DNA REPLİKASYONU. Prof.Dr. Hüseyin H. Biyokimya Anabilim Dalı
|
|
- Coskun Solak
- 7 yıl önce
- İzleme sayısı:
Transkript
1 DNA REPLİKASYONU Prof.Dr. Hüseyin H SÖNMEZS Cerrahpaşa a Tıp T p Fakültesi Biyokimya Anabilim Dalı
2 DNA genetik bilginin depolandığı biyolojik makro moleküld ldür. Prokaryotlarda hücrenin diğer komponentleri ile birlikte bulunur. Ökaryotlarda ise nükleus içinde inde yer alır r ve nükleus zarı ile diğer hücresel h komponentlerden ayrılm lmıştır. Ökaryotlarda DNA proteinlere bağlı olarak kromatin adı verilen yapılar oluşturur.
3 DNA çok sayıda deoksiribo nükleotid birimlerinin birleşmesinden oluşur. ur. Nükleotidler azotlu baz, pentoz şekeri ve fosfat grubu olmak üzere 3 grubu içerir. i Azotlu bazlar pürin p ve pirimidin olarak 2 tiptir. Pentoz şekeri ise deoksiribozdur
4 DNA nın n 2 polinükleotid zincirinden oluşan sarmal heliks yapısı 1953 de Watson ve Crick tarafından ortaya çıkarıldı. Heliks yapısında yer alan 2 polinükleotid zincirin bazları arasında oluşan hidrojen bağlar ları ile birleşir. ir. Bir merkez eksen etrafında kıvrk vrılarak ikili sarmal yapıyı meydana getirir.polin Polinükleotid zincirinde yer alan 2 nükleotid arasında fosfodiester bağı vardır. r.
5 Her baz çiftinde bir zincirdeki bir pürin p diğer zincirdeki pirimidin ile hidrojen bağlar ları aracılığı ığı ile birleşir. ir. Adenin-timin arasında 2, guanin-sitozin arasında 3 hidrojen bağı oluşur. ur.
6 Her iki zincirin bazları düzlemsel yapıdad dadır r ve düzelemleri eksene diktir. Heliks sarmalın n bir tam dönüşünde d nde 10 baz çifti yer alır.
7 DNA nın n birbirini tamamlayan iki komplementer zinciri zıt z t yönly nlü yani anti paraleldir. Bir zincir yönünde nde iken diğeri yönündedir. ndedir.
8 DNA Replikasyonu nun nun Genel Özellikleri DNA replikasyonu semikonservatiftir. DNA nın n her bir ipliği i yeni ipliğin in sentezi için i in bir kalıp fonksiyonu görür. g r. Bu şekilde üretilen iki yeni DNA molekülünde bir yeni sentez edilen iplik bir de eski iplik yer alır. Replikasyonun semi konservatif olduğu Meselson-Stahl deneyi ile gösterilmig sterilmiştir. tir.
9 DNA replikasyonunda polimeraz enzimleri dışıd ışında 20 den fazla enzim, protein görev g alır. Tümüne T DNA replikaz sistemi veya Replizom denir. DNA replikasyon aşamaları Başlama lama safhası Replikasyon orjini (leri) nin belirlenmesi Çift iplikli DNA nın n tek iplikli yapı oluşturmak turmak üzere denatürasyonu Replikasyon çatalı oluşumu umu Uzama safhası Sonlanma safhası
10 Başlama safhası DNA polimeraz kalıp p olarak sadece tek zincirli DNA molekülü kullanır. Çift sarmal DNA molekülünün replikasyon öncesinde birbirinden ayrılmas lması gerekir. DNA replikasyonu prokaryotlarda replikasyon orijini olarak adlandırılan özel bir noktada başlar. Bu noktada replikasyon çatalı oluşur. ur.
11 DNA epilasyonu ökaryotlarda prokaryotların aksine birçok noktada birden başlar. Bu şekilde prokaryot DNA sına göre g çok daha büyük k olan ökaryot DNA sıı ıın replikasyonu kısa sürede tamamlanır.
12 Prokaryotlarda DNA Replikasyonu E.coli coli de DNA sı çift iplikli halkasal yapıdad dadır. DNA replikasyonu Ori C olarak adlandırılan replikasyon merkezinde başlar.bu lar.bu merkezin özelliği i tekrar eden 2 anahtar dizi içermesidir. i Birinci dizi 9 baz çiftinin 4 kez tekrar edilmesi, ikinci dizi 13 baz çiftinin 3 kez tekrar edilmesidir.
13 Replikasyon merkezinde replikasyonun başlayabilmesi için i in DNA nın n iki zincirinin birbirinden ayrılmas lması ve replikasyon çatalının meydana gelmesi gerekir. Bu amaç için in farklı protein ve enzimler fonksiyon görür. r.
14 Başlama lama safhasındaki anahtar komponent DnaA proteinidir. 20 civarında DnaA protein molekülünden oluşan bir kompleks merkezde tekrar eden 9 baz çiftinin bulunduğu u bölgeye b bağlan lanır. Bu işlemde i ATP harcanır. r. 13 baz çiftinin bulunduğu u bölgede b DNA denatüre edilir. Bu işlemde i lemde ATP ve HU olarak adlandırılan histon benzeri protein kullanılır.
15 Takiben DnaB proteini, DnaC proteinini içeren i bir reaksiyon ile denatüre olan bölgeye b bağlan lanır. DnaB helikaz olarak etki eder ve replikasyon çatalı oluşturur. Ayrılm lmış olan DnaA zincirlerinin her biri tek zincirli DNA bağlay layıcı protein olarak adlandırılan SSB proteinleri ile etkileşir ir (single( stranded binding protein) Bu proteinler tek zincirli DNA yı stabilize eder ve renatürasyonu rasyonu önler. Çift sarmalın n açılmasa lması ile oluşan topolojik gerilim topoizomeraz (DNA gyrase) ) tarafından dengelenir.
16 Uzama safhası Bu safhada replikasyon çatalı ile oluşan iki ana zincir yeni DNA iplikçiklerinin iklerinin sentezi için i in kalıp p görevi g görür. g r. Ana zincirleri kalıp p olarak kullanıp p yeni DNA sentezini yapacak olan enzim DNA polimerazdır. DNA polimeraz bu sentezi yönünde nde yapabilir. E.coli coli de 3 tip DNA polimeraz mevcuttur. I, II ve III tipleri DNA replikasyonu polimeraz III tarafından yapılır.
17 DNA polimerazın substratları dört deoksiribonükleotid kleotid trifosfattır. datp, dctp, dgtp, dttp DNA polimeraz iki serbest nükleotid n arasındaki reaksiyonu kataliz edemez. Polimeraz ancak mevcut bir kalıbın n serbest 3 OH 3 ucuna nukleotid ilavesi yapabilir. Bu ön n zincir Primer olarak adlandırılır. r.
18 Primer DNA polimeraz için in bir nukleotidi ilk kabul edici yer olarak görev g yapar. Primer, primaz olarak adlandırılan bir enzim tarafından sentez edilen ve birkaç nukleotidden oluşan bir RNA parças asıdır. DNA kalıbı T C G T C G G A G C A G C G Primer 3 OH dg TP PPi OH
19 DNA Replikasyonu DNA molekülünün n ayrılan iki zincirinde aynı anda meydana gelir, ancak aynı şekilde cereyan etmez. Bir zincir replikasyon çatalına doğru kesintisiz olarak kopya edilebilir. Diğer zincir ise kısa k fragmentler şeklinde sentez edilir ve bu parçalar alar daha sonra birleştirilir. Bunlara Okazaki fragmentleri denir.
20 Bir okazaki fragmenti tamamlandığı zaman RNA primer polimeraz 1 tarafından uzaklaştırılır. r. Arada kalan boşluklar DNA ligaz ile doldurulur. Ligaz bir iplikçiğin in 3 3 hidroksil ucu ile diğerinin 5 5 fosfat ucu arasında bir fosfodiester bağı ğının oluşumunu umunu katalizler.
21 Sonlanma safhası E.coli coli de DNA nın n iki replikasyon çatalı terminal bölgede birleşir. ir. Bu bölge b 20 baz çiftinden oluşur ur ve Ter. adını alır. Bu bölge b aynı zamanda TUS (terminus( utilization substance) ) adlı protein için i in bağlanma bölgesi b içerir i ve replikasyon bu bölgede b durur.
22 Ökaryotlarda DNA Replikasyonu Ökaryotik hücrenin siklusu 4 faz içeriri
23 Ökaryot DNA replikasyonu Ökaryot hücrelerde DNA replikasyonundaki en belirgin fark birçok replikasyon orjini içermesidir. Ökaryot hücrelerde DNA replikasyonu hücre döngüsünün n S fazında cereyan eder. Replikasyon orjinlerine ARS (Autonomusly( replicating sequences) ) denir. S fazı öncesi G1 fazı esnasında nda bütün b n ARS dizilerine bazı özel proteinler bağlan lanır r ve orijin tanı kompleksleri ÖRL ler (origin recognition complex) ) oluşur. ur. S fazında özel kinazlar ORC ye bağlanarak lanarak DNA polimerazın hızlanmasına na olanak sağlayan ön replikasyon komplekslerini oluşturur.
