YAYINLAR. A- SCI, SSCI, AHCI indekslerine giren dergilerde yayınlanan makaleler

Transkript

1 YAYINLAR A- SCI, SSCI, AHCI indekslerine giren dergilerde yayınlanan makaleler 1- Pekmezci GZ, Bolukbas CS, Gurler AT, Onuk EE. Occurrence and molecular characterization of Hysterothylacium aduncum (Nematoda: Anisakidae) from Merlangius merlangus euxinus and Trachurus trachurus off the Turkish coast of Black Sea. Parasitol Res, (in press) DOI /s Altun S, Onuk EE, Çiftci A, Büyükekiz AG, Duman M. Phenotipic, Genotipic Characterisation and Antimicrobial Susceptibility Determination of Lactoccous garvieae Strains. Kafkas Univ Vet Fak Derg, (in press) DOI: /kvfd Onuk EE, Fındık A, Turk N, Altun S, Korun J, Ozer S, Avsever ML, Ciftci A. Molecular identification and determination of some virulence genes of Aeromonas spp. in fish and water from Turkish coastal regions. Revue de Médecine Vétérinaire (Yayımlanmak Üzere Kabul Edildi). 4- Altun S, Onuk EE, Çiftci A, Duman M, Büyükekiz AG. (2012) Determination of Phenotypic, Serotypic and Genetic Diversity and Antibiotyping of Yersinia ruckeri Isolated from Rainbow Trout. Kafkas Univ Vet Fak Derg, (in press) DOI: /kvfd Sırıken B, Yıldırım T, Erol I, Durupınar B, Çiftci A, Onuk EE. Prevalence and characterization of coagulase positive Staphylococci isolated from salted anchovy. Journal of Aquatic Food Product Technology, ID WAFP R4 (in press) 6- Demiryürek EÖ, Onuk EE, Yüksel G, Çiftçi A. (2012) Evaluation of microbial contamination of resilon and gutta-percha cones and their antimicrobial activities. African Journal of Microbiology Research. 6 (33); Durmaz Y, Onuk EE, Çiftçi A. (2012) Investigation of the presence and antibiotic susceptibilities of Flavobacterium psychrophilum in rainbow trout farms (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) in The Middle and Eastern Black Sea Regions of Turkey. Vet J Ankara Univ. 59(2); Didinen BI, Kubilay A, Diler O, Ekici S, Onuk EE, Findik A. (2011) First isolation of Vagococcus salmoninarum from cultured rainbow trout ( Oncorhynchus mykiss, Walbaum) broodstocks in Turkey. Bull. Eur. Ass. Fish Pathol., 31(6); Onuk EE, Çiftçi A, Fındık A, Çiftçi G, Altun S, Balta F, Özer S, Çoban AY. (2011) Phenotypic and Molecular Characterization of Yersinia ruckeri Isolates from Rainbow

2 Trout ( Oncorhynchus mykiss, Walbaum, 1792) in Turkey. Berliner und Munchener Tierarztliche Wochenschrift 124 (7-8): Özer S, Börekçi G, Bulduklu P, Çiftci A, Kanık A, Onuk EE. (2011) Evaluation of fluorescence in situ hybridization (FISH) and polymerase chain reaction (PCR) for identification of Enterococcus spp. isolated from fish and water. The Israeli Journal of Aquaculture-Bamidgeh. 63: Fındık A, İça T, Onuk EE, Perçin D, Kevenk TO, Çiftçi A. (2011) Molecular typing and cdt gene prevalence of Campylobacter jejuni isolates from various sources. Tropical Animal Health and Production. 43: Onuk EE, Çiftci A, Findik A, Durmaz Y. (2010) Development and optimization of multiplex polymerase chain reaction for identification of Flavobacterium psychrophilum, Yersinia ruckeri and Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida, J. Vet. Sci. 11(3): Cakiroglu D, Meral Y, Pekmezci D, Onuk EE, Kabak YB. (2010) Effects of Yeast Culture (Saccharomyces cerevisiae) on Humoral and Cellular Immunity of Jersey Cows in Early Lactation. JAVA, 9 (10): Fındık A, Akan N, Onuk EE, Çakıroğlu D, Ciftci A. (2009) Molecular typing and methicillin resistance profile of Staphylococcus aureus strains isolated from the noses of healthy dogs. Kafkas Univ. Vet. Fak. Derg. 15 (6): Ciftci A, Onuk EE, Fındık A, Yıldırım T, Sogut MU. (2009) Molecular typing of Staphylococcus aureus strains from ovine mastitis by pulsed-field gel electrophoresis and polymerase chain reaction. J Vet Diagn Invest, 21:(6) Çoban AY, Çiftci A, Onuk EE, Erturan Z, Çaycı YT, Durupınar B. (2009). Kistik fibrozlu hastalardan izole edilen Pseudomonas aeruginosa izolatlarının biyofilm oluşturma yeteneklerinin araştırılması ve bu özelliğin genotip ve antibiyotik duyarlılığı ile ilişkisinin belirlenmesi. Mikrobiyol Bult 43: (4) Çiftci A, Fındık A, Onuk EE, Savasan S. (2009) Detection of methicillin resistance and slime factor production of staphylococcus aureus in bovine mastitis. Braz J Microbiol, 40 (2): Çiftci A, Fındık A, İça T, Baş B, Onuk EE, Güngördü S. (2009) Slime Production and Antibiotic Resistance of Enterococcus faecalis Isolated from Arthritis in Chickens. J. Vet. Med. Sci. 71 (6): B- Diğer dergilerde yayınlanan makaleler

