2018-2019 Eğitim Yılı Dönem I. Ders Kurulu 2 HÜCRE BİLİMLERİ II Eğitim Programı Eğitim Başkoordinatörü: Dönem Koordinatörü: Koordinatör Yardımcısı: Prof.Dr. Mesut ÜNSAL Prof. Dr. Fatma SILAN Dr. Öğr. Üyesi Hakan TÜRKÖN Ders Kurulu Başkanı: Ders Kurulu Başkan Yardımcısı: Prof. Dr. Ö. ÖZDEMİR Öğr. Görevlisi Dr. Meltem İÇKİN GÜLEN Ders Kurulu Tarihleri: 22 Ekim 30 Kasım 2018 Eğitim Süresi: 6 Hafta AKTS kredisi: 7 Kredi Program güncellenme tarihi: Pratik sınav: 29 Kasım 2018 Teorik sınav : 30 Kasım 2018 DERS KURULU ÜYELERİ Tıbbi Genetik Prof. Dr. Ö. ÖZDEMİR Prof. Dr. Fatma SILAN Biyokimya Doç. Dr. M.Hilal ŞEHİTOĞLU Dr. Öğr. Üyesi Hakan TÜRKÖN Tıbbi Biyoloji Doç. Dr. M.Merve HIZ Biyofizik Dr. Öğr. Üyesi Özlem COŞKUN Dr. Öğr. Üyesi R.Özlem ÖZTOPUZ
SORU DAĞILIMI (Teorik+Pratik) Anabilim Dalı / Dersin Adı TIBBİ GENETİK (TG) 20 Ders ve Soru Sayıları Ders Sayısı SORU SAYISI Kuramsal Uygulama TOPLAM TEORİK UYGULAMA 6(x4) 26 24 8 BİYOKİMYA (BK) 28 1(x4) 29 33 1 TIBBİ BİYOLOJİ (TB) 11 1(x4) 12 13 1 BİYOFİZİK (BFZ) 16-16 20 - Toplam 75 8 83 90 10 Ders Kurulu Sırasında Süren YÖK Zorunlu Dersleri ve Diğer Eğitim Etkinlikleri Ders Ders sayısı Yabancı Dil 10 Türk Dili Ve Edebiyatı 10 Atatürk İlkeleri Ve 10 20 TOPLAM 50 Ders Kurulunun Amacı: Canlının en küçük birimi olan hücrenin yapı ve fonksiyonlarının tüm detayları ile öğrenciye öğretilmesi, temel hücre yapısının ve özelliklerinin anlatılması, biyomoleküllerin katıldığı sentez ve yıkım yollarının öğretilmesi, reaktif oksijen türleri ve antioksidan savunma sistemlerinin öğretilmesi,enzimlerin özellikleri ve enzim kinetiklerin anlatılması, hücrede gerçekleşen enerji akışı ile ilgili olayların biyofiziksel açıdan ele alınması, genetiğin moleküler prensiplerinin ve kavramlarının tanımlanması Ders Kurulunun Öğrenim Hedefleri: Enzimlerin biyolojik reaksiyonlardaki önemini ve özelliklerini öğrenmek Biyolojik moleküllerin yapı, işlev ve önemleri hakkında bilgi sahibi olmak Metabolizma ile ilgili temel bilgileri öğrenmek Hücredeki tüm biyokimyasal reaksiyonların amacının insan organizmasının yaşamının sürdürülmesi için gerekli olduğunun anlamak Biyomoleküllerin neler olduğu, laboratuar araç gereçlerinin tanınması ve ph metre kullanımı, çözeltiler ve çözelti hazırlama, Spektrofotometre tanımı, kullanımı ve fotometrik analizler yapabilmek için temel ler geliştirmek Lipit, amino asit ve nükleotit metabolizmasını kavramak Reaktif oksijen türleri ve antioksidan savunma sistemleri hakkında bilgi vermek Hücrede yer alan altyapıları ve organellerin işlevlerini tanımlama, ayırt etme yeteneğini kazanmak Hücre çeşitleri ve hücrelerdeki özgün yapısal niteliklerin görsel olarak tanımlayabilecek yetisi kazanmak Öğrencinin; daha sonraki yıllarda öğrenecekleri doku, organ sistemleri ve hastalıklara ait bilgilere bir temel oluşturabilmek Moleküler genetiğin temel kavramalarından santral dogma ve genetiğin kontrol mekanizmalarını tanımlamak Hücre sisteminde gerçekleşen olaylara biyofiziksel açıdan bakabilme yeteneği kazanır ve bu olayların biyofiziksel temellerini kavramak Hücrede enerji akışı hakkında bilgi sahibi olmak Hücre zarından madde alışverişi ve zarla ilişkili biyoelektriksel olayları kavramak Ölçme değerlendirme: Öğrenciler ders kurulu sonunda uygulama ve kuramsal sınava girerler. Bu sınavları sonunda 100 puan üzerinden not alırlar. Bu not, diğer ders kurullarından aldığı notlarla birlikte değerlendirilerek yıl sonu sınavına % 60 oranında etki eder. Tüm Öğretim üyelerimiz kendi anabilim dalına ait soruları tek dosya halinde 20 Kasım 2019 günü mesai bitimine kadar web sitemizdeki soru formatına uygun olarak Dönem I Kurul II Sorumlusu Prof. Dr. Ö. ÖZDEMİR e teslim etmeleri gerekmektedir.
2018-2019 EĞİTİM YILI DÖNEM 1 Kurul 2 1. HAFTA 22-26 EKİM 2017 22 Ekim 2018 Pazartesi 23 Ekim 2018 Salı 24 Ekim 2018 Çarşamba 25 Ekim 2018 Perşembe 26 Ekim 2018 Cuma 08:30-09:15 İngilizce Mesleki ingilizce 09:30-10:15 İngilizce Mesleki ingilizce TB_03 Canlı Sistemlerde ve Hücrelerde Sıvılar TB-04 Sitoplazma ve İnklüzyon cisimleri 10:30-11:15 BK-01 Biyokimyaya giriş ve Biyomoleküller BK_03 Enzim Yapı ve Sınıflaması Atatürk İlkeleri Ve BF_01 Proteinler ve biyolojik önemi Dr. Ö. ÖZTOPUZ BF_03 Hemoglobin ve miyoglobin örneğinde biyomoleküllerin yapı işlev ilişkileri -1 Dr. Ö. ÖZTOPUZ 11:30-12:15 BK-02 Biyomoleküller BK_04 Nükleik Asitler 1 Atatürk İlkeleri Ve BF_02 Proteinler ve biyolojik önemi Dr. Ö. ÖZTOPUZ BF_04 Hemoglobin ve miyoglobin örneğinde biyomoleküllerin yapı işlev ilişkileri -2 Dr. Ö. ÖZTOPUZ 13:30-14:15 BK_05 Nükleik Asitler 2 TB_01 Hücrede Biyolojik Moleküller 1 TB_05 Ribozom Yapı, Fonksiyon ve Biyosentezi 14:30-15:15 BK-12 Spektrofotometre tanımı, kullanımı ve fotometrik analizler TB_02 Hücrede Biyolojik Moleküller 2 TB_06 Hücre Organellere Giriş 15:30-16:15 BK-06 Konsantrasyon kavramı, laboratuvarda hesaplamalar BK-U01 ph metre kullanımı, çözeltiler ve çözelti hazırlama 1 Grup1 BK-U01 ph metre kullanımı, çözeltiler ve çözelti hazırlama 1 Grup 3 16:30-17:15 BK-07 Asitler-bazlar ve ph kavramı BK-U01 ph metre kullanımı, çözeltiler ve çözelti hazırlama 2 Grup 2 BK-U01 ph metre kullanımı, çözeltiler ve çözelti hazırlama 1 Grup 4