24 α δ Ökaryot DNA polimerazlar Nükleer DNA replikasyonu Ε β Tamir fonksiyonu γ Mitokondrial DNA replikasyonu
25 Ökaryotik kromozomlar prokaryotik kromozomlardan farklı olarak doğrusal rusal yapıdad dadır. Kromozomların n ucu telomer olarak adlandırılan yapılar ile sonlanır. Bu durum DNA replikasyonunun sonlanmasında nda kesintili zincirde problem yaratır. r.
26 Hücreler normalde yaklaşı şık k 50 kez bölünürler b (Hayflick( limiti) Bu süres reçte telomerler progressif olarak kısalk salır Her hücre h bölünmesinde b kısalan k telomer kritik uzunluğa gelince hücre h bölünmesi b durur Yaşlanma ve Ölüm Telomeraz denilen enzim aktif olursa hücre h büyümeye b ve bölünmeye devam eder
27 TELOMERAZ Ribonukleoprotein yapıda bir revers transkriptazdır Kromozom uçlaru larına telomerik tekrarların n eklenmesini katalizler
28 TELOMERAZ Bazı fetal dokular, germ hücreleri, kök k k hücre, h kapasitesi yüksek bazı hücreler (sperm, replikatif kapasitesi y ovum, epidermal deri hücresi h vb.) ve kanser hücreleri telomeraz aktivitesi gösterirg Somatik hücrelerde h ise yok veya ölçülemeyecek kadar düşüktd ktür Telomeraz aktivitesi çocuklarda erişkinlere kinlere göre g daha yüksektir y
29 DNA (Kromozom) Mutasyonları Mutasyonlar başlıca 2 şekilde görülebilir. g 1-Kromozom sayısında meydana gelen değişimler imler 2-DNA nın n nükleotid n dizisinde meydana gelen değişiklikler iklikler 1-Kromozom sayısında meydana gelen değişimler imler Örneğin: -Diploid genomdan tek kromozom kaybı: Monozami (2n-1) -Diploid genoma tek kromozom ilavesi *Trizomi (2n+1) *Down Sendromu (Kromozom 21)
30 2-DNA nın n nükleotid n dizisinde meydana gelen değişiklikler iklikler -DNA üzerindeki bu tip mutasyonlara DNA replikasyonu ya da onarımı sırasındaki hatalar, fiziksel ve kimyasal etkenler yol açar. a ar. 1-Nokta mutasyonları Transisyon Transversiyon 2-Çerçeve eve kayması mutasyonları Delesyon İnsersiyon
31 Nokta Mutasyonları En çok rastlanan tiptir. Tek bir baz çiftinin değişimi imi ile meydana gelir. Transisyon Tip Bir pürin p diğer pürin p veya bir Pirimidin diğer bir pirimidin ile yer değiştirir O 6 Transversiyon tip Pürin yerine pirimidin ya da Pirimidin yerine pürin p katılır. GGG AGG Glisin Arginin
32 Çerçeve eve Kayması Mutasyonları (Delesyon) DNA yapısına bir baz girmesi veya çıkması ile oluşur. ur. Normal kodonlarda nükleotid dizisinin okuma çerçevesi evesi değişir ir ve amino asid dizilimi kayar. Liz AAG Arj AGA C Gln GAA AAG Liz AAG CAG AGA AGA A Arg GAA G AAG AAG AA
33 RNA Transkripsiyonu
34 DNA nın n yapısında deoksiribonükleotidlerin kleotidlerin doğrusal dizilimi yer alır. Bu dizi genlerin son ürünü olan proteinlerin yapımı için in komut verir.
35 Bir DNA kalıbından RNA moleküllerinin llerinin sentezlenmesi işlemine i lemine transkripsiyon (okuma) adı verilmektedir. Tüm ökaryotik hücreler 4 tip RNA içerir. i
36 Replikasyon ve Transkripsiyon arasındaki belirgin farklar Replikasyon esnasında nda tüm t m DNA molekülü kopyalanır. Transkripsiyonda ise her defasında yalnız özel gen ya da gen grupları transkribe edilir. Bazı DNA bölgeleri b ise hiçbir zaman transkripsiyona uğramaz. u ramaz. Spesifik baz dizileri transkribe edilecek olan DNA segmentinin başlang langıcını ve sonunu işaretler. i Transkripsiyonda da başlama, lama, uzama ve sonlanma safhaları vardır. r. Transkripsiyon bir primere ihtiyaç göstermez. DNA nın n yalnız z bir iplikçili iliği i kalıp p olarak fonksiyon görür. g r. Transkripsiyon sonucu sentez edilen molekül l ekleme, çıkarma gibi çeşitli modifikasyonlara uğrar u ve fonksiyonel şekle dönüşür. d
37 Prokaryotik Gen Transkripsiyonu DNA ikili sarmalının n zincirlerinden biri üzerindeki bir bölgeye b komplementer olan RNA molekülünün n sentezlenmesi işlemi i lemi RNA polimeraz enzimi ile yapılır. Prokaryotik hücreler tek tip RNA polimeraz içerir. Bu RNA polimeraz farklı RNA tiplerini sentez edebilir. RNA polimeraz yaklaşı şık k 500 kd büyüklüğünde ve birçok alt üniteden oluşan kompleks bir enzimdir. Halo enzim α2 β β w σ RNA polimeraz aktivite için i in çift iplikli RNA ya bir iplik kalıp p olarak kullanılır. Çekirdek enzim Promotor bölgeyi tanır r ve Sentezi başlat latır. ya gereksinim duyar ve
38 RNA sentezi, RNA polimeraz emiminin DNA molekülü üzerinde promotor olarak adlandırılan spesifik baz dizilerini tanımas ması ile başlar. Promotor diziler transkripsiyonun başlama lama bölgesini b belirler. Bu dizilerdeki mutasyonlar genin ifade edilmesini ciddi biçimde imde etkiler.
39 Bakteriyel promotorlarda konsensus diziler 1-Transkripsiyon başlama noktasının n 10 nükleotid n uzaktaki-10 bölgesi Pribnow kutusu TATAAT 2-Başlama noktasına na 35 nükleotid n uzaktaki 35 bölgesib TGTTGACA
40 DNA üzerindeki promotor bölgeyi tanıyan RNA polimeraz üzerindeki sigma alt birimidir. Bu alt birim enzimin core kısmına geçici olarak bağlan lanır ve enzimi spesifik bölgeye b yönlendirir. y Sigma alt birimi sentezin başlamas lamasını takip eden birkaç fosfodiester bağı ğından sonra enzimin core kısmından ayrılır. r. RNA polimeraz enziminin bağlanmas lanması DNA çift iplikçiğinin inin açılmasa lmasına ve transkripsiyon kabarcığı ığının oluşumuna umuna neden olur. Yaklaşı şık k 17 bazlık k bir bölge b açılır.
41 RNA polimeraz etkisi ile RNA polimerizasyonu ortamdaki ribonükleotidlerin fosfodiester bağı ile birbirlerine bağlanmas lanması şeklinde devam eder. Sentez yönündedir. ndedir. E.coli coli de sentez hızıh yaklaşı şık k 50 nükleotid/ n kleotid/sn dir.
42 Sonlanma Transkripsiyonun sonlanma safhası da hassas bir kontrol altındad ndadır. Kalıp p olarak kullanılan lan DNA iplikçiğinin inin transkribe edilen bölgeleri sonlanma sinyalleri içerir. i Bakterilerde iki tür t r sonlanma mevcuttur. 1-p p (rho( rho) ) faktörünün n gerekli olduğu u sonlanma 2-rho faktöründen bağı ğımsız z sonlanma
43 Rho faktörü bir hekzamerik proteindir ve sonlanma bölgesinde tek zincirli RNA ya bağlanarak kalıp p DNA dan ayrılmas lmasını stimüle eder. rho faktöründen bağı ğımsız z sonlanma da GC ve takiben AT bazlarından zengin olan sonlanma bölgesinde b RNA transkripti saç tokası şeklinde bir yapı oluşturabilir ve polimeraz enzimi yavaşlar.
44 Ökaryotik Gen Transkripsiyonu
45 Ökaryotlarda 3 tip RNA polimeraz vardır. r. Tip Lokalizasyon Hücresel transkriptleri α-amanitine karşı duyarlılığı I Nukleolus 18S, 5.8S ve 28S rrna Duyarsız II Nukleoplazma mrna prekürsör ve hnrna Kuvvetli inhibe olur II Nukleoplazma trna ve 5S rrna Yüksek konsantrasyonda duyarlı
46 Ökaryotlarda transkripsiyonun başlama bölgelerinde b prokaryotlara benzer biçimde imde özel baz dizilimleri içeren i bölgeler vardır. r bölgesinde b bulunan TATA kutusu 2 80 bölgesinde b yer alan CAAT kutusu
47 Rifampisin ve aktinomisin transkripsiyonu inhibe eden iki antibiyotiktir. Rifampisin RNA sentezinin RNA zincirindeki ilk birkaç fosfodiester bağı ğını oluşumunu umunu engelleyerek transkripsiyonu inhibe eder. Aktinomisin spesifik olarak çift iplikli DNA ya bağlanarak RNA transkripsiyonunu inhibe eder. Ayrıca amanita phalloides adlı mantar tarafından üretilen alfa amanitin RNA polimeraz II ye bağlanarak RNA sentezinin uzama safhasını bloke eder. Yüksek konsantrasyonlardaki alfa amanitin polimeraz III ü inhibe edebilir buna karşı şılık polimeraz I bu toksine karşı duyarlı değildir.
