleus Membranı, Nükleus Porları. Doç. Dr. Ahmet Özaydın

Nitrik Oksit ve Solunum Sistemi Doç. Dr. Bülent GÜMÜŞEL Hacettepe Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Farmakoloji Anabilim Dalı

T.C. EGE ÜNİVERSİTESİ SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ TRPC GEN AİLESİNİN YAŞA BAĞLI AYRIMSAL EKSPRESYONU VE DEĞİŞEN VASKÜLER REAKTİVİTE PROFİLLERİ

Hücre reseptörleri. Doç. Dr. Çiğdem KEKİK ÇINAR

12. SINIF KONU ANLATIMI 7 GENETİK MÜHENDİSLİĞİ VE BİYOTEKNOLOJİ ÇALIŞMA ALANLARI

Transkript:

Terapötik Hedef Validasyonu: Sinekten insana Metiner Tosun EÜ Eczacılık Fakültesi Farmakoloji AD

Ca +2 : Yaşam ve ölüm sinyali Nature, 1998 2

Temel olaylar Küresel Ca 2+ dalgaları Hücre içi Küresel Ca 2+ dalgaları Hücrelerarası Membran uyarılması Mitokondri metabolizması Vezikül sekresyonu Düz kas gevşemesi Mitoz bölünme Sinaptik plastisite Fertilizasyon Düz kas kasılması İskelet kasının kasılması Kalp kasının kasılması Karaciğer metabolizması Gen transkripsiyonu Hücre çoğalması Yara iyileşmesi Silya hareketi Glial hücre fonksiyonu Safra akımı İnsülin sekresyonu Endotelde NO sentezi Nature, 1998 3

Model organizmalar 1 Virüsler Bakteriler ( E. coli) 4

Model organizmalar 2 Yuvarlak kurt (C. elegans): Maya (S. cerevisiae) 5

Model organizmalar 3 Meyve sineği (Drosophila melanogaster) Zebra balığı (Denio reriro) 6

Model organizmalar 4 Bitki (Arabidopsis thaliana) Fare (Mus musculus) + kültür hücreleri 7

Transient Receptor Potential, (trp) Kronoloji Abnormal electroretinogram from a Drosophila mutant. Nature 224, 1969. Induction of photoreceptor voltage noise in the dark in Drosophila mutant. Nature 258, 1975. (Kendiliğinden oluşan trp mutant sinek) Molecular characterization of the Drosophila trp locus: a putative integral membrane protein required for phototransduction. Neuron 2, 1989. 8

Lantan Drosophila mutant trp fotoreseptörü taklit etmektedir. Sens Neural Behav Physiol 166, 1989. (TRP nin görmedeki işlevinin anlaşılması) 9

trp kronolojisi: devam The trp gene is essential for a light-activated Ca 2+ channel in Drosophila photoreceptors. Neuron 8: 1992. trp, a novel mammalian gene family essential for agonist-activated capacitative Ca 2+ entry. Cell. 85, 1996 The genome sequence of Drosophila Science 287, 2000. 10

Drosophila TRP ve insan TRPC1 kanal proteinlerinin yapısal ve topolojik özellikleri. Curr Opin Neurobiol, 1996. 11

THE RUNNERS UP Science 298, 2002 12

7 TRP ailesi Montell, STKE, 2005 13

TRP proteinlerinin filogenetik ağacı. Nilius, Pflügers Arch Europ J Physiol, 2005. 14

TRP lerin çeşitli türlerdeki fizyolojik işlevleri Sinek: görme. Minke, Biophys Struct Mech, 1977; Montell et al., Science, 1985. Nematod: zararlı kimyasalları algılama. de Bono et al., Nature, 2002. Maya: hipertonisite algılama. Denis & Cyert, J Cell Biol, 2002. Fare: feromon algılama. Stowers et al., Science, 2002. İnsan: ayrımsal tat ve sıcaklık algılama. Zhang et al., Cell, 2003. 15