BK-01, BK02 Biyokimyaya giriş ve Biyomoleküller Biyokimya kavramını tanımlayabilmeli, biyokimyanın temel fonksiyonlarını açıklayabilmeli Biyokimya ile diğer disiplinler arasındaki bağlantıyı değerlendirebilmeli Canlılığı ve canlı maddede yer alan faktörleri açıklayabilmeli Biyomolekülleri tanımlayabilmeli, biyomolekül hiyerarşisini açıklayabilmeli Biyomoleküller arasındaki bağları ilişkilendirebilmeli Makromolekülleri yorumlayabilmeli, yapı-fonksiyon ilişkisini değerlendirebilmeli Makromoleküllerin oluşum reaksiyonlarını açıklayabilmeli Makromolekülleri biyolojik fonksiyonlarına göre sınıflandırabilmeli Karbonhidrat, lipit, protein, nükleik asit kavramlarını tanımlayabilmeli Makromoleküllerin fonksiyonlarını ayırt edebilmeli, aralarındaki bağlantıları yorumlayabilmeli BK-03 Enzim Yapı ve Sınıflaması Enzim terimini tanımlayabilmeli Enzimlerin yapısal özlliklerini sayabilmeli Enzimlerin tıpta kullanım alanlarını yorumlayabilmeli Enzimleri isimlendirebilmeli, enzim kodu kavramını açıklayabilmeli Sistematik isimlendirmenin özelliklerini sayabilmeli, kod özelliklerini açıklayabilmeli BK-04 Nükleik Asitler 1 Nükleik asit kavramını tanımlayabilmeli, Nükleik asitleri sınıflandırabilmeli Nükleik asit yapılarını açıklayabilmeli Nükleotid ve nükleosit kavramlarını yapı üzerinde anlatabilmeli Nükleik asitlerdeki bağları tanımlayabilmeli, Özelliklerini açıklayabilmeli Nükleik asiti oluşturan prekürsörlerin özelliklerini açıklayabilmeli BK-05Nükleik Asitler 2 Nükleik asit ve nükleotitlerin fonksiyonlarını listeleyebilmeli DNA, RNA ve özelliklerini açıklayabilmeli DNA ve RNA sarmalını çizebilmeli, bağları üzerinde gösterebilmeli DNA ve RNA reaksiyonlarını anlatabilmeli, reaksiyon için gerekli materyalleri tanımlayabilmeli RNA çeşitlerini sayabilmeli, özelliklerini açıklayabilmeli BK-06 Konsantrasyon kavramı, laboratuvarda hesaplamalar Karışımları sınıflandırabilmeli, özelliklerini açıklayabilmeli Çözünürlük kavramını tanımlayabilmeli, çözünürlüğü etkileyen faktörlerle bağıntısını açıklayabilmeli Konsantrasyon kavramını tanımlayabilmeli, konsantrasyon birimlerini sayabilmeli Konsantrasyon türlerini tanımlayabilmeli, tür- fonksiyon ilişkisi kurabilmeli Laboratuvarda kullanılan çözeltilere konsantrasyon hesaplamalarını uygulayabilmeli Konsantrasyon hesabı ile çözelti hazırlamayı açıklayabilmeli BK-07 Asitler-bazlar ve ph kavramı Asit ve baz kavramlarını tanımlayabilmeli, özelliklerini sayabilmeli Asit ve bazların kuvvetini yorumlayabilmeli, formülize edebilmeli Titrasyon tavramını tanımlayabilmeli, titrasyon eğrisi çizebilmeli ve yorumlayabilmeli ph kavramını tanımlayabilmeli, asitlik ve bazlıkla ilişkilendirebilmeli Handerson-Hasselbalch denklemini yazabilmeli Asitlik ve bazlık arasındaki kantitatif ilişkiyi Handerson-Hasselbalch denklemi ile açıklayabilmeli Tampon çözelti kavramını tanımlayabilmeli, vücut içi tampon sistemlerini sayabilmeli Tampon çözelti hazırlama kurallarını açıklayabilmeli, konsantrasyonları hesaplayabilmeli BK-08 Aminoasitler Dr. H. TÜRKÖN Aminoasiti tanımlayabilmeli Aminoasitleri sayabilmeli Aminoasitlerin önemini ve metabolizmadaki yerini açıklayabilmeli Aminoasitlerin genel kimyasal özelliklerini açıklayabilmeli Aminoasitlerin genel fiziksel özelliklerini açıklayabilmeli BK-09 Aminoasitler Dr. H. TÜRKÖN Aminoasitlerin sınıflandırmasını tanımlayabilmeli Aminoasidlerin herbirinin yapısını açıklayabilmeli Standart ve non-standart aminoasitleri sayabilmeli Aminoasitlerin verdiği reaksiyonları sayabilmeli Aminoasitleri tanımlama deneylerini tanımlayabilmeli
BK-10 Proteinler 1 Proteini tanımlayabilmelii isimlendirme yapabilmeli Proteinleri oluşturan aminoasitleri sayabilmeli, bağ yapılarını açıklayabilmeli Peptit bağını tanımlayabilmeli, özelliklerini sayabilmeli Peptit bağları ile oluşan yapıları isimlendirebilmeli Proteinlerin biyolojik özelliklerini sayabilmeli BK-11 Proteinler 2 Proteinlerin üç boyutlu yapılarını çizebilmeli, tüm yapı türlerini karşılaştırabilmeli Protein türlerini sınıflandırabilmeli Fibröz ve globüler proteinlerin özelliklerini sayabilmeli Proteinlerin denatürasyonu ve renatürasyonuna sebep olan etmenleri sıralayabilmeli Proteinlerin saflaştırma tekniklerini sınıflayabilmeli, özelliklerini sayabilmeli BK-12 Spektrofotometre tanımı, kullanımı ve fotometrik analizler Fotometre, fotometri ve spektrofotometre kavramlarını tanımlayabilmeli Spektrofotometrenin bölümlerini sayabilmeli, sırasıyla yazabilmeli Spektrofotometre bölümlerinin özelliklerini açıklayabilmeli Spektrum ve dalga boyu bağıntısı kurabilmeli Dalga boylarını özelliklerine göre sınıflandırabilmeli Işık absorbsiyonunu ve transmisyon kavramlarını açıklayabilmeli Absorbsiyon ve transmisyon arasındaki ilişkiyi matematiksel denklemle ifade edebilmeli Spektrofotometreyi çalıştırabilmeli, ölçüm küvetini kullanabilmeli Spektrofotometrede dalga boyu ayarlayabilmeli, ölçüm alabilmeli Lambert-Beer kanunu açıklayabilmeli, sonuçlara uygulayabilmeli BK-U01 ph metre kullanımı, çözeltiler ve çözelti hazırlama 1 ph skalasını açıklayabilmeli, cetvel üzerinde asitlik ve bazlık phlarını gösterebilmeli Hidrojen veya hidroksil iyon konsantrasyonları ile ph kavramını ilişkilendirebilmeli İyonlaşma ve iyonlaşma sabiti kavramlarını tanımlayabilmeli ph metre kullanım yerlerini ve amaçlarını sayabilmeli ph metre çalışma prensibini açıklayabilmeli, metotları yorumlayabilmeli ph metre bölümlerini sayabilmeli, özelliklerini açıklayabilmeli ph'ya ve ölçüme etki eden faktörleri açıklayabilmeli ph metre kalibrasyonunu uygulamalı olarak gösterebilmeli ph metrede ph tayini yapabilmeli, sonucu okuyabilmeli ph metreden alınan ölçüm sonuçlarını yorumlayabilmeli BF-01 Proteinler ve biyolojik önemi Dr. Ö. ÖZTOPUZ Proteinlerin fonksiyonlarını tanımlayabilmeli Proteinlerin fonksiyonlarına göre ayrımını yapabilmeli Proteinlerin yapısal özellklerini tanımlayabilmeli Peptit bağı oluşumunu açıklayabilmeli Amino asidlerin biyofiziksel özelliklerini anlatabilmeli BF-02 Proteinler ve biyolojik önemi Dr. Ö. ÖZTOPUZ Amino asidlerin primer ve sekonder yapısını oluşturan bağları tanımlayabilmeli Amino asidlerin tersiyer yapısını oluşturan bağları tanımlayabilmeli Amino asidlerin kuarterner yapısını oluşturan bağları tanımlayabilmeli Proteinlerin denaturasyonunu tanımlayabilmeli Protein metabolizması bozukluklarını açıklayabilmeli TB-01 Hücrede Biyolojik Moleküller 1 Organik ve inorganik madde ayrımını yapabilmeli Su molekülünün yapısal özelliklerini tanımlayabilmeli Suyun yaşamsal öneminin gerekçesini açıklayabilmeli Proteinlerin yapısal özelliklerini bilmeli Proteinlerin işlevsel özelliklerini sıralayabilmeli TB-02 Hücrede Biyolojik Moleküller 2 Karbonhidratları sınıflandırabilmeli Lipitleri sınıflandırabilmeli Hücre membranında bulunan lipitleri sıralayabilmeli Hücresel membranında bulunan tüm biyolojik yapıların ayrımını yapabilmeli Nükleik asitleri sayabilmeli