48 Sentez edilen RNA molekülleri lleri primer transkripsiyon adını alır r ve modifikasyona uğrayarak u olgun şekle dönüşür. d Olgun RNA molekülüne dönüşüm d m post transkripsiyonel modifikasyon olarak isimlendirilir. Prokaryotik trna ve rrna molekülleri lleri ile tüm t ökaryotik RNA molekülleri lleri bu modifikasyona uğrar. u
49 5 cap oluşumu umu mrna Modifikasyonu Ökaryotlarda RNA polimerazii kalıp p DNA zincirinden büyük b k bir primer transkript sentezler Sentez edilen bu primer transkriptin 5 ucuna bir cap takılır. 5 cap oluşturmak turmak için i in bu uçta u bulunan nükleotidin n terminal trifosfatı bir fosfatını kaybeder, 5 5 difosfat oluşur. ur. Bu difosfatın β fosfatı GTP nin α fosfatı ile etkileşir. ir. S adenozin metioninden (SAM) bir metil grup guanin halkanın 7.pozisyonuna transfer edilir. Böylece B 7 metil guanizin cap yapısı oluşur. ur. Bu yapı molekülü nükleazların yıkımına karşı korur ve aynı zamanda olgun mrna nın ribozomlara bağlanmas lanmasında nda rol alır.
50 mrna ya PoliA zincirinin eklenmesi PoliA zinciri çekirdek enzimi olan poliadenilat polimeraz ile oluşur. ur. AAUAAA dizisine yakın n bir noktada nükleotidler n ekzonukleaz ile uzaklaşı şır. Buraya yaklaşı şık k 250 nukleotidlik polia zinciri ilave edilir. Bu yapı mrna nın stabilize olmasını ve çekirdekten çıkışını kolaylaştırır. r.
51 Ökaryötik pre-mrna transkripti ekzon ve intron adı verilen bölgeler b içerir. i Ekzonlar olgun mrna da mevcut iken, intronlar transkriptten uzaklaştırılır. r. Bu nedenle intronlar proteinin aminoasit dizisine katkıda bulunmaz. Pre-mRNA transkriptindeki intron-ekzon ayrım bölgelerindeki diziler (5 ) ) GU ve (3 ) AG dir dir.
52 Splays (kesip, çıkarma, birleştirme) mekanizmalarına na göre g intronlar çeşitli gruplara ayrılır. r. Grup I ve Grup II intronlar herhangi bir ilave protein ya da enzimatik aktivite gereksinimi olmaksızın n kesip çıkarma işlemini i lemini kendileri yapabilir (self splicing)
53 Splays mekanizması her iki grupta da benzer biçimde imde iki transesterifikasyon mekanizması içerir. Grup I intronlar bir guanin nükleotid kofaktöre gereksinim duyar. Ancak bu enerji kaynağı olarak kullanılmaz. lmaz. Guaninin 3.hidroksil grubu bir nükleofil olarak kullanılır.
54 Grup II intronlardaki reaksiyon da Grup I e benzer ancak bir guanin nükleotid kofaktör olarak kullanılmaz. lmaz.
55 İntronların üçünc ncü ve en büyük b k grubu nüklear mrna primer transkriptlerinde bulunur. Bunlar splaysozomal intronlar olarak adlandırılır. r. Bu intronların kendileri kesip çıkarma işlemini i lemini yapamaz.ilave olarak büyük b k protein komplekslere ihtiyaç duyar. Bu kompleks splaysozom olarak adlandırılır. r. Bu yapılar özelleşmiş RNA protein kompleksleri, küçük üçük nüklear ribonükleoproteinler (snrnps)) içerir. i Her snrnps ler de küçük üçük nüklear RNAs içerir (snrnas)
56 Nüklear ribonükleoproteinler olan U1 ve U2 introna bağlan lanır. Oluşan kompleks splaysozom olarak adlandırılır. r. U1 intron-ekzon bağlant lantı bölgesine bağlan lanırken U2 intron içerisinde adenin içeren bölgeye b bağlan lanır. Diğer ribonükleoproteinler U4,U5,U6 komplekse bağlan lanır ve bir loop oluşturulur. İntronun 5 ucundaki G kalınt ntısına na bağlı fosfat grubu adenin kalınt ntısının n 2 2 hidroksil grubu ile bağ oluşturur. Bir yıkım y m meydana gelir. İntronun 3 ucunda ikinci yıkım y m oluşur. ur. Ekzonlar birleştirilir.
57 Ökaryotik rrna Modifikasyonu rrna geni 45S büyüklb klüğünde bir transkript oluşturur. Bu transkript proteinler ile birleşerek erek ribonükleoprotein partikülleri oluşturur. 45S transkriptinin nükleotidlerinin %1-2 si metillidir. Bu metik grupları transkriptin yıkımı çin marker fonksiyonu görür. g r. Meydana gelen bir seri yıkım y m sonucu 18S, 28S ve 5.8S rrna lar meydana gelir.
58 Ökaryotik trna Modifikasyonu trna primer transkripti yaklaşı şık k 100 nükleotid n uzunluğunda unda oluşturulur. Bu primer transkript 5 ve 3 3 uçlarından yıkılarak y intronlar uzaklaştırılır. r. Bu olayda endonükleazlar görev yapar. Daha sonra 3 ayrı modikasyon meydana gelir. 1-Urasil SAM tarafından metillenir.. Timin oluşur ur 2-Urasilin çift bağlar larından biri dihidrourasil oluşturmak üzere indirgenir 3-Bir urasil kalınt ntısından ndan pseudoüridin oluşturulur. Son olarak 3 3 uca CCA dizisi ilave edilir.
59 Genetik Şifre ve Protein Sentezi
60 Protein sentezi biyosentetik işlemler lemler arasında en kompleks olanlardandır. r. Protein sentezi çok sayıda ribozomal proteinleri, enzimleri, protein faktörleri, trna lar ları içerir. Bir hücrenin h tüm t biyosentetik reaksiyonlar için i in kullandığı kimyasal enerjinin %90 ı protein sentezi için in harcanır. r. Protein sentezinin bu çok kompleks yapısına karşı şın n hızıh oldukça a yüksektir. y E.coli coli de 100 amino asidlik bir polipeptidin sentezi 5 sn. sürer. s
61 DNA nın n yapısındaki deoksiribonükleotidlerin kleotidlerin doğrusal dizilimi genlerin son ürünü olan proteinlerin yapımı için in komut verir de Francois Jacob ve Jacques Monod mrna nın varlığı ığını ortaya atmış ve bu buluş genetik bilginin DNA da depolandığı halde, proteine çevrilen şifrenin RNA da bulunduğuna una açıklık k getirmiştir. tir. Asıl l sorun dört d harfin (Dört nükleotidin) n 20 amino asidin dizilimini nasıl l belirlediğidir. idir.
62 20 tür t r amino asidin protein molekülündeki diziliş sırasının n belirlenmesi için i in azotlu bazlarında özel bir diziliş göstermesi gerekir. Bu ancak özel bir kodlama sistemi ile olabilir. Bu kodlama sisteminde her aminoasid için in bir baz olsa 4 1 =4 kod olur (4<20). Bu kodlama sisteminde her aminoasid için in iki baz olsa 4 2 =16 kod olur (16<20). Her amino asid için in 3 bazdan oluşan bir kod olur ise 4 3 =64 kod olur (64>20).
63 Genetik şifre (Kod) nin genel özellikleri Genetik şifre mrna daki ribonükleotid bazları kullanılarak larak doğrusal olarak yazılır. mrna daki üç ribonükleotid bir kodon u oluşturur turur ve her bir kodon bir amino asidi belirler. Genetik şifre dejeneredir. Bir amino asid birden fazla kodon tarafından belirlenebilir. 18 aminoasidin birden fazla kodonu vardır. r. Aynı amino asidi belirleyen kodonlara sinonim kodonlar denir.
64 Şifrede başla ve dur sinyalleri bulunur. AUG=Başlama kodonu UAA, UAG,UGA=Sonlanma kodonları Şifre içinde i inde virgüller yoktur. Şifre duraksamazdır (Kodonlar arasında bir boşluk yoktur). Şifre evrenseldir (virüs, probaryat, ökaryotlar aynı şifreyi kullanır). Ancak bazı istisnalar saptanmış ıştır.
65 mrna nın translasyonu amino asidlerin polipeptid zincirine biyolojik polimerizasyonudur. Bu işlem i lem ribozomlarda gerçekle ekleşir.
66 Ribozomal Yapı A o büyüklüğünde partiküllerdir. Sitoplazmada ya serbest halde ya da endoplazmik retikulumun yüzüne yapışı ışık k olarak bulunurlar. Yapısal olarak rrna ve protein içerirler. i Bir büyük b k bir küçük üçük k olmak üzere iki alt birim içerirler. i Alt üniteler Svedberg birimi ile tanımlan mlanır. Ultra santrifüjde oluşan çekim alanında nda hareket eden cisimciklerin çökelme hızlarh zlarını belirleyen bir birim olup, cisimciğin in kütlesi k ile ilişkilidir.