TRP-aracılı fizyolojik mekanizmalar ve olası patolojik durumlar Sinyal iletimi Damar düz kas tonus ve mikrovasküler permeabilite Damar endoteli ve düz kas fonksiyonları Fertilizasyon Böbrek, mesane ve ince bağırsak fonksiyonları Nöronal gelişim ve plastisite Hipoksik hücre ölümü Kanser Enflamasyon 16

TRP ekspresyonu ile ilişkili hastalıklar 1 Impaired endothelium-dependent vascular relaxation in TRPC4-KO mice, Freichel et al., Nat Cell Biol, 2001 Inflammation of airways: possible role in asthma TRPP-PKD2; Autosomal dominant polycystic kidney disease, Cai et al., J Biol Chem, 1999. TRPM8; upregulated in several types of cancer, breast, colon, prostate, lung, skin, Peier et al., Cell, 2002; Mckemy et al., Nature, 2002; Tsaveler et al., Cancer Res, 2001. 17

TRP ekspresyonu ile ilişkili hastalıklar 2 Vascular injury enhances plasticity in TRPC expression, Berghdahl et al., Am J Physiol Cell Physiol, 2005. TRPC channel overexpression & increased PASMC proliferation and pulmonary vascular medial hypertrophy in IPAH patients, Yu et al., PNAS, 2004, Landsberg & Yuan, News Physiol Sci, 2004, Zhang et al., Am J Physiol Cell Physiol, 2004. Neuronal degeneration & TRP channel, Geng, Biochim Biophy Acta, 2004. Alzheimer s-disease-linked prenisilin2 variants influences TRPC6-enhanced Ca2+ entry into HEK293 cells, Lessard, Cellul Signal, 2005. 18

Sıçanda hedef keşfi: Depo-kontrollü kalsiyum girişinin işlevsel varlığı 19

İzole damarda [Ca2+]i ve kasılma yanıtlarının eşzamanlı izlenmesi PSS in out Force Transducer PC Detector UV Excitation 340/380 nm 20

R340/380 Canlı damar dokusunda membran depolarizasyonuna bağlı eşzamanlı [Ca 2+ ] i ve kasılma yanıtları (Tosun, JPET, 1998) 1,05 Ca 2+ 1,00 33.2 mm KCl 10 M Verapamil Kontraksiyon 10 mn 10 min 21

Force (mn) R340/380 [Ca 2+ ]i değişimlerinden bağımsız vazokonstriksiyon (Tosun, JPET, 1998) 1,15 Wash Ca 2+ 1,10 1,05 1,00 Ca 2+ - bağımsız yanıt -9 3x 5x 7x -8 3x -7 3x -6 log [U46619] 20 Kontraksiyon 10 0 0 1 Time (h) 2 3 22

R340/380 Ca 2+ ve kasılma kenetinin ayrıştığı durumlar (Tosun JPET, 1998) ER stresi 1.15 Sadece [Ca 2+ ] i Sadece kontraksiyon 1.10 Ca 2+ 1.05 1.00 10 M CPA 1 10 M Verapamil 0.1 0.3 1 mm Ni 2+ 0.01 0.1 1 M U4 1 M NE Kontraksiyon 10 mn 30 min 23

Ca 2+ indikatörü yüklü VSM hücreiçi Ca 2+ depoları Golovina& Blaustein, Science, 1997 24

Depo kontrollü Ca 2+ girişi (SOC): 3 teori (Clapham, Nature, 2003). 25

2004 26

TRP1 ve TRP6: Sıçan aortunda yaşa bağlı zıt ekpresyon profili

Yaşlanma sürecinde sıçan aortunda TRPC1 azalırken TRPC6 artar (Erac et al 2009, AGE) 28

Yaşlanma sürecindeki sıçan aortunda TRPC protein dağılımı değişmektedir (Erac et al 2009, AGE) 29

TRPC6 adrenoseptör (AR) sinyal iletimi ile ilişkili olup yaşlı aortta AR duyarlığı artmaktadır (Erac et al 2009, AGE) 30

Yaşlanma ile azalan TRPC1 ekspresyonunu in vitro post-transkripsiyonel gen susturma (PTGS) yöntemi ile taklit ederek terapötik hedef tanımlama 31