TG-01 DNA Yapısı ve Replikasyonu 1 Dr. F. SILAN DNA nın yapıtaşı olan nükleotidleri bilecek, nükleotidler arası benzerlik ve farklılıkları anlayacak ve bunun spontan mutasyon oluşumundaki rolünü kavrayacak DNA zincirinin yönlerini anlayacak Nükleer ve Mitokondrial DNA farklılıklarını kavrayacak DNA-RNA farklılıklarını kavrayacak DNA nın histon ve nonhiston proteinlerle katlanmasını, kromatin oluşumunu anlamak TG-02 DNA Yapısı ve Replikasyonu 2 Dr. F. SILAN DNA replikasyonunda görevli enzimleri (Giraz, Topoizomeraz, Polimeraz vb), bu enzimlerin görevlerini ve bu enzimleri etkileyen ilaçların tıpta kullanımını kavrayacak DNA replikasyonunun hücre siklusuyla ilişkisini kavrayacak Replikasyonda primaz enziminin rolünü, primerlerin gerekliliğini, DNA polimerazların replikasyon sürecindeki proof reading aktivitesini kavrayacak ve bunun replikasyon hatalarını azaltıcı rolünü kavrayacak Telomerlerin her replikasyonda kısalmasını, telomeraz enzimini, ve bunların kanser ve yaşlılıkla ilişkisini anlayacak
2018-2019 EĞİTİM YILI DÖNEM I KURUL-2 2. HAFTA 29 Ekim-2 KASIM 2018 29 Ekim 2018 Pazartesi 30 Ekim 2018 Salı 31 Ekim 2018 Çarşamba 1 Kasım 2018 Perşembe 2 Kasım 2018 Cuma 08:30-09:15 İngilizce BK_08 Aminoasitler Dr. H. TÜRKÖN TG_U01 (2. Grup) DNA İzolasyonu Lab. 09:30-10:15 İngilizce BK_09 Aminoasitler Dr. H. TÜRKÖN TG_U02 (2. Grup) DNA İzolasyonu Lab. 10:30-11:15 RESMİ TATİL TG_01 DNA Yapısı ve Replikasyonu Dr. F. SILAN Atatürk İlkeleri Ve BK_10 Proteinler -1 TG_U01 (1. Grup) Uygulama 3 DNA İzolasyonu Lab. 11:30-12:15 TG_02 DNA Yapısı ve Replikasyonu Dr. F. SILAN Atatürk İlkeleri Ve BK_11 Proteinler -2 TG_U02 (1. Grup) Uygulama 3 DNA İzolasyonu Lab. ÖĞLE ARASI 13:30-14:15 TG_03 RNA Yapısı, çeşitleri, Transkripsiyon, Splicing, Olgunlaşma 1 Dr. F. SILAN TG_05 DNA Analiz Yöntemleri 1 Dr. F. SILAN TG_U01 (3. Grup) DNA İzolasyonu Lab. 14:30-15:15 RESMI TATIL TG_04 RNA Yapısı, Çeşitleri, Transkripsiyon, Splicing, Olgunlaşma 2 Dr. F. SILAN TG_06 DNA Analiz Yöntemleri 2 Dr. F. SILAN TG_U02 (3. Grup) DNA İzolasyonu Lab. 15:30-16:15 Mesleki ingilizce TG_U01 (4. Grup) DNA İzolasyonu Lab. 16:30-17:15 Mesleki ingilizce TG_U02 (4. Grup) DNA İzolasyonu Lab.
TG-03 RNA Yapısı, çeşitleri, Transkripsiyon, Splicing, Olgunlaşma 1 Dr. F. SILAN RNA nın DNA dan farklılıklarını ve DNA dan RNA sentezini kavrayacak Fonksiyonel RNA kavramını anlayacak ve dolayısıyla Gen kavramını bilecek Ribozyme kavramını anlayacak Major RNA çeşitleri olan mrna, trna ve rrna nın sentez, yapı ve fonksiyonlarını bilecek snrna, ribonükleoprotein kavramları ve splicing i anlayacak Exon- intron kavramlarını ve alternatif splicing ile bir genden farklı proteinlerin, özellikle izoenzimlerin sentezini kavrayacak hnrna dan olgun mrna sentezini, bu sentezi bozan faktörleri bilecek mrna nın olgunlaşması aşamalarını, 5cap ve 3 polia ucu kavramlarını, bu aşamaları etkileyen mutasyonların protein miktarını nasıl etkilediğini ve örnek hastalıkları kavrayacak TG-04 RNA Yapısı, Çeşitleri, Transkripsiyon, Splicing, Olgunlaşma 2 Dr. F. SILAN Ribozomal RNA çeşitleri, sentez ve splicing aşamaları ile kromozomal yerleşimleri, satellit polimorfizmleri ile bağlantısını kavrayacak snorna yapı ve görevlerinin anlaşılması XIST RNA ve X inaktivasyonundaki rolünü kavrayacak Long Noncoding RNA lar ve çeşitli hastalıklarla özellikle kanserle bağlantısının anlaşılması mirna yapısı, çeşitleri, sentezi ve hastalıklarla ilişkilerinin anlaşılması Small interferan RNA lar, yapı sentez ve fonksiyonları anlaşılarak, bir tedavi yöntemi- yeni tedavi hedefleri olarak sirna ların görülmesi TG-05 DNA Analiz Yöntemleri I Dr. F. SILAN DNA analizlerinin endikasyonlar, hangi durumlarda DNA analizlerinin yapılması gerektiğinin kavranılması DNA analizleri için uygun doku ve numune seçiminin yapılabilmesi, Doğrudan mutasyon analizi ve indirekt analiz kavramlarının anlaşılması Mutasyonun tipine ve yerleşimine göre analiz yöntemi seçmek Genetik analiz raporlarının giriş kısmında yazan yöntemlerin tanınması TG-06 DNA Analiz Yöntemleri I Dr. F. SILAN Belli bir mutasyonun aranmasına yönelik,- mutasyon spesifik yöntemlerin ve hibridizasyon yöntemlerinin kavranılması Bilinmeyen bir mutasyonun aranmasına yönelik yöntemlerin kavranılması DNA analizinde saptanan mutasyonların patojenitesinin sınıflandırılabilmesi DNA düzeyinde Delesyon- duplikasyon analizlerinin karşılaştırmasını yapabilme MLPA yöntemini kavrama array CGH yöntemini kavrama ve MLPA ile karşılaştırabilme BK-13 Enzimlerin Katalitik reaksiyonları Enzimlerin denatürasyonuna sebep olan faktörleri sayabilmeli Enzim aktif bölge özelliklerini açıklayabilmeli Enzim-substrat bağlanmasını açıklayabilmeli, bağlanma modellerini karşılaştırabilmeli Koenzim, kofaktör, apoenzim, holoenzim gibi kavramları tanımlayabilmeli Enzim aktivite birimlerini tanımlayabilmeli Enzim katalizine etki eden faktörleri