67 mrna nın translasyonu ile ilgili başlıca sorulardan biri, sitozoldeki aminoasidlerin mrna daki uygun kodonlarına na nasıl l doğru olarak aktarıld ldığıdır. trna nın bulunuşu u ile bu sorunun cevabı yanıtlanm tlanmıştır. trna, mrna daki kodonlar ile doğru amino asidler arasındaki adaptör r moleküld ldür.
68 t-rna Yapısı nükleotidi n içeren i küçük üçük k yapılard lardır. r. Yapılar larında adenin, guanin, sitozin ve urasil dışında psödouridin douridin, dihidrourasil,, timin gibi bazlar da bulunur. Bu yapılar post transkripsiyonel modifikasyonlar sonucu oluşur. ur. Baz eşlenmelerine e bağlı olarak t-rna t ikincil yapı oluşturur. Modifiye bazlar içeren i halkasal bölgelerde b baz eşleşmesi bulunmaz.
69 t-rna nın n kollarından ikisi adaptör r fonksiyonu görür. g r. Bir tanesi amino asid koludur. Bu kolun 3 ncundaki 3 adenosin kalınt ntısı spesifik bir amino asid ile esterleşir. Diğeri antikodon koludur. 3.kol D koludur ve dihidroüridin ridin içerir. 4.kol T ψ C halinden ribotimizin psodouridin içerir.
70 Protein Sentez Basamakları Amino asid aktivasyonu ve trna ya bağlanmas lanması Polipeptid zincir sentezinin başlamas laması Polipeptid zincir sentezinin uzaması Polipeptid zincir sentezinin sonlanması ve ribozomdan ayrılmas lması Katlanma ve posttranslasyonel işlemlerlemler ve polipeptidin
71 Amino Asid Aktivasyonu Protein sentezinin ilk fazı sürecinde sitozolde 20 farklı aminoasid trna sentetaz enzimleri ile spesifik trna lar larına bağlan lanır. t-rna larda antikodonun 3.bazı esnek (wobble( wobble) ) olduğu için in 32 farklı t-rna olduğu u düşünülmektedir. d Buna karşı şılık k her amino asid için in spesifik bir aminoaçil il trna sentetaz vardır. r.
72 Reaksiyon iki safhada oluşur. ur. 1.safhada amino asidlerin aktif şekli olan amino açil adenilat lar lar oluşur. ur. İkinci safhada ise aktifleşmi miş amino asid t-rna ya aktarılır. r.
73 Peptid Zincirinin Sentezinin Başlamas laması Prokaryotik hücrelerde polipeptid sentezinin başlamas laması için: in: 30 S ribozomal alt ünite mrna molekülü f met-trna trna Başlatma latma faktörleri (IF1, IF2, IF3) GTP 50 S ribozomal alt ünite
74 Başlama lama kompleksinin oluşumu umu 3 kademede meydana gelir: 1. Kademe 30 S ribozomal alt ünite iki başlama lama faktörü bağlar (IF1, IF3) mrna 30 S alt üniteye bağlan lanır. Başlat latıcı kodon AUG nin önünde nde bulunan altı bazdan oluşan (AGGAGG) Shine-Dalgarno dizisi küçük k alt birime bağlanmada rol oynar. Bakteriyel ribozomlar üç bölge içerir. i A P E bölgelerib (amino açil) ) (Peptidil( Peptidil) ) (Exit( Exit) Başlat latıcı kodon AUG P bölgesinde b pozisyon alır.
75 2.Kademe Bu kademede 1.kademede oluşmu muş olan yapıya GTP bağlı IF-2 2 ve f-metf met-trnatrna ilave olur. Bu RNA nın n anti kodonu mrna nın başlat latıcı kodunu ile eşe oluşturur.
76 3.Kademe Bu kademede oluşan büyük b k kompleks 50 S ribozomal alt ünite ile birleşir. ir. IF2 ye bağlı GTP hidroliz olur. Üç başlama faktörü ribozomdan ayrılır. r. Sonuçta 70 S ribozomdan oluşan başlama kompleksi meydana gelir.
77 Protein Sentezinin Uzama Safhası Uzama safhası Başlama lama kompleksi Aminoaçil il trna lar Uzama faktörleri (EF-Tu, EF-Ts Ts,, EF-G) GTP içerir. i
78 Uzama safhasının n 1.kademesinde Uygun aminoaçil il trna GTP bağlı EF-Tu kompleksine bağlan lanır. Oluşan amino açil-trna EF-Tu. GTP kompleksi 70 S başlama kompleksinin A bölgesine b bağlan lanır. GTP hidroliz olur ve EF-Tu. GDP kompleksi 70 S ribozomdan ayrılır. r. EF-Tu GTP kompleksi yeniden oluşturulur. turulur.
79 Uzama safhasının n 2. Kademesinde; Ribozomun P ve A bölgelerindeki b iki amino asid arasında bir peptid bağı oluşturulur. Bu reaksiyon peptidil transferaz enzimi ile gerçekle ekleştirilir ve sonuçta A bölgesinde b dipeptidil- trna meydana gelir.
80 Uzama safhasının n 3.kademesi Translokasyondur. Ribozom mrna nın 3 yönünde nde bir kodon hareket eder. Bu hareket ile dipeptidil trna A bölgesinden b P bölgesine kayar. Deaçil trna da P den E bölgesine b kayar. Bu hareket EF-G G (translokaz( translokaz) ) gerektirir. Enerji GTP hidrolizinden sağlan lanır. Ribozom artık k 3.aminoasid için haz in hazırdır. r.
81 Protein Sentezinin Sonlanması Uzama safhası mrna üzerinde üç sonlandırıcı kodon (UAA, UAG, UGA) dan birinin mevcudiyeti ile sonlanır. Sonlanma kodonunu takiben sonlandırma faktörleri (RF1,RF2,RF3) devreye girer. Terminal peptidil trna bağı hidroliz edilir.
Replikasyon, Transkripsiyon ve Translasyon. Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ
Replikasyon, Transkripsiyon ve Translasyon Yrd. Doç. Dr. Osman İBİŞ DNA replikasyonu DNA nın replikasyonu, DNA molekülünün, sakladığı genetik bilgilerin sonraki nesillere aktarılması için kendi kopyasını
DetaylıDNA Replikasyonu. Doç. Dr. Hilal Özdağ. A.Ü Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı Tel: /202 Eposta:
DNA Replikasyonu Doç. Dr. Hilal Özdağ A.Ü Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı Tel: 2225826/202 Eposta: hilalozdag@gmail.com 1 Watson ve Crick Gözümüzden kaçmamış olan bir nokta da.. Replikasyon
DetaylıBiyoteknoloji ve Genetik II. Hafta 8 TRANSLASYON
Biyoteknoloji ve Genetik II Hafta 8 TRANSLASYON Prof. Dr. Hilal Özdağ A.Ü Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı Tel: 2225826/125 Eposta: hilalozdag@gmail.com TRANSLASYON Translasyon a. mrna ribozoma
DetaylıTRANSLASYON ve PROTEİNLER
TRANSLASYON ve PROTEİNLER Prof. Dr. Sacide PEHLİVAN 13 Aralık 2016 mrna daki baz sırasının kullanılarak amino asitlerin doğru sıra ile proteini oluşturmasını kapsayan olayların tümüne Translasyon veya
DetaylıBAKTERİLERİN GENETİK KARAKTERLERİ
BAKTERİLERİN GENETİK KARAKTERLERİ GENETİK MATERYALLER VE YAPILARI HER HÜCREDE Genetik bilgilerin kodlandığı bir DNA genomu bulunur Bu genetik bilgiler mrna ve ribozomlar aracılığı ile proteinlere dönüştürülür
DetaylıKonu 4 Genetik Şifre ve Transkripsiyon
PowerPoint Lecture Presentation for Concepts of Genetics Ninth Edition Klug, Cummings, Spencer, Palladino Konu 4 Genetik Şifre ve Transkripsiyon Yrd. Doç. Dr. Aslı Sade Memişoğlu Copyright Copyright 2009
DetaylıTRANSLASYON VE DÜZENLENMESİ
TRANSLASYON VE DÜZENLENMESİ TRANSLASYON Translasyonda nükleik asit kullanılır fakat son ürün bir nükleik asit değil proteindir. Translasyon mekanizması 4 ana bileşenden oluşmaktadır: 1. mrnalar 2. trnalar
DetaylıTanımlamalar PROTEİN SENTEZİ; TRANSLASYON. Protein sentezi ;translasyon. mrna ; Genetik şifre 1/30/2012. Prof Dr.Dildar Konukoğlu
PROTEİN SENTEZİ; TRANSLASYON Prof Dr.Dildar Konukoğlu DNA SENTEZİ DNA DNA RNA sentezi DNA mrna Protein sentezi mrna Protein Tanımlamalar Replikasyon Replikasyon Transkripsiyon Transkripsiyon Translasyon
DetaylıDNA REPLİKASYONU. Doç.Dr. TUĞBA YILMAZ ÖZDEN
DNA REPLİKASYONU Doç.Dr. TUĞBA YILMAZ ÖZDEN DNA sentezi (replikasyon) DNA çift heliksini oluşturan iki zincir birbirinden ayrıldığında, bu zincirlerden her biri sentezlenecek yeni zincir için kalıp olarak
DetaylıTRANSLASYON VE TRANKRİPSİYON
TRANSLASYON VE TRANKRİPSİYON GEN İFADESİ (GEN EKSPRESYONU) Gen ifadesinin düzenlenmesi çeşitli aşamalarda olur: 1) Primer transkriptlerin oluşumu 2) Primer mrna dan matür (olgun) mrna oluşumu 3) mrna nın
Detaylı12. SINIF KONU ANLATIMI 2 DNA VE RNA
12. SINIF KONU ANLATIMI 2 DNA VE RNA DNA (DEOKSİRİBONÜKLEİK ASİT) Temel nükleik asittir. Prokaryot hücrelerin sitoplazmasında, ökaryot hücrelerde çekirdek, mitokondri ve kloroplast organelinde bulunur.