Gen susturma: RNA interferans NATURE 2006 32

RNAi mekanizmasının keşfi Fire, A. et al. Nature 391, 806 811 (1998) Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in C. elegans. RNAi memeli hücrelerinde de operasyonel Elbashir, S.M. et al. Nature 411, 494 498 (2001) Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells. 33

A7r5 embriyonik sıçan hücrelerinde TRPC üyeleri (Selli et al, 2009 Vascul Pharmacol) 34

CyPB expression TRPC1 geni susturulmuş A7r5 hücrelerinde TRPC6 ekspresyonu artmaktadır (Selli et al, 2009, Vascul Pharmacol) 60 NT sirna CyPB sirna 40 20 0 0 ** n=3 35

[Ca 2+ ] i (340/380) SR Ca 2+ salıverilişi ve SR stresi sonrası depo-kontrollü Ca (SOC) SOC Fura-2/AM time 36

Reseptörden bağımsız Ca 2+ girişi sitrpc1-transfekte A7r5 hücrelerinde artmaktadır (Selli et al, 2009, Vascul Pharmacol) 37

SOC girişi sitrpc1-transfekte A7r5 hücrelerinde artmaktadır (Selli et al, 2009, Vascul Pharmacol) 38

TRPC6 mrna/ actin in vivo sitrpc1 uygulanması: TRPC6 ekspresyonu aortta artmaktadır 50 40 Control +sitrpc1-treated 30 ~%60 %92 20 10 0 VSM n=3 0 Endotelium n=1 (3 pooled) 39

Sonuçlar: TRPC1 in SOC bileşiminde temel düzenleyici olduğu ve azalmasının TRPC6 tarafından kompanse edildiği düşünülmektedir. TRPC6 artışı yaşlanmayla ilişkili vazospastik hastalıklarda ilaç hedefi olabilir. 40

TRP iyon kanallarının insan kanser hücre hatlarında araştırılması: Devam eden çalışmalar ve gelecek HTS 41

shrna eksprese eden plazmid ve kanser hücre hatları Transfeksiyondan 72 s sonra Protein ekspresyonu 42

SR Ca 2+ salıverilişi ve SOC TRPC1 susturulmuş kanser hücrelerinde artmaktadır 43

Real time Cell Analyzing (RTCA) (xcelligence, Roche) proliferasyonu, sitotoksisite, adhezyon, canlılık, invazyon ve migrasyon 44

RTCA: Optimizasyon çalışmaları (farklı sayıda ekilen aynı kanser hücre hattı ) 5000 2500 1250 625 45

RTCA: (Benzer sayıda ekilen farklı kanser hücre hatları) 46

Gelecek: Tüm genom nicel gen ekspresyon analizi Direct Hybridization Assay HumanHT-12 BeadChip (> 25,000 gen, > 48,000 probe 47

Teşekkür Yasemin Eraç & Çiğdem Selli, (Doktora öğr.) EÜ Eczacılık Fak. Farmakoloji AD K Can Akçalı, Bilkent Üni., Fen Fak., Mol Biol ve Genetik AD Buket Kosova, EÜ Tıp Fak., Tıbbi Biol. AD Esra Erdal, D.E.Ü. Tıp Fak. Tıbbi Biol. AD TÜBİTAK Proje destekleri 2003-2012 TRPC Gen Ailesinin Karsinogenezdeki İşlevsel Ekspresyon Kalıbının Post- Transkripsiyonel Gen Susturma ile Araştırılması. M Tosun (P.Y.), B Kosova, E. Erdal, Y Eraç, Ç Selli, SBAG-108S072 Vazospazm Gelişiminde Kapasitatif Kalsiyum Girişinin Farmakolojik ve Moleküler Yaklaşımlarla Kontrolü. M Tosun (P.Y.), B Kosova, Y Eraç, Ç Selli, SBAG-3033 Sıçan Vasküler Düz Kasında Trpc Gen Ailesinin Ayrımsal Ekspresyonlarının Yaşlanma Sürecindeki Yeri. M Tosun (P.Y.), KC Akçalı, B Kosova, Y Eraç, SBAG- 2735 48