tanımlayabilmeli Substrat ve reaksiyon hızı arasındaki bağıntıyı yazabilmeli, grafiği yorumlayabilmeli Vmax, Km, Substrat konsantrasyonu, enzim konsantrasyonu arasındaki ilişkiyi yorumlayabilmeli BK-14 Enzim Kinetikleri Enzimlerin kinetik karakterini tanımlayabilmeli Enzim inhibisyonunu tanımlayabilmeli, inhibitörleri yorumlayabilmeli İnhibisyon türlerini sınıflandırabilmeli İnhibitör varlığında meydana gelen reaksiyonları açıklayabilmeli, substrat-enzim-inhibitör arasındaki ilişkiyi yorumlayabilmeli İnhibitörlerin tıpta kullanımını açıklayabilmeli BK-15 Enzim Aktivitesine Etki Eden Faktörler 1 Enzim aktivitesini düzenleyen mekanizmaları açıklayabilmeli Efektör, indüktör, modulatör gibi kavramları tanımlayabilmeli Efektörlerin özelliklerini sayabilmeli Efektörlerin tıpta kullanımını açıklayabilmeli Enzim katalitik etkinlik özelliklerini sıralayabilmeli
BK-16 Enzim Aktivitesine Etki Eden Faktörler 2 Allosterik enzimleri tanımlayabilmeli, özelliklerini açıklayabilmeli Feed back inhibisyon özelliklerini açıklayabilmeli, buna uygun reaksiyonları gösterebilmeli Kovalent modifikasyon özelliklerini açıklayabilmeli, metabolik rolünü anlatabilmeli Zimojen aktivasyonunu ve buna uyan enzimleri tanımlayabilmeli, özelliklerini sayabilmeli Metabolik entegrasyonda inhibisyon ve aktivasyonların rolünü açıklayabilmeli BF-03 Hemoglobin ve miyoglobin örneğinde biyomoleküllerin yapı işlev ilişkileri 1- Dr. Ö. ÖZTOPUZ Miyoglobin ve hemoglobin örneğinde yapı-işlev arasındaki bağlantıyı açıklayabilmeli Hemoglobinin yapısını açıklayabilmeli Miyoglobinin yapısını tanımlayabilmeli Hemoglobin ve miyoglobin arasındaki yapı benzerlikleri ve farklılılarını ilişkilendirebilmeli Normal hemoglobin türlerini sıralayabilmeli BF-04 Hemoglobin ve miyoglobin örneğinde biyomoleküllerin yapı işlev ilişkileri 2- Dr. Ö. ÖZTOPUZ Hemoglobine oksijenin bağlanmasına etki eden faktörleri anlatabilmeli Miyoglobinin tanıdaki önemini açıklayabilmeli Hemoglobin ve miyoglobin arasındaki yapı benzerlikleri ve farklılılarını ilişkilendirebilmeli Hemoglobinopatiler açıklayabilmeli Anormal hemoglobinlerde yapı bozukluğunun işleve etkisini açıklayabilmeli TB-03 Canlı Sistemlerde ve Hücrelerde Sıvılar Vücut sıvılarını sınıflandırabilmeli Ekstraselüler sıvı kompartımanı açıklayabilmeli Intertisyel sıvı, Transelüler sıvı ve lenf sıvısının farkını belirleyebilmeli Hücre içi (intraselüler) ve hücre dışı (ekstraselüler) sıvı farkını anlatabilmeli Vücut sıvılarının dağılımı sayabilmeli TB-04 Sitoplazma ve İnklüzyon cisimleri Sitoplazmanın kolloidal yapısını, özelliğini ve biyolojik sistem için gerekliliğini anlatabilmeli Sitoplazma içeriğinin ve miktarının hücresel fonksiyona ve hücre döngüsüne bağlı değişebileceğini kavramalı Sitoplazmik inküzyon tanımını yapabilmeli Sitoplazmik inküzyonları sayabilmeli Sitoplazma aktarımının hücresel fonksiyonların devamına etkili olabileceğini kavrayabilmeli TB-05 Ribozom Yapı, Fonksiyon ve Biyosentezi Ribozomun organel-inküzyon ayrımında ki yerini tartışabilmeli Prokaryot ve ökaryotik ribozomlar arası farkları açıklayabilmeli Ribozomun prokaryotik ve ökaryotik organizmadaki farklı yerleşimlerini sayabilmeli Ribozomun moleküler düzeyde yapısını açıklayabilmeli Ribozom biyogenezini anlatabilmeli TB-06 Hücre Organellere Giriş Organellerin hücresel organizasyon için gerekliliğini açıklayabilmeli Ökaryotik hücredeki organelleri sayabilmeli, Kavramsal olarak organellerin belirli sayıda aileler şeklinde düzenlendiğini fark edebilmeli, Organelerin birbirleriyle etkileşimli çalıştığını kavrayabilmeli Ribozomun yapısını ve protein sentezi ile ilişkisini açıklayabilmeli TG-U01 (1. Grup) DNA İzolasyonu 1 Lab. Total genomik DNA eldesinde kullanılan teknikleri kavramak Tanı amaçlı DNA elde etme basamaklarını bilmek, kavramak Genomik DNA eldesinde kullanılan invazive, non-invazive biyolojik materyalleri bilmek, kavramak Mİkropipet kullanımını öğrenmek, kullanmak DNA eldesinde kullanılan bütün sarfları bilmek, dokunmak, öğrenmek TG-U02 (1. Grup) DNA İzolasyonu Lab.2 Optimize kit kullanarak periferik kandan DNA izolasyonununu aktif olarak yaparak öğrenmek Kit kapsamında kullanılan sarf ve solusyonları tanımak, miktarlarını ve kullanım sırasını kavramak, kullanmak Eppendorf tüp, mikropipet, pipet uçları gibi izolasyonda kullanılan sarfları tanımak ve kullanmak Bu amaç için mikrosantrifüjü kullanmak Periferik Kan-EDTA biyolojik materyalin DNA eldesinde kullanılacak miktarını öğrenmek, Bir izolasyonda elde edilecek DNA (ng olarak) miktarını bilmek İzolasyon sonrası DNA miktarını ölçebilmek
2018-2019 Eğitim Yılı DÖNEM I Kurul 2 3. HAFTA 05 KASIM 09 KASIM 2018 05 Kasım 2018 Pazartesi 06 Kasım 2018 Salı 07 Kasım 2018 Çarşamba 08.30-09.20 Türk Dili Mesleki İngilizce İngilizce 09.30-10.20 Türk Dili Mesleki İngilizce İngilizce 10.30-11.20 11.30-12.20 TG_07 Translasyon (Protein Sentezi) 1 Dr. Ö. ÖZDEMİR TG_08 TG Translasyon(Protein Sentezi) 2 Dr. Ö. ÖZDEMİR BF_07 Biyoenerjtiğe giriş, Biyolojik sistemler açısından termodinamik kurallar Dr. Ö. COŞKUN BF_08 Biyoenerjtiğe giriş, Biyolojik sistemler açısından termodinamik kurallar Dr. Ö. COŞKUN Atatürk İlkeleri Ve Atatürk İlkeleri Ve 12.30-13.20 Öğle Arası 08 Kasım 2018 Perşembe BK_15 Enzim Aktivitesine Etki Eden Faktörler 1 BK_16 Enzim Aktivitesine Etki Eden Faktörler 2 BF_09 Biyolojik işler (Osmotik iş, kimyasal iş, mekanik iş) Dr. Ö. COŞKUN BF_10 Biyolojik işler (Osmotik iş, kimyasal iş, mekanik iş) Dr. Ö. COŞKUN 09 Kasım 2018 Cuma TG_11 Mutasyon 1 (Mutasyonlar ve Mutagenezis) Dr. Ö. ÖZDEMİR TG_12 Mutasyon 2 (Mutasyon Tipleri 1) Dr. Ö. ÖZDEMİR TG_13 Mutasyon 3 (Mutasyon Tipleri 2) Dr. Ö. ÖZDEMİR 