3 1- Avsever ML, Onuk EE, Türk N, Tunalıgil S, Eskiizmirliler S, İnçoğlu Ş, Yabanlı M. Pasteurellozis cases in sea bass and sea brem cultured in the Agean region and bacteria isolated from these cases (Yayımlanmak Üzere Kabul Edildi). Bornova Veteriner Bilimleri Dergisi, Onuk EE, İnat G, Fındık A, Çelikel İÜ, Çiftci A. (2010 ) Sığır karkas orijinli Escherichia coli O157 izolatlarının rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA-polimeraz zincir reaksiyonu ile genotiplendirilmesi. Etlik Vet Mikrobiyol Derg, 21, Çakıroğlu D, Meral Y, Pekmezci D, Onuk EE, Gökalp G. (2010) Yeni Doğan Buzağılarda Çeşitli Hematolojik ve Biyokimyasal Parametreler İle Kolostral İmmun Globulinler Arasındaki İlişkinin Belirlenmesi. F.Ü. Sağ. Bil. Vet. Derg., 24 (1): Onuk EE, Diker KS. (2006) Dezenfektanların Balık Kökenli Bakteriyel Patojenler Üzerindeki Etkilerinin İncelenmesi. Ankara Üniv Vet Fak Derg., 53, Onuk EE. (2005) Balıklarda Aşılama ve Önemli Bakteriyel Aşılar. Vet. Hek. Mikrobiyol. Derg., 5(1-2): Onuk EE. (2005) Balıkların Bakterilere Karşı Doğal Savunma Mekanizmaları. Vet. Hek. Mikrobiyol. Derg., 5(1-2): Çiftci A, İça T, Onuk EE, Baş B, Tosun G. (2003) Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında Slime Faktör Üretimi ve Antibiyotik Dirençliliği. Vet. Hek. Mikrobiyol. Derg., 3(1-2): C- Hakemli konferans/sempozyumların bildiri kitaplarında yer alan yayınlar 1- Söğüt MÜ, Onuk EE, Bilgin K, Bilgin M, Çiftci A. (2012) Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen S. aureus Suşlarının Moleküler Analizi ve Genotiplendirilmesi. XXXV. Türk Mikrobiyoloji Kongresi (Uluslararası Katılımlı), 3-7 Kasım 2012, Kuşadası, Aydın. 2- Onuk EE, Çiftci A, Fındık A. (2012) Su ve Balıklardan İzole Edilen Aeromonas Türlerinin Moleküler Analizi. Sözlü Sunu. X. Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Eylül 2012, Kuşadası/AYDIN. 3- Çiftci A, Onuk EE, Çiftci G, Fındık A, Söğüt MÜ. (2012) Balık Kökenli Aeromonas sobria Suşlarının Fenotip ve Genotip Yönünden Karşılaştırmalı Analizi. Sözlü Sunu. X. Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Eylül 2012, Kuşadası/AYDIN.