DetaylıDNA REPLİKASYONU. Dr. Mahmut Cerkez Ergoren
DNA REPLİKASYONU Dr. Mahmut Cerkez Ergoren Arthur Kornberg 1959 Nobel Ödülü "the mechanisms in the biological synthesis of DNA DNA Replikasyonu Replikasyon genetik materyalin tamamen kendi benzeri yeni
DetaylıProkaryotik promotor
Transkripsiyon Transkripsiyon-Replikasyon Farkları 1.Replikasyon sırasında tüm kromozom kopyalanır fakat transkripsiyonda sadece bir gen bölgesi kopyalanabilir. 2. Transkripsiyon düzeyi organizmanın o
DetaylıDNA nın REPLİKASYONU ve REKOMBİNASYONU. Prof.Dr. Sacide PEHLİVAN
DNA nın REPLİKASYONU ve REKOMBİNASYONU Prof.Dr. Sacide PEHLİVAN REPLİKASYON (DNA nın Eşlenmesi-Hangi DNA ) nükleer-mitokondrial Nerede? Ne zaman? Neden? DNA Replikasyon Mekanizmasının Özellikleri Özgül
DetaylıHücrede Genetik Bilgi Akışı
Hücrede Genetik Bilgi Akışı 1) Genomun korunması DNA nın tam olarak kopyalanması ve hücre bölünmesiyle yeni kuşak hücrelere aktarılması 2) Genetik bilginin çevrimi Hücre içerisinde bilginin DNA dan RNA
DetaylıGENETİK ŞİFRE PROF. DR. SERKAN YILMAZ
GENETİK ŞİFRE PROF. DR. SERKAN YILMAZ Genetik Şifre (Kod) Organizmalardaki proteinlerin birincil yapılarının (amino asit dizilerinin), DNA molekülündeki genlerin nükleotid dizisi tarafından tayin edilmesi
DetaylıTranskripsiyon (RNA Sentezi) Dr. Mahmut Çerkez Ergören
Transkripsiyon (RNA Sentezi) Dr. Mahmut Çerkez Ergören Transkripsiyon Transkripsiyon DNA molekülündeki bilginin RNA nükleotid dizisi haline çevrilmesi işlemidir. (DNA dan RNA sentezlenmesi) Hücre içi genetik
DetaylıChapter 10 Lecture. Genetik Kavramlar Concepts of Genetics Tenth Edition. 1. DNA Yapısı. Çeviri: Aslı Sade Memişoğlu
Chapter 10 Lecture Genetik Kavramlar Concepts of Genetics Tenth Edition 1. DNA Yapısı Çeviri: Aslı Sade Memişoğlu Genetik malzeme nedir? Çoğunlukla genetiğin ikili sarmalın keşfiyle başladığı düşünülür
DetaylıGenetik Şifre ve Transkripsiyon
Genetik Şifre ve Transkripsiyon Prof. Dr. Sacide PEHLİVAN 12 Aralık 2016 RNA (Ribonükleik Asit): Ribonükleotid Polimeri Tek zincirli bir moleküldür. İçerdiği şeker ünitesi riboz dur. DNA dan baz içeriği
DetaylıGenetik materyal: DNA replikasyonu
Genetik materyal: DNA replikasyonu Umut Fahrioglu, PhD MSc DNA Replikasyonu DNA replikasyonu genomların ve içerdikleri genlerin nesilden nesile aktarılmasında çok önemli bir rol oynar. Hücreden hücreye
DetaylıRNA Yapısı ve Katlanması, Hücrede Bulunan RNA Çeşitleri
RNA Yapısı ve Katlanması, Hücrede Bulunan RNA Çeşitleri RNA (Ribonükleik Asit) Nükleik asitler, Friedrich Miescher tara2ndan 1869'da keşfedildi. İl=haplı bandajlardan izole edilen bu maddeye nüklein adını
DetaylıBİYOLOJİ DERS NOTLARI YGS-LGS YÖNETİCİ MOLEKÜLLER
www.benimdershanem.esy.es Bilgi paylaştıkça çoğalır. BİYOLOJİ DERS NOTLARI YGS-LGS YÖNETİCİ MOLEKÜLLER NÜKLEİK ASİTLER Nükleik asitler, bütün canlı hücrelerde ve virüslerde bulunan, nükleotid birimlerden
DetaylıDNA. Kendi kopyasını yapabilir, Tamir edilebilir, Rekombinasyon geçirebilir.
DNA Kendi kopyasını yapabilir, Tamir edilebilir, Rekombinasyon geçirebilir. DNA REPLİKASYONU DNA Replikasyonu, Mitoz-Mayoz dur. Önce G1 den sonra S fazında ORJİN denilen bölgede başlar. DNA POLİMERAZLAR
DetaylıDNA ve RNA NIN YAPISI. Yrd.Doç.Dr. Özlem KURT ŞİRİN
DNA ve RNA NIN YAPISI Yrd.Doç.Dr. Özlem KURT ŞİRİN Bu derste neler öğreneceğiz? Nükleotid tanımı ve yapısı DNA nın primer, sekonder ve tersiyer yapısı RNA çeşitleri ve yapıları Canlılarda, genetik bilginin
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİ DOÇ. DR. MEHMET KARACA (5. BÖLÜM)
MOLEKÜLER BİYOLOJİ DOÇ. DR. MEHMET KARACA (5. BÖLÜM) TRANSKRİPSİYONU (ÖKARYOTİK) STOPLAZMA DNA Transkripsiyon hnrna RNA nın işlenmesi mrna G AAA Eksport G AAA NÜKLEUS TRANSKRİPSİYONU (PROKARYOTİK) Stoplazma
DetaylıNükleik Asitler. DNA ve RNA nükleik asitleri oluşturur
NÜKLEİK ASİTLER Nükleik Asitler DNA ve RNA nükleik asitleri oluşturur Genetik bilginin nesiller boyu aktarılması ve bunun proteinlere tercüme edilmesinde görev alırlar Nükleotid ünitelerinden oluşurlar
DetaylıDers 8 trna-rrna yapısı, İşlenmesi ve İşlevleri
Ders 8 trna-rrna yapısı, İşlenmesi ve İşlevleri mrna trna - rrna Taşıyıcı (transfer) RNA (trna) Nispeten küçük moleküllerdir. Bir öncu molekülün nükleusta işlenmesiyle oluşurlar. trna molekülleri, mrna
DetaylıYAZILIYA HAZIRLIK SORULARI. 12. Sınıf 1 GENDEN PROTEİNE
YAZILIYA HAZIRLIK SORULARI 12. Sınıf 1 GENDEN PROTEİNE Protein sentezini tüm canlılar gerçekleştirir. Bir mrna molekülünde en fazla 64 çeşit kodon bulunur. DOĞRU YANLIŞ SORULARI Canlıların heterotrof beslenenleri
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİ DOÇ. DR. MEHMET KARACA
MOLEKÜLER BİYOLOJİ DOÇ. DR. MEHMET KARACA RİBOZOMLAR Ribozom RİBONÜKLEOPROTEİN (RNP) yapısındadır. Ribozomlar hem protein hem de RNA moleküllerinden oluşur. Ribozomlar protein ve RNA moleküllerinden oluşan
DetaylıNÜKLEİK ASİTLER ( DNA VE RNA)(Yönetici Moleküller)
NÜKLEİK ASİTLER ( DNA VE RNA)(Yönetici Moleküller) NÜKLEİK ASİTLERİN KEŞFİ *FRIEDRICH MIESCHER * Balık spermlerinin çekirdeklerini ve akyuvar çekirdeklerini ayrıştırarak yaptığı çalışmalarda, bu hücrelerin
DetaylıRNA Sentezi (Transkripsiyon) Prof.Dr.T
RNA Sentezi (Transkripsiyon) Prof.Dr.T.Tülay Akçay Sistron genetik ekspresyon un(ifadenin) en küçük k birimidir.tek bir mrna birden fazla protein transle ediyorsa polisistronik mrna dır. Operonlar ve polisistronik
DetaylıTranslasyon. Doç. Dr. Nurten Özsoy. mrna tarafından taşınan bilgilerin protein dizilerine aktarılmasıdır. sitoplazma serbest amino asitler.