13.30-14.20 14.30-15.20 15:30-16:15 BF_05 Enzim kataliz mekanizmaları ve özellikleri Dr. Ö. ÖZTOPUZ BF_06 Enzim kataliz mekanizmaları ve özellikleri Dr. Ö. ÖZTOPUZ TB_07 Endomembran Sistemi-1 (Granüler Endoplazmik Retikulumun Yapısı ve fonksiyonları) TG_09 Gen Regülasyonu 1 Dr. Ö. ÖZDEMİR TG_10 Gen Regülasyonu 2 Dr. Ö. ÖZDEMİR BK_13 Enzimlerin Katalitik reaksiyonları BK_17 Aminoasit Katabolizması ve Üre Döngüsü 1 Dr. H. TÜRKÖN BK_18 Aminoasit Katabolizması ve Üre Döngüsü 2 Dr. H. TÜRKÖN TB_09 Endomembran Sistemi-3 (Golgi Kompleksi yapı ve fonksiyonları) TB-U01 Hücre Çeşitleri-Bitki ve Hayvan Hücresi (Grup-1) TB-U01 Hücre Çeşitleri-Bitki ve Hayvan Hücresi (Grup-2) TB-U01 Hücre Çeşitleri-Bitki ve Hayvan Hücresi (Grup-3) 16:30-17:15 TB_08 Endomembran Sistemi-2 (Düz Yüzlü Endoplazmik Retikulum(SER) BK_14 Enzim Kinetikleri TB-U01 Hücre Çeşitleri-Bitki ve Hayvan Hücresi (Grup-4)
TG-07 Translasyon (protein sentezi) 1 Dr. Ö. ÖZDEMİR Transkripsiyon, splisyon, translasyon terimlerini kavrayacak Ekspresive, non-ekspresive DNA tiplerini kavrayacak Sens DNA zincirinden protein sentez basamaklarını öğrenecek Ekspresive, non-ekspresive DNA tiplerini kavrayacak Protein sentez aşamaları ve burada görev alan molekülleri kavrayacak TG-08 Translasyon (protein sentezi) 2 Dr. Ö. ÖZDEMİR Ribozom, mrna, trna moleküllerinin sentez yolağındaki görev sıralarını tanımlayabilecek Kodon, anti-kodon terimlerini kavrayabilecek Aminoasit, kodlandığı üçlü baz dizisi ve woobl teoremini kavrayacak Protein sentezi aşamasında mrna ve yeni polipeptit sentez yönlerini kavrayabilecek Protein sentezinin başlangıç, elongasyon ve sonlanma aşamalarını kavrayabilecek Polipeptit sentez sonrası basamakları kavrayabilmek TG-09 Gen Regülasyonu I Dr. Ö.ÖZDEMİR Ökaryotik gen alt birimlerini tanımlamak, fonksiyonlarını kavramak Prokaryotik gen alt birimlerini tanımlamak, fonksiyonlarını kavramak Lac operonu hakkında temel bilgi sahibi olmak Katabolik ve anabolik gen regülasyonlarını öğrenmek, farklılıklarını kavramak Polisistronik ve monosistronik mrna transkripsyonunu tanımlamak, farkını kavramak TG-10 Gen Regülasyonu II Dr. Ö.ÖZDEMİR Transkrisiyon faktörlerinin ökaryotik genomda gen regülasyonundaki görevlerini kavramak Olgun mrna sentezi ve splisyon mekanizmalarını kavramak Alternatif splisyon kavramını tanımlayabilmek, ökayrotik bir genin farklı doku ve hücrelerde farklı ekspresyonlarını kavrayabilmek Split, Housekeeping, doku spesifik gen aileleri ve regülasyon mekanizmalarını kavramak Epigenetik düzenleme ile gen regülasyonu kavramak TG-11 Mutasyon I (Mutasyonlar ve Mutagenezis ) Dr. Ö.ÖZDEMİR Mutasyon, mutabilite, mutagenezis, sitotoksisite ve genotoksisite kavramları bilmek, öğrenmek Fiziksel ve kimyasal mutajenleri kavramak, etki mekanizmalarını öğrenmek Patojenik ve non-patojenik mutasyon tiplerini bilmek, öğrenmek Mutasyon tanı yöntemlerini kavramak Mutasyon tanısı konulabilen invazive, non-invazive biyolojik materyallerini kavramak TG-12 Mutasyon II (Mutasyonlar Tipleri 1) Dr. Ö.ÖZDEMİR Kromozom düzeyinde meydana gelen mutasyonları bilmek, sendromik kromozomal mutasyonları kavramak Kromozom yapısını ve tiplerini kavramak Yapısal ve sayısal kromozom aberasyonları kavramak Polizomi, poliploidi, trizomi, monozomi, euploidi, aneuploidi terimlerini kavramak Oksotrofik, revers, ikinci revers mutasyonları kavramak Exon, non-exon ve intron bölge mutasyonları kavramak TG-13 Mutasyon III (Mutasyon Tipleri 2) Dr. Ö.ÖZDEMİR Non-mikroskopik mutasyonları bilmek, kavramak Nokta mutasyonları kavramak Silent, missens, nonsens ve frameshift mutasyon kavramlarını bilmek patojenite derecelerini kavramak Ökaryotik genomda mutasyon önleyen mekanizmaları öğrenmek Ökaryotik genomda mutasyonlarla başeden, gideren mekanizmaları kavramak BF-05 Enzim kataliz mekanizmaları ve özellikleri 1 Dr. Ö. ÖZTOPUZ Biyolojik katalizörlerin neler olduğunu açıklayabilmeli Biyolojik katalizörlerin çalışma prensiplerini açıklayabilmeli Aktif Bölgenin ne olduğunu, burada bulunan enzimleri açıklayabilmeli Enzim katalizi ve Aktivasyon enerjisini açıklayabilmeli Reaksiyonlarının hızlarını etkileyen faktörler sayılabilmeli BF-06 Enzim kataliz mekanizmaları ve özellikleri 2 Dr. Ö. ÖZTOPUZ Enzim kataliz mekanizmalarını tanımlayabilmeli Enzim aktivitesi hakkında bilgi verebilmeli Aktivite ölçüm yöntemleri hakkında bilgi verebilmeli Enzimatik ölçümler için kullanılan biyolojik materyalleri açıklayabilmeli Birçok hastalıkta tanı aracı olarak enzimlerin önemini kavrayabilmeli
BF-07 Biyoenerjtiğe giriş, Biyolojik sistemler açısından termodinamik kurallar 1 Dr. Ö. COŞKUN Biyoenerjetik tanımını yapabilmeli Termodinamik açıdan sistem kavramını açıklayabilmeli Biyolojik sistemler açısından termodinamik kanunlarını sayabilmeli Termodinamik 0. kanununu örnek vererek açıklayabilmeli Termodinamik 1. kanununu örnek vererek açıklayabilmeli BF-08 Biyoenerjtiğe giriş, Biyolojik sistemler açısından termodinamik kurallar 2 Dr. Ö. COŞKUN Termodinamik 2. kanununu örnek vererek açıklayabilmeli Termodinamik 3. kanununu örnek vererek açıklayabilmeli Endergonik ve ekzergonik reaksiyonları açıklayabilmeli Entropi kavramını açıklayabilmeli Gibbs serbest enerji ifadesini tanımlayabilmeli BF-09 Biyolojik işler 1 (Osmotik iş,kimyasal iş,mekanik iş) 1 Dr. Ö. COŞKUN Mekanik işin moleküler mekanizmasını bilebilmeli Kas dokunun hücrelerini, bileşenlerini, tiplerini açıklayabilmeli Kas dokusu proteinlerini sayabilmeli, fonksiyonlarını açıklayabilmeli Kayan filamentler modelinin molekülsel esasını bilebilmeli Kas kasılmasının mekanizmasını açıklayabilmeli BF-10 Biyolojik işler 2 (Osmotik iş, kimyasal iş, mekanik