4 4- Altun S, Onuk EE, Çiftci A, Duman M, Büyükekiz AG. (2012) Flavobacterium psychrophilum Suşlarının RAPD-PCR İle Genetik Farklılıklarının İncelenmesi. Poster. X. Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Eylül 2012, Kuşadası/AYDIN. 5- Altun S, Onuk EE, Çiftci A, Büyükekiz AG, Duman M. (2012) Gökkuşağı Alabalığı Kökenli Listonella anguillarum İzolatlarının Fenotipik ve Genotipik Karakterizasyonu. Poster. X. Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Eylül 2012, Kuşadası/AYDIN. 6- Yucel AC, Onuk EE, Sariyilmaz E, Karabucak B. Ex vivo comparison of antimicrobial activity of calcium hydroxide against Enterococcus faecalis and Candida albicans. Ese Congress September 2011, Roma, İTALYA. 7- Güvenç T, Onuk EE, Kabak Y, Yarım M, Fındık A, Çiftci A, Karayiğit Ö. A case of Anthrax in a puma (Puma Concolor), 29 th Meeting of the European Society of Veterinary Pathology and The European College of Veterinary Pathologists, 9 th European Congress of Toxicologic Pathology of the European Society of Toxicologic Pathology, s: 201, Uppsala, Sweden, 7-10 September, Siriken B, Yildirim T, Erol I, Durupinar B, Çiftci A, Onuk EE. (2010) Detection, genotyping and characterization for methicilline resistance, pvl gene, biofilm formation of coagulase positive staphylococci isolated from salted anchovy. 3rd Global Fisheries & Aquaculture Research Conference, 29th Nov. - 1st Dec., pp , Egypt, 9- Demiryürek EÖ, Onuk EE, Yüksel G, Çiftci A. (2010) Examination of the microbial contamination and antimicrobial-antifungal activities of different gutta-percha cones. 10th International Congress of the Turkish Endodontic Society, September 23-25, 2010, İstanbul, Türkiye. 10-Yenisey M, Onuk EE, Uz N, Külünk Ş, Ceylan G, Güler AU. (2010) Effect of Ventilation-Air Conditioning Systems on the Microbial Level of Prosthodontics Clinic Air. 34th Annual Conference of the European Prosthodontic Association & 1st Conference of the Association of Prosthetic Dentistry of Kosovo, September 23-25, 2010, Prishtina, Kosovo. 11-Onuk EE, Çiftçi A, Fındık A, Çiftçi G, Altun S, Balta F, Özer S, Çoban AY. (2010) Gökkuşağı Alabalıklarından ( Oncorhynchus Mykiss Walbaum, 1792) İzole Edilen Yersinia ruckeri Suşlarının Fenotipik ve Moleküler Karakterizasyonu. Sözlü Sunu. IX.

5 Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Ekim 2010, Girne/Kıbrıs. 12-Onuk EE, Özer S. (2010) Balık Kökenli Aeromonas hydrophıla Şuşlarının Bazı Virulens Genlerinin Belirlenmesi ve Genotipik Analizi. Poster. IX. Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Ekim 2010, Girne/Kıbrıs. 13-Durmaz Y, Onuk EE, Çiftçi A. (2010) Orta ve Doğu Karadeniz Bölgesi'nde Gökkuşağı Alabalığı ( Oncorhynchus Mykıss, Walbaum, 1792) Çiftliklerinde Flavobacterıum psychrophilum Enfeksiyonlarının Varlığının Saptanması. Poster. IX. Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Ekim 2010, Girne/Kıbrıs. 14-Fındık A, İça T, Onuk EE, Perçin D, Kevenk TO, Çiftçi A. (2010) Farklı Kaynaklardan İzole Edilen Campylobacter jejuni Suşlarının Moleküler Tiplendirmesi ve cdt Gen Prevalansı. Poster. IX. Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Ekim 2010, Girne/Kıbrıs. 15- Fındık A, Akan N, Onuk EE, Çakıroğlu D, Ciftci A (2009) Molecular typing and methicillin resistance profile of Staphylococcus aureus strains isolated from the noses of healthy dogs. 34th FEBS Congress, July 4-9, Prague. 16- Ciftci A, Fındık A, Onuk EE, Savaşan S (2009) Detection of methicillin resistance and slime factor production of Staphylococcus aureus in bovine mastitis. 34th FEBS Congress, July 4-9, Prague. 17-Ciftci A, Onuk EE, Fındık A, Yıldırım T, Sogut M U (2009) Molecular typing of Staphylococcus aureus strains from ovine mastitis by pulsed-field gel electrophoresis and polymerase chain reaction. 34th FEBS Congress, July 4-9, Prague. 18- Onuk EE, Çiftci A, Findik A, Durmaz Y. (2009) Development and optimization of multiplex polymerase chain reaction for identification of Flavobacterium psychrophilum, Yersinia ruckeri and Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida. 34th FEBS Congress, July 4-9, Prague. 19-Çoban AY, Çiftci A, Onuk EE, Erturan Z, Çaycı YT, Durupınar B (2008) Kistik fibrozlu hastalardan izole edilen Pseudomonas aeruginosa izolatlarında biyofilm varlığının araştırılması. XXXIII. Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Ekim 2008, Bodrum. 20- Çiftci A, İça T, Baş B, Onuk EE, Güngördü S. (2004) Artritli Tavuklardan İzole Edilen Enterekok Suşlarında Slime Faktör Üretimi ve Antibiyotik Direnci. Poster. VI.