Translasyon Doç. Dr. Nurten Özsoy mrna tarafından taşınan bilgilerin protein dizilerine aktarılmasıdır Gen protein zinciri Sentezlenen mrna sitoplazma serbest amino asitler trna ribozom Transkripsiyon
DetaylıBAKTERİLERİN GENETİK YAPISI
BAKTERİLERİN GENETİK YAPISI Kromozom bakteri hücrelerinde genellikle çift zincirli helikal çembersel (bazı bakterilerde lineer) yapıdaki DNA molekülü Genom kromozomal ve plazmitlerde bulunan toplam genetik
DetaylıGENETİK ŞİFRE. Prof. Dr. Filiz ÖZBAŞ GERÇEKER
GENETİK ŞİFRE Prof. Dr. Filiz ÖZBAŞ GERÇEKER Genetik Bilgi Akışı Genetik kodun özellikleri 1. Genetik şifre, harfler halinde gösterilen mrna moleküllerini oluşturan ribonükleotid bazları kullanılarak,
Detaylı2. Histon olmayan kromozomal proteinler
12. Hafta: Nükleik Asitler: Nükleik asitlerin yapısal üniteleri, nükleozitler, nükleotidler, inorganik fosfat, nükleotidlerin fonksiyonları, nükleik asitler, polinükleotidler, DNA nın primer ve sekonder
Detaylı15- RADYASYONUN NÜKLEİK ASİTLER VE PROTEİNLERE ETKİLERİ
15- RADYASYONUN NÜKLEİK ASİTLER VE PROTEİNLERE ETKİLERİ İyonlaştırıcı radyasyonların biyomoleküllere örneğin nükleik asitler ve proteinlere olan etkisi hakkında yeterli bilgi yoktur. Ancak, nükleik asitlerden
DetaylıÇukurova Üniversitesi
Gen Ekspresyonu (Kalıtsal Bilginin anlatımı) DNA molekülünün taşıdığı bilginin protein moleküllerine çevrilmesine Gen ekspresyonu denir. Gen ekspresyonu 2 aşamada gerçekleşir: 1.Transkripsiyon (Yazılım):
DetaylıGenetik şifre, Transkripsiyon ve Translasyon ASLI SADE MEMİŞOĞLU
Genetik şifre, Transkripsiyon ve Translasyon ASLI SADE MEMİŞOĞLU Giriş DNA nın genetik bilgiyi barındırdığının anlaşılmasından sonra; DNA nın genler halinde nasıl organize olduğu ve Genetik işlevin kromozomlar
DetaylıSANRAL DOGMA REPLİKASYON 11.10.2012. Memeli hücre döngüsü. DNA sentezi ve histon sentezi. DNA sentezi için hızlı gelişim. fazı. fazı.
SANRAL DOGMA 1 2 REPLİKASYON Memeli hücre döngüsü DNA sentezi için hızlı gelişim S fazı DNA sentezi ve histon sentezi G0 Hücreler sessiz G1 fazı M fazı G2 fazı Gelişim ve hücre bölünmesi için hazırlık
DetaylıGIDA BİYOTEKNOLOJİSİ-3
Protein sentezi GIDA BİYOTEKNOLOJİSİ-3 1 2 Genler ve genetik kod Gen: DNA nın genetik bilgiyi taşıyan bölümleri. Bütün genler DNA dan oluşur. Bir gendeki bilgileri A,G,T,C bazlarının sıralanışı belirler.
DetaylıA. DNA NIN KEŞFİ VE ÖNEMİ
DNA nın Yapısı ve Replikasyonu Biyoloji Ders Notları A. DNA NIN KEŞFİ VE ÖNEMİ İlk olarak Friedrich Miescher (1869) akyuvar hücreleri ve balık sperminde yönetici molekülleri tespit etmiştir. Çekirdekte
DetaylıGENETİK. Öğt. Gör. Meltem KÖKDENER
GENETİK Öğt. Gör. Meltem KÖKDENER 2 5.1. TRANSKRİPSİYONUN AŞAMALARI 5.2. PROTEİN SENTEZİ (Translasyon ) 5.3. GENETİK İFADENİN DÜZENLENMESİ 5 GENETİK TRANSKRİPSİYON ÜNİTE 5 TRANSKRİPSİYON Öğr. Gör. Meltem
DetaylıGEN MUTASYONLARI. Yrd. Doç. Dr. DERYA DEVECİ
GEN MUTASYONLARI Yrd. Doç. Dr. DERYA DEVECİ Gen mutasyonları 2 temel mekanizma ile gerçekleşir. A. İnsersiyon; Bir veya daha fazla nükleotidin araya girmesiyle B. Delesyon; Bir veya daha fazla nükleotidin
DetaylıÜNİTE 10:YÖNETİCİ MOLEKÜLLER
ÜNİTE 10:YÖNETİCİ MOLEKÜLLER Nükleik asitler sadece kalıtsal bilgiyi taşıyan moleküller olmayıp bu bilgiyi protein senteziyle birlikte hücre yönetiminde kullanmalarıyla önem kazanmaktadırlar.gelişmiş canlıların
DetaylıChapter Konu 11 Lecture 11. Konu 11. Concepts of Genetics. Tenth Edition. 2-DNA Eşlenmesi ve Rekombinasyon
Chapter Konu 11 Lecture 11 Concepts of Genetics Konu 11 Tenth Edition 2-DNA Eşlenmesi ve Rekombinasyon Konu 11 İçerik 11.1 DNA yarı korunumlu eşlenme ile kopyalanır 11.2 Prokaryotlarda DNA eşlenmesi 11.3
DetaylıTranskripsiyon ve Transkripsiyonun Düzenlenmesi
MBG 505 BAKTERİ GENETİĞİ Transkripsiyon ve Transkripsiyonun Düzenlenmesi Emrah ÖZÇELİK Ribonükleik asit (RNA) 3 tip RNA Mesajcı RNA (mrna) (genetik seviyede) Transfer RNA (trna) Ribozomal RNA (rrna) (fonksiyonel
Detaylıwww.demiraylisesi.com
YÖNETİCİ MOLEKÜLLER C, H, O, N, P atomlarından meydana gelir. Hücrenin en büyük yapılı molekülüdür. Yönetici moleküller hücreye ait genetik bilgiyi taşır, hayatsal faaliyetleri yönetir, genetik bilginin
DetaylıSınıf ; Çalışma yaprağı 3
Öğrencinin Adı ve soyadı ; Sınıf ; Çalışma yaprağı 3 F.8.2. DNA ve Genetik Kod / Canlılar ve Yaşam Bu ünitede öğrencilerin; DNA ve genetik kod ile ilişkili kavramları açıklamaları ve aralarındaki ilişkileri
DetaylıÇukurova Üniversitesi. Fen Edebiyat Fakültesi Biyoloji Bölümü
RNA TEK ZINCIRLIDIR Nükleik asitlerin ikinci çeşidi ribonükleik asit ya da RNA'dır; bu moleküller DNA'ya benzer ancak; RNA'da deoksiriboz yerine riboz şekeri Azotlu baz timin yerine urasil RNA'nın çoğunlukla
DetaylıNükleoproteinlerin Yapısı. Yrd.Doç.Dr. Özlem KURT ŞİRİN
ükleoproteinlerin Yapısı Yrd.Doç.Dr. Özlem KURT ŞİRİ Bu derste neler öğreneceğiz? ükleotid tanımı ve yapısı DA ve RA nın yapısı ükleoprotein metabolizması Replikasyon, transkripsiyon, translasyon Canlılarda,
DetaylıPROTEİN BİYOSENTEZİ ve REGÜLASYONU. Yrd.Doç.Dr. Filiz Bakar Ateş
PROTEİN BİYOSENTEZİ ve REGÜLASYONU Yrd.Doç.Dr. Filiz Bakar Ateş RNA Yapısı ve S entezi Ø Bir organizmanın genetik yapısını DNA da bulunan deoksiribonükleotid dizeleri belirler. Ø Genetik bilginin DNA da
DetaylıSİTOPLAZMİK ZAR ve SİTOPLAZMA
SİTOPLAZMİK ZAR ve SİTOPLAZMA Sitoplazmik Zarın İçeriği ve Fonksiyonu Hem gram negatif hem gram pozitif bakterilerde sitoplazmayı saran ve sitoplazma ile hücre çeperi arasında yer alan bu zarın ayrı bir
DetaylıIII-Hayatın Oluşturan Kimyasal Birimler
III-Hayatın Oluşturan Kimyasal Birimler MBG 111 BİYOLOJİ I 3.1.Karbon:Biyolojik Moleküllerin İskeleti *Karbon bütün biyolojik moleküllerin omurgasıdır, çünkü dört kovalent bağ yapabilir ve uzun zincirler
DetaylıMOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER GİRİŞ Ara Sınav 50 Ödev 30 Performans Görevi (Seminer) 20
MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER Dersin içeriği Nükleik asitler Hücre parçalama yöntemleri Ayırma ve saflaştırma yöntemleri (filtrasyon, diyaliz, çöktürme santrifüjleme vb) DNA izolasyonu ve analizi
DetaylıGenler ve proteinler arasındaki temel ilişki
GENDEN PROTEİNE Genler ve proteinler arasındaki temel ilişki İngiliz hekim Archibald Garrod (1909), genlerin, enzimler aracılığı ile fenotipi belirlediğini ilk öne süren kişidir. Garrod, doğuştan metabolizma
DetaylıHücre Neden DNA sını Replike Eder? ÇÜNKİ Mitoz Bölünmenin Gerçekleşmesi İçin S Evresinde DNA nın 2 Katına Çıkması Gerekmektedir
DNA REPLİKASYONU Hücre Neden DNA sını Replike Eder? ÇÜNKİ Mitoz Bölünmenin Gerçekleşmesi İçin S Evresinde DNA nın 2 Katına Çıkması Gerekmektedir Hücre yaşam döngüsü G 1, S, G 2, Mitoz,evreleri ile tamamlar.