iş) Dr. Ö. COŞKUN Düz kas ile iskelet kasının kasılma mekanizması arasındaki farkı açıklayabilmeli Kas kasılması - gevşemesi döngüsünü ve bu döngünün kontrolünü öğrenebilmeli Kasılma çeşitlerini örnekleyerek açıklayabilmeli Kas kasılmasının enerji kaynaklarını anlatabilmeli Kastaki fizyoljik ya da patolojik anomalileri açıklayabilmeli BF-11 Biyolojik membranlar ve aksiyon potansiyelleri Dr. Ö. COŞKUN Hücre membranının bileşenlerini yapısını anlatabilmeli Hücre membranının görevlerini sıralayabilmeli Hücre membranı modelini açıklayabilmeli Hücre membranı lipitlerini tanımlayabilmeli Hücre membranı proteinlerini açıklayabilmeli BF-12 Biyolojik membranlar ve aksiyon potansiyelleri 2 Dr. Ö. COŞKUN Hücre membranı bileşenlerinin görevlerini anlatabilmeli Hücre membranından madde alışverişi ve membranla ilişkili biyoelektriksel olayları kavrayabilmeli Moleküllerin membrandan nasıl taşındığını anlatabilmeli Enerjetik açıdan membrandan molekülerin taşınmasını anlatabilmeli Hücrede gerçekleşen osmotik olayları açıklayabilmeli TB-07 Endomembran Sistemi-1 (Granüler Endoplazmik Retikulumun Yapısı ve fonksiyonları)1 Endomembran sistemi içerisindeki organellerin ilişkisini kavrayabilmeli Endoplazmik retikulum un görevlerini listeleyebi Düz ve Granüllü ER arasındaki farkı yapısal farklılığı açıklayabilmeli Düz ER nin görevlerini sırayabilmeli Granüllü ER nin protein sentezi ve işlenmesi konusunda ki görevini tartışabilmeli TB-08 Endomembran Sistemi-2 (Düz Yüzlü Endoplazmik Retikulum(SER) Granüllü ER ve düz ER in, yapı ve fonksiyonca farklı ve birbirlerine bitişik olduğunu bilip, düz ER in üzerinde ribozom olmadığını anlatabilmeli Tubul veya vesiküller şeklinde GER membranlarından türevlendiğini, protein sentezine katılmadığını ve farklı hücrelerde farklı işlevleri olduğunu bilmelidir. Düz ER nin steroid hormonların sentezinde rol oynadığını kavrayabilmeli Düz ER nin metabolik işlere katıldığını, kimyasal maddelerin detoksifikasyonunda görev aldığını, karaciğerde kolesterol ve safra yapımında işlev gördüğünü, lipid biyosentezinin en önemli yeri olduğunu ve kas kasılmasında işlev gördüğünü sayabilmeli Düz ve Granüllü ER arasındaki farkı fonksiyonel olarak kavrayabilmeli TB-09 Endomembran Sistemi-3 (Golgi Kompleksi yapı ve fonksiyonları) Golgi kompleksinin yapısal ve fonksiyonel özelliklerini sayabilmeli Golgi kompleksinin hücresel lokalizasyonunu ve endoplazmik retikulum ile ilişkisini açıklayabilmeli Protein ve yağ yapılı salgı maddelerinin taşınması ve paketlenmesindeki rolünü anlatabilmeli Golgi kompleksinin fonksiyonel önemini ifade edebilmeli Golgi kompleksinin ekzositoz ile ilişkisini kavramalı
BK-17 Aminoasit Katabolizması ve Üre Döngüsü 1 Dr. H. TÜRKÖN Proteinlerin sindirimini ve emilimini açıklayabilmeli Vücuttaki protein döngüsünü tanımlayabilmeli Aminoasitlerin amino grubunu tanımlayabilmeli Aminoasitlerden azot grubunun nasıl uzaklaştırıldığını açıklayabilmeli Aminoasitlerin amino grubunun katabolizmasını ve reaksiyonlarını açıklayabilmeli BK-18 Aminoasit Katabolizması ve Üre Döngüsü 2 Dr. H. TÜRKÖN Üre molekülünü tanımlayabilmeli Üre döngüsünü açıklayabilmeli Üre döngüsünde yer alan reaksiyonları sayabilmeli Üre döngüsünün düzenlemesini açıklayabilmeli Amonyak metabolizmasını açıklayabilmeli BK-19 Aminoasitlerin Karbon İskeleti Katabolizması 1 Dr. H. TÜRKÖN Aminoasitlerin karbon iskeletini tanımlayabilmeli Karbon iskeletinin yıkımı sonucu oluşan ürünleri sayabilmeli Esansiyel ve nonesansiyel aminoasitleri tanımını yapabilmeli Esansiyel ve nonesansiyel aminoasitleri sayabilmeli Glukojenik, ketojenik ve hem ketojenik hemde glukojenik aminoasitleri sayabilmeli BK-20 Aminoasitlerin Karbon İskeleti Katabolizması 2 Dr. H. TÜRKÖN Karbon iskeletinin yıkımı sonucu oluşan ürünlerin hangi aminoasitlerden tarafından lede edildiğini açıklayabilmeli Aminoasitlerin yıkılım reaksiyonlarını açıklayabilmeli Folik asitin aminoasit reaksiyonlarındaki rolünü açıklayabilmeli Aminoasitlerin metabolizması esnasında ortaya çıkan bozuklukları açıklayabilmeli Aminoasit metabolizması ile ilişkili hastalıkları tanımlayabilmeli TB-U01 Hücre Çeşitleri-Bitki ve Hayvan Hücresi Bitki hücresinin bölümlerini ve organellerini mikroskop altında tanımlayabilmeli, Bitki hücresinin yapısal özellikleri ile fonksiyonları arasındaki yapı-fonksiyon birlikteliğini ve ilişkiyi kavrayabilmeli. Hayvan hücresinin bölümlerini ve organellerini mikroskop altında tanımlayabilmeli, Hayvan hücresinin yapısal özellikleri ile fonksiyonları arasındaki yapı-fonksiyon birlikteliğini kavrayabilmeli. Bitki hücresi ile hayvan hücresi arasındaki yapısal farklılıkları tanımlayabilmeli. bilgi bilgi bilgi
2018-2019 Eğitim Yılı DÖNEM I Kurul 2 12 Kasım 2018 Pazartesi 4. HAFTA 12 KASIM 16 KASIM 2018 13 Kasım 2018 14 Kasım 2018 Salı Çarşamba 15 Kasım 2018 Perşembe 16 Kasım 2018 Cuma 08.30-09.20 Türk Dili İngilizce Mesleki ingilizce 09.30-10.20 Türk Dili İngilizce Mesleki ingilizce 10.30-11.20 11.30-12.20 TG_14 DNA Analiz Yöntemleri 3 (PCR 1) Dr.Öztürk ÖZDEMİR TG_15 DNA Analiz Yöntemleri 4 (PCR 2) Dr.Öztürk ÖZDEMİR YÖK DERSİ VİZE:Türk Dili YÖK DERSİ VİZE: AİTT Atatürk İlkeleri Ve Atatürk İlkeleri Ve BK_19 Aminoasitlerin Karbon İskeleti Katabolizması 1 Dr. H. TÜRKÖN BK_20 Aminoasitlerin Karbon İskeleti Katabolizması 2 Dr. H. TÜRKÖN 12.30-13.20 13.30-14.20 14.30-15.20 15:30-16:15 TB_10 Lizozom ve Peroksizomların Yapı ve fonksiyonları TG_16 DNA Analiz Yöntemleri 5 (Sanger Sekanslama 1) Dr. Ö. ÖZDEMİR TG_17 DNA Analiz Yöntemleri 6 (Sanger Sekanslama 2) Dr. Ö. ÖZDEMİR TG -18 NGS-Yeni Nesil Dizileme yöntemleri 1 Dr. F. SILAN BF_11 Biyolojik membranlar ve aksiyon potansiyelleri Dr. Ö. COŞKUN BF_12 Biyolojik membranlar ve aksiyon potansiyelleri Dr. Ö. COŞKUN BK_21 Aminoasitlerin özel ürünlere dönüşümü 1 Dr. H. TÜRKÖN 16:30-17:15 TB_11 Mitokondri Yapı ve Fonksiyonu BK_22 Aminoasitlerin özel ürünlere dönüşümü 2 Dr. H. TÜRKÖN