6 Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Eylül 2004, Fırat Üniversitesi Veteriner Fakültesi, Elazığ. 21-Çiftci A, İça T, Onuk EE, Baş B, Tosun G. (2004) Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Staphylococcus aureus Suşlarında Slime Faktör Üretimi ve Antibiyotik Dirençliliği. Poster. VI. Ulusal Veteriner Mikrobiyoloji Kongresi (uluslararası katılımlı), Fırat Üniversitesi Veteriner Fakültesi, Eylül 2004, Elazığ. D- Projeler 1- Flavobacterium psychrophilum, Yersinia ruckeri ve Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida nin İdentifikasyonunda Multipleks Polimeraz Zincir Reaksiyonu (M - PZR) Metodunun Optimizasyonu ve Geliştirilmesi. TÜBİTAK, 107O208 Numaralı Proje, Görevi: Yürütücü (tamamlandı) ( ). 2- Prostodonti Kliniğinde Havalandırma-Klima, Ünit-Fotöy ve Çevre Yüzeylerdeki Mikroorganizma Düzeylerinin Karşılaştırılmalı İncelemesi. Ondokuz Mayıs Üniversitesi, DHF 048 Numaralı Proje. Görevi: Yardımcı Araştırmacı (tamamlandı) ( ). 3- Orta ve Doğu Karadeniz Bölgesinde Gökkuşağı Alabalığı (Oncorhynchus mykiss) Çiftliklerinde Flavobacterium psychrophilum un Epidemiyolojisinin Polimeraz-Zincir Reaksiyonu ile Belirlenmesi ve Antibiyotik Dirençliliğinin Ortaya Konulması. TAGEM/HS/09/02/08/140 Numaralı Proje. Görevi: Yardımcı Araştırmacı (tamamlandı) ( ). 4- Su ve Balık Kökenli Aeromonas Türlerinin Moleküler Tiplendirilmesi. Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Vet 051 Numaralı Proje. Görevi: Yürütücü (tamamlandı) ( ). 5- Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Veteriner Fakültesi, Su ürünleri Hastalıkları Anabilim Dalı Deneme Ünitesi ve Araştırma Laboratuarı. Ondokuz Mayıs Üniversitesi, PYO.VET Numaralı Proje (Altyapı Projesi, Bütçe; ,36 TL). Görevi: Yardımcı Araştırmacı (devam ediyor). 6- Balık Kökenli Aeromonas hydrophila Suşlarının Antibiyotip, Genotip, Protein Profili Ve Spesifik Antijenik Glikoprotein Varlığı Yönünden Karşılaştırmalı Analizi Ile Aşı Ve Teşhis Kitleri Geliştirilmesi. TÜBİTAK, 111O806 Numaralı Proje, Görevi: Yardımcı Araştırmacı (devam ediyor).

7 7- Karadenizde Yakalanan Bazı Deniz Balıklarında Zoonoz Anisakis Türlerinin Moleküler Karakterizasyonu (OMU BAP, PYO ) Görevi: Yardımcı Araştırmacı (devam ediyor). 8- Balık Kökenli Aeromonas sobria Suşlarının Antibiyotip, Genotip ve Protein Profili Yönünden Karşılaştırmalı Analizi (OMU BAP, PYO ) Yardımcı Araştırmacı (devam ediyor).