DetaylıGenden proteine Genler, transkripsiyon ve translasyon yolu ile proteinleri belirler Transkripsiyon, DNA yönetiminde RNA sentezidir Ökaryotik
Genden proteine Genler, transkripsiyon ve translasyon yolu ile proteinleri belirler Transkripsiyon, DNA yönetiminde RNA sentezidir Ökaryotik hücreler, transkripsiyondan sonra RNA yı değişikliğe uğratırlar
DetaylıMİTOKONDRİ Doç. Dr. Mehmet GÜVEN
MİTOKONDRİ Doç.. Dr. Mehmet GÜVENG Hemen hemen bütün b ökaryotik hücrelerde ve ökaryotik mikroorganizmalarda bulunur. Eritrositlerde, bakterilerde ve yeşil alglerde mitokondri yoktur. Şekilleri (küremsi
Detaylı-Conservative Ökaryotlarda Yarı-Saklı (Semikonservatif) Replikasyon J. Herbert Taylor, Philip Woods ve Walter Hughes 1957 de Meselson ve Stahl ın çalışmasının yayınlanmasından bir yıl önce ökaryotlarda
DetaylıNükleik Asitlerin İşlevi
Nükleik Asitler Nükleik Asitlerin İşlevi n n n n n Metabolik işlemlerde kullanılan enerji (ATP: Adenozintrifosfat) Hücrelerin hormonlara ve diğer hücre dışı uyarılara karşı yanıtında ana bağlantı bileşeni
DetaylıGenetik Bilgi: DNA Yapısı, Fonksiyonu ve Replikasyonu. Dr. Mahmut Çerkez Ergören
Genetik Bilgi: DNA Yapısı, Fonksiyonu ve Replikasyonu Dr. Mahmut Çerkez Ergören Genetik materyal; Kendini çoğaltır. Bilgi depolar. Bilgiyi ifade eder. Mutasyonla varyasyonlara izin verir. Genetik Tarihçe
DetaylıÇekirdek 4 bölümden oluşur Çekirdek zarı: karyolemma Kromatin: Chromatin Çekirdekcik: Nucleolus Çekirdek sıvısı: karyolymph
NUKLEUS Bir hücrenin tüm yapılarının ve etkinliklerinin kodlandığı kromozomu Ayrıca, DNA sını dublike edecek ve 3 tip RNA yı ribozomal (rrna), haberci (mrna) ve transfer (trna)-sentezleyecek ve işleyecek
DetaylıGIDA BİYOTEKNOLOJİSİ-2
DNA nın replikasyonu GIDA BİYOTEKNOLOJİSİ-2 1 2 DNA Replikasyonu (DNA çoğalması, DNA ikileşmesi, DNA sentezi) Bir hücrenin bölünebilmesi için DNA nın da çoğalması gerekir. DNA replikasyon mekanizmasının
DetaylıAkıllı Defter. 9.Sınıf Biyoloji. vitaminler,hormonlar,nükleik asitler. sembole tıklayınca etkinlik açılır. sembole tıklayınca ppt sunumu açılır
9.Sınıf Biyoloji 1 Akıllı Defter vitaminler,hormonlar,nükleik asitler sembole tıklayınca etkinlik açılır sembole tıklayınca ppt sunumu açılır sembole tıklayınca video açılır 1 VİTAMİNLER ***Vitaminler:
DetaylıKALITIMIN MOLEKÜLER TEMELİ YÖNETİCİ MOLEKÜLLER
KALITIMIN MOLEKÜLER TEMELİ YÖNETİCİ MOLEKÜLLER Aynı cinsiyetteki iki insanın DNA larının benzerlik oranı, gen yapıları Yüzlerce hastalığın sebebi olan genler günümüzde saptanmıştır. Örn; Parkinson hastalığı
DetaylıC H A P T E R. Genler ve Genomlar. Yrd. Doç Dr. Aslı Sade Memişoğlu. PowerPoint Lecture by: Melissa Rowland-Goldsmith Chapman University
C H A P T E R 2 Genler ve Genomlar Yrd. Doç Dr. Aslı Sade Memişoğlu PowerPoint Lecture by: Melissa Rowland-Goldsmith Chapman University Chapter Contents 2.1 Hücre yapısı 2.2 Yaşamın molekülü 2.3 Kromozom
Detaylı11. Hafta: Prof. Dr. Şule PEKYARDIMCI NÜKLEOTİDLER
11. Hafta: Nükleik Asitler: Nükleik asitlerin yapısal üniteleri, nükleozitler, nükleotidler, inorganik fosfat, nükleotidlerin fonksiyonları, nükleik asitler, polinükleotidler, DNA nın primer ve sekonder
DetaylıLYS ANAHTAR SORULAR #4. Nükleik Asitler ve Protein Sentezi
LYS ANAHTAR SORULAR #4 Nükleik Asitler ve Protein Sentezi 1) İncelenen bir nükleotidin DNA ya mı yoksa RNA ya mı ait olduğu; I. Bağ çeşidi II. Pürin bazı çeşidi III. Pirimidin bazı çeşidi IV. Şeker çeşidi
Detaylı7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ
7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ Başlıklar 1. Prokaryotlar gen ifadesini çevre koşullarına göre düzenler 2. E. Coli de laktoz metabolizması 3. Lac operonu negatif kontrol 4. CAP pozitif kontrol
Detaylı7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ
7. PROKARYOTLARDA GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ Başlıklar 1. Prokaryotlar gen ifadesini çevre koşullarına göre düzenler 2. E. Coli de laktoz metabolizması 3. Lac operonu negatif kontrol 4. CAP pozitif kontrol
DetaylıDers 5 - mrna yapısı, İşlenmesi ve İşlevleri - I -
Ders 5 - mrna yapısı, İşlenmesi ve İşlevleri - I - Pre-mRNA (hnrna) cap mrna AAAAAAAAAAAAA REPLİKASYON DNA nın kendini eşlemesi TRANSKİPSİYON DNA dan RNA ya gene
DetaylıHücre içinde bilginin akışı
Hücre içinde bilginin akışı 1 DNA Çift Zincir Heliks 2 Hücre Çekirdeği ve Çekirdek Zarının Yapısal Organizasyonu Hatırlıyor musunuz? DNA Kromatin Kromatid Kromozom RNA Protein Çekirdek Çekirdekcik Nükleotid
DetaylıDNA, RNA, replikasyon, transkripsiyon, translasyon. Doç.Dr.Pınar AKSOY SAĞIRLI
DNA, RNA, replikasyon, transkripsiyon, translasyon Doç.Dr.Pınar AKSOY SAĞIRLI İnsan vücudunda bulunan trilyonlarca hücre, bölünerek birbirinden çoğalıyor. İlk hücreden sonra bölünerek çoğalan her hücrede,
DetaylıKONU 5 TRANSLASYON VE PROTEİNLER
KONU 5 TRANSLASYON VE PROTEİNLER Translasyon ve proteinler Translasyon; mrna, trna, ribozomlar ve polipeptid zincir sentezinin başlaması, uzaması ve sonlanması için gerekli çeşitli translasyon faktörleri
DetaylıBakteri Hücrelerinde Bölünme
Bakteri Hücrelerinde Bölünme Bakteri hücrelerinde eşeysiz çoğalma görülür. Bu da ana hücrenin DNA miktarını ikiye (replikasyon) çıkardıktan sonra yaşadığı bir sitokinezle gerçekleşir. Yrd.Doç.Dr. Yosun
DetaylıProf. Dr. Turgut Ulutin DNA REPLİKASYONU (DNA EŞLEŞMESİ)
Prof. Dr. Turgut Ulutin DNA REPLİKASYONU (DNA EŞLEŞMESİ) DNA REPLİKASYONU Replikasyon genetik materyelin tamamen kendi benzeri yeni bir molekül oluşturma işlemidir. DNA kendini eşleyebilen yegane biyomoleküldür
Detaylıhendisliği BYM613 Genetik MühendisliM Tanımlar: Gen, genom DNA ve yapısı, Nükleik asitler Genetik şifre DNA replikasyonu
BYM613 Genetik MühendisliM hendisliği Hacettepe Üniversitesi Biyomühendislik BölümüB 2012-2013 2013 Güz G z DönemiD Salı 9.00-11.45, D9 Dr. Eda Çelik-AKDUR edacelik@hacettepe.edu.tr İçerik Tanımlar: Gen,
DetaylıKALITIMIN MOLEKÜLER TEMELİ
KALITIMIN MOLEKÜLER TEMELİ MBG 111 BİYOLOJİ I Hazırlayan: Yrd.Doç.Dr. Yosun MATER Genetik Bilgi Kaynağımızın Doğası 1928 de Frederick Griffith bakteri hücrelerinin kendini transforme edilebildiğini gösterdi.