TG-14 DNA Analiz Yöntemleri 3 (PCR 1)I Dr. Ö.ÖZDEMİR İn vitro gen ortamda (tüp) gen sentezini kavramak İn vitro gen manipülasyon mekanizmalarını kavramak PCR nedir in vitro ortamda amplifiye olunan gen ürünlerin kullanım hedeflerini öğrenmek PCR nedir basamaklarını kavramak PCR bileşenlerini öğrenmek, hedef gen sentez esaslarını kavramak TG-15 DNA Analiz Yöntemleri 4 (PCR 2) Dr. Ö.ÖZDEMİR İn vivo, İn vitro gen sentez mekanizmalarını kavramak PCR tiplerini öğrenmek Nested-PCR tekniği ve kullanım amaçlarını kavramak PCR optimizasyon teknikleri hakkında bilgi sahibi olmak PCR ürünlerinin rekombinant DNA teknolojisinde kullanım alanları hakkında bilgi sahibi olmak TG-16 DNA Analiz Yöntemleri 5 (Sanger dizileme) Dr. Ö.ÖZDEMİR Tıbbi Genetikte etkin kullanılan tanı yöntemlerini kavramak DNA sekans yöntemlerinin kesin ve etkin tanıdaki önemini bilmek Sanger dizi analiznin tıbbi genetikte altın standart olduğunu kavramak Sanger ve Pyro dizi analizlerini kavramak, üstün ve zayıf noktalarını bilmek Moleküler tanıda Pyro sekans analizinin tercih edildiği durumları kavramak TG-17DNA Analiz Yöntemleri 6 (sanger dizileme 2) Dr. Ö.ÖZDEMİR Sanger sekans analizi basamakları kavramak Pyro sekans analizi basamaklarını bilmek Kapiller elektroforez tekniği ve DNA dizilemedeki önemini bilmek Kapiller, SAGE ve agaroz elektroforez tekniklerinin tıbbi genetikteki tanısal değerlerini kavramak Sekanslanmış hedef gen dizilerini değerlendirilme ve raporlanmasını kavramak TG-18 Yeni Nesil Dizileme Yöntemleri 1 Dr. F. SILAN Klasik sanger yöntemi ile yeni nesil dizilemelerin farklılıkları, Yeni nesil dizilemenin kapsamı ve gerekliliği ikinci nesil dizileme yöntemleri üçüncü nesil dizileme yöntemleri dördüncü nesil dizileme yöntemleri TB-10 Lizozom ve Peroksizomların Yapı ve fonksiyonları Peroksizomun görevini açıklayabilmeli Lizozomun görevini tanımlayabilmeli Lizozom ve peroksizomların yapısı ve içerdiklerin enzimler ve fonksiyonları konusunda bilgi sahibi olabilmeli Lizozomal depo hastalıklarının proteinlerin lizozomal yönlendirilmesi kusuru veya lizozomal enzim aktivitesi kaybı ile ilişkisini kavrayabilmeli TB-11 Mitokondri Yapı ve Fonksiyonu Mitokondri yapısını ve fonksiyonunu bilmeli İç ve dış membran özelliklerini ve hücre fonksiyonundaki önemini bilmeli Organizmamızda farklı tipleri olduğunu bilmeli Mitokondiriyal ribozom yapılarının özelliğini bilmeli ve nedenini açıklayabilmeli Hücrenin enerji ihtiyacına bağlı olarak sayısal değişiklikler gösterebildiğini bilmeli Hücrede nasıl çoğaldıklarını bilmeli TG-U03 (1. Grup) PCR 1 İn vivo, İn vitro gen sentez basamaklarını yaparak kavramak Thermal sycler cihazını tanımak, denatürasyon, annelaing ve polimerizasyon siklus basamaklarını kodlamayarak öğrenmek PCR bileşenlerini bilmek, eppendor tüpte bu bileşenlerin hazırlığını yapmak Sentezlemek istediği gene ait primer dizilerin seçimini yapmak, öğrenmek Amplifiye etmek istediği PCR tüpünü Thermal Sycler cihazına yerleştirmek, PCR amplifikasyon koşullarını fiilen kodlamak, öğrenmek TG-U04 PCR 2 Siklus basamaklarını programlamak PCR da pre-run ve post-run basamaklarını öğrenmek PCR ürünlerinin analizi öncesi hazırlık yapmak Thermal cycler da reaksiyon döngülerini izlemek bilgi
TG-U05 Elektroforez 1 (Agaroz Jel Elektroforezi 1) Elektroforez tekniğini bilmek, öğrenmek Elektroforezde kullanılan ekipmanları tanımak Jel elektroforez tekniğinin basamaklarını bilmek, öğrenmek Agaroz jel elektroforez bileşenlerini aktif olarak tanımak, kullanmak Elekrtoforezde kullanmak üzere %1.5 ve 2 lik agaroz jel hazırlama Donmadan önce agaroz jelde örnek yükleme kuyucukları hazırlama TG-U06 (1. Grup) Elektroforez 2 (Agaroz Jel Elektroforezi 2) Örnek yükleme kuyucukları oluşturulan agaroz jelin donmasını görmek Agaroz jeli yükleme tankına yerleştirme uygulamasını yapmak Jelin hazırlandığı ve örneklerin yürütüleceği TAE, TBE tamponları hazırlamak Mikropipet ile (10 microlitre) örneklerin( Yükleme tamponu ile desteklenmiş Marker, PCR ürünleri) kuyucuklara aktif olarak yükleme uygulamasını yapmak Örneklerin hangi VOLT/Amper ve süre gibi koşullarında yürütüleceği programlamayı yapmak, uygulamak BK-20 Aminoasitlerin özel ürünlere dönüşümü 1Dr. H. TÜRKÖN Aminoasitlerin protein sentezinden başka hangi metabolik ürünlere dönüştüklerini açıklayabilmeli Aminoasitlerin dönüştükleri önemli metabolik ürünleri sayabilmeli Bu ürünlerin metabolizmadaki işlevlerini tanımlayabilmeli Kreatin sentezine katılan aminoasitleri sayabilmeli Glisin aminoasitinin kkatıldığı reaksiyonları açıklayabilmeli BK-21Aminoasitlerin özel ürünlere dönüşümü 2 Dr. H. TÜRKÖN Kükürtlü aminoasitlerin katıldığı reaksiyonları sayabilmeli Poliaminlerin sentezini ve metabolik fonksiyonlarını sayabilmeli Histidin aminoasitinden oluşan ürünleri sayabilmeli Tirozin aminoasitinden oluşan ürünleri sayabilmeli Alanin aminoasitinden oluşan ürünleri sayabilmeli
2018-2019 Eğitim Yılı DÖNEM I Kurul 2 19 Kasım 2018 Pazartesi 08.30-09.20 Türk Dili 09.30-10.20 Türk Dili 10.30-11.20 11.30-12.20 12.30-13.20 13.30-14.20 14.30-15.20 BF_13 Biyoelektrik potansiyeller Dr. Ö. COŞKUN BF_14 Biyoelektrik potansiyeller Dr. Ö. COŞKUN BK_23 Nükleotid Metabolizması 1 BK_24 Nükleotid Metabolizması 2 5. HAFTA 19 KASIM 23 Kasım 2018 20 Kasım 2018 Salı BK_25 Mineraller 1 BK_26 Mineraller 2 TG -19 NGS-Yeni Nesil Dizileme yöntemleri 2 Dr. F. SILAN TG -20 NGS-Yeni Nesil Dizileme yöntemleri 3 Dr. F. SILAN BK_27 Vitaminler 1 BK_28 Vitaminler 2 21 Kasım 2018 Çarşamba İngilizce BF_15 Hemodinamiğe giriş Dr. Ö. ÖZTOPUZ BF_16 Hemodinamiğe giriş Dr. Ö. ÖZTOPUZ Atatürk İlkeleri Ve 15:30-16:15 16:30-17:15 22 Kasım 2018 Perşembe TG_U03 (1. Grup) Uygulama 4 PCR Lab. TG_U05 (2. Grup) Uygulama 5 Elektroforez Lab TG_U04 (1. Grup) Uygulama 4 PCR Lab. Tüm öğretim Üyeleri TG_U06 (2. Grup) Uygulama 5 Elektroforez Lab TG_U03 (2. Grup) Uygulama 4 PCR Lab. TG_U05 (1. Grup) Uygulama 5 Elektroforez Lab TG_U04 (2. Grup) Uygulama 4 PCR Lab. Tüm öğretim Üyeleri TG_U06 (1. Grup) Uygulama 5 Elektroforez Lab TG_U03 (4. Grup) Uygulama 4 PCR Lab. Tüm öğretim Üyeleri TG_U05 (3. Grup) Uygulama 5 Elektroforez Lab TG_U04 (4. Grup) Uygulama 4 PCR Lab. Tüm öğretim Üyeleri TG_U06 (3. Grup) Uygulama 5 Elektroforez Lab TG_U03 (3. Grup) Uygulama 4 PCR Lab. TG_U05 (4. Grup) Uygulama 5 Elektroforez Lab TG_U04 (3. Grup) Uygulama 4 PCR Lab. Tüm öğretim Üyeleri TG_U06 (4. Grup) Uygulama 5 Elektroforez Lab 23 Kasım 2018 Cuma
BF-13 Biyoelektrik potansiyeller 1 Dr. Ö. COŞKUN Taşıyıcı protein kanalları hakkında bigi verebilmeli Büyük moleküllerin membrandan taşınma olaylarını anlatabilmeli Membran dinlenim potansiyelini açıklayabilmeli Nerst eşitliğini formülüze ederek açıklayabilmeli Gibbs-Donnan dengesini anlatabilmeli BF-14 Biyoelektrik potansiyeller 2 Dr. Ö. COŞKUN Uyarılabilir hücreler, aksiyon potansiyelleri, biyoelektrik ilişkilerini bilebilmeli Sinir uyarıları iletiminin fizyolojik temellerini açıklayabilmeli, membran potansiyellerini iyon dengesine göre yorumlayabilmeli Membran potansiyeli eğrisi çizebilmeli, grafik üzerinde aksiyon potansiyelini yorumlayabilmeli Kalpteki aksiyon potansiyelini açıklayabilmeli Tanıda kullanılan biyoelektriksel potansiyelleri anlatabilmeli BF-15 Hemodinamiğe giriş-1 Dr. Ö. ÖZTOPUZ Damar sisteminde basınç-akım ilişkisini açılayabilmeli Akışkanlar dinamiği ile ilgili yasaları anlatabilmeli Akışkanlar mekaniği ile ilgili temel bilgi düzeyine sahip olabilmeli Akış direncini açıklayabilmeli Makaslama zorunu anlatabilmeli BF-16 Hemodinamiğe giriş-2 Dr. Ö. ÖZTOPUZ Viskoziteyi açıklamalı Hemodinamik bozukluklar ile ilgili bilgiye sahip olabilmeli Arterial sistemi oluşturan damarların özelliklerini söyleyebilmeli, biyofizik yasaları ile açıklayabilmeli Dolaşım sisteminde akım-basınç-direnç ilişkisini kavrayabilmeli Kan akımı - Kanın damar içindeki hareketi ile ilgili problemleri çözebilmeli BK-23 Nükleotit Metabolizması 1 Nükleik asitler ve nükleotit sindirim yolunu açıklayabilmeli Pürin nükleotitlerinin sentezini, enzim ve kontrol noktalarını sırasına uygun anlatabilmeli Sentez sonrası oluşan pürin nükleotitlerini tanımlayabilmeli Pürin nükleotitlerinin yıkımını açıklayabilmeli, reaksiyonlarını yazabilmeli, son ürünü gösterebilmeli Pürin metabolizması bozukluklarını, metabolizmadaki enzim fonksiyonlarıyla ilişkilendirebilmeli BK-24 Nükleotit Metabolizması 2 Pirimidin nükleotitlerinin sentezini, enzim ve kontrol noktalarını sırasına uygun anlatabilmeli Sentez sonrası oluşan pirimidin nükleotitlerini tanımlayabilmeli Pirimidin nükleotitlerinin yıkımını açıklayabilmeli, reaksiyonlarını yazabilmeli, son ürünü gösterebilmeli Serbest pirimidin yıkım reaksiyonlarını açıklayabilmeli Pirimidin metabolizması bozukluklarını, metabolizmadaki enzim fonksiyonlarıyla ilişkilendirebilmeli BK-25 Mineraller 1 Mineralleri tanımlayabilmeli Biyoeser element tanımı yapabilmeli Eser, Ultraeser elementlerin özelliklerini sayabilmeli Eser, ultraeser elementleri sayabilmeli, yer aldığı reaksiyonları tanımlayabilmeli Hücre içi ve dışı temel anyon ve katyonları sınıflandırabilmeli BK-26 Mineraller 2 Demir fonksiyonları, metabolizma bozuluklarını açıklayabilmeli Bakır fonksiyonunu, metabolizma bozukluklarını açıklayabilmeli Diğer eser ve ultraeser elementlerin eksiklerinden meydana gelecek durumları yorumlayabilmeli Makrominerallerin fazlalığı veya eksikliğinde ortaya çıkan durumları yorumlayabilmeli Minerallerin, eser ve ultraeser elementlerin diğer biyomoleküllerle ilişkilerini değerlendirebilmeli BK-27 Vitaminler 1 Vitamin tanımını yapabilmeli Vitaminleri sınıflandırabilmeli Her vitaminin günlük ihtiyaç değerini kadın ve erkekte ayırt edebilmeli Yağda çözünen vitaminleri sayabilmeli, özelliklerini açıklayabilmeli Suda çözünen vitaminleri sayabilmeli, özelliklerini açıklayabilmeli
BK-28 Vitaminler 2 Vitamin eksikliklerinde ortaya çıkan hastalıkları ve sendromları açıklayabilmeli Vitamin fazlalılığında ortaya çıkan hastalıkları ve sendromları açıklayabilmeli Organizmada gerçekleşen reaksiyonlarda yer alan vitaminleri sayabilmeli, özelliklerini açıklayabilmeli Vitaminlerin yer aldığı reaksiyonları tanımlayabilmeli Vitaminlerin diğer biyomoleküllerle olan ilişkisini açıklayabilmeli TG-19 NGS-Yeni Nesil Dizileme yöntemleri -2 Dr. F. SILAN Yeni nesil dizileme ile analiz edilebilen gen panelleri Yeni nesil dizileme ile saptanan mutasyonların doğrulanması Ekzom analizi kapsamı Ekzom analizi kısıtlılıkları Trio analiz kavramı TG-20 NGS-Yeni Nesil Dizileme yöntemleri -3 Dr. F. SILAN Analiz sırasında kullanılan filtreler NGS ile mozaisizm analizi Cover analizi NGS ile likid biyopsi kavramı NGS ile CNV analizi
2018-2019 Eğitim Yılı DÖNEM I Kurul 2 26 Kasım 2018 Pazartesi 6. HAFTA 26 KASIM 30 KASIM 2018 27 Kasım 2018 28 Kasım 2018 Salı Çarşamba 29 Kasım 2018 Perşembe 30 Kasım 2018 Cuma 08.30-09.20 İngilizce 09.30-10.20 İngilizce 10.30-11.20 Mesleki ingilizce Atatürk İlkeleri Ve 11.30-12.20 Mesleki ingilizce Atatürk İlkeleri Ve 12.30-13.20 Öğle Arası 13.30-14.20 SINAV (Pratikler) SINAV (Teorik) 14.30-15.20 15:30-16:15 16:30-17:15