DetaylıPROTEİN SENTEZİNİN DÜZENLENMESİ VE AŞAMALARI
PROTEİN SENTEZİNİN DÜZENLENMESİ VE AŞAMALARI Protein Sentezinin Düzenlenmesi Edward TATUM 1940 yılında bir gen bir enzim hipotezini ileri sürmüştür. Bu hipotez daha sonra bir gen bir protein haline gelmiştir.
DetaylıNÜKLEİK ASİTLER İsmail Temel
NÜKLEİK ASİTLER İsmail Temel Nükleik asitler genetik bilginin depolanması ve ifade edilmesinden sorumlu moleküllerdir. Kimyasal olarak birbirinden farklı iki değişik nükleik asit vardır: Deoksiribonükleik
DetaylıGENETİK ŞİFRE VE TRANSKRİPSİYON
GENETİK ŞİFRE VE TRANSKRİPSİYON Giriş Ökaryotlardaki transkripsiyon, prokaryot ve bakteriyofajlara benzer ancak daha karmaşıktır. Transkripsiyon, bir ana polimeraz enzimine ve destekleyici proteinlere
DetaylıKalıtımın moleküler temeli
Kalıtımın moleküler temeli DNA kalıtsal maddedir Birçok protein, DNA replikasyonunda ve DNA nın tamirinde birlikte çalışır Kromozom, proteinlerle birlikte paketlenmiş bir DNA molekülünden oluşur 1856-1865-
DetaylıHücre zarının yapısındaki yağlardan eriyerek hücre zarından geçerler.fazlalıkları karaciğerde depo edilir.
DERS: BİYOLOJİ KONU: C.T.B(Vitaminler e Nükleik Asitler) VİTAMİNLER Bitkiler ihtiyaç duydukları bütün vitaminleri üretip, insanlar ise bir kısmını hazır alır. Özellikleri: Yapıcı, onarıcı, düzenleyicidirler.
DetaylıREKOMBİNAT DNA TEKNOLOJİSİ TEMEL İLKELERİ VE UYGULAMA ALANLARI. Yard.Doç.Dr. Gülay Büyükköroğlu Eczacılık Fakültesi Farmasötik Biyoteknoloji ABD.
REKOMBİNAT DNA TEKNOLOJİSİ TEMEL İLKELERİ VE UYGULAMA ALANLARI Yard.Doç.Dr. Gülay Büyükköroğlu Eczacılık Fakültesi Farmasötik Biyoteknoloji ABD. Tarihçe Rekombinant DNA teknolojisine ilişkin deneysel çalışmalar
DetaylıGenetik çalışmaların yüksek canlılardan çok mikroorganizmalarla yapılması bazı avantajlar sağlar.
8.Hafta: Bakteri Genetiği BAKTERİ GENETİĞİ Genetik çalışmaların yüksek canlılardan çok mikroorganizmalarla yapılması bazı avantajlar sağlar. 1) Yüksek canlılarda çok sayıda kromozom ve onları kontrol eden
DetaylıÖKARYOTLARDA GENETİK MATERYALİN YAPISI VE ORGANİZASYONU
ÖKARYOTLARDA GENETİK MATERYALİN YAPISI VE ORGANİZASYONU Doç. Dr. Bengi ÇINAR KUL Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Genetik Anabilim Dalı İnsan genomu 3 x 10 9 bp (n) İnsan diploidtir (2n) her çekirdek
DetaylıDNA REPLİKASYONU VE REKOMBİNASYONU
DNA REPLİKASYONU VE REKOMBİNASYONU Replikasyon Watson ve Crick in DNA nın yapısını önermelerinin ardından bilim adamları DNA nın nasıl kopyalandığı üzerinde yoğunlaşmıştır. DNA nın kendini kopyalamasına
DetaylıGEN EKSPRESYONU: GENDEN PROTEİNE
GENLER ve İŞLEVLERİ GEN EKSPRESYONU: GENDEN PROTEİNE Hazırlayan: Yrd.Doç.Dr. Yosun MATER Yrd.Doç.Dr.Yosun MATER Genlerin Doğası Şimdiye kadar öğrendiklerimiz bize canlıya ait bilgilerin DNA da yer aldığını
DetaylıPROTEİN BİYOSENTEZİ ve REGÜLASYONU. Yrd.Doç.Dr. Filiz Bakar Ateş
PROTEİN BİYOSENTEZİ ve REGÜLASYONU Yrd.Doç.Dr. Filiz Bakar Ateş Nükleik asitler genetik bilginin depolanması ve ekspresyonu için gereklidir. 1. DNA (deoksiribonükleik asit) 2. RNA (ribonükleik asit) gen
Detaylı12. SINIF KONU ANLATIMI 6 GENETİK ŞİFRE VE PROTEİN SENTEZİ 2
12. SINIF KONU ANLATIMI 6 GENETİK ŞİFRE VE PROTEİN SENTEZİ 2 SANTRAL DOGMA Hücredeki bilgi aktarım mekanizmasının tamamına SANTRAL DOGMA denir. Santral dogma tek yönlü bilgi aktarımıdır. Geri dönüşümü
DetaylıNükleik asitler. Deoksiribonükleik asit Ribonükleik asit 18.11.2008. DNA nın YAPISI ve ÖZELLİKLERİ
Nükleik asitler Sıcaklıkla öldürülmüş S suşları Canlı R suşlarını canlı S suşuna dönüştürür a) Farelere virulan S suşu enjekte edildiğinde ölür b) R suşu enjekte edildiğinde yaşar c) Isıyla öldürülmüş
DetaylıNÜKLEİK ASİTLER ÜN TE 3
NÜKLEİK SİTLER ÜN TE 3 NÜKLEİK SİTLER NÜKLE K S TLER DN (Deoksiribonükleik asit) RN (Ribonükleik asit) Bulundu u Yerler Çekirdek Bulundu u Yerler Çekirdek Mitokondri Ökaryotlarda Mitokondri Kloroplast
DetaylıDNA VE GENETİK KOD KAZANIM KONTROL SINAVI
NA VE GENETİK KO KAZANIM 4. 1. 1. GEN 3.KROMOZOM 6 2. NA 4.NÜKLEOTİ 5 1 2 ukarıdaki kutucuklarda verilen kavramları basitten karmaşığa doğru sıralayınız? A) 4-3-1-2 B) 2-1-3-4 C) 4-1-2-3 ) 2-1-4-3 3 4
DetaylıGEN İFADESİ: REPLİKASYON, TRANSKRİPSİYON, TRANSLASYON, POSTTRANSLASYONEL MODİFİKASYONLAR
GEN İFADESİ: REPLİKASYON, TRANSKRİPSİYON, TRANSLASYON, POSTTRANSLASYONEL MODİFİKASYONLAR Hücre yaşam döngüsünde Mitoz, G1, S, G2 evreleri tanımlanır. Farklılaşmasını tamamlamış ve bölünmesi duran hücrelerin
DetaylıGen Đfadesi, tespiti ve ölçülmesi
Gen Đfadesi, tespiti ve ölçülmesi Doç. Dr. Hilâl Özdağ Eposta: ozdag@medicine.ankara.edu.tr Tel: 2225826/202 Ders Notları Đçin: http://bteml.biotek.ankara.edu.tr/wiki/index.php/ana_sayfa adresinden Genombilimde
DetaylıArtan bilgi ile birlikte hasta ve ailelerin bilinçlendirilmesi
Bugün gelinen noktada genetik Artan bilgi ile birlikte hasta ve ailelerin bilinçlendirilmesi «Genetik bilgiden hastaların ve ailelerin yararlanması için tüm sağlık çalışanları insan genetiğinin temelinde
DetaylıArtan bilgi ile birlikte hasta ve ailelerin bilinçlendirilmesi
2 Artan bilgi ile birlikte hasta ve ailelerin bilinçlendirilmesi «Genetik bilgiden hastaların ve ailelerin yararlanması için tüm sağlık çalışanları insan genetiğinin temelinde yatan prensipleri anlamalıdır»
DetaylıYrd.Doç.Dr. Yosun MATER
* Yrd.Doç.Dr.Yosun MATER *Genom ve DNA replikasyonu *Bir birey tarafından taşınan genetik materyalin tamamı genom olarak adlandırılır. *Genomun gen içeren bölümü genik DNA olarak adlandırılır. * Gen nedir?
DetaylıGenetik Kod ve Protein Sentezi. Dr. Mahmut Çerkez Ergören
Genetik Kod ve Protein Sentezi Dr. Mahmut Çerkez Ergören Protein Sentezi = Translasyon Genetik bilginin protein molekülü şeklindeki ifadesi. Protein Sentezi Proteinler gen ekspresyonunun son ürünüdür.
Detaylı